5FPMA

Structure of heat shock-related 70kda protein 2 with small-molecule ligand 5-phenyl-1,3,4-oxadiazole-2-thiol (at809) in an alternate binding site.
Total Genus 121
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
121
sequence length
381
structure length
379
Chain Sequence
GPAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTIFDAKRLIGRKFEDATVQSDMKHWPFRVVSEGGKPKVQVEYKGETKTFFPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGGKVHSAVITVPAYFNDSQRQATKDAGTITGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKGGGEKNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVSHLAEEFKRKHKKDIGPNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGVDFYTSITRARFEELNADLFRGTLEPVEKALRDAKLDKGQIQEIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILIG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Detection of Secondary Binding Sites in Proteins Using Fragment Screening.
pubmed doi rcsb
molecule keywords HEAT SHOCK-RELATED 70KDA PROTEIN 2
molecule tags Chaperone
source organism Homo sapiens
total genus 121
structure length 379
sequence length 381
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-12-02
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5fpmA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5fpmA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5fpmA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5fpmA04
5E26A 4I6MB 3VGKA 1IJJA 4J8FA 4HTLA 3C7NB 1WOQA 1HUXA 1Y64A 1K8KA 3UB5A 3CHWA 2NLXA 4M7XA 3LM2A 4A62A 2FLOA 2BTFA 3B8AX 3LDOA 4B1UB 4EIAA 3R8EA 4CD1A 3L0QA 2Q31A 5ELZA 2FXUA 1J6ZA 3FZMA 3AAQA 1E4FT 1JCFA 4JHDA 3RSEA 2KHOA 2ZWHA 1NMDA 4BRKA 3O1WA 3MCPA 4FWPA 4NO7A 4BG9A 5F1XA 1HKCA 4BRDA 1BDGA 4H0TB 4QS9A 3UKRA 1DGKN 2QWPA 2WUSA 2YJEA 3LDLA 4EFHA 2P9KA 2A5XA 4WQ5C 4CJ7A 2Q1NA 3VEYA 1MWKA 2AA4A 1D4XA 3AARA 2P9IB 1SZ2A 3ZETA 3VF4A 4M7YA 5JLHA 4JN4A 3TU5A 1DKGD 1Z05A 1NLVA 2P9SB 3GDQA 1OKJA 3LM9A 2ZGZA 4A61A 4BRLA 3IDHA 3JS6A 5EY4A 1KAXA 3ZX2A 4B1ZA 4AM6A 1HLUA 1YAGA 2E88A 4GNIA 2HF3A 2CGKA 1Z6RA 1QQNA 2E2NA 2E2PA 3QB0A 4PKHA 4YDUC 3L4IA 5F2RA 3O6WA 5AQVA 4PKGA 4FWMA 5AFUH 4H5NA 3VOVA 3GE1A 2V7ZA 4CZGA 1S3XA 5AZIB 4I6MA 2P9UA 1YVNA 3WXLA 5KQ8A 3VEZA 1GLBG 1MDUB 5BPMA 4H5VA 3IUCA 5BN8A 2V51B 3G25A 3HI0A 5JICA 2FSNA 4BROA 5AQNA 3BF1A 3OHRA 3QBWA 4K25A 2OANA 3H46O 5BR9A 2FF3B 4O5FA 3UKUA 3W3DA 1NGCA 1TUYA 1TYQB 4B1XB 4EHUA 4BRMA 3ENHA 3ZX0A 1YXQA 5EOYA 4MLEA 1X9JA 1LOTB 2GWKA 2A40A 3MN7A 3SK3A 5BRDA 2QWNA 1EQYA 3A8YA 4A2BA 1HPMA 4DCHA 2IVPA 2P9IA 1BUPA 5AQZA 3FZFA 2P9LB 2E20A 3EKSA 5AQIA 3KZBA 3R6MA 3J8AA 2P9SA 2QWMA 3LDQA 4JNEA 1H1VA 4BRGA 3D7EO 5JLFA 3GOIA 3BF3A 1SAZA 2PBDA 3BEXA 3F9MA 4FO0A 4BRNA 2NRHA 4XEIA 3U9DA 4DHYA 5B8HA 4BR4A 3VEWA 4DB3A 4PL7A 3GL1A 1DEJA 2P9NB 3VERA 4BC4A 5AQYA 3L6QA 2HMPA 2E2OA 4Y0WA 5AQTA 3CETA 3QBXA 4C23A 3FLCO 4IO8A 3WXJA 4HWIA 5AQRA 3QMLA 2A6AA 2ITMA 3CJ7A 4FWRA 4FWLA 4JD2B 4H0XB 3TPQA 3ULEA 4BRQA 3EO3A 1JCEA 3DWLA 1JCGA 3CERA 1X3MA 2YJFA 3IMXA 3HM8A 4BC5A 1RGIA 3WXIA 2Q2RA 4H0VB 4CZJA 4BREA 2NZTA 1BO5O 5AQKA 1NGJA 1V4TA 3BUZB 3H1QA 3GBTA 3KVGA 1TYQA 1T44A 2FF6A 3H1VX 5TKYA 1NGGA 2I7NA 4QS7A 4IZ9A 1U6ZA 3R9PA 3QFUA 2YI1A 3DJCA 3FE1A 5AQWA 4PL8A 4CZEA 5E84A 2QWLA 4BVOA 3MMVA 4H03B 3M1FA 1QQMA 2QWOA 2F9TA 2I7PA 1S22A 4XH1A 1QZ6A 1KAYA 3P4IA 3I33A 4H5TA 2E8AA 2P9LA 1XUPO 1T6DA 2VCPA 3O08A 4CI6A 3VENA 3QFPA 3O8MA 1GLFO 5BPNA 3M6GA 3EL2A 3ENOA 3CJ9A 2EWSA 3O4WA 3O80A 4BR9A 3AAPA 3U9ZA 1Q18A 3WQUA 4FWOA 2GTDA 3O5BA 2HOEA 1V4SA 3VGLA 4FSVA 4A2AA 1ATNA 2P9NA 3C7NA 5AQOA 1R59O 5AQHA 5AQQA 5ADXH 3EKUA 4H5WA 3FFKB 4F9OA 4CZIA 1BWFO 2A42A 4BQZA 3FZLA 4ISFA 5KPTA 2W41A 3VGMA 1K8KB 3WEEB 3O1BA 3D2FB 4JD2A 1NGBA 2IVOA 1ZXOA 4IWVA 1RFQA 3CJAA 3LL3A 5EXWA 3KHYA 3HZ6A 1GLDG 3SLCA 3MN6A 1X3NA 4FWQA 1NWKA 4WQ4A 1NGDA 3FZHA 5AQUA 3SMPA 1NGEA 1SQKA 3GG4A 1BG3A 3VF2A 4L3QA 5KQDA 4JHDB 4BGAA 3CJBA 3H3NO 3VEOA 4B9QA 4AM7A 4BG8A 3U4LA 3VPZA 4QS8A 2A41A 2FSJA 2HF4A 2YCHA 3DXMB 2ASOA 4BR2A 4IJNA 4XH4A 3A5MC 2GELA 2J4RA 2VWBA 3CJCA 5LJWA 4EHTA 3ATUA 4FL9A 4BR5A 1E4GT 3A0IX 4GY2B 3MN5A 1G99A 4BC3A 4E1JA 2E1ZA 4BRCA 4B1VA 5AR0A 4BRHA 5BPLA 4LC9B 5AQPA 5FPMA 1QZ5A 2GWJA 5BN9A 2BUPA 2UYTA 5AFUA 4ISEA 1NGHA 2Q0RA 5FPNA 1NM1A 3ATVA 4ISGA 3ZEUB 4WQ4C 4CBUA 2D1KA 3MK6A 1GLCG 4K43A 5BREA 5AZIA 2IIRA 5AQMA 1U2VB 1WUAA 4JAXA 4FWKA 3QDKA 1BU6O 3FR0A 4IXCA 1RDWX 3MN9A 4FWSA 4BRAA 2QWRA 2P9UB 1ESVA 3WEEA 1GLAG 3D2FA 4MO5A 4FPBA 2CGLA 1LCUA 3VEVA 3M3ZA 1XC3A 3AY9A 4XH5A 3CJ1A 5AQLA 4K41A 2QW9A 4FWNA 2ASMA 3ZX3A 2YHXA 3UKUB 3FZKA 4BR7A 1CZAN 2ZF5O 3CQYA 3WT0A 1GLEG 4DQ8A 3HBTA 3VEXA 4MO4A 4YDUA 3HSCA 3VF6A 5FPEA 2FSKA 3A5OC 4H0YB 3WUHA 5AQSA 5AQJA 3VESA 1BA0A 1HKBA 2VYPA 5JMVA 3DXKB 3DXMA 2GEMA 4MLHA 2GUPA 3A5NC 4CZLA 4RWTA 3H3OB 3ID8A 2D0PA 5BRHA 2ASPA 4BRFA 2CH6A 3QICA 4B1YB 3FGUA 4H0OA 3EZWA 4B1WB 4CZHA 1NGIA 2DPNA 1NGAA 5AZJB 3HTVA 2CGJA 1YUWA 1XQSC 3BP8A 4K42A 3D2EB 2YHWA 2P9PB 3WQTA 5AQFA 5AQGA 4EAHD 2ZGYA 3CIPA 4M63C 5F0XA 3CI5A 5FPDA 4H5RA 2AP1A 4CD3A 3ZEUA 1QHAA 2QWQA 3SJHA 5KPZA 2V52B 4BR0A 1ZC6A 2E1YA 4BVPA 4CZFA 5EX5A 3WXKA 1U2VA 3U8XA 3UE5A 2H3GX 1P8ZA 5KPRA 3C0BA 4WYBA 3CQXA 3H45C 1C0FA 2QXLA 2YHYA 5AQXA 3VETA 3IFRA 5EVZA 2PAVA 2E2QA 1ATRA 3ULEB 2D4WA 4BC2A 3S41A 3SMSA 2W40A 4PKIA 1BA1A 4BQLA 3RSEB 1GLJO 2Q36A 2IVNA 1T6CA 2QM1A 4H0PA 3I8BA 1ZBSA 1HX1A 4RTFD 3UKRB 2Q97A 2V7YA 1HKGA 4BRIA 2P9KB 3DAWA 1C0GA 3H6EA 4IJAA 1NBWA 2D0OA 3LDNA 1BOTO 4RCHA 1ATSA 3ZETB 4CZKA 3DXKA 5LY3A 5CE3A 2Q0UA 4FOEA 4BGBA 4Z94A 5LJVA 1NGFA 3LDPA 4CBXA 4O8KA 3W0LA 4CZMA 5AZJA 1GLLO 1IG8A 3D2EA 3A5LC 4KBOA 1KXPA 2CH5A 1HJOA 2P9PA 5I9EB 1KAZA 4WQ5A 5ADXA 1MA9B 3EN9A 3MDQA 4FOIA 4NB4A 4CBWA 1QQOA 2F9WA 1MWMA 4BRPA 2A3ZA 4FPAA 3JXUA 1TUUA 5BRFA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5HROA 3VGKA 3IG1A 2RKIA 4J8FA 1WOQA 1Y64A 3CHWA 4EP4A 3Q7CA 4M7XA 3LM2A 4A62A 3PY8A 4B1UB 4KTWA 2O4GA 3AVBA 3AAQA 2C1IA 4JKGB 1HNVA 2UXBK 1WAJA 4DSJA 2KHOA 2ZWHA 4CVNE 1KVCA 4FWPA 1BIZA 2F96A 4BRDA 1BDGA 4H0TB 1UOCA 4FJJA 3D0PA 3K59A 2NRZA 3LWMA 4LD0A 2Q1NA 3THYA 3VEYA 1HYVA 3UIQA 5C10A 3CMEN 3QESA 1D4XA 3J80O 5DMRA 3CC4N 1NKEA 1U48A 4M7YA 2D56A 1L3SA 4JN4A 1Z05A 1NLVA 4RW6A 3GDQA 3KOWA 3LM9A 3SQ4A 4BRLA 4JK7A 3THVA 3C94A 4V19S 3SPYA 4HHTA 3PSFA 1L5UA 1NOYA 1HLUA 4AB0A 5HRPA 1SL0A 4CEFA 3M5RA 1C1AA 3IS9A 3L4IA 5F2RA 1RBSA 4PKGA 4H5NA 2F8SA 3OTOK 3AO2A 1WN7A 3GE1A 4HUEA 4DR1K 1NU0A 4FJ7A 1YVNA 3OYJA 3MXIA 1NJIO 3OYDA 1MDUB 3DMJA 1JKHA 1QTMA 4HUGA 1C1BA 2OPQA 2V51B 3G25A 4FM0A 3HI0A 5JICA 3KKRA 4BROA 3PX4A 2D0CA 2E2FA 4DFMA 3CCLN 4E72A 1MU2A 4AH9A 4QOZB 2FF3B 3I0SA 1NGCA 2Z1JA 4CK1A 1NK4A 1NKBA 4IG3A 2YKNA 3ASMA 3DLEA 4O55A 4X66K 4BRMA 1IG9A 1YXQA 3HPOA 4DTSA 4MLEA 3OYBA 3T7ZA 4DSFA 1GPSA 3F9KA 3VQ7A 1EWQA 4KPYA 2QWNA 4F3OA 4E3SA 3A8YA 3S3MA 4A2BA 4H4MA 2UXCK 1JL2A 2Z1HA 1RT1A 3CQ8A 1B3CA 5C24A 2IVPA 2NRWA 1I2UA 3RMBA 2P9IA 1YF5L 1UA1A 2LSNA 1C0MA 3NGYA 3FZFA 3SUPA 5M1FA 2P9LB 2E20A 3EKSA 4KI6A 4I9QA 2O8FB 3AVGA 3KZBA 2NNWA 3JYTA 4LH4A 1T7BA 1BQMA 1H1VA 3VQAA 2W6KA 3DOKA 3S3OA 1RT2A 1IBKK 3GOIA 1LWCA 1BCMA 1SAZA 2PBDA 2I61A 4F4KA 3U3GA 4LSLA 4BRNA 2E6LA 4DQQA 3BDPA 1N8RO 4O4GA 3L6QA 2I5JA 4X62K 2E2OA 4E19A 3SI6A 4FJNA 4Y0WA 5AQTA 3VQEA 3NH0A 3LPUA 1IBMK 5MLCQ 3O3GA 5AQRA 3QMLA 2A6AA 4A5BA 4FWLA 3TPQA 4H0XB 4KHUA 3EO3A 1JCGA 3CERA 2DY4A 1X3MA 2FC0A 2YJFA 3ZT4A 4YORA 4CGGA 4XIUA 1Q82O 3OJSA 2G8KA 3SQ1A 4BC5A 1RGIA 3WXIA 1S1XA 3FFIA 3P38A 1BO5O 4DUYK 1WMTA 1LV5A 4IG0A 3AVAA 4JV5K 1O13A 1LQQA 3CF5L 4OJRA 3O3HA 1TL1A 3ALYA 5TKYA 4FLUA 1N36K 1L4VA 2KKZA 3SJJA 2F8TA 4QS7A 5I3UA 5KK4A 4M42A 3M8RA 3AO4A 1L3TA 4PL8A 1RT5A 2Z1GA 3KK2A 3AV9A 3MECA 2QWLA 5KGWA 4CJKA 5JVHL 3MMVA 4H03B 3ZT0A 1QSYA 2W6LA 3RMAA 1KAYA 1DTQA 2BANA 1KLMA 4BE0A 3CFRA 3J7YP 2K35A 1EWRA 1TAQA 3O08A 2DTUA 3CCJN 1GLFO 1YJ9N 3EL2A 4CW7B 4CFCA 3O4WA 4BR9A 3AAPA 1Q18A 4JKEA 5HBMA 4FM2A 4FWOA 3QEVA 1D9DA 3NGIA 4BDZA 3KIOA 2GTDA 1D5AA 1NK7A 3AA5X 4MQ3A 3C7NA 4OGCA 5DK5A 3EKUA 3FFKB 2A42A 1WBBA 3FZLA 3PIPL 4ISFA 5KPTA 5M1NA 3VGMA 3F2KA 3O1BA 4JD2A 1NGBA 3QINA 2IVOA 4PQUA 4FJ9A 4V1DC 1RFQA 1GLDG 3HSTB 3CD6N 3TSPA 4JKAA 2WBNA 4ZHRA 5FRMA 1HPZA 3LP2A 4M3UA 3BGRA 5AQUA 1SS6A 1SQKA 3OBYA 1VSIA 3AVLA 4B9QA 1FK9A 4KAZA 4KH6A 3LAKA 2A41A 1QHTA 2NRVA 2YCHA 2IS3A 4M3ZA 1JLAA 2ASOA 3AO5A 3LALA 4OO1J 4IJNA 1B9DA 4FLWA 1BCOA 3HOTA 4E7HA 4FL9A 3OBWA 2NY8X 4I7FA 3MN5A 2GX9A 4DR6K 4M41A 2E4LA 4BRCA 4ELTA 4BRHA 5BPLA 4DV5K 2RN2A 4OPAA 3CCVN 1NJWA 2BUPA 2ZJQL 2UYTA 5AFUA 3RR8A 2Q0RA 1CZBA 3SUOA 3QERA 4K43A 3R3LA 1U2VB 3C6HA 4IOCL 2NUBA 1WB9A 3KD1E 4F3TA 4IXCA 4LY7A 4DV1K 1GLAG 4KV8A 4MO5A 4IFVA 3LAMA 5JS1A 1LCUA 3VEVA 1YTAA 4JS5A 4J2DA 1XC3A 3CG7A 5I42A 4K41A 4JKBA 2QW9A 4AF1A 3DM2A 3CC7N 3FZKA 4W5NA 2B4JA 2VGNA 1KD1O 1WSIA 2XY7A 4B3OA 1KSPA 1NMNA 4CJ4A 3MX2A 2P5OA 3THXA 1Q9YA 2HHXA 2IDOA 5M1PA 4B3MK 4KHPK 5AQJA 4CJSA 1Q81O 2X6NA 3DXKB 3DXMA 4O0JA 4CHQA 4YY3K 3P39A 1C0TA 3A5NC 1OZZA 3HL8A 4CF9A 4JK9A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 5HRO A;  3VGK A;  3IG1 A;  2RKI A;  4J8F A;  1WOQ A;  1Y64 A;  3CHW A;  4EP4 A;  3Q7C A;  4M7X A;  3LM2 A;  4A62 A;  3PY8 A;  4B1U B;  4KTW A;  2O4G A;  3AVB A;  3AAQ A;  2C1I A;  4JKG B;  1HNV A;  2UXB K;  1WAJ A;  4DSJ A;  2KHO A;  2ZWH A;  4CVN E;  1KVC A;  4FWP A;  1BIZ A;  2F96 A;  4BRD A;  1BDG A;  4H0T B;  1UOC A;  4FJJ A;  3D0P A;  3K59 A;  2NRZ A;  3LWM A;  4LD0 A;  2Q1N A;  3THY A;  3VEY A;  1HYV A;  3UIQ A;  5C10 A;  3CME N;  3QES A;  1D4X A;  3J80 O;  5DMR A;  3CC4 N;  1NKE A;  1U48 A;  4M7Y A;  2D56 A;  1L3S A;  4JN4 A;  1Z05 A;  1NLV A;  4RW6 A;  3GDQ A;  3KOW A;  3LM9 A;  3SQ4 A;  4BRL A;  4JK7 A;  3THV A;  3C94 A;  4V19 S;  3SPY A;  4HHT A;  3PSF A;  1L5U A;  1NOY A;  1HLU A;  4AB0 A;  5HRP A;  1SL0 A;  4CEF A;  3M5R A;  1C1A A;  3IS9 A;  3L4I A;  5F2R A;  1RBS A;  4PKG A;  4H5N A;  2F8S A;  3OTO K;  3AO2 A;  1WN7 A;  3GE1 A;  4HUE A;  4DR1 K;  1NU0 A;  4FJ7 A;  1YVN A;  3OYJ A;  3MXI A;  1NJI O;  3OYD A;  1MDU B;  3DMJ A;  1JKH A;  1QTM A;  4HUG A;  1C1B A;  2OPQ A;  2V51 B; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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