5AQZA

Hsp72 with adenosine-derived inhibitor
Total Genus 123
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
123
sequence length
390
structure length
390
Chain Sequence
GSMAKAAAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVALNPQNTVFDAKRLIGRKFGDPVVQSDMKHWPFQVINDGDKPKVQVSYKGETKAFYPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDRTGKGERNVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVNHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASLEIDSLFEGIDFYTSITRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDLVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILIKSTRAAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Exploiting Protein Conformational Change to Optimize Adenosine-Derived Inhibitors of Hsp70.
pubmed doi rcsb
molecule keywords HEAT SHOCK 70 KDA PROTEIN 1A
molecule tags Chaperone
source organism Homo sapiens
total genus 123
structure length 390
sequence length 390
ec nomenclature ec 3.6.3.51: Transferred entry: 7.4.2.3.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5aqzA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqzA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqzA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5aqzA04
3JXUA 1RDWX 2NLXA 3H1QA 3VF2A 5FPEA 3EL2A 3EZWA 3BEXA 4L3QA 1GLLO 4XH4A 3QFPA 1D4XA 3O1BA 5AQLA 4IJAA 1BUPA 2VYPA 5LJVA 2D0OA 4A61A 2GEMA 1P8ZA 3CJCA 4KBOA 1NMDA 3FZKA 2QWMA 5AZIB 5AZJA 1QHAA 3ENHA 1GLCG 1QQMA 5AZJB 4BQZA 2ZWHA 3A0IX 3CI5A 4BG8A 4YDUC 4H5TA 1BG3A 1E4GT 4LC9B 4BR4A 5LY3A 4DQ8A 4BRAA 2A42A 2A5XA 5E26A 5BRDA 3VESA 3JS6A 5AR0A 3WEEA 3UKRA 3LDNA 2BUPA 5AQYA 3HM8A 4BRCA 2E8AA 5BPNA 5I9EB 3WEEB 1BO5O 2FF3B 5AQZA 4A2BA 4IJNA 3FR0A 3WQTA 4CZLA 2CH6A 3MCPA 4JNEA 1NGDA 5BPMA 5BREA 5KPZA 1U6ZA 4BRIA 2GUPA 1JCFA 1V4SA 3VEOA 4B1VA 3FLCO 4BVPA 3LM9A 1QQNA 3VGKA 1BDGA 1HKCA 3L6QA 4DHYA 1NGBA 4E1JA 1NGAA 1LCUA 1SZ2A 2PAVA 4BC5A 2P9IB 4BC4A 4BC3A 3VPZA 3H6EA 3BP8A 3ZEUB 4FPBA 4M7XA 1DKGD 1S3XA 4GY2B 3M6GA 4JD2B 4WYBA 2ZF5O 4CZEA 3CJAA 3U9ZA 1NGIA 3H46O 3J8AA 2QWPA 4Z94A 3DXKB 3H1VX 3CETA 4FOIA 4WQ4A 4M7YA 4H5NA 5AQSA 2UYTA 4PKHA 3DJCA 4JHDA 4IWVA 4MO4A 3R8EA 1X9JA 1YVNA 1XC3A 3LDPA 1MWMA 4O5FA 1HX1A 2Q0RA 3ZETB 2QWOA 4YDUA 3FGUA 5BN9A 5AQUA 4FWOA 2I7NA 4RCHA 3CJ7A 4BRHA 1NGGA 4CBUA 1IJJA 1SAZA 4CZKA 3LDQA 3H3NO 3WXLA 4BRPA 3ID8A 1YUWA 3QICA 2F9TA 4XEIA 2CGJA 3O4WA 5JLFA 2E20A 3QBXA 3D2FA 4BR9A 4IXCA 1NLVA 3KVGA 4JAXA 1ZXOA 5AFUA 4EAHD 2V52B 3LDOA 2GTDA 1YXQA 1TYQA 4IO8A 2AP1A 4RWTA 2FLOA 3AY9A 5BRFA 4K41A 1TYQB 3CJ9A 2GWKA 1T44A 3KZBA 1GLBG 1X3NA 1QZ6A 2D4WA 1NM1A 2Q1NA 4H5WA 2E2QA 3VEWA 5BN8A 3DAWA 2CH5A 4HWIA 4PKGA 4FWQA 4FO0A 4BQLA 4MLHA 4BRQA 1WOQA 5JICA 3FZLA 2FSJA 1LOTB 3LL3A 4K42A 2EWSA 5AQGA 5JLHA 1NGEA 3FZMA 1T6DA 2YHYA 3QMLA 3WXIA 3UB5A 3HBTA 1E4FT 2FXUA 4BG9A 4C23A 4CZJA 4BRDA 4QS7A 1XQSC 3GOIA 3ZX0A 1ZC6A 1DEJA 1GLJO 1Y64A 4QS8A 4BR0A 4BREA 5AQTA 3GE1A 3SMSA 2I7PA 3GL1A 4BRLA 4CZIA 4NO7A 5F2RA 1HUXA 2QXLA 2J4RA 5AQWA 3UKRB 4DCHA 4CD1A 4K43A 3IFRA 1GLEG 2E2NA 5FPNA 2FF6A 5E84A 1NGHA 4K25A 5BRHA 4WQ5A 4B1YB 3SJHA 5AQPA 3ENOA 2ITMA 3VGMA 4ISGA 2Q97A 2E88A 1S22A 4H0OA 3O8MA 4EIAA 2P9LA 5KQDA 3TPQA 5F0XA 5AQFA 2GWJA 1NGCA 3C7NA 1J6ZA 4QS9A 3CERA 3MDQA 3AARA 3F9MA 5AQKA 3VEVA 1MDUB 3R9PA 3C7NB 1MA9B 3DXMA 4EHTA 4CZGA 3FZHA 2V7YA 1BWFO 4BGBA 2P9UA 2HF3A 3B8AX 1GLAG 3DXMB 1ESVA 2HOEA 2GELA 3O6WA 3EKSA 4B1UB 4IZ9A 2QM1A 3CJBA 3O1WA 4BRKA 2F9WA 3A5LC 2VCPA 3M1FA 3FFKB 2V51B 1EQYA 3ZX2A 3LDLA 1ZBSA 3UE5A 3VERA 2YI1A 2CGKA 4JHDB 1NGFA 2V7ZA 5AQJA 2P9NA 3A5NC 2A41A 2Q36A 2BTFA 5AFUH 4A62A 2E1YA 4CJ7A 2P9NB 5AQVA 4HTLA 5AQRA 2P9KA 4GNIA 4B1WB 1DGKN 2Q31A 1ATRA 4H0XB 4H0TB 3QB0A 1KAYA 1NBWA 3VF4A 5LJWA 1OKJA 3MK6A 2ZGZA 4FWNA 1QQOA 3IUCA 2YJFA 2OANA 3L0QA 4CD3A 2E2PA 3SLCA 2ZGYA 3WXKA 2HF4A 4CI6A 5AQNA 5EVZA 1T6CA 4XH5A 1BOTO 2IVNA 4ISFA 2KHOA 3OHRA 4BRFA 1YAGA 3VF6A 2QWQA 3D2FB 2YHXA 3A5MC 4BRNA 3EN9A 3I33A 4FWLA 4B1ZA 3CIPA 1NWKA 1JCEA 3WUHA 4FWSA 3ZX3A 3W3DA 5B8HA 1XUPO 1MWKA 2E1ZA 1BA0A 3HI0A 1GLFO 3VEXA 3D2EA 4BC2A 3VENA 4FWKA 3L4IA 4H5VA 3FZFA 5ADXA 1C0FA 3D2EB 2CGLA 4FL9A 3LM2A 1Z6RA 3FE1A 5AQXA 3BF3A 4B9QA 4CBWA 2QWNA 2DPNA 1TUYA 3VEZA 3VOVA 1K8KA 3IMXA 2QWLA 3CQXA 1HLUA 3MMVA 5JMVA 1K8KB 3ATUA 4AM7A 3GDQA 1HJOA 3HSCA 4FOEA 5AZIA 3MN7A 1HKBA 1RGIA 2W41A 4CZHA 1RFQA 1JCGA 3MN5A 3O5BA 4EHUA 2FSNA 4WQ4C 3VEYA 1U2VA 1NGJA 5ELZA 4A2AA 4BRGA 4BGAA 1X3MA 3O80A 5EXWA 4H0PA 1U2VB 4H03B 5BPLA 5AQQA 3U8XA 1HPMA 2NRHA 4BR7A 1V4TA 3W0LA 2NZTA 4FWRA 3I8BA 4XH1A 4PL8A 4BRMA 1G99A 4JN4A 3SMPA 4FPAA 1Z05A 1IG8A 4CZFA 5AQIA 2Q2RA 4ISEA 3WXJA 3SK3A 5AQOA 2A6AA 1BU6O 3R6MA 2D0PA 4CBXA 4F9OA 1SQKA 2ASOA 2P9LB 3M3ZA 5FPMA 3P4IA 3IDHA 3WQUA 5AQMA 4BR2A 3VETA 3C0BA 4PKIA 2E2OA 2IVPA 4BVOA 2YJEA 2AA4A 1KAZA 3QDKA 1BA1A 4FWMA 5EY4A 3HZ6A 2P9UB 2FSKA 4H0VB 4FSVA 3AAPA 3ATVA 2H3GX 2P9IA 5KQ8A 4BR5A 3ZEUA 3GBTA 3HTVA 2IVOA 2ASPA 3GG4A 4H5RA 5TKYA 4JD2A 1C0GA 3WT0A 3S41A 4NB4A 3H45C 1KAXA 4MLEA 5AQHA 4EFHA 3DXKA 4H0YB 4RTFD 4Y0WA 1ATSA 2ASMA 3A5OC 3G25A 4AM6A 3MN6A 3RSEA 1KXPA 1TUUA 2P9KB 3BF1A 3DWLA 5KPTA 4FWPA 3RSEB 1QZ5A 3ZETA 3CQYA 5KPRA 3MN9A 5FPDA 5EOYA 2Q0UA 3EO3A 1H1VA 2A40A 5ADXH 2HMPA 2YCHA 2YHWA 3QBWA 5BR9A 1HKGA 3U9DA 4MO5A 3EKUA 3H3OB 2P9SA 2W40A 4DB3A 4J8FA 3U4LA 2QW9A 3UKUA 3CJ1A 4BROA 4CZMA 1WUAA 2D1KA 2P9SB 3A8YA 3O08A 3D7EO 2IIRA 2VWBA 3TU5A 4WQ5C 4I6MA 3UKUB 3QFUA 3KHYA 2P9PA 3CHWA 3VGLA 5EX5A 4I6MB 4M63C 1GLDG 1R59O 1Q18A 3ULEA 5F1XA 1CZAN 2P9PB 4B1XB 2QWRA 1ATNA 4PL7A 4O8KA 5CE3A 3BUZB 3ULEB 2WUSA 3AAQA 2A3ZA 2PBDA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4PWDA 2P5GA 4IBNA 1OZZA 3AA2A 4Z4EA 1GLLO 4KRFA 2GX9A 1BISA 3G4SN 3P38A 5LJVA 5BR8K 2D0CA 4CJFA 1BGXT 5K14A 2GEMA 1IKYA 4FK2A 2I61A 1BHLA 3CD6N 1QHAA 3AVHA 3CFPA 2I5JA 3CM6A 4N56A 4IOAL 3K9KA 3EYZA 1QQMA 2HHVA 2ZWHA 4CW7B 5GIPA 2OPSA 2PFUA 5A2QO 1JLAA 4H5TA 4UAFE 1BG3A 2WONA 2LJMA 1RBRA 1G15A 2Z1JA 4BR4A 4DQ8A 2A42A 1XRSB 1EX4A 1EWQA 2GMOA 4FJHA 3VESA 4O0JA 3PV8A 5AR0A 3RR7A 1FXXA 2BUPA 1T7EA 3QEIA 3HM8A 5CYMA 1BO5O 3ENBA 2HSTA 4A2BA 1QSSA 4KH6A 1LW2A 2RE2A 3SV3A 1SKWA 3VQ7A 4CF8A 4K8ZA 2XHBA 2GUPA 1JCFA 1V4SA 1RT1A 4M3XA 1QQNA 1QSLA 1BDGA 4CHPA 1EXQA 1TV6A 3AO4A 4X66K 1RILA 3LZJA 3TABA 1KFSA 1SN4A 2HNYA 1Q9YA 3ITHA 4BC4A 2ATBA 4E3SA 4M7XA 4DUZK 5SZTA 4JD2B 3CJAA 1TAUA 3O3GA 3H46O 3J8AA 1TKDA 1ITGA 3DXKB 4ZTJA 2YKNA 2OZMA 4JKGB 4WQ4A 4LFCK 1NK4A 2KBKA 1CZ9A 4PKHA 4DFJA 4LF9K 2JDQD 2HBLA 4HVJA 4AILC 1XC3A 4J2DA 2C1GA 3LDPA 2NUBA 4CIGA 3K9JA 2QWOA 4YDUA 5BN9A 1GOCA 1OVQA 2RKIA 4DTXA 1B7DA 2C1IA 1NGGA 2HBMA 4CZKA 4KHQA 4CF9A 1A5XA 1DTTA 2HHTA 1J5OA 3CXCM 5AJ3K 1NK0A 3QICA 1RBUA 2F9TA 3HOSA 4XEIA 2CGJA 1BIUA 3MWTA 1BCMA 5JLFA 4W5RA 3QBXA 1KD1O 2UU9K 1VQ9N 4BR9A 1NK5A 2E3FA 2FBVA 4JAXA 2YNIA 3HRGA 2V52B 4B3OA 3LDOA 3CPWM 1L3SA 4AB0A 3BZKA 2HMIA 1QHTA 2Z1IA 4K41A 1TYQB 3LDSA 3OYJA 1X3NA 4CEDA 4DSLA 1X9SA 3LALA 1B9DA 4JYAK 1NM1A 2E2QA 2X74A 5BN8A 4NYFA 4EZ9A 3VQ9A 3VQCA 4MLHA 1WOQA 4R5PA 3KOWA 3AVMA 1U48A 3DYAA 1SL1A 4K42A 4X62K 2UXBK 5AQGA 5JLHA 1JLBA 3WXIA 3UB5A 2FXUA 4BRDA 4CJ3A 1XQSC 4C8KA 2O8DB 2A1SA 1KC8O 1GLJO 1Y64A 1ZUTA 3TTCA 4BREA 2I7PA 5HLFA 4FLWA 5J2PA 4DQQA 3HK2A 3LWLA 4CIEA 4NO7A 5AQWA 3UKRB 4DCHA 1N8RO 4CD1A 3IFRA 2E2NA 5T7BA 5E84A 3LP2A 4K25A 2BE2A 1Q82O 1J53A 1WT7A 5AQPA 3VGMA 2E88A 4AHCA 2DFFA 3HPOA 3OYEA 2P9LA 4A5BA 3TPQA 5F0XA 4AHVA 2IS3A 1NGCA 2N2QA 2KGQA 4KHPK 3CCMN 3U3GA 2VG5A 4DSEA 3VEVA 3C7NB 1MA9B 4EHTA 3SYZA 4EZ6A 3T1AA 3TTFA 4UY8O 4CZGA 3FZHA 1BWFO 2P9UA 3B8AX 1OH5A 4CERA 3L2VA 1KVCA 4L8RB 3LWMA 3AVKA 3P83D 3K5OA 2VCPA 4MDAA 1HYSA 3LPTA 1DT9A 1XHXA 2V51B 4WFAL 3ASMA 4FLVA 1ZBSA 3SPZA 3VERA 4W5OA 3L3VA 2IOCA 5HRPA 1W9HA 1NGFA 2IAJA 4CHYA 4CEAA 3OBYA 1RDUA 3V9UA 3B6PA 2P9NB 3C6HA 4YOTA 2NRRA 2KBJA 4CFAA 1CHZA 1DGKN 5KGWA 4FM0A 3QB0A 3E9PA 4O55A 3CFOA 4CVNE 5C25A 3SUQA 1T03A 1T8EA 4FJLA 2KSKA 2G8FA 1HNWK 2D0AA 3L0QA 3KLFA 2HF4A 4OGCA 4KTQA 4BWJA 4ELVA 4HHFA 4CGJA 5AQNA 5EVZA 4CJTA 4XH5A 2EX3A 2KHOA 3OHRA 4BRFA 3D2FB 2YHXA 4BRNA 4CFBA 4I2QA 4CJUA 3PX6A 1SKSA 3BGRA 1JCEA 4DLGA 1HQEA 3ZX3A 4LY7A 1HYVA 1XWLA 1NJYA 2E1ZA 3DLKA 4G9ZA 2UUCK 1GLFO 1UA1A 4BDZA 1T7AA 5TKWA 2JLEA 4Z4GA 4JKEA 3O3HA 3I0SA 5GINA 3S5TA 4DFMA 5AQXA 5E41A 4PQUA 2HNDA 2UUAK 3BK3C 3V9XA 3RMDA 4BEBA 3J80O 1BI4B 3VOVA 3IMXA 2BANA 3CCUN 2DFHA 2A1RA 4IG0A 5JMVA 3GDQA 3F73A 1RTHA 1HKBA 4WCEL 2HB5A 3OYIA 1RFQA 4CK2A 4YOYA 2FSNA 4A59A 4KREA 3ULDA 1WNSA 4BRGA 1FKPA 1F21A 5AQQA 5BPLA 3U8XA 1XC9A 4M41A 2ZD1A 4J2AA 4XH1A 1CZBA 3I8BA 3MECA 4PL8A 2O8CA 1G99A 1NJIO 4ILGB 2RPIA 1IG8A 1VSKA 3SK3A 2GL1A 1HNVA 1TGOA 1LQQA 3AO3A 2VWKA 1ZBLA 2BH1A 2D0PA 4CBXA 4F9OA 1C0MA 1ILYA 3L2QA 4F2SA 3IDHA 3WQUA 4DTSA 3P31A 3C0BA 2QTDA 2AA4A 3TSPA 1VSIA 4M3RA 4Z4IA 3V9ZA 1BA1A 1FW6A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4PWD A;  2P5G A;  4IBN A;  1OZZ A;  3AA2 A;  4Z4E A;  1GLL O;  4KRF A;  2GX9 A;  1BIS A;  3G4S N;  3P38 A;  5LJV A;  5BR8 K;  2D0C A;  4CJF A;  1BGX T;  5K14 A;  2GEM A;  1IKY A;  4FK2 A;  2I61 A;  1BHL A;  3CD6 N;  1QHA A;  3AVH A;  3CFP A;  2I5J A;  3CM6 A;  4N56 A;  4IOA L;  3K9K A;  3EYZ A;  1QQM A;  2HHV A;  2ZWH A;  4CW7 B;  5GIP A;  2OPS A;  2PFU A;  5A2Q O;  1JLA A;  4H5T A;  4UAF E;  1BG3 A;  2WON A;  2LJM A;  1RBR A;  1G15 A;  2Z1J A;  4BR4 A;  4DQ8 A;  2A42 A;  1XRS B;  1EX4 A;  1EWQ A;  2GMO A;  4FJH A;  3VES A;  4O0J A;  3PV8 A;  5AR0 A;  3RR7 A;  1FXX A;  2BUP A;  1T7E A;  3QEI A;  3HM8 A;  5CYM A;  1BO5 O;  3ENB A;  2HST A;  4A2B A;  1QSS A;  4KH6 A;  1LW2 A;  2RE2 A;  3SV3 A;  1SKW A;  3VQ7 A;  4CF8 A;  4K8Z A;  2XHB A;  2GUP A;  1JCF A;  1V4S A;  1RT1 A;  4M3X A;  1QQN A;  1QSL A;  1BDG A;  4CHP A;  1EXQ A;  1TV6 A;  3AO4 A;  4X66 K;  1RIL A;  3LZJ A;  3TAB A;  1KFS A;  1SN4 A;  2HNY A;  1Q9Y A;  3ITH A;  4BC4 A;  2ATB A;  4E3S A;  4M7X A;  4DUZ K;  5SZT A;  4JD2 B;  3CJA A; 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