5AQFA

Fragment-based screening of hsp70 sheds light on the functional role of atp-binding site residues
Total Genus 127
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
127
sequence length
382
structure length
382
Chain Sequence
SMSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Chaperone
molecule keywords HEAT SHOCK COGNATE 71 KDA PROTEIN
publication title A fragment-based approach applied to a highly flexible target: Insights and challenges towards the inhibition of HSP70 isoforms.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 127
structure length 382
sequence length 382
chains with identical sequence C
ec nomenclature ec 3.6.3.51: Transferred entry: 7.4.2.3.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5aqfA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqfA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqfA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5aqfA04
1E4FT 3VPZA 3WEEB 5BRDA 1NGIA 5CE3A 1BO5O 4H0OA 1XQSC 1BG3A 1K8KA 2FLOA 3JS6A 4FOIA 4QS8A 3BF3A 5JICA 4FOEA 4H5WA 4H0YB 3H6EA 3VEWA 4O5FA 3VENA 1ZXOA 2DPNA 4FWRA 4A2AA 2HOEA 4H03B 2YHXA 3FR0A 4M63C 5E84A 3VEVA 4CD3A 4KBOA 5AQQA 1GLJO 3LDLA 1G99A 4L3QA 5KPTA 1ATNA 2NRHA 1XC3A 3CJ1A 3ENOA 2IVOA 3HSCA 1HKBA 4FWNA 2VYPA 3FZFA 3M6GA 4FPAA 1T44A 1DGKN 3CHWA 4FWOA 1BUPA 3WXLA 3ZX2A 1BA1A 3WEEA 2ZGYA 2HMPA 5AQIA 3MDQA 2P9KA 5LY3A 4H0VB 2BUPA 4PKIA 3O1WA 1YAGA 2ASOA 4HTLA 3ATVA 3P4IA 3FZLA 3CQXA 2F9TA 2QW9A 3U4LA 3FE1A 5FPDA 1QHAA 2GELA 5BR9A 1HJOA 3LM9A 4IWVA 5AR0A 4CZIA 1DKGD 1LCUA 3UKUB 2Q0RA 4MO4A 2FSNA 1NGAA 4BGAA 2NLXA 3SLCA 4EAHD 3EN9A 1JCEA 5AQFA 3W0LA 1X9JA 4F9OA 2P9LB 3CIPA 5FPNA 4I6MB 4BR2A 3QBWA 3H45C 2GWKA 4JD2B 4WQ4A 1NBWA 4BREA 4PL8A 3BP8A 3VEXA 3WQUA 2FF6A 1ATSA 2EWSA 3SJHA 2A5XA 3VERA 3ATUA 3O8MA 5AQHA 3SMSA 1R59O 1HX1A 2I7NA 4H5RA 3CJAA 3DJCA 1P8ZA 4FSVA 2W40A 5AQPA 3CJ9A 5EOYA 4BR0A 2P9IA 2YHWA 1MA9B 3UKUA 4BC3A 1K8KB 2FF3B 5BRFA 3FGUA 3AARA 2QWQA 3ZX0A 1NGBA 4B1XB 5EY4A 3ULEB 4H5TA 4K43A 4JAXA 2ASMA 2ITMA 4I6MA 4WQ4C 4K25A 4H5NA 3KZBA 3D2EA 1U2VB 3QFPA 3U9ZA 2QWMA 1IJJA 1EQYA 2Q36A 3IUCA 3TPQA 4BRGA 5AZJB 4A2BA 3LDNA 3WXKA 1MWMA 2ZGZA 3H1VX 2J4RA 3ID8A 1SQKA 4JNEA 5FPMA 3OHRA 5BRHA 1T6DA 3EKUA 4O8KA 3R9PA 4BRNA 4BRHA 1DEJA 1QQOA 3I8BA 3R6MA 5AQRA 2P9KB 4BC2A 2VWBA 1NLVA 3UE5A 3EZWA 1V4TA 3GL1A 3WUHA 5KPRA 2YJEA 1GLCG 3H46O 5AQZA 3O08A 3ULEA 4CI6A 3GOIA 3VF2A 5AQOA 1GLDG 3H3OB 4BRQA 3O6WA 5E26A 4BR5A 3VGMA 3A5NC 3GE1A 3CQYA 3MMVA 4PKHA 1U2VA 3UB5A 4PL7A 5F2RA 3U9DA 3ZX3A 1Z05A 4CZLA 4FWMA 4JN4A 4CZKA 4XH1A 5AZJA 3QDKA 4BC4A 4M7YA 4DQ8A 5AQKA 3QB0A 4FPBA 3EL2A 5AFUA 5BPLA 4MLHA 1X3NA 2H3GX 2NZTA 3FFKB 1E4GT 2YHYA 3MCPA 3G25A 3O5BA 2I7PA 4NB4A 3TU5A 5AFUH 2BTFA 3AAQA 1KAZA 4FWKA 4EIAA 4CBWA 3O1BA 3VF6A 4MO5A 2WUSA 3C7NB 2FXUA 1V4SA 2VCPA 5BN9A 3EKSA 4BG8A 4BG9A 2IIRA 3U8XA 1D4XA 3DXKA 3VETA 4BROA 3O4WA 4IXCA 4B1ZA 3LDOA 2FSKA 2PBDA 3CJCA 3CERA 1HKGA 2P9IB 4BR4A 2GUPA 3IFRA 4B1YB 2YCHA 1WUAA 4FWPA 2HF3A 4RCHA 1GLEG 2ZWHA 5FPEA 3WT0A 5ELZA 2E2OA 3FZHA 2AA4A 2W41A 4RTFD 4FO0A 3IDHA 4CBUA 4DB3A 1TUYA 4E1JA 3D2EB 3S41A 3C7NA 2QWNA 4M7XA 2CH6A 1GLFO 3H1QA 1NMDA 4BR7A 1Q18A 2P9NB 4Z94A 3L4IA 4IO8A 4AM6A 3I33A 2CGKA 1RFQA 2CGJA 4YDUA 2E2PA 1QZ5A 3QICA 3W3DA 4IJNA 3F9MA 4CJ7A 4CD1A 5ADXA 4ISEA 3VGLA 4CZMA 1NGJA 1IG8A 2V7ZA 3HTVA 2F9WA 1RDWX 4H0TB 1BU6O 1NGFA 4Y0WA 5KPZA 5AQJA 1BOTO 5KQ8A 1GLBG 4B1VA 5AQUA 5ADXH 4WYBA 4CZGA 2HF4A 4B1UB 3FZMA 5BPNA 4H5VA 2A3ZA 4NO7A 4QS9A 4XH4A 5JLFA 5JLHA 4K41A 1TUUA 2QWRA 3A5LC 2OANA 4CZHA 1WOQA 1NWKA 2QWPA 1MWKA 4B1WB 4A62A 4DCHA 1NGGA 2KHOA 5BN8A 3J8AA 1JCFA 2P9NA 1BWFO 2E2NA 2Q2RA 3QFUA 5AQSA 1NGHA 3HM8A 2D0PA 4FWLA 3A8YA 2V52B 2V7YA 3IMXA 3VESA 4YDUC 3SMPA 3BEXA 3HBTA 4FWQA 2E88A 4AM7A 3MN9A 3QMLA 1JCGA 1QQNA 2PAVA 1QQMA 1OKJA 3HI0A 5AQLA 3GG4A 4XH5A 3ZEUA 4CZFA 1TYQB 1GLLO 3JXUA 3CJ7A 4CBXA 3DXMA 1QZ6A 2Q1NA 4BVPA 5AQVA 3MN5A 4BGBA 2E20A 3DXKB 1CZAN 3QBXA 1XUPO 3LDPA 2CH5A 4BRLA 2E1YA 1SZ2A 5TKYA 3DAWA 3GDQA 2D0OA 5AQYA 2AP1A 1HLUA 4HWIA 4K42A 1U6ZA 3H3NO 4BRCA 3O80A 3GBTA 1HPMA 3A5OC 4ISFA 3RSEB 5AQTA 3LL3A 4J8FA 4BC5A 4BRAA 1S22A 1ZBSA 1H1VA 3SK3A 4DHYA 2A41A 2P9SA 1NGEA 3AY9A 4BRDA 3FZKA 2IVNA 2P9PA 1TYQA 4BR9A 2A6AA 2A42A 1YVNA 5LJWA 3VEZA 3LDQA 4H0XB 5EX5A 1NGDA 4H0PA 5F0XA 2IVPA 3UKRA 1GLAG 2E1ZA 1KXPA 3KHYA 2V51B 3WXJA 4B9QA 1KAYA 3WQTA 3MN6A 3VEOA 4MLEA 2QXLA 1Z6RA 3A0IX 3R8EA 5BREA 3RSEA 2QM1A 1YXQA 1ZC6A 2ZF5O 3ZETB 5AQNA 4CZEA 3FLCO 2GTDA 2P9UB 2Q31A 3EO3A 3M3ZA 2GWJA 4ISGA 1NM1A 4BVOA 4WQ5A 4RWTA 1HUXA 2A40A 3L0QA 1NGCA 2CGLA 3AAPA 5AQMA 1C0GA 2D4WA 4A61A 1MDUB 4JHDB 3HZ6A 4GY2B 4BQZA 5AQGA 1ATRA 1ESVA 3UKRB 2ASPA 1YUWA 3CI5A 4IZ9A 3VGKA 5B8HA 3MN7A 3VF4A 4EFHA 2E8AA 1X3MA 3ZEUB 3D2FB 5EXWA 4LC9B 4BRMA 3DXMB 3VOVA 1BA0A 5AZIB 3ZETA 4BRKA 1J6ZA 2P9UA 4BRFA 2E2QA 1S3XA 4BQLA 5BPMA 4WQ5C 3A5MC 4BRPA 3CJBA 4IJAA 3D7EO 1HKCA 2UYTA 3C0BA 5AQWA 4PKGA 4C23A 1C0FA 2GEMA 3VEYA 3LM2A 3L6QA 4JHDA 5F1XA 3M1FA 5JMVA 3BUZB 1RGIA 1BDGA 1T6CA 2P9LA 1LOTB 2YI1A 3WXIA 2YJFA 5EVZA 4JD2A 2P9SB 5LJVA 2Q0UA 2P9PB 4EHTA 5AQXA 3D2FA 1SAZA 3MK6A 3CETA 5AZIA 4QS7A 4BRIA 4GNIA 2FSJA 3DWLA 4FL9A 3BF1A 1Y64A 4XEIA 5I9EB 4EHUA 2Q97A 2QWLA 2D1KA 3ENHA 5KQDA 3KVGA 2QWOA 3B8AX 1KAXA 4CZJA 4FWSA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5BRDA 3WEEB 1RBTA 4FJXA 1C0TA 1BO5O 2NRRA 4HHTA 3OYCA 3OVNA 4QS8A 4CF9A 4FVMA 4FOEA 4H5WA 2XHBA 4KHPK 3MEEA 1C56A 3VEWA 4EP4A 4ILGB 5HP1A 4FWRA 1OMYA 2E2FA 2XO7A 1D8YA 4FK0A 2PZSA 4CJ3A 5GAGP 3CF5L 2IGIA 3I56N 1HR0K 2IC3A 2F8TA 3NMUA 1POIA 1ZU3A 1ATNA 4BECA 1XC3A 4IOAL 4WF9L 2IVOA 3TAMA 3LP3A 3TAQA 3M6GA 4FWOA 1DGKN 1BA1A 3WEEA 1S6QA 5AQIA 3O9SA 3OYIA 4M45A 2Q3SA 2BUPA 4PKIA 3O1WA 1UOCA 3TSPA 3FZLA 3SCXA 4CJFA 4XIUA 5FPDA 1QHAA 1G15A 3DMJA 3VQ7A 3U3GA 4IOCL 4IWVA 4DV7K 3P38A 4B3TK 3OYNA 1MR4A 4MO4A 3KP0A 1QE1A 3CC4N 1TKXA 3OYMA 4JYAK 3AGKA 2HSTA 1X9JA 1JLCA 4C8MA 4F9OA 3AVBA 3QBWA 3H45C 2GWKA 2QTDA 3NF6A 1N36K 4BE2A 2FF6A 4FZXC 3AVJA 3SJHA 1YT3A 4KHNA 1R59O 3CJAA 3TR8A 1ZUTA 2W00A 3MXJA 4WFBL 4FJNA 3OS0A 4FSVA 5HRRA 1T7EA 4O4GA 3CJ9A 2WC9A 4KHWA 4CIEA 3S3MA 4CERA 4M3RA 2LKBA 2IS3A 4CECA 2YHAA 3FGUA 4BDZA 1JLAA 1K8AO 1HMVA 5TKWA 3ULEB 4H5TA 3KOYA 1JXEA 4K43A 1SS6A 1N4NA 4K25A 4H5NA 1DTQA 3C6AA 3ZYYX 1OH5A 3KKSA 3LANA 3JYTA 1EQYA 3EZ5A 3PX6A 4QAGA 4A2BA 3WXKA 4IG0A 1MWMA 4RW6A 2DY4A 3VQAA 5C2FA 1WB9A 1S72N 5FPMA 4NLBA 3V9WA 4BWJA 5GIPA 2VWKA 4BC2A 3UE5A 1S1WA 4AHCA 2YJEA 1GLCG 3CCSN 4FJ8A 3O08A 1BI4A 3ULEA 1S9GA 3C95A 1I3AA 3VF2A 3CCEN 4J2EA 4KH4A 2ZJQL 4DR7K 4MFBA 4X62K 3ISNC 3CQYA 3UB5A 2NRTA 4JI4K 3U9DA 4IDHA 1RT4A 4JN4A 4CK1A 2LR3A 1ZBUA 2MBKA 4FYDA 3QERA 5AQKA 4FPBA 2G2KA 2KGQA 5AFUA 3LWLA 3LAMA 1WSJA 1C55A 4NB4A 2NZTA 4Y1CA 1E4GT 3VTHA 2I7PA 4PY5A 4M3XA 3AAQA 1KAZA 4FWKA 4J2BA 3VF6A 2WUSA 4F2SA 1FW6A 4CFDA 5LL6Z 2VCPA 3DLHA 5KGWA 4YORA 4BG9A 2G8IA 4V19S 3DXKA 5GAHP 2YNFA 4BROA 1JLBA 4HUEA 1Q8IA 3SQ2A 3CERA 1NMNA 2P9IB 3BGRA 3SUQA 2GUPA 3VTIA 3IG1A 5I3UA 4UAEF 4FWPA 4YOTA 1GLEG 2ZWHA 5FPEA 3WT0A 4AAZA 3FZHA 2AA4A 1ZBFA 3ALYA 1HNIA 4CIGA 1LQIA 3VQEA 1IO2A 2HVIA 3RTVA 4E1JA 2E3GA 3OYJA 1J54A 4FW2A 1TI5A 3H1QA 1NMDA 4LF6K 4IO8A 3M8QA 3TAGA 1SKRA 4CF0A 3VMFB 4I9QA 1VQ8N 2BDPA 1IG8A 2F9WA 4CE9A 1RDWX 3MX2A 5AQJA 1BOTO 4CJKA 4B1VA 1KTQA 5AQUA 5ADXH 2HF4A 4B1UB 5JLFA 4H5VA 4E19A 2O8CB 3MX5A 4DU3A 1VSKA 1YVUA 3DLEA 4DV4K 1UWBA 3A5LC 4R5PA 4CZHA 4ZHRA 3OTOK 1VQKN 3KTQA 3BZCA 2D56A 3CFPA 4A62A 3VQDA 3MXMA 4DV3K 1QVFM 4LFBK 2E2NA 1YHQN 2Q2RA 1CLQA 1SL2A 1RT6A 4JK7A 1WBBA 2NNWA 3SMPA 4OPKA 3MN9A 3QMLA 1JCGA 3F5TA 3CCUN 4DF4A 3QEXA 3I0RA 1ZBIA 4ELTA 1NJXA 5CYMA 2KTQA 1OVQA 1TYQB 1GLLO 3C6TA 4DSEA 3DXMA 1QZ6A 2Q1NA 2O8CA 1JJ2M 1VK0A 4CGDA 1C1BA 5FRMA 2E20A 1Q82O 3DLRA 3RWUA 1Q9XA 5KK4A 1B9FA 2E1YA 4B9VA 4DWIA 4CK2A 4DTJA 2D0OA 2VWJA 1ZVEA 2GMOA 1HLUA 4HWIA 1VNAA 3OA9A 1D5AA 4CEOA 3L2RA 1LAWA 4HTUA 4MDBA 2KQ2A 3A5OC 3RSEB 4YHHK 3LL3A 3Q7BA 4KHQA 1NK8A 4BC5A 4BRAA 3S3OA 1S22A 1ZBSA 4M42A 2YC1C 3PUFA 3J7AP 3O9RA 1VQNN 4BRDA 2KZZA 2IVNA 3L3VA 2NRWA 1TYQA 4OKJA 4K0KK 1FK9A 3WNHA 4KFBA 5CZ2A 2PFUA 5SZTA 2ZE2A 4CEAA 2IVPA 3N4PA 2LY6A 1GLAG 3OY9A 3T1HK 3KHYA 2VQFK 2V51B 3WXJA 3MXIA 1KAYA 3VEOA 1T7PA 1Z6RA 5KRTA 1S6PA 3QI7A 1DT9A 5BREA 4M3YA 3RSEA 5M1PA 4KO0A 4CGJA 3EO3A 3TTDA 1GOAA 1PE4A 1SNBA 4CEBA 3HVRA 4BVOA 4WQ5A 3P39A 3L0QA 2CGLA 3AAPA 3NAEA 2PYJA 2D4WA 2HBLA 1S1UA 2NRVA 4A61A 4CHZA 1MDUB 4GY2B 3SNNA 4KAZA 4BEBA 3KLEA 5GADP 3KHWA 1EXQA 3U3YA 3CI5A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 5BRD A;  3WEE B;  1RBT A;  4FJX A;  1C0T A;  1BO5 O;  2NRR A;  4HHT A;  3OYC A;  3OVN A;  4QS8 A;  4CF9 A;  4FVM A;  4FOE A;  4H5W A;  2XHB A;  4KHP K;  3MEE A;  1C56 A;  3VEW A;  4EP4 A;  4ILG B;  5HP1 A;  4FWR A;  1OMY A;  2E2F A;  2XO7 A;  1D8Y A;  4FK0 A;  2PZS A;  4CJ3 A;  5GAG P;  3CF5 L;  2IGI A;  3I56 N;  1HR0 K;  2IC3 A;  2F8T A;  3NMU A;  1POI A;  1ZU3 A;  1ATN A;  4BEC A;  1XC3 A;  4IOA L;  4WF9 L;  2IVO A;  3TAM A;  3LP3 A;  3TAQ A;  3M6G A;  4FWO A;  1DGK N;  1BA1 A;  3WEE A;  1S6Q A;  5AQI A;  3O9S A;  3OYI A;  4M45 A;  2Q3S A;  2BUP A;  4PKI A;  3O1W A;  1UOC A;  3TSP A;  3FZL A;  3SCX A;  4CJF A;  4XIU A;  5FPD A;  1QHA A;  1G15 A;  3DMJ A;  3VQ7 A;  3U3G A;  4IOC L;  4IWV A;  4DV7 K;  3P38 A;  4B3T K;  3OYN A;  1MR4 A;  4MO4 A;  3KP0 A;  1QE1 A;  3CC4 N;  1TKX A;  3OYM A;  4JYA K;  3AGK A;  2HST A;  1X9J A;  1JLC A;  4C8M A;  4F9O A;  3AVB A;  3QBW A;  3H45 C;  2GWK A;  2QTD A;  3NF6 A;  1N36 K;  4BE2 A;  2FF6 A;  4FZX C;  3AVJ A;  3SJH A;  1YT3 A;  4KHN A;  1R59 O;  3CJA A; 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