4H5NA

Hsc70 nbd with po4, na, cl
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
382
structure length
382
Chain Sequence
KGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILSGDK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transcription
molecule keywords Heat shock cognate 71 kDa protein
publication title New crystal structures of HSC-70 ATP binding domain confirm the role of individual binding pockets and suggest a new method of inhibition.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 120
structure length 382
sequence length 382
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-09-18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 4h5nA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4h5nA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4h5nA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4h5nA04
3HSCA 5AQXA 2FF6A 3D2EB 3VENA 4BRPA 4MLEA 3WXLA 5BRHA 5AQSA 1K8KB 3O8MA 3DJCA 3D2FA 5F0XA 3O4WA 2A5XA 4ISEA 4CBXA 2P9PA 4H0TB 1CZAN 2V7ZA 3VGLA 2IVOA 5AQRA 4J8FA 3O1WA 4B9QA 1XQSC 3QFPA 4RTFD 4B1VA 3FZHA 2ITMA 5AQUA 1T6DA 4FWRA 4CZGA 4CZEA 4ISGA 5JLHA 4XEIA 4LC9B 1T44A 3RSEB 1HJOA 3H3NO 4L3QA 1HUXA 5FPMA 1Y64A 2ASPA 3MDQA 1X3MA 4JNEA 4FL9A 5LY3A 3W3DA 3M1FA 2IIRA 1ATSA 3WXIA 3EN9A 2E8AA 2E2OA 2NRHA 1HLUA 4FOIA 4CJ7A 3A0IX 4IZ9A 2P9LB 5BPMA 3UKUB 3VPZA 4FSVA 5EXWA 3DXKB 4JD2B 5AZIA 2W41A 4FWOA 2P9NA 3B8AX 2ZGYA 5ELZA 4HTLA 3D2EA 3MN6A 3BF1A 5TKYA 3ZETA 4PKHA 1XUPO 2VWBA 3SLCA 4IJAA 3IUCA 2NZTA 2WUSA 2CH5A 3AARA 4I6MA 5AQHA 1HKGA 2QWMA 5JLFA 1GLLO 3A5OC 3VEWA 2ASMA 3MCPA 3U9DA 2P9KA 4KBOA 5B8HA 5KPRA 4K42A 3J8AA 1HKBA 1YVNA 3QDKA 1BDGA 4IWVA 3BP8A 1D4XA 4BROA 1H1VA 4DQ8A 2YJFA 3WXKA 4H5RA 4EHTA 4JAXA 2BTFA 2Q0UA 5FPDA 2YHYA 4ISFA 3VGKA 5BPNA 1X3NA 2OANA 5AQGA 4BVPA 2YHXA 3SJHA 4BR2A 3H46O 2VCPA 3SMSA 1HX1A 3A8YA 1BO5O 2Q1NA 2ZF5O 4BR5A 4JD2A 2GWKA 4YDUC 2QWRA 4FWMA 2J4RA 2Q97A 3MK6A 3VF6A 1DKGD 3A5NC 4K43A 3VF2A 4QS9A 4FWQA 4CZLA 2D0PA 2P9SB 1ESVA 5AQWA 2GWJA 1SQKA 1MA9B 3VGMA 4BRIA 3HI0A 1S3XA 4PKIA 4RCHA 4YDUA 4H0OA 4BRLA 4BG8A 4BRGA 2GUPA 3VEVA 2KHOA 2GTDA 3WT0A 4EFHA 4Z94A 3O1BA 2QW9A 1LOTB 3OHRA 2ZWHA 4A2AA 3QBXA 4CZKA 2EWSA 1NBWA 3KZBA 3L0QA 3L6QA 3AY9A 2HF3A 3WXJA 3ZX2A 4BR7A 4DCHA 3CJ9A 4PL8A 4XH4A 3HZ6A 3TU5A 3VERA 2P9UA 3UB5A 4BRNA 5BRFA 3FZKA 2CH6A 3DXMB 4WQ4C 3P4IA 4WQ5A 4BQZA 2D1KA 2HF4A 5EY4A 1TUYA 3ULEB 4BRAA 1U2VB 3ENHA 3FLCO 2YI1A 1LCUA 3FZMA 4FOEA 4WQ4A 3EO3A 3H1VX 4BC3A 1YXQA 3R9PA 5AQPA 3AAQA 3CJ1A 2P9SA 3M6GA 1NGAA 2FSNA 1G99A 2QWOA 2Q36A 4BQLA 3CJ7A 2H3GX 5AFUH 3TPQA 4MO5A 2E2PA 3WQTA 1ATNA 1QZ6A 4AM7A 4BR4A 3IDHA 1XC3A 1RDWX 4QS7A 2BUPA 1MWKA 5AQMA 4BREA 4B1ZA 1DGKN 4BRQA 1C0FA 5I9EB 3FGUA 1V4TA 5BR9A 1NGCA 1JCGA 3EKSA 3ZEUB 4NO7A 3A5LC 3H45C 4JN4A 3CQYA 2A3ZA 1KXPA 3LL3A 2GEMA 2D0OA 4H5WA 2HMPA 2V7YA 3CETA 3H3OB 5FPEA 3ZX0A 5KPTA 2AP1A 5FPNA 1QZ5A 2IVNA 5KPZA 3ID8A 5AQQA 1NMDA 4CD1A 3DWLA 4FPBA 3MN7A 2I7NA 4BR0A 1U2VA 3GDQA 3EZWA 3FZFA 3GG4A 1K8KA 1NWKA 1GLBG 2V51B 3BF3A 4BRKA 3CI5A 1Q18A 3F9MA 2ZGZA 5CE3A 1RGIA 5AQNA 3GOIA 3WQUA 4B1XB 3LDQA 4BGAA 5EOYA 1NM1A 3C7NB 1P8ZA 1U6ZA 1E4FT 1TYQB 4FWNA 2A41A 2E2NA 2V52B 3GBTA 4BRDA 2Q2RA 2NLXA 3FE1A 3WUHA 1SAZA 3RSEA 1S22A 5LJVA 4K41A 4H03B 4M7YA 4CZIA 4O5FA 2Q31A 2E2QA 1HPMA 5AZJB 4C23A 1Z6RA 4H5NA 3BUZB 3QBWA 2FF3B 3ZEUA 1YUWA 4GNIA 4WYBA 1MWMA 3HBTA 1ATRA 5AQYA 2QXLA 3WEEB 4DB3A 4E1JA 3HM8A 2P9LA 3UKUA 3DXKA 3UE5A 4BC5A 4A61A 1QHAA 2CGLA 3UKRB 3FZLA 2E88A 4H5VA 5EVZA 2PAVA 3LM9A 3S41A 3O08A 5AQVA 2FSJA 5BREA 2E1ZA 1DEJA 2W40A 2I7PA 4CBUA 5LJWA 5KQDA 3R6MA 4O8KA 3C7NA 2AA4A 5E26A 1GLJO 4QS8A 1NLVA 3I33A 4H0YB 3MN9A 1HKCA 1WOQA 4F9OA 3LDLA 4XH1A 3D2FB 5AQJA 1E4GT 1JCFA 2P9PB 4EIAA 3U8XA 5KQ8A 5AFUA 5BPLA 2Q0RA 1NGBA 3CJCA 2FLOA 4WQ5C 1QQOA 5AZJA 4NB4A 4B1UB 4PKGA 4FWLA 3EKUA 1BA0A 2P9IB 3H1QA 2QWLA 2F9WA 5ADXH 1IJJA 4BRCA 3KHYA 4BGBA 4JHDB 4BRMA 2VYPA 5AQOA 3UKRA 1TUUA 3IMXA 4FWSA 3IFRA 1GLDG 2YJEA 4Y0WA 5JMVA 2A40A 3CQXA 4BG9A 2IVPA 4HWIA 4FWKA 4MO4A 3QMLA 4FPAA 3QICA 5AZIB 1OKJA 2CGKA 3H6EA 2P9NB 3ZX3A 1BOTO 2E1YA 1BUPA 4XH5A 3ZETB 3ENOA 2A6AA 2QWNA 2CGJA 3JS6A 3ATVA 4I6MB 4CBWA 4BC2A 3VEYA 4IXCA 2FSKA 1NGIA 2P9KB 1EQYA 3VETA 4K25A 3VESA 2P9IA 4FO0A 3CHWA 1BG3A 3C0BA 3DXMA 1V4SA 3EL2A 1X9JA 4H0PA 3W0LA 4JHDA 1NGFA 3GL1A 5EX5A 3CJAA 3ULEA 3I8BA 3MMVA 5AQKA 4H0XB 3ATUA 4BRHA 5AQLA 5AR0A 4CD3A 1YAGA 2DPNA 4IO8A 1NGEA 2A42A 2FXUA 1KAYA 1NGJA 3DAWA 2D4WA 1NGDA 3SK3A 3AAPA 1NGHA 4BVOA 1R59O 4DHYA 4CZHA 3VOVA 4PL7A 3JXUA 1QQMA 3CERA 3D7EO 3U4LA 3G25A 2F9TA 1JCEA 5AQZA 4BR9A 3LM2A 4H0VB 4H5TA 4CZFA 4B1YB 5BN8A 4M7XA 4A62A 2HOEA 3O80A 2PBDA 1BA1A 5AQFA 4IJNA 2ASOA 2QWPA 3L4IA 1MDUB 2QM1A 1ZBSA 1RFQA 2GELA 5ADXA 4CI6A 2P9UB 3SMPA 5AQIA 3U9ZA 5AQTA 3FR0A 4MLHA 4AM6A 3A5MC 4A2BA 4RWTA 5BRDA 1J6ZA 1GLCG 2UYTA 3FFKB 1BU6O 1GLFO 1TYQA 1Z05A 3O6WA 3CIPA 4EHUA 1ZXOA 3VF4A 2YHWA 3LDNA 3VEZA 1T6CA 4GY2B 3VEOA 4M63C 4CZJA 2QWQA 4BC4A 3QB0A 1BWFO 3O5BA 3GE1A 3LDOA 2YCHA 1IG8A 3BEXA 4FWPA 5F2RA 1GLEG 3WEEA 3M3ZA 5F1XA 3MN5A 1C0GA 4EAHD 1KAZA 3LDPA 5BN9A 1SZ2A 1GLAG 5JICA 4B1WB 1NGGA 1WUAA 4BRFA 3VEXA 1QQNA 4CZMA 1KAXA 3CJBA 3HTVA 5E84A 3QFUA 2E20A 3KVGA 3R8EA 1ZC6A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4RW9A 3CCMN 4JV5K 1CZ9A 1S1UA 2LJMA 1OZZA 3D2EB 3VENA 3KHWA 1X9WA 3AA4A 5KGWA 4KHNA 1BGXT 3PX4A 3O8MA 2PYJA 4HHFA 1ZBIA 4ISEA 4CBXA 3KOZA 3QIOA 1CZAN 1EXQA 4J8FA 4RTFD 1TL3A 4B1VA 3DLRA 2FBVA 3HL8A 3EEQA 2NY8X 2A7TA 4KI4A 3C6UA 3RSEB 1HJOA 5A2QO 4C8MA 1X1PA 3TAMA 4CEDA 4FJMA 5FPMA 1M1KO 5KRTA 1JJ2M 4KTZA 2LI7A 4CJUA 4CGHA 3M1FA 5CY4A 2IIRA 3WXIA 4E0DA 1XWLA 2NY9X 3EN9A 4KHQA 1I6GA 4CJ7A 3R1XA 2ITGA 2UU9K 2O8BB 3KLFA 5GADP 4AB0A 3D2EA 3ZETA 4PKHA 1P00A 3AVAA 4IJAA 1RBSA 2GUIA 1BCOA 4E19A 5AQHA 4CF2A 4FW2A 1QSLA 2ASMA 4IFVA 2VWJA 3MCPA 3PSIA 4H4OA 4FJJA 1JL1A 3S3OA 5KPRA 4FJGA 4JRQA 1D4XA 1DT9A 4DU3A 4EHTA 4KKOA 4DTRA 4B9UA 3SYZA 4MQ3A 1IKWA 4DTNA 4JI5K 2OPPA 1EX4A 4ID5A 1X3NA 4M41A 4DSJA 2KW4A 4ZTJA 1NH5A 4BR2A 3A8YA 3V81A 4BECA 2ZF5O 4BR5A 4ICLA 4NYNA 2HSTA 2GWKA 3D45A 5JS1A 2QWRA 3HSTB 4QS9A 4KH4A 3T3FA 3HOTA 2P9SB 2K35A 4GV6A 4BRIA 1NG9A 3LDSA 4BRLA 5KTQA 2YEOA 2KHOA 4EFHA 4CFAA 2QW9A 3OHRA 2G8FA 1AHOA 2OYQA 3AY9A 2OTLN 4YNQA 1IKVA 4FJ9A 4LD0A 3CPWM 5KRSA 4XH4A 3TU5A 2OPRA 4F2RA 2HBMA 2P9UA 4O5BA 3UB5A 5BRFA 3FZKA 1OVQA 3KLIA 2E3FA 4AHVA 1NNEA 3TI0A 4CEBA 3O9RA 2HF4A 5EY4A 4CERA 4DUZK 3HT3A 4B3RK 4OKKA 3Q7CA 1UA0A 4WQ4A 5C2FA 2B4JA 1YXQA 4PWDA 3MAQA 2P9SA 3M6GA 4I9QA 1NGAA 3AGKA 5C12A 3TAQA 4BQLA 2Q36A 3I0RA 3LPTA 1J54A 4AM7A 3IDHA 1K9MO 1JLBA 4BREA 4Z0UA 2MN5A 1DGKN 4BRQA 3FGUA 3BY5A 1JCGA 5JENA 3ZEUB 4YOVA 1P90A 4DMNA 3CQYA 1UAXA 1U45A 3LZIA 1TGOA 4ELTA 3Q7BA 2GEMA 3ZX0A 2V7YA 4DV0K 4CF1A 3G4SN 1VRUA 3DI6A 1MU2A 2IVNA 3ZT4A 3L2RA 1ZBHA 3MN7A 1ZVGA 2I7NA 1Q9XA 1VSDA 3EZWA 3GG4A 4B9MA 3OYHA 1O1WA 4GVMA 2V51B 4JLHA 1S72N 4UADE 1NK8A 3F9MA 1RT5A 1QTMA 1RGIA 1OH7A 4BGAA 5EOYA 1NM1A 1U04A 1TYQB 1VSIA 2QI2A 2A41A 3FFIA 4NXNK 3O3HA 4CJ5A 2V52B 3GBTA 4BRDA 4HTUA 4AQYK 1TK8A 4M3YA 4DF8A 3F9KA 3MX5A 3C65A 5LJVA 1WT7A 4E7IA 5J2QA 1NU0A 2O8FA 4M7YA 1WSFA 3SQ1A 4O5FA 2Q31A 1WSEA 3K0SA 3KTQA 3VQQA 4C23A 2O4GA 2MZ0A 1HNIA 3BUZB 3ZEUA 2FF3B 4DR4K 4FYDA 4B8AB 3AO3A 5GINA 3L2WA 3HM8A 2UXDK 1W97L 4RW8A 3C6HA 3DXKA 2KGQA 4F3OA 1RDDA 4B3TK 4AH9A 1QHAA 1WB9A 4M42A 1JKZA 1BIUA 3O3FA 4OJRA 2E88A 4J2DA 5EVZA 1ILYA 3AVHA 3N4PA 3KP1A 3DLGA 2G8IA 4O8UA 3I8DA 2W40A 4DR7K 2C1GA 5GAEP 2HHXA 5SWMA 3HVRA 4GW6A 3MN9A 1C1CA 2IAJA 4XH1A 4DKWA 1E4GT 1JCFA 2P9PB 4EIAA 3U8XA 5KQ8A 2LY6A 5BPLA 3TAGA 4NB4A 4BE0A 4QAGA 4B1UB 4PKGA 4KTQA 3EKUA 4CFDA 1BA0A 1RDCA 3H1QA 1LQQA 4DTUA 4CHPA 4BRCA 2P5OA 2D0BA 3KHYA 4O4GA 3OS1A 3PX0A 4C8LA 1TUUA 2WONA 2E3GA 2Z1HA 1GLDG 4Y0WA 1NJZA 3G71N 4HWIA 3VN5A 4LSLA 1OKJA 3PSMA 2CGKA 1J9AA 4YOUA 1C0TA 1K73O 4ZTFA 4BACA 2HW3A 2E1YA 1S1XA 3CCUN 3SQ2A 5AJ3K 1RBTA 3CW4A 3DM2A 3K5OA 2LJ7A 3JS6A 4FCYA 2F8TA 3ATVA 5FRMA 4IXCA 2P9KB 1BISA 3QESA 4CK3A 2NRWA 3VESA 3CHWA 3T7ZA 2ZD1A 1X9JA 5TKWA 2KLAA 4R79A 5DM7L 3W0LA 3GL1A 2LR3A 2BE2A 4CF8A 1GPTA 5GIOA 1RT3A 1D5AA 3I8BA 4JI8K 3MMVA 3PV8A 1WSIA 2SN3A 1YIJN 2OZSA 2HHIA 4I9LA 3QI7A 2DPNA 1NGEA 4ILGB 2JDQD 4KRFA 1KAYA 1NGJA 1I3AA 1SL1A 1NGDA 3SK3A 1JXEA 2QEXN 1NGHA 1HQEA 4DHYA 2N2QA 3K57A 3D7EO 4DTOA 1YTAA 4Z4IA 1XHZA 1VQ9N 1JCEA 1JXCA 4NCGA 5AQZA 3DLLL 2R7YA 5C15A 4JKCA 1WBDA 3LWLA 2KKZA 4RW6A 1FKPA 1WLJA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4RW9 A;  3CCM N;  4JV5 K;  1CZ9 A;  1S1U A;  2LJM A;  1OZZ A;  3D2E B;  3VEN A;  3KHW A;  1X9W A;  3AA4 A;  5KGW A;  4KHN A;  1BGX T;  3PX4 A;  3O8M A;  2PYJ A;  4HHF A;  1ZBI A;  4ISE A;  4CBX A;  3KOZ A;  3QIO A;  1CZA N;  1EXQ A;  4J8F A;  4RTF D;  1TL3 A;  4B1V A;  3DLR A;  2FBV A;  3HL8 A;  3EEQ A;  2NY8 X;  2A7T A;  4KI4 A;  3C6U A;  3RSE B;  1HJO A;  5A2Q O;  4C8M A;  1X1P A;  3TAM A;  4CED A;  4FJM A;  5FPM A;  1M1K O;  5KRT A;  1JJ2 M;  4KTZ A;  2LI7 A;  4CJU A;  4CGH A;  3M1F A;  5CY4 A;  2IIR A;  3WXI A;  4E0D A;  1XWL A;  2NY9 X;  3EN9 A;  4KHQ A;  1I6G A;  4CJ7 A;  3R1X A;  2ITG A;  2UU9 K;  2O8B B;  3KLF A;  5GAD P;  4AB0 A;  3D2E A;  3ZET A;  4PKH A;  1P00 A;  3AVA A;  4IJA A;  1RBS A;  2GUI A;  1BCO A;  4E19 A;  5AQH A;  4CF2 A;  4FW2 A;  1QSL A;  2ASM A;  4IFV A;  2VWJ A;  3MCP A;  3PSI A;  4H4O A;  4FJJ A;  1JL1 A;  3S3O A;  5KPR A;  4FJG A;  4JRQ A;  1D4X A;  1DT9 A;  4DU3 A;  4EHT A;  4KKO A;  4DTR A;  4B9U A;  3SYZ A;  4MQ3 A;  1IKW A;  4DTN A;  4JI5 K;  2OPP A;  1EX4 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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