5AQSA

Fragment-based screening of hsp70 sheds light on the functional role of atp-binding site residues
Total Genus 119
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
119
sequence length
382
structure length
382
Chain Sequence
SMSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title A fragment-based approach applied to a highly flexible target: Insights and challenges towards the inhibition of HSP70 isoforms.
pubmed doi rcsb
molecule keywords HEAT SHOCK COGNATE 71 KDA PROTEIN
molecule tags Chaperone
source organism Homo sapiens
total genus 119
structure length 382
sequence length 382
chains with identical sequence C
ec nomenclature ec 3.6.3.51: Transferred entry: 7.4.2.3.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5aqsA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqsA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqsA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5aqsA04
2ASOA 4FWSA 3VEOA 1NGDA 2GTDA 2ZGYA 2I7NA 3W3DA 4M7XA 1BG3A 3H3OB 2IVNA 5AZJA 5KPRA 4RWTA 3O1WA 3JXUA 1OKJA 4BVOA 1YVNA 2P9UA 2V7ZA 4BRPA 3BUZB 4B1VA 3CJBA 2ZF5O 5AFUH 3DXMA 3LDQA 3IMXA 1LOTB 3QFUA 5AQQA 4YDUC 3DXKB 4NB4A 2P9IA 1BUPA 4JN4A 4JD2B 2P9KA 4MLHA 4H0TB 2QWNA 3M3ZA 3ID8A 3WXKA 4CZIA 4H5TA 1NWKA 1BA0A 3QBXA 3LDPA 1MDUB 2UYTA 2E8AA 1XUPO 2IVOA 1T6CA 4JHDB 4EHTA 4BG8A 3SJHA 4CZGA 3ULEB 3I33A 3H1VX 3WT0A 3A5LC 1J6ZA 4IZ9A 4IWVA 1U2VB 3U8XA 4CZHA 4FWOA 2YJEA 2V52B 1NGAA 2FSJA 1X9JA 1Y64A 2Q1NA 3CJAA 5E26A 3O4WA 4K41A 3U9ZA 1SAZA 1GLFO 2Q97A 3VETA 1TYQB 5AQLA 3M1FA 3LM9A 3SMSA 1QQOA 1KXPA 1RDWX 2ITMA 3QMLA 5AQSA 4K25A 1D4XA 5FPDA 2AP1A 4BR4A 3O08A 1BWFO 1V4SA 1C0FA 2P9SA 3MMVA 5AZIB 5AQRA 4GNIA 3FLCO 5AQGA 3U4LA 1E4GT 5AQYA 2QW9A 3AARA 4WQ5C 3CQYA 2VWBA 5KQDA 4RCHA 3L6QA 1HKCA 5AZJB 3ZX0A 4QS9A 4BGAA 3CJCA 5EOYA 4MO5A 3MCPA 2QWPA 4H0PA 4MO4A 3BF3A 2CH5A 5AQZA 2P9UB 4EAHD 4H0YB 5AQJA 2CH6A 3SLCA 5F2RA 4NO7A 4EIAA 4K42A 3D7EO 4FWKA 4CZEA 4BRLA 1GLJO 1WUAA 4E1JA 4CZFA 3ZEUA 4BR7A 5KPTA 3RSEA 2QWOA 1XC3A 2W41A 3CJ9A 3MN6A 4BRAA 1NMDA 3DWLA 1S22A 4JNEA 3CERA 3VEXA 3WQUA 3O5BA 4BGBA 4BRMA 1GLLO 3AAPA 4IJNA 4XEIA 1SZ2A 4KBOA 5AQPA 3VEZA 3UKRB 1ZC6A 4BR0A 4BROA 4QS8A 3FZMA 3VPZA 1T6DA 3O1BA 3MN7A 2GWJA 3ZETA 2ASPA 4PL8A 1X3NA 3FZLA 5F1XA 1JCGA 1QQNA 3A0IX 1QHAA 3UB5A 4BQLA 1C0GA 3VGLA 2YI1A 2P9PA 4JAXA 4H5NA 2E1YA 2E20A 5LY3A 2IIRA 4BRHA 1DKGD 1XQSC 2A42A 1BOTO 1IJJA 1GLCG 4CD3A 5CE3A 2YHWA 2CGJA 4DHYA 5AQUA 4XH5A 3CJ1A 3FFKB 3R8EA 2P9SB 3MK6A 3SMPA 2NZTA 2V51B 2ZWHA 2DPNA 3M6GA 3WQTA 3CHWA 3R6MA 4H03B 1YUWA 3VEVA 2YHXA 3D2EA 3H46O 5F0XA 4A61A 4EHUA 1X3MA 2FXUA 4BG9A 2FF3B 5AQWA 3GE1A 5JLHA 2VCPA 1QZ6A 5BR9A 2WUSA 3VENA 3O80A 4PKGA 3H1QA 1K8KB 4CI6A 1LCUA 1QZ5A 5AQHA 3W0LA 3WEEA 4DQ8A 2E1ZA 5EVZA 5KQ8A 1Z05A 3R9PA 3VF4A 2BTFA 2A40A 2D0PA 2GELA 3CI5A 4YDUA 2P9NA 3O6WA 5AQXA 5BREA 3QFPA 2Q0UA 3LM2A 3ZEUB 1MWMA 3H3NO 4H0XB 1TUYA 1KAXA 3CETA 3L4IA 4H0OA 4BR5A 3UKUA 5LJWA 3FGUA 5EXWA 1H1VA 4BC5A 1BA1A 3ZX3A 2CGLA 3H6EA 4A62A 4WQ4C 2J4RA 1P8ZA 2E88A 3EKSA 1HKBA 5AQOA 1T44A 5ADXH 3IUCA 5EX5A 1ZXOA 3QB0A 3VERA 2VYPA 4HTLA 2H3GX 2QWLA 2NRHA 1EQYA 4H5WA 2P9LA 3UE5A 3VOVA 4BRDA 2P9PB 3HM8A 2Q31A 2FLOA 3WUHA 3ENHA 5BRDA 1TUUA 2Q0RA 2YCHA 5BN8A 5AQMA 1QQMA 1HUXA 5B8HA 4GY2B 5AR0A 3EN9A 2ZGZA 2E2QA 2A6AA 1GLDG 3HZ6A 4BC2A 4BRQA 2AA4A 3A5NC 2HOEA 3DXMB 4FPAA 1NGIA 1HKGA 2I7PA 1YAGA 2A41A 2P9IB 4FO0A 4DB3A 3TU5A 1G99A 2P9KB 1HJOA 3EO3A 4LC9B 1MA9B 3BF1A 5ELZA 1ZBSA 5FPMA 5FPEA 3CJ7A 3D2EB 4IXCA 1WOQA 3EKUA 2A3ZA 4WQ5A 2D1KA 3J8AA 4AM6A 4Z94A 4A2AA 4BQZA 1SQKA 3AAQA 3S41A 1NBWA 3AY9A 2GWKA 4AM7A 1JCFA 5BN9A 1HLUA 2E2NA 4FWNA 1KAZA 4I6MA 4F9OA 1NGEA 3C7NA 2V7YA 2QXLA 1BDGA 2D0OA 2FSNA 3IFRA 4H5RA 4DCHA 2ASMA 3FZHA 4O5FA 4EFHA 1NGHA 3HI0A 1RGIA 1U6ZA 4Y0WA 1E4FT 1Q18A 1NGFA 1BO5O 4ISGA 5I9EB 1MWKA 2EWSA 3B8AX 3GL1A 5JLFA 4PKHA 4H0VB 3UKUB 4XH1A 2NLXA 5AQKA 1GLEG 2QWRA 5LJVA 3WXIA 4BC4A 4FOIA 1DGKN 4QS7A 4BREA 5AFUA 3FZKA 3ATUA 4FSVA 4BC3A 2F9WA 3U9DA 4CD1A 4FOEA 5AQVA 4M63C 2E2OA 3DAWA 1ATRA 4B9QA 3KVGA 1JCEA 4C23A 3GG4A 4BR2A 2P9LB 4B1WB 3F9MA 2HF4A 3BEXA 4BR9A 4FWRA 3VF2A 4CZJA 1NGCA 5BPNA 4FWMA 3WXJA 4XH4A 2GEMA 3SK3A 3GDQA 3C0BA 5E84A 1IG8A 1ATNA 2QWMA 2KHOA 3QICA 3EL2A 3FE1A 1KAYA 4CJ7A 3L0QA 4B1ZA 4B1XB 4IO8A 3JS6A 3WXLA 3KZBA 3TPQA 3RSEB 3UKRA 4H5VA 2F9TA 4BRNA 5AQTA 2Q36A 4BRKA 3IDHA 3D2FA 1NLVA 1ESVA 5KPZA 2D4WA 3CQXA 2YHYA 3FR0A 3MN5A 3VGMA 1NM1A 1HPMA 5BRFA 3ZETB 4CBXA 5ADXA 3A5OC 5AQFA 2FSKA 5TKYA 2YJFA 3ZX2A 1BU6O 3MDQA 4I6MB 3FZFA 3O8MA 3C7NB 4B1UB 2HMPA 4FPBA 5BPLA 1R59O 1NGBA 3HBTA 4J8FA 4K43A 3A5MC 1HX1A 1CZAN 3BP8A 4BRIA 3DXKA 5JICA 4JD2A 4CBWA 1ATSA 3OHRA 3G25A 1YXQA 4MLEA 2PBDA 4FWPA 4M7YA 3QDKA 4FWQA 2FF6A 3KHYA 2PAVA 3DJCA 2OANA 3H45C 2IVPA 4CZKA 4JHDA 4WQ4A 5JMVA 1RFQA 2QWQA 3I8BA 1Z6RA 3ULEA 3VF6A 2GUPA 4L3QA 5BPMA 4PKIA 4CBUA 1U2VA 1K8KA 4HWIA 2Q2RA 1S3XA 3ENOA 4A2BA 3LDLA 3CIPA 3ATVA 5BRHA 4O8KA 2E2PA 3MN9A 2W40A 4WYBA 4FWLA 3LDNA 3GOIA 3LDOA 5AQIA 1DEJA 2A5XA 4FL9A 3LL3A 4BRGA 4ISFA 3EZWA 3GBTA 4BRFA 1TYQA 3HSCA 3WEEB 4RTFD 1GLAG 2QM1A 4B1YB 4CZMA 3A8YA 4BRCA 3VGKA 3HTVA 2P9NB 2HF3A 4BVPA 4CZLA 1GLBG 3VEYA 1NGGA 1V4TA 3P4IA 5AZIA 2BUPA 1NGJA 5FPNA 4PL7A 2CGKA 5EY4A 3QBWA 4ISEA 3VESA 3D2FB 3VEWA 5AQNA 4IJAA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3OYNA 3W3DA 3K5NA 3SQ0A 4O55A 3H3OB 5AZJA 2NY8X 1RBTA 3RMCA 3O9QA 3V4IA 3O1WA 4FLTA 1QVFM 1OKJA 1YVNA 4PQUA 4JI8K 5HP1A 2ZF5O 3BY5A 4FJMA 3DXMA 3LDQA 3IMXA 1LOTB 3NMUA 4DU1A 4DUZK 1GOCA 4JD2B 4JN4A 2O8EA 1K9MO 3P38A 3BK3C 4RW4A 3ID8A 4LF7K 1YIJN 3NAEA 3SAFA 4CZIA 1WN7A 1NWKA 3KLGA 4IEEA 1BA0A 4MFBA 3LDPA 1J9AA 1XUPO 4YFUA 4M45A 3SJHA 3L56A 1U45A 4F4KA 3O3HA 3SZ2A 1J6ZA 4DR7K 3V6DA 2IGIA 4C8OA 4CIGA 1N36K 2NRWA 4F2SA 1BI4B 3DLEA 1DT9A 1FW6A 1I2UA 2WC9A 1VRUA 1X9JA 2NRVA 2F8TA 4K41A 1WBDA 1C6VA 3U9ZA 3VQAA 1SAZA 3LM9A 4TSXA 5HRPA 1P00A 1RDWX 5CZ2A 5AQSA 3T1AA 1D4XA 3AA2A 1B92A 3O4NA 1L5UA 1NRBA 2N2QA 5FPDA 1S1TA 3OTOK 3THXA 4BR4A 3O08A 3DMJA 3EZ5A 1BWFO 1PTXA 4GW6A 2OZSA 2XRIA 4GNIA 1NK4A 2QA4N 3C95A 4KREA 1IKXA 4B9LA 5I42A 2XY5A 5KQDA 3TTCA 5GINA 4M3ZA 3L6QA 4W5QA 4UAEF 3ZSQA 3BF3A 2VQFK 1EX4A 1WT7A 5HLFA 3S3NA 3AO4A 3ZSWA 1W97L 3SLCA 3AVJA 5F2RA 4EIAA 4K42A 2UUAK 3DLHA 3SBGA 3CXCM 5J1EA 4Z0UA 1RDDA 4CJTA 3L3UA 3O5BA 4HUFA 3TWHA 4BRMA 1GLLO 4KO0A 1QSSA 3CCVN 4IJNA 4O8UA 2XY7A 1FKOA 2PYLA 3ZT1A 4QS8A 3KK1A 2G8WA 3PSMA 1XHZA 2G8IA 2HBKA 3ITHA 2ASPA 1RTIA 3LP2A 1JCGA 1VSDA 3MXJA 3UIQA 4DMNA 1C0GA 1QSYA 2P9PA 4JAXA 4ILJA 3ASMA 4R79A 4FLVA 4QOZB 2G8VA 4IG3A 4BRHA 1ZBUA 2F96A 1GLCG 1S1WA 3V9SA 3PX0A 3RWUA 4RW6A 4DHYA 4DTRA 3NGIA 3E9OA 2P9SB 1HNWK 1VQLN 2V51B 3TAEA 4KYPA 2DPNA 2Z1HA 4AQYK 4B9TA 2O8CA 4KH4A 3VEVA 2YHXA 3D2EA 4E19A 3LPUA 4G1QA 3KOXA 3P31A 4N47A 2ZJRL 4BECA 1S5JA 1XHXA 5JLHA 3NDKA 1QZ6A 1L3UA 3NGYA 4PKGA 3E66A 3V81A 3OYAA 3WEEA 1X9MA 1KQSM 1VSEA 1RBVA 3R9PA 2BTFA 5HL7L 2GELA 4J2BA 4CK1A 4FJ8A 2P9NA 3TI0A 3NHGA 3QFPA 4JK9A 3J80O 2MBKA 4KAZA 3ZEUB 4KHSA 3H3NO 1I6GA 1KAXA 3CETA 3OJSA 4FJ9A 4M3YA 2W6LA 4ZTJA 3VN5A 4H0OA 3VA0A 4BC5A 4W5OA 3ZX3A 1YJNN 5KRTA 2D5RA 1ICAA 4B8AB 5HBMA 2E88A 3ZYYX 4M3UA 1ZVEA 3C6UA 4NCAA 3QB0A 3G10A 3ZSZA 1VSJA 3HPGA 1WSIA 2QWLA 4HTLA 4CEFA 5HRSA 3K5OA 4DSJA 1KVAA 4BRDA 4CGFA 1WSEA 2R7YA 3S3MA 4DLGA 2NRXA 4B3TK 1T03A 2O8BB 3WUHA 1BHLA 1P0AA 1T1TA 5BN8A 2DFEA 5GAEP 3LWMA 4CE9A 3AO5A 5AQMA 2RN2A 5B8HA 4E7KA 4DTXA 2YHAA 2E2QA 2A6AA 3AGRA 3ZT4A 3HZ6A 1VQMN 2GV9A 4CHOA 4V1DC 2AA4A 3DXMB 4FPAA 1YITN 1NGIA 1HKGA 4IDHA 2A41A 4KV8A 4Z4CA 1XWLA 4DB3A 1G99A 1FXXA 4LC9B 4DV6K 1W0HA 3BF1A 1TV6A 1ZBSA 5FPMA 5FPEA 4CHPA 2RE2A 2NUBA 2E5LK 2F8SA 2Z1IA 1SNBA 2D1KA 1NK0A 4AM6A 4BE0A 4A2AA 3HT3A 4CQKA 3L2RA 1C1AA 4JKEA 1JCFA 3THWB 1PX9A 5BN9A 1TKZA 3EE9A 3THYA 1M1KO 4OPKA 4FWNA 1YHQN 4AAZA 3K5LA 4CCHA 4CJWA 2KGQA 4I6MA 4PWDA 2V7YA 2QXLA 2FSNA 1LAWA 3FZHA 3CMEN 3HI0A 1LWFA 1U6ZA 4NCBA 1NGFA 4JKGB 4E89A 3GL1A 3P5JA 3LANA 4BEBA 5LJVA 2DY4A 3IS9A 1C0UA 2F9WA 4MDBA 4N56A 4MQ3A 4M63C 3M8QA 1ATRA 3KVGA 3I56N 3GG4A 3KWGA 1KVBA 2N2RA 2P9LB 3F9MA 1R0AA 1EWRA 1QHTA 1MU2A 3VF2A 4DWIA 2P1JA 4O0IA 3NGZA 4XH4A 3V9UA 5KK4A 3C0BA 4FJLA 2BRZA 5E84A 1SKWA 3J81O 4DV3K 2QKKA 4N76A 2KHOA 3VQCA 3EL2A 1POIA 2FC0A 1UA0A 2G8KA 3L0QA 4B1ZA 2KW4A 4ELUA 2YKNA 3DI6A 4BRNA 4JLHA 1HNIA 1HMVA 1IKWA 3D2FA 1ESVA 5KPZA 4CGJA 2W42A 2D4WA 3MWPA 2YHYA 3FR0A 1Q9YA 3VGMA 3E01A 1UA1A 3HXMA 1NM1A 2HB5A 3F5TA 4KB1A 4FJJA 2ZJPL 3PLAA 4YOUA 3S5TA 4ID1A 3A5OC 2YJFA 3ZX2A 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2ASO A;  4FWS A;  3VEO A;  1NGD A;  2GTD A;  2ZGY A;  2I7N A;  3W3D A;  4M7X A;  1BG3 A;  3H3O B;  2IVN A;  5AZJ A;  5KPR A;  4RWT A;  3O1W A;  3JXU A;  1OKJ A;  4BVO A;  1YVN A;  2P9U A;  2V7Z A;  4BRP A;  3BUZ B;  4B1V A;  3CJB A;  2ZF5 O;  5AFU H;  3DXM A;  3LDQ A;  3IMX A;  1LOT B;  3QFU A;  5AQQ A;  4YDU C;  3DXK B;  4NB4 A;  2P9I A;  1BUP A;  4JN4 A;  4JD2 B;  2P9K A;  4MLH A;  4H0T B;  2QWN A;  3M3Z A;  3ID8 A;  3WXK A;  4CZI A;  4H5T A;  1NWK A;  1BA0 A;  3QBX A;  3LDP A;  1MDU B;  2UYT A;  2E8A A;  1XUP O;  2IVO A;  1T6C A;  4JHD B;  4EHT A;  4BG8 A;  3SJH A;  4CZG A;  3ULE B;  3I33 A;  3H1V X;  3WT0 A;  3A5L C;  1J6Z A;  4IZ9 A;  4IWV A;  1U2V B;  3U8X A;  4CZH A;  4FWO A;  2YJE A;  2V52 B;  1NGA A;  2FSJ A;  1X9J A;  1Y64 A;  2Q1N A;  3CJA A;  5E26 A;  3O4W A;  4K41 A;  3U9Z A;  1SAZ A;  1GLF O;  2Q97 A;  3VET A;  1TYQ B;  5AQL A;  3M1F A;  3LM9 A;  3SMS A;  1QQO A;  1KXP A;  1RDW X;  2ITM A;  3QML A;  5AQS A;  4K25 A;  1D4X A;  5FPD A;  2AP1 A;  4BR4 A;  3O08 A;  1BWF O;  1V4S A; 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 3OYN A;  3W3D A;  3K5N A;  3SQ0 A;  4O55 A;  3H3O B;  5AZJ A;  2NY8 X;  1RBT A;  3RMC A;  3O9Q A;  3V4I A;  3O1W A;  4FLT A;  1QVF M;  1OKJ A;  1YVN A;  4PQU A;  4JI8 K;  5HP1 A;  2ZF5 O;  3BY5 A;  4FJM A;  3DXM A;  3LDQ A;  3IMX A;  1LOT B;  3NMU A;  4DU1 A;  4DUZ K;  1GOC A;  4JD2 B;  4JN4 A;  2O8E A;  1K9M O;  3P38 A;  3BK3 C;  4RW4 A;  3ID8 A;  4LF7 K;  1YIJ N;  3NAE A;  3SAF A;  4CZI A;  1WN7 A;  1NWK A;  3KLG A;  4IEE A;  1BA0 A;  4MFB A;  3LDP A;  1J9A A;  1XUP O;  4YFU A;  4M45 A;  3SJH A;  3L56 A;  1U45 A;  4F4K A;  3O3H A;  3SZ2 A;  1J6Z A;  4DR7 K;  3V6D A;  2IGI A;  4C8O A;  4CIG A;  1N36 K;  2NRW A;  4F2S A;  1BI4 B;  3DLE A;  1DT9 A;  1FW6 A;  1I2U A;  2WC9 A;  1VRU A;  1X9J A;  2NRV A;  2F8T A;  4K41 A;  1WBD A;  1C6V A;  3U9Z A;  3VQA A;  1SAZ A;  3LM9 A;  4TSX A;  5HRP A;  1P00 A;  1RDW X;  5CZ2 A;  5AQS A;  3T1A A;  1D4X A;  3AA2 A;  1B92 A;  3O4N A;  1L5U A;  1NRB A;  2N2Q A;  5FPD A;  1S1T A;  3OTO K;  3THX A;  4BR4 A;  3O08 A;  3DMJ A;  3EZ5 A;  1BWF O;  1PTX A;  4GW6 A; 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