5AQJA

Fragment-based screening of hsp70 sheds light on the functional role of atp-binding site residues
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
381
structure length
381
Chain Sequence
MSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title A fragment-based approach applied to a highly flexible target: Insights and challenges towards the inhibition of HSP70 isoforms.
pubmed doi rcsb
molecule keywords HEAT SHOCK COGNATE 71 KDA PROTEIN
molecule tags Chaperone
source organism Homo sapiens
total genus 122
structure length 381
sequence length 381
chains with identical sequence C, E
ec nomenclature ec 3.6.3.51: Transferred entry: 7.4.2.3.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5aqjA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqjA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqjA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5aqjA04
4J8FA 3CHWA 2CH6A 4BC5A 3G25A 5E84A 3B8AX 1YVNA 1ATRA 3WXLA 4BGAA 2KHOA 4H0OA 4EAHD 5BRFA 2IVNA 3MMVA 4YDUA 1NGBA 3RSEB 4QS8A 4NB4A 4BRGA 4O8KA 3D2FB 4BG8A 3CERA 2IVOA 1MDUB 4LC9B 3WT0A 3A5MC 1LCUA 2E20A 2D1KA 3VEYA 3IUCA 2YJFA 3VF2A 4BR7A 4B1XB 3UB5A 1ATSA 4IWVA 3WXIA 5ADXA 2ASPA 1TYQA 3LM2A 4JHDB 4MLHA 2E8AA 1P8ZA 4B1YB 2P9KB 3A0IX 1G99A 3D7EO 2QWOA 1BUPA 3VPZA 3ZX2A 4BR5A 3QFUA 4WQ4A 2AA4A 1GLDG 5F2RA 4ISEA 2ASMA 1NGEA 5EVZA 4XH4A 1XC3A 4DHYA 4FPAA 5B8HA 2AP1A 5AQFA 3WXKA 3JXUA 2QWMA 3AARA 1NGJA 3FE1A 3O08A 5ADXH 5AZIB 2P9UB 3DXMB 2P9NA 3SK3A 3QB0A 1QQOA 3CIPA 3DXKA 2H3GX 2A40A 4IJNA 4BG9A 1GLFO 1BA0A 4HTLA 4B1UB 1E4FT 4DCHA 2NRHA 3BF1A 3O8MA 1U2VA 1NGCA 5AQZA 2D0PA 4IXCA 4PKIA 4GNIA 2V7ZA 2F9WA 4CZHA 5BPLA 2ZF5O 2ITMA 5F1XA 1DGKN 3VGKA 4CZEA 4K42A 2E2NA 5AQJA 1HUXA 2P9LB 1XUPO 3H45C 3CJAA 5ELZA 3TU5A 2Q0UA 1BG3A 2E88A 3GDQA 5EXWA 2VWBA 4H03B 3ULEB 3S41A 1KAZA 1NGHA 4E1JA 2WUSA 4MO4A 3O1WA 3GG4A 2YHYA 1ZXOA 3HI0A 1HX1A 4WQ4C 3FZFA 4I6MA 4BRMA 3H1QA 5AZJA 5AQOA 1MA9B 4F9OA 3VEZA 2VYPA 3D2EA 3QMLA 1ZBSA 1BO5O 2I7NA 4BRNA 2F9TA 4H5WA 2GUPA 1BDGA 2E2PA 1ZC6A 5EY4A 2P9PB 2CGLA 3VESA 3ATUA 5KPZA 2P9SB 1RFQA 3L6QA 1TUUA 4BC3A 5BRHA 4RWTA 3I33A 2QWRA 3FZHA 3MCPA 1MWMA 4XH1A 2Q36A 1KAXA 3C0BA 3H6EA 3CJ7A 2FF6A 4FL9A 3BEXA 5AQQA 2P9IA 3CJ1A 3MN9A 4CZJA 4IO8A 4B1ZA 4CZIA 4EFHA 5AQXA 1HKGA 1Z6RA 1K8KA 2PAVA 4BR0A 5AQTA 2HF4A 4NO7A 2UYTA 4A62A 3ATVA 1TYQB 2CGJA 4BC4A 4H0TB 4BVPA 5AQLA 4HWIA 1T6CA 2V51B 3O80A 3AY9A 1D4XA 3VGLA 2YHWA 3VETA 5AQRA 4H5NA 3U9ZA 3CQYA 5KPRA 4DB3A 1Z05A 2A42A 4A2AA 3UKUB 3LDPA 1BU6O 3FZKA 2Q2RA 2GEMA 1TUYA 5BN9A 2PBDA 3ENHA 4FWRA 3I8BA 3MK6A 4FWSA 5AQMA 1NGGA 3CJBA 3DAWA 3CQXA 2A41A 4CZGA 4H0PA 3LDQA 4H5RA 2VCPA 4XEIA 3TPQA 1KAYA 1U2VB 2QWQA 2E2QA 2EWSA 3VF6A 3FZLA 4K43A 3C7NA 4BC2A 3VEWA 3CJCA 2BTFA 2E2OA 3FLCO 4WQ5A 3VF4A 5BREA 2YJEA 1QZ5A 1WOQA 5BR9A 4BRFA 3O4WA 4BGBA 1J6ZA 3CJ9A 3P4IA 3MN5A 3SJHA 4O5FA 4K41A 4FO0A 2Q0RA 3UKRA 1IJJA 4YDUC 5KQ8A 2CH5A 3DWLA 1Q18A 5AR0A 1JCFA 2GELA 2YI1A 2FF3B 4I6MB 1NGFA 2NZTA 3EZWA 3KVGA 1HJOA 1NGDA 4FWPA 3L4IA 3VERA 3VGMA 5LJVA 2P9KA 1HPMA 1DKGD 4BRPA 1YAGA 3BUZB 4JD2B 4BRLA 4M7YA 4BRIA 1V4TA 2GWJA 5BPMA 4XH5A 2GTDA 2HOEA 4QS7A 1S3XA 2HF3A 1T44A 4FWLA 3VEVA 4A2BA 5LJWA 4Y0WA 4JAXA 5CE3A 4CI6A 4IZ9A 1BA1A 4CD1A 2BUPA 1QHAA 3R9PA 4B9QA 4FWKA 4BROA 4B1VA 2FSJA 1SZ2A 4CD3A 1RDWX 5I9EB 4PKHA 2I7PA 4PL7A 3FFKB 2P9IB 1V4SA 1X3NA 1WUAA 1U6ZA 3O6WA 1ESVA 4BRQA 3R8EA 3KHYA 1EQYA 2FSKA 3MN7A 3ZETA 3IFRA 3HSCA 3J8AA 1BWFO 3QICA 4FOEA 4CBWA 5KPTA 4FWOA 3M1FA 4FSVA 3QFPA 4ISFA 3LDNA 1GLJO 3M3ZA 3H3OB 3L0QA 5AQWA 4L3QA 3O1BA 5JMVA 1E4GT 3GE1A 4ISGA 1SAZA 4H0VB 1JCGA 1NLVA 4FWMA 3H3NO 3GBTA 4H0XB 5AFUA 3VOVA 3LDOA 3OHRA 3LL3A 3U8XA 1DEJA 4BRAA 2GWKA 5FPMA 1S22A 2CGKA 2QWPA 1ATNA 5AQYA 3HM8A 1QQNA 2ZGZA 5AQHA 4C23A 3QBXA 1GLLO 1NGIA 3KZBA 2P9PA 3A8YA 1C0GA 1Y64A 2YHXA 3ZX0A 4FWNA 4JN4A 1QQMA 2W41A 3CI5A 1KXPA 5KQDA 2FSNA 1X3MA 3WQUA 3A5NC 4CBXA 2P9NB 4BRKA 3DXKB 4RCHA 4BR9A 4BRCA 3WEEA 2J4RA 3DJCA 3FR0A 3R6MA 1HLUA 4BQZA 3UKRB 3W0LA 4CZMA 3U4LA 4Z94A 4FPBA 3ZEUA 3M6GA 3SMSA 4K25A 2IVPA 3JS6A 4FOIA 4JNEA 3SMPA 5AQUA 4BREA 1HKBA 3FGUA 1JCEA 4PKGA 1RGIA 3W3DA 4CBUA 1NBWA 4AM7A 5AQNA 4QS9A 4RTFD 3RSEA 5EX5A 5FPNA 5LY3A 3LM9A 3D2FA 2NLXA 4BQLA 2A5XA 3VENA 3UKUA 1GLCG 1GLAG 2DPNA 4H5TA 2QXLA 5AZJB 2QW9A 1C0FA 4JHDA 3F9MA 4KBOA 3EKUA 3D2EB 5AQVA 5BPNA 2ZWHA 3A5OC 1YXQA 3ENOA 3MN6A 5F0XA 2OANA 1OKJA 3MDQA 3EKSA 3H1VX 3H46O 4A61A 4BVOA 5FPDA 2ASOA 5JLHA 3GL1A 1SQKA 5BN8A 5FPEA 3ZETB 4CZLA 3VEXA 4H0YB 3BP8A 2FXUA 5AZIA 2P9UA 3DXMA 1YUWA 4B1WB 3QDKA 3WUHA 4MLEA 3WQTA 5AQIA 2Q31A 4WQ5C 3EL2A 1H1VA 3WXJA 2QWLA 2HMPA 4BR4A 1NM1A 3IDHA 1XQSC 4FWQA 1K8KB 3O5BA 2D0OA 5AQKA 4AM6A 1GLEG 5E26A 5JICA 2A3ZA 4BRHA 2E1ZA 3FZMA 3HBTA 3HZ6A 5AQSA 3BF3A 1CZAN 1NMDA 2P9LA 3UE5A 1LOTB 4M63C 5AQPA 5AQGA 3U9DA 3ULEA 3ZX3A 3IMXA 4CZFA 4EIAA 5EOYA 4JD2A 3GOIA 2E1YA 4PL8A 1NGAA 2IIRA 2Q1NA 4BRDA 2FLOA 1T6DA 3AAPA 4EHUA 3QBWA 3CETA 4IJAA 2A6AA 1R59O 4BR2A 2QM1A 1MWKA 1HKCA 3AAQA 3WEEB 1QZ6A 4CJ7A 3ID8A 5BRDA 5TKYA 3VEOA 4DQ8A 2QWNA 3A5LC 2YCHA 4GY2B 4EHTA 4MO5A 1BOTO 2W40A 1X9JA 4M7XA 3ZEUB 3EO3A 1IG8A 5AFUH 4WYBA 1NWKA 2V52B 4CZKA 4H5VA 1GLBG 2Q97A 2P9SA 3EN9A 2D4WA 3LDLA 3C7NB 2ZGYA 3HTVA 5JLFA 2V7YA 3SLCA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4BC5A 2CH6A 5E84A 1YVNA 3BZKA 1RT1A 3RWUA 4H0OA 3AVLA 2ZD1A 5CYQA 3HM9A 3MMVA 2YEOA 1RTDA 2X6NA 4BE0A 4IOCL 1NGBA 2RE2A 4EZ6A 1IKYA 1LWCA 2YC1C 3NF8A 3A5MC 4OKJA 4ZTFA 4O8UA 4CEAA 4KTWA 3VEYA 3IUCA 1HJRA 5CY0A 4FJLA 1SS6A 4IWVA 4MLHA 3C6HA 4AH9A 3THYA 3OYDA 1G99A 3LP1A 2QWOA 1CZ9A 1WBBA 4GVEA 5HRRA 4B9UA 3VPZA 1LQIA 3QFUA 1W9HA 2YHBA 3V9WA 1T0ZA 3HT3A 3LAKA 3CCSN 2KJAA 4OGEA 3V1RA 2AP1A 5LMUK 3DLKA 1HMVA 1HNIA 1UWBA 1QQOA 4KPYA 4JKDA 3E9LA 2DFHA 4CESA 1GLFO 1BA0A 4HTLA 4B1UB 1ZBHA 1TAQA 4DR7K 4DCHA 3K58A 2NRHA 2YV0X 4W5OA 1LAVA 3OYEA 5AQZA 3KK3A 1QSYA 3VN5A 3VQQA 2ITGA 2ZF5O 2D5RA 2OPRA 3OJUA 3BDPA 4DLEA 1U49A 1NRAA 1WSGA 1ZBUA 3CJAA 4DTMA 3D0PA 4JKCA 3S41A 2ETJA 3AO1A 4GV9A 1RDAA 3KK2A 3K5OA 3I0SA 4GW6A 1IG9A 4HHFA 4CEEA 3QO9A 4B9SA 1ZXOA 3P5JA 3HI0A 3DI6A 3LP2A 1QS4A 1Q8IA 4I6MA 4CHYA 3QNNA 4HE7A 2NY8X 3LWMA 4CEQA 4F9OA 1B9DA 3O4NA 3QMLA 1ZBSA 1EO1A 2I7NA 3PSMA 2MBKA 1FXXA 3K5MA 2G8UA 4E7LA 2E2PA 1UOCA 3SUQA 3C65A 3SYZA 2KZZA 3NF9A 3H08A 2JLEA 3VQAA 2O8CB 3L6QA 3A2FA 2RN2A 5BRHA 3I33A 1FKPA 3I0RA 3FZHA 4PQUA 4DSIA 4CJTA 1HNVA 3I56N 3SBTA 4WF9L 4FJKA 1N6QA 5A2QO 1YTUA 3MX2A 1JLEA 5AQQA 4M42A 3CJ1A 1C1AA 3KP1A 4IO8A 3I55N 1HNXK 4EFHA 4DU4A 5AQXA 1Z6RA 1JLFA 2HF4A 1K6YA 3K9JA 2ATQA 4NO7A 4DTOA 4H0TB 4A57A 1S9GA 5AQLA 4BE2A 3MEGA 4KI6A 1T8EA 1I6FA 1WNSA 1T6CA 2G8HA 4JKGB 3LDSA 1D4XA 2YHWA 2RPIA 1WSEA 3U9ZA 4A2AA 3UKUB 4E89A 5C42A 4DWIA 4RW7A 2GEMA 1CZBA 3L4QA 1NE5A 4B9LA 1IKXA 2KZMA 1SN1A 4FWSA 3Q7CA 3DAWA 2A41A 4CF8A 4DV5K 3KKRA 2B4JA 4H0PA 1C56A 1VQMN 4XEIA 3P1GA 2EWSA 2LSNA 3VF6A 1IKWA 1GPSA 4CGIA 3FZLA 3HPOA 3KKSA 4CJRA 3VEWA 1C1BA 3CJCA 4GKJK 3TTCA 2E2OA 3AO4A 2X6SA 4HTUA 4IG3A 3AVFA 1J6ZA 1WBDA 4FJIA 4O5FA 1RBVA 4FO0A 4J2DA 2O4GA 3DWLA 1ASUA 5AR0A 4LF6K 5BR8K 1RTJA 4CJSA 3VQ6A 5HL7L 2HBKA 4JI8K 1TGOA 3L4IA 3KOZA 3VGMA 2QA4N 4DSFA 4BRPA 4ZHRA 1YAGA 3OS0A 2PYJA 3BUZB 1RBUA 1B7DA 3ZT4A 3NH2A 1V4TA 2GWJA 3M8PA 4O4GA 4FWLA 1L3UA 3J7ZO 1GOBA 4CF0A 4FZZA 1KSPA 3PLAA 4JAXA 3DLEA 1O13A 3WNFA 3HOSA 2BUPA 1JXCA 4B1VA 4C8LA 1U48A 3DLLL 4CQKA 3M5RA 4DV7K 3M8SA 4PKHA 3ZSZA 2I7PA 2ZM6K 4DUYK 2VG6A 4E72A 1V4SA 4GV6A 1WUAA 3F2KA 1RTHA 3KHYA 1EQYA 1W0HA 2FSKA 2D0CA 4FOEA 1OH7A 3O9QA 2PYLA 4DLGA 4KHYA 2LN8A 1KD1O 3QFPA 3QEXA 1RT5A 1GLJO 3M3ZA 3H3OB 3L0QA 4UY8O 4Z4GA 4L3QA 1LWFA 2W6KA 3OTOK 3THVA 4WFNL 3IAYA 1T05A 1RDBA 1SAZA 3RRHA 4AHRA 4FLWA 1MYNA 1JCGA 4OPAA 3H3NO 4CJPA 2LJ7A 2DFFA 3TI0A 3AVJA 4HHTA 2YIPA 5KGXA 1DEJA 1WN7A 2F96A 5FPMA 1DQ7A 4JI7K 3HM8A 5AQHA 3CXCM 4FVUA 1C1CA 4DFMA 1E3MA 5DM6L 4KFBA 3VQ8A 4AQYK 3AVIA 4KHSA 2W41A 1NJWA 2FSNA 3T7ZA 5C12A 5DK5A 2YBRC 1XHZA 2JGUA 2OPSA 3QERA 1GPTA 3W0LA 4Z4FA 1NKBA 1M1KO 3U4LA 4CGHA 2YILA 4FPBA 1EXQA 1NK7A 2HBJA 3ZT2A 5JVHL 2UU9K 3LP3A 3ISNC 4K25A 1L4VA 3CCVN 2IVPA 4CFAA 1WWNA 4ILGB 4LSNA 1P00A 4F8RA 4DKWA 2IAJA 3NH1A 1N8RO 1EP4A 2OPQA 2XY6A 2Z1HA 3FGUA 3NMUA 1FW6A 1I3AA 3ZSRA 4B8AB 3L2QA 3QEWA 1TK5A 4AILC 4ELTA 4M3UA 3VQBA 4HUGA 4DV2K 5LY3A 3LM9A 1T1TA 3D2FA 2A5XA 5FLXO 1A5VA 3QESA 4EZ9A 3ZSYA 3AV9A 1GLAG 1DJTA 4IFVA 1VAZA 4CGJA 4CE9A 1OH6A 2C1GA 1KVAA 4W5TA 3F9MA 1XNQK 4NYFA 3EKUA 3FFIA 3D2EB 1WLJA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4BC5 A;  2CH6 A;  5E84 A;  1YVN A;  3BZK A;  1RT1 A;  3RWU A;  4H0O A;  3AVL A;  2ZD1 A;  5CYQ A;  3HM9 A;  3MMV A;  2YEO A;  1RTD A;  2X6N A;  4BE0 A;  4IOC L;  1NGB A;  2RE2 A;  4EZ6 A;  1IKY A;  1LWC A;  2YC1 C;  3NF8 A;  3A5M C;  4OKJ A;  4ZTF A;  4O8U A;  4CEA A;  4KTW A;  3VEY A;  3IUC A;  1HJR A;  5CY0 A;  4FJL A;  1SS6 A;  4IWV A;  4MLH A;  3C6H A;  4AH9 A;  3THY A;  3OYD A;  1G99 A;  3LP1 A;  2QWO A;  1CZ9 A;  1WBB A;  4GVE A;  5HRR A;  4B9U A;  3VPZ A;  1LQI A;  3QFU A;  1W9H A;  2YHB A;  3V9W A;  1T0Z A;  3HT3 A;  3LAK A;  3CCS N;  2KJA A;  4OGE A;  3V1R A;  2AP1 A;  5LMU K;  3DLK A;  1HMV A;  1HNI A;  1UWB A;  1QQO A;  4KPY A;  4JKD A;  3E9L A;  2DFH A;  4CES A;  1GLF O;  1BA0 A;  4HTL A;  4B1U B;  1ZBH A;  1TAQ A;  4DR7 K;  4DCH A;  3K58 A;  2NRH A;  2YV0 X;  4W5O A;  1LAV A;  3OYE A;  5AQZ A;  3KK3 A;  1QSY A;  3VN5 A;  3VQQ A;  2ITG A;  2ZF5 O;  2D5R A;  2OPR A;  3OJU A;  3BDP A;  4DLE A;  1U49 A;  1NRA A;  1WSG A;  1ZBU A;  3CJA A;  4DTM A;  3D0P A;  4JKC A;  3S41 A;  2ETJ A; 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