5AQHA

Fragment-based screening of hsp70 sheds light on the functional role of atp-binding site residues
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
381
structure length
381
Chain Sequence
MSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title A fragment-based approach applied to a highly flexible target: Insights and challenges towards the inhibition of HSP70 isoforms.
pubmed doi rcsb
molecule keywords HEAT SHOCK COGNATE 71 KDA PROTEIN
molecule tags Chaperone
source organism Homo sapiens
total genus 120
structure length 381
sequence length 381
ec nomenclature ec 3.6.3.51: Transferred entry: 7.4.2.3.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5aqhA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqhA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqhA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5aqhA04
5BPNA 1QZ6A 2E88A 3LM2A 3JXUA 5AQLA 2E2OA 2QWMA 3VOVA 5LJWA 3VERA 1RFQA 5BRFA 4QS8A 4B1XB 1NGIA 3L4IA 3I33A 3C7NB 2V7ZA 3QBXA 4FWKA 2Q31A 4BRLA 4BRKA 5FPMA 3C0BA 4BQZA 1J6ZA 2NLXA 2P9UA 1ESVA 1XUPO 4BVPA 4WQ5A 3CJ1A 3M1FA 2ITMA 2YHWA 2ZF5O 1JCFA 1TYQA 3DXMB 4WQ4C 4BGBA 4Z94A 4B1VA 2QWPA 2FSNA 3FZKA 1EQYA 3G25A 1ATRA 3CERA 3ZEUB 4BR7A 4EIAA 2BTFA 4IJNA 3R9PA 3VF4A 4BG9A 1E4FT 4BRHA 4JD2B 1NGCA 2VYPA 1QQMA 1GLBG 3WXJA 2ASOA 2Q97A 3VF2A 4FL9A 3IMXA 3MN5A 2CH5A 3O8MA 3WXIA 2QXLA 2E1ZA 1BOTO 4PKGA 3SMPA 3AAQA 3MMVA 4EHTA 5AZIB 3QB0A 1JCEA 2D4WA 3WXLA 1DEJA 1GLLO 5AZJA 4CBWA 3QFUA 1DKGD 5AQVA 1SQKA 4I6MB 4XEIA 5FPDA 1HKBA 3MN7A 4AM6A 4JN4A 1QHAA 1YAGA 3LDOA 3BP8A 5JLFA 3H6EA 4CZEA 2ZGZA 4DCHA 3SJHA 3VENA 3QFPA 1BA0A 4JD2A 4A2BA 4DB3A 5ADXA 4IJAA 5KPZA 3KVGA 4H5VA 4QS7A 4JHDA 4BR5A 3RSEB 1GLDG 3H45C 3KZBA 2FSJA 4JNEA 3ENHA 3HI0A 3VGKA 1XQSC 5EX5A 2HOEA 4F9OA 1U6ZA 3U9DA 2YJFA 3M6GA 3CJBA 2GELA 1KAZA 5AZIA 4RWTA 1NBWA 3D7EO 4BC3A 2V51B 4NB4A 2IVNA 1QZ5A 3OHRA 4WQ5C 3D2EB 3TPQA 5AQYA 5F0XA 3AAPA 1NGJA 3LDNA 4FWLA 3FZFA 4B1WB 3MK6A 1ATSA 2GWKA 4RCHA 1NGHA 3FLCO 1WOQA 4CD1A 3MCPA 4M7XA 4EHUA 1LOTB 3LL3A 4CZJA 3W0LA 1E4GT 5ELZA 1BWFO 1D4XA 5AQQA 1HKCA 4HTLA 4FWQA 4BGAA 2IIRA 3ATVA 4A61A 1HKGA 1R59O 3VF6A 1OKJA 4BRGA 5JLHA 2D0OA 3CIPA 4BROA 3VEWA 1ATNA 4FPBA 3H3OB 3SLCA 2I7NA 4CBUA 3H3NO 2P9IB 4BRNA 5BRHA 1S22A 4XH5A 3SK3A 3IUCA 2P9PA 3BEXA 3GOIA 2P9KB 5JMVA 2V52B 2YHYA 3GDQA 1TUYA 3EKSA 1NGDA 2H3GX 5AQUA 2IVOA 1HJOA 1MA9B 2IVPA 4FWOA 3FE1A 4K25A 2WUSA 2GWJA 2F9TA 3DXKA 3MDQA 4JAXA 1Z6RA 2QWOA 3AY9A 4H5TA 2HF4A 2FF3B 1HLUA 4H03B 1MWMA 4CZGA 5AQTA 4B1ZA 2P9IA 2P9SA 4FPAA 4A62A 3P4IA 4DQ8A 4FWRA 2A42A 2EWSA 3BF1A 4CI6A 3CJ7A 3ULEB 3GG4A 5CE3A 3VGLA 4YDUA 5AQFA 3ZX2A 1U2VB 2GEMA 3CJCA 4K42A 3C7NA 3VETA 5LJVA 2GUPA 4PL7A 2OANA 2UYTA 3EN9A 3VESA 4CZLA 4BRIA 4BG8A 5AQZA 3FFKB 2HF3A 3CHWA 1NM1A 1NGBA 2BUPA 3WEEB 1YVNA 4RTFD 3LDPA 2CGLA 1X3NA 3O4WA 3GE1A 3U4LA 5AQMA 4FOIA 1YUWA 3WXKA 3DXMA 3O6WA 2D0PA 4H0XB 2P9LB 4HWIA 3FZHA 3O08A 1MDUB 3ULEA 1IG8A 1Y64A 3ID8A 2QWNA 5KPRA 3GBTA 4FWPA 3EKUA 3R6MA 3TU5A 1U2VA 3ZEUA 1JCGA 4BQLA 4CBXA 3U9ZA 4XH4A 3A5OC 2QWQA 1C0GA 2YI1A 1V4SA 3MN9A 4H0VB 3FR0A 1BU6O 2A5XA 4WYBA 4MLEA 4FSVA 2QWRA 3UKUB 2A41A 5KQDA 3CI5A 2Q2RA 2A6AA 1V4TA 5BR9A 1QQNA 5F1XA 1NGAA 1RGIA 3EZWA 1HUXA 1BDGA 2E2PA 2AA4A 3UB5A 4BRMA 3CJAA 5AQSA 4CZHA 3FGUA 5AQXA 5EXWA 4CD3A 4I6MA 3A0IX 4A2AA 4DHYA 5ADXH 4BRPA 1X3MA 5LY3A 2QWLA 5EY4A 4YDUC 4J8FA 3O80A 3IFRA 1NWKA 3QMLA 2DPNA 3D2FB 3VEYA 5AQHA 1BUPA 3VEZA 2W41A 2Q1NA 3RSEA 5KQ8A 2E2NA 2Q0RA 3HM8A 1IJJA 1GLCG 5AQOA 5JICA 3MN6A 1Z05A 1KXPA 1NGEA 1NGGA 4H5NA 3VPZA 3ATUA 3IDHA 3D2EA 5AQPA 5AR0A 3VGMA 2W40A 3QICA 5I9EB 3A8YA 1BA1A 4BR2A 3J8AA 3BF3A 4ISFA 4AM7A 4B1UB 3A5MC 2QW9A 1HPMA 4B1YB 4FO0A 1QQOA 3DAWA 3D2FA 3LDQA 3A5NC 2NZTA 4LC9B 5FPNA 3EL2A 2HMPA 4C23A 2QM1A 5BN9A 1T44A 3HSCA 4O5FA 1RDWX 2ASMA 5BN8A 1GLFO 1HX1A 4O8KA 1ZC6A 1TYQB 1H1VA 3S41A 4CZIA 1MWKA 4EAHD 4BR0A 5AQGA 5EOYA 4BC5A 3QDKA 4M63C 3VEVA 1G99A 1K8KB 4BC4A 4NO7A 4ISEA 5E84A 1GLEG 1SZ2A 2P9KA 1NMDA 3M3ZA 1GLAG 4QS9A 4CZMA 4M7YA 3HZ6A 5F2RA 2P9NB 3A5LC 1WUAA 4MO4A 5TKYA 3O1WA 4MO5A 5KPTA 2A40A 2PAVA 4EFHA 3WT0A 3GL1A 5FPEA 4BC2A 1BG3A 2YCHA 4IXCA 3VEXA 2FF6A 3CQYA 5B8HA 1C0FA 4K43A 4IO8A 5AZJB 1NLVA 4Y0WA 4K41A 4H0PA 4E1JA 3L0QA 3CETA 5AQRA 3WQTA 1K8KA 1BO5O 1S3XA 5AQNA 4BR4A 5AQIA 4BRQA 1LCUA 1P8ZA 2CH6A 4H0OA 2FXUA 3BUZB 2CGKA 4GNIA 3AARA 2E20A 3LM9A 1Q18A 4CZFA 1X9JA 2NRHA 3O1BA 2FLOA 4L3QA 4JHDB 2Q0UA 3ZETB 2P9NA 3H1QA 3HTVA 2V7YA 3UE5A 3F9MA 3WUHA 4ISGA 3B8AX 3CJ9A 1GLJO 2AP1A 3H46O 3FZLA 4H0TB 2YHXA 3I8BA 2ZGYA 2GTDA 3WEEA 5AQKA 4CZKA 4FWNA 3DJCA 1KAYA 3CQXA 5AQJA 4FWSA 4IWVA 4B9QA 2E2QA 3ZX0A 2P9LA 4BRAA 4KBOA 3ENOA 1XC3A 3O5BA 2YJEA 2A3ZA 3UKRB 3ZETA 3W3DA 1YXQA 3EO3A 3R8EA 5EVZA 5BPLA 3H1VX 4MLHA 1T6CA 1SAZA 2I7PA 4CJ7A 5AQWA 2PBDA 3VEOA 4H5WA 5AFUA 3UKUA 2CGJA 4BRCA 4WQ4A 5BREA 1T6DA 4GY2B 5E26A 3HBTA 2P9PB 2J4RA 4XH1A 3L6QA 1TUUA 2ASPA 3ZX3A 2VWBA 1KAXA 2Q36A 4PKIA 4FWMA 3U8XA 2FSKA 2F9WA 4BREA 4BRFA 4BRDA 3WQUA 3UKRA 1ZBSA 2ZWHA 5AFUH 4BR9A 2D1KA 3JS6A 2VCPA 4PL8A 3SMSA 3DWLA 3DXKB 1ZXOA 4IZ9A 5BPMA 4FOEA 1NGFA 2P9UB 1CZAN 4BVOA 5BRDA 2E8AA 3QBWA 3KHYA 2KHOA 3LDLA 2E1YA 4H0YB 1DGKN 4H5RA 3FZMA 4PKHA 2P9SB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4JS5A 4DU4A 4ID5A 1KVCA 2E2OA 1U49A 5BRFA 3G10A 3ZSWA 2P5OA 3L4IA 4M42A 1KLMA 3C7NB 2EX3A 2Q31A 4CK2A 4DFKA 4UAFE 3ZSZA 1VSIA 3ENBA 4JKCA 3HL8A 5FPMA 5CY0A 3DRRA 4BQZA 1A5WA 4LF6K 1VSLA 3TTCA 2NLXA 2G2KA 2KGQA 2HHHK 1JLQA 1ESVA 1XUPO 3H08A 2RKIA 4CW7B 4WQ5A 3OW2M 2NNWA 2W6KA 2ITMA 5FROA 5FLXO 4YOWA 1XHZA 4G1QA 4E7JA 1SL1A 4IOAL 1IV0A 1LQHA 4CHYA 4C8MA 1RT4A 2VGMA 3G25A 1TK8A 4DFPA 2IDOA 3CERA 3KLGA 2BTFA 4IJNA 1OH8A 3EE9A 4BG9A 1VNAA 1KFDA 2ASOA 3PUFA 5C24A 4FL9A 2YILA 2HSTA 4JI8K 3O8MA 4FJHA 3LP2A 2E1ZA 4KB1A 3VQBA 5GIOA 3AAQA 4DR2K 1JLAA 4GKJK 1JCEA 3OA9A 3QFUA 1KTQA 2HBJA 4I6MB 1KD1O 4JN4A 3NMUA 2XY8A 4F3OA 4FW1A 2ZGZA 1AYJA 4DCHA 1WB9A 3LPTA 3SJHA 4JD2A 4A2BA 5C2FA 1MYNA 4M3XA 4IJAA 4GVMA 4FYDA 2DFEA 3B6PA 3NH2A 3VGKA 1HNZK 5EX5A 4DLGA 2VG6A 3NF7A 3U9DA 1I2UA 5E41A 5AZIA 3D7EO 4BC3A 1QZ5A 3R1XA 2IS3A 3D2EB 3AO3A 1KCFA 2N2RA 2FBTA 3HRGA 4DG1A 2B68A 5SZTA 2E5LK 2O8BA 4RCHA 1NGHA 1VSJA 3FLCO 4CD1A 4M7XA 4EHUA 3SAFA 2YX6A 4CCHA 2HHSA 2IC3A 1KLNA 1C0MA 1HKCA 4WCEL 4AHUA 4CJEA 1S1UA 2F7TA 1OKJA 5JLHA 1JLBA 2D0OA 3VQDA 2XY7A 2RE2A 3HVRA 3C6HA 4DTRA 3O9UA 3C94A 3K5MA 1Q8IA 4Z4FA 1S22A 4XH5A 2I5JA 4BWMA 3IUCA 4CECA 3GOIA 2HVIA 4ILGB 2HVHA 2V52B 2KBJA 2ZJRL 5HLFA 1T1TA 5JS1A 3GDQA 3OYKA 1SUQA 1T7EA 4CGDA 3IG1A 1OVYA 2GWJA 3VQPA 1B3CA 4JAXA 1WAFA 3CD6N 4AEIA 4DUYK 4JI5K 1L3TA 5AQTA 1DTTA 4ELUA 2P9SA 1YIJN 4FPAA 2OZMA 3VGLA 3JYTA 4PA1A 4WFBL 3CJCA 4V19S 3C7NA 2OCEA 1CZBA 4PL7A 3SBTA 1ILYA 3OYGA 1VSMA 2HHVA 2HF3A 4GV6A 5KGWA 4DV0K 2BUPA 4BDYA 2KKZA 2X78A 3QEPA 1NOYA 4LH4A 1OZZA 2JWLA 4PHTX 2G8UA 2D0PA 3K59A 3O08A 2OTLN 1S1TA 4LSNA 4M45A 1RCHA 4B9LA 2VGNA 4DSLA 4FWPA 3R6MA 2B4JA 1U2VA 1JCGA 5KRSA 4CBXA 3SI6A 1XNQK 3A5OC 4OPHA 3MN9A 3OJUA 3FR0A 1XC9A 4WYBA 1NJYA 3E1YA 3KP1A 4FSVA 3UKUB 3CI5A 1HNXK 1V4TA 1C1BA 3RRHA 1QQNA 1RGIA 3EZWA 4GW6A 4Z4IA 3UB5A 3WNEA 2F4VK 4O0JA 2E6MA 3FGUA 3OJSA 2UUBK 1XMQK 4CIFA 4I6MA 3HT3A 3TSUA 3LAKA 5ADXH 1GOAA 1X3MA 4YDUC 4UY8O 4OO1J 3D2FB 3TTDA 3VEYA 3MEDA 4JI4K 1OVQA 3QETA 1WSEA 1BUPA 3VEZA 2Q1NA 2E2NA 3SUQA 1S9EA 3HYFA 4W5RA 4NYNA 1U4BA 3QO9A 3PLAA 4DQRA 3KK3A 1NGGA 1P0AA 3TR8A 3IDHA 3D2EA 3VGMA 1IKWA 1BGXT 4N56A 3OYFA 3A8YA 3S5TA 4BR2A 3J8AA 1L3VA 3A2FA 4B1UB 1U04A 1NKBA 1QQOA 3DAWA 5J2QA 2O4GA 4LC9B 2NY8X 2QM1A 5BN9A 1T44A 3J7ZO 5C2DA 1NJIO 5DM7L 4NLBA 3RR8A 2I61A 4BDZA 1HRHA 3NCIA 1MWKA 4GV3A 4DFMA 3QDKA 1G99A 3P1GA 1IBMK 1JZBA 4FJIA 4FJ5A 5E84A 1SEGA 2UXDK 1XNRK 3M3ZA 4RW9A 4FM0A 3CCRN 1S6PA 3AVHA 3CF5L 4KREA 4M7YA 1PTXA 4B3MK 4G9ZA 2P9NB 1T05A 5TKYA 4MO5A 1GOBA 3PSIA 1O13A 3WT0A 3GL1A 4DMNA 4BC2A 2YCHA 4HCBA 3VEXA 5B8HA 3CQYA 4K43A 1NLVA 3C95A 4Y0WA 3OYAA 4LFBK 4W5NA 4OGEA 4A57A 1RTDA 1VQ5N 3F9KA 1P8ZA 3LPUA 4H0OA 2FXUA 4CE9A 4RW8A 2MBKA 4GNIA 3QEWA 2HHQA 2XRIA 3AARA 5K14A 1EWRA 5C15A 4CZFA 4IFYA 1X9JA 1VSEA 3ZYYX 4B9SA 2YKNA 2JDQD 5GINA 2Q0UA 3CW4A 3P5JA 3VQ9A 2HB5A 3UE5A 3F9MA 2XO7A 4JI2K 2HNZA 5C12A 3B8AX 3CJ9A 1WAJA 3RMCA 3FZLA 3OYDA 4JKBA 1RBTA 1FK9A 3I8BA 1QQCA 2ZGYA 2GTDA 3AO2A 5M1QA 4KKOA 4MDBA 3R3LA 3ZSXA 3VN5A 4U67L 2HMIA 4KH4A 3V4IA 4DSJA 4PUOA 1M1KO 3ZX0A 1SKWA 2LSNA 4KB0A 1J5OA 3QINA 1KQSM 1XC3A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4JS5 A;  4DU4 A;  4ID5 A;  1KVC A;  2E2O A;  1U49 A;  5BRF A;  3G10 A;  3ZSW A;  2P5O A;  3L4I A;  4M42 A;  1KLM A;  3C7N B;  2EX3 A;  2Q31 A;  4CK2 A;  4DFK A;  4UAF E;  3ZSZ A;  1VSI A;  3ENB A;  4JKC A;  3HL8 A;  5FPM A;  5CY0 A;  3DRR A;  4BQZ A;  1A5W A;  4LF6 K;  1VSL A;  3TTC A;  2NLX A;  2G2K A;  2KGQ A;  2HHH K;  1JLQ A;  1ESV A;  1XUP O;  3H08 A;  2RKI A;  4CW7 B;  4WQ5 A;  3OW2 M;  2NNW A;  2W6K A;  2ITM A;  5FRO A;  5FLX O;  4YOW A;  1XHZ A;  4G1Q A;  4E7J A;  1SL1 A;  4IOA L;  1IV0 A;  1LQH A;  4CHY A;  4C8M A;  1RT4 A;  2VGM A;  3G25 A;  1TK8 A;  4DFP A;  2IDO A;  3CER A;  3KLG A;  2BTF A;  4IJN A;  1OH8 A;  3EE9 A;  4BG9 A;  1VNA A;  1KFD A;  2ASO A;  3PUF A;  5C24 A;  4FL9 A;  2YIL A;  2HST A;  4JI8 K;  3O8M A;  4FJH A;  3LP2 A;  2E1Z A;  4KB1 A;  3VQB A;  5GIO A;  3AAQ A;  4DR2 K;  1JLA A;  4GKJ K;  1JCE A;  3OA9 A;  3QFU A;  1KTQ A;  2HBJ A;  4I6M B;  1KD1 O;  4JN4 A;  3NMU A;  2XY8 A;  4F3O A;  4FW1 A;  2ZGZ A;  1AYJ A;  4DCH A;  1WB9 A;  3LPT A;  3SJH A;  4JD2 A;  4A2B A; 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