5AQMA

Fragment-based screening of hsp70 sheds light on the functional role of atp-binding site residues
Total Genus 124
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
124
sequence length
382
structure length
382
Chain Sequence
SMSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLFSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title A fragment-based approach applied to a highly flexible target: Insights and challenges towards the inhibition of HSP70 isoforms.
pubmed doi rcsb
molecule keywords HEAT SHOCK COGNATE 71 KDA PROTEIN
molecule tags Chaperone
source organism Homo sapiens
total genus 124
structure length 382
sequence length 382
chains with identical sequence C
ec nomenclature ec 3.6.3.51: Transferred entry: 7.4.2.3.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5aqmA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqmA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqmA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5aqmA04
3VERA 4BRCA 4BR9A 1V4TA 4BRLA 3A5LC 3A8YA 2E1YA 3L4IA 4CZLA 2D1KA 3GG4A 3CJBA 1RGIA 4CBXA 4PL8A 3ENHA 2V7YA 4FL9A 4BREA 1LOTB 4FSVA 5BREA 4JHDB 3VEXA 2CGKA 1Z05A 5AQKA 2HMPA 3M1FA 4FWSA 5EX5A 5CE3A 2P9NA 2F9WA 4FWNA 4CJ7A 1C0GA 3R9PA 4DQ8A 5AQNA 1MDUB 5AQQA 2CGLA 4BG9A 2E8AA 1X9JA 4BROA 3HM8A 1J6ZA 5E26A 4DB3A 2E2NA 2FXUA 3H3OB 3MK6A 5BN9A 3IMXA 2OANA 1C0FA 4PKGA 3ID8A 3SLCA 4I6MA 3DJCA 1DGKN 2NRHA 2HF4A 2GWKA 3H3NO 1NGDA 2YCHA 3FGUA 3IFRA 4Y0WA 1NMDA 4H0XB 3VEYA 4FWMA 4WYBA 1TYQA 5KPZA 4M63C 4BC2A 1DKGD 5LY3A 4FWRA 3UB5A 4M7XA 2P9NB 3DXKA 1GLJO 4WQ4A 1KAXA 3UE5A 4H5VA 3DAWA 2DPNA 2QWNA 2V7ZA 3ZEUA 5FPMA 1H1VA 3FE1A 4BC4A 4H0YB 2FSJA 4B1XB 3S41A 2VCPA 5AQGA 5EXWA 2CH5A 4BG8A 1ESVA 5JLFA 1BWFO 2ZGZA 4I6MB 3VEWA 1K8KA 4FWPA 4BRNA 3H45C 1IJJA 4CD3A 4PL7A 2WUSA 2A40A 2CGJA 3AY9A 3WQTA 4H0PA 2V51B 5JICA 3QDKA 4BGAA 1HPMA 3JXUA 5AQTA 1TYQB 3P4IA 4L3QA 4CZKA 1X3MA 5AQFA 2Q2RA 5AQHA 4BVOA 4BRFA 2IVOA 3A5OC 3AAQA 1S22A 4NB4A 4ISEA 3ZX3A 3DXKB 2W40A 4BRIA 4GNIA 5FPDA 4BRAA 1RDWX 3SK3A 3MDQA 4K42A 3MMVA 3ZEUB 4CZFA 2QWLA 2Q1NA 1YUWA 4B1ZA 3D2EA 5AQIA 2F9TA 4PKIA 4BR2A 4FPAA 3VF2A 1SZ2A 4BQLA 2E2QA 1YXQA 3W0LA 3GL1A 5BRDA 1BUPA 1K8KB 4BRHA 3LDOA 1ATRA 2PAVA 4B1WB 4E1JA 2Q36A 2GTDA 3I8BA 1JCEA 1Z6RA 3VGKA 5EOYA 3VGMA 1MA9B 4WQ5C 5AQXA 1RFQA 2E1ZA 3IDHA 1NLVA 3CJAA 4AM6A 1NGJA 4H5WA 1OKJA 3WT0A 1GLLO 5EY4A 5FPEA 4RCHA 2YJEA 4A2BA 4HWIA 2VWBA 2ZF5O 1S3XA 4IXCA 1JCGA 1GLAG 3FZMA 4BR7A 2P9SA 2J4RA 3O5BA 2IIRA 3FZHA 2W41A 4WQ4C 3D2EB 5KQ8A 5BPNA 3CJ9A 2P9UA 1LCUA 5FPNA 4CZEA 4XH4A 1GLBG 2E88A 1GLFO 4AM7A 4PKHA 1NBWA 5BRFA 3BF1A 1NGHA 4DCHA 2IVPA 3LDQA 3VESA 2E20A 1QQOA 3O4WA 2ITMA 1BOTO 1NGFA 1NWKA 1BU6O 4F9OA 1MWMA 3O80A 3WQUA 4BR4A 3LDPA 2QWPA 2Q0RA 1D4XA 3M3ZA 1HKBA 3WEEA 2A5XA 3WUHA 2P9IA 3O6WA 1EQYA 4QS7A 3AARA 2I7PA 1HX1A 1GLCG 5AQMA 4O5FA 4WQ5A 3ENOA 4CZIA 3AAPA 5E84A 2FSKA 3QFPA 3L6QA 2P9SB 4K41A 2I7NA 4CZJA 1BDGA 2P9UB 4BC5A 5KQDA 3KHYA 3VEOA 3CI5A 3LDNA 2HOEA 1YVNA 2ASOA 3MN9A 1E4GT 4BRQA 4MLHA 3EL2A 4M7YA 3HSCA 3EO3A 5JLHA 3F9MA 3WEEB 4CBWA 5B8HA 3CQXA 4XH5A 2P9IB 4KBOA 4MO4A 3BP8A 3HBTA 2E2OA 4FPBA 2FLOA 1R59O 4EHTA 3VEZA 4HTLA 4DHYA 1XQSC 2EWSA 2GEMA 1NGEA 2FF3B 4IZ9A 2HF3A 3LDLA 5AFUH 2D4WA 4FO0A 3HTVA 1T44A 3U9DA 4BRGA 4CD1A 3ZX2A 1QZ5A 4FWOA 3U9ZA 5AFUA 4B1YB 2YJFA 1QQMA 4H03B 3QB0A 4RTFD 3CETA 3ATUA 3U4LA 2P9PA 3QMLA 3TPQA 5BPLA 3FZLA 3MCPA 2UYTA 1U6ZA 2QWQA 2NLXA 1NGIA 3GE1A 2CH6A 3DXMA 2GELA 3C7NA 1E4FT 3KVGA 2NZTA 2D0PA 1NGGA 2AP1A 1KXPA 3QBWA 2PBDA 3BF3A 1ZBSA 3QICA 3D2FA 2D0OA 2ASPA 3VEVA 1NM1A 1WUAA 1HJOA 4A2AA 1X3NA 3GOIA 1BO5O 3IUCA 1ZXOA 3O8MA 4BQZA 3UKRA 3MN6A 5ELZA 1XUPO 5AQLA 3HI0A 1JCFA 3B8AX 4IO8A 4JN4A 3GDQA 2QWMA 1NGAA 3VETA 2A41A 3SMSA 2P9PB 4BR5A 5KPTA 1U2VA 4CZGA 3U8XA 2P9LA 2ASMA 2QWOA 3WXJA 3DXMB 4BGBA 3C7NB 4BC3A 1ATSA 4IJAA 2YHYA 3LM9A 4EHUA 5BRHA 3HZ6A 3VENA 5AZJA 3D2FB 4ISGA 4ISFA 2QXLA 3M6GA 5F2RA 4FOEA 1V4SA 3FFKB 5AQRA 4IJNA 2ZGYA 1YAGA 3UKRB 1ATNA 1SQKA 3O08A 1T6DA 4CZHA 3CERA 3EN9A 1QHAA 5F1XA 3UKUA 2Q0UA 2V52B 4YDUA 4FOIA 3SJHA 2YHXA 3QBXA 4FWKA 4JAXA 1T6CA 4H0VB 2IVNA 1QQNA 2Q97A 4C23A 1U2VB 1NGCA 2P9LB 4BRMA 4H5NA 4GY2B 2VYPA 4CBUA 3FLCO 3G25A 3LL3A 5AQZA 3OHRA 4JD2A 3A0IX 5TKYA 4BRDA 2QWRA 2Q31A 3FZKA 3H1VX 3I33A 3BUZB 1Q18A 3CHWA 4BRKA 2GUPA 5AZJB 1CZAN 2P9KA 2E2PA 2YHWA 4IWVA 3KZBA 3CIPA 5KPRA 1GLDG 2A42A 4H0TB 2GWJA 3DWLA 3RSEA 3L0QA 4CI6A 3MN7A 2AA4A 4B1VA 1XC3A 5AQOA 3UKUB 4Z94A 3O1WA 5JMVA 3TU5A 4EIAA 3ZX0A 4EAHD 3A5NC 2BTFA 5EVZA 2KHOA 3FZFA 1TUUA 1P8ZA 4QS8A 3ULEA 5LJWA 5AZIA 1KAZA 1Y64A 4A61A 4JD2B 3EKSA 4JNEA 3VGLA 1HKGA 3W3DA 3J8AA 4A62A 1ZC6A 1WOQA 1SAZA 4NO7A 1HKCA 5F0XA 1HUXA 1G99A 1QZ6A 4BVPA 2P9KB 3WXKA 4K43A 5BN8A 3VF6A 1NGBA 2BUPA 3CQYA 3WXIA 4H5TA 3RSEB 5BPMA 1TUYA 3VOVA 4BR0A 1HLUA 3ZETA 4XEIA 2QW9A 4RWTA 3H1QA 3R6MA 3JS6A 5AQJA 4O8KA 3VPZA 4B1UB 1BA0A 2FF6A 4LC9B 4MLEA 3R8EA 4XH1A 3ATVA 4H5RA 5AQVA 5AQSA 2A6AA 2ZWHA 3C0BA 2FSNA 4BRPA 2YI1A 1DEJA 5BR9A 3VF4A 3BEXA 3ULEB 4J8FA 4B9QA 4YDUC 5AZIB 2H3GX 3CJ7A 5AQWA 3CJCA 3H6EA 4JHDA 3QFUA 4FWLA 1KAYA 3LM2A 3EKUA 2QM1A 3D7EO 4QS9A 5I9EB 2A3ZA 3O1BA 5ADXH 1IG8A 3A5MC 4K25A 5AQUA 4EFHA 4MO5A 5AR0A 5AQPA 1BG3A 5ADXA 4H0OA 1MWKA 3MN5A 3SMPA 3ZETB 4CZMA 3CJ1A 3H46O 4FWQA 3FR0A 3WXLA 1BA1A 5AQYA 3GBTA 5LJVA 1GLEG 3EZWA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1XHXA 3EZ5A 4H4OA 1V4TA 4FJHA 3A5LC 3A8YA 2E1YA 1EXQA 1N4NA 4AHVA 3CJBA 4N5SA 3CPWM 1RGIA 1TK5A 4KAZA 4JYAK 3TWHA 4JI6K 1RTDA 3ENHA 2V7YA 3VQQA 1Q81O 3SBGA 1A5XA 3DLHA 4DFKA 1NE5A 1TL1A 2HMPA 5EX5A 2HB5A 3G6EN 4RW4A 4DQ8A 2LI7A 4BG9A 3ZSQA 4BROA 2O8CB 2KBHA 1J6ZA 2YHBA 4WFAL 2O8EB 4CK1A 4DQRA 4L8RB 1U48A 4CIFA 5J2MA 3VQ5A 4CEQA 1C0FA 3OYIA 2BE2A 2WBNA 4ELTA 4M3YA 4IG0A 3CCJN 4E7HA 3H3NO 4JK7A 3TR8A 3L2WA 3UIQA 3PUFA 4DFJA 3ZLJA 1TYQA 5KPZA 4CVNE 4LF6K 3LP3A 4FWRA 4J2EA 1VSMA 3LP2A 1YHQN 4E1MA 1S72N 3MXMA 4CJVA 3TTDA 3DAWA 4Z4CA 5KI6A 3MWTA 3NVMA 3ZEUA 5FPMA 3N4PA 2Y1IA 5EU7A 1FH3A 4CGDA 2HBLA 3I0SA 3ZT4A 3S41A 4ELUA 4BG8A 4BRNA 4DSEA 1NK6A 1S5JA 5AJ3K 4AQYK 5T7BA 2ITGA 2KJAA 1IJJA 3NF9A 4PL7A 2XHBA 3ZSXA 4DS5A 4FJIA 4K8ZA 2CGJA 1VQKN 3AY9A 4DR2K 1I2VA 3T3FA 1EETA 1ZYQA 4OPKA 1HPMA 1TYQB 4L3QA 1XHZA 1X3MA 5AQHA 2D0BA 3WNHA 2FBYA 5JVHL 4C8KA 1OVQA 1WSGA 2F96A 3KWIA 4FJXA 5GIOA 1RDWX 4DTOA 3SK3A 3IRXA 2KW4A 3MMVA 4Z4EA 4E7JA 3ZEUB 4CZFA 3SAGA 4CEOA 2Q1NA 1YUWA 5AQIA 3TTFA 1WBDA 4FPAA 1SZ2A 2EHGA 4Z4HA 2QXFA 4A5AA 4DSIA 1RT4A 3A2FA 4G1QA 2GTDA 3HPGA 1OH6A 4K0KK 5EOYA 3RMDA 4FM1A 4PA1A 1MA9B 3KHWA 4WQ5C 4JRQA 3IDHA 3DRPA 1NLVA 1RTJA 1ZVEA 2E4LA 2VGMA 2PYLA 2YNHA 1BI4A 5HRRA 1WNSA 3FZMA 4JK9A 2J4RA 3QNOA 3O5BA 4CFDA 3FZHA 5KQ8A 1ZU3A 5BPNA 2MBKA 3CJ9A 4IFVA 3J7ZO 3EE8A 3P39A 1SUQA 1C56A 2LY6A 1NGHA 3O9SA 2LJ7A 2OCEA 2E20A 2D56A 1BOTO 4JKHA 1K8AO 4I2PA 1D4XA 3M3ZA 3AVBA 4CJTA 4DR5K 3WEEA 1A5VA 4B9UA 2IDOA 3RR8A 1DQ7A 3BY5A 5KGWA 3OYAA 2UUCK 4B9NA 2Z1IA 3O9RA 3K2PA 1EQYA 4DV2K 3RMBA 1C6VA 2I7PA 3AARA 4O5FA 5AQMA 1NK0A 1Z25A 4B3RK 1T8EA 1BI4B 2KSKA 1I94K 1TKDA 1ASWA 2FSKA 4DR3K 2N69A 1EP4A 2VY6A 4CGHA 2I7NA 4CZJA 4ZHRA 4HVJA 5M1QA 3KHYA 3ZCMA 5HRNA 1KVCA 3CI5A 3LDNA 4CF2A 2JWKA 2ETJA 2HOEA 3O3GA 2JDQD 4DU4A 1ZYVA 1XC9A 3HSCA 1YTUA 3QLHA 1WSFA 1B7DA 3THVA 3KD1E 3F9MA 3WEEB 2VGNA 5B8HA 3TAFA 2OTJN 1BK8A 4BE7B 5J2QA 2FLOA 3VEZA 3HO1A 3ASMA 3BZKA 3EE9A 2EWSA 2GEMA 1VQ6N 1SN4A 2HF3A 5M1FA 2X6NA 5AFUH 4CIEA 1X9WA 1WT7A 1ZBIA 3HTVA 3QO9A 1T44A 1KVAA 3VQDA 1D9FA 2HVIA 1FJGK 3E9OA 4CHQA 3NVKA 4B1YB 2IOCA 1KLNA 1VRUA 3CETA 3U4LA 2EX3A 1LWFA 3SPYA 1QSSA 4R79A 3TSPA 4F2SA 3GE1A 1JXBA 4R5PA 3OYDA 3JAMO 2Z1JA 1LAWA 1UA0A 1JKZA 3CG7A 2OYQA 5JVGL 1YITN 2P5OA 3CPEA 4CHNA 3OYKA 5HRSA 2XY6A 2D0OA 5KRTA 3KOXA 4A59A 4OJRA 2D0AA 1BO5O 3ZSVA 3DLKA 4CJ5A 4B9MA 1W0HA 1ZBHA 3OW2M 3HI0A 3SUQA 4WFNL 4FJ5A 1GOCA 3O9TA 1N8RO 3SNNA 3OY9A 4NLCA 2QWMA 3KOYA 3LZIA 3CW4A 4CF0A 3VETA 1NK7A 2A41A 2DTUA 4FLVA 4I9QA 4FJLA 3MECA 4BR5A 1D5AA 3KLIA 3MXIA 1XRSB 4Z0UA 3WXJA 4CJUA 2PY5A 5GIPA 1VSFA 3OYFA 5IWAK 4EHUA 1RILA 2YHYA 5D3GA 2JWLA 5BRHA 5LL6Z 3WXMB 4KREA 2M8BB 1S1WA 4IG3A 5AZJA 3NF8A 4OPHA 4UY8O 3NH2A 4FOEA 3FFKB 3U6FA 2ZGYA 1YAGA 4I7FA 3O08A 4DTSA 5M1KA 1T7AA 3EN9A 5F1XA 3UKUA 2Q0UA 1CXQA 4YDUA 5FLXO 1GPSA 2YHXA 3QBXA 3L56A 1NH5A 4JAXA 2GBZA 2ZQBA 1L3TA 4C23A 4HCCA 4CJEA 4AHRA 1BQNA 4DLEA 4V1DC 3G25A 4JD2A 3A0IX 3S9HA 5TKYA 4CEBA 2QWRA 3CCUN 2C1GA 1Q18A 4E7KA 1JLGA 1DJTA 4CK3A 1BRZA 4AAZA 4CEEA 5AZJB 3OTOK 4UAEF 3SBTA 5CZ2A 3KZBA 3CIPA 4BWJA 4DTMA 1SV5A 4H4MA 2ATBA 3KKRA 1WSEA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1XHX A;  3EZ5 A;  4H4O A;  1V4T A;  4FJH A;  3A5L C;  3A8Y A;  2E1Y A;  1EXQ A;  1N4N A;  4AHV A;  3CJB A;  4N5S A;  3CPW M;  1RGI A;  1TK5 A;  4KAZ A;  4JYA K;  3TWH A;  4JI6 K;  1RTD A;  3ENH A;  2V7Y A;  3VQQ A;  1Q81 O;  3SBG A;  1A5X A;  3DLH A;  4DFK A;  1NE5 A;  1TL1 A;  2HMP A;  5EX5 A;  2HB5 A;  3G6E N;  4RW4 A;  4DQ8 A;  2LI7 A;  4BG9 A;  3ZSQ A;  4BRO A;  2O8C B;  2KBH A;  1J6Z A;  2YHB A;  4WFA L;  2O8E B;  4CK1 A;  4DQR A;  4L8R B;  1U48 A;  4CIF A;  5J2M A;  3VQ5 A;  4CEQ A;  1C0F A;  3OYI A;  2BE2 A;  2WBN A;  4ELT A;  4M3Y A;  4IG0 A;  3CCJ N;  4E7H A;  3H3N O;  4JK7 A;  3TR8 A;  3L2W A;  3UIQ A;  3PUF A;  4DFJ A;  3ZLJ A;  1TYQ A;  5KPZ A;  4CVN E;  4LF6 K;  3LP3 A;  4FWR A;  4J2E A;  1VSM A;  3LP2 A;  1YHQ N;  4E1M A;  1S72 N;  3MXM A;  4CJV A;  3TTD A;  3DAW A;  4Z4C A;  5KI6 A;  3MWT A;  3NVM A;  3ZEU A;  5FPM A;  3N4P A;  2Y1I A;  5EU7 A;  1FH3 A;  4CGD A;  2HBL A;  3I0S A;  3ZT4 A;  3S41 A;  4ELU A;  4BG8 A;  4BRN A;  4DSE A;  1NK6 A;  1S5J A;  5AJ3 K;  4AQY K;  5T7B A; 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