5AQKA

Fragment-based screening of hsp70 sheds light on the functional role of atp-binding site residues
Total Genus 121
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
121
sequence length
378
structure length
378
Chain Sequence
GPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title A fragment-based approach applied to a highly flexible target: Insights and challenges towards the inhibition of HSP70 isoforms.
pubmed doi rcsb
molecule keywords HEAT SHOCK COGNATE 71 KDA PROTEIN
molecule tags Chaperone
source organism Homo sapiens
total genus 121
structure length 378
sequence length 378
ec nomenclature ec 3.6.3.51: Transferred entry: 7.4.2.3.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5aqkA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqkA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqkA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5aqkA04
2V7ZA 4FWSA 3O80A 4YDUC 3I33A 2E2OA 2P9LB 1H1VA 3GL1A 3VEOA 3UB5A 4K25A 3WXJA 5LJVA 4FPBA 2V51B 2P9PA 2IIRA 1GLEG 2BUPA 4H5NA 4BGAA 2QWOA 3HZ6A 1QQOA 3MMVA 4JHDB 3D2EB 1QQMA 5EX5A 4QS7A 1Z05A 2PAVA 3BP8A 2YHWA 3IUCA 4HTLA 4BRFA 2E88A 1HKGA 3O6WA 3CI5A 3VGKA 2QWMA 1HUXA 4H0XB 1CZAN 1K8KA 5FPMA 2D1KA 2E2PA 2FF6A 3EN9A 1MA9B 4CD1A 1IJJA 2A3ZA 4EHTA 3QMLA 4B1WB 4B1YB 5LY3A 1NLVA 3QDKA 1OKJA 4CZJA 1G99A 3SMPA 1NGJA 1GLCG 1SZ2A 2Q1NA 5AQWA 1V4TA 4NB4A 2CGJA 1U2VB 2YI1A 5BPMA 4XEIA 5KQDA 3I8BA 3F9MA 3WXKA 3KZBA 4IXCA 5AQTA 5AQGA 4AM7A 4FWKA 4L3QA 3BEXA 3H6EA 2FF3B 3MDQA 4BR2A 3GDQA 1BWFO 4CBXA 4IZ9A 3DAWA 2I7PA 5BN8A 4BRKA 2PBDA 4FWOA 1GLJO 3D2FB 3IDHA 3DWLA 5AQZA 3UE5A 4EIAA 1RGIA 3MN7A 2QWNA 4BRGA 4RTFD 2YJEA 1BO5O 5E84A 3S41A 3VGMA 2I7NA 3M6GA 3CJAA 4XH4A 5E26A 3VENA 1MWMA 3P4IA 4H5TA 3M1FA 3W0LA 3EL2A 5AQMA 3LDQA 1XC3A 2ZWHA 4BGBA 3C7NA 3ZETA 3TPQA 2IVPA 3VERA 2QWLA 2CH6A 2A40A 4B1ZA 3VETA 2QWPA 3ZX3A 3RSEA 4IO8A 2Q97A 5BRDA 4M7YA 4MLEA 4WQ5C 1DEJA 2P9IA 2QW9A 4BRNA 2OANA 3WQTA 2GEMA 3GOIA 4MO4A 2Q2RA 5BPLA 3VEXA 4BR9A 1KAXA 3H1QA 1MWKA 3WUHA 3QFUA 5CE3A 4NO7A 4A61A 3WEEB 1NGCA 5JMVA 1X3MA 5KPTA 4BR7A 4CJ7A 3LDOA 5AQLA 3L6QA 3HSCA 5AZJA 5AQVA 5ADXH 1E4FT 4I6MA 4H5WA 4FL9A 4JD2B 4H0OA 1NGFA 2UYTA 2HF4A 3HM8A 2A6AA 3HTVA 3UKUA 5AQKA 2A42A 4BREA 1JCGA 4FOEA 4B9QA 5KPRA 3VEYA 1TYQA 2P9NB 5LJWA 5EY4A 3G25A 1GLFO 3DJCA 3DXMA 3D7EO 3VOVA 5AQUA 2D0OA 4O8KA 5AQNA 3VF2A 5AQYA 1TUYA 4H5VA 3MN9A 3CQXA 2A41A 5KQ8A 1X9JA 4PKGA 2E8AA 1KXPA 4H03B 1S3XA 4FWPA 3AARA 3WT0A 3W3DA 2VWBA 4BVPA 3MN5A 4BC4A 5AZIA 1GLAG 3FFKB 1EQYA 4DCHA 2ZGZA 1HLUA 2HMPA 2J4RA 2V52B 3WXIA 2ITMA 5AR0A 3U9ZA 1KAZA 2W41A 5AFUA 4WYBA 1C0GA 4FSVA 5BR9A 4AM6A 1HPMA 1U6ZA 3EKSA 3SJHA 4CZIA 1RDWX 3LM9A 3ZEUA 4DQ8A 2P9LA 3O5BA 5AFUH 5EOYA 2FSKA 3JS6A 1YAGA 5AQXA 4H5RA 5EXWA 3QBXA 3BF1A 1HJOA 3VF6A 4C23A 1BG3A 4H0PA 2NLXA 3FZFA 1MDUB 1NWKA 2BTFA 2P9SB 3DXKB 2A5XA 5AQIA 3ATUA 4JHDA 4GNIA 1LCUA 4PKIA 1QHAA 1NM1A 3HBTA 4DB3A 5JLHA 1IG8A 4YDUA 3WXLA 3A8YA 3B8AX 4WQ4C 1GLDG 5JICA 4E1JA 1YUWA 1ATSA 2GWJA 3TU5A 2ASPA 3UKRB 4BRDA 1NGDA 3H1VX 1RFQA 3QB0A 1DGKN 1XUPO 3KHYA 2FLOA 4MO5A 4BR4A 3GE1A 1T6CA 3IFRA 3A5NC 4CZFA 1KAYA 3R8EA 1D4XA 3MN6A 3CJ9A 2E2NA 4FWMA 2YHYA 5AQRA 3H45C 3A5MC 2E1ZA 4JN4A 1WUAA 4BRCA 4BQLA 4FOIA 3QICA 5F1XA 3OHRA 4BRHA 1SQKA 1NGIA 2KHOA 3ENHA 1NGBA 2QXLA 5EVZA 1TUUA 1ESVA 3L0QA 4QS8A 1V4SA 5ELZA 1GLBG 3EO3A 3ULEA 4I6MB 4B1UB 2HF3A 4BRLA 1BDGA 5FPEA 1NGAA 1NGHA 1HKBA 3U8XA 2YCHA 4BVOA 1C0FA 5AQHA 2YHXA 5BRFA 4EFHA 3FZKA 1BA0A 3VPZA 1XQSC 1S22A 3FZLA 1Q18A 2WUSA 3VEZA 1HKCA 1NMDA 4FWLA 1P8ZA 2F9WA 4H0VB 4RWTA 3ZX0A 4IWVA 4JAXA 4F9OA 4BR5A 2P9PB 4BC3A 3AY9A 1BA1A 1R59O 3CJCA 3GG4A 3MK6A 3LM2A 3AAPA 5AQPA 2YJFA 4QS9A 5AQFA 5BRHA 2ZGYA 4FWNA 4IJNA 5AQOA 5BN9A 1K8KB 4BR0A 1WOQA 3BF3A 1JCFA 1ZC6A 4BROA 3GBTA 1QZ5A 3WEEA 2D4WA 2VYPA 2H3GX 4PL8A 4CD3A 3H3NO 4DHYA 2AP1A 4WQ5A 3CJ7A 1ZBSA 1T44A 5KPZA 4BRMA 2ZF5O 2ASMA 1HX1A 3IMXA 4JD2A 1NGGA 4CZEA 4XH5A 3FGUA 2E20A 4A62A 3CERA 2Q31A 3C0BA 3O4WA 4Z94A 2GWKA 3L4IA 2NZTA 2P9KA 4B1XB 3U9DA 3CJBA 3AAQA 3CETA 4BG8A 4CBWA 2CH5A 5F2RA 5FPDA 2P9UA 3ID8A 3O08A 1BOTO 4FWQA 3VEWA 2P9NA 4PKHA 1NGEA 4A2AA 2ASOA 4ISFA 3VEVA 3LL3A 4PL7A 4O5FA 5B8HA 4BRQA 1DKGD 5AQQA 4EHUA 2E2QA 1E4GT 1J6ZA 3JXUA 4BRPA 4CZKA 1X3NA 4FWRA 2FSJA 3H3OB 3J8AA 3SMSA 2IVNA 3CHWA 3D2EA 3EKUA 3BUZB 1Y64A 3ATVA 4BQZA 3QFPA 2QM1A 5FPNA 5AQSA 2W40A 3SK3A 3MCPA 4M63C 5JLFA 3R9PA 3C7NB 2QWQA 4MLHA 1YVNA 3ZETB 1Z6RA 4CBUA 1QZ6A 4BRIA 3RSEB 4RCHA 4KBOA 3WQUA 4CZMA 4ISEA 5BPNA 4H0TB 4EAHD 4CZLA 2P9IB 2AA4A 3A5OC 3ULEB 5I9EB 4CI6A 1U2VA 2QWRA 5TKYA 2DPNA 2HOEA 4CZGA 3M3ZA 4A2BA 3R6MA 2P9SA 3FLCO 1GLLO 3QBWA 3DXKA 1YXQA 3A0IX 1BU6O 2Q36A 3CQYA 4FO0A 4K41A 5AQJA 3O1BA 3VGLA 3CJ1A 4Y0WA 1ATRA 4LC9B 5AZJB 4HWIA 3CIPA 2EWSA 3UKRA 3LDPA 1SAZA 2GUPA 4BC5A 3D2FA 3A5LC 2IVOA 4FPAA 2VCPA 4K42A 3SLCA 3LDNA 3UKUB 3EZWA 3FZHA 4BC2A 2GTDA 2FXUA 1ZXOA 5BREA 3O1WA 4XH1A 1TYQB 4CZHA 1BUPA 1NBWA 3DXMB 4WQ4A 5F0XA 2V7YA 2CGLA 3FR0A 2Q0RA 4JNEA 4M7XA 3ZX2A 4GY2B 2FSNA 5ADXA 4IJAA 3HI0A 3ENOA 3LDLA 4K43A 4BRAA 3VESA 2F9TA 1QQNA 5AZIB 1JCEA 2D0PA 4H0YB 4B1VA 2NRHA 3H46O 2Q0UA 2E1YA 4J8FA 3O8MA 1ATNA 2GELA 3FZMA 1T6DA 2CGKA 2P9KB 3U4LA 1LOTB 3KVGA 4BG9A 3FE1A 2P9UB 4ISGA 3VF4A 3ZEUB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4KB0A 1QTMA 4YDUC 2NRTA 3LZIA 4B9VA 1IH7A 4K25A 1FK9A 4IDHA 2YBRC 1C1CA 2BDPA 4DV6K 1GLEG 2BUPA 1IKXA 2RPIA 3ZYYX 2GX9A 4QS7A 3TR8A 4CJFA 4B3TK 2QWMA 1VSFA 1CZAN 4E7IA 1GOCA 2D1KA 2FF6A 4CF9A 2A3ZA 1KRPA 4DQRA 4FZXC 1HYSA 5LY3A 3THYB 1NLVA 3KOYA 3QDKA 4C8MA 4LH5A 4UAFE 1WB9A 1KVAA 1KFDA 4IKFA 2HHVA 5AQWA 3I8DA 4IO9L 3T1HK 2YI1A 5BPMA 4PUOA 4X62K 3SUNA 1CZBA 4EP4A 4UY8O 5AQGA 1BCMA 2UUAK 4AM7A 2PZSA 2ZM6K 3HP6A 4CEZA 3H6EA 4I9QA 5GIOA 3GDQA 4CBXA 3KHWA 4IZ9A 1J53A 3KLFA 1KLMA 2PBDA 1GLJO 2ASCA 4KH6A 3N4QA 2VQEK 2E5LK 1RGIA 4BRGA 4YOWA 4W5QA 1BO5O 3QLHA 2W6KA 3M6GA 4AHTA 2RN2A 3AVGA 3M1FA 3EL2A 3L56A 4BGBA 3C7NA 4CESA 4E19A 2CH6A 2A40A 2HVIA 2HBMA 3F2KA 2QWPA 3VETA 3ZX3A 4CF8A 3QEWA 4KFBA 2IAJA 4M3RA 1JXCA 4BE2A 1VQ9N 4ID5A 3KIOA 3OBYA 4RW4A 4IEIA 4MLEA 5LL6Z 1S1XA 3QEIA 3K5MA 2O8FA 1DEJA 3A2FA 4DFKA 4CK2A 4RW8A 5HBMA 4BDPA 3MX5A 4CF2A 4B9SA 3WQTA 3LDSA 4M3YA 4MO4A 5C0YA 1BIZA 4BR9A 4F2SA 1Z25A 3WUHA 3QFUA 2Z1HA 1D9DA 5JMVA 3K2PA 1FW6A 5LMUK 2M8BB 3VQ5A 4F8RA 5AZJA 1E4FT 4I6MA 4H5WA 4CIGA 2DFHA 4H0OA 5EU7A 1TK5A 4KTZA 2YC1C 4MQ3A 5HRNA 1XWLA 2A42A 4LFAK 3KC6A 2KZMA 1WSJA 1TL3A 4KAZA 2FBXA 3OYLA 3VEYA 2P9NB 3D7EO 5I3UA 5AQUA 2D0OA 3VF2A 4RW7A 2B68A 2QEXN 1TUYA 3G6EN 4H5VA 2DTUA 2ITGA 1O13A 3KTQA 1X9JA 4FVMA 1KXPA 1S3XA 1T1TA 4LF6K 4JRQA 4FJNA 2VWBA 4DU3A 4DCHA 1WSGA 2ZGZA 1HLUA 2J4RA 2V52B 3WXIA 1I2VA 3CCSN 4PHTX 4WYBA 4CFBA 5BR9A 4AM6A 4HHFA 3B6OA 5GAGP 1U6ZA 4GVEA 1SL2A 2E6MA 3G4SN 4DV3K 2HHXA 2XY7A 2HBKA 1KQSM 4GV3A 4J2EA 4GV6A 3LWMA 1Q82O 4FLUA 5AFUH 3CMEN 3K57A 3JS6A 1YAGA 1U47A 3PO4A 3ZT2A 3BF1A 5A2QO 5M1NA 1BG3A 3AVNA 4KH5A 1NWKA 3ATUA 4B9LA 4PKIA 5HRPA 2FBYA 3I0RA 2YNFA 4CGIA 4JKBA 5JLHA 2B4JA 1S6QA 3WXLA 1S1TA 4CHOA 1GLDG 2OCEA 5JICA 3TU5A 1RFQA 3C95A 4J2AA 2FLOA 3J7YP 4MO5A 2JDQD 2BH1A 3ZSVA 3J7AP 2ZJPL 4B3RK 3CJ9A 4NXNK 4FWMA 3L2QA 1LQIA 2XY5A 3A5MC 1IKYA 2JGUA 4JN4A 4CEOA 1VNBA 1WUAA 2BANA 4BRCA 4BQLA 4FOIA 4KHWA 4UADE 3THWA 3OHRA 4BRHA 1I94K 3V1QA 2UU9K 2KHOA 5GAHP 1TUUA 4ILGB 1VSEA 4ICLA 5JS2A 1QVGM 1ZYVA 1LWEA 1TKZA 3HOTA 1WWNA 4N5SA 4JS5A 3PSIA 1NGAA 1HKBA 2PY5A 3PIOL 4CF0A 3NF8A 1OH8A 3OYFA 4NCBA 5AQHA 2IGIA 4I7FA 1QSYA 1YIJN 1T7EA 3VQQA 4CJEA 3FZLA 2D5RA 3MEDA 2YHBA 2F8SA 4OVLA 4U67L 1HPZA 3AGRA 4CQKA 3SPYA 4B3MK 2WTUA 2B5JA 4F3TA 4BR5A 2P9PB 3QIOA 4DUZK 4J2BA 1DT9A 3MX2A 2KBKA 1G15A 4DFJA 1OH5A 1BISA 1LWFA 2QXFA 4DV2K 3OYCA 4OKEA 4QS9A 4KRFA 5BRHA 2KBHA 3KP1A 1IG9A 2O4IA 1RBRA 3HK2A 5C24A 4BEBA 3ZSYA 1TK8A 3IS9A 1T8EA 2EHGA 3M8PA 1RBSA 5J2MA 3NCIA 3GBTA 1W97L 3EZ5A 2VYPA 1BIUA 4PL8A 4V1DC 1LAVA 3H3NO 4M3WA 4MDBA 4DHYA 1UAXA 4AAZA 1VQ7N 5KPZA 2ZF5O 2ASMA 1HX1A 2UXDK 5JENA 3QNOA 1CLQA 3KD1E 5CZ1A 3O9RA 1RT4A 3U6FA 1K6YA 3AVBA 3CETA 3TWHA 2HHUA 2XRIA 1ITGA 4YOUA 1N34K 5DM6L 5C25A 3AV9A 4Z4EA 3LL3A 4PL7A 4CJSA 3VQCA 4O5FA 3L8BA 5AQQA 4EHUA 2E2QA 3OW2M 1B9FA 1ZBLA 3KWIA 4FWRA 1FJGK 4BACA 2VG6A 5M1FA 4ELTA 1XNQK 1K9MO 2HNZA 3TTDA 3PO5A 3BDPA 2LT8A 3E9PA 3CM5A 4KKOA 2QTDA 2QWQA 2HBJA 5HLFA 1Z6RA 4V19S 3SAHA 3CMAN 4BRIA 3I56N 1S9EA 3RSEB 3OYDA 4OPKA 3LALA 1X9MA 3T1YK 4NYNA 3QIPA 4ISEA 4DQSA 1VQ8N 4EAHD 4H0TB 4FZZA 5HOOA 3MWTA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4KB0 A;  1QTM A;  4YDU C;  2NRT A;  3LZI A;  4B9V A;  1IH7 A;  4K25 A;  1FK9 A;  4IDH A;  2YBR C;  1C1C A;  2BDP A;  4DV6 K;  1GLE G;  2BUP A;  1IKX A;  2RPI A;  3ZYY X;  2GX9 A;  4QS7 A;  3TR8 A;  4CJF A;  4B3T K;  2QWM A;  1VSF A;  1CZA N;  4E7I A;  1GOC A;  2D1K A;  2FF6 A;  4CF9 A;  2A3Z A;  1KRP A;  4DQR A;  4FZX C;  1HYS A;  5LY3 A;  3THY B;  1NLV A;  3KOY A;  3QDK A;  4C8M A;  4LH5 A;  4UAF E;  1WB9 A;  1KVA A;  1KFD A;  4IKF A;  2HHV A;  5AQW A;  3I8D A;  4IO9 L;  3T1H K;  2YI1 A;  5BPM A;  4PUO A;  4X62 K;  3SUN A;  1CZB A;  4EP4 A;  4UY8 O;  5AQG A;  1BCM A;  2UUA K;  4AM7 A;  2PZS A;  2ZM6 K;  3HP6 A;  4CEZ A;  3H6E A;  4I9Q A;  5GIO A;  3GDQ A;  4CBX A;  3KHW A;  4IZ9 A;  1J53 A;  3KLF A;  1KLM A;  2PBD A;  1GLJ O;  2ASC A;  4KH6 A;  3N4Q A;  2VQE K;  2E5L K;  1RGI A;  4BRG A;  4YOW A;  4W5Q A;  1BO5 O;  3QLH A;  2W6K A;  3M6G A;  4AHT A;  2RN2 A;  3AVG A;  3M1F A;  3EL2 A;  3L56 A;  4BGB A;  3C7N A;  4CES A;  4E19 A;  2CH6 A;  2A40 A;  2HVI A;  2HBM A;  3F2K A;  2QWP A;  3VET A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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