4FSVA

Crystal structure of a heat shock 70kda protein 2 (hspa2) from homo sapiens at 1.80 a resolution
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
384
structure length
380
Chain Sequence
RGPAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTIFDAKRLIGRKFEDATVQSDMKHWPFRVVSEGGKPKVQVEYKGETKTFFPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGGKVHSAVITVPAYFNDSQRQATKDAGTITGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKGEKNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVSHLAEEFKRKHKKDIGPNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGVDFYTSITRARFEELNADLFRGTLEPVEKALRDAKLDKGQIQEIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILIGDK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Chaperone
molecule keywords Heat shock-related 70 kDa protein 2
publication title Crystal structure of a heat shock 70kDa protein 2 (HSPA2) from Homo sapiens at 1.80 A resolution
rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 120
structure length 380
sequence length 384
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-06-27
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 4fsvA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4fsvA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4fsvA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4fsvA04
1HKGA 4H0PA 4BGAA 5BRFA 2CGLA 4CI6A 5KPTA 1YUWA 1RDWX 3ZETA 3WUHA 5AQPA 1ATSA 4BC4A 3HI0A 4LC9B 4DHYA 2CH6A 3L0QA 1NMDA 2ASPA 5AQJA 3D7EO 4FPAA 3IDHA 4WQ5C 3ZX2A 2FLOA 2YHXA 4B9QA 1CZAN 1S3XA 2W40A 2P9KB 2P9SA 2ZGYA 1GLEG 3FE1A 3R6MA 3LDNA 4GNIA 4BRGA 3QFPA 5BPMA 3ZX0A 4H0YB 4B1VA 1XQSC 4XH1A 3OHRA 5LJVA 5AQXA 1GLBG 5AFUA 3BEXA 1GLLO 3WEEB 3FZLA 3W0LA 4AM7A 3SLCA 2A42A 1Q18A 5AQVA 1LCUA 3H45C 4CZKA 5AZJA 4BR2A 1DGKN 2KHOA 2YJEA 4BR4A 5KQDA 4BRCA 1NGEA 3MMVA 5FPDA 3C7NA 4K42A 4BC5A 3LDLA 2FXUA 4H0OA 3D2EB 1MWMA 3CIPA 1HPMA 1T6CA 2A3ZA 2FF6A 2DPNA 1TYQA 4A61A 1KXPA 1NGGA 3ZEUA 1TUYA 5JLFA 5F1XA 1GLJO 4BVPA 4BR5A 2H3GX 1QZ6A 4FWQA 2P9PB 4BG8A 1IG8A 3D2FA 3LDOA 5AQMA 1NBWA 4FL9A 4FPBA 3AARA 4CBWA 4MO4A 5TKYA 5JMVA 2PAVA 4HWIA 4BRAA 4EHUA 3O08A 3MDQA 4ISFA 5I9EB 1HLUA 2E1ZA 3VESA 3GL1A 4YDUA 1QQNA 5F2RA 1G99A 3EO3A 2P9LA 1YVNA 4RCHA 4CZFA 1NGIA 3G25A 5EOYA 2YHYA 1BO5O 2EWSA 3WXKA 3WXJA 3CI5A 5AQHA 3AAQA 1YXQA 2P9UA 1HKBA 3UKUB 2GUPA 2FSNA 4CBUA 1SQKA 3ZX3A 4FWSA 4FOIA 2E2NA 4A2BA 2D0OA 3WT0A 4CZJA 1GLDG 5KPZA 3VF4A 1ESVA 1BWFO 5FPNA 1Y64A 5AQWA 4AM6A 4EFHA 4BG9A 2E2PA 2Q0RA 4HTLA 2V52B 4MLHA 3A8YA 3QBWA 1P8ZA 4BRFA 3D2EA 4FO0A 3O80A 5AQYA 3MK6A 4JAXA 4B1XB 1LOTB 2E2OA 5AR0A 1MDUB 1NGDA 5JLHA 1RFQA 3HSCA 3KHYA 3VENA 3O8MA 3WXIA 4RTFD 4CJ7A 2P9PA 5AQUA 1BUPA 3VPZA 2E1YA 5KQ8A 3VGKA 5AQLA 4K41A 1V4TA 1OKJA 4CZHA 4FWNA 4M63C 3WXLA 4EAHD 1HJOA 5EY4A 3A5MC 5E84A 1MWKA 5LY3A 1DKGD 3ULEA 1QQOA 2QWOA 1C0GA 1HKCA 3L6QA 4A62A 2WUSA 1NGCA 4XH4A 4JHDA 1NGHA 4IXCA 4JD2B 2A5XA 2ASOA 4PL7A 2J4RA 3ENHA 2FF3B 4WQ4A 2HOEA 3UE5A 1ZBSA 2VCPA 3VEZA 3MCPA 4BQZA 2F9TA 2YCHA 3UKRB 5AFUH 1HUXA 5AZIA 3UKUA 4H5WA 3VEWA 4MLEA 3LM9A 3H46O 4B1UB 4C23A 4FWOA 4H0XB 1E4GT 3BF1A 1NGJA 5BR9A 4IJNA 2CGKA 3FFKB 2QWQA 3MN9A 5ELZA 1T44A 2QWRA 1ZXOA 5FPEA 3DAWA 4B1ZA 3FZKA 3FLCO 3I8BA 1X3MA 2BTFA 4IZ9A 4YDUC 2QWMA 2A41A 4I6MA 3FGUA 3M6GA 2PBDA 5AQRA 1BA0A 1ATNA 1D4XA 4CBXA 3DXKB 4Y0WA 3VF6A 3DXMB 1NGAA 4CD1A 2Q36A 3KZBA 2ZWHA 3BF3A 2QWPA 4PKHA 5AQZA 1ATRA 1E4FT 4B1WB 3CERA 5ADXH 2QWLA 5KPRA 2YHWA 3HZ6A 3O1BA 3O6WA 4CZGA 2GWKA 3H3NO 4FSVA 1QZ5A 1KAXA 2Q2RA 3AAPA 3LL3A 2QW9A 2FSJA 3A5NC 2E8AA 1XC3A 2IVOA 3R8EA 4BRQA 3A0IX 2Q97A 4FWMA 4JN4A 3QDKA 2P9IB 2P9KA 3JS6A 3ZETB 4ISGA 2ASMA 2HF4A 4F9OA 1BU6O 4BR7A 1HX1A 1JCGA 3WQTA 3IFRA 3VEOA 3M3ZA 1WOQA 4GY2B 4FOEA 5AQOA 2IVPA 3CJBA 1C0FA 4QS9A 5E26A 4BREA 4K25A 3EN9A 2P9SB 4O5FA 3GG4A 1BDGA 2GELA 4H5NA 4NO7A 4K43A 3WEEA 1KAYA 1H1VA 3VEVA 1MA9B 3TU5A 3VGMA 3TPQA 3IUCA 5AQGA 3O4WA 1NGFA 4PKGA 5BN9A 1U6ZA 4EHTA 2CH5A 3EZWA 1NM1A 3GOIA 3VEXA 2E2QA 3ENOA 3GBTA 5AZJB 4FWRA 2ZF5O 4B1YB 4BRKA 3HTVA 3SJHA 4WQ4C 1NWKA 2V51B 4FWKA 3DXKA 3C7NB 5EVZA 4CD3A 2NRHA 2VWBA 2CGJA 1J6ZA 5AQNA 3EKSA 3P4IA 2NZTA 3GE1A 2Q0UA 3CHWA 3ZEUB 3R9PA 3O5BA 3A5OC 4BC2A 2YJFA 3W3DA 3HM8A 1GLAG 2P9NB 4BRPA 3LM2A 4PL8A 3L4IA 5BREA 3MN5A 1Z6RA 3C0BA 3D2FB 1TUUA 4XH5A 3LDQA 1V4SA 2HMPA 2ZGZA 3LDPA 4BR0A 4DCHA 1SAZA 1JCEA 1WUAA 2P9IA 3QFUA 4H5RA 1IJJA 2VYPA 5AQTA 4FWPA 2AA4A 2AP1A 2QWNA 4PKIA 4WYBA 2I7NA 3H3OB 3UB5A 3ID8A 4BRIA 4BVOA 3EL2A 1GLFO 5CE3A 3AY9A 3CQXA 4M7XA 2W41A 3VF2A 1DEJA 3CJ7A 1X3NA 2P9LB 3MN7A 4E1JA 1SZ2A 5AQFA 3VETA 1QQMA 3BUZB 3VGLA 4DQ8A 4BR9A 3U9DA 1U2VB 4BC3A 1QHAA 1T6DA 2OANA 2P9UB 4IJAA 4Z94A 4JNEA 5AQSA 3H6EA 2Q31A 3BP8A 3H1VX 4MO5A 3QB0A 1BA1A 5BRHA 5AQQA 2I7PA 2Q1NA 4H0TB 3FZMA 4A2AA 3CETA 3MN6A 2E20A 4WQ5A 4BRLA 3QBXA 1EQYA 1BOTO 3ATUA 3B8AX 2ITMA 4BROA 3CJAA 4BRDA 3CJCA 2IIRA 3IMXA 3SMPA 4BQLA 5B8HA 3QICA 5BRDA 1K8KB 4NB4A 4H03B 3SK3A 5AQKA 5BN8A 2F9WA 3H1QA 3O1WA 3KVGA 3RSEB 4RWTA 2GEMA 2P9NA 2NLXA 3EKUA 4J8FA 3VERA 3S41A 2GTDA 2UYTA 4BGBA 4CZEA 4BRNA 4JD2A 1YAGA 5ADXA 3ULEB 3DJCA 4XEIA 1JCFA 3QMLA 1NGBA 3CQYA 3I33A 4IO8A 4DB3A 4CZLA 2QXLA 1KAZA 5EX5A 1RGIA 3WQUA 3DWLA 1NLVA 4BRHA 4JHDB 1BG3A 3UKRA 5BPNA 2V7ZA 2D4WA 2A40A 3U9ZA 3M1FA 3F9MA 3FZFA 4QS7A 2FSKA 4FWLA 4M7YA 1GLCG 1S22A 4L3QA 3CJ9A 3J8AA 5LJWA 4O8KA 3CJ1A 1X9JA 2V7YA 1U2VA 3HBTA 5AQIA 5AZIB 2E88A 3SMSA 4QS8A 3VOVA 5FPMA 4EIAA 2D1KA 2A6AA 3FZHA 2HF3A 3VEYA 3DXMA 3GDQA 1R59O 3A5LC 5BPLA 3U8XA 3ATVA 4H0VB 4IWVA 4KBOA 3FR0A 1TYQB 2GWJA 4I6MB 2IVNA 4CZIA 1ZC6A 1Z05A 5JICA 4CZMA 2BUPA 3JXUA 1K8KA 4H5TA 2QM1A 4ISEA 3U4LA 2D0PA 5EXWA 2YI1A 1XUPO 4BRMA 5F0XA 3RSEA 4H5VA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3P83D 4CJ5A 3C6TA 4JLHA 1SV5A 5BRFA 5DM6L 4V1DC 3AO4A 1RDWX 3ZETA 4JI5K 3BY5A 1QSYA 1XHZA 4YHHK 4UADE 4BC4A 5JENA 3RRHA 4F8RA 3L0QA 3D7EO 2HNYA 5AQJA 4IEEA 3EE9A 3IDHA 4FPAA 3SAHA 4DLEA 2YHXA 3DOKA 4J2DA 4DFKA 2W40A 4UJ0A 1WSGA 1CZBA 1AYJA 1TKTA 1WMTA 4IFYA 2HHHK 4A5BA 4BRGA 3ZX0A 1NU0A 4H0YB 1B9FA 1L3TA 2D0CA 2WFBA 3U6FA 2FC0A 5JS1A 5AQXA 2HHIA 4KKOA 2HHQA 4FJHA 2A42A 4F2SA 2NUBA 3H45C 1J9AA 1DGKN 3DM2A 5D3GA 2KHOA 4CEOA 1S72N 2BDPA 3NGIA 2I61A 3TAGA 5FPDA 3DMJA 3B6OA 3TARA 1M1KO 2FXUA 1MWMA 4KFBA 3SQ2A 2OZMA 4ELVA 1TYQA 3O9UA 2VQFK 5JLFA 1K8AO 3OA9A 1GLJO 4BR5A 1QZ6A 1X9WA 2N2RA 5C25A 3V6DA 2OPQA 5M1NA 1KVBA 2P51A 4QOZB 4JI3K 1ZBHA 3D2FA 1P00A 5GAEP 3B6PA 1RTIA 1NBWA 1WSIA 3AARA 1ZVEA 1VSFA 4UAFE 3VQ4A 1Q81O 5C0YA 1C0UA 4I7FA 1N32K 3O08A 2I5JA 3MDQA 1VSIA 4C8NA 4CF1A 4HCBA 3KJVA 1QQNA 3EYZA 3ZSZA 3T1YK 4RCHA 3SAGA 4CZFA 4CW7B 1RBTA 3WXKA 4JKBA 4N41A 4FM2A 3CI5A 4CJVA 3AAQA 3PO4A 4M3UA 2FSNA 1HRHA 1SQKA 3VN5A 4FOIA 2D0OA 2IAJA 4AHTA 3OJSA 1RTDA 2G8FA 2PYLA 3HL8A 4O5BA 5GINA 1ESVA 2ZM6K 1B7DA 2IC3A 4F2RA 2E2PA 2KBHA 4MLHA 2KJAA 5HLFA 3A2FA 1BI4B 4DLGA 4AHRA 4FJKA 1VNAA 5CZ2A 3DRRA 4JKAA 4JAXA 4DQQA 1LOTB 3KLIA 1MDUB 3HSTB 3ZT4A 4KH5A 5AQUA 1BUPA 2F4VK 4O55A 3S9HA 4M63C 3WXLA 3E7UX 5HROA 5E84A 4M45A 4AQYK 3QESA 2ETJA 1QQCA 3ULEA 3AO2A 4LY7A 1QQOA 2JDQD 5HRRA 3DYAA 2UXBK 1NMNA 4IXCA 5HOOA 3QEWA 4N47A 1JXCA 1RBUA 1L3UA 1UA0A 2VCPA 3MCPA 3MWPA 3CCLN 1ASWA 1SEGA 5AFUH 4CHYA 3SPZA 1YT3A 3EEQA 1LAWA 5AZIA 3VEWA 2KTQA 3H46O 3E1YA 3K5OA 3FFKB 4B8CA 1ZUTA 3HYFA 2QWQA 5DM7L 3LWLA 1RNHA 4OJRA 1U4BA 5HRSA 4A5AA 1ZXOA 4B1ZA 3FLCO 2BTFA 4IZ9A 3KD5E 4E7IA 3OYDA 1NK5A 5AQRA 1D9FA 4Y0WA 3CFPA 3DXMB 3LALA 1JZBA 3RTVA 4K8ZA 3K59A 4CD1A 4PUOA 3OYIA 3TAMA 3GKUA 1JKHA 3KZBA 2YNGA 2ZWHA 1VQPN 4WE1A 2QA4N 1ATRA 1LW2A 3ZSQA 4I9QA 4I9LA 1ZYWA 4B3RK 4HHFA 1SS6A 4DKWA 1S1TA 2YHWA 4DV2K 3O1BA 2VG6A 1NOZA 4LD0A 4AHVA 1XMQK 1KLNA 2ATBA 4MQ3A 4Z4HA 1KRPA 1Q8IA 2GL1A 2FSJA 4E7HA 3R8EA 5C15A 1WB9A 1C1CA 2UXCK 4NYFA 2HF4A 4F9OA 1HX1A 3H08A 3VQCA 3K0SA 3KLEA 3AA5X 1IG9A 2K35A 2IVPA 2RKIA 3CJBA 4QS9A 4BREA 3CCMN 3AVNA 4K25A 4ZTJA 3EN9A 2P9SB 1C56A 2E3FA 4DTNA 4C8OA 4KHPK 3PIPL 1IKWA 3CG7A 1POIA 1BDGA 2GELA 2VG5A 4FCYA 3J7ZO 3RWUA 2IOCA 1J54A 2YILA 2C1IA 2JWLA 3O4WA 4DV7K 1NGFA 1HNVA 1JL1A 1NM1A 3GOIA 5LMNK 1T8EA 3DLLL 1SNBA 3ENOA 3F9KA 1QS4A 4E72A 4WQ4C 1OH6A 4LSNA 2NRZA 4RW9A 3FFIA 3WXMB 3ZLJA 2N69A 5HP1A 4DSJA 4OLBA 3THYB 2VWBA 1J6ZA 3EKSA 3P4IA 1M90O 3C94A 3O5BA 1TKDA 1NK8A 4BC2A 4DF4A 2YJFA 2HHXA 4M41A 5CHIA 1EKEA 3VQ5A 3IKMA 4JKHA 5CZ1A 4DG1A 4PL8A 4AAZA 4JEPA 3LDQA 3V4IA 5IT9O 4DSEA 3ZT1A 1IJJA 4M3WA 5AQTA 1N5YA 4FWPA 1WN7A 2QWNA 4WYBA 4DS5A 3LAMA 1QVFM 3ID8A 2FBTA 3OS0A 1P0AA 1GLFO 1VSJA 3D0PA 4M7XA 4OGCA 4M3XA 3VQDA 4PWDA 2E0HA 2P5GA 1SN1A 3VETA 1B9DA 1OZZA 3VGLA 3U9DA 1NRBA 3T3FA 1QHAA 5C24A 4IJAA 3AGKA 4DV3K 5AQSA 3C6AA 4M3YA 1TGOA 1NH5A 4DFJA 2HBMA 4PY5A 4JI6K 1BA1A 3K58A 2I7PA 3AVFA 3RRGA 3OYLA 3FZMA 4DTOA 4WF9L 3QIPA 4BROA 3MCAB 3NH1A 1KV0A 1VQLN 1VSHA 4NB4A 3BZKA 1T3VA 4H03B 3SK3A 5HRNA 3H1QA 3O1WA 1I6FA 3RSEB 4RWTA 3IRXA 3MEEA 3L2QA 3K5NA 2QK9A 1VRTA 1NKBA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3P83 D;  4CJ5 A;  3C6T A;  4JLH A;  1SV5 A;  5BRF A;  5DM6 L;  4V1D C;  3AO4 A;  1RDW X;  3ZET A;  4JI5 K;  3BY5 A;  1QSY A;  1XHZ A;  4YHH K;  4UAD E;  4BC4 A;  5JEN A;  3RRH A;  4F8R A;  3L0Q A;  3D7E O;  2HNY A;  5AQJ A;  4IEE A;  3EE9 A;  3IDH A;  4FPA A;  3SAH A;  4DLE A;  2YHX A;  3DOK A;  4J2D A;  4DFK A;  2W40 A;  4UJ0 A;  1WSG A;  1CZB A;  1AYJ A;  1TKT A;  1WMT A;  4IFY A;  2HHH K;  4A5B A;  4BRG A;  3ZX0 A;  1NU0 A;  4H0Y B;  1B9F A;  1L3T A;  2D0C A;  2WFB A;  3U6F A;  2FC0 A;  5JS1 A;  5AQX A;  2HHI A;  4KKO A;  2HHQ A;  4FJH A;  2A42 A;  4F2S A;  2NUB A;  3H45 C;  1J9A A;  1DGK N;  3DM2 A;  5D3G A;  2KHO A;  4CEO A;  1S72 N;  2BDP A;  3NGI A;  2I61 A;  3TAG A;  5FPD A;  3DMJ A;  3B6O A;  3TAR A;  1M1K O;  2FXU A;  1MWM A;  4KFB A;  3SQ2 A;  2OZM A;  4ELV A;  1TYQ A;  3O9U A;  2VQF K;  5JLF A;  1K8A O;  3OA9 A;  1GLJ O;  4BR5 A;  1QZ6 A;  1X9W A;  2N2R A;  5C25 A;  3V6D A;  2OPQ A;  5M1N A;  1KVB A;  2P51 A;  4QOZ B;  4JI3 K;  1ZBH A;  3D2F A;  1P00 A;  5GAE P;  3B6P A;  1RTI A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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