5BPLA

Crystal structure of adp and pi bound human hsp70 nbd mutant r272k.
Total Genus 125
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
125
sequence length
380
structure length
380
Chain Sequence
KAAAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVALNPQNTVFDAKRLIGRKFGDPVVQSDMKHWPFQVINDGDKPKVQVSYKGETKAFYPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDRTGKGERNVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVNHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACERAKKTLSSSTQASLEIDSLFEGIDFYTSITRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDLVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILMG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Nucleotide binding to variants of the HSP70-NBD.
rcsb
molecule keywords Heat shock 70 kDa protein 1A
molecule tags Hydrolase
source organism Homo sapiens
total genus 125
structure length 380
sequence length 380
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-05-28
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5bplA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5bplA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5bplA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5bplA04
4DHYA 3DXMB 3ATVA 3KZBA 4ISGA 2ZWHA 4FOIA 3W3DA 4H03B 3ENHA 5AQSA 3EKSA 2P9PA 3CJ9A 2ITMA 1RDWX 3A5LC 3IDHA 3EKUA 1GLJO 1GLFO 2PAVA 4IJNA 3O80A 4CD1A 1TUYA 4PKHA 1NGEA 4PKGA 4EAHD 4K43A 4JNEA 4FO0A 3L6QA 4CJ7A 1GLLO 4JD2B 4XH1A 5JICA 3VGLA 1NBWA 3MCPA 4BR5A 3QICA 5EX5A 3MN7A 5BRFA 1X9JA 4H5WA 2GELA 3C7NA 4CBWA 3P4IA 2P9KB 4IXCA 2GWKA 1ATRA 3MN5A 5ELZA 3SLCA 2CH6A 4IWVA 3VETA 4GY2B 3A0IX 3S41A 3LDPA 3CQXA 3WXJA 1MWKA 3O8MA 5BR9A 4Y0WA 3VPZA 2E2NA 4AM7A 4ISFA 2FSKA 4BRMA 4B1UB 1U2VA 5AQVA 4B1YB 4EIAA 4H5RA 3EN9A 5AQHA 4B1VA 3G25A 4BRKA 4JN4A 3QFUA 3GL1A 1HKCA 4CZJA 2QW9A 4FPAA 3O4WA 4XH4A 4BRLA 2A40A 5KQ8A 4BR0A 5FPMA 4A61A 2ASMA 4H5NA 2OANA 2QWMA 4H0XB 2WUSA 4DB3A 3SK3A 3GOIA 4Z94A 3LDOA 2QWRA 1IJJA 2V51B 3H3NO 3LDLA 4YDUC 4BRDA 1EQYA 3O5BA 2VWBA 4CZKA 5AZJA 2AP1A 3JXUA 4KBOA 2W41A 3DWLA 4FSVA 1HLUA 1Z05A 1J6ZA 2YJEA 2E8AA 2Q97A 4BQLA 3VF2A 4M7YA 1K8KA 3JS6A 2YCHA 4FL9A 4H0TB 4BRAA 5EXWA 1SQKA 1BA1A 1BDGA 1KAXA 5AQWA 4BRIA 1RGIA 5BN9A 4WQ5C 2FF6A 5EY4A 3DXMA 4O5FA 3SMPA 4H0YB 4BGAA 3R6MA 1GLBG 3MDQA 3HSCA 4FPBA 5AFUA 4EHTA 3QFPA 5AQZA 3BP8A 4BR2A 4K42A 2QWPA 1JCFA 3IUCA 4L3QA 1HX1A 4BR4A 4FWMA 3FE1A 4FOEA 4H0PA 5BRHA 4B1XB 3CQYA 2KHOA 5BREA 1QQNA 2DPNA 3HM8A 1C0FA 5AQKA 2Q1NA 3GE1A 4JD2A 3RSEB 1K8KB 1S22A 3BEXA 3F9MA 4QS9A 2YHXA 4A2AA 4BC4A 4BC3A 3M6GA 4BG9A 1YUWA 2A41A 4PL8A 1JCEA 3H1VX 3MMVA 3A5MC 4J8FA 4CZFA 2P9KA 4IZ9A 3FFKB 2A42A 4BRGA 3CETA 3I33A 2QWLA 5F0XA 2E88A 4JHDA 3CJ7A 3C0BA 4DCHA 2F9TA 1P8ZA 3FZFA 1BG3A 1JCGA 3ZETB 4MO5A 1BO5O 3CJAA 5F1XA 3B8AX 2FSNA 2CGJA 2GTDA 1QZ5A 3A5NC 4BROA 3UKUA 4A62A 3A8YA 1KAZA 2CGLA 5AQGA 3IFRA 4RWTA 2HF3A 3MK6A 2W40A 1NGDA 1NGIA 1NGGA 1HUXA 3I8BA 4BRPA 3TPQA 3O1BA 1S3XA 5AR0A 1ZXOA 3R9PA 1ATNA 4BC5A 2V7YA 5KPRA 4BR9A 3VEZA 2V52B 1MA9B 1NGFA 5AQIA 4QS8A 1BA0A 3FZLA 3WXIA 3LDNA 3HTVA 5AFUH 4JAXA 3VEYA 4JHDB 1NMDA 4CZEA 2E1YA 4CZMA 5TKYA 2E2PA 3W0LA 3CIPA 1MWMA 2ASPA 3UKUB 1WUAA 5AQFA 5KPTA 2QWOA 4MO4A 5AQYA 3LDQA 3WQUA 4BRNA 3FR0A 3CJCA 1NLVA 4B1WB 5KQDA 3WEEB 5AQLA 4C23A 5JMVA 5AQPA 2CH5A 3D2FB 1BU6O 4PL7A 4H0OA 3VEWA 1T44A 3DAWA 2HOEA 3BF1A 3CERA 4I6MA 2H3GX 3VERA 4CZIA 1R59O 4FWLA 1SZ2A 3MN6A 4MLHA 2J4RA 3O08A 5AZIA 1DEJA 3D2EA 1NGAA 4WQ4C 3ID8A 3WXLA 3QBXA 1GLDG 3RSEA 3EO3A 3HBTA 3DJCA 2IVPA 3O6WA 2QWQA 2IVNA 4FWNA 4BREA 4E1JA 1QQOA 5AQRA 1YAGA 4CD3A 5LY3A 4XH5A 4EFHA 3L0QA 4BRCA 5JLFA 3UKRB 4PKIA 4BVOA 3J8AA 4A2BA 2CGKA 5AQQA 5FPNA 4I6MB 1GLEG 3QDKA 4BRFA 1BOTO 3WT0A 1X3MA 3ZETA 4BG8A 5FPDA 1TUUA 4BRHA 2P9IB 5LJWA 1BUPA 5AQXA 4HTLA 5AZIB 1IG8A 2HF4A 3LM9A 3D2EB 3FZHA 3VF6A 1YXQA 3VF4A 1DKGD 3AARA 4BR7A 2Q0UA 2FF3B 4XEIA 2P9SA 2E1ZA 4MLEA 1KAYA 2GUPA 3ZX0A 5BPMA 4HWIA 1CZAN 1ZC6A 1V4TA 1TYQB 1HJOA 3EL2A 2AA4A 3ZEUA 4AM6A 4DQ8A 1ESVA 1WOQA 2A3ZA 1NGJA 2P9NB 3OHRA 3WUHA 3GBTA 2BUPA 3QBWA 5AQJA 3FGUA 2EWSA 3VESA 1XUPO 4LC9B 3VEVA 1KXPA 2FSJA 5AQTA 3BF3A 3HI0A 4WQ5A 3CJ1A 3H1QA 1RFQA 1Y64A 3MN9A 3KVGA 2QWNA 2Q36A 1E4GT 1D4XA 3O1WA 4FWOA 3VOVA 2YJFA 4CBUA 2P9SB 3U9DA 2ASOA 4CZGA 3R8EA 2ZGYA 1HKBA 3WEEA 2VCPA 5BN8A 3VEOA 3FLCO 3D2FA 3KHYA 5JLHA 3U4LA 1ATSA 3ZEUB 2IVOA 4QS7A 3UB5A 3H6EA 5AQMA 4GNIA 4FWKA 4FWQA 3SMSA 1GLCG 4F9OA 3TU5A 4H5VA 2QM1A 2NZTA 1T6CA 3ULEB 4EHUA 5CE3A 5KPZA 5EVZA 2ZF5O 3AY9A 3DXKB 4M7XA 2P9LB 3LM2A 5LJVA 3U8XA 5BPNA 2F9WA 5FPEA 1BWFO 2P9UA 3AAQA 3CI5A 2D0OA 3U9ZA 3A5OC 4FWSA 3UE5A 4RTFD 1NM1A 5E84A 3CJBA 2YI1A 3VGKA 1NGCA 5ADXA 2I7NA 3M3ZA 2P9PB 3ENOA 1NWKA 4NO7A 4M63C 1V4SA 2I7PA 3UKRA 1Z6RA 1NGHA 2NLXA 1E4FT 1U6ZA 2PBDA 4H5TA 3QMLA 4BC2A 3M1FA 1GLAG 2YHYA 1QQMA 2E20A 2BTFA 1YVNA 3HZ6A 2P9IA 2A6AA 1QZ6A 3EZWA 3GG4A 2YHWA 3LL3A 3WQTA 3WXKA 1SAZA 5I9EB 2P9UB 1MDUB 1OKJA 3C7NB 5AQUA 2FLOA 3D7EO 4O8KA 4B9QA 2IIRA 1XQSC 5AQOA 1H1VA 4RCHA 3VGMA 1TYQA 3VENA 2P9NA 2UYTA 4B1ZA 4WYBA 1NGBA 4BVPA 2GEMA 3AAPA 3IMXA 1U2VB 4BRQA 2D4WA 2A5XA 3ATUA 3H45C 1X3NA 5F2RA 4FWPA 1C0GA 2Q2RA 1HKGA 4CBXA 5BPLA 4NB4A 2E2OA 3ZX2A 4CZHA 3CHWA 2VYPA 4CZLA 2FXUA 2Q31A 2QXLA 3FZMA 1LCUA 1XC3A 4YDUA 4CI6A 4K41A 2D1KA 3FZKA 1DGKN 1LOTB 4WQ4A 1T6DA 4FWRA 5ADXH 5AZJB 3QB0A 1Q18A 4IO8A 4K25A 4IJAA 3ULEA 4BGBA 2D0PA 3SJHA 2HMPA 4H0VB 3BUZB 3DXKA 2P9LA 1QHAA 1ZBSA 2Q0RA 2E2QA 3VEXA 2NRHA 3ZX3A 2V7ZA 4ISEA 4BQZA 1HPMA 3H3OB 3H46O 5E26A 1G99A 2GWJA 3GDQA 5EOYA 5B8HA 5AQNA 2ZGZA 5BRDA 3L4IA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3DXMB 1A5XA 3V9ZA 1AHOA 4ISGA 2ZWHA 2KJAA 4FZZA 5GIPA 4JKCA 3ENHA 3U3YA 3OJUA 3BZCA 3A5LC 2G8WA 4IJNA 2YC1C 3O80A 1TVRA 3DLLL 1TUYA 1VSKA 1NPIA 2NRXA 2ATBA 2NRZA 4FM2A 5CY4A 4CJ7A 2X74A 1NKBA 4NCAA 3KP1A 1S5JA 1VQPN 3K5LA 1VQNN 3T3FA 1NBWA 2UUCK 4ILJA 2D0CA 4AHTA 1SN4A 4E19A 3AO2A 1X9JA 4H5WA 2GELA 4WFAL 4CCHA 2IAJA 3AO4A 2ZD1A 1S6PA 3WXJA 3V4IA 1YTUA 3PO5A 4JYAK 5FLXO 1X9SA 4ISFA 1X1PA 4IOCL 4FJIA 4H5RA 3EN9A 2WC9A 3G25A 1WAJA 4JN4A 4BRKA 5GINA 1XHZA 1P00A 3RMDA 4IEEA 4QAGA 3TANA 1ZYQA 3HM9A 2NRWA 4H5NA 4M3UA 1TV6A 4KV8A 5DK5A 1OVYA 4DB3A 3GOIA 1GPSA 3RR8A 2QI2A 3DOLA 4FM0A 4FLZA 4YDUC 4BRDA 1VK0A 1BHLA 3O4QA 3O5BA 2VWBA 5I3UA 4EZ6A 1S1UA 4CJRA 1OH8A 1VQ6N 1JL2A 4FSVA 1JKZA 4DV4K 2Z1GA 3KP0A 4BRAA 3JS6A 4CGHA 1KQSM 1BA1A 3KOZA 1YF5L 5DMRA 3J80O 1KAXA 3KTQA 4BRIA 2DTUA 1LWFA 3L2QA 4JI2K 3V81A 1QSYA 2FF6A 4JKGB 3DXMA 3R6MA 3T1AA 1L3VA 3MDQA 3HSCA 4FPBA 3QFPA 4K42A 2G2KA 1JCFA 1I6GA 4BR4A 3JSMA 4FWMA 4CJSA 3KK7A 5DM6L 3GE1A 3A2FA 2QXFA 4QS9A 3BEXA 1LQIA 4BC3A 5C12A 1JCEA 3H1VX 3CETA 3PV8A 1N33K 3VTHA 3EE8A 1B9DA 4DKWA 4IO9L 3C0BA 4LF9K 4OKJA 5F1XA 3NGIA 3B8AX 2FSNA 1C0TA 2GTDA 4JS4A 1QZ5A 3VQ9A 1KAZA 5AQGA 4B9UA 1BCMA 1NGDA 4CGGA 3I8BA 3EZ5A 2HHQA 4DLEA 3R9PA 3I0SA 2P5GA 1U47A 4FW2A 1VNAA 4BWMA 2LKBA 2KBKA 1LQQA 3KOXA 1MA9B 2O8CB 4I2QA 2HHUA 1YVUA 1NRBA 3LP0A 3J81O 3KD1E 2KBHA 3SQ2A 2LJ7A 2ASPA 1SEGA 2GMOA 4OGEA 5LMNK 1VQ4N 4FLUA 2HHSA 1JLCA 2QWOA 2VGNA 3HP6A 3WQUA 5AJ3K 3B6OA 3FR0A 4R5PA 3CJCA 5AQPA 2CH5A 3MAQA 2YIOA 1BU6O 3QI7A 1T8EA 1ZVGA 4WFNL 2HBMA 5CZ1A 1EETA 4I6MA 3QESA 2FC0A 4NCBA 1NRAA 1HPZA 3MN6A 4MLHA 2B6AA 1HRHA 1ITGA 4RG8A 3AA5X 1NGAA 1ASWA 3ID8A 1EKEA 2MN5A 4A5AA 1NJYA 2QWQA 4FWNA 4BREA 4E1JA 1QQOA 4JK8A 3OS1A 3SZ2A 3TAFA 3L4QA 4V1DC 3SYZA 2C1IA 4DF8A 5LY3A 2G8KA 4EFHA 1TK0A 4IEIA 4AB0A 2ZJQL 4F2SA 3UKRB 3L2UA 3THYB 3J8AA 1BCGA 2CGKA 5AQQA 4AAZA 2YHAA 4BDZA 5FRMA 1GLEG 3MXIA 4BRFA 4CJ4A 3WT0A 4ZTFA 3HO1A 1X3MA 4JI6K 1NJXA 5FPDA 2P9IB 5LJWA 1OH7A 4LFBK 5AZIB 1QVFM 4AHSA 2RPIA 3FZHA 3VF6A 4OPHA 2B68A 3CYMA 4GV3A 3MCAB 2Q0UA 4XEIA 3ID6A 1KAYA 3ZX0A 5HROA 1N4NA 1F21A 3HT3A 3EL2A 2NNWA 3SAHA 1TYQB 3NMUA 3HVTA 1WOQA 3PX6A 2A3ZA 3OHRA 3WUHA 2G8UA 2UXCK 4NLCA 1T05A 3QINA 2EWSA 3SCXA 3VESA 5AQTA 3OYLA 3KKSA 1KD1O 1VQMN 4IFEA 4A59A 1S9EA 2DFFA 3PSMA 3SJJA 3SPZA 3VQ8A 1VSFA 1GOAA 3TAEA 4V19S 4DTNA 4DSFA 5CYMA 1ZBHA 2YJFA 3U9DA 2D0BA 1SKRA 5BN8A 3FLCO 5I42A 2PY5A 5JLHA 1UA1A 3U4LA 1NOYA 2IVOA 1REVA 4QS7A 5AQMA 4DWIA 4F9OA 1XMQK 4IKFA 3SV4A 4H5VA 4KHUA 4CJPA 1T6CA 1VAZA 2C1GA 3TR8A 4CHPA 4MFBA 5GADP 1SN1A 1ZBIA 4EP4A 3CFPA 2P9UA 3VQEA 2D0OA 3TARA 3A5OC 3T19A 4N76A 5E84A 4G1QA 5ADXA 2I7NA 5EU7A 1OH6A 2P9PB 1S9GA 4DMNA 2HHVA 3VMFB 1VRUA 3UKRA 4FJ5A 3THYA 2NLXA 1U6ZA 3QMLA 1GLAG 2YHYA 1S6QA 4KHQA 2E20A 3K2PA 4KFBA 1U48A 4I9LA 3KOWA 1RT1A 1YVNA 4HE7A 2P9IA 4KB0A 4CGIA 1NK5A 1L3UA 4AHRA 4GMJB 3GG4A 2YHWA 5C2FA 2LR3A 3NE6A 5GAHP 1WAFA 1OZZA 5I9EB 4CEAA 4MDBA 1OKJA 3C7NB 4IG3A 1ZUTA 4O8KA 2IIRA 1UWBA 1H1VA 4LFAK 4RCHA 2B4JA 5BR8K 2WTUA 1TYQA 1N8RO 1LW2A 4IDKA 4O8UA 3G4SN 1DLOA 2ZM6K 1NGBA 3BK3C 1B9FA 4BVPA 3CCMN 1JXCA 2Y1JA 3OYDA 1RBRA 3ZSQA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3DXM B;  1A5X A;  3V9Z A;  1AHO A;  4ISG A;  2ZWH A;  2KJA A;  4FZZ A;  5GIP A;  4JKC A;  3ENH A;  3U3Y A;  3OJU A;  3BZC A;  3A5L C;  2G8W A;  4IJN A;  2YC1 C;  3O80 A;  1TVR A;  3DLL L;  1TUY A;  1VSK A;  1NPI A;  2NRX A;  2ATB A;  2NRZ A;  4FM2 A;  5CY4 A;  4CJ7 A;  2X74 A;  1NKB A;  4NCA A;  3KP1 A;  1S5J A;  1VQP N;  3K5L A;  1VQN N;  3T3F A;  1NBW A;  2UUC K;  4ILJ A;  2D0C A;  4AHT A;  1SN4 A;  4E19 A;  3AO2 A;  1X9J A;  4H5W A;  2GEL A;  4WFA L;  4CCH A;  2IAJ A;  3AO4 A;  2ZD1 A;  1S6P A;  3WXJ A;  3V4I A;  1YTU A;  3PO5 A;  4JYA K;  5FLX O;  1X9S A;  4ISF A;  1X1P A;  4IOC L;  4FJI A;  4H5R A;  3EN9 A;  2WC9 A;  3G25 A;  1WAJ A;  4JN4 A;  4BRK A;  5GIN A;  1XHZ A;  1P00 A;  3RMD A;  4IEE A;  4QAG A;  3TAN A;  1ZYQ A;  3HM9 A;  2NRW A;  4H5N A;  4M3U A;  1TV6 A;  4KV8 A;  5DK5 A;  1OVY A;  4DB3 A;  3GOI A;  1GPS A;  3RR8 A;  2QI2 A;  3DOL A;  4FM0 A;  4FLZ A;  4YDU C;  4BRD A;  1VK0 A;  1BHL A;  3O4Q A;  3O5B A;  2VWB A;  5I3U A;  4EZ6 A;  1S1U A;  4CJR A;  1OH8 A;  1VQ6 N;  1JL2 A; 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