5AQVA

Fragment-based screening of hsp70 sheds light on the functional role of atp-binding site residues
Total Genus 125
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
125
sequence length
378
structure length
378
Chain Sequence
GPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title A fragment-based approach applied to a highly flexible target: Insights and challenges towards the inhibition of HSP70 isoforms.
pubmed doi rcsb
molecule keywords HEAT SHOCK COGNATE 71 KDA PROTEIN
molecule tags Chaperone
source organism Homo sapiens
total genus 125
structure length 378
sequence length 378
ec nomenclature ec 3.6.3.51: Transferred entry: 7.4.2.3.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5aqvA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqvA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqvA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5aqvA04
1NGGA 1D4XA 3FLCO 3M6GA 5KPTA 3SLCA 2PAVA 3ID8A 4M7YA 2ZGYA 5KQDA 4FO0A 1C0FA 4WQ4A 4IXCA 3DXMA 3L0QA 1C0GA 4RCHA 1TUYA 2E88A 2GELA 3ZX3A 4MLHA 4WQ4C 1NLVA 4H5VA 4ISFA 3EN9A 1S3XA 1NGIA 1DKGD 1MDUB 1ATSA 5F0XA 2P9SB 4IJAA 4L3QA 3A5OC 4RTFD 5BRFA 3AARA 4JN4A 4JD2B 1WUAA 3WQUA 4CZHA 4BGBA 3VEWA 2GWKA 5JMVA 4DHYA 3WXKA 3LM2A 3ATVA 2YHWA 3JS6A 2AP1A 4B1VA 4H5WA 3DJCA 3VF2A 4BVOA 4O8KA 1NGHA 2IIRA 1HLUA 2FLOA 4B1WB 2QWLA 3C7NB 5AQMA 3FE1A 3VESA 5E84A 1BG3A 4C23A 3ZX0A 1LOTB 1U2VA 3M1FA 3VEVA 3VPZA 2YHYA 3HTVA 4BG9A 1XC3A 3O08A 1NGDA 3A5MC 4AM6A 4BRIA 1K8KA 5AFUA 5AQSA 1TYQB 2ZF5O 2GUPA 3FZLA 4H0VB 3S41A 4YDUA 2CH5A 3QB0A 4CZJA 3HBTA 3VF4A 1X9JA 3QICA 3RSEB 5BPLA 1NWKA 3UKRB 3LL3A 3W3DA 4FPAA 1YAGA 3A5LC 4BRDA 2FXUA 2HMPA 4DQ8A 4BR9A 3RSEA 3L4IA 5AQIA 3D2EB 3HSCA 1HKCA 5ADXH 3DXKA 5AQHA 2F9WA 3WQTA 3HZ6A 4EFHA 2Q97A 3FR0A 4FWKA 3GG4A 3LDOA 5KQ8A 1ZC6A 3EKSA 2D4WA 2P9IB 3U8XA 4FWLA 2P9UB 3CJBA 5BRDA 4IWVA 5BRHA 3CJ1A 3KVGA 3IMXA 3LDNA 1NMDA 3QBWA 2HF4A 2Q1NA 2CGLA 1Q18A 5KPRA 5LJVA 1NGCA 2P9UA 3HI0A 1V4SA 5AZJB 1WOQA 1NGEA 4H03B 4PKGA 4EIAA 3QDKA 2GTDA 4BRAA 3R9PA 3D2FA 4XEIA 2ZWHA 3LDQA 2OANA 4M63C 2P9LB 1MA9B 3KZBA 4K42A 3WUHA 2ASOA 4H5RA 1NGBA 2P9NB 4FOIA 2J4RA 5FPDA 4H0OA 2P9KB 4BR5A 4BRGA 4A2BA 5KPZA 3FZMA 3FZHA 2E2PA 1GLLO 3WXIA 2ASPA 3U9ZA 4CBWA 3M3ZA 1RDWX 3UKUB 3CETA 2GWJA 1MWKA 3OHRA 2Q36A 4A62A 3SJHA 1BUPA 1EQYA 3AAQA 5FPEA 2E1ZA 2A6AA 1T6DA 4M7XA 3O80A 3SK3A 1QQNA 4DB3A 3ZEUB 4E1JA 5AQVA 3GBTA 2FSNA 2DPNA 4H0XB 3CJ7A 3O8MA 5AQJA 3BF3A 3H3NO 1GLFO 5BPMA 1BA0A 2UYTA 3GDQA 2YJFA 2I7PA 2P9SA 3ULEB 3FZKA 2D0PA 3W0LA 3KHYA 4CZMA 2QWMA 1G99A 3JXUA 4JD2A 3SMSA 1YUWA 2P9PB 3A0IX 4QS8A 1RGIA 4FWPA 3WT0A 5AQNA 3ZX2A 4CD1A 5LY3A 5EXWA 3I8BA 4HTLA 5AR0A 2QM1A 3CQYA 4BQLA 3UE5A 3L6QA 3O5BA 3H46O 3FZFA 1YXQA 4PKHA 4B1ZA 3VEYA 3BF1A 4BRKA 3IUCA 4B1XB 4H5NA 1HJOA 5AQFA 5EOYA 4F9OA 3C7NA 2FSJA 2A41A 3EKUA 2KHOA 1HUXA 3P4IA 3MCPA 3GOIA 4K43A 2FF3B 2YI1A 1XQSC 1HX1A 4MO4A 4AM7A 1GLDG 2HOEA 5JICA 5AQGA 4BC5A 4YDUC 1QZ5A 2QWNA 1ESVA 4NB4A 1TYQA 1KAYA 4JHDB 3H3OB 3J8AA 3ZETB 4BRMA 1SZ2A 2V7ZA 2Q0UA 4EAHD 4PKIA 2V51B 5BPNA 4EHUA 4CBUA 4CD3A 3ZETA 5AQXA 3UKRA 4XH5A 3U9DA 4FSVA 5JLHA 1OKJA 3U4LA 3A5NC 4FL9A 1Z6RA 2HF3A 5AQLA 2YJEA 1R59O 4QS7A 4BC4A 3B8AX 1GLEG 5EX5A 3D2EA 4BRFA 4B1UB 4IO8A 2CH6A 3ATUA 3QFPA 5AQZA 1BOTO 5AQQA 3CJCA 5ADXA 5AZIB 3BUZB 1E4GT 4EHTA 2E2NA 2AA4A 2I7NA 4GNIA 3HM8A 3BP8A 3CHWA 3LDPA 4JNEA 3WEEB 2IVPA 1T44A 4FWQA 4MO5A 3MDQA 3H6EA 2QWQA 2P9IA 3O1BA 2QWOA 4JAXA 2E8AA 5E26A 1Z05A 2VYPA 3D7EO 3DWLA 4K41A 3WEEA 4BG8A 3H1VX 2NLXA 1YVNA 4FWSA 3ENHA 2VCPA 3QBXA 5AZJA 1GLJO 1NGJA 4CZIA 2QW9A 1NBWA 3A8YA 3H1QA 2V52B 3AAPA 1J6ZA 3VETA 4J8FA 3VENA 4PL7A 1KAZA 4LC9B 2ITMA 1ZBSA 2QWPA 1P8ZA 3IFRA 2D1KA 2NRHA 2P9LA 4CI6A 2WUSA 2P9NA 4ISGA 3VEXA 2H3GX 2P9KA 3H45C 3I33A 3R8EA 1DGKN 4HWIA 5F1XA 4BQZA 3MMVA 1QQMA 1IG8A 3VGMA 2QWRA 2E20A 3WXJA 3UKUA 3UB5A 4NO7A 3VEZA 5AQKA 2ASMA 3CI5A 4WQ5A 2IVNA 1E4FT 3GL1A 3MN6A 1S22A 3LDLA 3VEOA 4WQ5C 3ZEUA 5FPNA 1GLCG 2V7YA 4B1YB 4RWTA 3QFUA 4BR0A 3CQXA 4WYBA 5JLFA 2W41A 5AQWA 2BUPA 4H0PA 3SMPA 4CZFA 1JCEA 1HKBA 3LM9A 3TPQA 3EZWA 2PBDA 4CJ7A 3CJAA 5BN9A 3O4WA 4H5TA 1NGFA 4H0TB 5EVZA 2IVOA 3ULEA 2GEMA 4PL8A 3TU5A 2CGJA 4IZ9A 2FF6A 4KBOA 3MN9A 2P9PA 5BREA 1HPMA 3EL2A 1MWMA 1HKGA 3O1WA 1KXPA 4MLEA 1RFQA 2QXLA 2A40A 5TKYA 1GLAG 4FWOA 2YHXA 1T6CA 4B9QA 5AQYA 2YCHA 2Q0RA 4CZEA 4CZGA 1SAZA 4IJNA 2E1YA 4CBXA 4FWMA 1DEJA 2ZGZA 1H1VA 4GY2B 3EO3A 4BC3A 5AFUH 1U2VB 5AQUA 3C0BA 4BGAA 4Z94A 1QHAA 5ELZA 2E2QA 3ENOA 4BRQA 1K8KB 1IJJA 3FGUA 3WXLA 5I9EB 1BDGA 5EY4A 1XUPO 4FWRA 4XH4A 3G25A 3MN5A 1NGAA 3IDHA 1SQKA 3FFKB 4I6MB 5CE3A 3GE1A 1ATNA 4JHDA 3VF6A 4BRLA 4BR7A 5B8HA 1TUUA 4BC2A 4I6MA 2EWSA 2Q31A 5AQOA 2A5XA 1ATRA 5AQPA 4BROA 4Y0WA 2E2OA 4QS9A 4BR4A 1BO5O 1U6ZA 1JCFA 3DXKB 4BR2A 4CZLA 1V4TA 2A42A 2VWBA 3MK6A 4O5FA 5AQRA 3O6WA 2FSKA 3DAWA 4CZKA 1JCGA 1BU6O 4DCHA 5FPMA 1NM1A 3VGLA 2D0OA 1BWFO 2Q2RA 1ZXOA 2W40A 4FPBA 5AZIA 4BRPA 4BRCA 2CGKA 4FWNA 1GLBG 3QMLA 1QZ6A 4A2AA 4BREA 5BR9A 5BN8A 1X3MA 1BA1A 3AY9A 1KAXA 1X3NA 3R6MA 1CZAN 2F9TA 3CERA 3VOVA 4BRHA 3D2FB 4H0YB 4K25A 3VGKA 3MN7A 1Y64A 2BTFA 3BEXA 4A61A 4BVPA 2NZTA 5AQTA 4XH1A 5LJWA 3VERA 4FOEA 3F9MA 3CJ9A 5F2RA 3CIPA 4BRNA 4ISEA 2A3ZA 1LCUA 1QQOA 3DXMB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3M6GA 5KPTA 4FM1A 2PAVA 3NGZA 3OYGA 3SNNA 1ZFUA 1ITGA 5KQDA 4IO9L 1M90O 1C0FA 2ETJA 4FW2A 4DU3A 3DXMA 1EX4A 4LF9K 1IH7A 1TUYA 2E88A 4MLHA 3R1XA 5K14A 1NGIA 2Z1IA 3NVKA 1MDUB 3HPOA 4DV5K 2P9SB 4GVEA 4L3QA 1RT6A 1L5UA 2KTQA 3NHGA 3HXMA 3HVRA 4RTFD 4DQRA 3SQ1A 3OVNA 4JD2B 3PO4A 1NJYA 3I8DA 3AO3A 2OZSA 3L3UA 5JMVA 3OYDA 3S3NA 3LM2A 1YF5L 4EP5A 4RW8A 4I2PA 4BVOA 5C42A 1SUQA 1RDCA 2GBZA 3VQ5A 3SQ0A 2IDOA 3C6TA 4ILHA 3WNGA 3ZX0A 1LOTB 4DTPA 1UA1A 5LMUK 4E7LA 1XC3A 5AFUA 3TANA 1SN1A 2E6MA 1HNVA 4G1QA 1JL2A 1TYQB 1J53A 1VHXA 2LY5A 3S41A 1U49A 4Z4FA 2EHGA 2PZSA 2JWKA 4CJRA 3QICA 5BPLA 1NWKA 3UKRB 3LL3A 4CJKA 1L3UA 2HHWA 4FPAA 1YAGA 3KD5E 4L8RB 2FXUA 4M3TA 1LW0A 2HMPA 3QNOA 1RT2A 4CGGA 3HRGA 1SKWA 5HRNA 2LSNA 3S5TA 5ADXH 3DXKA 3AVBA 5AQHA 3DRPA 3DI6A 3C6AA 3HPHA 2HBJA 1TAQA 4JI0K 2O8FB 3PX6A 1WSEA 3LPTA 4KI6A 2Q97A 1JLBA 2YIPA 5KQ8A 2OPRA 1JLGA 3O9UA 1JXCA 2BE2A 2P9IB 2P9UB 5GAEP 3KLHA 3G4SN 3BZCA 1IBLK 5KTQA 4IWVA 3KVGA 1TL3A 3TTCA 1FH3A 1Q18A 2E6LA 5KPRA 1XC9A 1V4SA 1NGEA 1NPIA 5LL6Z 4PKGA 3OBWA 2GTDA 4B8CA 3R9PA 3WNHA 1AHOA 4CESA 3IG1A 2OANA 4M63C 1YJWN 2P9LB 3WUHA 2ASOA 4PWDA 2OYQA 2C1GA 3FZHA 3VQ7A 2VG7A 3U9ZA 1NJIO 4KH6A 1CLQA 3UKUB 3OHRA 3SAFA 1WBBA 3SJHA 4FLUA 1EQYA 2E1ZA 4CQKA 2G8WA 4CEQA 3THYA 4XIUA 4C8NA 1GOAA 1ZBHA 2BRZA 4H0XB 3OYCA 1YI2N 1SV5A 5CZ2A 3OS2A 2OPQA 5A2QO 1GLFO 1Y97A 1RTHA 3G6EN 1TL1A 1QSLA 3O9QA 1HNWK 3FFIA 1DQ7A 3CCJN 4B08A 4DSEA 2DFFA 4AB0A 3FZKA 1XMQK 4DLGA 3W0LA 4LFBK 4A5BA 3V4IA 4GV9A 2P9PB 4QS8A 1K73O 5AQNA 1KRPA 5EXWA 2R7YA 3CQYA 4BQLA 4KHNA 3DRRA 3L6QA 1BI4B 4M3WA 4X66K 3C95A 3OS0A 2HVHA 1BRZA 3O4QA 4F2SA 4KAZA 4CHQA 3KLEA 4LFCK 4B1XB 4LF6K 3C94A 1EP4A 4F9OA 1B7DA 2A41A 1VK0A 4CJFA 3U3GA 1BMRA 3GOIA 2FF3B 3LP1A 4K43A 2YHBA 3CMEN 4DR7K 2MBKA 3SAHA 1GLDG 2HOEA 5JICA 5AQGA 2O8BA 4F8RA 2N66A 1TK0A 4BRMA 2V7ZA 3RTVA 2KZMA 3N4QA 4CBUA 4CD3A 3LP2A 5AQXA 4YORA 4DLEA 4CERA 3U9DA 1DJTA 2OPSA 3EYZA 1L3SA 2PY5A 1OKJA 3K5NA 3A5NC 3DOKA 3V9ZA 4E1MA 1REVA 4I2QA 3RR8A 5EX5A 3VQDA 3TTDA 3GKUA 4IO8A 1P00A 4FJJA 1BOTO 1S9EA 4CFDA 3T1HK 3BUZB 3ISNC 2E2NA 1C0MA 2AA4A 1RTJA 2Q3SA 2KFZA 4PUOA 3LDPA 4JNEA 1YJ9N 1KQSM 2IVPA 4KB1A 4DR5K 4UAFE 3KOXA 3H6EA 2B68A 3D7EO 4K41A 1LWFA 4BG8A 4CVNE 3L8BA 1FJGK 2D0BA 3ENHA 3QBXA 4FM2A 1KC8O 3A8YA 1LWEA 1W97L 3AAPA 3TAFA 3VQCA 1WSHA 1JZBA 3VETA 4KPYA 4LC9B 4GKJK 2N69A 4KHSA 2XY6A 1VSHA 1ZBSA 3ENBA 1S72N 1RDDA 4AHUA 5GIPA 4CI6A 2WUSA 4ISGA 2P9KA 3DLRA 3E9LA 5CY0A 3VQ6A 5F1XA 1QQMA 3AVLA 5M1QA 1RT1A 4A59A 1IV0A 3UB5A 4FLYA 3VEZA 2ASMA 3LWLA 2PFUA 4M3RA 5C10A 3GL1A 1JXEA 1S22A 3QEIA 2V7YA 1HNZK 2A7TA 3DYAA 1A5VA 3ALYA 3L4QA 3EZWA 4CJ7A 1I2UA 4H0TB 3ULEA 4H5TA 4OPHA 5FRNA 4DU1A 3TU5A 4KBOA 1S6QA 4CK3A 1T7PA 2VWKA 2FBYA 2ASCA 1UGLA 4W5QA 3O1WA 2LY6A 4Q0BA 4DTNA 1J9AA 5TKYA 3ZSRA 4DF8A 5I3UA 4DTUA 4DSLA 3SPYA 4N41A 3E01A 2YCHA 3QIOA 1HJRA 3TAPA 2HHHK 3ASMA 4K8ZA 1BGXT 4GY2B 3EO3A 4DR1K 3RR7A 4HCBA 4CJTA 4LF8K 1XNRK 4BRQA 3P31A 1IJJA 2YX6A 1BDGA 2W6LA 5HBMA 2YNFA 1J5EK 4FWRA 3KLFA 1OVQA 3G25A 4M3XA 3P1GA 3FFKB 5CE3A 3AA3A 1I39A 4LSLA 3K59A 4BRLA 2OZMA 5C0YA 4I6MA 3KOWA 1EO1A 3WNEA 2M8BB 1RT3A 1NOYA 4Y0WA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3M6G A;  5KPT A;  4FM1 A;  2PAV A;  3NGZ A;  3OYG A;  3SNN A;  1ZFU A;  1ITG A;  5KQD A;  4IO9 L;  1M90 O;  1C0F A;  2ETJ A;  4FW2 A;  4DU3 A;  3DXM A;  1EX4 A;  4LF9 K;  1IH7 A;  1TUY A;  2E88 A;  4MLH A;  3R1X A;  5K14 A;  1NGI A;  2Z1I A;  3NVK A;  1MDU B;  3HPO A;  4DV5 K;  2P9S B;  4GVE A;  4L3Q A;  1RT6 A;  1L5U A;  2KTQ A;  3NHG A;  3HXM A;  3HVR A;  4RTF D;  4DQR A;  3SQ1 A;  3OVN A;  4JD2 B;  3PO4 A;  1NJY A;  3I8D A;  3AO3 A;  2OZS A;  3L3U A;  5JMV A;  3OYD A;  3S3N A;  3LM2 A;  1YF5 L;  4EP5 A;  4RW8 A;  4I2P A;  4BVO A;  5C42 A;  1SUQ A;  1RDC A;  2GBZ A;  3VQ5 A;  3SQ0 A;  2IDO A;  3C6T A;  4ILH A;  3WNG A;  3ZX0 A;  1LOT B;  4DTP A;  1UA1 A;  5LMU K;  4E7L A;  1XC3 A;  5AFU A;  3TAN A;  1SN1 A;  2E6M A;  1HNV A;  4G1Q A;  1JL2 A;  1TYQ B;  1J53 A;  1VHX A;  2LY5 A;  3S41 A;  1U49 A;  4Z4F A;  2EHG A;  2PZS A;  2JWK A;  4CJR A;  3QIC A;  5BPL A;  1NWK A;  3UKR B;  3LL3 A;  4CJK A;  1L3U A;  2HHW A;  4FPA A;  1YAG A;  3KD5 E;  4L8R B;  2FXU A;  4M3T A;  1LW0 A;  2HMP A;  3QNO A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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