5AQZA

Hsp72 with adenosine-derived inhibitor
Total Genus 123
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
123
sequence length
390
structure length
390
Chain Sequence
GSMAKAAAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVALNPQNTVFDAKRLIGRKFGDPVVQSDMKHWPFQVINDGDKPKVQVSYKGETKAFYPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDRTGKGERNVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVNHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASLEIDSLFEGIDFYTSITRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDLVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILIKSTRAAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Exploiting Protein Conformational Change to Optimize Adenosine-Derived Inhibitors of Hsp70.
pubmed doi rcsb
molecule keywords HEAT SHOCK 70 KDA PROTEIN 1A
molecule tags Chaperone
source organism Homo sapiens
total genus 123
structure length 390
sequence length 390
ec nomenclature ec 3.6.3.51: Transferred entry: 7.4.2.3.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5aqzA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqzA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqzA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5aqzA04
2NRHA 2E2QA 3MN6A 3GDQA 2FF6A 2FSNA 3H46O 1YAGA 5EY4A 4I6MB 4B9QA 3A5NC 3IUCA 5KQDA 2A41A 3H6EA 1BWFO 1NGGA 1X3MA 1XQSC 3MDQA 5LJWA 5BR9A 1IG8A 3G25A 3TU5A 1P8ZA 1NGHA 3LM2A 4B1WB 1HKBA 3SJHA 4BQZA 3WXIA 3H1QA 2Q36A 4A62A 3WXJA 2FSKA 3CQXA 3FLCO 1QQMA 3L4IA 1OKJA 1BO5O 4DB3A 4CZEA 3DXMB 3SMPA 4CBXA 2P9IB 3C7NB 5I9EB 3EZWA 3RSEA 2QWQA 2F9TA 2D0PA 3I8BA 4B1UB 3ZX0A 1C0FA 1QZ5A 4PKIA 5AQSA 4EHTA 1KAYA 2QWNA 3B8AX 2V52B 3L6QA 3WQTA 2Q31A 3A5OC 2E2OA 1K8KA 3UKUA 1HLUA 1KAZA 4H0TB 3LL3A 3WXLA 1YXQA 3LDLA 3BF3A 4MO5A 2WUSA 3EKUA 4Y0WA 3CJAA 2P9PB 3ID8A 3CJ9A 2A42A 2E8AA 2HMPA 3KVGA 1Z6RA 2ASOA 4ISEA 4Z94A 1ZC6A 1DEJA 1BUPA 2VWBA 1NGBA 2YJFA 3D7EO 1NWKA 3MCPA 3VEVA 4BRCA 3ZX2A 4CD1A 3BF1A 3W0LA 3EL2A 3O08A 1D4XA 3J8AA 3VENA 4KBOA 1GLCG 2J4RA 3AY9A 3R6MA 3ZX3A 5FPDA 4WQ5C 1QHAA 3VEOA 1ZBSA 4A2AA 4XH4A 3CJ7A 5JLHA 5JMVA 4FWSA 4CBWA 3WQUA 1NGCA 3D2EB 1V4SA 3VEYA 1MDUB 2IVNA 1RFQA 4FWNA 2E2NA 2QWRA 1QZ6A 2IIRA 5CE3A 1HUXA 2YI1A 4L3QA 1KAXA 3D2FA 2OANA 5AQZA 4IXCA 4WQ4C 4CZIA 4E1JA 3LDQA 3WUHA 5BPLA 3UKRA 1TUYA 3VGLA 5JICA 2GEMA 3WEEA 1BOTO 5ADXH 2NLXA 5EVZA 1NMDA 4H5RA 1MWMA 3U9DA 3IFRA 4A61A 2QWPA 5BRFA 4H0XB 2E1ZA 2P9SA 2P9NA 2Q1NA 5BN8A 3CERA 2H3GX 4FWOA 2DPNA 1NLVA 4H5WA 2D4WA 1EQYA 4NO7A 5B8HA 4GY2B 4BRKA 3UKUB 4JD2B 4BRHA 3O8MA 3H3NO 1DKGD 3BEXA 4BC5A 4JAXA 4F9OA 4HTLA 3WT0A 4JHDA 1C0GA 5AQUA 4FWPA 4CBUA 3VOVA 4H5TA 1Q18A 3VERA 4BR4A 5AQTA 3M6GA 1U2VB 4RTFD 4C23A 3BP8A 2P9KA 2HF3A 5AQLA 4EIAA 3SLCA 2QM1A 4IWVA 4BRNA 1SAZA 3CIPA 2E88A 5AQIA 3MK6A 3VEWA 4M7YA 5AFUH 5F2RA 3C0BA 3DXKA 2FXUA 3H1VX 2GUPA 3MMVA 4K43A 1T6CA 5AQRA 4YDUA 2YJEA 1GLLO 3SK3A 2HF4A 1JCFA 1LOTB 3S41A 5EX5A 3KHYA 4CZLA 3QICA 2Q0UA 3ENHA 3QDKA 5BPNA 1HKCA 1Y64A 4BGBA 1SQKA 1S22A 2AA4A 3FGUA 1NGJA 1G99A 1HPMA 1JCEA 2V51B 4BRDA 3ENOA 4MLHA 3GE1A 4QS7A 1BG3A 2A5XA 1GLDG 3DAWA 4ISGA 3FZMA 4WYBA 4BRQA 3FFKB 4BR9A 3AAQA 3O1WA 4H03B 3FZFA 2CGKA 1MA9B 4H0PA 4XH5A 1WOQA 5F0XA 4H0OA 3ZETB 2P9SB 2BUPA 2W40A 3CQYA 2CH5A 2P9LA 3M1FA 1RGIA 1ZXOA 2YHXA 3O4WA 3R9PA 3R8EA 3HBTA 2ASPA 1ATNA 1JCGA 2QWOA 1RDWX 4BRIA 3F9MA 1HKGA 2CGJA 3ZEUB 5AQXA 4B1ZA 4BG8A 2P9UA 4O8KA 4FOEA 3CETA 5FPEA 2ITMA 4K25A 3U8XA 2YHYA 3ULEA 3HSCA 4AM7A 2D1KA 3FZKA 3L0QA 5KQ8A 3FR0A 4CZKA 5AZJA 3QBXA 4RCHA 3UB5A 1X3NA 4BRAA 3JS6A 1TYQA 4K42A 1BU6O 2NZTA 2KHOA 3I33A 3TPQA 4CZFA 2I7NA 2P9IA 3C7NA 3WXKA 2QWMA 5AQJA 4BR2A 3DJCA 5AQPA 2YCHA 3RSEB 2VCPA 3O5BA 4HWIA 5AQVA 5AR0A 3MN9A 4FWKA 4B1XB 3A5LC 2F9WA 5AQWA 2BTFA 4WQ4A 3LDPA 2GWJA 3O1BA 1S3XA 5KPZA 2IVPA 4H0VB 4BRMA 4FWRA 4EHUA 1X9JA 3EO3A 3BUZB 2VYPA 2AP1A 4NB4A 4QS9A 3CJBA 1K8KB 3EN9A 5AQQA 1H1VA 4RWTA 3QMLA 1E4FT 2V7YA 5AQYA 2GELA 3QFUA 2P9PA 5BN9A 3UE5A 1T44A 1HJOA 1YVNA 1NGIA 3VEXA 5EOYA 3KZBA 4FWMA 1NGDA 5E26A 3QB0A 2E2PA 4M7XA 3MN5A 4CI6A 2D0OA 1ESVA 2E20A 4H0YB 3MN7A 4BRGA 3IMXA 5AQNA 3OHRA 5JLFA 5BRDA 4JNEA 4H5NA 4PKGA 2UYTA 2EWSA 4BR0A 3GBTA 1NGEA 5AQKA 4FOIA 3LDNA 2P9UB 4M63C 3A0IX 1ATSA 3A5MC 3D2EA 4LC9B 3ATUA 2Q0RA 4YDUC 3ULEB 4BRLA 2QW9A 3HM8A 5AQMA 2A3ZA 3JXUA 2I7PA 4IJNA 4O5FA 4A2BA 5FPMA 1E4GT 2HOEA 4IJAA 4FPBA 1GLAG 3VESA 5AZJB 3O6WA 3ATVA 2GTDA 4K41A 1QQNA 5LJVA 2A6AA 3H45C 4XH1A 3FE1A 4FWQA 3D2FB 1TYQB 4BR5A 3GG4A 1T6DA 3A8YA 4CZJA 3FZLA 3U4LA 3LDOA 1XUPO 4BG9A 4IZ9A 1GLBG 3UKRB 1XC3A 3QBWA 3WEEB 4PL7A 4AM6A 4B1YB 2FLOA 3IDHA 3M3ZA 5AFUA 4IO8A 5BREA 1BA0A 3VF2A 4EFHA 2IVOA 3GL1A 5E84A 5BPMA 3GOIA 4GNIA 3EKSA 5AQHA 1QQOA 1NGFA 1ATRA 3CJ1A 3H3OB 4BC4A 4CJ7A 4CZGA 2P9NB 4BRPA 3DWLA 3O80A 4FPAA 5FPNA 1WUAA 3CJCA 4JD2A 1V4TA 4B1VA 5KPTA 2Q2RA 4EAHD 5TKYA 3CI5A 3VF6A 5AZIA 4DHYA 3QFPA 1LCUA 1U2VA 4FL9A 4JHDB 1KXPA 3CHWA 1DGKN 2ZF5O 5AQOA 4BREA 5AQFA 4I6MA 4BC2A 4BQLA 4H5VA 2P9KB 3HTVA 4JN4A 2W41A 3W3DA 1R59O 1GLFO 2FF3B 1GLJO 4ISFA 1NM1A 4WQ5A 1SZ2A 1NGAA 2A40A 3VGKA 3DXKB 3DXMA 3VGMA 3VEZA 3FZHA 4DCHA 1Z05A 2Q97A 3HI0A 5F1XA 5KPRA 2CH6A 2FSJA 4MO4A 1IJJA 1GLEG 2ZWHA 4FWLA 4BR7A 3VPZA 2ASMA 1BDGA 4BVPA 2GWKA 5AQGA 3VETA 2ZGYA 1MWKA 4PKHA 4BROA 4QS8A 4BVOA 3AAPA 4BRFA 4CD3A 2PBDA 2CGLA 4BGAA 3SMSA 4FSVA 1TUUA 1U6ZA 2YHWA 2QXLA 1NBWA 3VF4A 1BA1A 4J8FA 4BC3A 4CZMA 3ZETA 4MLEA 4XEIA 2V7ZA 4FO0A 5LY3A 2QWLA 4PL8A 3HZ6A 5ELZA 5ADXA 2P9LB 2ZGZA 3U9ZA 5BRHA 3AARA 3ZEUA 3P4IA 4CZHA 4DQ8A 2E1YA 1CZAN 3LM9A 1HX1A 5EXWA 5AZIB 1J6ZA 1YUWA 2PAVA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1VRUA 2E2QA 3VQCA 3CM5A 3AV9A 3KTQA 3RVCA 3AVLA 4ELVA 5EY4A 4B9QA 4O0IA 2HHIA 3H6EA 1NGGA 4B9MA 5LJWA 1A5VA 1IG8A 1P8ZA 3WNHA 2JGUA 2DY4A 1K73O 1ZBUA 3QNNA 3ENBA 2Q36A 3K2PA 3THVA 3CQXA 2HW3A 3FLCO 2HHTA 1NG9A 4CBXA 2P9IB 3C7NB 3RSEA 2GL1A 2C1GA 5IT9O 4KO0A 3V9SA 5K14A 3I8BA 4N41A 4E7JA 3TSUA 3UIQA 4XJXA 4WFAL 3L4QA 3B8AX 3LZIA 1IKXA 2V52B 3K5OA 4FJLA 3KD5E 1QHTA 1HLUA 3BF3A 4CJKA 4AB0A 4F2SA 4MO5A 3EKUA 1TKTA 2X6SA 2Q3SA 3ID8A 3CJ9A 2A42A 2HBMA 4KH5A 4CJQA 3KVGA 4CIFA 3SQ0A 1Q7YO 1M90O 1Z6RA 3HJFA 2P5GA 1JZBA 1DEJA 4AILC 5KTQA 1XC9A 1OH7A 3D7EO 4DQSA 3MCPA 3VEVA 4FLWA 3ZX2A 2QEXN 3BF1A 4IDKA 2QXFA 3QEWA 3OJUA 4L8RB 3K0SA 4CGGA 2J4RA 3AY9A 5CY0A 1W9HA 1YJWN 2KZZA 1E3MA 4BECA 3CJ7A 3PO4A 3V4IA 4FWSA 3WQUA 1NGCA 1EO1A 1A5XA 1S1XA 2KBJA 1RFQA 3EE8A 3KD1E 1NE5A 3DOKA 3DOLA 3T69A 4IOCL 1HUXA 1NJWA 5AQZA 3N4QA 4LH5A 4CZIA 4E1JA 1PE4A 4E1NA 3LDQA 3J7YP 3WUHA 5BPLA 1WNSA 1BOTO 1ZVGA 4CHOA 1MWMA 4KRFA 1T3VA 4CVNE 2YHAA 2QWPA 5BRFA 2E0HA 2E1ZA 2P9SA 1RTJA 1P0AA 3CERA 3LALA 3C6HA 1VQ4N 3PV8A 4GV6A 3SJJA 4OLAA 2D4WA 1EQYA 4NO7A 4BRKA 2X74A 3I0SA 4JD2B 4DTRA 4DTMA 1RCHA 3SZ2A 3QO9A 3SQ2A 1EKEA 4JI0K 5AQUA 1UOCA 1CZBA 4FWPA 1EXQA 4H5TA 4BR4A 1WBDA 2ZJPL 5AQLA 2E2FA 4N5SA 2YKNA 2O8FB 4IWVA 4M3ZA 5HRNA 2QKBA 5AQIA 3ZT0A 3VEWA 4CF1A 2B6AA 3DMJA 3EE9A 3C0BA 3DXKA 1B9DA 1JL1A 1GOCA 4FJ8A 3OTOK 1GOBA 1WB9A 2YIPA 1T6CA 4KFBA 1S72N 2YJEA 3AA3A 2N69A 3ZT1A 5C25A 4JV5K 2LKBA 1S6PA 1JCFA 3Q7BA 1W0HA 5HL7L 1YVUA 1R0AA 2KJAA 3QICA 2Q0UA 3ENHA 4ILGB 3QDKA 1ZBIA 1UGLA 5BPNA 1HKCA 1SQKA 2AA4A 3KK3A 3HYFA 3I55N 4FYDA 1HPMA 1LQIA 4YY3K 2HHQA 2V51B 2IAJA 3ENOA 3RWUA 4MLHA 1BG3A 4BDZA 3DAWA 3HP6A 3S3NA 1N33K 3VMFB 4DFMA 3SF4D 4CEDA 3PX0A 4BRQA 4BR9A 4JKGA 3AAQA 1QSYA 2KZMA 1WMTA 2OPPA 3CQYA 1N5YA 1WSIA 2P9LA 1VSLA 2YHXA 5LMUK 3TI0A 2Z1GA 2NUBA 3KLEA 3F73A 1LAWA 1JCGA 4BDPA 3F9MA 4CK2A 4M45A 5HRPA 5IWAK 2ATQA 3CETA 2ITMA 1J5OA 1RT2A 2YHYA 1L3UA 3OYLA 1HYSA 4PHTX 4KHQA 1BIUA 3E7UX 3KOWA 3AVBA 5KQ8A 4ZTFA 1TAUA 4OVLA 5DM7L 1FK9A 2D56A 4BRAA 2PFUA 2K35A 2UXCK 4K42A 2VG6A 2OPQA 4CZFA 2I7NA 4E1MA 4FM2A 3RR8A 1KV0A 1OZZA 2PYJA 3AO5A 3DJCA 4N76A 4NLBA 1VSHA 3O5BA 4HWIA 5AQVA 3MN9A 2D0CA 1XNQK 1JLCA 2O8BA 3O1BA 4NXNK 4H0VB 4BRMA 4EHUA 1LV5A 3BUZB 4W5QA 3SYZA 1N34K 1B9FA 3NCIA 2YKMA 4QS9A 1WSHA 3CYMA 5LL6Z 4CHYA 3QMLA 2D0AA 3OYKA 1PTXA 2GELA 3QFUA 3UE5A 5C10A 4Q5VA 3HK2A 4IKFA 4E7KA 1VQKN 3VEXA 5EOYA 4C8OA 4FWMA 3VTHA 4M7XA 1WSJA 3DLRA 3LP3A 5AQNA 2UYTA 3MCAB 3TTDA 4Z4HA 2EWSA 4BR0A 1T0ZA 3TANA 1N8RO 4WFNL 2F8TA 1GPTA 2P9UB 4CEAA 3VQDA 1ATSA 1QSSA 3A5MC 1JJ2M 3E1YA 4DSEA 4AH9A 3ID6A 3J80O 1VQLN 2QW9A 4XIUA 1JL2A 4M3TA 4AAZA 4X62K 3JXUA 1QVFM 2LI7A 4A2BA 2JWLA 1E4GT 3OW2M 1NKCA 3VESA 1BK8A 2GTDA 4K41A 3LWLA 4DTPA 3K9KA 4GW6A 1T6DA 3K9JA 3L8BA 4CZJA 3O9QA 4YOYA 2HMIA 3G4SN 1XUPO 1VQNN 1GLBG 3UKRB 2XY8A 1LAVA 3WEEB 4AM6A 3DRRA 3BGRA 4B1YB 2FLOA 2GBZA 4FZZA 4YOVA 3SQ4A 2OTJN 3GL1A 5E84A 3V81A 5BPMA 3EKSA 1VQPN 4CZGA 4KI6A 5HOOA 3HPGA 1KD1O 2HVHA 3QIOA 3AVIA 4QCLA 4B1VA 4EAHD 2HHSA 5C15A 4B3TK 1OH8A 4DHYA 3QFPA 3NGIA 3T1HK 3CCMN 1DGKN 2ZF5O 3QERA 1T8EA 4I6MA 3JAMO 5C2FA 3HPHA 4WE1A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1VRU A;  2E2Q A;  3VQC A;  3CM5 A;  3AV9 A;  3KTQ A;  3RVC A;  3AVL A;  4ELV A;  5EY4 A;  4B9Q A;  4O0I A;  2HHI A;  3H6E A;  1NGG A;  4B9M A;  5LJW A;  1A5V A;  1IG8 A;  1P8Z A;  3WNH A;  2JGU A;  2DY4 A;  1K73 O;  1ZBU A;  3QNN A;  3ENB A;  2Q36 A;  3K2P A;  3THV A;  3CQX A;  2HW3 A;  3FLC O;  2HHT A;  1NG9 A;  4CBX A;  2P9I B;  3C7N B;  3RSE A;  2GL1 A;  2C1G A;  5IT9 O;  4KO0 A;  3V9S A;  5K14 A;  3I8B A;  4N41 A;  4E7J A;  3TSU A;  3UIQ A;  4XJX A;  4WFA L;  3L4Q A;  3B8A X;  3LZI A;  1IKX A;  2V52 B;  3K5O A;  4FJL A;  3KD5 E;  1QHT A;  1HLU A;  3BF3 A;  4CJK A;  4AB0 A;  4F2S A;  4MO5 A;  3EKU A;  1TKT A;  2X6S A;  2Q3S A;  3ID8 A;  3CJ9 A;  2A42 A;  2HBM A;  4KH5 A;  4CJQ A;  3KVG A;  4CIF A;  3SQ0 A;  1Q7Y O;  1M90 O;  1Z6R A;  3HJF A;  2P5G A;  1JZB A;  1DEJ A;  4AIL C;  5KTQ A;  1XC9 A;  1OH7 A;  3D7E O;  4DQS A;  3MCP A;  3VEV A;  4FLW A;  3ZX2 A;  2QEX N;  3BF1 A;  4IDK A;  2QXF A;  3QEW A;  3OJU A;  4L8R B;  3K0S A;  4CGG A;  2J4R A;  3AY9 A;  5CY0 A;  1W9H A;  1YJW N;  2KZZ A; 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