4KBOA

Crystal structure of the human mortalin (grp75) atpase domain in the apo form
Total Genus 105
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
105
sequence length
376
structure length
374
Chain Sequence
AVVGIDLGTTNSCVAVMEGKQAKVLENAEGARTTPSVVAFTADGERLVGMPAKRQAVTNPNNTFYATKRLIGRRYDDPEVQKDIKNVPFKIVRASNGDAWVEAHGKLYSPSQIGAFVLMKMKETAENYLGHTAKNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGQISGLNVLRVINEPTAAALAYGLDKSEDKVIAVYDLGGGTFDISILEIQKGVFEVKSTNGDTFLGGEDFDQALLRHIVKEFKRETGVDLTKDNMALQRVREAAEKAKCELSSSVQTDINLPYLTMSGPKHLNMKLTRAQFEGIVTDLIRRTIAPCQKAMQDAEVSKSDIGEVILVGGMTRMPKVQQTVQDLFGRAPSKAVNPDEAVAIGAAIQGGVLA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Signaling protein
molecule keywords Stress-70 protein, mitochondrial
publication title Crystal structure of the nucleotide-binding domain of mortalin, the mitochondrial Hsp70 chaperone.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 105
structure length 374
sequence length 376
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-04-23
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 4kboA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4kboA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4kboA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4kboA04
3BP8A 2FSNA 1DKGD 2QWOA 2PBDA 4BC5A 3LDLA 1MWMA 4BRHA 5KQDA 5KQ8A 3U8XA 4CBUA 3DXMB 2GUPA 3VERA 2Q1NA 2YHWA 3FLCO 3SMSA 1Y64A 1NGDA 2E2NA 1EQYA 2FF6A 4BG9A 2IVOA 5AQMA 1CZAN 4BQZA 3CHWA 5LY3A 1XC3A 5BN8A 3ATUA 2FSKA 1X3MA 2A5XA 5BPLA 5AZIA 1BA0A 3AAPA 4CD3A 4IJNA 1HKCA 2QM1A 4H5VA 4H5WA 2QWLA 4H5TA 3MN6A 1X9JA 1R59O 4FOEA 3HI0A 3J8AA 5AQYA 3HSCA 2P9PA 3ZEUA 3LDPA 3D7EO 2AP1A 2H3GX 5EVZA 4K43A 4B1WB 4H03B 4O5FA 3I8BA 1QHAA 3WQUA 2YJEA 5FPDA 3CJ7A 4A62A 4YDUA 1YAGA 3FZFA 3UKUA 4H5RA 1Z6RA 4JHDA 3KZBA 4EAHD 3M6GA 3MCPA 3ZX3A 3ZETB 4FSVA 2QWQA 2Q2RA 3H3OB 3WEEA 4B9QA 3CJCA 3H1VX 3VGLA 2P9UA 1IJJA 3VPZA 3R9PA 3CQYA 4YDUC 1U2VA 2F9TA 1IG8A 5EX5A 4CD1A 2V51B 2A40A 1MDUB 1ATNA 1S3XA 1V4TA 2YJFA 2D0PA 3SMPA 2A3ZA 3LDNA 5BRHA 1ZXOA 2VYPA 4BRIA 3GBTA 2GWKA 3AAQA 2J4RA 1RDWX 4XEIA 1S22A 4CZEA 2W41A 3U9DA 4MO4A 4JD2B 1GLBG 3SK3A 1D4XA 3ATVA 1HJOA 3EN9A 4JN4A 5ADXH 2D0OA 1U6ZA 4CZJA 1NBWA 3FR0A 1BA1A 1NMDA 3JXUA 1QZ6A 4A2BA 1JCFA 2P9PB 3ZEUB 3QFUA 3AY9A 1E4GT 2V52B 3SJHA 2CGLA 4PKGA 3VGKA 3EKSA 1C0FA 3H3NO 3QFPA 1NGIA 2ZF5O 4BROA 2P9SA 5AQOA 5AQQA 5AZJA 1NGFA 3L4IA 1T6CA 5JICA 1DGKN 4JHDB 3HM8A 3BUZB 2HMPA 3CJ9A 3GL1A 1G99A 4DHYA 4PL7A 4C23A 1DEJA 4H0VB 3CERA 4H0TB 3VEWA 5LJVA 4DB3A 1XQSC 2P9UB 2Q0RA 5BREA 3ULEA 3VF2A 1QQOA 1SQKA 3A8YA 3GDQA 4HWIA 5B8HA 2IIRA 1BUPA 2FLOA 1U2VB 3QICA 3TPQA 5FPMA 2A6AA 2NRHA 4GY2B 4BRQA 2FXUA 5EXWA 3UB5A 1T44A 4BQLA 2E2PA 3O1BA 1GLCG 3KVGA 4BRPA 1NM1A 1Z05A 1HPMA 3MK6A 2IVNA 3DAWA 1GLJO 4H0YB 1QQNA 3D2FA 4B1VA 3VEXA 4XH5A 4J8FA 3VF6A 4A61A 1GLLO 4MO5A 2E20A 2YHYA 2IVPA 2WUSA 5EY4A 5AQZA 3WXJA 4BR0A 2HF3A 3KHYA 4FPBA 3CJAA 3VENA 3VEYA 1ATRA 4B1ZA 3FGUA 3FZHA 2EWSA 2GEMA 2E88A 2P9SB 4FWSA 5BN9A 5AZJB 3MN7A 3A5NC 4H0PA 4BRGA 5E26A 2V7ZA 4BR2A 4BVPA 1K8KA 2Q31A 1ZC6A 5LJWA 4CBXA 5AQHA 4XH1A 3H1QA 2E1YA 2NLXA 5AQUA 1BU6O 5EOYA 1J6ZA 3QB0A 4K42A 3IDHA 3HZ6A 5AQNA 1NGGA 4BGAA 1HLUA 2P9IA 3CETA 4FWMA 5F1XA 4AM7A 4B1XB 4CBWA 2KHOA 3HTVA 3U9ZA 1ZBSA 3L6QA 1TYQA 3LM2A 3O6WA 3R8EA 4BVOA 4E1JA 3MMVA 4JAXA 5AQPA 4IZ9A 4WYBA 5KPZA 1NGCA 1E4FT 1JCEA 3O5BA 2E8AA 4WQ4A 4CJ7A 4RWTA 3D2FB 3UKRA 1MWKA 1H1VA 4L3QA 4NB4A 4EIAA 3HBTA 5AQGA 1YXQA 5AQIA 3B8AX 5AFUA 4PKHA 3EO3A 2PAVA 3FZMA 4K41A 2E2OA 3BEXA 4BRNA 2HF4A 2NZTA 5AZIB 3ENHA 1NGEA 5AQKA 1RFQA 2FSJA 3SLCA 2DPNA 3FZKA 2QWMA 1HKGA 3CJBA 1KAZA 2A41A 3S41A 4BC4A 3AARA 3M1FA 3CJ1A 5I9EB 1K8KB 4F9OA 5FPEA 3DXKA 4BRCA 4ISEA 4M7XA 2I7NA 3RSEA 4CZGA 1C0GA 4BR4A 3ZX2A 2BUPA 1T6DA 1P8ZA 4FPAA 3W0LA 5F0XA 2P9IB 3UKUB 1NWKA 4BRLA 5FPNA 3WXIA 1NGHA 1NGBA 1TYQB 2QWPA 2W40A 4B1YB 4A2AA 4ISGA 2CGJA 2UYTA 4FWLA 1BOTO 3WEEB 3O08A 4BREA 4BRDA 1HKBA 4JNEA 4Y0WA 3LDQA 1Q18A 3L0QA 5AQVA 3O8MA 1HX1A 4CZFA 2AA4A 3C0BA 3UKRB 3MN5A 4FWQA 3CIPA 2P9NA 1GLEG 3QBWA 1BWFO 1KXPA 2BTFA 3OHRA 3ID8A 3IMXA 2ASPA 3LM9A 3TU5A 4CZIA 2GELA 4XH4A 5BR9A 1KAYA 4QS7A 4I6MA 1QQMA 2ZGYA 4QS9A 5F2RA 3F9MA 2F9WA 5ADXA 3VETA 3A0IX 3ZETA 1NGJA 3DXKB 4HTLA 1ESVA 2YHXA 3GE1A 3RSEB 3EKUA 3WUHA 5BPMA 3MDQA 1X3NA 3VEZA 3VF4A 4B1UB 3D2EA 2GWJA 3WXLA 1OKJA 4H0OA 4FL9A 1NGAA 5AQTA 2OANA 3A5MC 4QS8A 3VEOA 2FF3B 2ASOA 2P9KA 4IXCA 4WQ5A 2QWNA 3O80A 2Q0UA 5AFUH 1WOQA 1XUPO 3QBXA 5JLFA 2GTDA 5AQSA 4AM6A 3P4IA 4DQ8A 3A5OC 3R6MA 3JS6A 1BO5O 3U4LA 3BF3A 4H0XB 1TUUA 3ULEB 4FWPA 2D4WA 3VESA 3C7NA 1QZ5A 3GOIA 4KBOA 4MLEA 4JD2A 4PL8A 4WQ5C 5KPRA 4BRFA 2A42A 3UE5A 2P9NB 5E84A 2ASMA 5AQFA 4FWRA 1WUAA 4CZLA 4BRAA 1NLVA 1SZ2A 2Q36A 2E1ZA 4NO7A 2CH6A 3VEVA 5JLHA 3WXKA 4O8KA 1JCGA 4IWVA 3IFRA 1ATSA 3W3DA 4I6MB 2D1KA 3FE1A 4BG8A 4BC2A 4RCHA 4CZKA 4H5NA 4BR7A 2V7YA 2P9LA 4EHUA 1YUWA 4CZMA 3FFKB 2QXLA 4Z94A 2I7PA 3WT0A 4EHTA 3CI5A 1KAXA 4DCHA 3A5LC 3ENOA 3D2EB 2ZGZA 4WQ4C 3ZX0A 4BRKA 2QW9A 3DWLA 2P9KB 3O4WA 3DJCA 2E2QA 4FO0A 5CE3A 4LC9B 4BR9A 5BRFA 3LDOA 1BG3A 3CQXA 3QMLA 3DXMA 1LOTB 3MN9A 5AQXA 4GNIA 3C7NB 5AQLA 4FOIA 4K25A 5AQRA 3EL2A 5AR0A 3G25A 4RTFD 3VGMA 3M3ZA 2VCPA 4BGBA 4M63C 3I33A 1YVNA 4PKIA 5ELZA 5TKYA 5AQWA 4FWKA 3H6EA 3IUCA 5BRDA 1RGIA 2ZWHA 4CI6A 4IO8A 5AQJA 2Q97A 3EZWA 4EFHA 2QWRA 1BDGA 1TUYA 4CZHA 2YI1A 1LCUA 4BC3A 4BR5A 3FZLA 1GLDG 4M7YA 3O1WA 2YCHA 3LL3A 4MLHA 4FWOA 4FWNA 3H45C 3QDKA 5KPTA 2P9LB 1HUXA 4IJAA 2ITMA 4BRMA 2HOEA 3GG4A 3BF1A 2VWBA 5JMVA 2CH5A 4ISFA 2CGKA 1V4SA 3H46O 3VOVA 5BPNA 1SAZA 1MA9B 3WQTA 1GLAG 1GLFO
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5SZTA 2PBDA 3M8PA 4BRHA 5CZ2A 4E7LA 3U8XA 4YOWA 4DQRA 3OVNA 4LF8K 3AA2A 3FLCO 2FBYA 2VG7A 1Y64A 4DTNA 3V9XA 1CN2A 3VQ9A 2Y1JA 3KOWA 1C0MA 3CPEA 1N36K 4DF4A 3VA3A 5HRRA 3CM5A 4LF4K 3QINA 5LY3A 3K0SA 1WBBA 3NVKA 2YIOA 4YOUA 2A5XA 1GOBA 2LR3A 5D3GA 1HKCA 1JKHA 3IKMA 4IOXA 3QEIA 2LN8A 1VSIA 1JZBA 3OYBA 4K8ZA 4CJ3A 1JXEA 3HSCA 3NF7A 5C2DA 4CE9A 3LDPA 2FC0A 4YORA 3D7EO 5EVZA 4JI0K 3RMDA 2O8CA 2YJEA 4O8UA 4A62A 4QAGA 1YAGA 3AVCA 4EP5A 3KIOA 1Z6RA 4JHDA 3KZBA 3M6GA 2R7YA 3ZX3A 1S9GA 2G8KA 2ZJQL 2QWQA 3H3OB 2E4LA 4DKWA 4DWIA 3T7ZA 3THYA 4IOAL 5C0YA 3OJUA 3PX4A 3MX5A 3OS0A 2HSTA 4J2DA 2E6LA 1B7DA 4M3UA 1DT9A 3HVRA 2WFBA 1OVQA 2A40A 4U67L 1MDUB 1RTJA 2HHXA 3OYJA 2A1RA 2D0PA 3VQ8A 1I3AA 4KTWA 3SUOA 4ZTFA 1PE4A 4BRIA 3OYEA 1TGOA 2GBZA 1WT7A 3U9DA 5FLXO 4MO4A 2KGQA 2G8FA 4B9SA 1YHQN 1D4XA 3ATVA 1HMVA 1NJIO 3ZSYA 4CZJA 2OA8A 4OKEA 4XJXA 1AHOA 1NMDA 3OS1A 2YV0X 1WB9A 4CFAA 1U47A 1JCFA 3AY9A 1VQON 2CGLA 5CHIA 2O8CB 3EKSA 4Z4IA 1C0FA 4V19S 2P9SA 4CJRA 3QETA 4KHWA 1UGLA 3BDPA 2B5JA 2YC1C 3H08A 3NH1A 1T6CA 5JICA 4JHDB 2QA4N 1P90A 3AVJA 4BWJA 4JI8K 1G99A 4DHYA 4PL7A 1RCHA 2IDOA 4H0VB 3AVMA 3THYB 3NFAA 5M1QA 3ZSZA 1K8BA 4H0TB 4CEEA 3E9LA 1QQOA 2GV9A 1ITGA 2HNDA 1VRTA 3TPQA 4LFCK 2HVIA 4FK0A 3HJFA 3KVGA 2C1GA 1TKTA 2HBLA 3AVLA 5DMRA 4JK9A 4UQGA 3TTCA 3CQ8A 1GLJO 4DTUA 3KHWA 1KVBA 4DR4K 4DFPA 4EZ6A 3D2FA 4B1VA 4IEEA 4AHCA 4J8FA 4A61A 5A2QO 3KD1E 2WUSA 5EY4A 4R5PA 4BR0A 1I2VA 3VN5A 3CG7A 1ATRA 4N76A 3IRXA 3PSMA 4JKEA 2GEMA 2P9SB 2RE2A 4CVNE 1LAVA 1W7AA 1HNXK 3MN7A 4H0PA 1IKYA 2UXDK 1VSEA 1P00A 1QVGM 2Q31A 3L2QA 4FZXC 4DQIA 3O3GA 2YEOA 1SL2A 4BACA 2NLXA 1BCGA 2QKKA 3S3OA 1QS4A 5AQUA 3N4PA 1C56A 4K42A 3E66A 1TAQA 4C8MA 4X66K 3K5MA 4BGAA 1NGGA 4GV3A 1JLQA 2P9IA 1ASUA 3CETA 4C1NK 3L2VA 3L8BA 4Q0BA 1LWFA 4CBWA 1T7PA 2QEXN 2KHOA 3HTVA 4LSNA 3LM2A 3P31A 3O6WA 3PY8A 1I94K 4E1JA 4LF5K 3NF8A 2KFZA 1NGCA 5HOOA 1LV5A 1BQMA 1EP4A 4A5AA 3CXCM 4FJJA 4PWDA 4CJ7A 3D2FB 3UKRA 3RMCA 4NB4A 3CM6A 3HBTA 1YXQA 4KKOA 4KH4A 5AFUA 4DS4A 1EWQA 2E2OA 2KFNA 4LF9K 5AZIB 5FRMA 5AQKA 2NRVA 4DSEA 3FZKA 1HKGA 2X78A 1BQNA 2NRZA 1B9DA 4C8LA 3L2UA 3CJ1A 5I9EB 1N4NA 5AJ3K 2HHUA 3E9PA 4DV4K 4DSKA 2M8BB 3F5TA 2I7NA 3RSEA 1BISA 4OPKA 4GKKK 1C0GA 5H1SQ 2BUPA 4DR3K 1OH8A 1T6DA 1D9FA 1P8ZA 2JWKA 3AVNA 4FJ5A 5F0XA 2P9IB 5C24A 1NJYA 1RT3A 1NGBA 3TTFA 3HK2A 4B1YB 2WC9A 1BOTO 4BREA 3DLLL 4JNEA 4DU1A 3QESA 1Q18A 3SF4D 4CGFA 1PTXA 2RPIA 2OTLN 2HMIA 3PO4A 3UKRB 3C94A 4FWQA 3LDSA 3CIPA 4CF9A 1RBSA 2P9NA 2GUIA 2HNZA 4DV0K 1TI5A 3QBWA 3SQ4A 3O9UA 1NK7A 3ID8A 4O55A 2YBRC 5BR9A 5GAGP 1L4VA 5CYMA 3PV8A 3EY1A 5F2RA 4FM1A 4FJGA 5ADXA 4E7HA 4UADE 4BE2A 1YJNN 2JWLA 3ISNC 2VWKA 4KTQA 3RSEB 3WUHA 5BPMA 1DTQA 1NK4A 2FBVA 2DTUA 1L3VA 1OKJA 2PFUA 2OANA 4WQ5A 3F9KA 4J2EA 3CCEN 3QBXA 2O8FB 1WN7A 3P4IA 4DQ8A 1EXQA 1FKOA 2D0CA 4LH4A 4JK7A 1RBVA 3A5OC 3QIPA 4CJ4A 5DM6L 1SN1A 3LP2A 1VQ7N 1K73O 4B9NA 2O8EB 4OGEA 4CEAA 4B3TK 3C7NA 3GOIA 3N4QA 4BRFA 5JENA 2P9NB 5E84A 2ASMA 1VQPN 3NE6A 4O5BA 1WUAA 4CHYA 4IEIA 2BH1A 3O3FA 2E1ZA 2CH6A 1VQ5N 3IFRA 4GW6A 1U49A 3NMUA 1ATSA 2HNYA 3HRGA 2D1KA 4CZKA 4JI3K 2XHBA 2Y1IA 4CGGA 2V7YA 1S1VA 2P9LA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 5SZT A;  2PBD A;  3M8P A;  4BRH A;  5CZ2 A;  4E7L A;  3U8X A;  4YOW A;  4DQR A;  3OVN A;  4LF8 K;  3AA2 A;  3FLC O;  2FBY A;  2VG7 A;  1Y64 A;  4DTN A;  3V9X A;  1CN2 A;  3VQ9 A;  2Y1J A;  3KOW A;  1C0M A;  3CPE A;  1N36 K;  4DF4 A;  3VA3 A;  5HRR A;  3CM5 A;  4LF4 K;  3QIN A;  5LY3 A;  3K0S A;  1WBB A;  3NVK A;  2YIO A;  4YOU A;  2A5X A;  1GOB A;  2LR3 A;  5D3G A;  1HKC A;  1JKH A;  3IKM A;  4IOX A;  3QEI A;  2LN8 A;  1VSI A;  1JZB A;  3OYB A;  4K8Z A;  4CJ3 A;  1JXE A;  3HSC A;  3NF7 A;  5C2D A;  4CE9 A;  3LDP A;  2FC0 A;  4YOR A;  3D7E O;  5EVZ A;  4JI0 K;  3RMD A;  2O8C A;  2YJE A;  4O8U A;  4A62 A;  4QAG A;  1YAG A;  3AVC A;  4EP5 A;  3KIO A;  1Z6R A;  4JHD A;  3KZB A;  3M6G A;  2R7Y A;  3ZX3 A;  1S9G A;  2G8K A;  2ZJQ L;  2QWQ A;  3H3O B;  2E4L A;  4DKW A;  4DWI A;  3T7Z A;  3THY A;  4IOA L;  5C0Y A;  3OJU A;  3PX4 A;  3MX5 A;  3OS0 A;  2HST A;  4J2D A;  2E6L A;  1B7D A;  4M3U A;  1DT9 A;  3HVR A;  2WFB A;  1OVQ A;  2A40 A;  4U67 L;  1MDU B;  1RTJ A;  2HHX A;  3OYJ A;  2A1R A;  2D0P A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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