5FPMA

Structure of heat shock-related 70kda protein 2 with small-molecule ligand 5-phenyl-1,3,4-oxadiazole-2-thiol (at809) in an alternate binding site.
Total Genus 121
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
121
sequence length
381
structure length
379
Chain Sequence
GPAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTIFDAKRLIGRKFEDATVQSDMKHWPFRVVSEGGKPKVQVEYKGETKTFFPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGGKVHSAVITVPAYFNDSQRQATKDAGTITGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKGGGEKNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVSHLAEEFKRKHKKDIGPNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGVDFYTSITRARFEELNADLFRGTLEPVEKALRDAKLDKGQIQEIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILIG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Detection of Secondary Binding Sites in Proteins Using Fragment Screening.
pubmed doi rcsb
molecule keywords HEAT SHOCK-RELATED 70KDA PROTEIN 2
molecule tags Chaperone
source organism Homo sapiens
total genus 121
structure length 379
sequence length 381
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-12-02
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5fpmA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5fpmA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5fpmA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5fpmA04
3AAQA 3IUCA 1H1VA 1HLUA 3M3ZA 3FFKB 3KVGA 2CGLA 2E20A 2GUPA 2EWSA 1NBWA 3VF6A 4H5TA 5BPLA 4FWSA 5B8HA 4FO0A 1BO5O 3M6GA 4YDUC 4B1WB 3GG4A 4ISGA 4CZEA 4BQLA 5AQHA 5AQGA 4IJNA 2P9LB 3C0BA 2P9SA 4FWPA 2I7NA 5EOYA 2W40A 5AQJA 2H3GX 4M7XA 3TPQA 4BRHA 3U4LA 1Z6RA 3FZLA 3W0LA 4K41A 3C7NB 3VF4A 4CZGA 5KQ8A 3P4IA 5BN9A 2D0OA 1GLAG 4FPAA 1KAZA 3QBXA 4BRQA 2QWOA 1TYQA 2Q1NA 2GELA 4AM6A 5AQTA 4FWMA 2ITMA 3A5NC 3O6WA 3UE5A 2QM1A 1NGIA 1KXPA 1MA9B 2WUSA 2BUPA 3MN6A 3WQUA 5AQKA 5AQUA 3LL3A 1NGAA 2FXUA 4BC3A 4BC2A 3TU5A 4H0PA 2YJFA 4H5VA 2FF6A 4BRCA 3LM9A 3R6MA 3FLCO 1NLVA 4BR4A 3D2EB 1RFQA 3QB0A 5I9EB 3HI0A 2YI1A 4GNIA 3D2FB 1XUPO 3L4IA 3SLCA 3UKRA 1GLDG 1LOTB 3AY9A 3WQTA 1LCUA 5BPMA 1D4XA 2VCPA 3BP8A 4FL9A 1NGBA 3BEXA 4I6MB 3I33A 2YHWA 4WQ5A 5AQOA 3CETA 3SMPA 1YVNA 3CJAA 4H0VB 2P9IB 4IZ9A 2IVOA 3ENHA 2IVPA 3R8EA 2E2NA 3ZETB 5AQQA 4WQ4A 4BC4A 4BRNA 2ASOA 2E8AA 4C23A 2P9PA 2NZTA 2P9NA 1HX1A 1R59O 5EY4A 4PKHA 2YJEA 4CJ7A 4EHTA 2ZF5O 4RWTA 1BDGA 4BC5A 4JN4A 4H0YB 3EO3A 4DQ8A 1MDUB 2I7PA 3CJ7A 3MMVA 4JAXA 5EXWA 1BG3A 3H3NO 3MN5A 3CJCA 5ELZA 3ATUA 3EKSA 1SQKA 3EN9A 4MLHA 4CD3A 3L6QA 1U6ZA 1V4SA 3WEEA 3F9MA 2YCHA 1T6CA 4I6MA 4FSVA 2V51B 1QQMA 1G99A 5AQPA 2E1YA 1QZ6A 3SJHA 1NGJA 2E88A 3CI5A 2Q31A 3H1VX 5AZIB 3ZETA 4ISEA 3GE1A 4BR9A 1WUAA 5JICA 4O8KA 2AP1A 2A6AA 4DCHA 1DKGD 1K8KA 4PKIA 3FZMA 4EFHA 3CQXA 1C0GA 3L0QA 3DXMB 3IDHA 3MDQA 2FSJA 2P9KA 4RTFD 3UB5A 1DGKN 3VPZA 1YAGA 4DB3A 3DXKA 5AQMA 4CZJA 3QICA 4CZLA 3BF3A 5AQNA 1TUYA 2ASMA 3ID8A 4XEIA 5AQWA 1QQOA 1IJJA 4BRMA 4BGAA 4F9OA 2ZGZA 3MCPA 2F9WA 5AQVA 4WYBA 2ZGYA 2YHYA 3ENOA 3J8AA 3MN9A 1X3MA 3S41A 4CZFA 4B1XB 1SZ2A 3AARA 1NMDA 2Q36A 3EKUA 3I8BA 1KAXA 4BRDA 3CQYA 5AQZA 2GWJA 3CIPA 4BGBA 2A41A 3IMXA 2BTFA 4LC9B 4NB4A 5KPZA 4IJAA 4PL8A 2Q0UA 3DAWA 4DHYA 1BUPA 1HKBA 3DXMA 2D4WA 3H6EA 3U8XA 1U2VB 3DWLA 4BRLA 3O1BA 2VYPA 4FWRA 4MO5A 1TUUA 3O80A 1NGEA 4FWNA 4QS7A 4JHDB 2PBDA 2QXLA 2QWLA 4FWKA 2P9LA 2E2OA 3GBTA 4XH4A 4BQZA 3AAPA 3H45C 3VEZA 3H1QA 4B1VA 3CJ9A 4IXCA 3A5LC 3KHYA 3LM2A 3C7NA 3UKUB 2CGKA 5AQRA 3BUZB 4HWIA 5BN8A 3O4WA 2A5XA 2GWKA 3EZWA 3O1WA 5CE3A 5AQIA 5FPNA 3FR0A 3FZKA 4AM7A 3MN7A 3FGUA 3A5OC 2FSKA 4BRPA 3B8AX 4EHUA 3ZEUB 3KZBA 3ZX3A 4EAHD 2Q97A 4FWLA 4M7YA 3GL1A 1HPMA 3O5BA 2YHXA 5AQLA 2P9UB 4ISFA 3HBTA 4H03B 1NWKA 3VGMA 4JHDA 4BRFA 5BREA 3D2EA 4B1YB 4B1UB 4BREA 4BR7A 5E84A 3SK3A 3D2FA 2CH5A 2E2PA 1HKGA 2HF4A 4WQ5C 3QMLA 4Y0WA 2DPNA 5EX5A 3WUHA 3CJBA 1ZBSA 5FPDA 2ZWHA 3FZHA 4FOIA 2HMPA 1JCFA 1Y64A 5BRFA 2PAVA 3R9PA 4PL7A 2P9IA 1YUWA 1OKJA 3WT0A 1NGGA 3SMSA 3MK6A 4BVOA 5AR0A 2AA4A 3JS6A 2P9SB 5LJVA 2V52B 4K43A 3FZFA 2A3ZA 4HTLA 4YDUA 5FPEA 3ZEUA 2QWPA 4K25A 1QZ5A 2ASPA 4BRKA 4CBWA 4BG9A 5BRDA 4BRGA 1TYQB 2OANA 2QWMA 1NGFA 1HKCA 3A8YA 4H5NA 2V7YA 5AQXA 5F1XA 1EQYA 2FSNA 2UYTA 4QS9A 4FWOA 1WOQA 4JD2B 3U9ZA 2FLOA 1BA0A 4H0TB 1BA1A 1V4TA 3WXLA 2GEMA 3HZ6A 5LJWA 3VERA 5AZJB 3M1FA 1CZAN 4BROA 4BR2A 4A61A 4CZKA 4M63C 1ZXOA 4CI6A 5AQFA 4BRAA 4CD1A 5KPRA 1XC3A 5AZIA 3A5MC 2GTDA 1XQSC 4BR0A 1BWFO 1X9JA 4CZMA 1X3NA 1NGCA 4CBUA 4Z94A 5JMVA 3GDQA 3EL2A 2QWQA 3A0IX 4K42A 3UKRB 3ULEB 3FE1A 1E4FT 1NGHA 5AQSA 1SAZA 2F9TA 3VF2A 2QWRA 1ATNA 3CERA 3VGLA 4IWVA 1T6DA 1Q18A 2QW9A 3LDNA 1RDWX 4MO4A 4B1ZA 1Z05A 1GLFO 1NGDA 4JNEA 4L3QA 4KBOA 5AFUA 5BRHA 3VEXA 1BU6O 3VESA 4JD2A 3HTVA 4FWQA 2P9PB 2P9NB 3BF1A 5ADXA 3LDOA 4H0OA 3QBWA 4A62A 3O08A 5AZJA 3RSEB 2KHOA 1T44A 4A2AA 4CBXA 2A42A 3VEYA 1P8ZA 5BPNA 2HF3A 5FPMA 1IG8A 5AFUH 5AQYA 1GLEG 4BR5A 3VEWA 1ATRA 1C0FA 1HUXA 3D7EO 1GLCG 1QHAA 3ULEA 2D0PA 2CGJA 4CZIA 5ADXH 4QS8A 1BOTO 3WEEB 3VETA 1U2VA 2NLXA 4B9QA 2V7ZA 1QQNA 2J4RA 4J8FA 1HJOA 2FF3B 5TKYA 3VGKA 3HSCA 3CHWA 4RCHA 3ZX0A 5JLFA 4H0XB 1YXQA 5EVZA 1RGIA 1S22A 5LY3A 3LDPA 2Q0RA 2HOEA 3JXUA 1DEJA 4EIAA 1ZC6A 1JCEA 3LDLA 1K8KB 1ESVA 3VENA 3UKUA 2W41A 3O8MA 3ZX2A 1KAYA 2P9KB 3RSEA 3DJCA 4PKGA 2E1ZA 4WQ4C 5E26A 3DXKB 1S3XA 3GOIA 4FOEA 1J6ZA 3H46O 1GLJO 2D1KA 3WXJA 1MWKA 4O5FA 5JLHA 1NM1A 3LDQA 4CZHA 3ATVA 4NO7A 4XH5A 3W3DA 4H5RA 1MWMA 3HM8A 4BVPA 5BR9A 3G25A 2CH6A 4IO8A 4BRIA 4A2BA 3WXIA 1GLLO 1GLBG 3H3OB 3IFRA 2VWBA 4MLEA 4BG8A 2QWNA 3CJ1A 4GY2B 3U9DA 3VEVA 5F0XA 3QFPA 3OHRA 5KPTA 5KQDA 2A40A 2IVNA 2P9UA 4E1JA 2IIRA 3QFUA 5F2RA 4FPBA 4XH1A 2E2QA 3VEOA 3VOVA 1JCGA 3WXKA 2Q2RA 4H5WA 1E4GT 3QDKA 1ATSA 2NRHA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4OO1J 4W5NA 3HPHA 1H1VA 2W6KA 4CF1A 4U67L 4AHCA 3SBGA 1NJYA 4K0KK 4F8RA 1QVFM 3ZSYA 1TK8A 1RBUA 3KOWA 3HSTB 4BDYA 1KQSM 1L5UA 2P9LB 5CHIA 4F2SA 4FWPA 4KTZA 4DV5K 3HPGA 5EOYA 2GBZA 4MFBA 5CY4A 4BRHA 3V1RA 4JI8K 3C7NB 4LF5K 5BN9A 2D0OA 1KAZA 1CZBA 4AH9A 1ZFUA 5AQTA 3E7UX 4OX9K 1TKTA 2QM1A 1UA1A 1MA9B 4B9NA 5JVGL 3MN6A 4FM2A 3LL3A 3SYZA 1NGAA 4Z4HA 4BC2A 3TU5A 3ZT2A 4IBNA 4DSFA 2GMOA 1XC9A 4CGGA 1YITN 4CHNA 4FJKA 2EX3A 3QB0A 3HI0A 2HVIA 4GNIA 3L4IA 1DT9A 4ICLA 5KRTA 4LH4A 3SLCA 4DTJA 1I94K 3E7RL 1LOTB 4DG1A 2E4LA 2RKIA 4CJ4A 3KLEA 4DFJA 1VNAA 1NGBA 4I6MB 2DTUA 3AA4A 2HHWA 5C0YA 4E89A 4F4KA 5GADP 3RRGA 1P0AA 1YVNA 4H0VB 5HL7L 5HRSA 1ZYWA 4DLGA 2BRZA 3LAMA 3TANA 1Q86O 4OLBA 4CJVA 4BE2A 4LF9K 2ASOA 2P9PA 4FVUA 3O3GA 1Q7YO 1R59O 4PKHA 4CJ7A 4LFBK 4DKWA 4B9MA 2ZF5O 3G0ZA 1NRAA 3JYTA 1RT6A 4H0YB 1LW2A 3MXJA 3CJ7A 4G1QA 3MMVA 4JAXA 4O0JA 3KLFA 3BZKA 1TAQA 4CD3A 1POIA 4MLHA 3IG1A 3L6QA 3VQAA 1IKWA 2XRIA 3CQ8A 2OPPA 1MR4A 5KK4A 1XNRK 3DLHA 2NRXA 3M5RA 1YHQN 3R3LA 1RBRA 4CEAA 2WTUA 5DK5A 4CGDA 4IOCL 2Q31A 3O9TA 4Z4CA 3TAFA 1WUAA 4CEOA 4DSEA 1Q82O 4NCBA 1JKHA 4DTUA 2A6AA 2IAJA 5M1OA 3T1YK 4YHHK 3FZMA 3P5JA 1N4NA 4BE1A 3DXMB 2LSNA 3L2RA 2P9KA 4RTFD 3RMBA 4DB3A 1ZBHA 2YEOA 2VQFK 3VQPA 4KHSA 1BGXT 3GKUA 2P5OA 3ID8A 2GX9A 1Z25A 1ZBFA 1IJJA 1WSFA 3T7ZA 1OH6A 4JI7K 4HHFA 2I61A 4CK1A 4IOXA 2QK9A 3J8AA 3MN9A 1A5VA 3JSMA 3AA2A 3S41A 3AVBA 4Y1CA 1NKEA 1NMDA 2HBKA 5IWAK 4O55A 3CFOA 3CQYA 5AQZA 1ZUTA 5MLCQ 2O8EA 5IT9O 1LWFA 4B9UA 3CC2N 4PL8A 4DHYA 1HKBA 3H6EA 3QLHA 3HO1A 4X62K 1BI4A 4M3TA 4Q0BA 1WBBA 2X6SA 2D0BA 1TVRA 3LWMA 2E3FA 4JHDB 3SUOA 1Z26A 1OH8A 2P9LA 2E2OA 3OYHA 3MX5A 2O8DA 3GBTA 4AEIA 4CF2A 4BEBA 4XH4A 3WNFA 4C8MA 3QEXA 2YC1C 4BQZA 4KHYA 4CE9A 2N2RA 3NH2A 5C42A 3KHYA 3LM2A 3C7NA 3UKUB 4X66K 2A1SA 2NRVA 2A5XA 2G8UA 2MN5A 4B3RK 4BY9C 3DOLA 2YHBA 3FR0A 3WXMB 1JXEA 2YNHA 4HCBA 1T7BA 2KPYA 4E1NA 2FSKA 5E41A 3V1OA 1VSMA 1ZBLA 4CHQA 3B8AX 4Z4IA 3P31A 1U49A 2VGMA 3NHGA 4EHUA 3I56N 2HMIA 3TSPA 5GIOA 2UU9K 3ZX3A 4CGHA 4EAHD 2Q97A 5HOOA 1HPMA 2G8HA 1TI5A 4ISFA 3T1HK 4CFAA 3OYLA 4B1UB 5C12A 4DTSA 2E2PA 4DQRA 1ZBUA 1ZBIA 1QE1A 4BECA 1EWRA 1VRTA 1NK8A 1PTXA 2XY7A 4B9SA 2LI7A 3THWA 1XI1A 1ZBSA 5FPDA 3KK2A 3QIOA 3Q7BA 4OPJA 1JCFA 1Y64A 3DRRA 3NE6A 4GW6A 3MECA 1OH5A 2OA8A 1GPTA 3MK6A 5AR0A 1JLAA 2P9SB 5HROA 4HTLA 1JLCA 4CIGA 2PYLA 2QKKA 2QWPA 1HQEA 2ASPA 4A57A 1ILYA 3L2VA 5CY0A 4BRKA 4JLHA 3LDSA 1VQPN 4BG9A 2UXCK 5KGXA 5FRNA 2QWMA 1EP4A 2F7TA 4H5NA 2VG5A 3NGIA 2V7YA 5K14A 3AVFA 2N66A 4KKOA 1VSDA 4RW6A 3D0PA 3LZIA 3U9ZA 4EZ6A 3LALA 1BA0A 1WB9A 3NDKA 5SWMA 1P00A 1RT7A 2GEMA 3VERA 1T05A 3LZJA 3ZLJA 3R2VA 3OYJA 3LWLA 4M63C 3S3NA 4CD1A 2NY9X 2GTDA 1XQSC 3ZSRA 4F3TA 4CEEA 1IV0A 1X9JA 1X3NA 3AO5A 1NGCA 4CBUA 1SEGA 4CIEA 3LP2A 5HRPA 5JMVA 3GDQA 3EL2A 4IEEA 2QWQA 3A0IX 4JI0K 4GKKK 2HNYA 1JLBA 4AHSA 5J2PA 1NGHA 2NY8X 1E4FT 2HBJA 3K2PA 3VQ5A 1VK0A 1ATNA 4IWVA 5AJ3K 1Q18A 4H4OA 4OPKA 2GV9A 4CJEA 4FYDA 2KKZA 1WAJA 1BQNA 1Z05A 1GLFO 1NGDA 3LPUA 4JNEA 4L3QA 5AFUA 3H08A 1QQCA 3PO5A 1NMNA 1RDDA 5CR4A 1BU6O 3VESA 3ZSQA 4FWQA 1ZU3A 2E2FA 1IBKK 3KJVA 3CC7N 2W42A 4CGIA 4J2BA 4A62A 1QS4A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 2FLO A;  1BA0 A;  4H0T B;  1BA1 A;  1V4T A;  3WXL A;  2GEM A;  3HZ6 A;  5LJW A;  3VER A;  5AZJ B;  3M1F A;  1CZA N;  4BRO A;  4BR2 A;  4A61 A;  4CZK A;  4M63 C;  1ZXO A;  4CI6 A;  5AQF A;  4BRA A;  4CD1 A;  5KPR A;  1XC3 A;  5AZI A;  3A5M C;  2GTD A;  1XQS C;  4BR0 A;  1BWF O;  1X9J A;  4CZM A;  1X3N A;  1NGC A;  4CBU A;  4Z94 A;  5JMV A;  3GDQ A;  3EL2 A;  2QWQ A;  3A0I X;  4K42 A;  3UKR B;  3ULE B;  3FE1 A;  1E4F T;  1NGH A;  5AQS A;  1SAZ A;  2F9T A;  3VF2 A;  2QWR A;  1ATN A;  3CER A;  3VGL A;  4IWV A;  1T6D A;  1Q18 A;  2QW9 A;  3LDN A;  1RDW X;  4MO4 A;  4B1Z A;  1Z05 A;  1GLF O;  1NGD A;  4JNE A;  4L3Q A;  4KBO A;  5AFU A;  5BRH A;  3VEX A;  1BU6 O;  3VES A;  4JD2 A;  3HTV A;  4FWQ A;  2P9P B;  2P9N B;  3BF1 A;  5ADX A;  3LDO A;  4H0O A;  3QBW A;  4A62 A;  3O08 A;  5AZJ A;  3RSE B;  2KHO A;  1T44 A;  4A2A A;  4CBX A;  2A42 A;  3VEY A;  1P8Z A;  5BPN A;  2HF3 A;  5FPM A;  1IG8 A;  5AFU H;  5AQY A;  1GLE G;  4BR5 A;  3VEW A;  1ATR A;  1C0F A;  1HUX A;  3D7E O;  1GLC G;  1QHA A;  3ULE A; 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 3VOV A;  1JCG A;  3WXK A;  2Q2R A;  4H5W A;  1E4G T;  3QDK A;  1ATS A;  2NRH A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 4OO1 J;  4W5N A;  3HPH A;  1H1V A;  2W6K A;  4CF1 A;  4U67 L;  4AHC A;  3SBG A;  1NJY A;  4K0K K;  4F8R A;  1QVF M;  3ZSY A;  1TK8 A;  1RBU A;  3KOW A;  3HST B;  4BDY A;  1KQS M;  1L5U A;  2P9L B;  5CHI A;  4F2S A;  4FWP A;  4KTZ A;  4DV5 K;  3HPG A;  5EOY A;  2GBZ A;  4MFB A;  5CY4 A;  4BRH A;  3V1R A;  4JI8 K;  3C7N B;  4LF5 K;  5BN9 A;  2D0O A;  1KAZ A;  1CZB A;  4AH9 A;  1ZFU A;  5AQT A;  3E7U X;  4OX9 K;  1TKT A;  2QM1 A;  1UA1 A;  1MA9 B;  4B9N A;  5JVG L;  3MN6 A;  4FM2 A;  3LL3 A;  3SYZ A;  1NGA A;  4Z4H A;  4BC2 A;  3TU5 A;  3ZT2 A;  4IBN A;  4DSF A;  2GMO A;  1XC9 A;  4CGG A;  1YIT N;  4CHN A;  4FJK A;  2EX3 A;  3QB0 A;  3HI0 A;  2HVI A;  4GNI A;  3L4I A;  1DT9 A;  4ICL A;  5KRT A;  4LH4 A;  3SLC A;  4DTJ A;  1I94 K;  3E7R L;  1LOT B;  4DG1 A;  2E4L A;  2RKI A;  4CJ4 A;  3KLE A;  4DFJ A;  1VNA A;  1NGB A;  4I6M B;  2DTU A;  3AA4 A;  2HHW A;  5C0Y A;  4E89 A;  4F4K A;  5GAD P;  3RRG A;  1P0A A;  1YVN A;  4H0V B;  5HL7 L;  5HRS A;  1ZYW A;  4DLG A;  2BRZ A;  3LAM A;  3TAN A;  1Q86 O; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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