5AQLA

Fragment-based screening of hsp70 sheds light on the functional role of atp-binding site residues
Total Genus 123
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
123
sequence length
381
structure length
381
Chain Sequence
MSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLWSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title A fragment-based approach applied to a highly flexible target: Insights and challenges towards the inhibition of HSP70 isoforms.
pubmed doi rcsb
molecule keywords HEAT SHOCK COGNATE 71 KDA PROTEIN
molecule tags Chaperone
source organism Homo sapiens
total genus 123
structure length 381
sequence length 381
chains with identical sequence C
ec nomenclature ec 3.6.3.51: Transferred entry: 7.4.2.3.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5aqlA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqlA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqlA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5aqlA04
2Q31A 4BR2A 2W40A 4AM7A 2CGJA 4WQ5C 1HX1A 3CJ9A 5AFUH 1BA1A 4BVPA 1QZ5A 2QWRA 3QBXA 2D4WA 3BEXA 2UYTA 3AAPA 3VF6A 3UKRA 5AQIA 3BUZB 1C0FA 1NGDA 3ENHA 3O08A 3TPQA 1HKGA 3WEEB 4CZHA 1OKJA 4BC5A 1BOTO 5KQ8A 4BR4A 3DXKB 1U2VB 2A3ZA 5BRHA 3MK6A 3VPZA 5F0XA 3RSEA 3D2FB 2HF4A 2Q36A 4WQ4C 3AY9A 2AP1A 2BUPA 5KPRA 1ATSA 3JS6A 3DAWA 4MO4A 3MN7A 3UE5A 5CE3A 3HSCA 2CH6A 2GUPA 4JD2A 3WUHA 4ISGA 5EOYA 4WYBA 4A2AA 1X9JA 3FZLA 3UKUA 1RDWX 5AQNA 3A5LC 3VEOA 2A40A 5EX5A 4BGBA 4XEIA 3R9PA 2GELA 1XUPO 4A2BA 2YI1A 2QWNA 4FO0A 5BRFA 4GNIA 3FE1A 2D0OA 3ZX0A 4QS7A 3BF3A 3M3ZA 3VGMA 3UKRB 5AZJA 4BRNA 1NGIA 1Q18A 4K41A 4CD1A 1MDUB 3A8YA 1T6CA 4HWIA 3RSEB 4M63C 2Q97A 2FLOA 3VEVA 3VEWA 3SLCA 4F9OA 1ZXOA 4IJAA 3R8EA 3OHRA 1LOTB 3G25A 1T6DA 4H03B 4JD2B 4BVOA 2WUSA 1Y64A 3MN6A 3WXJA 4BRQA 2PAVA 1HPMA 3FZMA 4BR5A 4O5FA 1GLDG 3UKUB 3U4LA 1D4XA 2E1ZA 3VETA 5AQFA 4MLHA 4CBUA 2P9IB 3A5OC 2E2NA 1SQKA 4JNEA 4WQ5A 5JLFA 3LM2A 1QQNA 4RTFD 3P4IA 3ZX2A 5EVZA 2P9PA 1LCUA 2E2OA 4IO8A 4EAHD 3FLCO 2P9UA 3LDLA 3VF4A 2V52B 3QMLA 5FPNA 3KHYA 3CQYA 4YDUA 3O5BA 1IJJA 3ATVA 1SZ2A 3LDNA 1BA0A 1ATNA 2YHXA 5AQZA 4WQ4A 2FSKA 2ZWHA 5AQKA 1JCEA 1JCGA 4BGAA 5BREA 5BPNA 4B1UB 4FWPA 4B1VA 3H3OB 2E20A 4BRDA 3HZ6A 1NWKA 3WT0A 2I7NA 4BQZA 3QDKA 1HKCA 5AQWA 3FZKA 2YJFA 5AQQA 2Q2RA 4XH4A 1BO5O 1TYQA 2ZGZA 3U8XA 5AZIA 2P9PB 4H5TA 4FWKA 2NRHA 4EHUA 2P9UB 4FWLA 2W41A 3GOIA 3U9DA 4FWQA 3I33A 2Q0UA 2FF3B 3QFPA 3UB5A 4BRAA 3L4IA 3QFUA 4J8FA 4FWRA 3EZWA 5AQXA 2E2QA 1MA9B 1ESVA 4YDUC 1HKBA 2YJEA 3WXKA 1Z05A 5KPTA 3SMPA 4K43A 4B1XB 3ZETA 4CI6A 4BR9A 4BRCA 1H1VA 4PL8A 5AQRA 4FPAA 4ISFA 5EY4A 5ELZA 1BU6O 2OANA 3H45C 1BG3A 1GLFO 1TYQB 1G99A 2QWQA 4NO7A 3KZBA 4FWOA 4CJ7A 1CZAN 3O80A 2I7PA 2YHYA 5KPZA 3MCPA 5AQGA 3BP8A 4FWSA 4IWVA 4H0YB 3IUCA 4Z94A 2IVNA 3J8AA 1NGBA 5AQMA 3FR0A 4A61A 4CZKA 4CZGA 4H5NA 1QQMA 5JMVA 2VWBA 1IG8A 3S41A 3B8AX 3EO3A 2CGKA 3LDPA 4PKIA 3O1BA 5LJVA 5AR0A 4ISEA 2E88A 3VOVA 3ZETB 3L6QA 2P9NA 5B8HA 1DGKN 3GBTA 1KAYA 1XC3A 2ZGYA 4NB4A 4DQ8A 4BRGA 2FSJA 2GWKA 2QWPA 3WQTA 3WQUA 2AA4A 2YCHA 2V51B 4H0PA 3ID8A 5AFUA 5JLHA 3SK3A 2KHOA 5BN8A 3O1WA 3R6MA 3MN9A 4BRPA 3HM8A 3GE1A 4DCHA 5KQDA 2E2PA 4O8KA 3MDQA 5ADXH 4BRMA 5AQPA 1V4SA 5LJWA 2BTFA 4DHYA 3VEXA 1YXQA 3BF1A 4BRFA 5BR9A 2FF6A 4GY2B 2IVOA 5AZJB 2ASMA 2DPNA 4E1JA 3HBTA 4BRIA 2FXUA 5AQLA 3QBWA 4H0XB 5AQOA 4PL7A 4I6MA 5BRDA 3A5MC 2YHWA 1NGHA 1V4TA 3DWLA 5FPMA 4FWMA 2HOEA 4EFHA 3FZHA 2P9LA 3IMXA 3W0LA 3LL3A 5AQUA 1NBWA 1RFQA 4CZMA 3CJ7A 3FZFA 2A5XA 4M7YA 3C0BA 4BG8A 4BG9A 3SJHA 4CZJA 3CQXA 4AM6A 3CIPA 3IDHA 4EIAA 3M1FA 1NM1A 1P8ZA 2NLXA 3CERA 5FPEA 3SMSA 4CBXA 4BREA 2J4RA 3ZEUA 3F9MA 1E4FT 3CI5A 3ZX3A 1BWFO 4JAXA 3A5NC 1NLVA 4RWTA 3EKSA 3QICA 3L0QA 3WXLA 4I6MB 3ENOA 1BUPA 1GLLO 4IXCA 4QS8A 5E84A 2QM1A 4FOEA 1NGGA 2P9LB 3JXUA 5F2RA 3DJCA 3H1VX 5ADXA 4B1ZA 1ZC6A 3D2EA 1ATRA 2Q0RA 3A0IX 2CH5A 3H6EA 2PBDA 2HF3A 4H5RA 5AQTA 2EWSA 4K42A 4C23A 1NGFA 1YUWA 4A62A 2GEMA 3GDQA 1XQSC 4DB3A 4CBWA 3CETA 3ZEUB 4FPBA 1WUAA 4PKHA 5AZIB 3EKUA 4FL9A 3IFRA 1QQOA 4EHTA 5EXWA 1X3NA 1WOQA 5JICA 4JN4A 4CZIA 3CJBA 2VYPA 3O8MA 1JCFA 1KXPA 5LY3A 1MWKA 1S22A 4LC9B 3VEZA 1GLCG 4RCHA 3EL2A 2GWJA 5AQSA 3GL1A 4H0VB 1Z6RA 2VCPA 2NZTA 4FOIA 3EN9A 4BC4A 1X3MA 1R59O 4L3QA 3DXMA 3VGLA 4BRLA 4K25A 1HLUA 4BRHA 4BROA 3AAQA 3HTVA 2A6AA 3H46O 4M7XA 1YAGA 5AQYA 3D2EB 1HUXA 4KBOA 2ASOA 4PKGA 4CZFA 1NMDA 4H5WA 2Q1NA 3FFKB 4H0OA 1S3XA 1DEJA 2ZF5O 2P9IA 5BN9A 2E1YA 1GLBG 1TUUA 1K8KA 3H3NO 1QZ6A 1GLEG 2QW9A 3C7NA 3VENA 1YVNA 4H0TB 2F9WA 2IIRA 3MMVA 3ULEA 4B9QA 3LDQA 4BR0A 2GTDA 1E4GT 2HMPA 2P9SA 2QWMA 2QXLA 3TU5A 2H3GX 3D7EO 2A42A 3M6GA 4H5VA 4FSVA 1J6ZA 3VESA 4BC2A 3FGUA 1MWMA 5AQVA 3U9ZA 3LDOA 3DXMB 2FSNA 3VGKA 4JHDA 1NGAA 3ATUA 5FPDA 1NGJA 3CJ1A 3AARA 1GLJO 2D0PA 2P9NB 3CJCA 4XH1A 2CGLA 3LM9A 2P9KA 3VERA 3HI0A 1NGEA 2QWOA 1T44A 1K8KB 1GLAG 4QS9A 4IZ9A 3QB0A 4BRKA 3C7NB 4MO5A 3GG4A 1U6ZA 4CD3A 1HJOA 3VF2A 3ULEB 1TUYA 1QHAA 2F9TA 5BPMA 4BC3A 4CZEA 1RGIA 5I9EB 4B1YB 2D1KA 1C0GA 4CZLA 2P9SB 3KVGA 3CHWA 2A41A 3I8BA 4FWNA 3CJAA 4HTLA 2IVPA 1KAXA 4BQLA 5E26A 2E8AA 5AQJA 4JHDB 3MN5A 3O6WA 1KAZA 1NGCA 3WEEA 1DKGD 5F1XA 4XH5A 1SAZA 4IJNA 3VEYA 3O4WA 3DXKA 1U2VA 3W3DA 1ZBSA 4B1WB 3WXIA 4MLEA 3D2FA 5BPLA 2P9KB 4Y0WA 2ITMA 5TKYA 2V7YA 3H1QA 2V7ZA 4BR7A 2ASPA 5AQHA 1EQYA 2QWLA 1BDGA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2Q31A 1EETA 4M3RA 1S1TA 2W40A 3SCXA 1ZBUA 4CGHA 2GX9A 3PIPL 3NE6A 4UAEF 3KK3A 4DSIA 4CEEA 4KHQA 3QBXA 5I3UA 4NYNA 4BECA 5GAHP 2VY6A 4JRPA 4I2QA 4KTZA 3AAPA 1REVA 3UKRA 3BUZB 5C42A 3KLFA 4E89A 4CJKA 2NRTA 3SBTA 1JL2A 4BC5A 1A5WA 4CIGA 2A3ZA 3MK6A 3HSTB 1NK9A 3CC7N 2RF2A 4M3TA 2Q36A 2YNHA 4OPHA 4WQ4C 5CY0A 5KPRA 3JS6A 4CGJA 2CH6A 3VQ5A 4WYBA 4BE7B 1X9JA 3FZLA 3E7UX 3A5LC 1KLNA 1XUPO 3CMEN 4KPYA 2YI1A 4FO0A 5M1KA 3EYZA 4N5SA 4HTUA 3NFAA 4DU3A 1EWQA 3HM9A 3QESA 3ZX0A 4F4KA 4QS7A 2D0CA 1WWNA 4E3SA 3M3ZA 1HYZA 3VGMA 3CPWM 2R7YA 5AZJA 4BRNA 4DS4A 4CHNA 4U7BA 1TKXA 4Q0BA 3P31A 1T6CA 3VQ4A 3NAEA 3PX0A 1NPIA 2FLOA 5J2PA 1WMTA 1I2UA 2XY5A 1KTQA 1ZXOA 1N34K 4FLUA 4CE9A 4JRQA 1LOTB 3MXIA 1Y64A 5DM6L 1HQUA 1HPMA 3FZMA 1RDUA 1ZBHA 3U4LA 4CEBA 3QO9A 3VETA 1JLAA 1XWLA 5AQFA 1T05A 2ZM6K 3E7RL 3J80O 1NK5A 4JKGA 2N66A 4JNEA 5DM7L 1QQNA 3P4IA 1ASUA 3ZX2A 5EVZA 3C95A 2P9PA 4JI2K 1YIJN 3OBWA 3PSFA 3RR8A 1ZVEA 3FLCO 1VNAA 2P9UA 3KHYA 3K9JA 4AILC 3NF8A 1CHZA 3ZSZA 1FH3A 5KRSA 1SZ2A 4V1DC 2O8DB 2YHXA 2PY5A 3DI6A 4CERA 3ENBA 1JCGA 5BREA 2Y1JA 1C1CA 4FWPA 3C6HA 1RT7A 4BRDA 4DTNA 3NMUA 4BQZA 3QDKA 3OYJA 3ZT2A 4N41A 4J2AA 2B3CA 3L3VA 3VQEA 2KBHA 4BWMA 2HVIA 1Q81O 3P1GA 2W41A 3U9DA 3NVKA 2KYQA 5MLCQ 3DLGA 3QFPA 3UB5A 4BRAA 1TI5A 3NF7A 5E41A 2D0AA 2ITGA 3I55N 3LAKA 3G10A 3C65A 4J2EA 1OVYA 2HHTA 4DV6K 2OTJN 5JS1A 4AH9A 2YJEA 1UWBA 4B1XB 1TGOA 4JLHA 4CI6A 4DR1K 3VQCA 1Y97A 4N56A 3CPEA 3ZT4A 1ASVA 4ISFA 1TYQB 1ZBIA 2G8HA 2QWQA 3N4QA 3BGRA 3NH1A 1OZZA 5M1PA 4CJFA 4IOAL 4LSLA 1XHZA 2VWJA 4O5BA 1HPZA 2O8EA 3J7ZO 1QQCA 1NGBA 3O3FA 5AQMA 2B68A 4CJUA 2WONA 1VSHA 4DTXA 4PWDA 4PKIA 4B9SA 5LJVA 4PQUA 3QLHA 5LMNK 1GOAA 3AO5A 2LKBA 5B8HA 3DLHA 2ZGYA 3M8QA 3MX2A 2WTUA 3TSUA 1GPSA 4DQ8A 4CHOA 4BRGA 2GWKA 2QWPA 3AVLA 1XNQK 2AA4A 2YCHA 4DTMA 3OBYA 5M1FA 3AVIA 4DSLA 3HM8A 3GE1A 2E2PA 5ADXH 4F3TA 1BIUA 1BRZA 4BRMA 5AQPA 1XNRK 1V4SA 1CZ9A 1N32K 4HCBA 4BRFA 2O4IA 1QVGM 2HNYA 5AZJB 2ASMA 4CF1A 1T7AA 4Y1DA 1C1AA 4H0XB 4IEIA 4PL7A 1S5JA 4OLAA 4FW2A 3OYMA 2YHWA 4MFBA 2IGIA 4EFHA 3W0LA 5GAEP 3KHWA 2O8CA 1DQ7A 3LL3A 1RFQA 4CZMA 4EP5A 3CM6A 2FC0A 4CFDA 4BG9A 3SI6A 3E9LA 2XY8A 1Z26A 4YORA 1VSEA 3MECA 2Z1JA 1ILYA 4JKGB 4CBXA 4BREA 4DFJA 1NJWA 2HBMA 3TAMA 2RKIA 2KFZA 3M8SA 2YC1C 3B6OA 3CI5A 3RRHA 5FDLA 4JAXA 5CYQA 4LFAK 4JKEA 2O8FB 4KV8A 4RWTA 1NLVA 3CCEN 3EKSA 5GINA 3NCIA 3L0QA 3D0PA 4CHQA 3ENOA 3ZSOA 4WCEL 4IOCL 1GLLO 4QS8A 1GPTA 1B9DA 5E84A 1KVCA 1NGGA 4LY7A 4I2PA 4DTUA 2P9LB 5KGXA 5F2RA 3KLEA 3BZCA 3DJCA 1ZC6A 1ATRA 4Z4EA 4KB1A 3A0IX 2HHIA 4MDBA 1AHOA 3O3HA 1YUWA 4A62A 2OPSA 1C0TA 2IS3A 3GDQA 4DB3A 1NNEA 3CETA 5FLXO 1WUAA 3KWIA 2OA8A 4OGEA 3IFRA 4E7JA 1BQNA 1QQOA 4EHTA 4CJEA 3TR8A 2VYPA 4JS4A 3LWLA 1XC9A 1T7EA 3DYAA 4LC9B 3VEZA 3E1YA 4NLCA 4B8CA 2VCPA 2NZTA 4DQSA 1R59O 1TK0A 4BROA 1YAGA 4ILJA 4JK9A 3D2EB 4DV5K 1OH7A 4WFBL 2UXCK 4H5WA 5AJ3K 3M8RA 4LF8K 3PLAA 2ZF5O 3KD1E 2HMIA 2E1YA 2DFFA 4ELVA 4GKKK 2XRIA 3H3NO 1OVQA 3U6FA 3VENA 1BK8A 4IDHA 4W5RA 1YVNA 4H0TB 2IIRA 1TL1A 4B9QA 2GTDA 4R5PA 3O4NA 4GVEA 2O8EB 2IC3A 2P9SA 1JZBA 2QXLA 3DLBA 3U3YA 2A42A 2VGMA 1NKBA 1UGLA 3E9PA 1JXEA 3VQBA 3MEEA 3DXMB 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2Q31 A;  1EET A;  4M3R A;  1S1T A;  2W40 A;  3SCX A;  1ZBU A;  4CGH A;  2GX9 A;  3PIP L;  3NE6 A;  4UAE F;  3KK3 A;  4DSI A;  4CEE A;  4KHQ A;  3QBX A;  5I3U A;  4NYN A;  4BEC A;  5GAH P;  2VY6 A;  4JRP A;  4I2Q A;  4KTZ A;  3AAP A;  1REV A;  3UKR A;  3BUZ B;  5C42 A;  3KLF A;  4E89 A;  4CJK A;  2NRT A;  3SBT A;  1JL2 A;  4BC5 A;  1A5W A;  4CIG A;  2A3Z A;  3MK6 A;  3HST B;  1NK9 A;  3CC7 N;  2RF2 A;  4M3T A;  2Q36 A;  2YNH A;  4OPH A;  4WQ4 C;  5CY0 A;  5KPR A;  3JS6 A;  4CGJ A;  2CH6 A;  3VQ5 A;  4WYB A;  4BE7 B;  1X9J A;  3FZL A;  3E7U X;  3A5L C;  1KLN A;  1XUP O;  3CME N;  4KPY A;  2YI1 A;  4FO0 A;  5M1K A;  3EYZ A;  4N5S A;  4HTU A;  3NFA A;  4DU3 A;  1EWQ A;  3HM9 A;  3QES A;  3ZX0 A;  4F4K A;  4QS7 A;  2D0C A;  1WWN A;  4E3S A;  3M3Z A;  1HYZ A;  3VGM A;  3CPW M;  2R7Y A;  5AZJ A;  4BRN A;  4DS4 A;  4CHN A;  4U7B A;  1TKX A;  4Q0B A;  3P31 A;  1T6C A;  3VQ4 A;  3NAE A;  3PX0 A;  1NPI A;  2FLO A;  5J2P A;  1WMT A;  1I2U A;  2XY5 A;  1KTQ A;  1ZXO A;  1N34 K;  4FLU A;  4CE9 A;  4JRQ A; 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