5AQSA

Fragment-based screening of hsp70 sheds light on the functional role of atp-binding site residues
Total Genus 119
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
119
sequence length
382
structure length
382
Chain Sequence
SMSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title A fragment-based approach applied to a highly flexible target: Insights and challenges towards the inhibition of HSP70 isoforms.
pubmed doi rcsb
molecule keywords HEAT SHOCK COGNATE 71 KDA PROTEIN
molecule tags Chaperone
source organism Homo sapiens
total genus 119
structure length 382
sequence length 382
chains with identical sequence C
ec nomenclature ec 3.6.3.51: Transferred entry: 7.4.2.3.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5aqsA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqsA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqsA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5aqsA04
3WXKA 2FLOA 3DXMB 5F0XA 2QWLA 3DXMA 5E26A 2P9UB 4FWKA 5AQTA 1BG3A 2P9UA 4FWNA 2V7ZA 4BG8A 4DHYA 2D1KA 2ASMA 2KHOA 4H0XB 2OANA 2Q2RA 3AAPA 2HMPA 3CI5A 4XEIA 1SAZA 2Q36A 3LM9A 4JN4A 1NGAA 4FWQA 4WQ4A 1QZ5A 1KAXA 3CIPA 5AQQA 1NGGA 3AARA 5TKYA 4PKGA 4BGAA 4EHUA 3O08A 5LY3A 3HSCA 1NGHA 3EO3A 3ID8A 3LL3A 1HKBA 4CZIA 5LJWA 3VGMA 4H0YB 4FWSA 2IVNA 2VCPA 5JLFA 5AZIB 3BF1A 3IMXA 2CH6A 4I6MB 4BRMA 5AZIA 3VEVA 5BRHA 2QWQA 4I6MA 4BRQA 1U2VB 2PBDA 1BOTO 3VEOA 1GLBG 1ZXOA 2IVPA 2FSJA 3ATUA 2UYTA 3MMVA 1D4XA 1Z05A 1JCEA 2P9PB 1QZ6A 3ENHA 2P9PA 3TPQA 5BN9A 4JAXA 1GLDG 4BC3A 3IFRA 1ATSA 2D0OA 4BR2A 3U4LA 3I33A 1NWKA 3O1WA 4BREA 3FZMA 3MCPA 3WQUA 3LDQA 2ZGZA 2Q1NA 2AP1A 3EKSA 1BDGA 2CGKA 2Q0RA 4CD1A 2PAVA 4YDUC 4B1XB 4FOIA 4CBUA 3WUHA 4JD2B 2NRHA 5ADXH 4XH5A 4JD2A 4CZGA 4K42A 3J8AA 4H0TB 3G25A 3MK6A 4CZJA 2P9NB 2YHYA 2A5XA 4BVPA 4QS8A 2P9NA 4M7YA 4CI6A 5AQHA 4XH1A 5AZJB 5AZJA 2E2NA 4FWMA 1DEJA 1T44A 2F9WA 1LCUA 3SK3A 4B1VA 5AQFA 1IJJA 3A5LC 3U9ZA 5BN8A 4HTLA 2YJEA 4BQLA 4J8FA 4BRCA 3H46O 2V7YA 4KBOA 3SJHA 3EZWA 2QWMA 1KAZA 2I7PA 5AQNA 3GBTA 5FPNA 5AQIA 1HKCA 4CZHA 4H0VB 3VF6A 4IWVA 4WQ4C 3D7EO 2QM1A 4H0OA 2BTFA 1X9JA 4BRIA 5LJVA 4B1WB 3DJCA 5BREA 4NO7A 3TU5A 1P8ZA 3B8AX 1HLUA 4BRHA 2HF4A 3CERA 3MN7A 3WT0A 4BRGA 1T6DA 1YAGA 2P9IB 3BF3A 3DAWA 3CJCA 1BO5O 2F9TA 2I7NA 4A2BA 4CZLA 1TUUA 1E4FT 1IG8A 1MDUB 1BA1A 4CBWA 5E84A 5AFUA 5I9EB 1GLCG 3LDNA 3CHWA 3R8EA 4B1YB 4B9QA 5AQRA 2QXLA 3D2EB 3D2EA 1EQYA 3S41A 4FWRA 5AQKA 5KPZA 4FWOA 1K8KB 3EN9A 1XQSC 3MN6A 1K8KA 3QBXA 2P9SB 1XC3A 3QFUA 5F2RA 2HF3A 2P9SA 3KZBA 1V4TA 2ITMA 1X3MA 3ZEUB 4MLHA 1GLFO 3ZEUA 4PL7A 1GLJO 3EKUA 4WQ5C 3ZETB 4CJ7A 4CZMA 3VPZA 3IUCA 2IVOA 2Q97A 3MN9A 3UB5A 3W0LA 3ZX2A 5BPNA 4M63C 1U2VA 2FSNA 2FSKA 5FPEA 1U6ZA 3FFKB 1YVNA 3FZFA 3VEZA 5EOYA 4HWIA 5AQUA 4FPAA 3L0QA 2YHWA 2A41A 4CZKA 2CGLA 3KVGA 1J6ZA 3CJ7A 4FPBA 4DB3A 3QDKA 5AQVA 4BGBA 4E1JA 4EIAA 2YCHA 1ZBSA 1HKGA 3LDOA 1DKGD 4PKHA 1C0FA 3HTVA 3A8YA 5AQZA 2E88A 1DGKN 1TYQB 4Y0WA 1TYQA 4QS7A 4QS9A 1SZ2A 3VF4A 2QWRA 2NZTA 3GG4A 5KQDA 3CJBA 4WQ5A 4O8KA 4MO4A 5AQPA 5AQGA 2EWSA 3L6QA 4Z94A 3CJAA 3HM8A 3SMPA 4A62A 4IJNA 1XUPO 2V51B 4BRAA 4BROA 2QWNA 5AR0A 4BRKA 3GOIA 5CE3A 3WXJA 1GLEG 4DCHA 1V4SA 1NGJA 1YXQA 2GWJA 1TUYA 2E8AA 5AQJA 2NLXA 3O80A 3OHRA 5BPLA 4BR5A 5AQLA 3W3DA 3BP8A 4BR7A 1ATRA 4CZFA 4BRNA 5KPTA 3QICA 3CQXA 2GWKA 4JHDB 3M3ZA 1C0GA 4JHDA 3CJ1A 3O4WA 2AA4A 5AQWA 4ISEA 5JICA 2ASPA 3QB0A 3H6EA 4H03B 2ZF5O 2A40A 4BRPA 3FGUA 4F9OA 3QMLA 4C23A 3R6MA 3HI0A 1H1VA 4LC9B 4BRLA 4FL9A 3D2FB 3VEWA 4FO0A 3D2FA 3C7NB 3C7NA 3QBWA 4B1ZA 3GDQA 3SLCA 3P4IA 3UKRB 1YUWA 2E1YA 4A2AA 3UKRA 4B1UB 2P9IA 4ISGA 3R9PA 3DWLA 2D0PA 3O1BA 3ZX0A 1G99A 4K43A 3A0IX 4FOEA 3C0BA 1T6CA 5BR9A 1ATNA 5EVZA 3M6GA 1HX1A 3VEYA 1QQMA 1BU6O 3VEXA 1JCGA 4BRDA 4BG9A 1NBWA 4RWTA 2A42A 1QHAA 2GELA 5AQSA 2ASOA 5EX5A 3WQTA 1X3NA 2FF6A 1Y64A 2W41A 4AM7A 4IZ9A 1RGIA 2IIRA 4CD3A 3O8MA 3LDPA 1KAYA 2VYPA 2E2OA 3ZETA 3AY9A 3JXUA 1BWFO 3LDLA 3CETA 5AFUH 2D4WA 3IDHA 4RCHA 2E1ZA 5EXWA 3RSEB 1BUPA 3RSEA 4O5FA 2FXUA 3VERA 4EHTA 4IJAA 5KQ8A 2E20A 1NM1A 4RTFD 5KPRA 1SQKA 4BC4A 1QQNA 5JMVA 4H5NA 1HJOA 4EFHA 4BC2A 2YHXA 4XH4A 3VF2A 5FPDA 3ATVA 3H1QA 2E2QA 5AQXA 1RFQA 2P9LB 2VWBA 2QW9A 3A5NC 3VESA 2P9LA 3VENA 1GLLO 5ADXA 1E4GT 1NGEA 4BVOA 4NB4A 3O5BA 4A61A 2FF3B 1MA9B 1HPMA 5AQMA 4H0PA 3DXKB 5BRFA 4H5VA 3GE1A 3DXKA 5EY4A 3H3NO 1HUXA 3FZHA 2WUSA 1NGDA 5BRDA 5B8HA 3VGKA 1GLAG 3A5MC 3ZX3A 3CQYA 3UKUB 2A3ZA 2QWOA 3UKUA 2YI1A 3A5OC 3SMSA 4MO5A 4BR9A 5F1XA 3H45C 3H3OB 3FLCO 2V52B 3KHYA 3MDQA 3L4IA 1R59O 4H5WA 1ESVA 1MWKA 2Q31A 2J4RA 5AQYA 3CJ9A 4GY2B 1NMDA 1JCFA 3GL1A 4L3QA 3BEXA 2A6AA 1BA0A 4IO8A 3WXIA 3U9DA 4CBXA 4ISFA 1WOQA 4M7XA 3VETA 3BUZB 1Z6RA 2Q0UA 3HBTA 4DQ8A 3AAQA 1NGIA 2H3GX 3FZKA 1NGCA 4PL8A 4EAHD 1S3XA 3O6WA 3U8XA 3WEEB 2YJFA 1KXPA 3WEEA 2QWPA 4BC5A 5AQOA 2DPNA 4WYBA 3F9MA 2ZWHA 2E2PA 1QQOA 4H5RA 4PKIA 5JLHA 5ELZA 5BPMA 4MLEA 5FPMA 2W40A 4BQZA 3H1VX 2BUPA 1RDWX 4H5TA 3JS6A 4BRFA 3EL2A 1ZC6A 4FWLA 4JNEA 4FWPA 3HZ6A 3LM2A 4CZEA 1Q18A 1OKJA 1WUAA 2HOEA 4YDUA 2GEMA 4IXCA 4GNIA 3ULEB 3FZLA 1MWMA 3ULEA 4BR0A 1NGFA 3WXLA 3UE5A 2CGJA 2GUPA 3VOVA 3FR0A 3MN5A 2ZGYA 3I8BA 1LOTB 4FSVA 4K41A 3QFPA 4BR4A 3M1FA 2GTDA 2P9KB 4AM6A 2P9KA 1NGBA 3VGLA 1S22A 1NLVA 3ENOA 1CZAN 2CH5A 3FE1A 4K25A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2QXFA 5F0XA 2QWLA 4WE1A 1WSJA 4I9QA 2V7ZA 3K9JA 4BG8A 3TSQA 3RRHA 2O8FB 2XY8A 1QVGM 3KK2A 4JI6K 2O8FA 4M41A 1LQIA 3AAPA 3MWTA 4DTPA 3C94A 4C8KA 2HVHA 3S9HA 1A5XA 5GADP 4FWQA 3CCEN 1QZ5A 3CIPA 5AQQA 4WFAL 1NGGA 4AQYK 2G8WA 1Y97A 3AARA 4EHUA 2RF2A 3HSCA 3LP0A 3EO3A 4KB1A 1ZBLA 5M1KA 4DUYK 3ZSVA 1HRHA 4I6MB 4BRMA 4Q5VA 4I6MA 2PBDA 1BOTO 4O8UA 2HBJA 1WSFA 4A5AA 3AVGA 2FSJA 3ATUA 1C55A 3MMVA 1Z05A 4CGIA 5M1FA 1L3SA 1N33K 4DR2K 4F3TA 4OKEA 4BE7B 3SBGA 4N41A 3IFRA 3ZT1A 5KK4A 3ZSXA 4KHUA 1N36K 1WSEA 4IG0A 3NH2A 1TAUA 3FZMA 2O4GA 5M1OA 2VG6A 5BR8K 4FJ9A 1BDGA 4R5PA 4JK9A 3QEVA 4B1XB 4FW1A 4FOIA 5CR4A 3S5TA 4JK8A 2LKBA 4CFAA 1SKRA 3AVNA 4OPHA 4K42A 1NKCA 3VQ7A 3G25A 4M3UA 1JKHA 3V9ZA 3MK6A 2QTDA 2YHYA 4BVPA 4O44A 5HL7L 1BL3A 2HHVA 1VQON 3CMEN 1VSEA 1T44A 5DMRA 1YTUA 1T7BA 5AQFA 1W7AA 3LDSA 3KHWA 4DV6K 3MXMA 1X9MA 3VQBA 4HTLA 3OYEA 5IWAK 3MEGA 2F4VK 4BRCA 3H46O 4XIUA 4KHPK 4DQIA 4KBOA 4W5OA 1VQMN 4CIFA 3MECA 4IKFA 1EXQA 3GBTA 5FPNA 3HYFA 3DOKA 4CEZA 4B3MK 4LFCK 4EZ6A 1LQHA 2YKMA 2I61A 4E7HA 3V1OA 3DJCA 4NCBA 3LP1A 3NGZA 1ZBHA 1P8ZA 3TWHA 5KGXA 3B8AX 1N6QA 4JS5A 4BRHA 3NMUA 3PIOL 3DOLA 4MDAA 3KOWA 1BCGA 1YAGA 2P9IB 3DAWA 4BWMA 2F9TA 2I7NA 4A2BA 2YHBA 1XRSB 2PYJA 1JLCA 1HNVA 1TUUA 1E4FT 1IG8A 5I9EB 4F8RA 4JK7A 4B1YB 1TI5A 3NF6A 3ZSZA 1JKZA 1EQYA 3IS9A 4WF9L 5AQKA 4X64K 5KPZA 4FWOA 3SF4D 1XQSC 3DLRA 3ITHA 3QBXA 2UUCK 3L2RA 3CM5A 3THYB 2R7YA 3QFUA 3THYA 3D6RA 4PY5A 3HK2A 1KLNA 3ZEUB 3ZEUA 1SKWA 4CF0A 3EKUA 4WQ5C 4CZMA 2VGNA 4Y1CA 4DV0K 1NOYA 3MAQA 3F73A 3KP1A 4DU1A 4FJJA 3UB5A 3W0LA 3WNGA 4DR6K 4M63C 2FSKA 1PE4A 1U6ZA 1YVNA 4B9SA 3FZFA 3VEZA 1IO2A 4HWIA 3P83D 4CJSA 1S1VA 1WBBA 4FPAA 3L0QA 4CZKA 3KVGA 1J6ZA 1WT7A 4FPBA 4CF2A 3RWUA 4DB3A 2D56A 3KLIA 4Z4IA 4BGBA 3ZYYX 4E1JA 4CGDA 4N47A 1IBMK 4O0JA 1VSJA 1HKGA 3LDOA 3HVTA 1JJ2M 4NYNA 2OYQA 1C0FA 3A8YA 5AQZA 1XMOK 4DTSA 2NRTA 2G8VA 5CY4A 2LY6A 5FDLA 3AA5X 3CJBA 3OYGA 2KZMA 1SL1A 1SS6A 1HNWK 2A1SA 3K0SA 1NK6A 3KLFA 4B9MA 3CJAA 3HM8A 1VNBA 2V51B 3ZT4A 1M90O 3WNEA 1I6GA 2VWKA 4XJXA 3WXJA 1Q81O 5D3GA 5SZTA 3SUPA 1LQQA 1UOCA 2E8AA 3OYLA 5BPLA 5AQLA 3BP8A 3MEEA 4CZFA 1IKWA 3QICA 3T7ZA 3TSPA 4JHDB 3M3ZA 3C95A 4JHDA 4DMNA 4LD0A 1NJWA 3VA3A 4K0KK 1FH3A 4H03B 3E1YA 1IBKK 4DS4A 4FLUA 4LF5K 1U4BA 2GMOA 3NF8A 4CECA 4FO0A 4FCYA 1NK8A 2HHXA 3MWPA 4RW7A 1CLQA 3C7NB 4DV7K 1FJGK 2HB5A 3L8BA 3C7NA 4ELUA 4CEAA 2YV0X 5FRMA 1YUWA 2ATQA 3R9PA 2D0PA 1QSSA 4KREA 1G99A 3GKUA 4FOEA 5BR9A 1ATNA 4FM2A 1VQ4N 1HX1A 2OTJN 3VEXA 4C8MA 4DTNA 4B08A 4BRDA 1SV5A 4E1NA 2D0CA 1LAWA 3O3HA 2HMIA 2UUAK 4BG9A 4J2DA 5HRPA 2GELA 3RRGA 2A1RA 2A7TA 1ZYQA 2FF6A 1Y64A 5CYMA 4AHUA 4IZ9A 3LPTA 5C0YA 3O8MA 5M1NA 4B3RK 1W97L 4LF4K 3VQAA 3AVKA 5GAEP 4DFMA 4UAFE 4KKOA 4DR3K 4JI7K 2C1GA 3OYMA 4CK3A 3CETA 3MXIA 4MQ3A 1O1WA 2D4WA 3G71N 4IOCL 2FBYA 4JKAA 4KI4A 4M3YA 1K9MO 4FJXA 2FXUA 3PO5A 3IAYA 2ETJA 3VERA 3P1GA 4EHTA 5KQ8A 2E20A 5KPRA 1SQKA 4HTUA 4BC4A 4DTRA 1JLGA 5JMVA 2G8HA 2G2KA 4DG1A 4DQQA 3ATVA 5A2QO 5AQXA 1CHZA 2FC0A 3S3OA 2IS3A 4DLEA 2VWBA 3R3LA 1E4GT 4O0IA 5DK5A 4FVUA 3BY5A 3CCUN 5AQMA 3SZ2A 3KP0A 5EY4A 4IDKA 3FZHA 2JGUA 2E0HA 5B8HA 1LWCA 3VMFB 2QWOA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 3CHW A;  3R8E A;  4B1Y B;  4B9Q A;  5AQR A;  2QXL A;  3D2E B;  3D2E A;  1EQY A;  3S41 A;  4FWR A;  5AQK A;  5KPZ A;  4FWO A;  1K8K B;  3EN9 A;  1XQS C;  3MN6 A;  1K8K A;  3QBX A;  2P9S B;  1XC3 A;  3QFU A;  5F2R A;  2HF3 A;  2P9S A;  3KZB A;  1V4T A;  2ITM A;  1X3M A;  3ZEU B;  4MLH A;  1GLF O;  3ZEU A;  4PL7 A;  1GLJ O;  3EKU A;  4WQ5 C;  3ZET B;  4CJ7 A;  4CZM A;  3VPZ A;  3IUC A;  2IVO A;  2Q97 A;  3MN9 A;  3UB5 A;  3W0L A;  3ZX2 A;  5BPN A;  4M63 C;  1U2V A;  2FSN A;  2FSK A;  5FPE A;  1U6Z A;  3FFK B;  1YVN A;  3FZF A;  3VEZ A;  5EOY A;  4HWI A;  5AQU A;  4FPA A;  3L0Q A;  2YHW A;  2A41 A;  4CZK A;  2CGL A;  3KVG A;  1J6Z A;  3CJ7 A;  4FPB A;  4DB3 A;  3QDK A;  5AQV A;  4BGB A;  4E1J A;  4EIA A;  2YCH A;  1ZBS A;  1HKG A;  3LDO A;  1DKG D;  4PKH A;  1C0F A;  3HTV A;  3A8Y A;  5AQZ A;  2E88 A;  1DGK N;  1TYQ B;  4Y0W A;  1TYQ A;  4QS7 A;  4QS9 A;  1SZ2 A;  3VF4 A;  2QWR A;  2NZT A;  3GG4 A;  5KQD A;  3CJB A;  4WQ5 A;  4O8K A;  4MO4 A;  5AQP A;  5AQG A;  2EWS A;  3L6Q A;  4Z94 A;  3CJA A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2QXF A;  5F0X A;  2QWL A;  4WE1 A;  1WSJ A;  4I9Q A;  2V7Z A;  3K9J A;  4BG8 A;  3TSQ A;  3RRH A;  2O8F B;  2XY8 A;  1QVG M;  3KK2 A;  4JI6 K;  2O8F A;  4M41 A;  1LQI A;  3AAP A;  3MWT A;  4DTP A;  3C94 A;  4C8K A;  2HVH A;  3S9H A;  1A5X A;  5GAD P;  4FWQ A;  3CCE N;  1QZ5 A;  3CIP A;  5AQQ A;  4WFA L;  1NGG A;  4AQY K;  2G8W A;  1Y97 A;  3AAR A;  4EHU A;  2RF2 A;  3HSC A;  3LP0 A;  3EO3 A;  4KB1 A;  1ZBL A;  5M1K A;  4DUY K;  3ZSV A;  1HRH A;  4I6M B;  4BRM A;  4Q5V A;  4I6M A;  2PBD A;  1BOT O;  4O8U A;  2HBJ A;  1WSF A;  4A5A A;  3AVG A;  2FSJ A;  3ATU A;  1C55 A;  3MMV A;  1Z05 A;  4CGI A;  5M1F A;  1L3S A;  1N33 K;  4DR2 K;  4F3T A;  4OKE A;  4BE7 B;  3SBG A;  4N41 A;  3IFR A;  3ZT1 A;  5KK4 A;  3ZSX A;  4KHU A;  1N36 K;  1WSE A;  4IG0 A;  3NH2 A;  1TAU A;  3FZM A;  2O4G A;  5M1O A;  2VG6 A;  5BR8 K;  4FJ9 A;  1BDG A;  4R5P A;  4JK9 A;  3QEV A;  4B1X B;  4FW1 A;  4FOI A;  5CR4 A;  3S5T A;  4JK8 A;  2LKB A;  4CFA A;  1SKR A;  3AVN A;  4OPH A;  4K42 A;  1NKC A;  3VQ7 A;  3G25 A;  4M3U A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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