5AQGA

Fragment-based screening of hsp70 sheds light on the functional role of atp-binding site residues
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
381
structure length
381
Chain Sequence
MSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title A fragment-based approach applied to a highly flexible target: Insights and challenges towards the inhibition of HSP70 isoforms.
pubmed doi rcsb
molecule keywords HEAT SHOCK COGNATE 71 KDA PROTEIN
molecule tags Chaperone
source organism Homo sapiens
total genus 120
structure length 381
sequence length 381
chains with identical sequence C, E
ec nomenclature ec 3.6.3.51: Transferred entry: 7.4.2.3.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5aqgA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqgA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqgA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5aqgA04
3EL2A 1GLCG 1XC3A 2F9WA 4MO4A 1XQSC 2IVNA 4CBXA 3DXMB 3LL3A 3SMSA 2ASOA 3RSEA 3W3DA 2NLXA 3AY9A 5FPDA 4JD2A 2E2OA 4JHDA 5FPMA 3BP8A 4H0OA 3U9ZA 3VEXA 4PKHA 3ZX3A 3DJCA 3D2EA 2E2PA 4H03B 4HWIA 5AQSA 3DXMA 5AFUA 5AQGA 4CJ7A 1WOQA 3QICA 3QFUA 4CZMA 4FO0A 2VCPA 3GOIA 5AQMA 3HM8A 3QMLA 3HBTA 2A3ZA 3ENOA 3H46O 4WYBA 2Q0RA 4H0YB 4GNIA 4BRQA 4AM7A 2QW9A 1DEJA 1NLVA 3IUCA 4CZIA 4BG9A 4DHYA 3A5MC 5AQVA 4IJNA 1QHAA 4O8KA 4PL8A 2E1YA 1ATNA 3CJAA 4IZ9A 4A62A 3A0IX 2ZWHA 3CHWA 1D4XA 4BVPA 1TYQB 1JCFA 4M7YA 1Z6RA 3TU5A 4BRCA 4A61A 3AAQA 3CQYA 1HKCA 3MMVA 4FOIA 2QWLA 4FWRA 2A40A 3C7NB 2Q1NA 1RGIA 3MN7A 2WUSA 4PKIA 5JLHA 5EX5A 4H0XB 1NM1A 5E26A 3H3NO 3S41A 4BRLA 3SMPA 3UB5A 5LY3A 3HSCA 1RFQA 3H1QA 1E4GT 2YHXA 2QWRA 3UE5A 3CETA 4B1UB 1QQMA 2E8AA 1ESVA 5BREA 2E1ZA 4QS8A 3EKUA 3VEYA 5AQWA 2Q0UA 3VEVA 5ADXA 3ZX2A 5F1XA 1SQKA 2QWMA 2AP1A 5AQFA 5KQDA 2GELA 4B1YB 2D0PA 1YXQA 3WXIA 1T6CA 4FOEA 2ITMA 4QS7A 2DPNA 4ISGA 1H1VA 1IJJA 4K43A 2P9IB 3ULEA 4H0PA 5JLFA 3AARA 4K25A 3CI5A 3DAWA 3UKRA 4IWVA 1MDUB 3VERA 3QBXA 1NGGA 2H3GX 4JN4A 3I33A 3ATUA 3J8AA 3DXKB 4FPBA 5KQ8A 1LCUA 3SJHA 2EWSA 3FFKB 3EN9A 1SAZA 2YJFA 3KHYA 1QZ5A 5EOYA 4BR5A 3HI0A 3ZETA 2GEMA 2P9KA 4I6MA 2ASPA 2GWJA 3A5LC 3R8EA 2YHYA 1GLLO 2FF3B 1YAGA 1JCEA 3MCPA 3RSEB 4H5RA 4DCHA 4JD2B 2CGKA 4Z94A 1HPMA 2ZF5O 5BN8A 2FSJA 4JHDB 4NO7A 4XH1A 3LM9A 3O1WA 4RWTA 3O1BA 3D2EB 3A5OC 2VYPA 3JS6A 1BWFO 2Q31A 4BG8A 1HKBA 4CZGA 5KPTA 2P9SA 3G25A 4BRPA 5EXWA 1V4SA 4PKGA 2V52B 1ATSA 4B1XB 2P9LA 3MDQA 5FPEA 2AA4A 3MN5A 4LC9B 4NB4A 3KVGA 2ZGYA 3FZMA 3VEWA 1V4TA 5AFUH 2QWQA 3C0BA 4H5NA 4HTLA 1GLJO 3MN9A 5ELZA 5BRFA 5TKYA 1NGHA 4EAHD 3QDKA 4FWQA 4BGAA 4BC2A 2YI1A 3L0QA 4H5WA 3O08A 2E88A 3ZEUA 4M7XA 5AQXA 5AQOA 1MWKA 3CQXA 1Q18A 3FE1A 3ID8A 4DB3A 3R6MA 4K41A 5KPRA 3MK6A 5BPLA 4BRKA 1CZAN 2HF4A 5B8HA 1HX1A 1R59O 1WUAA 3EKSA 4FWKA 2E2QA 5AQHA 4QS9A 1U6ZA 1HLUA 1NGIA 2P9NA 1XUPO 4CD1A 3H1VX 5JMVA 5BR9A 3TPQA 5CE3A 4CZEA 4XH4A 1BG3A 1HJOA 5AZJA 4DQ8A 2GUPA 2HF3A 5BPMA 1YVNA 2P9UB 3R9PA 3EZWA 3O6WA 1OKJA 2ASMA 2ZGZA 3CJCA 4BRDA 1KAZA 5LJWA 1ZBSA 2CH5A 4L3QA 4FWPA 4CZLA 4MO5A 3VETA 2V7YA 5AQUA 3B8AX 3ULEB 5ADXH 3GG4A 4WQ4A 4IJAA 3UKRB 2UYTA 4BR4A 3ZX0A 5AQRA 2P9UA 3QFPA 1E4FT 4MLEA 3WEEA 2BUPA 4JNEA 2A41A 1U2VA 4BRHA 3O80A 3VOVA 4GY2B 4BR7A 3KZBA 5JICA 5AQZA 2A42A 2BTFA 3EO3A 3VGMA 3M6GA 2QWOA 3QB0A 3GL1A 2A6AA 1S22A 1BUPA 3ZETB 2A5XA 2I7NA 1GLFO 1GLBG 4MLHA 3VGLA 2P9KB 4I6MB 4XEIA 4FWMA 4CZKA 2FLOA 1MA9B 1TUYA 4CZJA 1C0FA 3W0LA 4BROA 4WQ4C 1ATRA 4AM6A 5AQLA 5AZIA 3UKUA 2QWPA 3QBWA 1NGEA 4BRGA 2YCHA 3L6QA 2F9TA 4CBWA 3JXUA 4BVOA 4F9OA 4EFHA 5AQYA 2GWKA 4FSVA 2P9SB 4BRAA 2VWBA 3WT0A 1G99A 2P9PA 4FWSA 1BDGA 1Z05A 2P9LB 3WQTA 4BC4A 2QM1A 3WQUA 1NBWA 1BA1A 2YHWA 5E84A 3GBTA 3VESA 4ISEA 3I8BA 3VEOA 4CZFA 4A2BA 2QXLA 3ENHA 3GDQA 3OHRA 3WXJA 1QZ6A 5LJVA 1NGDA 2YJEA 2NZTA 3BF1A 4A2AA 2Q97A 3VENA 2HOEA 5AQPA 2IVPA 3U9DA 3ZEUB 4KBOA 1X3MA 4FPAA 1K8KB 4IXCA 4PL7A 4BREA 2FSNA 4BRIA 4BR9A 3U4LA 4M63C 3VF6A 1JCGA 5AQKA 2D1KA 3D7EO 1C0GA 1ZXOA 4CBUA 4YDUA 3WXLA 3D2FA 5AQTA 4BRNA 3LDLA 1K8KA 3L4IA 3BUZB 3FZFA 3CERA 3HZ6A 3U8XA 1T6DA 2P9NB 4EHTA 3H3OB 1MWMA 2I7PA 5AQJA 5BN9A 3CJ9A 4H5TA 4EIAA 3WUHA 5AZJB 4B9QA 2PBDA 3VF4A 5FPNA 4IO8A 1GLDG 4BRFA 3H6EA 3IFRA 4CI6A 1KAXA 1BU6O 1BA0A 1EQYA 3LM2A 4FWOA 4RCHA 3ATVA 4YDUC 2FF6A 4H5VA 3WEEB 3F9MA 2E20A 2E2NA 5BPNA 1NGAA 4BC5A 4C23A 5EY4A 1U2VB 4J8FA 3AAPA 1IG8A 1NMDA 1NGJA 3SLCA 5F2RA 2IIRA 1SZ2A 4WQ5A 1DKGD 3M1FA 2V51B 5I9EB 1KXPA 4K42A 3LDNA 1YUWA 1NWKA 1BOTO 2PAVA 4Y0WA 4BC3A 3O5BA 5EVZA 4H0VB 3FGUA 5AQIA 2CGLA 4FWLA 3VEZA 1TYQA 4BGBA 1HKGA 2Q36A 5AQNA 4BRMA 3M3ZA 2OANA 1J6ZA 4B1ZA 3LDQA 4ISFA 3C7NA 3VF2A 1X9JA 4XH5A 3HTVA 1GLAG 2CGJA 1KAYA 3O8MA 5F0XA 5AQQA 3FR0A 4EHUA 4FWNA 4BR0A 2D0OA 3P4IA 5BRHA 5AZIB 4B1VA 2FXUA 3UKUB 2V7ZA 1HUXA 3VGKA 4E1JA 2QWNA 3BF3A 3MN6A 1ZC6A 1NGCA 2J4RA 2FSKA 3WXKA 4B1WB 1LOTB 2W40A 1DGKN 4WQ5C 2P9PB 4BR2A 2IVOA 3SK3A 4RTFD 3VPZA 4CZHA 4FL9A 3CJ7A 3DWLA 1Y64A 1NGBA 3CIPA 1RDWX 4BQLA 2CH6A 3CJ1A 5KPZA 3FZKA 2GTDA 3FLCO 5AR0A 1S3XA 2NRHA 3IMXA 1TUUA 2P9IA 3GE1A 4O5FA 1GLEG 4JAXA 1QQNA 3A8YA 3A5NC 3O4WA 1NGFA 4CD3A 3CJBA 3IDHA 1X3NA 4H0TB 1QQOA 4BQZA 2D4WA 3LDOA 3H45C 3BEXA 1P8ZA 1BO5O 3DXKA 3FZLA 3FZHA 2Q2RA 2HMPA 1T44A 3LDPA 2KHOA 3D2FB 2W41A 5BRDA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1T7AA 3S3MA 2GBZA 3LALA 4DKWA 3DLLL 4F3TA 4FK4A 4O4GA 4DSEA 3JSMA 1LQQA 4CF8A 3DXMB 3SMSA 4FLYA 1C1CA 3RSEA 3W3DA 3AY9A 4BE1A 4JD2A 3RRGA 1VQ6N 1NK0A 1L5UA 2PYLA 2ZJPL 3U9ZA 1X9SA 2YILA 5D3GA 3D2EA 4FZYA 2G8FA 3V1QA 1JKHA 2HHXA 3DXMA 1ZFUA 2W42A 4PA1A 1LQIA 1SV5A 3QICA 2MBKA 3QEIA 2VCPA 3GOIA 3THVA 5KI6A 3AO3A 3M8PA 4WYBA 4GNIA 4BRQA 1DEJA 3SQ0A 3TSPA 4OX9K 3T69A 1OH7A 1CN2A 1MYNA 3A5MC 5C24A 4PL8A 4IFVA 2ITGA 3CCUN 3HPHA 1U47A 4BVPA 4M7YA 3TU5A 2QKBA 3NF8A 1IKXA 3CQYA 3KKRA 1HKCA 2O8DB 1RDDA 2RE2A 1UA1A 5LMNK 2KBJA 4Y1DA 4H8KA 4PKIA 2KPYA 1XHXA 1NM1A 3BZKA 3H3NO 5E26A 3DRPA 5IWAK 3UB5A 5LY3A 4KI4A 3HSCA 2FBTA 4LSNA 4B1UB 1QQMA 1XNRK 4DQRA 3EKUA 1S9EA 3CCMN 1XNQK 5AQWA 4DLGA 4JV5K 4CJ3A 1HNVA 4CJPA 2XY8A 5KQDA 3GKUA 4B1YB 3WNGA 4NYFA 3WXIA 1T6CA 2ITMA 1SEGA 4RG8A 2QK9A 1WT7A 2KTQA 1HNXK 2P9IB 4ZTJA 5JLFA 3AARA 4K25A 3CI5A 1XHZA 1LQHA 5H1SQ 2O8BB 3VERA 3VA3A 4UAEF 4NYNA 3OYEA 4JN4A 3V1OA 3I33A 1BRZA 3A2FA 1GOCA 1KSPA 1XC9A 2UUBK 4HE7A 3J8AA 1ASWA 3ZT2A 5C10A 3DXKB 1EXQA 2FBYA 4BDZA 1LCUA 3SJHA 3MXIA 3FFKB 1T03A 1I6GA 1SAZA 2YJFA 4BR5A 5EOYA 3V9XA 3NCIA 1L3VA 3PX6A 4I6MA 4FM1A 3T19A 3CG7A 1AHOA 1FW6A 4CF1A 3SBGA 1L4VA 3LZIA 3HOSA 4Z94A 4OGEA 3N4QA 4XH1A 1VAZA 3V1RA 3O1WA 2XY7A 1VSLA 4CK3A 3L56A 5SZTA 3O1BA 3AO4A 4DFPA 1KTQA 4JK7A 3AGRA 1VSMA 4CHPA 3KLGA 3AO1A 3LP3A 3CCVN 5C2FA 1HKBA 3G25A 2ATBA 3J80O 3IG1A 4PWDA 2V52B 4AQYK 5FPEA 3VN5A 2OZMA 1SKWA 3LDSA 4NB4A 2ZGYA 1J5OA 2QKKA 3FZMA 3LPTA 4KH5A 1I3AA 1IV0A 2QWQA 1NJWA 4H5NA 4HTLA 3K2PA 4B9LA 2YEOA 5TKYA 4EAHD 4FWQA 2E0HA 4DSJA 2YI1A 3LANA 3TWHA 4V19S 1TKZA 5AQOA 1N34K 3KK3A 1MWKA 3CQXA 1Q18A 4A59A 4A57A 2GX9A 1YVUA 3R6MA 3CC4N 1LWCA 3M8SA 5I3UA 5BR8K 1UAXA 4CGJA 3JYTA 1U04A 4EP4A 4J2BA 4BRKA 5B8HA 3V9SA 1JLBA 1WUAA 2G8UA 3E66A 4QS9A 2YKNA 5C42A 1HLUA 4FW2A 4CD1A 4W5RA 3ZT1A 2PFUA 1JXEA 2X78A 1BL3A 1LW2A 1B9DA 4FLVA 1HJOA 2E6MA 4DFMA 4DQ8A 2HF3A 3EE9A 1NK7A 4NLBA 4DWIA 3EZWA 2ASMA 1SS6A 2RF2A 2ZGZA 4BRDA 4CJFA 5LJWA 3NVKA 2NRRA 1ZBSA 1KD1O 2CH5A 4L3QA 4MO5A 2E4LA 5AQUA 3B8AX 4EZ6A 3AVFA 3I0SA 1S1WA 1N36K 3RMCA 4BR4A 5AQRA 4XJXA 1O13A 4JNEA 3CW4A 1T7EA 4KB0A 1K8BA 2YX6A 4LH4A 3O80A 4DTRA 1OVQA 3VGMA 2QWOA 3QB0A 2IOCA 3U3GA 2E3FA 2A6AA 3SPYA 1S22A 1VQ8N 1BUPA 4FZZA 3OYIA 2A5XA 3VGLA 3AGKA 1IKWA 4PUOA 4XEIA 1QVGM 2HBLA 1QSYA 3KC6A 4KRFA 1P00A 1HR0K 4WQ4C 5AJ3K 4W5QA 1ATRA 4AM6A 4C8MA 1NGEA 2YCHA 3DLRA 3DOKA 1LWFA 3OYDA 3JXUA 1RNHA 4KTWA 4FSVA 3G10A 1B92A 4BRAA 2P9PA 1BDGA 5TKWA 4BDYA 3PX0A 2MZ0A 2XO7A 2UUCK 3HP9A 1HYVA 5CYQA 3O3FA 2ASCA 1O1WA 5E84A 1SN1A 3VEOA 4AHCA 1CXUA 2QXLA 4DQSA 3ENHA 3OHRA 2D0BA 2NZTA 3THXB 3AVCA 3THYB 3CYGA 3ZEUB 4DF8A 3HJFA 4A5BA 3OJSA 1VSKA 4FPAA 3V9WA 4DV7K 1HRHA 3G4SN 2O8EA 2HNZA 4JLHA 5HRPA 4YDUA 4JKAA 2KYQA 3DI6A 3O3HA 2G2KA 3L4IA 3CERA 4KKOA 1T6DA 2P9NB 4EHTA 3H3OB 1U45A 5J1EA 5AQJA 5BN9A 4FXDA 4M3YA 4H5TA 4YNQA 3NMUA 1LAWA 4CW7B 3VQEA 1HPZA 1I39A 3T1HK 4E0DA 4J2AA 4CEFA 4B3OA 1P0AA 5FPNA 3AVNA 4BRFA 1BU6O 2BH1A 1OH8A 1ZBFA 4CGGA 1Q8IA 3KK7A 1EQYA 3LM2A 4FZXC 3SZ2A 3O9SA 3OY9A 4ICLA 3KOWA 5CYMA 5A2QO 3ATVA 1RILA 1XMOK 3WEEB 4H5VA 2E20A 5BPNA 1NGAA 1A5WA 3VQDA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1T7A A;  3S3M A;  2GBZ A;  3LAL A;  4DKW A;  3DLL L;  4F3T A;  4FK4 A;  4O4G A;  4DSE A;  3JSM A;  1LQQ A;  4CF8 A;  3DXM B;  3SMS A;  4FLY A;  1C1C A;  3RSE A;  3W3D A;  3AY9 A;  4BE1 A;  4JD2 A;  3RRG A;  1VQ6 N;  1NK0 A;  1L5U A;  2PYL A;  2ZJP L;  3U9Z A;  1X9S A;  2YIL A;  5D3G A;  3D2E A;  4FZY A;  2G8F A;  3V1Q A;  1JKH A;  2HHX A;  3DXM A;  1ZFU A;  2W42 A;  4PA1 A;  1LQI A;  1SV5 A;  3QIC A;  2MBK A;  3QEI A;  2VCP A;  3GOI A;  3THV A;  5KI6 A;  3AO3 A;  3M8P A;  4WYB A;  4GNI A;  4BRQ A;  1DEJ A;  3SQ0 A;  3TSP A;  4OX9 K;  3T69 A;  1OH7 A;  1CN2 A;  1MYN A;  3A5M C;  5C24 A;  4PL8 A;  4IFV A;  2ITG A;  3CCU N;  3HPH A;  1U47 A;  4BVP A;  4M7Y A;  3TU5 A;  2QKB A;  3NF8 A;  1IKX A;  3CQY A;  3KKR A;  1HKC A;  2O8D B;  1RDD A;  2RE2 A;  1UA1 A;  5LMN K;  2KBJ A;  4Y1D A;  4H8K A;  4PKI A;  2KPY A;  1XHX A;  1NM1 A;  3BZK A;  3H3N O;  5E26 A;  3DRP A;  5IWA K;  3UB5 A;  5LY3 A;  4KI4 A;  3HSC A;  2FBT A;  4LSN A;  4B1U B;  1QQM A;  1XNR K;  4DQR A;  3EKU A;  1S9E A;  3CCM N;  1XNQ K; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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