5AQQA

Fragment-based screening of hsp70 sheds light on the functional role of atp-binding site residues
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
381
structure length
381
Chain Sequence
MSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title A fragment-based approach applied to a highly flexible target: Insights and challenges towards the inhibition of HSP70 isoforms.
pubmed doi rcsb
molecule keywords HEAT SHOCK COGNATE 71 KDA PROTEIN
molecule tags Chaperone
source organism Homo sapiens
total genus 120
structure length 381
sequence length 381
chains with identical sequence C, E
ec nomenclature ec 3.6.3.51: Transferred entry: 7.4.2.3.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5aqqA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqqA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqqA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5aqqA04
3UB5A 3O1BA 2E8AA 4EAHD 1BA1A 2Q1NA 3TU5A 1KXPA 3VGKA 1GLCG 4IJNA 1GLLO 4BGBA 5JMVA 4IZ9A 5F1XA 3O4WA 3MK6A 3LDLA 4H03B 2FSNA 4FOIA 4O8KA 1NGCA 1JCFA 2EWSA 1MDUB 3HTVA 4MO5A 3IFRA 2QWLA 4BR4A 3CJCA 3S41A 3QBXA 3KVGA 4CJ7A 3MN5A 3H45C 1LCUA 2NRHA 2ZGZA 3H46O 3JS6A 4HTLA 3WUHA 2ZGYA 4WQ4C 3C7NA 2ITMA 1QZ5A 4CZHA 3CIPA 3DJCA 1HKCA 2QWMA 5AQZA 3VETA 3VEYA 4BRMA 4FPBA 2Q2RA 3D2FA 3LDQA 5KPRA 3A5LC 1NGHA 4EHUA 1U2VA 2CH6A 3QICA 3C7NB 3HSCA 4BRPA 4YDUA 4FSVA 4BRIA 5AQNA 5I9EB 5BPNA 1NBWA 3IUCA 5F0XA 4CZEA 4XH1A 4CZMA 4NB4A 4BC4A 1V4TA 3LL3A 3ULEA 2AA4A 5BREA 4IXCA 5AQXA 1SAZA 3MCPA 1ZC6A 5AR0A 4H0TB 4BGAA 1LOTB 4EIAA 1ATNA 5E26A 2PAVA 3OHRA 3WQTA 3GL1A 2A5XA 4B1XB 2PBDA 4M7YA 4HWIA 2CGJA 4FWRA 2IVOA 2P9LA 2FLOA 2BUPA 4H5WA 3ZETA 3KHYA 3WQUA 3EL2A 5AQUA 3DXMB 4J8FA 3AARA 3EN9A 1TUUA 2QWQA 3L6QA 3ULEB 5BRFA 1K8KA 2QWNA 3JXUA 1BWFO 1G99A 1GLDG 2GUPA 4DHYA 1S3XA 1BG3A 3VF2A 4I6MA 4FWNA 4M63C 4CD3A 2QWPA 3A0IX 3D7EO 1CZAN 3BUZB 2QM1A 2GELA 2P9LB 2Q0UA 3U9ZA 4IWVA 3CJBA 5FPDA 5B8HA 2Q36A 5LJWA 4BR7A 1JCGA 3MN9A 4H0VB 3CQYA 3P4IA 4DCHA 3GOIA 2V7YA 3HI0A 2ASPA 3CJAA 4H0XB 4K42A 1Q18A 4QS9A 3BEXA 4JHDB 1GLAG 4BROA 3W3DA 5BPMA 4I6MB 1QQOA 4BRAA 4CZKA 1BUPA 1QHAA 1YXQA 2A40A 4BRKA 5AQGA 5BN9A 4DQ8A 3CHWA 1MWKA 3ID8A 4BC3A 3GE1A 4BR0A 4EFHA 1HJOA 2WUSA 4XEIA 4CD1A 2D4WA 3QDKA 4CBWA 4H5RA 3CJ9A 3VF6A 3GDQA 2A3ZA 3EZWA 2A42A 4H5NA 3ATVA 1HLUA 4K41A 1IG8A 1C0FA 2P9UA 3DAWA 1P8ZA 5BN8A 2IVNA 2GTDA 4WQ5A 4CZJA 3ENOA 3UE5A 3MDQA 5EVZA 3QBWA 5F2RA 1YVNA 4CZLA 1SQKA 3FZKA 1BA0A 4BRGA 3CI5A 4H5VA 4RTFD 1X3MA 1YUWA 5TKYA 1KAXA 5EXWA 2P9UB 5FPMA 3EKUA 5AQTA 3H3NO 4BRHA 3IMXA 1WOQA 4FWOA 1Z05A 2FF6A 3FLCO 3SK3A 3ZX2A 2E1ZA 2FSJA 2IVPA 1T6CA 5JICA 3SMSA 3IDHA 1BOTO 2CGLA 2YHYA 4JD2B 2GWKA 4JN4A 3H1VX 4ISEA 2E2NA 5JLHA 1S22A 3RSEA 2W40A 2ASOA 4B1VA 3MMVA 2HF4A 1QQNA 1BDGA 5AZIB 5ADXH 3L0QA 4AM6A 3ATUA 3FGUA 1ATRA 2ZF5O 2GWJA 3DXMA 3VEZA 3VGLA 1NGGA 4CZGA 4CBUA 4B1ZA 2FF3B 1T44A 1D4XA 3MN7A 1X9JA 3O6WA 4H0OA 3RSEB 3SLCA 5BR9A 3FE1A 3LDNA 3MN6A 3ZX0A 4CBXA 2HOEA 5AQVA 1NGEA 4BR2A 5KQDA 2P9KA 3VESA 5AQQA 4FWPA 5AQKA 2ASMA 4KBOA 3WXJA 2P9SB 1GLJO 1WUAA 3F9MA 1RFQA 3HZ6A 2Q31A 3O8MA 3R8EA 2QWOA 1HPMA 2I7NA 4JHDA 4B9QA 3WEEA 2E2OA 3A5NC 5AQMA 2Q97A 4MLEA 4BREA 3VPZA 1DKGD 4H0PA 4IJAA 4PKIA 4LC9B 2V7ZA 4FWKA 4JNEA 1NMDA 2BTFA 3A8YA 1H1VA 2Q0RA 4K43A 5AFUH 4H5TA 2P9KB 3ZX3A 5AQFA 1NWKA 1ZXOA 2NLXA 3LM2A 5BRDA 3M1FA 4WYBA 4BRQA 1C0GA 3U4LA 1XC3A 4FWSA 5AZJA 5AQJA 3AAQA 4FWQA 3BF1A 4BRFA 4WQ4A 3WEEB 2AP1A 1QZ6A 3FZHA 3FZFA 4BRCA 3J8AA 3WXKA 4BQZA 2VYPA 1XUPO 2F9TA 2QWRA 2D1KA 4E1JA 1NGAA 2DPNA 3FFKB 5AQSA 2V52B 4A2AA 4ISGA 4JAXA 2HMPA 5AZJB 3SMPA 4BQLA 4A61A 1DGKN 3VOVA 3R6MA 2P9IB 2YJFA 1TYQA 4YDUC 3H3OB 3CERA 1GLEG 4BR9A 3UKUA 3M6GA 3O80A 4DB3A 3VF4A 2FSKA 2I7PA 2E20A 3O5BA 4CZFA 1NM1A 3H6EA 3VERA 1ESVA 1ZBSA 1HKGA 2P9PA 4XH5A 1MA9B 2D0PA 5ADXA 4JD2A 3H1QA 1TYQB 5BRHA 4A2BA 3LDOA 2VWBA 2UYTA 3UKUB 3WXIA 4QS8A 4XH4A 5KPZA 5BPLA 1Y64A 2VCPA 3CETA 4B1WB 4FL9A 3C0BA 3DXKB 3VGMA 5AZIA 1KAZA 2P9PB 4FOEA 3GG4A 1XQSC 1QQMA 2CGKA 4CI6A 5EX5A 3G25A 1SZ2A 3BP8A 4EHTA 1KAYA 4BRNA 4FWMA 1HUXA 5AQLA 1HKBA 2YHWA 2FXUA 3A5MC 3UKRA 4BG9A 1E4FT 5AQWA 5AQPA 3SJHA 3D2EA 4GNIA 2E1YA 1ATSA 4AM7A 1GLBG 3CQXA 4F9OA 3EKSA 2HF3A 5AQHA 1MWMA 3QB0A 3GBTA 3QFPA 1RGIA 2H3GX 2J4RA 2E88A 4BVOA 1NGDA 4O5FA 3DWLA 2ZWHA 4L3QA 1BO5O 5AQIA 4B1UB 5AFUA 4BC2A 3FZMA 3A5OC 5LY3A 2P9SA 3I8BA 3ENHA 3LM9A 2YI1A 1NGIA 4Y0WA 3UKRB 1TUYA 2V51B 3WXLA 3D2EB 4FO0A 4FWLA 2D0OA 2A41A 3O08A 5CE3A 4MO4A 4ISFA 2YCHA 5ELZA 3FZLA 4BR5A 5KPTA 4CZIA 5KQ8A 2CH5A 3U8XA 2W41A 2KHOA 3I33A 4PL8A 1IJJA 3D2FB 2YJEA 3EO3A 4GY2B 3AY9A 4WQ5C 4BRDA 1DEJA 3B8AX 3QMLA 5AQOA 1NLVA 2E2QA 3CJ1A 1U2VB 2OANA 3HM8A 1V4SA 4Z94A 3CJ7A 4BC5A 1R59O 3VEWA 5EY4A 4FPAA 3M3ZA 4BG8A 1EQYA 3U9DA 4BVPA 1E4GT 2P9IA 1T6DA 2GEMA 3O1WA 4QS7A 3KZBA 3W0LA 4B1YB 3VEOA 3WT0A 2P9NA 2IIRA 2QXLA 3L4IA 3VEVA 2A6AA 2E2PA 4PL7A 1NGFA 4M7XA 3ZEUA 3ZETB 3VENA 1U6ZA 1X3NA 1HX1A 1OKJA 1GLFO 1JCEA 1K8KB 3BF3A 1J6ZA 1NGJA 4RWTA 4A62A 3AAPA 5E84A 3TPQA 2P9NB 5LJVA 1Z6RA 1NGBA 5FPNA 2YHXA 4C23A 1RDWX 3DXKA 5AQRA 5FPEA 4BRLA 1BU6O 2NZTA 4PKGA 3ZEUB 2F9WA 4PKHA 4MLHA 4H0YB 3LDPA 4RCHA 1YAGA 5AQYA 3R9PA 5JLFA 3HBTA 3FR0A 4IO8A 4K25A 4NO7A 2QW9A 5EOYA 3QFUA 3VEXA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2E8AA 2JGUA 3NF9A 3THVA 3TAFA 4CFAA 5IWAK 3D0PA 5FRMA 1JLGA 2FBTA 1I6FA 3CCVN 1LV5A 3O4WA 4H03B 3SUPA 5C2FA 1VSIA 1UGLA 3BZCA 1HNIA 3AGKA 5C12A 1WSFA 2QWLA 2W6LA 1N8RO 3Q7CA 4KH6A 4DV6K 3H45C 1YJ9N 3QLHA 4HTLA 4ILHA 2PFUA 2A1RA 4WQ4C 2HNDA 1QZ5A 4JYAK 1HKCA 4ICLA 4CJWA 4JK9A 1BQMA 1CLQA 4BRMA 4AB0A 3NH2A 3LDQA 3AA5X 1IG9A 3AVIA 4DTSA 4FK0A 3THXB 1EP4A 5HP1A 2W42A 1OZZA 2D5RA 4FJNA 4R5PA 3IKMA 4CEZA 2ETJA 4BRPA 2YNGA 4BWMA 1G15A 4B9NA 2G8UA 5I9EB 3SPYA 4AQYK 5BPNA 3AGRA 4B9UA 2ATBA 3ZSOA 2XO7A 2OA8A 1RDAA 4CZMA 1NG9A 3V9ZA 1ICAA 3RR8A 5AQXA 1SAZA 4DSJA 5AR0A 4H0TB 5CZ1A 3ALYA 3LWLA 4KI4A 3WQTA 1VSJA 3OHRA 1TAQA 2A5XA 4B1XB 4CF2A 2YC1C 4M7YA 3N4PA 2IVOA 2P9LA 3S3MA 2DTUA 4H5WA 1I2VA 4IDHA 3KHYA 1AHOA 2QWQA 2KW4A 1NK7A 3ULEB 4B08A 1BWFO 1G99A 1GLDG 2YHAA 4GVEA 2BE2A 1WMTA 4M63C 4CD3A 2IOCA 1GOCA 4N5SA 3RR7A 4CHYA 2KBHA 3A0IX 4KHPK 1CZAN 2KFZA 4DV0K 3QEIA 4JS5A 2QM1A 2Q0UA 3NGYA 4FJ8A 1RT2A 2F8TA 1RBTA 2C1IA 4KH5A 5KK4A 2AJQA 5TKWA 1MYNA 3QIOA 2O8FA 3MN9A 4H0VB 3V9XA 4DCHA 2V7YA 3S3NA 3HI0A 2ASPA 3CJAA 4H0XB 1FKPA 4K42A 3BEXA 4JHDB 1F21A 3W3DA 4I6MB 2Z1IA 5DM6L 2KYQA 1ZUTA 2UU9K 4AHRA 3MXIA 4CZKA 1SS6A 1T3VA 3TTDA 2E3FA 3T1AA 4FJ5A 4K8ZA 5BN9A 1BIUA 3OYJA 2GV9A 3ID8A 4C1NK 2WFBA 4WE1A 3GE1A 4XEIA 4FLTA 1N32K 3MX5A 4X62K 2D4WA 4JK8A 4H5RA 3ENBA 1XMQK 3VF6A 1HNZK 3HPOA 3S5TA 4YOUA 1IG8A 1C0FA 2P9UA 3DAWA 2GTDA 4IOCL 3UE5A 3DRSA 3OW2M 1NK8A 4CZLA 1S5JA 4V1DC 1S1UA 3EYZA 3CI5A 5HRRA 3WNFA 4H5VA 3M8RA 4DTNA 2HMIA 3HOSA 4FLUA 5FPMA 4ELUA 1WOQA 4FWOA 2JLEA 2O8CB 2FF6A 4J2BA 3FLCO 1HNWK 3ZX2A 3MXMA 3SYZA 2IVPA 1N34K 4E7HA 3IDHA 2GL1A 1BOTO 1W97L 1VK0A 1VNAA 1VSDA 5JLHA 1TK0A 4YFUA 3RSEA 4LH4A 2W40A 2ASOA 2D0AA 3ISNC 3MMVA 3OYBA 1L3SA 1KVAA 5ADXH 3OYDA 1BMRA 3ATUA 3FGUA 1ATRA 1WBBA 4CEEA 4DV1K 4CHNA 3SI6A 3MWPA 3VEZA 3VGLA 3F9KA 1XHXA 4B1ZA 4J2DA 3AO5A 1X9JA 2PZSA 5I42A 3O9TA 4A59A 1XC9A 1JXEA 5M1KA 3HOTA 4CBXA 3D6RA 1AYJA 3RWUA 1CZ9A 2EX3A 1SL0A 3WXJA 2M8BB 5CR4A 1WUAA 1RFQA 3V81A 5A2QO 3R8EA 4B9QA 1NOYA 2E2OA 3NF7A 4MLEA 4H0PA 5GAEP 3QNOA 3C94A 4KHNA 4LC9B 2V7ZA 1C1AA 2VQFK 4JI5K 3AO4A 3K57A 4K43A 2P9KB 3ZX3A 3E9PA 1KLNA 4K8XA 3M1FA 4W5TA 1C0GA 3U4LA 5AZJA 4FWSA 5AQJA 1PX9A 3BF1A 4BRFA 4X65K 3WEEB 3VTHA 3RMDA 4WCEL 1QZ6A 4JEPA 4KB0A 3NF6A 4PY5A 4BQZA 1BRZA 2PYJA 2F9TA 4BE7B 1XNRK 2D1KA 4N76A 1TV6A 5AQSA 4A2AA 3J7YP 3SQ0A 2QKBA 1SUQA 1NNEA 1POIA 3UKUA 3M6GA 4DB3A 2I7PA 4Q5VA 4CZFA 5C15A 1ESVA 4B3RK 3J81O 1WNSA 1HKGA 4NYNA 4JKGA 4E7LA 1Q86O 4FLVA 1WB9A 3HPHA 3H1QA 4DR2K 1SEGA 4HCBA 3ZSYA 4CGFA 5GAGP 3VQBA 4B8AB 2NY8X 2P5GA 4RW9A 1RILA 3P31A 2VWKA 4X64K 3SCXA 3VGMA 4AHSA 4JI3K 3SAHA 5AZIA 3SAGA 1KAZA 1KVCA 4A57A 3KK7A 1WBDA 4FM1A 5KI6A 2OZMA 4KYPA 1SZ2A 2RF2A 3BP8A 1VQKN 4M41A 4CFDA 4FWMA 2YHWA 4IFEA 3NAEA 4BG9A 2FBVA 4WFNL 1C0TA 4UJ0A 2UUCK 4FZXC 2E1YA 5BR8K 4R79A 4PQUA 2ZQBA 2OCEA 3GBTA 3DWLA 2ZM6K 2Y1JA 1RBRA 3E9LA 4B1UB 4LF4K 3FZMA 4FW1A 1VSMA 2RKIA 4Z4HA 1NGIA 3VQDA 3WXLA 4DFJA 3D2EB 4FWLA 1ZVEA 3FZLA 2VY6A 1W7AA 3DLEA 4WFAL 1L3TA 3G4SN 4N56A 3D2FB 4H4OA 3EO3A 3AY9A 3DOKA 3KKRA 5HOOA 5CY4A 5KRSA 4AF1A 3B8AX 4JI4K 1U2VB 2OANA 3RMBA 1V4SA 4YHHK 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 2E8A A;  2JGU A;  3NF9 A;  3THV A;  3TAF A;  4CFA A;  5IWA K;  3D0P A;  5FRM A;  1JLG A;  2FBT A;  1I6F A;  3CCV N;  1LV5 A;  3O4W A;  4H03 B;  3SUP A;  5C2F A;  1VSI A;  1UGL A;  3BZC A;  1HNI A;  3AGK A;  5C12 A;  1WSF A;  2QWL A;  2W6L A;  1N8R O;  3Q7C A;  4KH6 A;  4DV6 K;  3H45 C;  1YJ9 N;  3QLH A;  4HTL A;  4ILH A;  2PFU A;  2A1R A;  4WQ4 C;  2HND A;  1QZ5 A;  4JYA K;  1HKC A;  4ICL A;  4CJW A;  4JK9 A;  1BQM A;  1CLQ A;  4BRM A;  4AB0 A;  3NH2 A;  3LDQ A;  3AA5 X;  1IG9 A;  3AVI A;  4DTS A;  4FK0 A;  3THX B;  1EP4 A;  5HP1 A;  2W42 A;  1OZZ A;  2D5R A;  4FJN A;  4R5P A;  3IKM A;  4CEZ A;  2ETJ A;  4BRP A;  2YNG A;  4BWM A;  1G15 A;  4B9N A;  2G8U A;  5I9E B;  3SPY A;  4AQY K;  5BPN A;  3AGR A;  4B9U A;  2ATB A;  3ZSO A;  2XO7 A;  2OA8 A;  1RDA A;  4CZM A;  1NG9 A;  3V9Z A;  1ICA A;  3RR8 A;  5AQX A;  1SAZ A;  4DSJ A;  5AR0 A;  4H0T B;  5CZ1 A;  3ALY A;  3LWL A;  4KI4 A;  3WQT A;  1VSJ A;  3OHR A;  1TAQ A;  2A5X A;  4B1X B;  4CF2 A;  2YC1 C;  4M7Y A;  3N4P A;  2IVO A;  2P9L A;  3S3M A; 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