5AQNA

Fragment-based screening of hsp70 sheds light on the functional role of atp-binding site residues
Total Genus 124
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
124
sequence length
381
structure length
381
Chain Sequence
MSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title A fragment-based approach applied to a highly flexible target: Insights and challenges towards the inhibition of HSP70 isoforms.
pubmed doi rcsb
molecule keywords HEAT SHOCK COGNATE 71 KDA PROTEIN
molecule tags Chaperone
source organism Homo sapiens
total genus 124
structure length 381
sequence length 381
chains with identical sequence C, E
ec nomenclature ec 3.6.3.51: Transferred entry: 7.4.2.3.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5aqnA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqnA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqnA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5aqnA04
2P9KB 1DEJA 4NO7A 4KBOA 4BR4A 1BA1A 4XEIA 4WYBA 1TUYA 5AQJA 3DXMB 1H1VA 4CI6A 5KPZA 1IG8A 5BPLA 2HF4A 4K42A 5AQGA 4J8FA 2GUPA 3F9MA 3FGUA 4CZEA 5AQIA 3BP8A 3BEXA 3DAWA 5JMVA 1S3XA 1KXPA 5FPMA 4RTFD 2P9IB 3GBTA 3EO3A 4K41A 3FR0A 4F9OA 1LOTB 4AM6A 4BRKA 3I8BA 3VEZA 2YHYA 5B8HA 4Y0WA 5AQNA 2QXLA 5EY4A 1Z05A 3R6MA 1MWMA 2FLOA 4CBXA 2E8AA 5AQFA 4BRIA 2Q0UA 1T6DA 2E2OA 2HMPA 3CERA 3VF6A 5BN9A 3VGKA 2Q2RA 1DKGD 4CBUA 3VPZA 3WQUA 5BRDA 3MDQA 4BRDA 3JS6A 2YCHA 4CBWA 1TYQA 4CJ7A 3VERA 4JNEA 3MN9A 3SLCA 3VEVA 4FWSA 3C0BA 3QDKA 1QQOA 3H6EA 4A2AA 1HPMA 3CJAA 4MLEA 4A2BA 2BUPA 3TU5A 3LL3A 4DHYA 3LDNA 5ADXH 3CIPA 1XC3A 3QFPA 4FWQA 3QBXA 5AQXA 4H03B 4PKHA 5AQLA 1MWKA 3LDLA 2P9SA 3RSEB 5KPRA 2FSNA 2I7PA 5AQPA 3ENHA 4PKIA 3VF2A 3ATVA 4BQLA 2NRHA 4BRQA 3FLCO 1HKBA 5AQVA 5AQQA 3UKRA 1T44A 4BRLA 3U9DA 2E1YA 4CZFA 2E2NA 4PL8A 3GE1A 1E4GT 2CH6A 4NB4A 4H5WA 5KQDA 1Y64A 3ATUA 4FSVA 5AQUA 3W3DA 3WQTA 1YUWA 5ADXA 2V52B 2YJFA 1GLFO 3DXKB 3IDHA 1KAZA 4FOEA 4BRHA 3HBTA 2QW9A 2F9WA 2Q31A 3J8AA 4M7XA 2KHOA 2NLXA 5FPNA 2AA4A 4I6MA 2J4RA 4MLHA 3ZETA 3QICA 3L6QA 3OHRA 4H0XB 2IVOA 4BRCA 5BN8A 1NBWA 5AQHA 3O8MA 3WXIA 3SK3A 4FWMA 1P8ZA 3VEXA 3S41A 3SJHA 3LM2A 3A5MC 1U2VA 1SQKA 4JN4A 3JXUA 3ID8A 2QWMA 3VENA 1MA9B 3C7NB 2Q0RA 1Z6RA 1NGHA 4YDUC 1HKGA 4BRMA 2DPNA 5TKYA 3GDQA 4QS8A 4BVOA 3HM8A 4M63C 1YXQA 4BRNA 5JLHA 1NGIA 3P4IA 4WQ5C 4FL9A 1RGIA 5E26A 2CGKA 2FF3B 4BR5A 4EFHA 3A5LC 4EHUA 4RWTA 2A41A 4O5FA 1E4FT 2W41A 3CJCA 1GLDG 3ZX2A 5EX5A 4PL7A 1HKCA 1NGAA 2P9PA 4JD2A 1X9JA 4K43A 5AQMA 1XQSC 3UE5A 3WEEB 1SZ2A 4XH1A 2P9UA 1KAYA 4RCHA 2P9NB 1K8KB 4MO5A 4DCHA 3SMSA 3LDOA 3DJCA 5AZIB 3O80A 4JAXA 1HLUA 3BF1A 3VEWA 2QM1A 3CETA 4IO8A 1IJJA 3BUZB 3ULEA 1WUAA 2ZF5O 1X3MA 2V51B 3GOIA 4WQ4A 2HF3A 2YHWA 4BR0A 2ZWHA 2P9LB 4JHDB 1JCEA 1V4SA 2EWSA 3EL2A 3UKUA 4AM7A 3A5NC 2YHXA 4EAHD 4H5TA 2QWNA 1DGKN 3QFUA 1JCFA 1YVNA 3VESA 2FSKA 2E2PA 3MMVA 1MDUB 2P9KA 3ZEUB 2AP1A 4XH5A 3O5BA 2ASMA 4BQZA 3M6GA 3ENOA 3DXMA 2CH5A 3A0IX 5LJVA 4FWKA 4L3QA 2A6AA 4DQ8A 4YDUA 3FZKA 5AQZA 4BGBA 2ASPA 2FF6A 1NGJA 3EZWA 2P9IA 1QZ5A 4FWRA 1KAXA 3FZLA 3CQYA 4BREA 3R9PA 5JLFA 3IMXA 1QHAA 4B1YB 3EN9A 2GWJA 1JCGA 3L4IA 3O1BA 3FZFA 1BU6O 2FXUA 1NGBA 2GEMA 4C23A 1NMDA 2ASOA 3HTVA 3H45C 3D2EB 3GL1A 3VEOA 4IXCA 3VETA 3VEYA 1D4XA 3UB5A 3D2FB 2IIRA 3AARA 4GNIA 4H5RA 4FPAA 4FPBA 2A3ZA 5BREA 4CZMA 3FZHA 2OANA 3CHWA 2E1ZA 4H0PA 5EOYA 3QBWA 5FPDA 2I7NA 4CD3A 4GY2B 3FFKB 1BUPA 1QQMA 1C0GA 2IVNA 5BPNA 3U8XA 3IUCA 3MN6A 1ZBSA 1J6ZA 3LDQA 3G25A 3EKUA 5CE3A 1BDGA 1BG3A 2HOEA 4BROA 4ISFA 2YI1A 1XUPO 4IJAA 5KQ8A 3RSEA 3KHYA 3O4WA 5EXWA 4CZHA 4Z94A 1ATSA 3IFRA 5AQSA 4FOIA 4H5NA 3LM9A 3M1FA 3H1VX 2QWOA 4HWIA 5ELZA 3ZX3A 4BC4A 3D2EA 5BR9A 3VF4A 1RFQA 4IZ9A 5AQRA 2D0OA 3SMPA 2VYPA 1ZC6A 5KPTA 3DXKA 3QMLA 1RDWX 1GLEG 4MO4A 2E2QA 4FWLA 3HZ6A 1V4TA 1QQNA 1HUXA 4QS7A 4BVPA 3O1WA 5F2RA 1X3NA 3QB0A 1NGDA 3WUHA 1TYQB 4B9QA 4LC9B 1NLVA 1Q18A 2ZGYA 4BR9A 5F1XA 3KZBA 1BA0A 1BWFO 1S22A 2A42A 3CQXA 4IWVA 4BC5A 1NGEA 3A5OC 3L0QA 1CZAN 1BOTO 4BG9A 3AAQA 3FZMA 3C7NA 4FWNA 2GELA 3AY9A 3WT0A 3FE1A 1HX1A 2D4WA 2P9SB 1ATNA 3WXLA 4BC2A 4EIAA 1ESVA 5AQYA 3H3OB 5AQTA 1R59O 5BRFA 5EVZA 4ISEA 2Q97A 4CD1A 4EHTA 5AQOA 4BR2A 5AFUH 2CGLA 2WUSA 3VOVA 4E1JA 4CZLA 1QZ6A 3UKRB 3VGLA 4CZGA 1NM1A 1WOQA 5AZJB 1U6ZA 2E88A 2QWRA 3WEEA 1GLLO 2P9NA 5FPEA 1K8KA 4H0YB 2V7ZA 1NGGA 1NGFA 4H0TB 3A8YA 4CZIA 4BC3A 3CJBA 3CJ7A 3O08A 3U4LA 3H1QA 4CZJA 5AZIA 2ITMA 4B1VA 2D1KA 1G99A 4K25A 2YJEA 4O8KA 2V7YA 3R8EA 2IVPA 1GLJO 4WQ5A 4A61A 4I6MB 5LY3A 1T6CA 3ZETB 1LCUA 4BRAA 2VCPA 4BRFA 5I9EB 1GLCG 2ZGZA 4A62A 5AFUA 4FWPA 3WXKA 2D0PA 2P9LA 4JHDA 5AQWA 2GWKA 1U2VB 3H46O 1EQYA 3LDPA 1YAGA 3KVGA 3CI5A 2PAVA 4BRGA 1HJOA 2A40A 3O6WA 3MN5A 3B8AX 4FO0A 3CJ1A 3U9ZA 1NGCA 2W40A 3ZEUA 4CZKA 3GG4A 2BTFA 1ATRA 1SAZA 4WQ4C 5AZJA 4B1XB 2CGJA 5AQKA 3M3ZA 2Q1NA 3BF3A 4DB3A 1GLAG 4PKGA 4H0OA 4BR7A 2Q36A 1ZXOA 2FSJA 2P9PB 4JD2B 4H5VA 2PBDA 4M7YA 4B1WB 2QWLA 2P9UB 4BGAA 4HTLA 1GLBG 3W0LA 2F9TA 3CJ9A 3D7EO 2QWPA 2UYTA 4BRPA 2NZTA 4B1UB 3HI0A 3EKSA 5BPMA 3AAPA 3ULEB 5E84A 1TUUA 5BRHA 4ISGA 1BO5O 3D2FA 3H3NO 4H0VB 3VGMA 3MCPA 3DWLA 2H3GX 3MN7A 2QWQA 3HSCA 1C0FA 2A5XA 5F0XA 4QS9A 2GTDA 3TPQA 2E20A 3UKUB 3WXJA 2VWBA 1NWKA 3I33A 4BG8A 5JICA 4IJNA 4B1ZA 3ZX0A 3MK6A 5LJWA 4FWOA 4XH4A 1OKJA 5AR0A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1DEJA 3VQ4A 4ZTJA 2HVIA 2X6SA 5C2FA 4KBOA 4BR4A 2O8BB 3EE8A 2IDOA 4ILGB 4JKHA 4CI6A 4LD0A 1FK9A 1N36K 5AQGA 3F9MA 1FKOA 3BP8A 3BEXA 3E7UX 1KXPA 3K5LA 5T7BA 4RTFD 2P9IB 3GBTA 2HHUA 1HNIA 4W5OA 4F9OA 1LOTB 3GKUA 4AM6A 4Z4HA 2N69A 3KJVA 4FJGA 2QXLA 1UA1A 2FLOA 1SN4A 1C6VA 4BRIA 4DR4K 1VNAA 4FJXA 4LF6K 5BN9A 2O8EB 3VPZA 1PTXA 3WQUA 3HPOA 2W00A 3CW4A 4FXDA 2YCHA 4CGJA 4ILJA 2LY5A 4FJ9A 4E72A 2X74A 4RW4A 4FZZA 1JKHA 3LANA 3QDKA 1WAFA 2B6AA 1AHOA 3G4SN 4MLEA 4X66K 3AVIA 3J7YP 3AVLA 2O8BA 1NMNA 5ADXH 4CE9A 5BR8K 1XC3A 3SBGA 1TK5A 5GAEP 4WE1A 5AQXA 5M1OA 4CK2A 3VTIA 1ZYWA 1NK4A 2MZ0A 5AQLA 5DM6L 1LQHA 4JKGB 5CZ2A 2LSNA 1NK5A 4CF2A 4CGFA 3VF2A 4RW7A 4BQLA 4PY5A 1HKBA 1WBBA 3NF8A 5HOOA 1J5OA 1T03A 4N47A 4BRLA 1NRAA 5M1KA 4CJEA 1T3VA 4PL8A 3AVHA 3D45A 4DFKA 3P39A 5KQDA 1OVQA 2V52B 1JXEA 1B7DA 1GLFO 3VQ8A 3TARA 3O9UA 1K8BA 4W5RA 4RW6A 2Q31A 3ID6A 2KHOA 1E3MA 2J4RA 4M3UA 4FJMA 3L6QA 2XY8A 3OHRA 4BDPA 2O8FB 4GKKK 1A5VA 1YT3A 5BN8A 1VSLA 3O8MA 2LT8A 3SK3A 4CEQA 2KBKA 4DV3K 3S41A 1IH7A 3PSIA 3VQBA 1SQKA 4JN4A 1B9DA 4YDUC 2N2RA 3E9PA 2YHAA 3OW2M 3P4IA 1D8YA 4FL9A 5AJ3K 4BWJA 2GMOA 2FF3B 4EHUA 1TKZA 4O5FA 3PV8A 2W41A 4YY3K 3CJCA 1RCHA 4H8KA 4AHUA 4DF8A 2OA8A 1YVUA 3DM2A 3L2WA 3LP1A 3UE5A 2DFEA 3WEEB 1K73O 4RCHA 5FDLA 3F2KA 4MO5A 2X6NA 3LDOA 4IO9L 2F7TA 5AZIB 3O80A 2B68A 3VEWA 5GADP 3CETA 5JENA 4IO8A 4HUEA 2HB5A 5DK5A 2ZJQL 1NJYA 4BY9C 1WUAA 4HE7A 3WNGA 1NK6A 1X3MA 3L2QA 4C8OA 2V51B 3GOIA 2E6LA 2YHWA 3IS9A 4BR0A 4UQGA 3V9XA 4FM1A 4FW2A 5FROA 3J81O 2P51A 3L2VA 2WONA 4O8UA 3CQ8A 3UKUA 4RW9A 2YNHA 2KJAA 2DFFA 3SQ4A 3RRGA 1TV6A 4F2RA 3OYCA 2QWNA 4N5SA 4BE2A 4BACA 1MDUB 4FLXA 3OYLA 4XH5A 4FJ8A 2ASMA 1IBMK 4QOZB 4KTZA 4DU1A 3DXMA 4FK4A 2HNYA 1RT3A 1RBSA 5LJVA 1WAJA 4A57A 3L4QA 2IAJA 5AQZA 3O9SA 4YORA 3DOLA 3NH1A 4B3OA 2VGMA 3Q7CA 1HQUA 1NGJA 1BISA 4B9LA 3I55N 2KZMA 4FWRA 3OJSA 1KAXA 1XI1A 1O1WA 1ASUA 2ZJPL 1QVGM 2GWJA 2D0CA 5M1QA 1EP4A 3FZFA 2FXUA 2YKMA 4AAZA 1XMOK 2ASOA 2IOCA 4IXCA 3K57A 4IOXA 3VEYA 1JKZA 3D2FB 4O0JA 1RBUA 4FPAA 2A3ZA 3K59A 4NXNK 1VSHA 1ZBFA 3CHWA 4EZ9A 4H0PA 4GKJK 3QNOA 2OTJN 1HYSA 5FPDA 1WLJA 4BECA 3NBPA 4GY2B 1QQMA 1KVBA 3U8XA 4CHPA 3N4PA 1EXQA 4LH4A 3NHGA 3L56A 1ZBSA 4M3ZA 4JK8A 3LDQA 2NRRA 4DUZK 2HOEA 4A5AA 1VSJA 1FXXA 4BROA 1XUPO 1C0MA 3FFIA 5CYQA 2ZQBA 4CECA 4WFNL 3KHYA 4DV1K 1NJWA 2N66A 3HPGA 3QNNA 3CMEN 4AHTA 3ZSQA 4JKAA 4OLAA 3JSMA 3ZX3A 4BC4A 4NXMK 1VSEA 4B8AB 1YTAA 2VYPA 4HVJA 1ASWA 3QMLA 1BQMA 3IKMA 1LV5A 1NNEA 3ZT4A 5KRTA 4CJQA 1C0TA 5DMRA 1RDWX 1ITGA 4MO4A 4LF5K 1M1KO 1V4TA 1QQNA 1HUXA 4BVPA 2DTUA 3O1WA 3T1YK 4J2DA 3T3FA 1NGDA 3WUHA 4B9QA 4LC9B 1NLVA 1JXCA 3AVAA 5GIOA 4JI6K 4GVEA 1Y97A 3TAEA 4Q0BA 4CFDA 2A42A 4IWVA 1IKYA 4CJ4A 2VQEK 3CCQN 2W6LA 4Z4IA 4BG9A 3RMCA 3C7NA 3WT0A 3SUOA 3ZT3A 4LFBK 1D9DA 4B3TK 1YIJN 4N56A 4FW1A 4FM0A 2DY4A 4EIAA 3KLEA 4CJ3A 1EX4A 2Q97A 4E7KA 5AQOA 2XO7A 1YJNN 4DV5K 1YTUA 3VQ6A 4E1JA 4CZLA 1TI5A 4W5QA 4HHTA 4ELUA 3TTDA 5A2QO 1VRTA 1WOQA 4I7FA 1SN1A 1U6ZA 4IEEA 2QWRA 3OS2A 4KKOA 1GLLO 5FPEA 2P9NA 4H0YB 3A8YA 1JJ2M 3O08A 1HNWK 4PHTX 3IAYA 2ITMA 3OYIA 4K25A 2YJEA 4O8KA 4DTNA 1EWQA 4DSLA 4WQ5A 3AA2A 1RBTA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1DEJ A;  3VQ4 A;  4ZTJ A;  2HVI A;  2X6S A;  5C2F A;  4KBO A;  4BR4 A;  2O8B B;  3EE8 A;  2IDO A;  4ILG B;  4JKH A;  4CI6 A;  4LD0 A;  1FK9 A;  1N36 K;  5AQG A;  3F9M A;  1FKO A;  3BP8 A;  3BEX A;  3E7U X;  1KXP A;  3K5L A;  5T7B A;  4RTF D;  2P9I B;  3GBT A;  2HHU A;  1HNI A;  4W5O A;  4F9O A;  1LOT B;  3GKU A;  4AM6 A;  4Z4H A;  2N69 A;  3KJV A;  4FJG A;  2QXL A;  1UA1 A;  2FLO A;  1SN4 A;  1C6V A;  4BRI A;  4DR4 K;  1VNA A;  4FJX A;  4LF6 K;  5BN9 A;  2O8E B;  3VPZ A;  1PTX A;  3WQU A;  3HPO A;  2W00 A;  3CW4 A;  4FXD A;  2YCH A;  4CGJ A;  4ILJ A;  2LY5 A;  4FJ9 A;  4E72 A;  2X74 A;  4RW4 A;  4FZZ A;  1JKH A;  3LAN A;  3QDK A;  1WAF A;  2B6A A;  1AHO A;  3G4S N;  4MLE A;  4X66 K;  3AVI A;  3J7Y P;  3AVL A;  2O8B A;  1NMN A;  5ADX H;  4CE9 A;  5BR8 K;  1XC3 A;  3SBG A;  1TK5 A;  5GAE P;  4WE1 A;  5AQX A;  5M1O A;  4CK2 A;  3VTI A;  1ZYW A;  1NK4 A;  2MZ0 A;  5AQL A;  5DM6 L;  1LQH A;  4JKG B;  5CZ2 A;  2LSN A;  1NK5 A;  4CF2 A;  4CGF A;  3VF2 A;  4RW7 A;  4BQL A;  4PY5 A;  1HKB A;  1WBB A; 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