5BPLA

Crystal structure of adp and pi bound human hsp70 nbd mutant r272k.
Total Genus 125
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
125
sequence length
380
structure length
380
Chain Sequence
KAAAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVALNPQNTVFDAKRLIGRKFGDPVVQSDMKHWPFQVINDGDKPKVQVSYKGETKAFYPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDRTGKGERNVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVNHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACERAKKTLSSSTQASLEIDSLFEGIDFYTSITRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDLVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILMG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Nucleotide binding to variants of the HSP70-NBD.
rcsb
molecule tags Hydrolase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Heat shock 70 kDa protein 1A
total genus 125
structure length 380
sequence length 380
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-05-28
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5bplA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5bplA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5bplA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5bplA04
4PKIA 3D2FB 1GLBG 4FOEA 3VGMA 2GELA 4EHUA 1HPMA 4JN4A 2IVNA 1NGDA 1MA9B 4DB3A 5KPRA 2P9NA 2QXLA 4EHTA 4H5WA 2ASMA 1NGCA 3UKRB 2E2QA 3U9ZA 5AQVA 2Q31A 1HLUA 1K8KA 1NLVA 1NGIA 1SAZA 4B1ZA 2GTDA 1J6ZA 5KPZA 3H6EA 3CJ7A 1NGFA 4BQLA 1U2VA 2E20A 3C0BA 3VEVA 4H0XB 5BN8A 2QWQA 1KAXA 1D4XA 1V4SA 3ENOA 4H0PA 3GG4A 4XH5A 4JHDB 5AQTA 5CE3A 4FWQA 5EX5A 4CZEA 1U6ZA 4JD2B 5AQNA 2E88A 3A5NC 4WQ5C 3ENHA 5BPNA 2A5XA 3FGUA 5AQZA 3QDKA 3O80A 2P9KA 4K25A 2BUPA 1IJJA 2Q1NA 3VGLA 1IG8A 3VEOA 3CJ9A 4FWPA 1CZAN 3QBWA 4CZMA 2A6AA 3EN9A 1Z6RA 5E84A 5ADXH 3SMSA 2VCPA 2FF6A 2P9IB 3MN7A 4EIAA 3O8MA 2E1YA 4Y0WA 4LC9B 2V51B 4A62A 2QM1A 1HJOA 3KVGA 5F1XA 1ESVA 2PBDA 1NGBA 1JCEA 3IFRA 2CGJA 4BR7A 4BR4A 3A0IX 1Z05A 1Y64A 2UYTA 5FPMA 2ASPA 1MWKA 2HF3A 5BRDA 5JMVA 3AY9A 4M7YA 2ZWHA 1QQOA 3EL2A 3ULEB 1YUWA 3ZEUA 4CZFA 1NGHA 5AQFA 3MN6A 1BWFO 5AFUH 4H5VA 3FLCO 5AQXA 3D2EA 2HF4A 2VYPA 2CH5A 1ATSA 4MO4A 4A61A 1GLFO 5BR9A 1BG3A 3U9DA 2I7PA 1BU6O 5AQKA 2A3ZA 5AQIA 3EZWA 3LDOA 2V7YA 1TUYA 2J4RA 3FZLA 4B1VA 5AR0A 4JAXA 3WQTA 1GLCG 3BP8A 1DGKN 1WUAA 4BR5A 1XC3A 4BRFA 3HBTA 1T44A 3GBTA 1TYQB 3H45C 4FPBA 1MDUB 3G25A 2QWOA 4H5RA 4K43A 1MWMA 3IDHA 3LL3A 3F9MA 4BG8A 1E4FT 4FSVA 5BRHA 2P9PA 3S41A 4H0TB 4GNIA 4NO7A 4RWTA 2IVOA 2FLOA 4IZ9A 3DXMA 3JS6A 3VETA 3CJBA 4CJ7A 4AM7A 4B1XB 3H3OB 2E1ZA 1DKGD 3LDNA 5BN9A 4I6MB 1R59O 2PAVA 3SK3A 3WEEA 5AZJA 4FO0A 2FSNA 3TU5A 3A5MC 4A2BA 3MN5A 3QB0A 3AAQA 4BRIA 4KBOA 2P9UB 3DAWA 4BG9A 4FOIA 2KHOA 2QWMA 1KAYA 2BTFA 3JXUA 4M63C 2H3GX 4XH1A 3UKUB 4NB4A 1NM1A 4CD1A 2EWSA 2ASOA 2QWRA 3FZKA 1ZC6A 3FFKB 4BRLA 5BRFA 4IWVA 5KPTA 2ZGZA 5ELZA 3VEZA 1GLDG 3IMXA 3VERA 4BRMA 3A8YA 2OANA 3QMLA 4RCHA 3ZX0A 4BR9A 3HZ6A 5EOYA 4BRNA 2NRHA 1HKGA 3CJAA 4B1UB 4WYBA 3VF4A 5FPEA 4BC4A 3CJ1A 4WQ4A 3MCPA 5EXWA 3L0QA 3CETA 4DHYA 2VWBA 5AQPA 3O5BA 3P4IA 3ATUA 3H46O 1NGJA 5AQMA 2YHWA 5AQGA 4CZGA 1C0FA 5I9EB 4XEIA 3WUHA 5AZJB 1G99A 5LY3A 1GLLO 3IUCA 2ZGYA 1GLAG 3ZETB 3VEWA 3LM9A 1HKCA 1SZ2A 1JCGA 1LOTB 4CBUA 3RSEA 3U4LA 3LDLA 2YCHA 4PL8A 3GE1A 5BPLA 2P9NB 3H1QA 3WXKA 3GDQA 3KHYA 3I8BA 3DXKA 1T6CA 1HUXA 2YJEA 1YAGA 1K8KB 4DCHA 3ATVA 2V52B 3WT0A 2Q97A 1U2VB 4MLEA 4RTFD 2D4WA 2E8AA 3M6GA 1HKBA 4FWMA 4H03B 2GWKA 5FPDA 4YDUA 2F9WA 4BRAA 4CZKA 4CD3A 4CZHA 1BO5O 4PKHA 4QS8A 2AP1A 2FF3B 3C7NA 4BGBA 3I33A 5AQJA 1SQKA 5JICA 2QWNA 1X9JA 4BR2A 4BRCA 3QFPA 2P9KB 5AQWA 3FZFA 3FR0A 1XQSC 2IVPA 2W41A 5AQSA 4FWOA 3SMPA 2QWLA 3CJCA 3HM8A 5BPMA 3DJCA 5AZIA 3O4WA 2P9SA 4ISFA 3R8EA 1GLJO 5AQRA 4BROA 4B1WB 2GWJA 1NGGA 3D2FA 2FSKA 4BRKA 4BQZA 5EY4A 5AQHA 3O6WA 3AAPA 5ADXA 4BRPA 1V4TA 4WQ4C 3FZMA 4WQ5A 5B8HA 3R6MA 3WXLA 3BUZB 4BREA 3LM2A 1QQNA 4FWRA 5AQUA 2ITMA 3EKUA 5F0XA 4EAHD 1QZ5A 3O1WA 4BC3A 4FWSA 3VESA 1JCFA 3HSCA 2DPNA 3ID8A 3B8AX 4JNEA 4M7XA 4QS9A 2GEMA 4H0YB 3ZEUB 4XH4A 3M3ZA 5F2RA 2ZF5O 4CZLA 4JHDA 1ATNA 1ZBSA 4MO5A 4JD2A 2I7NA 2NZTA 4PL7A 3D2EB 5JLHA 5AQQA 1TUUA 4BR0A 3CI5A 2A41A 1DEJA 3EKSA 4BRGA 3VOVA 2Q0RA 5AFUA 3QBXA 3BF1A 3MDQA 4K42A 3BF3A 3CIPA 1WOQA 4B1YB 4YDUC 3WXIA 1BUPA 2D1KA 1P8ZA 3QFUA 4ISGA 3EO3A 1QQMA 4IJNA 4B9QA 1QZ6A 2E2NA 4BVPA 3HI0A 2A40A 5AQLA 3A5OC 3CERA 4O8KA 4H5NA 2HMPA 3WQUA 3U8XA 3ZX3A 2CGLA 4FWKA 2P9PB 1X3NA 4C23A 2P9LA 5JLFA 1RFQA 4IO8A 3DXMB 4QS7A 5EVZA 4IXCA 3ULEA 3VENA 2A42A 3SJHA 2YHYA 3SLCA 3R9PA 1YVNA 1Q18A 2E2PA 3WEEB 1ATRA 5KQ8A 1S22A 2QWPA 3AARA 2E2OA 1XUPO 3VEXA 1RDWX 1LCUA 1KAZA 2CH6A 4L3QA 4MLHA 5AQOA 4BRQA 4BVOA 1X3MA 2Q36A 1RGIA 4BGAA 3WXJA 2D0OA 3H3NO 4AM6A 3J8AA 1QHAA 4IJAA 3GOIA 1OKJA 2HOEA 1TYQA 2CGKA 3FZHA 2Q2RA 3CQYA 3TPQA 4BC2A 3CHWA 4E1JA 1H1VA 1NGEA 4CBWA 4K41A 5BREA 3MK6A 3O08A 4Z94A 2V7ZA 1KXPA 4A2AA 1T6DA 4BC5A 4H0OA 1NGAA 1YXQA 2P9LB 4FPAA 5TKYA 1S3XA 3MN9A 4H5TA 1GLEG 2GUPA 4CI6A 4PKGA 4I6MA 5LJVA 3L6QA 5LJWA 3W3DA 1BA0A 3H1VX 2Q0UA 2IIRA 2YHXA 1BA1A 4FWNA 2P9UA 3DWLA 2W40A 4HTLA 3VPZA 3UE5A 4H0VB 5FPNA 1BDGA 2YI1A 4J8FA 3RSEB 4GY2B 4CZJA 4EFHA 3LDQA 3UKUA 3UKRA 1E4GT 3DXKB 3VGKA 2D0PA 1NWKA 3FE1A 3A5LC 3OHRA 3GL1A 3MMVA 3VEYA 3L4IA 3KZBA 1HX1A 4FWLA 3D7EO 4DQ8A 4HWIA 3M1FA 1NBWA 3O1BA 2WUSA 3ZX2A 2YJFA 3CQXA 3LDPA 2FXUA 3QICA 3C7NB 5KQDA 4FL9A 2NLXA 4F9OA 2F9TA 1BOTO 1C0GA 1EQYA 4CZIA 3VF2A 4BRHA 4O5FA 1NMDA 3BEXA 5AZIB 1ZXOA 3HTVA 2P9SB 3W0LA 4CBXA 2AA4A 2FSJA 4ISEA 3UB5A 3VF6A 4BRDA 2P9IA 5AQYA 2QW9A 5E26A 3ZETA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3KOYA 4PKIA 4DR2K 4KH5A 1ZVEA 4W5OA 1NGDA 4EHTA 1S72N 2OZSA 4IOXA 4CGGA 2Q31A 1QHTA 5A2QO 1NGIA 3IRXA 5KTQA 5DK5A 1YTAA 5KPZA 3J80O 3CCEN 4BQLA 1HNWK 3VTHA 4H0XB 2YKMA 3D45A 3L2UA 2ZJQL 1U6ZA 1VSDA 5AQNA 2E88A 3A5NC 3FGUA 2A5XA 5AQZA 4XJXA 3S9HA 3O80A 1JXEA 2P9KA 4K25A 3DOLA 4FJ5A 3RVCA 1B92A 4F2RA 3CCSN 4JK7A 2MN5A 4CE9A 3K5MA 3ZYYX 5FLXO 5D3GA 1Z6RA 5E84A 2HHSA 3O3FA 4CHQA 2FF6A 3OYBA 4O5BA 4EIAA 3BZKA 3O8MA 2E1YA 1D9DA 1HJOA 2D0CA 3E7UX 1RTDA 4JI1K 2FBXA 3ISNC 1NJWA 2F7TA 2PY5A 2VGMA 3TAFA 3CQ8A 4BR4A 4IOAL 3A0IX 1C55A 3LZJA 2NNWA 4WCEL 1VQ6N 1WAJA 3VQ8A 4H4MA 4RW4A 2G8IA 2W00A 2HBLA 3TTCA 5BRDA 4LF9K 1RTHA 1VQPN 4IBNA 1YUWA 3ZEUA 2GMOA 3NFAA 4JK9A 1NGHA 1JXBA 2JWLA 4WFAL 4DFKA 4H5VA 4ZHRA 5AQXA 3J81O 2X78A 3NBPA 2NRZA 3L3UA 1KSPA 1NRBA 3NVMA 4HTUA 1SN4A 2V7YA 1QE1A 1TUYA 4JLHA 3OY9A 4B1VA 1LQQA 3OYFA 2WC9A 1JLBA 1GLCG 3BP8A 3WQTA 4KPYA 3ZT1A 5J2QA 1XC3A 4FLTA 5J2MA 3AO2A 4CF9A 3H45C 4FPBA 1MDUB 3AO3A 1NOZA 4K43A 1K8AO 3F9MA 2LKBA 3DLEA 1TK0A 1E4FT 3P5JA 4FLZA 3KKRA 2O8EB 2SN3A 4FJ9A 2IVOA 3JS6A 4RW9A 4CJ7A 2I5JA 2JWKA 1FW6A 5BN9A 3OYJA 4OPAA 3N4QA 4DFMA 4M3ZA 4OVLA 4FO0A 2YNHA 4DU1A 3SAHA 2XY6A 3QB0A 3AAQA 3QIPA 4KHPK 3DYAA 3CF5L 3DAWA 1RT3A 5JS1A 4FOIA 4FVMA 4FLVA 3KLEA 1YHQN 2JGUA 4A57A 2OPSA 3THVA 1NM1A 4CD1A 4EP4A 3KKSA 4U7BA 4IEIA 2KJAA 3VQ9A 2ASOA 3LPTA 1KFSA 4FJ7A 3KOWA 3ZT3A 3MWPA 4O0JA 4ID5A 3HYFA 5ELZA 1ZFUA 3OYGA 1L5UA 1S9EA 4DR6K 3AVCA 2OANA 3QMLA 5K14A 3HZ6A 4BRNA 4B1UB 2F8TA 2O4IA 2EX3A 4JRQA 1KRPA 4LH5A 5HP1A 2I61A 3LP3A 4LH4A 5AQGA 4CZGA 1C0FA 3WUHA 2HB5A 4OPHA 3C6AA 3T1YK 4HCCA 3ZETB 3RRGA 3AVBA 3LM9A 3O9QA 2OPRA 1T03A 3PIPL 4B3OA 3HP9A 3LDLA 4GV9A 4Y1CA 3WXKA 3OW2M 3DXKA 4OKJA 1NNEA 3CM6A 1HYZA 1YAGA 1ZBLA 3DLBA 3ATVA 4MFBA 1BQNA 1W9HA 1T05A 1U2VB 3V6DA 4HUEA 2E8AA 4FWMA 1DT9A 4YDUA 1I2VA 1XNRK 5FDLA 4KHWA 2LN8A 2KTQA 3KWIA 3PUFA 4E7HA 2B6AA 4DQQA 4DUYK 1U47A 5AQWA 1S6PA 3FR0A 1LQHA 4FWOA 1C6VA 2LI7A 5AQSA 4QAGA 3SMPA 1NU0A 1RBTA 1I2UA 4DR4K 3O4WA 4ISFA 2Z1JA 1F21A 3CC7N 4FLUA 1ZVGA 4FJIA 3HXMA 1WNSA 1PX9A 3VQQA 4BRKA 3SZ2A 2NY9X 3TAQA 1XC9A 3O6WA 3U6FA 3CYGA 5I3UA 3MEDA 1X1PA 1ZBFA 1EO1A 1BK8A 5C15A 4DQRA 3CD6N 2YEOA 3WXLA 3G10A 4YOVA 4FWRA 1WMTA 3EKUA 3BY5A 4AILC 1OZZA 2VY6A 3VESA 1JCFA 3I0SA 4N5SA 2VQFK 3B8AX 1C1AA 2NRWA 2GEMA 4QS9A 4JHDA 3D0PA 1RT7A 1S1TA 3TAGA 1ATNA 2KW4A 4N47A 4BR0A 1X9MA 3E01A 3R1XA 4C8NA 1NOYA 2O8DA 2A41A 2W6KA 3I56N 3T1AA 1IBLK 3RMBA 2Q0RA 5AFUA 2ATBA 3ZSYA 3BF1A 3G71N 4M42A 4AHUA 2PZSA 4KB0A 1WSEA 1WOQA 4CFCA 3SAGA 1PE4A 2IS3A 4YDUC 3WXIA 3C6UA 1ILYA 1B9FA 4ISGA 1OH6A 1WN7A 4E89A 4BVPA 2HHWA 3HI0A 3A5OC 5C25A 4DSJA 4FK0A 4H5NA 3U8XA 3WNHA 2P9PB 2ATQA 5M1OA 1YITN 1VQMN 4PWDA 1RFQA 1T7EA 3FFIA 3THYB 5EVZA 4IXCA 3VENA 2YHYA 2FBTA 4NCBA 3R9PA 4QOZB 2MBKA 1YVNA 2E2PA 5T7BA 4IOCL 1RILA 5KQ8A 1S22A 2QWPA 1VK0A 4FLWA 1VQ7N 1LCUA 1KAZA 1GOCA 2O8DB 2G8WA 1X3MA 1J53A 5JS2A 3H3NO 1JKHA 2RKIA 3GOIA 4CJEA 1K8BA 3BZCA 4JKGA 1TYQA 3AV9A 4CF8A 4CJPA 4KI6A 3CQYA 4Q5VA 5M1FA 2LJMA 1WSJA 2YHBA 3PSIA 2MZ0A 3WNEA 1JXCA 4N56A 4DR3K 3AVIA 5CHIA 3V81A 1NKEA 3B6OA 4OPKA 1YXQA 4FPAA 3MN9A 5DMRA 4YY3K 1LW0A 1YVUA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3KOY A;  4PKI A;  4DR2 K;  4KH5 A;  1ZVE A;  4W5O A;  1NGD A;  4EHT A;  1S72 N;  2OZS A;  4IOX A;  4CGG A;  2Q31 A;  1QHT A;  5A2Q O;  1NGI A;  3IRX A;  5KTQ A;  5DK5 A;  1YTA A;  5KPZ A;  3J80 O;  3CCE N;  4BQL A;  1HNW K;  3VTH A;  4H0X B;  2YKM A;  3D45 A;  3L2U A;  2ZJQ L;  1U6Z A;  1VSD A;  5AQN A;  2E88 A;  3A5N C;  3FGU A;  2A5X A;  5AQZ A;  4XJX A;  3S9H A;  3O80 A;  1JXE A;  2P9K A;  4K25 A;  3DOL A;  4FJ5 A;  3RVC A;  1B92 A;  4F2R A;  3CCS N;  4JK7 A;  2MN5 A;  4CE9 A;  3K5M A;  3ZYY X;  5FLX O;  5D3G A;  1Z6R A;  5E84 A;  2HHS A;  3O3F A;  4CHQ A;  2FF6 A;  3OYB A;  4O5B A;  4EIA A;  3BZK A;  3O8M A;  2E1Y A;  1D9D A;  1HJO A;  2D0C A;  3E7U X;  1RTD A;  4JI1 K;  2FBX A;  3ISN C;  1NJW A;  2F7T A;  2PY5 A;  2VGM A;  3TAF A;  3CQ8 A;  4BR4 A;  4IOA L;  3A0I X;  1C55 A;  3LZJ A;  2NNW A;  4WCE L;  1VQ6 N;  1WAJ A;  3VQ8 A;  4H4M A;  4RW4 A;  2G8I A;  2W00 A;  2HBL A;  3TTC A;  5BRD A;  4LF9 K;  1RTH A;  1VQP N;  4IBN A;  1YUW A;  3ZEU A;  2GMO A;  3NFA A;  4JK9 A;  1NGH A;  1JXB A; 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