5FPEA

Structure of heat shock-related 70kda protein 2 with small-molecule ligand 1h-1,2,4-triazol-3-amine (at485) in an alternate binding site.
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
381
structure length
377
Chain Sequence
GPAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTIFDAKRLIGRKFEDATVQSDMKHWPFRVVSEGGKPKVQVEYKGETKTFFPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGGKVHSAVITVPAYFNDSQRQATKDAGTITGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKGEKNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVSHLAEEFKRKHKKDIGPNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGVDFYTSITRARFEELNADLFRGTLEPVEKALRDAKLDKGQIQEIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILIG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Detection of Secondary Binding Sites in Proteins Using Fragment Screening.
pubmed doi rcsb
molecule keywords HEAT SHOCK-RELATED 70KDA PROTEIN 2
molecule tags Chaperone
source organism Homo sapiens
total genus 122
structure length 377
sequence length 381
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-11-28
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5fpeA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5fpeA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5fpeA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5fpeA04
4AM7A 3DAWA 5BPLA 5AQSA 4XH5A 2CH5A 2GUPA 4CD1A 1DEJA 3UKRB 2P9LB 3I8BA 3L0QA 1K8KA 3QBWA 4EIAA 4BR7A 1ATRA 4I6MB 4H5RA 4CZLA 1BWFO 4PKGA 3CI5A 4E1JA 4LC9B 1NWKA 4EHTA 5AZIB 2V7ZA 3D2FA 3TU5A 4BQZA 5ELZA 3J8AA 1C0GA 1DGKN 4B1XB 3MK6A 2QWRA 2YCHA 4A62A 1HLUA 4MLHA 3UE5A 1KXPA 4RCHA 5AQQA 3DJCA 2IVOA 3FFKB 4BR4A 4BRCA 3TPQA 4BRPA 4H5NA 4BC4A 3VF4A 2WUSA 3LM2A 4M7YA 1DKGD 3H1VX 3H6EA 2P9SA 5AZJA 3GBTA 1NGDA 1U2VA 2Q0RA 4H5TA 1YAGA 2ZWHA 4JAXA 5AFUH 3O5BA 3VEOA 3A0IX 3H1QA 4ISGA 4BG8A 4A2BA 4H0YB 3VEVA 2FSJA 4BRKA 4CJ7A 2QWMA 3ENHA 5TKYA 4XH4A 1GLCG 5AQPA 3KVGA 3AARA 4DHYA 1X9JA 4EFHA 5FPDA 1ZBSA 3VPZA 1U6ZA 3G25A 3FGUA 4J8FA 4RTFD 4F9OA 3O1WA 5AQJA 4BRMA 5JLFA 3ZX0A 5LJVA 4BVPA 3R6MA 3MN5A 4WQ5C 3IMXA 3WUHA 4CZJA 2QWPA 2W41A 2P9PA 3FZFA 5FPMA 3U4LA 2P9NA 5FPNA 1ESVA 4H0OA 3ULEA 3IFRA 1Q18A 4NB4A 3IUCA 2P9KA 3HSCA 3HI0A 4FPBA 1HKCA 3EZWA 5JLHA 3BUZB 4BRFA 5EY4A 2D0PA 1V4SA 1QQMA 3VGMA 3AAQA 3DWLA 3C0BA 4FWPA 3O6WA 5KPRA 4BR9A 5LJWA 3MCPA 2YHXA 2A6AA 3CJBA 3WXIA 1SQKA 3OHRA 3C7NA 4CBUA 2ASPA 4CZIA 2P9PB 2DPNA 5KQ8A 1V4TA 3SLCA 3FZKA 5JICA 3QFUA 3H3OB 1Y64A 4BVOA 5AQMA 3H3NO 2D4WA 3FE1A 3QFPA 3ZEUB 4AM6A 3B8AX 5AQYA 3CJ1A 5KPZA 1BU6O 4BR5A 1TUYA 3VENA 1HKGA 2W40A 4JN4A 4H0PA 5AQWA 3H46O 3GE1A 1HJOA 2QM1A 3O8MA 3KZBA 5JMVA 2PAVA 4BRNA 2HOEA 4JD2A 4CZMA 4A2AA 1BOTO 3VEZA 4BGAA 2A42A 5BPNA 1T44A 3VEYA 4CZGA 5B8HA 1NGEA 3QMLA 1GLLO 5EOYA 2Q1NA 1S22A 4FO0A 4PL7A 4EHUA 3MDQA 3EL2A 1RDWX 4O5FA 4IXCA 3R9PA 4BROA 3U9DA 1CZAN 2Q97A 4O8KA 4DCHA 4H5WA 2QWOA 1RGIA 1Z6RA 1P8ZA 3WXLA 3O4WA 2Q2RA 1ATSA 1E4FT 1K8KB 4B1VA 1BG3A 5EXWA 4WQ5A 3SMPA 4Y0WA 5AQIA 2VCPA 2GELA 2QWQA 2GTDA 1TUUA 4RWTA 4L3QA 2IIRA 2IVPA 4CBXA 5BRFA 3FLCO 5LY3A 1WUAA 4HWIA 3CHWA 4H5VA 3D2FB 3VOVA 3ATUA 4JHDA 1T6DA 1LCUA 3CJ9A 2YHWA 4YDUC 4WYBA 3ATVA 1MWMA 1QZ6A 2P9UA 3QBXA 1ATNA 3MN9A 2FF3B 5BN9A 2E1YA 3LM9A 5AQUA 2PBDA 3VEWA 1KAXA 2GWJA 2UYTA 2BUPA 3ZX2A 2P9SB 5AZJB 3UB5A 2FSNA 4FWNA 1U2VB 2ASMA 4B9QA 4JNEA 2QWNA 1HX1A 3U9ZA 4WQ4A 3VF6A 2CGLA 5AQTA 3FZHA 3ID8A 5AQOA 1YXQA 1KAZA 3RSEA 5AQVA 4CZKA 2I7PA 2A41A 3HZ6A 5F0XA 4M7XA 1BA1A 3CQYA 1EQYA 5AQGA 3BF3A 2P9UB 4H0VB 4MO5A 4KBOA 4FWOA 3L4IA 4FWQA 3WEEA 3EKSA 3DXKA 5KQDA 1NGCA 5AQFA 4BG9A 2Q36A 4QS9A 5AQXA 5F2RA 4PKHA 3DXMA 1NGIA 4M63C 5CE3A 3SMSA 1GLFO 1NGHA 3GOIA 4QS7A 3A5NC 2YJEA 2Q0UA 4BRHA 3FZMA 4FOEA 1NGGA 1JCGA 4BC5A 4BRGA 3LL3A 3AY9A 3MN7A 2ITMA 3ZETA 2E2OA 4IZ9A 2P9NB 4WQ4C 2NRHA 2E2QA 4A61A 3UKUA 4B1YB 4BGBA 3ULEB 2ASOA 3AAPA 3D2EA 4MO4A 4BQLA 2P9KB 4FL9A 4BRIA 1OKJA 2HF3A 5EVZA 2Q31A 1MDUB 2D0OA 4Z94A 2E20A 4PKIA 3LDOA 4FPAA 4FWSA 3A8YA 2P9LA 4BC2A 3QDKA 3SK3A 4BC3A 3VERA 3I33A 3KHYA 3MN6A 3CETA 2E88A 4I6MA 5ADXH 3MMVA 4B1UB 1KAYA 1QQNA 2QW9A 2OANA 3C7NB 1NBWA 3QICA 4FOIA 3HM8A 1D4XA 2EWSA 2ZGYA 4CD3A 4EAHD 3CQXA 5F1XA 2D1KA 3JXUA 5AR0A 1QQOA 1GLJO 4BRDA 4NO7A 1ZC6A 5AQNA 4YDUA 3CJCA 2E2NA 2YJFA 4K42A 3WXJA 3FZLA 3WQTA 5I9EB 1TYQA 3M6GA 4H03B 4B1ZA 1HUXA 3BEXA 2V51B 2HF4A 2I7NA 4FWKA 2FSKA 1GLAG 1SZ2A 4CI6A 2J4RA 4FWMA 2GWKA 2ZF5O 4DQ8A 5AQLA 2AP1A 4CZHA 2ZGZA 4JD2B 4BR0A 2V52B 1S3XA 2YHYA 1R59O 1HPMA 2FF6A 1SAZA 3IDHA 4HTLA 5BREA 2FLOA 3L6QA 3CJAA 1GLEG 3ENOA 2P9IA 3D7EO 2QWLA 3EO3A 3H45C 4ISEA 3VEXA 4B1WB 4QS8A 4IJAA 5AQRA 2FXUA 4CZFA 4DB3A 1XC3A 3LDPA 1X3MA 3LDNA 1Z05A 2QXLA 3M1FA 4FSVA 5AFUA 3SJHA 3WXKA 1TYQB 4IJNA 3CERA 3QB0A 1LOTB 1IG8A 1XUPO 3U8XA 3FR0A 2A5XA 3EKUA 3LDLA 3CIPA 3P4IA 1WOQA 2VWBA 3A5OC 3F9MA 1NGJA 5BRHA 2NLXA 1QZ5A 2IVNA 1GLBG 1QHAA 2A3ZA 3W3DA 4H0TB 5BPMA 3O08A 2P9IB 2A40A 4XH1A 3O1BA 3A5MC 2NZTA 4K25A 1H1VA 4JHDB 3W0LA 2F9WA 2CH6A 3EN9A 2BTFA 2H3GX 1J6ZA 1YVNA 2GEMA 2HMPA 1IJJA 3HBTA 5E26A 1BUPA 1MWKA 1NMDA 3VETA 2CGKA 4IWVA 4XEIA 1NM1A 3M3ZA 3BF1A 4C23A 1NGAA 1X3NA 4CBWA 3LDQA 5EX5A 4K43A 1MA9B 2V7YA 3CJ7A 4ISFA 4FWRA 2F9TA 1T6CA 5E84A 3ZEUA 4PL8A 5BRDA 3BP8A 1RFQA 3S41A 1NLVA 5BN8A 3RSEB 2KHOA 3GL1A 3R8EA 4BRAA 3VF2A 2YI1A 1GLDG 5AQHA 4BRLA 1JCEA 3HTVA 1C0FA 1JCFA 3VGLA 4K41A 4BRQA 5FPEA 5AQKA 1BDGA 4GNIA 3WEEB 3DXKB 3VGKA 1BA0A 1NGBA 3WT0A 3A5LC 3UKRA 1YUWA 3DXMB 5AQZA 2E8AA 4BR2A 1NGFA 3VESA 2CGJA 3WQUA 1BO5O 3ZX3A 4MLEA 2AA4A 1XQSC 3ZETB 1ZXOA 4H0XB 4IO8A 5AZIA 2VYPA 3GG4A 5BR9A 5ADXA 1E4GT 3UKUB 4CZEA 5KPTA 3JS6A 4FWLA 1HKBA 4GY2B 3GDQA 1G99A 3D2EB 2E1ZA 3O80A 4BREA 2E2PA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3TR8A 1ZYQA 4ELUA 4XH5A 2CH5A 2KPYA 2GUPA 1DEJA 3I8BA 4AAZA 3SUPA 2YILA 3KP1A 1JL2A 1TV6A 2ZJQL 1YJ9N 3CC7N 1ICAA 1NMNA 4PKGA 4Z4FA 5LMNK 2LSNA 4WFBL 4EHTA 3D2FA 1A5WA 4FM2A 5ELZA 3SBGA 2IS3A 3L56A 1FKOA 1DGKN 2ETJA 4LF8K 5M1QA 4A62A 3I55N 4BRCA 4RCHA 3DJCA 3FFKB 4N5SA 1N32K 4BC4A 4G1QA 3ZSYA 4M7YA 4F2RA 1DKGD 3H6EA 4CIEA 2P9SA 3GBTA 1X9WA 4H5TA 5AFUH 3VEOA 3G4SN 3A0IX 4ISGA 4JKHA 4GVMA 4H0YB 2FSJA 3K58A 3HPHA 3KIOA 4JI5K 2EHGA 3M8PA 4DV2K 2G8UA 2O8CB 1GLCG 3KVGA 3AARA 4OJRA 3DRPA 4EFHA 3TSPA 4DLEA 3PLAA 3OYBA 5K14A 3P1GA 3G25A 3VQQA 1X9MA 3QNOA 1J53A 3IAYA 1W97L 2Z1IA 4FJMA 2W00A 1PTXA 3L8BA 2HBKA 4KHQA 1VSMA 4CZJA 4DR1K 2QWPA 2W41A 4E19A 3HRGA 5FPMA 3KOYA 1XI1A 1NK4A 4CFCA 4JLHA 1ESVA 4NB4A 3IUCA 3I0SA 4GV9A 3HSCA 2VGNA 1HPZA 3EZWA 2LJ7A 1BRZA 2KTQA 5EY4A 1QQMA 1IKXA 3K0SA 1U4BA 5KPRA 1RDDA 1ZYWA 1XHZA 3VA0A 4CBUA 1ILYA 2ASPA 4HHTA 4J2BA 5JICA 3QFUA 1TGOA 5AQMA 2D4WA 1S1TA 1IKWA 2YC1C 4KKOA 1HKGA 2HB5A 2W40A 2G8KA 1L3TA 5AQWA 3H46O 2QM1A 4OKEA 1RDUA 2HOEA 4OLAA 4JK7A 4AH9A 3OYAA 4JD2A 1VQPN 1RCHA 2FBTA 1BOTO 4MQ3A 2X6SA 1Q82O 2A42A 3QMLA 2EX3A 1GLLO 1QVFM 1FW6A 4PL7A 4CGGA 4EHUA 2WTUA 4WE1A 2IDOA 3Q7CA 4FLXA 1Q9XA 1NJYA 2E3GA 1CZAN 2XY5A 4O8KA 4B08A 3ZSWA 3NAEA 1K8BA 2HNZA 1Q81O 3OS0A 4WFAL 2JWLA 1PX9A 3SAHA 2Q2RA 4KYPA 2OPRA 3SMPA 3O9RA 3HM9A 2BH1A 1TUUA 1KD1O 1NH5A 4CGFA 3QERA 3SQ1A 3HJFA 3BGRA 3V9UA 1NOYA 1A5XA 1S9EA 5KI6A 4JHDA 3HO1A 1T6DA 4YDUC 3CJ9A 3DLRA 1QZ6A 3CC2N 1C0MA 2YNGA 1XC9A 3C65A 1ZU3A 3SF4D 3OYKA 1J9AA 5AQUA 4KHPK 2O8BB 4CIGA 3O9SA 3ZX2A 2IC3A 5DK5A 3ALYA 1JLBA 1S6PA 4B9QA 1VSEA 4IDHA 1HX1A 3MWPA 1D9FA 4WQ4A 1GOBA 3C94A 3CW4A 3FZHA 3AVFA 4FLYA 4E7JA 1QSLA 1KAZA 1VQ7N 4DFMA 4IFYA 4DTNA 3AA5X 1CZ9A 1EQYA 1NNEA 1EKEA 4MO5A 5MLCQ 3KP0A 4M3UA 4JEPA 3ZSQA 4KTWA 4PKHA 2E0HA 1WAJA 4KTQA 3DLBA 1SEGA 4CF0A 1HRHA 1VQNN 3IG1A 1WNSA 4DSKA 4CJ5A 4EP5A 3ULDA 1WB9A 4DWIA 5I3UA 3PO4A 4BRGA 5FRMA 3MN7A 2ITMA 3ZETA 4OO1J 2RPIA 1SN4A 1TL1A 1VSLA 4DF8A 2I61A 4V1DC 3IRXA 2KQ2A 2ZJRL 2ASOA 3AAPA 2YBRC 4J2EA 2F96A 1N5YA 4MO4A 4BQLA 1D8YA 3SBTA 4BRIA 2ZD1A 2HF3A 5EVZA 1KTQA 1NJXA 4IEIA 1QTMA 4FWSA 1QSSA 3QDKA 2GUIA 3VERA 1TVRA 1OH6A 4FJKA 4CK1A 3MN6A 2E88A 5ADXH 1DTTA 3AVKA 1JLQA 3QICA 1NBWA 1JL1A 3HM8A 2ZGYA 4BY9C 4DSIA 5F1XA 3RMAA 1YHQN 1JXCA 4FXDA 1NK6A 5AR0A 3VQ7A 4L8RB 1QQOA 1GLJO 3AVCA 3S9HA 4KHNA 3VQ6A 1IBMK 3J81O 4E7HA 3OTOK 2B68A 3NF6A 4N76A 4GKKK 3DYAA 4NLBA 1EETA 4BEBA 1HUXA 3CPEA 5J2MA 4FWKA 4DR7K 3BDPA 2J4RA 4FWMA 5CR4A 3AV9A 4E7IA 3O9TA 3NDKA 1CXQA 1R59O 2FC0A 3C6UA 3ZT2A 3AO5A 2QWLA 4JI8K 4CZFA 3MXIA 3BZCA 1X3MA 5GADP 2O8CA 2QXLA 1VNAA 3B6PA 3KK2A 3SQ4A 3KK3A 3M8QA 1TYQB 4ZTFA 1VSJA 3CERA 1RT5A 3QB0A 1IG8A 1P90A 3AO4A 4RG8A 2XY7A 4E89A 3LDLA 3CIPA 3P4IA 2VWBA 3A5OC 3F9MA 5BRHA 3TSUA 2IVNA 1QHAA 2A3ZA 5KTQA 4DTRA 4H0TB 2FBXA 1YJWN 4CIFA 2P9IB 2A40A 4CF1A 1HMVA 4IG0A 3A5MC 4LF7K 5HLFA 1YJNN 4DFPA 5CHIA 3EN9A 3AGKA 4B3MK 1J6ZA 4LH4A 1S1UA 4JK9A 1MU2A 1IJJA 3WNHA 1Y97A 3VETA 1NM1A 4CHPA 4IDKA 5FLXO 4CW7B 2V7YA 3CJ7A 1NK0A 3KLHA 4B9SA 4IOAL 4DU4A 2Z1GA 5CZ2A 4FWRA 4DS5A 3KWIA 2O8DB 1S9GA 2VWJA 1RFQA 1WSFA 3KOXA 3JSMA 3RSEB 3TABA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3TR8 A;  1ZYQ A;  4ELU A;  4XH5 A;  2CH5 A;  2KPY A;  2GUP A;  1DEJ A;  3I8B A;  4AAZ A;  3SUP A;  2YIL A;  3KP1 A;  1JL2 A;  1TV6 A;  2ZJQ L;  1YJ9 N;  3CC7 N;  1ICA A;  1NMN A;  4PKG A;  4Z4F A;  5LMN K;  2LSN A;  4WFB L;  4EHT A;  3D2F A;  1A5W A;  4FM2 A;  5ELZ A;  3SBG A;  2IS3 A;  3L56 A;  1FKO A;  1DGK N;  2ETJ A;  4LF8 K;  5M1Q A;  4A62 A;  3I55 N;  4BRC A;  4RCH A;  3DJC A;  3FFK B;  4N5S A;  1N32 K;  4BC4 A;  4G1Q A;  3ZSY A;  4M7Y A;  4F2R A;  1DKG D;  3H6E A;  4CIE A;  2P9S A;  3GBT A;  1X9W A;  4H5T A;  5AFU H;  3VEO A;  3G4S N;  3A0I X;  4ISG A;  4JKH A;  4GVM A;  4H0Y B;  2FSJ A;  3K58 A;  3HPH A;  3KIO A;  4JI5 K;  2EHG A;  3M8P A;  4DV2 K;  2G8U A;  2O8C B;  1GLC G;  3KVG A;  3AAR A;  4OJR A;  3DRP A;  4EFH A;  3TSP A;  4DLE A;  3PLA A;  3OYB A;  5K14 A;  3P1G A;  3G25 A;  3VQQ A;  1X9M A;  3QNO A;  1J53 A;  3IAY A;  1W97 L;  2Z1I A;  4FJM A;  2W00 A;  1PTX A;  3L8B A;  2HBK A;  4KHQ A;  1VSM A;  4CZJ A;  4DR1 K;  2QWP A;  2W41 A;  4E19 A;  3HRG A;  5FPM A;  3KOY A;  1XI1 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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