5AQGA

Fragment-based screening of hsp70 sheds light on the functional role of atp-binding site residues
Total Genus 120
50100150200250300350020406080100120
Genus TraceResidueGenus

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
381
structure length
381
Chain Sequence
MSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
Loading diagram...

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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connected with : NaN
molecule tags Chaperone
source organism Homo sapiens
publication title A fragment-based approach applied to a highly flexible target: Insights and challenges towards the inhibition of HSP70 isoforms.
pubmed doi rcsb
molecule keywords HEAT SHOCK COGNATE 71 KDA PROTEIN
total genus 120
structure length 381
sequence length 381
chains with identical sequence C, E
ec nomenclature ec 3.6.3.51: Transferred entry: 7.4.2.3.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5aqgA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqgA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqgA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5aqgA04
1NMDA 3R6MA 2D0OA 3FE1A 3CJAA 1K8KA 4PKHA 5F1XA 3H3NO 3JS6A 4QS7A 5E26A 4BG9A 4CD3A 3CJ7A 4CZHA 1SQKA 5BN9A 2BUPA 2VYPA 4WQ4C 4DQ8A 3EKSA 2D0PA 1BA1A 2FF3B 3CQYA 4PKGA 4YDUA 5JLFA 2EWSA 3GE1A 3WEEA 3ENHA 4BREA 1U6ZA 5AQFA 2P9SA 2HF3A 4CZLA 2Q0RA 5B8HA 3D2FB 4BG8A 2QWOA 1ZXOA 2ASPA 3B8AX 2P9UA 1Y64A 2QWPA 1NLVA 4BRFA 3EL2A 3LDLA 3KHYA 5ADXH 2CGKA 1BOTO 2V7YA 4I6MB 2P9NA 3C0BA 4BQLA 4CBWA 3ATVA 3A5OC 5FPEA 3FFKB 3MK6A 2YI1A 3O6WA 4FOEA 5LJWA 3A8YA 1JCGA 1R59O 2E2PA 3EZWA 3VEWA 3RSEB 4CZMA 5BPNA 4QS8A 4BR7A 4FWSA 3ZX2A 1XUPO 4JD2B 4BC4A 3VETA 3D2EA 3MDQA 1NGEA 2P9PA 4B9QA 4CD1A 4RTFD 4AM7A 1HUXA 2NRHA 1U2VB 4BRDA 4E1JA 2F9WA 3H1VX 4Z94A 5BREA 4BRAA 4BRMA 5AQYA 5JICA 1Q18A 1GLFO 4BGBA 3U9ZA 5AQTA 2QWQA 4H5TA 4ISGA 4FWNA 1QQOA 2DPNA 3MN5A 1KAYA 4DB3A 1ZC6A 2ZWHA 4JAXA 5I9EB 5AQLA 1ATNA 2BTFA 2OANA 2VCPA 2YHYA 5FPNA 2Q97A 3O1WA 4EHUA 4FSVA 2E8AA 1MA9B 2PAVA 1GLDG 1WUAA 3HBTA 5BRFA 4CI6A 4CZGA 1TUUA 1DEJA 4FL9A 3ULEA 4F9OA 4RCHA 5AQNA 5BRHA 1BWFO 3ATUA 5AZIA 1X3NA 5EOYA 1YAGA 3EKUA 1H1VA 3R9PA 3UKUB 4M63C 1TYQA 3VOVA 4B1YB 3WUHA 3IMXA 1HX1A 5KPZA 4BC3A 2FSJA 2P9LA 1NGFA 3MN9A 1HKGA 1XC3A 3SLCA 2IVOA 3QBWA 3KZBA 4ISEA 5LJVA 4RWTA 4NB4A 3R8EA 2ASOA 3SMSA 2E1YA 2CH5A 4XH5A 3GOIA 3DXKB 4DHYA 3U9DA 4GY2B 1JCEA 3F9MA 4FPAA 2FF6A 2QWNA 1BUPA 3D7EO 5BR9A 5AQOA 3QBXA 1ATRA 5KQDA 4BRCA 3C7NA 4BC2A 4M7YA 5AQRA 1NM1A 3IUCA 2E20A 1NGHA 3O8MA 3CQXA 3LL3A 1C0GA 4JHDB 3O4WA 1HKBA 2YCHA 4H5RA 1G99A 2ZF5O 3A5NC 3ENOA 3HM8A 2P9KB 2Q2RA 3G25A 3BF3A 4BR5A 4A2BA 4KBOA 3L4IA 4AM6A 3DXMB 2QM1A 4H5WA 2UYTA 3TU5A 2P9IB 1SZ2A 4EIAA 2D1KA 4H0OA 4FWRA 3CI5A 4CZEA 3DJCA 3UKRA 2CH6A 3QMLA 2FXUA 3VF6A 2QWRA 1GLLO 1YXQA 1NGAA 4HTLA 3VGLA 3ZX3A 3UB5A 3GL1A 4I6MA 3VF4A 3QICA 1TUYA 2A40A 5KPTA 1BO5O 3L0QA 2AA4A 3VEXA 3SMPA 1NWKA 1K8KB 4QS9A 5EXWA 4XEIA 5AQUA 3WXIA 5AR0A 1NBWA 4O8KA 2GUPA 4JD2A 2IVNA 1QZ6A 5BPLA 2ITMA 4BRGA 2QW9A 4FO0A 3I8BA 2A5XA 3WEEB 5BN8A 2YHWA 3CERA 5AQHA 2E1ZA 3MCPA 1RDWX 1HPMA 2P9SB 3LM2A 1LCUA 3H46O 4CZJA 1DKGD 1V4TA 1GLBG 3H6EA 1NGBA 4IJAA 4B1VA 4H0YB 3VEOA 4A62A 4BVOA 3CJBA 3AAPA 3P4IA 3BP8A 4WQ5C 3EN9A 2P9NB 5ELZA 3MMVA 3FZLA 4B1UB 5AQWA 1CZAN 1YUWA 2W41A 3FLCO 4L3QA 4BRPA 3LDPA 3S41A 4MLHA 3VPZA 3ID8A 3ZETA 2AP1A 3OHRA 1E4GT 5AQJA 2H3GX 2YJEA 3DAWA 3W3DA 4H0TB 1GLCG 3HI0A 5F0XA 3U8XA 3D2EB 1IG8A 2FSKA 2P9PB 4WQ5A 1NGIA 1HJOA 3U4LA 1JCFA 5AZJB 3VEVA 5AQZA 4BGAA 1RGIA 1YVNA 2GELA 2V7ZA 5AQQA 5FPDA 1NGCA 3SJHA 1Z05A 1T44A 1HLUA 2W40A 2FLOA 3ZEUA 2F9TA 4XH4A 3IFRA 3DXKA 1V4SA 2A42A 4PL8A 4XH1A 4M7XA 1QZ5A 2J4RA 3VGKA 5AQIA 4PL7A 4BR4A 2I7NA 5BPMA 3ULEB 4BR0A 3TPQA 1KAXA 1C0FA 1D4XA 4B1WB 2VWBA 5AZIB 2ZGZA 3MN7A 1LOTB 2Q0UA 4H5VA 3QB0A 3HTVA 3FZHA 5F2RA 4K43A 2P9LB 4FWMA 2A41A 2Q1NA 4FPBA 4IWVA 3AY9A 1EQYA 4MO4A 3VEYA 4BRLA 3HZ6A 2I7PA 4A61A 3CJ9A 3MN6A 2YJFA 4BRKA 3LDOA 1NGGA 1OKJA 2YHXA 3A5LC 4BC5A 3GDQA 4NO7A 3L6QA 2HMPA 5TKYA 5KPRA 1T6DA 4C23A 4IJNA 4FWQA 3LDQA 1BA0A 3KVGA 3JXUA 2FSNA 4H0VB 3C7NB 3QFPA 3CIPA 4CBUA 2NZTA 4BRHA 3GBTA 3VESA 2Q36A 3VGMA 3D2FA 3AAQA 1KXPA 1QQNA 5CE3A 1HKCA 3J8AA 3BF1A 3DWLA 4K41A 2CGJA 1X3MA 4FWKA 4EAHD 1P8ZA 1MWMA 1SAZA 4B1XB 4BRQA 4O5FA 2KHOA 2HF4A 4IZ9A 4CJ7A 1T6CA 5KQ8A 3RSEA 3WQUA 3UKRB 3CJCA 3FZFA 4WYBA 4LC9B 1BG3A 1S3XA 4IO8A 3UE5A 1XQSC 2GWJA 2NLXA 1U2VA 2IVPA 4IXCA 1WOQA 2V51B 2E2NA 1ZBSA 2IIRA 2QWLA 3ZX0A 4WQ4A 1KAZA 5AFUA 1ATSA 2P9UB 4H03B 2D4WA 4EHTA 3FGUA 2ASMA 4H0XB 3WQTA 3I33A 2CGLA 3H1QA 3GG4A 4H5NA 3O80A 2HOEA 4HWIA 5JLHA 4BVPA 4CZKA 3M3ZA 1GLJO 3CETA 5AZJA 2QWMA 4JNEA 3UKUA 2Q31A 1X9JA 5FPMA 4CZFA 2A3ZA 3O5BA 4FWLA 3A0IX 4B1ZA 3CJ1A 3HSCA 1QQMA 4BROA 2V52B 5EX5A 3W0LA 3H3OB 4BQZA 1NGDA 4GNIA 1QHAA 3O08A 3QFUA 3ZETB 5BRDA 2E2OA 1NGJA 4BR2A 3H45C 5AQSA 3M6GA 3CHWA 4K42A 3VF2A 1MDUB 1J6ZA 2GEMA 3A5MC 3LDNA 5AQKA 3FR0A 2WUSA 3VEZA 2PBDA 1DGKN 5EVZA 5ADXA 1TYQB 4FWOA 1Z6RA 2QXLA 3M1FA 1RFQA 3BEXA 3WXKA 1E4FT 4JHDA 5EY4A 3O1BA 3AARA 3FZMA 3ZEUB 2P9KA 4BRNA 3IDHA 3EO3A 1GLEG 5JMVA 1IJJA 2GTDA 3DXMA 1S22A 2GWKA 5AFUH 3FZKA 5LY3A 2P9IA 4BRIA 4K25A 4CZIA 3LM9A 5AQPA 4BR9A 2E88A 5AQMA 1BU6O 4FWPA 4Y0WA 3WXJA 4JN4A 3VENA 3WXLA 1BDGA 4CBXA 5E84A 1GLAG 5AQGA 3BUZB 1ESVA 4H0PA 3WT0A 5AQVA 5AQXA 4MLEA 3VERA 3SK3A 2A6AA 4ISFA 4MO5A 2E2QA 4A2AA 4DCHA 1MWKA 2ZGYA 4J8FA 4EFHA 4YDUC 3QDKA 4PKIA 4FOIA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1NMDA 5J2PA 3Q7CA 3ZLJA 3FE1A 4I2QA 3IAYA 1UAXA 3R1XA 4QCLA 4JKAA 1PX9A 5JENA 4BG9A 4CD3A 4E72A 4CFDA 1SQKA 5BN9A 2FF3B 3EE9A 3CFPA 2EWSA 4DWIA 1U6ZA 3VQ4A 1GPTA 1VSFA 3CQ8A 4CJKA 3D2FB 2KBKA 2ASPA 3ZSZA 3J7AP 4CESA 1NLVA 3SI6A 4BRFA 5KRSA 4A5AA 3KHYA 5ADXH 2CGKA 3AO1A 4C1NK 4JI1K 4EP5A 5GAEP 3C0BA 3THVA 3L3VA 4CGDA 3KKSA 4DV5K 3T1AA 1CXUA 1JCGA 1R59O 3C6AA 3AVJA 3RSEB 4CZMA 1A5WA 4FWSA 3ENBA 1BK8A 4IFEA 3QNOA 1NMNA 4BC4A 1WSIA 3KOZA 2N2RA 1LWEA 1JLBA 4CD1A 1N32K 3CCQN 1VSHA 2NRHA 4E1JA 4E7KA 5BREA 4FVUA 3QETA 1Q18A 4CJSA 4DTXA 1BIZA 4O5BA 1U48A 3G10A 2DPNA 1WAJA 3MN5A 2YEOA 1PTXA 4DB3A 3S3MA 4FSVA 2E8AA 2OPSA 5HP1A 1SKSA 3ULEA 1XI1A 4JKGB 3OYNA 2DTUA 1YAGA 1BQNA 2ZJPL 4M63C 5E41A 3VOVA 4B1YB 5HRPA 4KH4A 5CZ2A 4Y1DA 2KFZA 3NBPA 3B6PA 4LF9K 4UY8O 1U45A 3SLCA 2IVOA 1IG9A 4B3MK 4ISEA 3VQ8A 4NB4A 3SMSA 1VNAA 3KWIA 2E1YA 3L56A 4DV2K 4BE2A 4XH5A 4ILJA 2NRXA 4ZHRA 3DXKB 1IBLK 1VSKA 3U9DA 3CMEN 2QWNA 3E01A 1NK8A 4WF9L 3ZSRA 3QEWA 4JK9A 3QBXA 5KQDA 4CEAA 4WFBL 3LPTA 4KH5A 5AQRA 3KWGA 2E20A 3O8MA 1TL3A 5CZ1A 4B3RK 1T3VA 2C1GA 1N34K 3K57A 4AEIA 1G99A 2P51A 2ZF5O 3TTFA 3A5NC 3ENOA 1RTIA 4KRFA 3OBWA 3WNHA 4A2BA 3P5JA 3DXMB 2QM1A 4H5WA 3TU5A 2VQFK 4EIAA 3PO4A 1VQKN 4CZEA 4KHUA 3DJCA 3THYB 3DRRA 4FJXA 4NXNK 1TKXA 1T05A 2E3FA 4QOZB 4I9LA 1BRZA 1TK5A 1GOCA 4HTLA 3ZX3A 3UB5A 3IKMA 3ALYA 1B7DA 3OS2A 2KBHA 5T7BA 3VF4A 2I5JA 4M3XA 1ZYVA 5KPTA 3THXA 1BO5O 1VHXA 3VQ6A 1VAZA 3V9ZA 4CF9A 3SMPA 2WBNA 1NWKA 4UADE 4Q5VA 1SN1A 2IAJA 4BDYA 5EXWA 3CFOA 2HVHA 1JLFA 4EP4A 1AHOA 3ZYYX 3K2PA 4CJWA 4KPYA 2RF2A 4JD2A 1QZ6A 2ITMA 5CY4A 1WSHA 3CCVN 2YHWA 2HNDA 4E7JA 1RDWX 2P9SB 4DSEA 4OLBA 4YHHK 4CZJA 1V4TA 2UU9K 1GLBG 3H6EA 1RTDA 1O13A 4B1VA 5CR4A 4BECA 3CJBA 1D5AA 3DOKA 5HRSA 2A7TA 2Z1HA 1RDCA 4KAZA 3ZT0A 4DU1A 1S9EA 4L3QA 2O8EB 3S41A 3O9QA 3ID8A 3TWHA 3ZETA 3V1RA 3G4SN 4DUYK 2W00A 2YILA 2H3GX 2YJEA 3PIPL 4CIEA 1K73O 2YNFA 2GX9A 3T19A 5GIOA 1OMYA 1REVA 3ID6A 3U3YA 4NLBA 1HJOA 1PE4A 4AB0A 1ZBIA 1UA0A 5D3GA 4BGAA 5C25A 4Z4CA 4B9SA 2GELA 2QI2A 5C10A 4PY5A 1NGCA 4CEFA 3SJHA 1Z05A 1T44A 4A59A 3PX4A 1SEGA 4Q0BA 4LH5A 1KCFA 4XH4A 4KTZA 3IFRA 2LJ7A 3L2WA 4HHTA 5AQIA 1NOZA 1RDUA 1FKPA 4BR4A 3M8SA 1D4XA 2ZGZA 2OPQA 1Q9YA 3MN7A 3OVNA 2Q0UA 2KBJA 3HTVA 2MZ0A 3L3UA 1C0UA 4FWMA 1BMRA 4MO4A 3HZ6A 4DQSA 2FC0A 2O8CB 3S3NA 3A5LC 4CF8A 3GDQA 3MXMA 4KYPA 1I3AA 4BE0A 3L6QA 5KPRA 5TKYA 1BCMA 1T6DA 4YNQA 4JS5A 2YIPA 3E1YA 4FWQA 1I2VA 4YOTA 2G8UA 2O8BB 4KHQA 4ID1A 2G8KA 1NKBA 2YNIA 3O9TA 4J2BA 3PIOL 3C7NB 2Y1IA 3TAEA 2NY8X 3VQPA 2B68A 4LSNA 4CJ5A 1VQ9N 2Q36A 3I0SA 4ELVA 3D2FA 3AVFA 1KXPA 4O8UA 2HHIA 3J8AA 4I9QA 4FWKA 1MWMA 3C6UA 4B1XB 2HBKA 4FVMA 1TK0A 2OZSA 4DQIA 4IZ9A 3TANA 4X65K 3RVCA 3E9OA 3RSEA 3TARA 2F7TA 4KB1A 3CJCA 4DFPA 3FZFA 1G15A 1VQ4N 1S3XA 3D0PA 3TAPA 4EZ6A 4B9TA 2XY6A 1XQSC 2NNWA 2NLXA 4CJLA 3THWB 1MYNA 2E2NA 1E3MA 3PY8A 2QWLA 3ZX0A 4WQ4A 1KAZA 5IT9O 4JI8K 4H03B 2VG7A 1IKVA 3DRPA 4EHTA 2ASMA 2UUBK 3WQTA 3HPGA 2CGLA 2A1SA 5FROA 2AJQA 2ZJQL 1T8EA 4BVPA 2EX3A 2IC3A 3C95A 3HP6A 2YHBA 4JKFA 1U04A 2QWMA 3V9UA 4JNEA 5HRNA 1S5JA 1ILYA 1NK5A 1HMVA 3NE6A 1LV5A 3O5BA 3KK3A 4B8AB 1DJTA 3L8BA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 1NMD A;  5J2P A;  3Q7C A;  3ZLJ A;  3FE1 A;  4I2Q A;  3IAY A;  1UAX A;  3R1X A;  4QCL A;  4JKA A;  1PX9 A;  5JEN A;  4BG9 A;  4CD3 A;  4E72 A;  4CFD A;  1SQK A;  5BN9 A;  2FF3 B;  3EE9 A;  3CFP A;  2EWS A;  4DWI A;  1U6Z A;  3VQ4 A;  1GPT A;  1VSF A;  3CQ8 A;  4CJK A;  3D2F B;  2KBK A;  2ASP A;  3ZSZ A;  3J7A P;  4CES A;  1NLV A;  3SI6 A;  4BRF A;  5KRS A;  4A5A A;  3KHY A;  5ADX H;  2CGK A;  3AO1 A;  4C1N K;  4JI1 K;  4EP5 A;  5GAE P;  3C0B A;  3THV A;  3L3V A;  4CGD A;  3KKS A;  4DV5 K;  3T1A A;  1CXU A;  1JCG A;  1R59 O;  3C6A A;  3AVJ A;  3RSE B;  4CZM A;  1A5W A;  4FWS A;  3ENB A;  1BK8 A;  4IFE A;  3QNO A;  1NMN A;  4BC4 A;  1WSI A;  3KOZ A;  2N2R A;  1LWE A;  1JLB A;  4CD1 A;  1N32 K;  3CCQ N;  1VSH A;  2NRH A;  4E1J A;  4E7K A;  5BRE A;  4FVU A;  3QET A;  1Q18 A;  4CJS A;  4DTX A;  1BIZ A;  4O5B A;  1U48 A;  3G10 A;  2DPN A;  1WAJ A;  3MN5 A;  2YEO A;  1PTX A;  4DB3 A;  3S3M A;  4FSV A;  2E8A A;  2OPS A;  5HP1 A;  1SKS A;  3ULE A;  1XI1 A;  4JKG B;  3OYN A;  2DTU A;  1YAG A;  1BQN A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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