5AQLA

Fragment-based screening of hsp70 sheds light on the functional role of atp-binding site residues
Total Genus 123
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
123
sequence length
381
structure length
381
Chain Sequence
MSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLWSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title A fragment-based approach applied to a highly flexible target: Insights and challenges towards the inhibition of HSP70 isoforms.
pubmed doi rcsb
molecule keywords HEAT SHOCK COGNATE 71 KDA PROTEIN
molecule tags Chaperone
source organism Homo sapiens
total genus 123
structure length 381
sequence length 381
chains with identical sequence C
ec nomenclature ec 3.6.3.51: Transferred entry: 7.4.2.3.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5aqlA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqlA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqlA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5aqlA04
2Q0RA 3WXLA 4IXCA 3UB5A 1YVNA 3VPZA 5CE3A 1KAYA 4L3QA 3ULEA 1GLCG 3SMPA 3MDQA 5AQGA 5AQYA 2J4RA 4JHDB 3TU5A 2QWLA 3FZLA 2P9KB 2I7PA 4FWNA 5JICA 2YCHA 1QZ6A 3P4IA 4A61A 3VGMA 1NGEA 5AQOA 5BRHA 3ATUA 2E2QA 2IVNA 3JXUA 2YJFA 3O5BA 5F0XA 4XEIA 3CETA 5ADXA 1HJOA 4EFHA 4JHDA 3FE1A 4FWSA 4H5VA 4CI6A 2D0OA 1ZBSA 3ENOA 3BUZB 1R59O 3MK6A 3VEWA 1BDGA 1RGIA 1QQMA 4CZKA 3W0LA 5BREA 2P9IA 3D2FA 2IIRA 4B1UB 3O6WA 3L6QA 2P9LB 5KPRA 1OKJA 4IZ9A 2CGKA 1KAZA 4FWPA 2E1YA 5AQSA 2FSKA 5AFUA 4BRLA 1IG8A 4NB4A 3UE5A 1C0FA 5LJWA 3VF6A 4B1YB 3A5MC 3A5NC 3H3OB 4A62A 5AQUA 3WEEA 5FPDA 4FSVA 3U8XA 3O8MA 4WYBA 3QDKA 3F9MA 3AARA 1GLAG 4CZMA 4H0YB 3ZEUA 3AY9A 3C7NA 2GEMA 4XH5A 3S41A 1BG3A 4FWLA 4BR5A 4CZHA 3VGLA 2GWKA 1ESVA 3BF3A 1Z6RA 5KQDA 4RTFD 4XH4A 4YDUA 2ITMA 3WXJA 3CJCA 4RCHA 3VEOA 4I6MA 3ID8A 4FWOA 4LC9B 4B1ZA 4CD1A 5AQPA 3LDPA 4BQZA 5FPEA 2QWMA 2HF3A 1NMDA 1MA9B 3KVGA 4QS8A 3VERA 2FXUA 2GTDA 4B9QA 3QFUA 3GL1A 2YHWA 1T44A 1Z05A 4BVOA 5ADXH 4QS7A 3LDLA 4QS9A 5AQKA 3LDOA 2KHOA 1KAXA 2A3ZA 3TPQA 1HKGA 1BOTO 5AQMA 3DAWA 4JN4A 1K8KB 2NZTA 4RWTA 2YHXA 4H5WA 2V7ZA 3CERA 4K41A 4Y0WA 1HLUA 4XH1A 4JNEA 1NWKA 4HTLA 1QQOA 3ATVA 4PKIA 3CJ7A 1BO5O 1DGKN 3ZX3A 4IWVA 3EKSA 3DXKA 2E1ZA 3WXIA 2P9UB 3BEXA 3EL2A 3KHYA 5BPMA 3FZMA 1MDUB 3FGUA 3IFRA 3LM9A 1K8KA 3RSEB 1QQNA 3MN9A 3GG4A 1JCEA 4WQ4C 2BUPA 2F9TA 4BROA 4BGBA 2VYPA 2P9PB 1V4SA 3O1WA 4PKHA 3IDHA 5AQFA 4EAHD 2P9UA 4DHYA 1GLLO 3U4LA 5BR9A 3WQUA 1TUUA 4AM7A 2YHYA 3LDNA 3VEZA 5KQ8A 2H3GX 4WQ5A 3W3DA 3H45C 4FWKA 1LCUA 4J8FA 2Q97A 3H1QA 1TYQB 5AQQA 4YDUC 3CJ9A 3DXMB 1XQSC 4BC4A 1EQYA 4BRNA 4FOIA 1E4FT 1ATSA 2Q1NA 3HI0A 2QM1A 3MMVA 5AQXA 2P9KA 5I9EB 4BRFA 2A41A 3FZKA 5E26A 2FF6A 5EY4A 1BA0A 4MLEA 3R6MA 3VENA 1SZ2A 1H1VA 4PKGA 2W40A 3C0BA 4BVPA 2BTFA 2ZGZA 1D4XA 2HF4A 1U6ZA 4E1JA 1P8ZA 4CZFA 1YUWA 1GLBG 3L0QA 3FZFA 1NGIA 3GE1A 3VEXA 2Q31A 1LOTB 4NO7A 5KPZA 4H0PA 5EX5A 3GBTA 4BQLA 1ATRA 2AA4A 2IVOA 2AP1A 2IVPA 3LDQA 3I8BA 2P9LA 4FPAA 5AQVA 4H5TA 4CBUA 3QFPA 2GWJA 5F1XA 4FPBA 2GUPA 2P9NB 3IMXA 2FSNA 3SMSA 2P9SB 1HKCA 2QXLA 4A2BA 2HMPA 2VCPA 3MN6A 3AAQA 3J8AA 2Q0UA 4DQ8A 1T6CA 2A5XA 2QW9A 1RFQA 2F9WA 5AQWA 3UKUB 3VGKA 4ISFA 4JD2B 3D2EB 1QHAA 3EN9A 5BN8A 2I7NA 1U2VB 4FOEA 3CJ1A 4BC2A 2P9NA 5EVZA 3A5OC 2CGLA 4BRDA 4JAXA 2P9SA 5AQLA 1BU6O 4BRHA 2WUSA 4O5FA 1XUPO 4A2AA 1NGHA 2E20A 2E88A 3FFKB 4WQ5C 4PL7A 4JD2A 3BP8A 1WOQA 2A6AA 3EKUA 3VOVA 2YI1A 4BR4A 5BN9A 3L4IA 1WUAA 3GDQA 1Y64A 3VEVA 1X3NA 1TUYA 2EWSA 5ELZA 3EO3A 5BPNA 3OHRA 3ENHA 1V4TA 3CIPA 5AQNA 3VF2A 3QBXA 4H0VB 4MLHA 3WQTA 1GLEG 4BRKA 4CD3A 4DCHA 5AFUH 1KXPA 3H3NO 1SQKA 4BR7A 4BRPA 5FPMA 3A8YA 3H1VX 4B1WB 1SAZA 2ZF5O 2DPNA 1NGDA 2Q36A 5AZJB 2FSJA 1NM1A 4CZGA 4PL8A 2A40A 4Z94A 4K43A 4FL9A 4BR9A 4CZLA 5F2RA 4H5RA 3B8AX 4CZJA 2V52B 4BREA 3QBWA 3O4WA 3RSEA 4EHTA 4B1XB 1X3MA 3SK3A 1E4GT 3FR0A 4IJNA 3HBTA 3R9PA 1MWMA 2QWOA 4CZIA 2P9PA 1NGCA 1BA1A 1G99A 3BF1A 2V51B 2FF3B 4ISEA 3WXKA 3G25A 2QWNA 2W41A 2YJEA 2ZWHA 3WUHA 2D0PA 3CQYA 4BRMA 4CBWA 5E84A 3U9ZA 1X9JA 3HZ6A 5EOYA 3IUCA 1S22A 2E8AA 2OANA 3GOIA 5AQRA 4CBXA 1JCFA 1DKGD 1RDWX 5JLFA 3O1BA 4ISGA 3EZWA 4BRCA 4HWIA 1TYQA 2D1KA 3DXMA 2P9IB 3D2FB 1NLVA 3LL3A 5EXWA 1BUPA 1S3XA 1T6DA 4EIAA 1YXQA 1IJJA 2ASMA 3CJBA 3VETA 1NGFA 3H6EA 5TKYA 3A5LC 1ZXOA 2QWPA 3QICA 4MO5A 4BG8A 4KBOA 4BC5A 4BC3A 4GNIA 4WQ4A 3WEEB 3M1FA 5JMVA 3O80A 4FWMA 3ZX0A 4K42A 3D7EO 3ZEUB 3C7NB 2ZGYA 1ZC6A 2E2NA 4H0TB 4O8KA 3ZX2A 1J6ZA 2HOEA 4C23A 1QZ5A 4EHUA 4IJAA 4I6MB 2NLXA 1DEJA 3AAPA 5AZIB 4AM6A 5AQJA 1ATNA 4M7XA 1YAGA 4DB3A 3U9DA 3H46O 2QWQA 2CH5A 3CJAA 1HX1A 4IO8A 3CI5A 5FPNA 4BR0A 3UKRB 3QMLA 1BWFO 2E2PA 1CZAN 2PAVA 4M7YA 3MN7A 3JS6A 3WT0A 2QWRA 4BR2A 1NGAA 5BPLA 3M3ZA 5LY3A 4H0XB 1Q18A 4FWRA 3LM2A 1NBWA 4FO0A 5AZIA 4B1VA 3UKUA 4CJ7A 3D2EA 5JLHA 2A42A 1HPMA 3ZETB 1GLJO 2ASPA 2VWBA 3SJHA 4H0OA 3FZHA 4BRQA 2ASOA 4MO4A 3UKRA 1U2VA 1NGGA 3HSCA 2V7YA 5LJVA 2CGJA 4H5NA 1GLFO 1GLDG 3CHWA 2FLOA 2UYTA 4K25A 3VESA 3M6GA 3VEYA 1JCGA 4BGAA 4CZEA 4BRIA 3I33A 3DXKB 5BRDA 1C0GA 2PBDA 3ZETA 3R8EA 3VF4A 1NGBA 5KPTA 1NGJA 3HTVA 2CH6A 4BG9A 3SLCA 3QB0A 1MWKA 3O08A 3A0IX 3KZBA 2D4WA 4BRAA 5AR0A 3CQXA 4GY2B 1XC3A 3DJCA 3ULEB 5B8HA 5BRFA 4F9OA 4M63C 4H03B 4BRGA 2NRHA 2E2OA 1HKBA 5AQZA 3DWLA 2Q2RA 1HUXA 4FWQA 3HM8A 3FLCO 3MN5A 5AZJA 5AQTA 5AQIA 5AQHA 2GELA 3MCPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2XHBA 3SZ2A 3VPZA 1KAYA 3ULEA 4AEIA 2HHVA 3SMPA 2Q3SA 2P1JA 5AQGA 5AQYA 4WFAL 3O3HA 1I94K 2G8WA 3RMCA 5M1NA 4GV9A 4FWNA 3E7UX 3SYZA 3TSPA 4CF8A 1QZ6A 1NRBA 1RTHA 4I2PA 1WBDA 1NGEA 4J2AA 4M42A 1VQNN 5AQOA 5BRHA 2IVNA 4OPKA 1RTIA 2YJFA 5F0XA 4OX9K 3KLIA 4EFHA 2OPQA 1BCMA 5EU7A 2BH1A 1ZFUA 4CK2A 1VQKN 4CE9A 3G4SN 2E2FA 1JLGA 1D9FA 3MK6A 1TVRA 1CXQA 4YOUA 4CHPA 1RGIA 1LAWA 3HL8A 3ZSXA 1BCGA 4DUZK 3D2FA 3NGIA 1W0HA 4B1UB 2P9LB 4E1MA 2HVIA 1OKJA 1RT6A 3VQ4A 3QERA 4B9LA 2ITGA 3KK1A 5AFUA 1LW0A 1ZYVA 4IFVA 4B1YB 3A5MC 4KI6A 4LF7K 1RDCA 4FK4A 3QDKA 2VGNA 3VQ7A 4CZMA 1NKBA 4H0YB 4AHTA 1J53A 2UUCK 4BR5A 4CZHA 2PYJA 2GWKA 5KQDA 1T7EA 4RTFD 4XH4A 4YDUA 4G1QA 3TTFA 2ITMA 3I8DA 4OLBA 4O4GA 1TL3A 3CCJN 4FWOA 1FH3A 5GAEP 1YHQN 5AQPA 3LDPA 4BQZA 3NHGA 3NE6A 2OYQA 3IAYA 1NMDA 1NPIA 3P31A 1MA9B 4E1NA 3KVGA 3V9WA 4K8XA 4QS8A 5M1FA 4DS5A 4LSLA 4LF4K 4DU3A 1KV0A 1Z05A 4BVOA 1XNRK 1ZYQA 1NK5A 3SQ4A 4QS9A 3LDOA 1KAXA 1BGXT 4FJNA 3TANA 1BOTO 1N33K 5AJ3K 1K8KB 2NZTA 3AVKA 1K9MO 3CYMA 1JXBA 3DOLA 4K41A 4N76A 1BRZA 3OY9A 1SS6A 4WCEL 1BO5O 3AGKA 1DGKN 3ZX3A 3EKSA 3VN5A 5BPMA 1I39A 3PX6A 1A5VA 2ETJA 2BUPA 1RDBA 3L56A 2F9TA 2PZSA 3TI0A 4DTNA 1D5AA 1ZBHA 5H1SQ 3WNGA 2A7TA 3DOKA 1EWQA 3OYCA 3C94A 5HBMA 5BR9A 1GLLO 4Z0UA 3WQUA 2PY5A 4B9NA 3TAEA 4KH5A 4KRFA 4M3WA 1S72N 1EO1A 4IBNA 3H45C 4LF9K 1T0ZA 2HHSA 2Q97A 4I2QA 3AV9A 5HRPA 1YJ9N 3ITHA 4C8NA 4JKEA 3DLLL 4JRPA 4RW6A 5AQQA 3CJ9A 4BRNA 2XO7A 4CFBA 3TR8A 2RN2A 4E7HA 3HO1A 1BIUA 3AVHA 3PO5A 3K5LA 3PY8A 3AO5A 4GV6A 5E26A 4CIGA 4QAGA 3VENA 1JZAA 1B3CA 1DT9A 2F8SA 1VRUA 4JKFA 2ZGZA 2HF4A 4E1JA 4CZFA 3GE1A 4CEFA 2YEOA 3OYFA 3NH1A 1XHZA 4EZ6A 2MBKA 3I0SA 4H0PA 4EP5A 4JYAK 1TL1A 4MDAA 4BQLA 2VWJA 1ATRA 3QI7A 2AP1A 3IS9A 3I8BA 2P9LA 2LSNA 4CF1A 3KLHA 5I42A 5AQVA 3TTCA 3VQ9A 1LWCA 4AQYK 3TAQA 2P9NB 1HKCA 4Y1CA 1QSSA 1ZBFA 2Q0UA 1U47A 4DQ8A 1O1WA 4CECA 3ZYYX 1MU2A 2F9WA 3TAPA 3V81A 1VQLN 1WN7A 1YTAA 2FC0A 1QHAA 3S9HA 4FM2A 5BN8A 3DM2A 1DTTA 4KI4A 3K9JA 2GBZA 3VQQA 4BRDA 4JAXA 1UA1A 4AHSA 3SNNA 4FZYA 3OYHA 1RT2A 4CEDA 2WUSA 4CK1A 2DFEA 2E20A 4JK7A 4FLTA 1FW6A 3CG7A 1O13A 3HVTA 3T3FA 5BN9A 3D0PA 1WAFA 4DSFA 1WUAA 2A1RA 4LFCK 3D45A 2DFHA 2EWSA 5ELZA 4DV7K 3QIOA 1ZUTA 4BRKA 2B4JA 4DCHA 3CPWM 4B3OA 1SQKA 1KVAA 4BRPA 1OH7A 1RTJA 4CJUA 2OZSA 1LQQA 1RNHA 2Q36A 1T03A 2FSJA 2KTQA 1WAJA 1RT5A 1S1VA 4BR9A 4CJVA 4CZLA 3PX0A 3B8AX 1RILA 3LWLA 3G10A 3SQ2A 5HP1A 2HW3A 1HNWK 1TK8A 1Q82O 4KHPK 4EHTA 4B1XB 3O4QA 3VQ8A 3R9PA 4IJNA 2UUBK 1VSEA 4CZIA 2LR3A 1NK8A 3TARA 1SEGA 5JENA 1NGCA 1I6GA 3CW4A 3VQEA 3BF1A 1NK7A 2FF3B 3WXKA 2W41A 3KK3A 2D0PA 2NRRA 3QO9A 5HRRA 1K6YA 3LP1A 3IUCA 4NYFA 4CBXA 3JAMO 1FKPA 5HOOA 1JCFA 1GPTA 2PYLA 4Z4EA 5JLFA 1JKZA 2HHUA 1YVUA 4ISGA 3EZWA 1K8AO 4YHHK 4HWIA 1CN2A 2GV9A 2NY9X 4KB0A 4DSJA 1WT7A 5EXWA 1OVYA 2ASMA 3CCSN 1OMYA 3VETA 3OYKA 3H6EA 1ZXOA 2JDQD 3THXA 3J80O 4KTZA 2UUAK 4BC5A 4FJGA 3S5TA 3OJUA 1Q8IA 4OO1J 2MZ0A 3M1FA 3O80A 1VK0A 2NRVA 4FJJA 4K42A 3D7EO 3F5TA 4IDHA 3H08A 4U7BA 3ZX2A 2HOEA 4ELVA 5JVHL 1XRSB 3KWGA 4IJAA 3KP0A 3AAPA 5AZIB 2NNWA 1IKVA 5CYMA 4JKAA 1ITGA 3H46O 4DU1A 5FRMA 1N4NA 2CH5A 3CJAA 1HX1A 2LN8A 1WSFA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2XHB A;  3SZ2 A;  3VPZ A;  1KAY A;  3ULE A;  4AEI A;  2HHV A;  3SMP A;  2Q3S A;  2P1J A;  5AQG A;  5AQY A;  4WFA L;  3O3H A;  1I94 K;  2G8W A;  3RMC A;  5M1N A;  4GV9 A;  4FWN A;  3E7U X;  3SYZ A;  3TSP A;  4CF8 A;  1QZ6 A;  1NRB A;  1RTH A;  4I2P A;  1WBD A;  1NGE A;  4J2A A;  4M42 A;  1VQN N;  5AQO A;  5BRH A;  2IVN A;  4OPK A;  1RTI A;  2YJF A;  5F0X A;  4OX9 K;  3KLI A;  4EFH A;  2OPQ A;  1BCM A;  5EU7 A;  2BH1 A;  1ZFU A;  4CK2 A;  1VQK N;  4CE9 A;  3G4S N;  2E2F A;  1JLG A;  1D9F A;  3MK6 A;  1TVR A;  1CXQ A;  4YOU A;  4CHP A;  1RGI A;  1LAW A;  3HL8 A;  3ZSX A;  1BCG A;  4DUZ K;  3D2F A;  3NGI A;  1W0H A;  4B1U B;  2P9L B;  4E1M A;  2HVI A;  1OKJ A;  1RT6 A;  3VQ4 A;  3QER A;  4B9L A;  2ITG A;  3KK1 A;  5AFU A;  1LW0 A;  1ZYV A;  4IFV A;  4B1Y B;  3A5M C;  4KI6 A;  4LF7 K;  1RDC A;  4FK4 A;  3QDK A;  2VGN A;  3VQ7 A;  4CZM A;  1NKB A;  4H0Y B;  4AHT A;  1J53 A;  2UUC K;  4BR5 A;  4CZH A;  2PYJ A;  2GWK A;  5KQD A;  1T7E A;  4RTF D;  4XH4 A;  4YDU A;  4G1Q A;  3TTF A;  2ITM A;  3I8D A; 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