5AQGA

Fragment-based screening of hsp70 sheds light on the functional role of atp-binding site residues
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
381
structure length
381
Chain Sequence
MSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Chaperone
molecule keywords HEAT SHOCK COGNATE 71 KDA PROTEIN
publication title A fragment-based approach applied to a highly flexible target: Insights and challenges towards the inhibition of HSP70 isoforms.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 120
structure length 381
sequence length 381
chains with identical sequence C, E
ec nomenclature ec 3.6.3.51: Transferred entry: 7.4.2.3.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5aqgA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqgA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqgA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5aqgA04
3GL1A 2CH6A 3JXUA 4CZIA 2P9KB 4LC9B 3ZX3A 2YHXA 2YI1A 3P4IA 1C0FA 1BDGA 1XQSC 4NO7A 1NGIA 4O5FA 2WUSA 2Q36A 2CGJA 4ISEA 3HI0A 3VF2A 1QHAA 4JN4A 5BRDA 3VGMA 3M6GA 1HKBA 5AZIA 5FPEA 3JS6A 4PL7A 4FWRA 3HM8A 4WQ5A 3VEOA 1NGHA 3VERA 4ISFA 3C7NB 3VEXA 1NGAA 1BUPA 2AP1A 3ZX2A 3VOVA 4H5WA 2ZGZA 5KPTA 4BRIA 1YXQA 2QWMA 1NGJA 3VENA 3WQUA 2FLOA 2NRHA 3ULEB 4PKIA 3QFPA 2Q0UA 4IWVA 4E1JA 3DWLA 5FPNA 2ZWHA 3MCPA 4M7YA 4A2AA 3WXLA 3ZEUA 5LY3A 2PBDA 4B1YB 4CBXA 1GLFO 2Q97A 1T44A 2CGKA 3LDNA 2I7PA 5F2RA 4M7XA 4BRCA 2ITMA 4EHUA 3SMPA 4BR9A 4B1XB 2FXUA 1BWFO 3GE1A 4H5RA 2F9TA 2A40A 3TU5A 1JCGA 1T6CA 1ZXOA 3F9MA 5BN8A 4A2BA 3FGUA 4FL9A 5KPRA 4FOIA 3QBXA 3EKUA 1IG8A 4BG8A 2P9LA 4MLHA 3I33A 4CZFA 1MWKA 2A6AA 2HOEA 3EZWA 1QQMA 4JNEA 5AQQA 2P9IB 2YJFA 3LDOA 4HTLA 1IJJA 4GY2B 4B1UB 5AZIB 5FPDA 2QWPA 4BRPA 3VEZA 4BR0A 1GLEG 2ZF5O 4F9OA 1KAYA 3LDLA 3VETA 5E84A 4CZJA 2AA4A 5EXWA 1ZC6A 2NZTA 3SJHA 2Q31A 3VEVA 4BRAA 4XH4A 5AQGA 3WXIA 1NLVA 1GLDG 4BG9A 5JMVA 2OANA 5ELZA 3ZEUB 3CJBA 3WT0A 1NGDA 2E88A 3KVGA 4BGAA 4BC2A 2HF3A 3A5MC 3U4LA 3ULEA 1S22A 1QZ6A 3ZETA 4MO5A 5EY4A 4PL8A 2P9SA 4EFHA 4DQ8A 1HKCA 5AR0A 3QB0A 4IJAA 3RSEA 4CI6A 3EO3A 5AQMA 3GOIA 2HMPA 1NMDA 4JHDA 1JCEA 1TUYA 2KHOA 4CZGA 5EX5A 4YDUC 4AM6A 2P9LB 4BRMA 2ASOA 4FOEA 3WXKA 1RDWX 3O5BA 2GELA 4AM7A 4BRDA 3O4WA 1MDUB 5AQIA 3EL2A 3UB5A 4BRKA 4EHTA 4H5NA 3H46O 1DEJA 4RWTA 1BOTO 4I6MA 5BPLA 1RGIA 2UYTA 3BF3A 3O80A 4FSVA 3L0QA 1BA0A 4A61A 4H5TA 2V7YA 4BC4A 4CD1A 4EAHD 2P9IA 4RCHA 1T6DA 3QDKA 4FWOA 2QWQA 1S3XA 4JAXA 2P9NA 4QS9A 1NGBA 5AFUA 4BRGA 1YVNA 2QWNA 3AAQA 2D0OA 3H1QA 3VF6A 2W40A 3IFRA 4FO0A 3UKUA 4CZKA 3DXKA 4BC3A 2CGLA 1ATSA 1RFQA 3KHYA 5E26A 4H0XB 3VEWA 3ZETB 4BR7A 3CJ1A 3VGKA 1YAGA 3MN7A 3FZFA 4K41A 1HJOA 2P9SB 1G99A 4BQZA 4FPBA 3CERA 4K43A 3RSEB 3FZLA 3C0BA 3MMVA 1C0GA 3SLCA 5KPZA 4H03B 4H0YB 3GDQA 4JHDB 4IJNA 1R59O 5JLFA 2V52B 1Q18A 3BF1A 1GLAG 1SQKA 2V51B 2VCPA 2I7NA 3CQXA 1E4GT 3GBTA 5BRHA 4HWIA 1OKJA 4H0PA 3IDHA 4K42A 5FPMA 1TUUA 4I6MB 4B1VA 4FWSA 2F9WA 1X3NA 3QICA 3IMXA 4BROA 3G25A 4YDUA 4KBOA 1GLBG 2FF6A 3MN6A 2D0PA 2E1YA 3CJCA 5AQFA 2A3ZA 2QXLA 3DXMA 4BVPA 5KQ8A 3OHRA 3L4IA 3BUZB 3FR0A 3W3DA 5CE3A 3U9DA 5AQWA 1BU6O 2GTDA 2GWJA 4IZ9A 2P9NB 5AQJA 3KZBA 1SZ2A 4GNIA 1XUPO 3WXJA 3D2FB 3HBTA 4BRFA 3LDPA 2GUPA 3LM2A 4BRQA 4BR5A 5AZJA 2A41A 4A62A 4QS7A 4FPAA 3UKUB 4CD3A 4CZEA 2Q0RA 3DXKB 3CIPA 4BRHA 5AQVA 3FZHA 2P9UA 4Y0WA 4CZMA 3CJ7A 5AQSA 3FE1A 3LDQA 4L3QA 1TYQA 1QQNA 3R6MA 3UE5A 4XH5A 3HZ6A 3MN5A 3R9PA 1D4XA 1WOQA 3ATVA 2J4RA 3CETA 5AQRA 5AQOA 4FWMA 1MA9B 5AQUA 2ZGYA 1MWMA 1KAXA 5AQKA 3BEXA 1BG3A 5AQXA 1EQYA 4H0TB 2H3GX 2D1KA 3H3OB 5BREA 1Z05A 3GG4A 5AQPA 3DAWA 5BRFA 4K25A 2FF3B 2QWRA 3WEEA 1BA1A 3FFKB 2DPNA 5EOYA 2YCHA 1NGFA 1Y64A 4BC5A 3DXMB 4BVOA 3B8AX 3UKRA 1ATRA 4WYBA 2P9PA 4BR4A 1P8ZA 1BO5O 2EWSA 3LL3A 5BPMA 2E2NA 5AFUH 3ENHA 3O8MA 1DGKN 5AQHA 4PKHA 4H5VA 2IVNA 5AZJB 1J6ZA 1XC3A 4XH1A 4BREA 1K8KA 1Z6RA 1ESVA 3HTVA 1HX1A 3AARA 3IUCA 2P9UB 5BPNA 3MK6A 5AQYA 5EVZA 1SAZA 5AQZA 3D2FA 3VF4A 1NGEA 3I8BA 5F0XA 1TYQB 1HUXA 3H1VX 1GLCG 3ID8A 2QWOA 3H45C 5KQDA 2ASPA 4FWKA 1V4SA 1NM1A 3FLCO 3MDQA 3HSCA 3A5LC 5JLHA 2CH5A 4JD2B 4WQ4C 3O1WA 3FZMA 1ZBSA 3CJ9A 1GLLO 4QS8A 3U9ZA 2D4WA 4CZLA 4DHYA 1NWKA 1NBWA 3O08A 5ADXH 1HLUA 1HPMA 3D2EA 3VEYA 3ENOA 5F1XA 1QZ5A 3WEEB 1U2VB 3A0IX 3BP8A 4BR2A 4EIAA 5LJVA 3L6QA 2NLXA 4FWQA 4C23A 4FWNA 3J8AA 4RTFD 1DKGD 4B1WB 3CJAA 4B1ZA 2FSKA 3CI5A 3UKRB 4H0OA 2P9PB 2IIRA 5AQLA 4IO8A 3ZX0A 2E20A 4PKGA 3A8YA 3AY9A 5ADXA 4BRLA 2E8AA 1KAZA 2W41A 1HKGA 3AAPA 1NGCA 4H0VB 2A5XA 3LM9A 4BQLA 3CHWA 2GEMA 2BTFA 2YHYA 3O6WA 4O8KA 1K8KB 3SMSA 3O1BA 3DJCA 4DB3A 3M1FA 3H6EA 3D7EO 3M3ZA 1QQOA 4MLEA 4DCHA 4J8FA 3R8EA 3VESA 4FWPA 5BR9A 4M63C 1JCFA 1LCUA 5LJWA 1E4FT 2E2OA 2QW9A 1LOTB 3TPQA 2E2PA 4B9QA 4Z94A 2P9KA 3ATUA 2IVOA 1NGGA 3A5NC 2FSNA 3S41A 3VGLA 3SK3A 4BRNA 4WQ5C 1V4TA 3D2EB 3VPZA 4CZHA 1ATNA 3EKSA 1X9JA 5TKYA 1KXPA 2HF4A 3A5OC 4JD2A 4WQ4A 3QBWA 3W0LA 2GWKA 2QWLA 1H1VA 4IXCA 2QM1A 3FZKA 1WUAA 3CQYA 2Q2RA 5JICA 3U8XA 2VWBA 2A42A 4CBWA 5B8HA 3C7NA 1U2VA 2ASMA 4NB4A 2Q1NA 3MN9A 5AQTA 4XEIA 1YUWA 4CBUA 3QFUA 1U6ZA 4MO4A 3EN9A 2E1ZA 2YJEA 2PAVA 5I9EB 3WQTA 3WUHA 5AQNA 4ISGA 5BN9A 1GLJO 2E2QA 3QMLA 3H3NO 4FWLA 1CZAN 1X3MA 2BUPA 2V7ZA 4BGBA 2FSJA 2IVPA 4CJ7A 2YHWA 2VYPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2IAJA 3KKRA 2UU9K 4YOWA 4BDPA 4AEIA 4FJ9A 4CZIA 5FDLA 2HMIA 3I0RA 3WNFA 5IT9O 2A1SA 1T7AA 3C6TA 1NGIA 4O5FA 1ZVEA 5TKWA 2ZJQL 2CGJA 2YNGA 3QEPA 1U49A 4ISEA 1HNVA 1U48A 1T05A 2VWJA 1QHAA 1BHLA 4YOTA 4DV5K 3VGMA 3HSTB 4LFCK 3HO1A 3M6GA 1IBLK 4PL7A 4FWRA 3HM8A 3VEOA 4MDAA 2F7TA 3A2FA 2X74A 3NFAA 3M8PA 4H8KA 3C7NB 3VEXA 1NGAA 1BUPA 3QEVA 1RT5A 5KPTA 1SN1A 1T7BA 3VENA 3ULEB 2Q0UA 2RKIA 2ZWHA 3MCPA 1RTDA 3N4QA 4G9ZA 4O0JA 4CBXA 5DM6L 4B9NA 1HQUA 1JXBA 2M8BB 3OYBA 1YI2N 3SMPA 4BR9A 4B1XB 1YF5L 2GMOA 1BWFO 5C2FA 4H5RA 2BE2A 3VQQA 4FJ8A 1BMRA 4YOYA 2G8KA 1HMVA 1NK0A 2B3CA 1DLOA 3FGUA 4FJHA 4E89A 1ZBIA 1SN4A 3EKUA 4W5RA 2P9LA 4DFMA 2Y1JA 4C8KA 1MWKA 4JNEA 3EZWA 3KLEA 3NGIA 3SUNA 3LDOA 3ZT0A 2XRIA 4HTLA 2HNDA 2PZSA 4GY2B 1RDCA 1NJXA 4GV3A 1ZBHA 1JL1A 2QWPA 1QSLA 2YNFA 1GLEG 1NRAA 1YJNN 2F8SA 2RHKA 4V1DC 3HJFA 3LDLA 4DR4K 2OPSA 2KFNA 5E84A 1S5JA 4CZJA 2AA4A 1EWRA 4F4KA 1X1PA 4IFYA 1YVUA 2Q31A 4BRAA 1S1WA 4KHYA 5FRMA 1NLVA 1GLDG 2HHVA 5JMVA 2NRRA 4R79A 3ZEUB 2NRXA 4DFPA 1IKWA 4B3SK 3O9RA 2E88A 4JI4K 4BGAA 2HF3A 2ZJPL 4JV5K 3ZETA 4B3RK 3J7ZO 5M1PA 4OLBA 4PL8A 2W6LA 1VQMN 4KO0A 4N56A 1GOAA 4LFBK 3EO3A 1NPIA 3U3YA 1IH7A 2D0AA 1NMDA 4I7FA 4JHDA 1TUYA 3THVA 4DMNA 2ASCA 1BRZA 3V1QA 1CLQA 1C6VA 3WXKA 1LV5A 3O5BA 1MDUB 1U04A 1XWLA 4C1NK 1RCHA 3UB5A 3MXIA 3H46O 4RWTA 4CJ3A 3M8QA 3F73A 5BPLA 1RGIA 3J81O 1B92A 3THWA 2F96A 4A59A 4M3WA 4IOCL 2FC0A 3PIPL 3VQPA 4HVJA 5JS1A 4CCHA 3QNNA 1KRPA 3IKMA 2E6LA 2JWLA 3NH2A 1NGBA 5AFUA 1LQQA 1YVNA 4DR7K 3ZCMA 2D0OA 2W40A 1U4BA 1LWCA 4ILJA 4M3RA 4FO0A 1NE5A 4KYPA 1QS4A 3Q7CA 4CZKA 1RFQA 1TVRA 3VEWA 2B5JA 3C95A 1SKSA 3V9WA 4BR7A 1L3UA 1ZYQA 3MN7A 1HJOA 1G99A 4BQZA 3DLKA 3CCJN 1IKYA 4K43A 3C6AA 3RSEB 3NH0A 3AV9A 1TI5A 4AHTA 3SLCA 5AJ3K 1KFSA 3DLLL 4OPHA 3SJJA 1R59O 5JLFA 4OLAA 1RDBA 1L3SA 1GLAG 2I7NA 3CQXA 1X9WA 5BRHA 4AF1A 4V19S 4ILGB 3AO4A 2RN2A 1RNHA 4OVLA 3O3FA 4FVMA 5FPMA 4B1VA 3L2WA 3V9UA 4FWSA 1HYVA 3G25A 4CFCA 1GLBG 1KCFA 3NMUA 4KHSA 3CJCA 4CJQA 4HUEA 3CFRA 4BVPA 4CECA 1A5XA 4EP5A 2GBZA 4BE7B 5AQWA 4B8AB 1BU6O 2GTDA 4FCYA 3SPZA 3KHWA 2N2RA 1XUPO 3PUFA 1VQ9N 1SUQA 1BCOA 4BRFA 5C25A 3LDPA 4F3TA 5DK5A 4GVEA 5AZJA 4DWIA 4A62A 2VG5A 4CGFA 1WBDA 5AQVA 1K6YA 3KD5E 4CIFA 4CZMA 3CJ7A 4DLGA 5AQSA 4HE7A 1S1UA 4L3QA 3ZSYA 3J7AP 1TYQA 3ZSVA 1QQNA 3MEDA 3UE5A 1TK0A 1O1WA 4KHWA 4NCGA 3R9PA 3V81A 1IKVA 4FJMA 3DLBA 1WOQA 5CHIA 1IV0A 3AA4A 4FWMA 1OVQA 4DSFA 4I2QA 3AVAA 3ID6A 2X6SA 1D5AA 1EQYA 4YHHK 4JK7A 4H0TB 2D1KA 1Z05A 4FZYA 5BRFA 3L2VA 2QWRA 1JLGA 1EXQA 3NF8A 4YORA 1BA1A 3FFKB 5HRSA 1C0MA 4FJ7A 4C8OA 3CCMN 3QINA 3LPTA 3DOLA 4BVOA 5SZTA 2NY9X 1ATRA 1I2VA 2P9PA 4BR4A 1BO5O 3LL3A 3T19A 3SAFA 4JI2K 1VSHA 3C6UA 3V1OA 4DSIA 4RW9A 4PKHA 3RMBA 1N4NA 1J6ZA 4BREA 1K8KA 2LJMA 1Z6RA 1VSJA 1S1VA 3E9OA 5M1OA 1C55A 3QLHA 4RW6A 2YIOA 5LMUK 5AQYA 1YHQN 3I56N 3OYJA 3HP6A 3VF4A 5FROA 1VQ8N 4TSXA 3ALYA 1JL2A 1GLCG 3ID8A 3CC4N 2QK9A 4FWKA 1V4SA 1NM1A 4E7JA 3SF4D 3HSCA 4BDYA 3A5LC 5JLHA 2LI7A 4JD2B 4CJ4A 1ZBSA 1GLLO 1FK9A 1NJIO 3EE9A 4JKEA 3CCQN 1LQHA 1U2VB 1NU0A 4CFAA 2YX6A 2MN5A 3BP8A 3WNEA 4BR2A 4FK4A 4FWQA 2OTLN 4RTFD 4Y1DA 1DKGD 2YEOA 3CJAA 4IOAL 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2IAJ A;  3KKR A;  2UU9 K;  4YOW A;  4BDP A;  4AEI A;  4FJ9 A;  4CZI A;  5FDL A;  2HMI A;  3I0R A;  3WNF A;  5IT9 O;  2A1S A;  1T7A A;  3C6T A;  1NGI A;  4O5F A;  1ZVE A;  5TKW A;  2ZJQ L;  2CGJ A;  2YNG A;  3QEP A;  1U49 A;  4ISE A;  1HNV A;  1U48 A;  1T05 A;  2VWJ A;  1QHA A;  1BHL A;  4YOT A;  4DV5 K;  3VGM A;  3HST B;  4LFC K;  3HO1 A;  3M6G A;  1IBL K;  4PL7 A;  4FWR A;  3HM8 A;  3VEO A;  4MDA A;  2F7T A;  3A2F A;  2X74 A;  3NFA A;  3M8P A;  4H8K A;  3C7N B;  3VEX A;  1NGA A;  1BUP A;  3QEV A;  1RT5 A;  5KPT A;  1SN1 A;  1T7B A;  3VEN A;  3ULE B;  2Q0U A;  2RKI A;  2ZWH A;  3MCP A;  1RTD A;  3N4Q A;  4G9Z A;  4O0J A;  4CBX A;  5DM6 L;  4B9N A;  1HQU A;  1JXB A;  2M8B B;  3OYB A;  1YI2 N;  3SMP A;  4BR9 A;  4B1X B;  1YF5 L;  2GMO A;  1BWF O;  5C2F A;  4H5R A;  2BE2 A;  3VQQ A;  4FJ8 A;  1BMR A;  4YOY A;  2G8K A;  1HMV A;  1NK0 A;  2B3C A;  1DLO A;  3FGU A;  4FJH A;  4E89 A;  1ZBI A;  1SN4 A;  3EKU A;  4W5R A;  2P9L A;  4DFM A;  2Y1J A;  4C8K A;  1MWK A;  4JNE A;  3EZW A;  3KLE A;  3NGI A; 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