5AQNA

Fragment-based screening of hsp70 sheds light on the functional role of atp-binding site residues
Total Genus 124
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
124
sequence length
381
structure length
381
Chain Sequence
MSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title A fragment-based approach applied to a highly flexible target: Insights and challenges towards the inhibition of HSP70 isoforms.
pubmed doi rcsb
molecule tags Chaperone
source organism Homo sapiens
molecule keywords HEAT SHOCK COGNATE 71 KDA PROTEIN
total genus 124
structure length 381
sequence length 381
chains with identical sequence C, E
ec nomenclature ec 3.6.3.51: Transferred entry: 7.4.2.3.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5aqnA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqnA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqnA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5aqnA04
4EFHA 4MO4A 4O8KA 3O80A 3CQYA 4K42A 3UKRB 4F9OA 3MN9A 3M6GA 3D7EO 1IJJA 2HOEA 1LOTB 1T44A 3HI0A 3L0QA 3VF2A 1SAZA 2IVNA 3C7NA 2FSNA 1C0FA 3DXMB 3A5NC 1NM1A 4H5TA 2P9NA 5KQ8A 1D4XA 3AARA 4JN4A 5AQOA 1K8KA 1IG8A 2NRHA 3VEXA 1NGEA 4H5VA 4MLEA 3L6QA 4PKHA 4ISGA 3CETA 2AP1A 2EWSA 2GWJA 3C7NB 1ATNA 4FL9A 5FPNA 1HJOA 4FO0A 3F9MA 2ZGYA 4YDUA 1BWFO 1BUPA 2P9NB 3MN7A 4BRCA 2I7NA 4NB4A 3BEXA 3VETA 3VGKA 3MN5A 3ATUA 2YJFA 5AQVA 1YXQA 2A41A 3BF1A 4EHUA 1U2VB 3KZBA 5FPEA 1Y64A 4H0XB 2CGJA 5AQRA 1GLFO 3R6MA 5AFUA 5KPZA 3FZMA 3ZEUB 4BR2A 4CZFA 1NGIA 5ELZA 1HX1A 3WEEA 3R8EA 4BGAA 3GBTA 1KAZA 3ENOA 1YAGA 4FWPA 1E4FT 1KAXA 1YUWA 4BRLA 1E4GT 5AQLA 3HZ6A 2QWMA 4M7XA 4CI6A 3JXUA 2W41A 4H5WA 1JCFA 3MCPA 1QZ6A 2AA4A 2GTDA 4BROA 4IWVA 3FR0A 1V4SA 1NGHA 3IUCA 2J4RA 4M63C 3VEOA 2QWNA 4CZIA 1HUXA 1SZ2A 3VOVA 4RWTA 3EZWA 1QQMA 3A5LC 2FLOA 3JS6A 2BTFA 4DB3A 5F2RA 1T6DA 1TYQA 2D0OA 3VGMA 1HKGA 1TUUA 3SLCA 5AQFA 4BC4A 3VERA 3M3ZA 1BU6O 5BPMA 3TU5A 3WXKA 3CJBA 2P9SA 1RGIA 3AAPA 1J6ZA 3HM8A 1TYQB 2Q97A 2P9KA 2ASMA 3CERA 1MDUB 4FSVA 2BUPA 3AAQA 3U9DA 2FXUA 5BREA 4BRHA 5KQDA 2GEMA 3D2EA 4BR4A 3IMXA 2V7ZA 5BR9A 1S3XA 4YDUC 4CD1A 5JLHA 4BVPA 4CZGA 1NGBA 3FZHA 2P9UB 4FWRA 4AM7A 2P9KB 4BRDA 4IO8A 3DXMA 1G99A 4Y0WA 3O1BA 2YHWA 3KHYA 2YHXA 4RCHA 1ATSA 2Q0UA 2E8AA 1MWMA 4RTFD 4Z94A 3D2EB 5AQJA 1NGAA 4BG9A 3DJCA 3H3OB 3FLCO 5E84A 3VF6A 4BC5A 3IDHA 3LDOA 3FE1A 3GG4A 4ISEA 1KAYA 3H1QA 3CIPA 3UE5A 5BRHA 1JCEA 5BRDA 4B1XB 3WQUA 5FPDA 1NGFA 3SMSA 5FPMA 4CZLA 1GLCG 1WOQA 5AQMA 3CJAA 3EKSA 3DXKA 1BDGA 1V4TA 3GOIA 1U2VA 4PKGA 2E1ZA 4BQLA 5BN9A 4HWIA 5LJWA 1BOTO 4CZKA 3ZEUA 1QHAA 2A6AA 4CZHA 1BG3A 5AQZA 4CBXA 3DAWA 3M1FA 4XH5A 1U6ZA 1KXPA 3DXKB 4K25A 3HTVA 3LDPA 2HF3A 4I6MB 4BRGA 2A42A 3J8AA 3VGLA 1WUAA 3HBTA 3RSEA 2CH5A 1SQKA 4XH1A 5EOYA 3VEVA 2OANA 5ADXH 2E2NA 4BG8A 1XC3A 1BO5O 3UKUB 4A2AA 2DPNA 5AQUA 2GUPA 2HF4A 1Q18A 5AQHA 1OKJA 3H6EA 5BN8A 4QS8A 2CH6A 1BA1A 4FWSA 4PL7A 2E2PA 3RSEB 1QZ5A 1HPMA 4K41A 4B9QA 1XUPO 1HKBA 4QS7A 1MA9B 2IVPA 2GWKA 3LM2A 5JICA 3WT0A 2ITMA 3WUHA 3UB5A 3ZETA 2D1KA 1HLUA 2F9TA 4BRQA 2PAVA 5E26A 4B1UB 3VENA 1LCUA 5JMVA 3BUZB 3SMPA 5AQQA 4DHYA 3H45C 1QQNA 3EO3A 2Q36A 4H0OA 2CGKA 4BC2A 5CE3A 4BR0A 3O1WA 3EKUA 3ZETB 4BRPA 5AQKA 4MLHA 2P9IA 4WQ4A 3OHRA 1GLBG 3ULEA 1RFQA 3H46O 4JNEA 4EIAA 5EVZA 5AQXA 2IVOA 3QBXA 3EN9A 2HMPA 4J8FA 4L3QA 5AQPA 3DWLA 2QWRA 1NLVA 1QQOA 3U8XA 4CZJA 1DEJA 2P9UA 4XEIA 5BPNA 3BP8A 2P9IB 2NLXA 4FWOA 4XH4A 3ULEB 3O8MA 3I33A 5F1XA 3FGUA 2IIRA 2E2QA 4H0YB 4HTLA 5BPLA 5EX5A 4BRAA 2VYPA 5AZIA 1NGCA 5EXWA 1MWKA 4BGBA 4CZMA 4BR5A 2F9WA 4FWKA 3SJHA 1GLEG 4H0VB 4E1JA 1GLDG 4PKIA 4IJNA 2E88A 4BRFA 2VWBA 4H0PA 4B1WB 3CHWA 3QFUA 5F0XA 5AZIB 2NZTA 4BRIA 4WYBA 3QICA 4FPBA 5AR0A 3A0IX 3ATVA 3QDKA 4FWLA 3B8AX 2ZGZA 2CGLA 3L4IA 5AFUH 2PBDA 1ATRA 1XQSC 3VEZA 2V7YA 4EAHD 1HKCA 4BRKA 1JCGA 1S22A 4FWQA 4O5FA 4I6MA 3ZX3A 2QWPA 3A8YA 3LDQA 5AQGA 4CZEA 2D0PA 1RDWX 2ASOA 3MN6A 3FZFA 2YJEA 2ZWHA 3ID8A 3CI5A 3P4IA 3QB0A 1P8ZA 1GLLO 4WQ5A 2A3ZA 3UKUA 2GELA 3W3DA 4KBOA 3O4WA 3O6WA 2YCHA 1DGKN 4IJAA 1NMDA 4FOEA 2ZF5O 3U4LA 2H3GX 4JAXA 3H3NO 3CJCA 1Z05A 2KHOA 2QWQA 1Z6RA 4WQ4C 3EL2A 3VF4A 4A61A 1ZXOA 3QMLA 2V52B 4JHDA 4EHTA 4CJ7A 2V51B 1R59O 1K8KB 5AZJA 2QXLA 4B1VA 5LJVA 2Q0RA 1NGGA 5EY4A 3GDQA 3BF3A 1NGJA 2P9PA 3LDNA 2Q1NA 2QWLA 3MMVA 5AQTA 2P9LA 3VPZA 3D2FA 2YI1A 3CJ7A 3I8BA 4FPAA 4JHDB 4MO5A 4DQ8A 2Q2RA 2E2OA 3ZX0A 4BR9A 4GNIA 1GLAG 4H5RA 3FZLA 4PL8A 4BREA 3HSCA 3LM9A 5AZJB 5KPTA 4BC3A 4B1YB 1X9JA 4CBWA 5B8HA 2P9PB 1NGDA 2A40A 4FWNA 4FOIA 3H1VX 2P9LB 5TKYA 4M7YA 2QWOA 4BQZA 3D2FB 4A62A 4LC9B 4JD2A 3U9ZA 3QFPA 3WXJA 4A2BA 3O08A 3O5BA 3MDQA 3WEEB 5AQYA 2A5XA 5AQIA 5AQWA 1EQYA 4CD3A 3WXLA 2FSJA 1X3NA 2QW9A 3WXIA 3S41A 1ZBSA 3VEWA 4BRMA 3IFRA 3A5OC 2FF6A 5LY3A 1H1VA 4FWMA 2WUSA 3VEYA 5ADXA 3G25A 1CZAN 2YHYA 4GY2B 2VCPA 2E1YA 3A5MC 3SK3A 4DCHA 4JD2B 1NBWA 3MK6A 2D4WA 3CQXA 3CJ1A 1YVNA 3KVGA 4B1ZA 3C0BA 4K43A 4BR7A 3VESA 3LDLA 5BRFA 2W40A 3ZX2A 4H03B 2FSKA 3GE1A 3AY9A 3CJ9A 1T6CA 4AM6A 4H0TB 3TPQA 2Q31A 3FZKA 4WQ5C 4BVOA 3FFKB 3GL1A 4H5NA 3QBWA 1GLJO 5I9EB 5AQSA 4BRNA 4C23A 1NWKA 2I7PA 4IXCA 1BA0A 1DKGD 5JLFA 4ISFA 2ASPA 4QS9A 3WQTA 3UKRA 4CBUA 1TUYA 4IZ9A 3LL3A 1X3MA 2P9SB 1ESVA 1ZC6A 1C0GA 3W0LA 2QM1A 2FF3B 3ENHA 4NO7A 2UYTA 3R9PA 5AQNA 2E20A 5KPRA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1SNBA 3PIPL 1SS6A 4MO4A 4DSIA 3AVMA 4DTUA 3E7RL 4LSNA 1OH5A 4F9OA 2E0HA 1AYJA 3D7EO 3HI0A 3L0QA 5IWAK 4DR7K 3THYA 2FSNA 3OBYA 4O0JA 1N5YA 1I94K 4ELTA 5KQ8A 2Z1IA 3AARA 2Z1HA 3V1QA 4OLAA 3K9JA 2NRHA 3CFRA 3CCUN 3OTOK 4H5VA 1SL2A 4MLEA 4PKHA 4ISGA 3CETA 4IO9L 4DSEA 4M3ZA 4LFBK 1XC9A 4LSLA 5FPNA 4O4GA 1LV5A 4DQQA 3F9MA 1BWFO 4M3UA 2ZE2A 4IFYA 4WFNL 4F2SA 3ATUA 2VQEK 4FLVA 4CHPA 4H0XB 4DQSA 3NHGA 3RVCA 3L2RA 4B3TK 1RTHA 4BR2A 4CZFA 1EO1A 3S3NA 4CF0A 4E89A 4JKAA 4IOAL 1YAGA 1UGLA 1KAXA 4GVMA 4OGCA 4BDPA 3CC2N 5AQLA 3HZ6A 1YJNN 4M7XA 1I39A 4K8XA 4W5OA 2W41A 2P5OA 3DRRA 3LAMA 4AB0A 1QZ6A 1NK8A 2AA4A 5M1KA 4BROA 4IDHA 4IWVA 1V4SA 4BDZA 4HCBA 2KBHA 2LKBA 1M1KO 4M63C 4JK8A 4JKCA 1RDUA 3AA4A 4JKFA 4ILJA 2O8DB 1NOZA 1TVRA 3SCXA 4KREA 3I55N 2BTFA 3O3FA 1YJ9N 1TK5A 3AVHA 3ALYA 1NRAA 1HQUA 1TYQA 1HKGA 1PTXA 1TL1A 3KKRA 4C8KA 4F8RA 4CESA 4FZYA 5AQFA 2Y1JA 2OZMA 1KVAA 5CYMA 2D0BA 3WXKA 2P9SA 3HK2A 1KFSA 3WNHA 3AA2A 4CJWA 5MLCQ 4B9SA 4CJ4A 3J7AP 1NK4A 1S1UA 2XY8A 1NJYA 3U9DA 2BUPA 4LF8K 5KQDA 2DFEA 3CC4N 2GEMA 4BR4A 5CY0A 2V7ZA 5BR9A 1S3XA 3SAFA 1ZYWA 1BK8A 1C0TA 5K14A 1CHZA 2E3GA 4CD1A 3VN5A 3FZHA 1N33K 1XNQK 3OA9A 3OYLA 3DXMA 2HHHK 1XI1A 4IG0A 4KB0A 2YHXA 4RCHA 2MN5A 3WNEA 2O8BA 1Q9YA 1NGAA 3DJCA 4NLBA 3FLCO 4JI7K 4YY3K 3CPEA 4LH4A 1K8AO 1VSJA 4PUOA 3IDHA 1HJRA 1I2VA 4E7HA 3FE1A 4A5AA 4ISEA 4FJLA 3CIPA 1K6YA 3KWGA 1RBUA 4JS5A 1KSPA 3OYNA 1WOQA 1NK0A 2ZD1A 4B3SK 3DXKA 4AHTA 3OYGA 3GOIA 4RW8A 4EZ9A 5BN9A 3PSFA 1T3VA 1C56A 1VSDA 1RNHA 1P90A 1CZBA 3HYFA 4B08A 4DV2K 3M1FA 2UUBK 3WNFA 2O4IA 1J53A 3SUOA 2HF3A 4MFBA 4BRGA 4CIEA 2QA4N 4DTRA 1NJIO 3J8AA 4TSXA 3TTCA 3HBTA 4B9LA 1BIUA 1CXQA 4KHUA 1SQKA 2WC9A 3MEDA 1TKXA 4BG8A 4DTOA 1UWBA 4Z0UA 3ZLJA 4LH5A 2GUPA 3B6OA 5BN8A 2RHKA 1BA1A 2E2PA 1WT7A 3RSEB 2KGQA 3SUPA 1HPMA 1EKEA 4K41A 4B9QA 2FBTA 1HKBA 3KOXA 4LFAK 1MA9B 5JICA 3IRXA 1UA0A 2ITMA 3UB5A 2HHXA 1B3CA 4CF8A 4CW7B 2D56A 3ZT0A 4LF4K 2EX3A 1HLUA 2VG5A 4G1QA 2Q3SA 3P5JA 2OPQA 1I6GA 4DTNA 3M8QA 3SMPA 3TSPA 1PX9A 2KYQA 1QQNA 1C55A 1UA1A 5KI6A 1YTUA 3O1WA 4DU4A 4BRPA 3U3YA 5I42A 2P9IA 4WQ4A 3J80O 3OHRA 1GLBG 3AA3A 3ULEA 4AH9A 3EE9A 4W5TA 4RG8A 1RFQA 2F96A 4EP5A 3OS2A 4E7KA 1KC8O 5AQXA 2IVOA 4FJ5A 2A1SA 2NRXA 4O8UA 2QWRA 1YVUA 4OKJA 1QQOA 3ENBA 3U8XA 3O3HA 3PSIA 1DEJA 2ZJQL 1JXCA 4GV6A 3THXA 4FWOA 4HUFA 3CYMA 3MX2A 5CYQA 2E2QA 3CCQN 2HHSA 3T1AA 5AZIA 1NGCA 1MWKA 4BGBA 4M3RA 4E1MA 4BR5A 3N4PA 1FH3A 1D5AA 5JENA 5I3UA 1GLEG 3V1RA 1CN2A 4DU1A 2E88A 2G8WA 2ITGA 4H0PA 2A7TA 3CHWA 4B1WB 4JKGA 2GUIA 4BRIA 4WYBA 1L3VA 4FPBA 5AR0A 3SPYA 2IOCA 3AGRA 3QDKA 4KH6A 3QEVA 1U49A 2OPRA 5AFUH 4FM2A 5GAGP 3CCJN 4E7JA 4EAHD 4B9NA 1HKCA 4DR3K 1JCGA 4L8RB 4FWQA 2HB5A 4CK1A 4CZEA 1VSFA 3O9RA 4DLEA 1RDWX 4BACA 3LPUA 3QB0A 1P8ZA 1D8YA 4DQRA 1GPTA 4CGGA 2FBXA 2GELA 4B8CA 3W3DA 2K35A 3THVA 1DGKN 4DR6K 2PZSA 3U4LA 5D3GA 3TANA 2KHOA 4KTWA 1Z6RA 4WQ4C 4YFUA 4FLWA 2O8EA 4FLYA 2GMOA 1U47A 4A61A 1FK9A 4OJRA 3AO2A 4AHCA 5IT9O 1OVYA 1N6QA 1WB9A 3G10A 2Q0RA 3BF3A 3AVKA 4Z4IA 2ASCA 3LDNA 3MX5A 2G8FA 5AQTA 4WE1A 3L3UA 1J5EK 2P1JA 4HCCA 3HXMA 5GIOA 3OS1A 2ZJPL 3ZX0A 2KZZA 4GNIA 1EXQA 1GLAG 3NF6A 4BREA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1SNB A;  3PIP L;  1SS6 A;  4MO4 A;  4DSI A;  3AVM A;  4DTU A;  3E7R L;  4LSN A;  1OH5 A;  4F9O A;  2E0H A;  1AYJ A;  3D7E O;  3HI0 A;  3L0Q A;  5IWA K;  4DR7 K;  3THY A;  2FSN A;  3OBY A;  4O0J A;  1N5Y A;  1I94 K;  4ELT A;  5KQ8 A;  2Z1I A;  3AAR A;  2Z1H A;  3V1Q A;  4OLA A;  3K9J A;  2NRH A;  3CFR A;  3CCU N;  3OTO K;  4H5V A;  1SL2 A;  4MLE A;  4PKH A;  4ISG A;  3CET A;  4IO9 L;  4DSE A;  4M3Z A;  4LFB K;  1XC9 A;  4LSL A;  5FPN A;  4O4G A;  1LV5 A;  4DQQ A;  3F9M A;  1BWF O;  4M3U A;  2ZE2 A;  4IFY A;  4WFN L;  4F2S A;  3ATU A;  2VQE K;  4FLV A;  4CHP A;  4H0X B;  4DQS A;  3NHG A;  3RVC A;  3L2R A;  4B3T K;  1RTH A;  4BR2 A;  4CZF A;  1EO1 A;  3S3N A;  4CF0 A;  4E89 A;  4JKA A;  4IOA L;  1YAG A;  1UGL A;  1KAX A;  4GVM A;  4OGC A;  4BDP A;  3CC2 N;  5AQL A;  3HZ6 A;  1YJN N;  4M7X A;  1I39 A;  4K8X A;  4W5O A;  2W41 A;  2P5O A;  3DRR A;  3LAM A;  4AB0 A;  1QZ6 A;  1NK8 A;  2AA4 A;  5M1K A;  4BRO A;  4IDH A;  4IWV A;  1V4S A;  4BDZ A;  4HCB A;  2KBH A;  2LKB A;  1M1K O;  4M63 C;  4JK8 A; 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