5AQSA

Fragment-based screening of hsp70 sheds light on the functional role of atp-binding site residues
Total Genus 119
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
119
sequence length
382
structure length
382
Chain Sequence
SMSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title A fragment-based approach applied to a highly flexible target: Insights and challenges towards the inhibition of HSP70 isoforms.
pubmed doi rcsb
molecule keywords HEAT SHOCK COGNATE 71 KDA PROTEIN
molecule tags Chaperone
source organism Homo sapiens
total genus 119
structure length 382
sequence length 382
chains with identical sequence C
ec nomenclature ec 3.6.3.51: Transferred entry: 7.4.2.3.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5aqsA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqsA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqsA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5aqsA04
4A62A 1MDUB 1ESVA 2GEMA 4BC3A 5EVZA 3QBWA 1GLLO 3DXMA 3OHRA 2W40A 5AZIB 4K43A 4KBOA 1TYQB 2V7ZA 1OKJA 5JLFA 3VEVA 1BDGA 5LJWA 5AQMA 1BO5O 2QW9A 3O80A 1NGJA 4Y0WA 2QWRA 2QXLA 5KPZA 3UKUB 1NBWA 1HKBA 2QM1A 2FF6A 2PAVA 4H0VB 3H1VX 3HZ6A 2GWKA 4K42A 4CZHA 2E8AA 3FE1A 1NM1A 1K8KB 4MLEA 2ITMA 4BRGA 2P9IA 4BRHA 3SMSA 4A2BA 2E2QA 4M7XA 4BRAA 1YAGA 2W41A 2V51B 4FO0A 1X9JA 5B8HA 4BRQA 1E4FT 3CERA 3L0QA 2YHXA 2ASPA 3ZEUB 4CZJA 3WEEA 4BRFA 4IZ9A 2YI1A 5CE3A 3ZETA 2AA4A 1ZXOA 4BRPA 4H0XB 4FWSA 2FXUA 4I6MA 3UKRA 3KHYA 5BPLA 2NRHA 3LDOA 3O1WA 3R9PA 3QFUA 2Q2RA 1QQMA 1ATRA 2A5XA 3R8EA 3LL3A 4B1VA 2HMPA 2HF4A 4AM7A 3DXKA 5AQUA 1YUWA 3MK6A 4JHDA 4FOIA 3A5MC 2HOEA 4BGAA 3GBTA 1Q18A 1CZAN 1LCUA 4CZEA 2EWSA 2OANA 1NGCA 5F1XA 3DAWA 5KPRA 1G99A 5AQWA 1XQSC 3A8YA 4CBUA 2Q97A 1JCFA 3WUHA 1HKCA 3C7NB 3R6MA 5EXWA 2P9UB 4BRNA 5AQNA 4YDUA 2VYPA 4PL7A 1QQOA 2HF3A 3KVGA 3S41A 3L4IA 3UB5A 4WQ5A 3FZKA 3VGMA 4WQ5C 2A3ZA 1XUPO 3A5LC 4BQZA 5BRFA 4CJ7A 3VEWA 3ENHA 5AQGA 3DXMB 3W3DA 3L6QA 4RCHA 3KZBA 2KHOA 2Q31A 4FL9A 4BREA 2YHWA 1GLJO 1KAZA 3CIPA 3QICA 2J4RA 3HSCA 5AQTA 4FWPA 4PKIA 1XC3A 4IJNA 3WXKA 3CJBA 3EN9A 4XH1A 2I7NA 3VGLA 1BA0A 5F0XA 4H0PA 4CZIA 1Z05A 1HPMA 4CZLA 4H5WA 5AR0A 1MWMA 3VEYA 4IO8A 4EAHD 1R59O 4H5RA 4LC9B 4CD3A 1QHAA 5JMVA 5AQSA 3RSEA 3G25A 1BOTO 3FZFA 1J6ZA 2ZF5O 4BR0A 2F9WA 2FSKA 4E1JA 1EQYA 5AQFA 1YVNA 4FWOA 2A41A 3U9DA 2NZTA 3BF1A 4FSVA 2F9TA 3WXJA 1KXPA 3J8AA 5AQQA 3BUZB 4CD1A 1BWFO 3WEEB 2D0OA 2QWMA 3VERA 4BR4A 4WQ4A 4I6MB 3UKRB 3HI0A 4WQ4C 4B1XB 3ATUA 2Q0RA 1H1VA 4BQLA 2VCPA 2GUPA 3WT0A 2QWPA 5F2RA 3MN6A 3JXUA 3DXKB 3A5NC 4EFHA 3VEXA 1NMDA 2ZGZA 2ASOA 5BN8A 5ADXH 5AQLA 3EZWA 4JHDB 5ADXA 3AAQA 5KQ8A 4B1ZA 3SLCA 2BTFA 1NGFA 3FZLA 5AQHA 5EOYA 5I9EB 2ZGYA 1BA1A 2I7PA 5BPNA 4IWVA 3ULEA 3VF4A 4DCHA 4H5NA 1HJOA 4JAXA 5AFUH 2E2NA 1V4SA 1LOTB 5AFUA 3SK3A 2FF3B 2ZWHA 4BRLA 3LDPA 3MN5A 4FWQA 1NGEA 1T6DA 1WUAA 5LJVA 2YHYA 3FZMA 3H3OB 3QDKA 5AZJA 4XH4A 3O6WA 4A2AA 2CGKA 3GDQA 3IFRA 2P9LA 1QZ6A 5AQVA 2GELA 4BC4A 3MN9A 4MO5A 4BC5A 2UYTA 2P9NA 3GE1A 5BR9A 4H0TB 1HKGA 3IUCA 4BC2A 2ASMA 5BRHA 4JN4A 5AQJA 1Z6RA 1HX1A 4FWLA 5FPNA 2E88A 1ZC6A 2NLXA 1NGDA 1NGGA 1MWKA 5FPDA 5AQPA 1U2VB 3ATVA 4JD2A 3FFKB 1NLVA 2QWNA 3EO3A 3FZHA 1V4TA 2WUSA 4GY2B 3WXLA 3TPQA 4FWKA 3UKUA 1D4XA 4ISFA 2AP1A 3C0BA 5BREA 5AQIA 3F9MA 3FR0A 1BU6O 4K41A 3VEZA 1S3XA 1JCEA 1NWKA 2PBDA 1ATNA 1Y64A 3JS6A 2Q36A 4O5FA 1K8KA 1TUUA 3CHWA 3H6EA 3ENOA 4B1YB 3MDQA 4EHTA 5AQZA 5FPMA 3EL2A 4BR5A 4XH5A 2BUPA 5BN9A 4B1UB 3I8BA 3AARA 4H0YB 4CI6A 3ZEUA 4ISEA 4EHUA 3VF6A 3CJAA 4HTLA 3WQUA 1GLCG 4BRKA 5FPEA 3H46O 5KQDA 4CZKA 3EKUA 1WOQA 5AQRA 3QMLA 2P9SA 2YJFA 3CETA 3D2EA 4FWRA 5EX5A 1SAZA 3BEXA 4BVPA 2P9IB 3ULEB 4H03B 3U4LA 3SJHA 1RGIA 1SZ2A 3ZX2A 4QS7A 1MA9B 3DJCA 3FGUA 3CQXA 1BG3A 4FPBA 3CJ9A 1E4GT 2FSNA 1X3MA 4FWNA 1GLBG 1NGHA 5AZJB 1U6ZA 4RTFD 3ZETB 3D7EO 5BRDA 3QBXA 1HLUA 1KAYA 2P9LB 4B1WB 3QB0A 1NGIA 3VENA 3W0LA 1HUXA 3CJ7A 4J8FA 3ZX3A 1NGAA 4QS8A 3D2FA 3H45C 3QFPA 4AM6A 4BR7A 3IMXA 4B9QA 4BG9A 4JD2B 2P9KA 1S22A 3CJCA 5BPMA 2QWOA 2P9PA 4ISGA 3H3NO 4Z94A 1C0GA 3HBTA 5EY4A 4L3QA 1IJJA 2D1KA 4O8KA 2V52B 4QS9A 1GLFO 4WYBA 2D4WA 1NGBA 2CGLA 3GG4A 2VWBA 3U9ZA 4CBWA 5TKYA 2GWJA 5AQXA 5KPTA 3MN7A 3VOVA 4IJAA 4CZMA 4CZGA 3CJ1A 3BP8A 2E20A 4FWMA 2E1ZA 2QWQA 3VPZA 2D0PA 1DKGD 1DGKN 3B8AX 1KAXA 4HWIA 1DEJA 3BF3A 3HTVA 2GTDA 3M3ZA 4BGBA 4PL8A 3A5OC 3WQTA 5AZIA 2IIRA 1TYQA 3MCPA 4H0OA 4DQ8A 2E1YA 2IVOA 2E2PA 2P9SB 4BRMA 5E84A 3D2EB 3RSEB 4K25A 1C0FA 2V7YA 2IVPA 1GLEG 5ELZA 4H5VA 4MO4A 3UE5A 3EKSA 3O1BA 4M63C 4DB3A 1GLAG 3MMVA 3HM8A 2CH6A 5JLHA 4CBXA 2QWLA 2E2OA 4BR2A 4XEIA 3VEOA 3GL1A 3LM9A 5AQYA 3LM2A 3FLCO 1GLDG 1T6CA 3WXIA 1TUYA 3TU5A 4FPAA 2A42A 2CH5A 3VESA 2CGJA 3O08A 3O5BA 4RWTA 4BG8A 4C23A 1P8ZA 2YJEA 5E26A 4EIAA 4BVOA 4NB4A 3VETA 4BRDA 3P4IA 4YDUC 2FLOA 3D2FB 4IXCA 3VF2A 5AQOA 1JCGA 3SMPA 4DHYA 1QZ5A 2YCHA 3M6GA 4H5TA 5JICA 3CQYA 4PKHA 4PKGA 4CZFA 5LY3A 4BR9A 3DWLA 1SQKA 2P9KB 2P9PB 4NO7A 2IVNA 3LDLA 3O4WA 1ZBSA 2H3GX 3GOIA 3LDQA 4M7YA 1RDWX 1ATSA 1QQNA 3H1QA 1RFQA 1IG8A 3U8XA 3ZX0A 1YXQA 2FSJA 1U2VA 3IDHA 4BRIA 4A61A 4BROA 3O8MA 2A6AA 3VGKA 3AAPA 1T44A 1BUPA 3M1FA 4F9OA 4MLHA 3AY9A 2Q1NA 3A0IX 3C7NA 4GNIA 5AQKA 2P9NB 2P9UA 4BRCA 4FOEA 2DPNA 3CI5A 3ID8A 1X3NA 4JNEA 2Q0UA 2A40A 3I33A 3LDNA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3E01A 1WNSA 3PX6A 1M1KO 3QBWA 3IRXA 3OHRA 1YIJN 5AZIB 4B3MK 2V7ZA 1OKJA 1HNXK 2XY5A 2LY6A 1BISA 1L3SA 3AA4A 1ZBUA 5AQMA 4PA1A 4LSNA 3C6UA 4JKBA 2QWRA 2NY8X 4JKHA 3PY8A 4RW6A 3UKUB 2VY6A 3LALA 1NBWA 5KK4A 2D0AA 4EZ9A 1VRUA 4H0VB 4LF9K 3AO3A 3RMAA 3G4SN 4CZHA 1PTXA 3FE1A 4F4KA 4BRGA 1ZYQA 4CEBA 2E2QA 1TKZA 4DSKA 4KTZA 1OH8A 4ILJA 3AVBA 1ZBLA 4HUEA 5C42A 3ZEUB 2N2RA 4C8KA 1DLOA 2YI1A 4CJRA 3ZETA 3LWLA 3VQ5A 4FWSA 2KPYA 2FXUA 4AHUA 4KI4A 5BPLA 4DFJA 3LDOA 2D56A 4PY5A 2HMPA 4KFBA 2OZSA 4JEPA 3KWGA 4JHDA 2Z1IA 2JLEA 5A2QO 4KHNA 1P00A 5GAHP 1VK0A 3JSMA 3ZT3A 1PX9A 3V9UA 1NGCA 4IEIA 3DLBA 4C8OA 2YILA 3HM9A 3VMFB 4Z4GA 4JK9A 1Z26A 4IBNA 4WCEL 4M3XA 4BRNA 1U04A 5JVGL 2W42A 2P51A 1VQ8N 3VGMA 3UB5A 5M1KA 1KVBA 3E1YA 2KQ2A 3VEWA 1CHZA 3RMCA 3L6QA 4Z0UA 4CJWA 2Q31A 1GLJO 5KRSA 1OVQA 3QICA 3CCUN 2J4RA 1JLFA 3ULDA 4PKIA 2RHKA 1XC3A 1I6GA 1VQ9N 4FM0A 3WXKA 3CJBA 3AVCA 3EN9A 3P38A 3HVTA 1Z05A 1HPMA 4H5WA 4EAHD 1YTUA 4GV9A 4LC9B 1TI5A 1YITN 4CD3A 3DI6A 5JMVA 3RSEA 3BZKA 1BOTO 1S5JA 1J6ZA 1J5EK 3E7RL 3PSMA 3J7ZO 3ZSZA 5AQFA 2A41A 4DU4A 3ZSVA 1K8AO 3DLRA 4O0IA 4FSVA 1FXXA 4OPKA 2HMIA 5SWMA 4CD1A 3T1YK 1N33K 1T05A 4CJ4A 1NK6A 3WNGA 3LAMA 1VNAA 4WF9L 4FVMA 4C8MA 4BR4A 4LF8K 2Z1HA 4OPHA 3LP0A 3OYIA 1NK0A 3MN6A 3QNOA 1CZ9A 4YOYA 2MBKA 4DTXA 2X6NA 2ZGZA 2GL1A 4JHDB 3AAQA 1JLGA 3CFRA 4AHSA 3NBPA 1WSJA 4MDBA 5LMUK 5I9EB 1RBUA 1TL3A 3OS1A 4E89A 3VF4A 3MAQA 4DCHA 3TAMA 1HJOA 3PX4A 1XNQK 5AFUH 3L2VA 2FF3B 3AVMA 1SL1A 4YORA 1SUQA 4FWQA 1WUAA 4YOXA 1X9MA 4DR7K 4H8KA 3FZMA 4J2DA 2ZJPL 4A2AA 3NF6A 2CGKA 1RT2A 3CCJN 2HHQA 3IFRA 1WWNA 2IDOA 4BC4A 3MN9A 3AVFA 4MO5A 4NCBA 3H08A 4H0TB 3P5JA 1WN7A 4CHNA 4CK3A 4LFCK 5AQJA 3DMJA 1NRAA 1Z6RA 5HLFA 1J53A 1ZU3A 2E88A 1C56A 1ZC6A 3KC6A 2NLXA 1NGGA 2NRXA 3AVKA 3ZCMA 3ATVA 4JI7K 1SL2A 3P1GA 1RBSA 3TSPA 3SV3A 4DQSA 1NLVA 4O0JA 3KWIA 3JAMO 2QWNA 3EO3A 3FZHA 4NCGA 1N34K 3WXLA 3DRRA 3TPQA 1D4XA 3LPTA 3AGRA 4ISFA 5EU7A 1VSIA 4CJ5A 3VEZA 4Y1CA 2QKBA 1EKEA 3RR7A 5TKWA 1NWKA 2D0CA 2WOMA 1ATNA 3JS6A 2Q36A 2E5LK 3CHWA 2ZQBA 3AVIA 4EHTA 1NH5A 3C6TA 5AQZA 1U47A 5D3GA 4V1DC 4BR5A 4DLEA 2BUPA 2D0BA 1W2BM 3AARA 4CERA 4BDZA 4DR1K 1VRTA 3VF6A 2HNZA 2N66A 4BRKA 2G8VA 4CZKA 3EKUA 3U3YA 2QA4N 2P9SA 2BANA 3CETA 2G8HA 1TGOA 4J2BA 4CJFA 3BEXA 4CEEA 3BK3C 4H03B 2N2QA 3U4LA 2ZM6K 1HQEA 3E66A 1DJTA 1BGXT 3ZX2A 4PWDA 4QS7A 5IWAK 1LQQA 2HHVA 3CQXA 1SKRA 1BG3A 1S9GA 3O3GA 3C95A 1RDDA 4OPAA 3D7EO 1L3TA 1KAYA 2B3CA 3HPHA 2HBKA 4LFAK 3AGKA 3CM6A 5C0YA 2AJQA 2RE2A 3VENA 1NJWA 2F8TA 1OVYA 3ITHA 4NLBA 1RT7A 4DTJA 1WBBA 1NGAA 3OYFA 2EHGA 3O3FA 1YJ9N 4AM6A 4FW2A 4AHTA 2NRRA 4R5PA 4CJTA 5HRRA 2Q3SA 2P9KA 1M90O 1S22A 4ELTA 2P9PA 2QWOA 3F2KA 4ISGA 4Z94A 5KGXA 1C0UA 4CJ3A 5EY4A 4L3QA 2WTUA 1J5OA 3S3MA 4IG3A 4BWJA 4JI6K 2W00A 4O8KA 1VSEA 1BK8A 3V1RA 3QNNA 1A5VA 3THWA 3NF7A 3AO4A 1DTQA 3QEXA 1NGBA 2VWBA 4PUOA 5FDLA 2OCEA 2GWJA 2YNIA 2JGUA 3SAHA 1U48A 1HR0K 3VOVA 4U67L 3CJ1A 3BP8A 2E20A 3ZSQA 4DV2K 2QWQA 4Z4IA 5AJ3K 3T69A 1DGKN 1DEJA 2ETJA 1XWLA 3BF3A 4B9TA 2YKNA 4RW7A 2KLAA 3L4QA 2IIRA 3MCPA 4H0OA 4DQ8A 5CZ2A 2E1YA 2IVOA 2E2PA 2P9SB 1SNBA 1X9SA 4K25A 3UE5A 1VSHA 2OPRA 2YNFA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3E01 A;  1WNS A;  3PX6 A;  1M1K O;  3QBW A;  3IRX A;  3OHR A;  1YIJ N;  5AZI B;  4B3M K;  2V7Z A;  1OKJ A;  1HNX K;  2XY5 A;  2LY6 A;  1BIS A;  1L3S A;  3AA4 A;  1ZBU A;  5AQM A;  4PA1 A;  4LSN A;  3C6U A;  4JKB A;  2QWR A;  2NY8 X;  4JKH A;  3PY8 A;  4RW6 A;  3UKU B;  2VY6 A;  3LAL A;  1NBW A;  5KK4 A;  2D0A A;  4EZ9 A;  1VRU A;  4H0V B;  4LF9 K;  3AO3 A;  3RMA A;  3G4S N;  4CZH A;  1PTX A;  3FE1 A;  4F4K A;  4BRG A;  1ZYQ A;  4CEB A;  2E2Q A;  1TKZ A;  4DSK A;  4KTZ A;  1OH8 A;  4ILJ A;  3AVB A;  1ZBL A;  4HUE A;  5C42 A;  3ZEU B;  2N2R A;  4C8K A;  1DLO A;  2YI1 A;  4CJR A;  3ZET A;  3LWL A;  3VQ5 A;  4FWS A;  2KPY A;  2FXU A;  4AHU A;  4KI4 A;  5BPL A;  4DFJ A;  3LDO A;  2D56 A;  4PY5 A;  2HMP A;  4KFB A;  2OZS A;  4JEP A;  3KWG A;  4JHD A;  2Z1I A;  2JLE A;  5A2Q O;  4KHN A;  1P00 A;  5GAH P;  1VK0 A;  3JSM A;  3ZT3 A;  1PX9 A;  3V9U A;  1NGC A;  4IEI A;  3DLB A;  4C8O A;  2YIL A;  3HM9 A;  3VMF B;  4Z4G A;  4JK9 A;  1Z26 A;  4IBN A;  4WCE L;  4M3X A;  4BRN A;  1U04 A;  5JVG L;  2W42 A; 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