5AQUA

Fragment-based screening of hsp70 sheds light on the functional role of atp-binding site residues
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
381
structure length
381
Chain Sequence
MSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title A fragment-based approach applied to a highly flexible target: Insights and challenges towards the inhibition of HSP70 isoforms.
pubmed doi rcsb
molecule keywords HEAT SHOCK COGNATE 71 KDA PROTEIN
molecule tags Chaperone
source organism Homo sapiens
total genus 122
structure length 381
sequence length 381
ec nomenclature ec 3.6.3.51: Transferred entry: 7.4.2.3.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5aquA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aquA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aquA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5aquA04
3S41A 4M7XA 3VENA 1X9JA 4FWOA 3H1QA 4BRLA 4H0PA 2I7PA 4CZMA 4Z94A 4JD2A 2BTFA 3CJ7A 3IFRA 3ENOA 4YDUA 2GTDA 5AQJA 3A5OC 4M63C 3UKRB 3WXLA 5ADXA 4PKHA 4CI6A 2D4WA 3BP8A 3LDLA 2IVOA 4H0TB 4JD2B 3CJCA 5AQMA 4IZ9A 2H3GX 3QDKA 1BWFO 5BPLA 3LDOA 4CZJA 2E2OA 1LOTB 2J4RA 2P9PA 1HKGA 3GL1A 1HKCA 3O1WA 5TKYA 3ULEA 5AQSA 1JCFA 1T6CA 5AQZA 4H0XB 1X3NA 4JNEA 5AQVA 4JAXA 4FWKA 1WOQA 4ISGA 1QQOA 2E20A 1ZC6A 4O5FA 1ATRA 3VF6A 4BC5A 1RDWX 5KQDA 3FGUA 3AARA 3VPZA 3L0QA 3GE1A 2P9PB 1YXQA 3QMLA 4DCHA 1GLBG 3ULEB 3W3DA 4FO0A 2QWPA 1TYQA 3HTVA 5LJVA 1YUWA 2ASMA 2E8AA 3I33A 4BQZA 5LJWA 4HTLA 3VERA 4BC2A 3BUZB 5FPNA 3CI5A 3DXMA 5AQGA 1P8ZA 1TYQB 3VETA 5AQYA 2QW9A 1MDUB 4H03B 4BRNA 5BR9A 4H5RA 4WQ5C 5BREA 4CD3A 3KZBA 3MDQA 3OHRA 2KHOA 4C23A 1HLUA 4B1YB 4B1UB 3BF3A 4WQ4A 4CBWA 3FZLA 3DXMB 2QWMA 3A8YA 3C7NA 2IIRA 4EHTA 3GOIA 3A5NC 3KHYA 1QQNA 5F2RA 1WUAA 4HWIA 1Z05A 1MWKA 5AQLA 2NLXA 3QBXA 1E4GT 2E2QA 2P9IA 5ELZA 5KPRA 4J8FA 4CBXA 1BO5O 3M1FA 3MCPA 3VOVA 4EIAA 3VGKA 2ZGYA 1SQKA 4A2AA 5AQHA 1J6ZA 2EWSA 5AQTA 1V4SA 5AFUH 4BROA 5KPTA 5I9EB 4XH5A 3C7NB 3VESA 1TUUA 4GY2B 3CERA 2FF3B 4FWQA 2Q1NA 1ZBSA 2P9IB 4EFHA 1LCUA 1D4XA 1SAZA 1HPMA 4K42A 3H3NO 4IJAA 3RSEA 2V52B 4BREA 4CZKA 3H6EA 4IJNA 4DHYA 2AP1A 4A62A 3QBWA 4XH4A 4QS9A 3UKUA 1GLFO 1HUXA 4PKGA 4MLHA 3W0LA 2NRHA 2W40A 3JS6A 4BR0A 2CH5A 1GLAG 3EL2A 1NGAA 2WUSA 3AAQA 3ENHA 1BUPA 3CJBA 3RSEB 4WYBA 2D0OA 3U9DA 4PKIA 4AM7A 3A5LC 2P9SA 3UKUB 4K25A 4MLEA 1NGIA 3EZWA 1NWKA 2OANA 3VF2A 4H5TA 4QS8A 1K8KA 2VYPA 1T44A 4ISEA 3ZX2A 5AQRA 5F1XA 4B9QA 4BGBA 3VEVA 2BUPA 5FPEA 2YJFA 2CGLA 2QWNA 5JMVA 2P9SB 1GLCG 2YCHA 1H1VA 2Q2RA 3HI0A 3M6GA 4BVPA 2Q0UA 1T6DA 3WXJA 1QZ5A 1JCGA 5AQXA 1IG8A 1K8KB 3IMXA 3WEEA 2YJEA 3O4WA 3F9MA 4NO7A 4PL8A 5AR0A 3D2FA 3FZHA 2A6AA 4K43A 2QWRA 3ZX3A 1MA9B 1S22A 3BF1A 3G25A 3SMPA 1YVNA 4CZLA 3L6QA 3WEEB 1NGBA 4I6MA 2HMPA 4BRKA 5AQKA 2QM1A 3EO3A 4O8KA 4BRFA 1NGGA 4A2BA 3D2FB 4BR7A 5EOYA 5JLFA 1NBWA 4BQLA 3EN9A 3WT0A 1JCEA 3VGMA 4EHUA 5FPDA 2FSNA 1E4FT 2E1ZA 1BA1A 3CJ1A 3GG4A 4FOIA 4I6MB 3ZETA 3O80A 3LDNA 3TPQA 1XQSC 4XH1A 1DGKN 4ISFA 3BEXA 2VWBA 4FPAA 3D7EO 5AQFA 1ESVA 2V7ZA 4B1XB 2Q97A 2ZGZA 3CJ9A 2HOEA 4FWPA 1QZ6A 3IUCA 4NB4A 2A41A 1Y64A 3ZETB 1NGCA 3HM8A 5AQOA 3FFKB 2FSJA 4BRCA 4RWTA 5JICA 5BN8A 3B8AX 1OKJA 4FWRA 3LL3A 5E84A 4JHDB 2HF3A 3VEZA 3P4IA 4CZGA 3AY9A 5AQNA 3HBTA 1NGFA 3A5MC 3WXIA 4IWVA 4Y0WA 5EXWA 3CIPA 1BU6O 4YDUC 5ADXH 2CH6A 3FZFA 1RGIA 3SK3A 5BN9A 2GEMA 1BA0A 3LM9A 1CZAN 1X3MA 3ATUA 4AM6A 3UE5A 2UYTA 2HF4A 2P9UA 3DWLA 3O1BA 3R6MA 4H0VB 4QS7A 3WUHA 5EY4A 2DPNA 4BRMA 1GLLO 1NGDA 3A0IX 3LDPA 1GLJO 1NGEA 4GNIA 1XUPO 5CE3A 2E88A 1HKBA 4JN4A 3U4LA 3GBTA 2P9UB 3AAPA 3SMSA 2VCPA 3CQXA 3M3ZA 5F0XA 3UB5A 2GWJA 1ATSA 3VF4A 3MMVA 2I7NA 3WXKA 4FOEA 4MO5A 3ZX0A 2ASOA 2CGJA 2YHXA 2ZWHA 3CHWA 3FZKA 3CQYA 2ITMA 5KPZA 2P9LA 5EVZA 4CZIA 2QWLA 2P9NA 1KAXA 2V51B 4H0OA 3FZMA 1U2VA 4M7YA 4B1VA 4BRAA 3SJHA 2A40A 4CD1A 1IJJA 4BR5A 4BG9A 3DAWA 3EKUA 3LM2A 4FWMA 1BOTO 3H45C 3HSCA 4WQ5A 2P9LB 3ATVA 2P9NB 3O8MA 3C0BA 2F9WA 3VEWA 4LC9B 1TUYA 1U2VB 2P9KA 4BRHA 3SLCA 4B1WB 1G99A 5BRFA 4WQ4C 5AQUA 2ASPA 1NM1A 2E2NA 4CZHA 1ZXOA 4BR9A 1NLVA 2P9KB 5BRDA 3MN9A 1HX1A 2D0PA 3R9PA 3DJCA 4BC3A 4F9OA 3TU5A 5AFUA 3U8XA 1NMDA 4FPBA 3KVGA 4DQ8A 1EQYA 5AQQA 3I8BA 3D2EA 3H1VX 3JXUA 2YI1A 2QWOA 5AQWA 1DKGD 2A42A 2V7YA 4BRGA 3O08A 1U6ZA 4FWSA 4EAHD 2F9TA 3MK6A 3QFPA 5LY3A 3QFUA 4JHDA 4H5WA 2CGKA 3D2EB 4BC4A 1ATNA 5AZIA 2IVNA 4BGAA 4FSVA 2FLOA 4DB3A 2QXLA 5AQPA 3FE1A 3CJAA 4FWLA 4CZEA 3U9ZA 2A5XA 5FPMA 2FXUA 1MWMA 3H46O 1YAGA 3MN7A 4A61A 2AA4A 3WQUA 1XC3A 4KBOA 4BRPA 1KXPA 1GLDG 5E26A 5AZIB 1QQMA 2IVPA 3R8EA 4BG8A 4BRQA 1C0GA 3CETA 5BPMA 1Q18A 5EX5A 4H0YB 3ZEUA 5AZJA 2PAVA 3DXKA 1NGHA 4CZFA 5AQIA 2A3ZA 3J8AA 4MO4A 4IXCA 2Q36A 4RTFD 3GDQA 5KQ8A 4H5NA 3LDQA 4H5VA 4BR4A 2FSKA 4K41A 5AZJB 3ZEUB 3ID8A 3MN5A 3DXKB 1GLEG 2FF6A 3L4IA 3MN6A 1BG3A 2E2PA 3VEYA 5JLHA 1SZ2A 2Q0RA 2YHYA 2W41A 5BRHA 4CBUA 2GUPA 2QWQA 3VGLA 1QHAA 1DEJA 3O5BA 4FWNA 3IDHA 1RFQA 3H3OB 2E1YA 4RCHA 4B1ZA 4BRDA 3FLCO 2D1KA 4BRIA 4BVOA 5B8HA 1NGJA 3QB0A 4PL7A 3QICA 1BDGA 2GWKA 2ZF5O 1R59O 3FR0A 2Q31A 3VEOA 2NZTA 2GELA 3EKSA 4IO8A 1KAZA 1Z6RA 1C0FA 4E1JA 2PBDA 3O6WA 1S3XA 3VEXA 3WQTA 4BR2A 1HJOA 2YHWA 4CJ7A 3UKRA 4XEIA 3HZ6A 5BPNA 4FL9A 4L3QA 1V4TA 1KAYA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4M7XA 4FWOA 3KLFA 4CZMA 2I7PA 4Z94A 5E41A 4ZTJA 3ENOA 3F5TA 3KOWA 4DV4K 2GTDA 3UKRB 3J81O 4PKHA 5D3GA 4CJSA 3K2PA 2IVOA 5C42A 4FLXA 3NMUA 4JD2B 3LPTA 2H3GX 4E7KA 3LDOA 3IKMA 1D5AA 1I2VA 2P9PA 1HKGA 3GL1A 3KP0A 4DU4A 2VQEK 4FVUA 4YOUA 3DLKA 3E7RL 4M45A 1KSPA 4JAXA 3DLGA 4YHHK 1QQOA 3AO2A 2E20A 4O5FA 1YI2N 3V1QA 5J2NA 1C6VA 1LQHA 3PSFA 5KQDA 1JLBA 4DSFA 4DTRA 5BR8K 2ZM6K 1HQUA 4IFEA 3L2RA 1GLBG 2OTLN 1SNBA 4M3YA 1YUWA 2E8AA 1LW0A 4I2QA 1BL3A 4BQZA 1TAQA 5LJWA 4DWIA 4W5NA 3VQ6A 4CF9A 4GVEA 3T7ZA 3BUZB 3VQBA 1BIUA 4IFVA 1JXBA 1TYQB 2KW4A 2VGNA 3RMAA 1JJ2M 2HBLA 1ILYA 5BR9A 2LN8A 1S1WA 4CD3A 3MDQA 3VQ9A 1TAUA 1WT7A 1P0AA 2KHOA 2YIPA 4CJKA 2VG6A 4DR6K 1BIZA 3T69A 1W97L 4CBWA 3SYZA 2ZQBA 3C7NA 3K9JA 3KJVA 2OPQA 5AQLA 3VN5A 1LQQA 2E2QA 1YTAA 3VQPA 1BO5O 2A1RA 4Q0BA 2HNZA 1V4SA 1HNVA 4HHTA 1BRZA 4GY2B 4H4OA 3L3VA 5FROA 1G15A 2FF3B 3CCQN 3OYCA 2P9IB 2C1GA 3HP6A 2ATBA 2O4IA 3H6EA 1NK7A 2UU9K 3HM9A 3QBWA 1M1KO 4QS9A 3IS9A 4RW4A 4PKGA 4MLHA 2NRHA 2W40A 3JS6A 3MECA 5K14A 5J2PA 3P38A 2HMIA 1GLAG 3AO4A 3OYNA 1TK5A 5LMNK 4YOWA 3CJBA 3ZT3A 1A5VA 1TL3A 4YFUA 2XHBA 2NY8X 4PKIA 3A5LC 4CHOA 2P9SA 5DM7L 3UKUB 1DTQA 3V9ZA 1NGIA 3PX6A 3P5JA 1NWKA 2B68A 4MQ3A 4H5TA 3BGRA 1VQ8N 3IRXA 5KGWA 2P5GA 3KK2A 1VSEA 5AQRA 4CHYA 4B9QA 3CPEA 5J1EA 4M42A 4L8RB 2QWNA 1GLCG 1BMRA 2BRZA 4BVPA 1QZ5A 1IG8A 2UXBK 3THYA 4NO7A 1YIJN 1WWNA 1SN4A 4JRPA 5AR0A 4KHWA 3FZHA 4K43A 1GPSA 1RT5A 4CF1A 2I61A 4OLBA 3G25A 3SMPA 1UOCA 5KI6A 3WEEB 5CYMA 5AQKA 2D0AA 1WNSA 3RWUA 2O8BA 4BRFA 1NGGA 4BR7A 5EOYA 1QSLA 3H08A 1KRPA 4CEBA 4JI3K 4N47A 3CFPA 1JCEA 3VGMA 5FPDA 4LH4A 2HBMA 2EHGA 2E1ZA 3CJ1A 4FOIA 3F2KA 3GG4A 3NF7A 3LDNA 3TPQA 1VSJA 1DGKN 4Z4CA 4ISFA 3G71N 4FPAA 1LV5A 2V7ZA 3OJUA 4W5TA 3CPWM 3AVBA 2ZGZA 4DLGA 3OYJA 2GBZA 1TK8A 4NB4A 2A41A 4IO9L 1Y64A 1NGCA 1RBSA 1RDBA 4NLCA 4E1MA 5AQOA 3AO1A 4RWTA 1ICAA 3OA9A 3C6HA 1OKJA 1TKDA 3EEQA 4X66K 2P5OA 3SV3A 1HNWK 3QIOA 4FJLA 2HF3A 3VEZA 1BI4A 5J2QA 3CD6N 4RG8A 4MFBA 2UUAK 4Y0WA 5EXWA 3Q7BA 5ADXH 3FZFA 1KD1O 4AHUA 4OX9K 3RVCA 1EXQA 3AO5A 3ZT2A 2GEMA 1BA0A 1OH5A 4OLAA 3C6UA 4BDPA 4F8RA 3C6TA 4FJNA 3R6MA 1NK9A 4QS7A 4NCBA 5HRRA 3OBWA 1RT1A 2DPNA 1GLLO 2HSTA 4EZ9A 3J7ZO 2LI7A 2O8FB 4ZTFA 4CIGA 3KLHA 4FZYA 1XUPO 2E88A 1HKBA 1WSJA 4CJEA 2PZSA 3I8DA 2P9UB 2BE2A 1X9WA 2VCPA 3Q7CA 1T03A 4Z4IA 1WSGA 4A57A 1TL1A 4UY8O 5HL7L 1WLJA 5FDLA 2ZWHA 3ZSQA 4LFCK 2ITMA 3SQ1A 1B92A 4CZIA 3CYGA 1KAXA 1WSIA 4M3RA 1U2VA 3SAHA 4M7YA 1C0MA 1ITGA 3SJHA 3KLEA 4Z4HA 1JLCA 3BY5A 3K5NA 1YJWN 3CCEN 4G1QA 1VSHA 3DAWA 4ILHA 4FWMA 4JYAK 5GIOA 4FLTA 1ZBUA 1BOTO 3HVTA 2ZJRL 4Y1CA 3NGZA 1J54A 1RBRA 2P9LB 3U6FA 3HPHA 2F9WA 4LC9B 3T1YK 1YTUA 1TUYA 3MWPA 4WCEL 2Z1GA 2N2RA 1G99A 1BQMA 5BRFA 4WQ4C 2AJQA 5AQUA 2O8DB 1NJYA 3K9KA 2E2NA 4F2RA 3SI6A 5BRDA 1VSKA 3MN9A 2D0PA 5I42A 5TKWA 3SNNA 4KAZA 5AFUA 3U8XA 1WAFA 4KFBA 3M8SA 2O8EA 1EQYA 1KTQA 4B9SA 2KSKA 2KGQA 2A42A 3CCSN 2NNWA 3VA3A 3THWB 1U6ZA 4FM2A 4BEBA 2HHWA 1BCMA 3LAKA 4AHCA 3OYHA 3OYBA 4JHDA 4B3TK 4KO0A 3EE9A 4I9QA 4KHPK 4LF9K 2E2FA 1N33K 3MCAB 1IH7A 1S6PA 3O4NA 4BGAA 3RMBA 4UQGA 3NGYA 4KPYA 4AHVA 3HVRA 3U9ZA 4K0KK 1MWMA 3OY9A 1IG9A 3LP2A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4M7X A;  4FWO A;  3KLF A;  4CZM A;  2I7P A;  4Z94 A;  5E41 A;  4ZTJ A;  3ENO A;  3F5T A;  3KOW A;  4DV4 K;  2GTD A;  3UKR B;  3J81 O;  4PKH A;  5D3G A;  4CJS A;  3K2P A;  2IVO A;  5C42 A;  4FLX A;  3NMU A;  4JD2 B;  3LPT A;  2H3G X;  4E7K A;  3LDO A;  3IKM A;  1D5A A;  1I2V A;  2P9P A;  1HKG A;  3GL1 A;  3KP0 A;  4DU4 A;  2VQE K;  4FVU A;  4YOU A;  3DLK A;  3E7R L;  4M45 A;  1KSP A;  4JAX A;  3DLG A;  4YHH K;  1QQO A;  3AO2 A;  2E20 A;  4O5F A;  1YI2 N;  3V1Q A;  5J2N A;  1C6V A;  1LQH A;  3PSF A;  5KQD A;  1JLB A;  4DSF A;  4DTR A;  5BR8 K;  2ZM6 K;  1HQU A;  4IFE A;  3L2R A;  1GLB G;  2OTL N;  1SNB A;  4M3Y A;  1YUW A;  2E8A A;  1LW0 A;  4I2Q A;  1BL3 A;  4BQZ A;  1TAQ A;  5LJW A;  4DWI A;  4W5N A;  3VQ6 A;  4CF9 A;  4GVE A;  3T7Z A;  3BUZ B;  3VQB A;  1BIU A;  4IFV A;  1JXB A;  1TYQ B;  2KW4 A;  2VGN A;  3RMA A;  1JJ2 M;  2HBL A;  1ILY A;  5BR9 A;  2LN8 A;  1S1W A;  4CD3 A;  3MDQ A;  3VQ9 A;  1TAU A;  1WT7 A;  1P0A A;  2KHO A;  2YIP A;  4CJK A;  2VG6 A;  4DR6 K;  1BIZ A;  3T69 A;  1W97 L; 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