5AQGA

Fragment-based screening of hsp70 sheds light on the functional role of atp-binding site residues
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
381
structure length
381
Chain Sequence
MSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title A fragment-based approach applied to a highly flexible target: Insights and challenges towards the inhibition of HSP70 isoforms.
pubmed doi rcsb
molecule keywords HEAT SHOCK COGNATE 71 KDA PROTEIN
molecule tags Chaperone
source organism Homo sapiens
total genus 120
structure length 381
sequence length 381
chains with identical sequence C, E
ec nomenclature ec 3.6.3.51: Transferred entry: 7.4.2.3.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5aqgA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqgA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqgA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5aqgA04
1NMDA 2CGLA 4B1XB 4KBOA 3WXLA 5AZIA 5BREA 1U2VB 4JHDB 2P9PB 4QS8A 3J8AA 2P9LA 5F1XA 4FWNA 1ZBSA 3C7NB 2QWRA 4FPAA 4B1VA 4FWPA 1BOTO 3WXIA 2Q0UA 3WUHA 5FPEA 3EO3A 3A8YA 2AP1A 3SK3A 3DJCA 4CZGA 4CZFA 4DQ8A 1Z05A 4BRAA 3UKUA 3R6MA 3VPZA 3ZX0A 5KQDA 4XEIA 4M7YA 3H46O 3D2EB 2FSJA 1GLAG 2BUPA 2YCHA 3WEEA 2A40A 3MK6A 1DKGD 4I6MA 2P9NB 4BROA 2FXUA 2P9IA 3M6GA 3W3DA 4O8KA 2BTFA 3ZETB 4H03B 5EOYA 2P9SB 3O1BA 1GLBG 4MLEA 2P9UB 4DB3A 2NRHA 4CBXA 3CJCA 4PL7A 4IXCA 3QMLA 4AM7A 1R59O 5B8HA 1ZXOA 3ATUA 4JN4A 3MN7A 5ELZA 4YDUC 1BUPA 2DPNA 4CZHA 3I33A 3QICA 5AZIB 4L3QA 4EHTA 1HKGA 4BRHA 4CZMA 1EQYA 3DXKA 5AZJA 1MWMA 1V4TA 1NGBA 2HOEA 3A5OC 3H3NO 3O6WA 4FOEA 1GLJO 4BR4A 2ZGZA 3EZWA 4HTLA 4MO5A 1U2VA 4JHDA 1TUUA 2YHXA 4PKGA 2P9PA 1SZ2A 3IFRA 2QWLA 2HMPA 3C7NA 3ENOA 4B1WB 5CE3A 1BDGA 1ATSA 3HSCA 1S3XA 3LL3A 5AQQA 2ZF5O 4IJNA 3UKRB 3D2FA 4EHUA 2EWSA 1YAGA 1NGGA 2FF6A 2VCPA 1X3MA 4FWMA 4J8FA 5TKYA 3SMPA 2V51B 2F9WA 1NGFA 1HPMA 3VETA 4CD3A 5AQUA 3KZBA 4BQZA 3R9PA 3VESA 3QBWA 4BC3A 1MDUB 3O4WA 2YJEA 1X3NA 4DCHA 3IDHA 3JS6A 3O08A 2P9NA 3M1FA 1LCUA 1HKCA 3EN9A 1NGCA 4MLHA 2KHOA 2ASMA 2A3ZA 4BRKA 2V7ZA 2P9UA 3CJ9A 5AQYA 1HX1A 2NZTA 2V7YA 4WQ4A 3LDLA 3CQYA 4Y0WA 2I7NA 4BGAA 1NGEA 4H5TA 3FZKA 5AZJB 3VEZA 1OKJA 4F9OA 4EIAA 4Z94A 2E1YA 2QWPA 2E8AA 4K42A 1NGAA 1S22A 3LM2A 1MWKA 4ISEA 3A5MC 3ATVA 3AAQA 4A62A 3CIPA 5ADXH 5EVZA 3WQUA 3U9ZA 3GBTA 5AQNA 3L0QA 5AQZA 3QBXA 2ZWHA 3D2FB 3VGLA 4BVOA 4ISFA 1KAYA 2GWJA 3HBTA 3A5NC 3QFPA 5LY3A 3GL1A 2FSKA 2YHYA 4GY2B 4BQLA 2CH6A 5AFUA 3UKRA 5AQVA 4BRFA 1QQNA 4WYBA 4CD1A 3VEWA 1ATRA 1QZ5A 3VEYA 3VENA 3BF3A 1BA1A 5AQLA 1GLEG 1V4SA 3U9DA 5BPMA 3WT0A 1WUAA 3RSEB 3IMXA 4PKIA 5F2RA 4K43A 1T6CA 3VOVA 4GNIA 2ASOA 3CERA 2E2PA 2H3GX 4LC9B 1T44A 1IG8A 2QM1A 2IVNA 3FGUA 1GLCG 3L6QA 4H5WA 1TYQB 1QQMA 3GE1A 3MCPA 5AQMA 2FSNA 2GELA 4QS7A 1BG3A 3VEXA 3HTVA 4H0XB 4H0VB 2GWKA 3MDQA 2GEMA 4K41A 1XUPO 4PL8A 3FZLA 1YXQA 1JCFA 4BRCA 1C0FA 2AA4A 1D4XA 4FWKA 4FSVA 1BO5O 1KXPA 4YDUA 1DEJA 4JD2B 5E84A 5AQTA 2E2NA 3QB0A 5AQIA 4C23A 2QWOA 1KAXA 1QZ6A 2CGKA 1IJJA 4O5FA 4BRMA 3OHRA 4BREA 3WXKA 4RTFD 1HJOA 3VGKA 4CBWA 3AAPA 1K8KA 1Z6RA 5LJWA 3M3ZA 1E4FT 4BRDA 1Y64A 4FWOA 5I9EB 5KPZA 1BU6O 3S41A 5JICA 1RDWX 5BRDA 3MN9A 2OANA 4FPBA 5AQHA 4FWRA 3MN6A 2W40A 3CJ7A 5KPRA 5BN9A 5FPDA 4A2AA 1GLFO 5AFUH 5BPLA 4H0OA 3VEOA 4EFHA 5E26A 3CJAA 2HF4A 5FPMA 3O5BA 3GDQA 2D0PA 4WQ5C 3CQXA 1J6ZA 1Q18A 1TUYA 5AQJA 1ATNA 4H0TB 3RSEA 4CZEA 3SJHA 3LDOA 4B1UB 3DWLA 1ZC6A 3TU5A 2Q0RA 1H1VA 2ASPA 5AQWA 3A5LC 3BF1A 1XQSC 1G99A 4BRGA 1NGDA 4CZKA 3D7EO 4FOIA 2Q97A 3B8AX 3AY9A 2HF3A 2PAVA 1NWKA 1TYQA 2F9TA 4BRQA 5BRFA 2VWBA 1XC3A 1YVNA 2QXLA 3HM8A 4FWQA 4B9QA 3FLCO 4BR9A 3KVGA 3BP8A 5LJVA 3L4IA 2E2QA 4FO0A 2J4RA 3BEXA 2QW9A 3HI0A 2A42A 5AQGA 2GTDA 2IVPA 5AQXA 2PBDA 4BR5A 4JD2A 1K8KB 4K25A 5AQSA 5AQOA 1JCGA 4ISGA 4PKHA 3KHYA 3EL2A 2VYPA 2WUSA 4IO8A 3O8MA 3MMVA 3ZEUA 4H5NA 2E2OA 2D4WA 4XH4A 4B1ZA 4CBUA 5AQFA 1GLLO 4XH5A 4CI6A 3SMSA 2IIRA 1GLDG 1HKBA 4XH1A 2YI1A 3H1VX 3TPQA 2E20A 4NB4A 4E1JA 5JLFA 3F9MA 1WOQA 3LM9A 1P8ZA 5AQPA 5AR0A 4H0PA 1T6DA 5EX5A 3JXUA 3DXMB 3FZMA 4BG8A 2NLXA 4A61A 4AM6A 2P9KB 3GOIA 3VF4A 3EKUA 3WQTA 2FLOA 3ULEB 4EAHD 3H1QA 4CJ7A 4BC5A 3O1WA 3H6EA 3FR0A 2A5XA 4BRNA 2A41A 3EKSA 4RWTA 3G25A 3DAWA 1NGHA 2V52B 2E88A 4FWSA 3WXJA 4BRIA 2A6AA 4M7XA 4QS9A 1QHAA 1LOTB 1NGIA 2QWNA 2IVOA 5BN8A 3ID8A 3VF6A 4DHYA 3W0LA 1QQOA 5EXWA 3FFKB 3C0BA 3FZHA 1NM1A 2YJFA 5KQ8A 3R8EA 1HLUA 3SLCA 5BRHA 3AARA 5AQKA 2Q2RA 4H0YB 4B1YB 3VERA 5BR9A 4A2BA 3HZ6A 3ZEUB 1C0GA 5JLHA 4BR7A 3UB5A 5AQRA 4RCHA 3QFUA 2ITMA 3ZX3A 3QDKA 5KPTA 5JMVA 2QWQA 4HWIA 1HUXA 1X9JA 3GG4A 4IZ9A 2P9LB 1NLVA 3H45C 1U6ZA 3CJ1A 4MO4A 4CZLA 2Q1NA 2Q31A 4NO7A 5ADXA 3O80A 3UE5A 1JCEA 4BRLA 2CGJA 3BUZB 4CZIA 4BRPA 1SAZA 3VGMA 1NGJA 3IUCA 1MA9B 2W41A 3A0IX 5EY4A 1KAZA 2UYTA 3DXMA 3UKUB 3CI5A 1NBWA 1E4GT 1ESVA 3FE1A 2P9KA 3P4IA 5BPNA 1CZAN 1DGKN 4IJAA 3ULEA 3LDNA 4BVPA 1BA0A 3WEEB 1RFQA 4WQ5A 2Q36A 4FL9A 4I6MB 3VF2A 4BR0A 4JNEA 2D1KA 2P9IB 4BC2A 3D2EA 2ZGYA 4BGBA 2FF3B 3H3OB 4M63C 3CJBA 2E1ZA 3CHWA 3U4LA 2I7PA 5F0XA 3U8XA 1BWFO 4WQ4C 2D0OA 3ZETA 3FZFA 2P9SA 3CETA 1RGIA 4H5VA 2CH5A 4JAXA 2GUPA 4FWLA 4IWVA 1YUWA 4BC4A 3ZX2A 3LDQA 3VEVA 4BR2A 4CZJA 3LDPA 2QWMA 3ENHA 5FPNA 3MN5A 4H5RA 3DXKB 2YHWA 3I8BA 4BG9A 1SQKA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3WXLA 4ZTFA 4DSIA 4AHSA 5M1NA 1PTXA 1BHLA 2IC3A 2YNHA 3J8AA 2P9LA 5J1EA 5F1XA 4B1VA 1VQNN 5DK5A 1K73O 3WXIA 4B9NA 3RVCA 3WUHA 3A8YA 1NK7A 4CZFA 1Z26A 3HYFA 4BRAA 4BE2A 3UKUA 3VPZA 3NBPA 4XEIA 1ITGA 4M7YA 4LFAK 3R3LA 2KZZA 4CEOA 1GLAG 4LF8K 1RBTA 3DLGA 1T03A 3MEGA 5C10A 4FLZA 3WEEA 2A40A 3MK6A 2ZE2A 3CCRN 4B3TK 2P9NB 4FW2A 4FJKA 3RWUA 2SN3A 3AVKA 2HHXA 4CEDA 2PYLA 2BTFA 4DV1K 3ZETB 4BE1A 4FK0A 1KVAA 2HBLA 1MR4A 4B8AB 1RBRA 1GLBG 2P9UB 4AHUA 5MLCQ 3I8DA 4M41A 3ZT0A 3SUQA 3SBGA 3OJUA 1VQMN 3QEWA 2UUCK 2G8HA 4O0IA 1VSIA 2VGMA 4B9UA 5B8HA 3AO2A 4RW4A 4DG1A 1ZYVA 3VQ8A 4CJ4A 3MN7A 3HSTB 4CZHA 4M3RA 2KBKA 3CYGA 4EHTA 4AEIA 4DR5K 4IO9L 2WBNA 4FLYA 1CXQA 5AZJA 1HYVA 3PX0A 3TSUA 3MXIA 1JLGA 4DV0K 3LAKA 3OYBA 3AVJA 2VG6A 4B1WB 2XY6A 4JKAA 1RTHA 3MECA 4OJRA 4F4KA 4U7BA 3EE8A 3LP1A 4DS5A 4CIGA 1YAGA 1NGGA 4FWMA 2V51B 4UJ0A 4CFBA 3JSMA 1S1WA 5D3GA 3PO5A 4YOVA 1REVA 3QBWA 4OKJA 4CIFA 1ZVGA 4JV5K 3O4WA 4JI8K 1KVBA 2P9NA 3AA4A 3M1FA 3QEXA 1LCUA 1HKCA 5HRRA 4MLHA 2KHOA 1VQ4N 2A7TA 3QO9A 2X6SA 4ZHRA 2RKIA 4NXNK 1J9AA 2P9UA 4AHTA 4CF0A 1HX1A 2NZTA 2KBHA 3LDLA 3SNNA 4JI5K 1M1KO 4BGAA 3O3HA 2HSTA 4F9OA 3C65A 3PIOL 1IBKK 4K42A 1NGAA 1C1AA 4W5QA 2VGNA 1JXEA 1VSHA 4B9SA 4ISEA 2G8UA 2B4JA 1FXXA 4E7KA 3VQCA 3RR7A 3CIPA 3HT3A 3NH1A 5ADXH 1SL1A 3WQUA 3U9ZA 3N4QA 3QBXA 1KAYA 1AYJA 3A5NC 3QFPA 4B9MA 1HNXK 4EP4A 1UA0A 2YHYA 4CJTA 4GW6A 3OS0A 3VEWA 2OTJN 4KPYA 3HO1A 2O8FB 1B9FA 3OYEA 4CGDA 4DQQA 1BA1A 1GLEG 3RSEB 2LI7A 3IMXA 3OW2M 4M3XA 4Z4EA 1UWBA 4RW6A 1T6CA 4NYFA 3VOVA 1KQSM 1RDUA 1IKYA 1T44A 3J7AP 3S5TA 2MBKA 3K5LA 2MZ0A 1WSIA 2PFUA 2ZD1A 3BGRA 4BWMA 3ZT2A 3L6QA 1TYQB 1QQMA 3GE1A 4QS7A 2FSNA 3OYNA 2WC9A 1NKEA 3HXMA 3HTVA 3TAEA 4CHZA 1P00A 4H0VB 4JKFA 4CF1A 4K41A 1XUPO 4PL8A 3KLIA 1YXQA 4BRCA 2N69A 4JKEA 2QXFA 4GMJB 5M1OA 3E66A 3V1RA 3QB0A 2IOCA 1KAXA 4DTRA 3NF9A 1IO2A 2E3FA 2NRVA 1T7AA 4BREA 1CZBA 4IEEA 1K8KA 3KLGA 3V9ZA 3HVRA 5KPZA 2KGQA 3HP9A 4CGFA 4Z4CA 5JICA 1RDWX 5BRDA 3QNNA 4FPBA 5AQHA 3CJ7A 2ZJPL 3PUFA 1NJZA 4DV5K 3KOXA 3L2QA 1VQ8N 3M8SA 5BPLA 4H0OA 4EFHA 4FJJA 4OX9K 4HUFA 2KPYA 1Q18A 4DSEA 4HUEA 4C8OA 4H0TB 3RSEA 3K9JA 4B1UB 1XMOK 3TU5A 1A5VA 2E3GA 2JWKA 4HHFA 5CR4A 1NGDA 4CZKA 3D7EO 1Q81O 1OZZA 1I2VA 2D0BA 3OY9A 1TAQA 2PAVA 1TYQA 2VWBA 4FJMA 3HM8A 4FWQA 2ITGA 3FFIA 3DI6A 2LT8A 3L4IA 3HL8A 2E2QA 2J4RA 2D5RA 4NLCA 3HI0A 5CYMA 2O8DA 2IVPA 1QSLA 5AQOA 3TSQA 5LMNK 3KHYA 4DTSA 4C8KA 4FJHA 1WSEA 3EL2A 2VYPA 2VY6A 2WUSA 4GV3A 4H5NA 2D4WA 1WWNA 2Z1GA 2O8EB 5GADP 1C6VA 4FJ5A 4CI6A 4HE7A 2IIRA 2RN2A 4M42A 4Y1CA 1JLFA 2ZM6K 2YBRC 4NB4A 3JAMO 1KRPA 1XNQK 3L2RA 4E1JA 1P8ZA 1ZVEA 4BDYA 5AQPA 5AR0A 4H0PA 1M90O 1P90A 4B8CA 2XRIA 4BG8A 2YX6A 3VQ7A 3ZSZA 1WSJA 1XNRK 3GOIA 3VF4A 2OZMA 3EKUA 3WQTA 1YITN 4CJ7A 3D0PA 4OLAA 4YFUA 3VTIA 4JS5A 3RMBA 1KD1O 1WSGA 1Q9YA 3C6UA 2UXBK 4QS9A 1EWQA 1LAWA 2IVOA 1NRAA 3WNGA 1ZFUA 2E5LK 4N76A 5BR8K 3C0BA 3TAGA 3AA2A 4M3WA 3NH2A 2E0HA 1S9EA 5J2NA 1JJ2M 4I2PA 1RTDA 4O55A 4YHHK 4CF2A 3AARA 4C1NK 3QEIA 1SL0A 1RT5A 3IAYA 3DLRA 2Q2RA 3VERA 3PLAA 1KLNA 5I42A 1D9DA 4OO1J 3ZEUB 4CHNA 1C0GA 3KK7A 4RCHA 1UGLA 1XHZA 1W2BM 3HOTA 3MWTA 3QDKA 5KPTA 4DFKA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3WXL A;  4ZTF A;  4DSI A;  4AHS A;  5M1N A;  1PTX A;  1BHL A;  2IC3 A;  2YNH A;  3J8A A;  2P9L A;  5J1E A;  5F1X A;  4B1V A;  1VQN N;  5DK5 A;  1K73 O;  3WXI A;  4B9N A;  3RVC A;  3WUH A;  3A8Y A;  1NK7 A;  4CZF A;  1Z26 A;  3HYF A;  4BRA A;  4BE2 A;  3UKU A;  3VPZ A;  3NBP A;  4XEI A;  1ITG A;  4M7Y A;  4LFA K;  3R3L A;  2KZZ A;  4CEO A;  1GLA G;  4LF8 K;  1RBT A;  3DLG A;  1T03 A;  3MEG A;  5C10 A;  4FLZ A;  3WEE A;  2A40 A;  3MK6 A;  2ZE2 A;  3CCR N;  4B3T K;  2P9N B;  4FW2 A;  4FJK A;  3RWU A;  2SN3 A;  3AVK A;  2HHX A;  4CED A;  2PYL A;  2BTF A;  4DV1 K;  3ZET B;  4BE1 A;  4FK0 A;  1KVA A;  2HBL A;  1MR4 A;  4B8A B;  1RBR A;  1GLB G;  2P9U B;  4AHU A;  5MLC Q;  3I8D A;  4M41 A;  3ZT0 A;  3SUQ A;  3SBG A;  3OJU A;  1VQM N;  3QEW A;  2UUC K;  2G8H A;  4O0I A;  1VSI A;  2VGM A;  4B9U A;  5B8H A;  3AO2 A;  4RW4 A;  4DG1 A;  1ZYV A;  3VQ8 A;  4CJ4 A;  3MN7 A;  3HST B;  4CZH A;  4M3R A;  2KBK A;  3CYG A;  4EHT A;  4AEI A;  4DR5 K;  4IO9 L;  2WBN A;  4FLY A;  1CXQ A;  5AZJ A;  1HYV A;  3PX0 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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