4IO8A

Crystal structure of human hsp70 complexed with 4-{(2r,3s,4r)-5-[(r)-6-amino-8-(3,4-dichloro-benzylamino)-purin-9-yl]-3,4-dihydroxy-tetrahydro-furan-2-ylmethoxymethyl}-benzonitrile
Total Genus 117
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
117
sequence length
377
structure length
377
Chain Sequence
KAAAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVALNPQNTVFDAKRLIGRKFGDPVVQSDMKHWPFQVINDGDKPKVQVSYKGDTKAFYPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDRTGKGERNVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVNHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASLEIDSLFEGIDFYTSITRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDLVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Chaperone
molecule keywords Heat shock 70kDa protein 1A variant
publication title Functional analysis of hsp70 inhibitors.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 117
structure length 377
sequence length 377
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-01-07
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 4io8A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4io8A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4io8A03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4io8A04
1BOTO 3EN9A 4IJAA 4PL7A 1XUPO 1KXPA 4JN4A 1HJOA 1WUAA 1S3XA 4IO8A 1YUWA 2Q2RA 5KQDA 1S22A 3BF1A 3UB5A 5AQNA 1KAZA 4H5VA 3C0BA 4A62A 4JHDB 4LC9B 2J4RA 1SZ2A 3LDPA 3JS6A 3H3OB 4FPAA 1LOTB 4BRMA 5ELZA 1H1VA 3GL1A 1X9JA 3ID8A 4FWNA 1HLUA 2QM1A 2VCPA 4PL8A 5BN8A 2A6AA 3VESA 3ENOA 3A8YA 5AQYA 1ZC6A 4C23A 5FPMA 3M1FA 3IUCA 5AQKA 1IG8A 3A5NC 2WUSA 3CETA 3H46O 3ZEUB 1NWKA 3QB0A 2GWJA 2I7PA 3ZETA 3AY9A 4O8KA 4QS9A 3CQXA 2A5XA 3FGUA 3SMPA 5EX5A 1YVNA 4BVPA 5CE3A 1EQYA 2P9KA 1BA1A 2P9SA 4F9OA 3A5OC 4BRGA 4BC2A 3DAWA 1TYQA 4IWVA 4FWKA 3FE1A 5AQFA 2P9NB 4FPBA 3FZHA 2FSJA 4BRKA 2IVPA 2H3GX 1X3NA 4FWOA 4BG8A 3W0LA 3G25A 4IZ9A 2NLXA 5AZIB 3WEEA 2QWPA 1ZXOA 4BGAA 3O5BA 2E1ZA 2CGKA 3U9ZA 3VGKA 4BGBA 4H0PA 5LY3A 3MN9A 2P9LA 1OKJA 3DWLA 4FOEA 5JMVA 3EO3A 2P9PA 4Y0WA 2QWRA 5AQXA 3AAPA 5AQZA 1P8ZA 1X3MA 2IIRA 3HM8A 3MMVA 4FO0A 4M7XA 4A2AA 2ASOA 4ISEA 3WQTA 3DXMA 4BR9A 1GLDG 4DHYA 5F0XA 4CZLA 3VEYA 2A42A 4FWPA 4EHUA 5BPNA 3KVGA 5JLFA 2YHYA 3VF6A 4O5FA 5BRHA 1HPMA 2ZGZA 5ADXA 3VETA 2VYPA 2QWQA 5AQTA 5BRFA 2P9UB 4AM6A 1ATSA 3FFKB 3GE1A 3R6MA 1NGCA 1NGHA 1NGIA 4BRLA 2GWKA 1G99A 5EY4A 4CZGA 5FPDA 5AQHA 1BDGA 4YDUC 4H0OA 5AFUH 4Z94A 4FOIA 3D2EA 2I7NA 2P9IB 3WQUA 4H5NA 3ZX2A 2HF3A 5KPTA 3B8AX 3WXJA 2E1YA 3VEXA 1BO5O 4M63C 3IMXA 3CJBA 1DEJA 3H45C 4FWSA 2CGLA 4CD3A 1Z05A 3H6EA 2YHXA 2OANA 1RFQA 3CI5A 1YXQA 3D2FA 2IVNA 4FWMA 1NGBA 2FSKA 2YJEA 2E8AA 4RTFD 4FSVA 1C0FA 3QMLA 5KQ8A 4GNIA 1NBWA 4E1JA 4BRDA 3L4IA 1U2VB 3SK3A 4B1ZA 1D4XA 2P9NA 4CJ7A 5AQQA 3F9MA 4YDUA 3DXKA 3O08A 3MK6A 2V52B 2PBDA 4MLEA 5FPNA 2UYTA 3R9PA 1NGGA 5BPMA 5AQVA 2ZWHA 3FZMA 4NO7A 3P4IA 2ASPA 2Q0UA 2AA4A 3UKUA 3CIPA 4BRAA 2QWMA 3HTVA 3FZLA 1MWMA 2CH6A 4BREA 4B1XB 2YCHA 2A3ZA 3GBTA 2Q1NA 4EIAA 3MCPA 4BQZA 3FLCO 1LCUA 4FWLA 3VGLA 3CJ7A 3R8EA 1Y64A 1T6DA 2DPNA 5LJWA 4BRHA 2FXUA 1T44A 1NMDA 4DB3A 3O6WA 1KAYA 4FL9A 1Z6RA 3ULEB 4I6MA 3LM2A 3O8MA 3A5MC 4BR4A 2FSNA 2W40A 5E26A 1C0GA 3SLCA 3LDNA 5JLHA 2QWOA 4H0VB 4BG9A 4BRPA 3IDHA 3HBTA 4H5RA 1NLVA 2GELA 4MO5A 3S41A 4H5TA 2ZF5O 5AQOA 4ISGA 3BP8A 5AZJA 3RSEA 1GLAG 2E2PA 3QBXA 3MN6A 4K43A 4MLHA 3UE5A 1HUXA 4BC5A 1NGAA 1QQMA 3ATUA 1ATNA 3QFPA 3O4WA 5AFUA 3U8XA 1HKGA 4HTLA 4DQ8A 4EFHA 2P9IA 3UKRA 1JCEA 1Q18A 4K25A 4B1UB 3J8AA 2V7ZA 2EWSA 2VWBA 4GY2B 2F9WA 5AQGA 5TKYA 2F9TA 1CZAN 2HF4A 3GDQA 3BEXA 2E88A 4H0TB 5BRDA 4PKGA 1E4FT 2ASMA 5EOYA 3FR0A 2HOEA 3IFRA 3EKUA 3VOVA 3ZETB 4B1YB 3I8BA 3O80A 5I9EB 1DKGD 3OHRA 4CBWA 3LDQA 2BUPA 1ZBSA 2CH5A 2P9KB 2YJFA 4BRIA 1GLCG 3VGMA 4H0YB 5AQIA 1TYQB 4CBXA 3FZFA 1NGJA 5BREA 1U2VA 4JHDA 4BR0A 1GLFO 3L0QA 2KHOA 3QFUA 1TUUA 2FF6A 2E2OA 2Q97A 4BROA 3HSCA 4BQLA 3CERA 1BU6O 1BWFO 5AQUA 4EAHD 1NGEA 2YI1A 5KPRA 3WEEB 4FWRA 4DCHA 2NZTA 1GLLO 3SJHA 2Q36A 4WQ4C 5EXWA 4BC3A 2P9LB 3ZX3A 4NB4A 4CZIA 1ESVA 1NM1A 3HZ6A 1GLEG 3ZEUA 1WOQA 1V4SA 2D1KA 3U4LA 5AQMA 4A61A 4CZKA 1QZ6A 4CI6A 3O1WA 3DXMB 3VEZA 3EL2A 1QQNA 1R59O 1XC3A 3LDOA 5B8HA 4JNEA 4BR7A 1BUPA 3QBWA 2W41A 3GOIA 1JCFA 5ADXH 1ATRA 5F2RA 2GEMA 1HX1A 1V4TA 2BTFA 4M7YA 1QHAA 4IJNA 5AZIA 2D0PA 4WQ5C 4RWTA 1BA0A 5AQPA 2IVOA 2D0OA 5BPLA 3BF3A 2V7YA 4FWQA 4JD2B 4CD1A 4WQ4A 4CZJA 3D2EB 4QS8A 4BC4A 3H1QA 5JICA 4HWIA 3LM9A 4AM7A 3MN7A 4J8FA 4MO4A 3I33A 3VERA 4CZFA 1MDUB 4BRCA 3C7NB 4QS7A 2A41A 4XH1A 4PKHA 3SMSA 3ENHA 4XEIA 1MA9B 1K8KB 5FPEA 1HKCA 1NGDA 3M6GA 5KPZA 4BRNA 3AARA 3U9DA 3VENA 2YHWA 2HMPA 1J6ZA 3D2FB 3TPQA 2NRHA 3CJAA 3DJCA 2GUPA 2Q31A 5AQSA 1DGKN 3KHYA 4BRQA 3A5LC 1HKBA 4PKIA 4JAXA 2P9UA 4L3QA 2QWLA 3WXKA 3AAQA 1RDWX 3JXUA 3WXIA 4WQ5A 3GG4A 2CGJA 1QQOA 4IXCA 3DXKB 1GLJO 3EZWA 4CZEA 4RCHA 4XH4A 4BRFA 3WT0A 3ATVA 4K42A 2ITMA 3VF2A 1U6ZA 1YAGA 2QXLA 5AQLA 4H03B 3HI0A 3WXLA 2E20A 2D4WA 4BR2A 3VF4A 3H1VX 3UKUB 1T6CA 3TU5A 3O1BA 4BR5A 2QWNA 3CHWA 4CZHA 1E4GT 5AQJA 3FZKA 4BVOA 4WYBA 4B9QA 3EKSA 1SAZA 3MN5A 2P9SB 1TUYA 2A40A 3MDQA 3VEWA 4H0XB 4I6MB 5BN9A 4A2BA 5AQRA 3VPZA 2Q0RA 3D7EO 3WUHA 3VEVA 4H5WA 1MWKA 3CJCA 2AP1A 2PAVA 1KAXA 4B1WB 2FLOA 3A0IX 1JCGA 2ZGYA 5AZJB 3RSEB 3VEOA 4K41A 4EHTA 3M3ZA 5AR0A 4XH5A 3BUZB 4CBUA 4JD2A 2P9PB 3QICA 5F1XA 5AQWA 1IJJA 5LJVA 4CZMA 5BR9A 3UKRB 2V51B 1QZ5A 1SQKA 4B1VA 3QDKA 4KBOA 3ZX0A 2FF3B 3C7NA 2E2NA 1BG3A 4ISFA 3W3DA 3L6QA 3CQYA 3ULEA 1GLBG 1K8KA 3H3NO 2GTDA 3CJ1A 5E84A 3CJ9A 1NGFA 3KZBA 1XQSC 3LDLA 3LL3A 1RGIA 2QW9A 2E2QA 5EVZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3EN9A 1XUPO 1PX9A 1I2UA 2PYJA 2HVIA 4CGHA 3TTDA 4IO8A 5KQDA 3SQ0A 3D6RA 2OA8A 3KKSA 3NMUA 1KAZA 4H5VA 1GPSA 1MR4A 1WWNA 1XWLA 2RPIA 3DLRA 3ID8A 4FWNA 3DOKA 3LAKA 3VQ9A 4DQPA 1BRZA 3AGKA 3A8YA 4CE9A 2LY6A 3A5NC 5KK4A 4B9LA 2MBKA 1LWEA 3SUPA 1IKYA 2VY6A 1W0HA 4DSJA 4BVPA 2JLEA 2QK9A 4DV6K 4BRGA 4X65K 3DAWA 3ZSZA 4IWVA 3CC4N 5AQFA 2YC1C 1BCOA 4FPBA 4NCAA 1WSFA 1DJTA 1MYNA 1X3NA 2H3GX 4JYAK 2F8SA 4YFUA 3G25A 1VQ9N 2KJAA 3HL8A 5SWMA 3SQ4A 1CZBA 4A5AA 2QWPA 1VSEA 1Q86O 2O8EA 4BGAA 4DLEA 4BWJA 3MN9A 4BE2A 1SL2A 5JMVA 3C6AA 2P9PA 2P1JA 4E19A 4DTSA 4JKGA 4IFVA 4M7XA 3SPZA 4C8KA 2ASOA 4BDYA 1ICAA 3C6HA 2GMOA 3CG7A 4E72A 4DHYA 1VAZA 3BZCA 1T7AA 1LQQA 3CMAN 1RBUA 5JLFA 3VF6A 4QOZB 1HPMA 2NY8X 2Z1GA 4CF8A 1OH5A 2QWQA 2UXDK 1AYJA 4AM6A 3AVHA 1ATSA 1Z26A 2D0CA 4UADE 1VQMN 2N2RA 2ITGA 3SBTA 2GWKA 2A1SA 5AQHA 4DV3K 2FBVA 3RMDA 3PUFA 5AFUH 4Z94A 4FOIA 5C42A 5GAGP 2B3CA 1EWQA 1EO1A 4PUOA 2G8VA 2E1YA 1VQPN 1BL3A 1BO5O 4M63C 4BEBA 4CJ4A 4LH4A 3CJBA 4JEPA 5CYQA 3BZKA 3SI6A 2LR3A 2CGLA 4FYDA 2DFFA 2YHXA 2OANA 1NJZA 4Z4CA 5M1KA 3KLFA 4CHQA 3K57A 2VQEK 1YXQA 3LANA 4FJKA 4Q5VA 2P51A 2E3GA 4FSVA 4CEBA 4Z4GA 4CEZA 5JS1A 1NBWA 3QO9A 1I6FA 4BRDA 3L4IA 4NXNK 3SK3A 5AQQA 1BGXT 4AF1A 4FW1A 4E1NA 4YDUA 3DXKA 1YHQN 4W5QA 3KJVA 3NF9A 1VHXA 2PBDA 3R9PA 3THWB 5AQVA 3NGIA 4JS5A 3PSIA 4JI7K 4M3TA 4FLXA 4JKCA 2ASPA 3HPHA 4OGEA 1EX4A 2Q0UA 3LPUA 2AA4A 4BECA 3THYB 4M42A 4BRAA 3KK1A 3FZLA 2CH6A 1LW0A 4CEDA 4UAFE 1WNSA 2A3ZA 3GBTA 1HNXK 4FZZA 3TAGA 5FDLA 3LP0A 2E0HA 4BQZA 3O9TA 3VGLA 4CK3A 3RMBA 2O8BA 2DPNA 4IFEA 4BRHA 2FXUA 4MDAA 3O6WA 3CCSN 4NCGA 1JZBA 3C6UA 3LM2A 3CYMA 4J2BA 4JKBA 2FSNA 2W40A 3SLCA 2IAJA 4BG9A 1U4BA 3OYFA 3HBTA 1S1UA 2Z1HA 2D0AA 3UIQA 3HJFA 2WBNA 2B68A 4H5TA 4N41A 2E2PA 2BGGA 3MN6A 4B3TK 4MLHA 3OS1A 3QEWA 4IOXA 3AO1A 2YNIA 4LD0A 3KK2A 1KFDA 3ATUA 1ATNA 5AFUA 3NH1A 4G9ZA 1HPZA 1LQHA 4HTLA 3U6FA 4V19S 1ITGA 1REVA 5T7BA 5J2MA 2LJ7A 2VWBA 2F9WA 4B3OA 3O3GA 4DQIA 1CZAN 2HF4A 1RBTA 2E88A 4E7IA 3CCRN 4H0TB 5BRDA 4K8XA 1ILYA 4PKGA 1BHLA 3V9ZA 2HOEA 3IFRA 1T03A 1RT4A 3O9QA 3O80A 1EXQA 3L2UA 3LDQA 4IKFA 4WE1A 4IFYA 4DU3A 4DR1K 3VQQA 2E5LK 5BREA 1SL1A 1X9WA 4JHDA 3OYBA 1NK5A 2IGIA 4FVMA 3QFUA 2R7YA 4ID1A 2YBRC 1BWFO 4J2DA 2YI1A 5KPRA 2D0BA 2HBKA 4JKDA 3M8PA 1RT3A 3SJHA 1R0AA 2Q36A 3WNFA 1Q9XA 5EXWA 4C8NA 4FJLA 1YIJN 1ESVA 5CHIA 4DTJA 3L3UA 4CGJA 4KTQA 1V4SA 2D1KA 2HNZA 5HRRA 4DF8A 3PY8A 4DSKA 3IAYA 3OBYA 3DRRA 1TI5A 5B8HA 2YNFA 4BR7A 1BUPA 4WCEL 1VQ6N 3AA5X 4N5SA 5ADXH 1ASUA 4WFBL 3I8DA 2PYLA 4CIFA 2FBYA 3MCAB 4DS4A 4IJNA 5AZIA 3OS0A 1ZYVA 2D0PA 1SKRA 3OYGA 1UAXA 1B9DA 1RBRA 4FLUA 1N32K 2YX6A 3D2EB 3V6DA 4QS8A 1QSSA 4BC4A 4DLGA 4AM7A 3ZT3A 5TKWA 3DI6A 3CCVN 4K0KK 3J80O 3THVA 1EKEA 3OJSA 2JGUA 2O8DA 3SMSA 1NJIO 3ENHA 1NKBA 1NGDA 4EP5A 5EU7A 4BRNA 3VENA 3NAEA 4E7LA 1J54A 3L8BA 3ULDA 1ASVA 2NRHA 1BISA 2OTJN 4FK0A 2BH1A 4KFBA 1VQ4N 1RDWX 3V4IA 4C8LA 3GG4A 4KHUA 3ZT1A 4JV5K 2K35A 3VQEA 4FJMA 3ALYA 3IRXA 1GLJO 2HBLA 3N4PA 3PX4A 3O4QA 2HHTA 1SN1A 3ATVA 3KLGA 3EE9A 1U6ZA 1YAGA 2QXLA 3G6EN 4G1QA 2D4WA 3ITHA 4BR2A 4KKOA 3UKUB 4FM2A 4Z4IA 4FLYA 2RE2A 1T7EA 1JL2A 1XHZA 2KKZA 1XNQK 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3EN9 A;  1XUP O;  1PX9 A;  1I2U A;  2PYJ A;  2HVI A;  4CGH A;  3TTD A;  4IO8 A;  5KQD A;  3SQ0 A;  3D6R A;  2OA8 A;  3KKS A;  3NMU A;  1KAZ A;  4H5V A;  1GPS A;  1MR4 A;  1WWN A;  1XWL A;  2RPI A;  3DLR A;  3ID8 A;  4FWN A;  3DOK A;  3LAK A;  3VQ9 A;  4DQP A;  1BRZ A;  3AGK A;  3A8Y A;  4CE9 A;  2LY6 A;  3A5N C;  5KK4 A;  4B9L A;  2MBK A;  1LWE A;  3SUP A;  1IKY A;  2VY6 A;  1W0H A;  4DSJ A;  4BVP A;  2JLE A;  2QK9 A;  4DV6 K;  4BRG A;  4X65 K;  3DAW A;  3ZSZ A;  4IWV A;  3CC4 N;  5AQF A;  2YC1 C;  1BCO A;  4FPB A;  4NCA A;  1WSF A;  1DJT A;  1MYN A;  1X3N A;  2H3G X;  4JYA K;  2F8S A;  4YFU A;  3G25 A;  1VQ9 N;  2KJA A;  3HL8 A;  5SWM A;  3SQ4 A;  1CZB A;  4A5A A;  2QWP A;  1VSE A;  1Q86 O;  2O8E A;  4BGA A;  4DLE A;  4BWJ A;  3MN9 A;  4BE2 A;  1SL2 A;  5JMV A;  3C6A A;  2P9P A;  2P1J A;  4E19 A;  4DTS A;  4JKG A;  4IFV A;  4M7X A;  3SPZ A;  4C8K A;  2ASO A;  4BDY A;  1ICA A;  3C6H A;  2GMO A;  3CG7 A;  4E72 A;  4DHY A;  1VAZ A;  3BZC A;  1T7A A;  1LQQ A;  3CMA N;  1RBU A;  5JLF A;  3VF6 A; 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