5AQHA

Fragment-based screening of hsp70 sheds light on the functional role of atp-binding site residues
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
381
structure length
381
Chain Sequence
MSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title A fragment-based approach applied to a highly flexible target: Insights and challenges towards the inhibition of HSP70 isoforms.
pubmed doi rcsb
molecule keywords HEAT SHOCK COGNATE 71 KDA PROTEIN
molecule tags Chaperone
source organism Homo sapiens
total genus 120
structure length 381
sequence length 381
ec nomenclature ec 3.6.3.51: Transferred entry: 7.4.2.3.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5aqhA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqhA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqhA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5aqhA04
1DGKN 5JICA 4IWVA 3FE1A 5BPMA 3BP8A 2ASPA 3VEVA 4M7XA 4H0YB 3I8BA 4XH5A 3MN5A 4FWKA 4F9OA 3VGKA 4O8KA 1QQMA 4PKIA 5EOYA 4EIAA 4MO5A 3DAWA 4CJ7A 2HMPA 1BA0A 3DXKB 3O80A 3C7NA 4CZKA 1WUAA 2GEMA 3QMLA 4ISGA 2GTDA 3MN6A 3D2EB 5LJWA 2P9KB 1U6ZA 2V51B 4CZMA 4BVPA 2P9SB 3U9ZA 1T44A 2V7ZA 4RTFD 1YUWA 2QWOA 2DPNA 3LM2A 4B1XB 3FLCO 4WQ4A 5BRDA 4QS7A 4FWOA 1NWKA 3BF1A 5AQIA 3O6WA 1QZ5A 1ESVA 3ENHA 5AQMA 2H3GX 4L3QA 3M1FA 3WXLA 2YCHA 3VGLA 2IVPA 1NGDA 1HKBA 4MO4A 1OKJA 5LJVA 3HM8A 2Q31A 3H3NO 3FR0A 4EHTA 3CERA 4EAHD 3A5MC 1GLCG 1BOTO 3R6MA 4K43A 4JD2A 5AQKA 4Z94A 3LM9A 3L0QA 3J8AA 2GELA 3QB0A 1NGJA 3QICA 4H5WA 3EKSA 3CJAA 1G99A 3LDPA 4BRDA 3D2FB 1QQOA 1EQYA 3UKRB 3VETA 4YDUA 3WQTA 3CQXA 3ULEA 4BR0A 5KPRA 2A42A 4BR4A 2ASOA 2CH5A 4RCHA 3CQYA 3ID8A 4AM6A 1GLEG 4BGBA 2FSKA 4FWLA 4RWTA 3VOVA 2VYPA 1C0FA 2KHOA 1YVNA 3MN9A 3LDQA 2Q97A 5AQSA 4BC2A 4IZ9A 2FXUA 3HI0A 1NLVA 3UKUA 2IIRA 3MMVA 1HKGA 4WYBA 3VERA 4BQZA 4Y0WA 5AQVA 4E1JA 2D4WA 4WQ5C 4MLHA 4CZJA 1NM1A 5EY4A 1X3MA 5AQFA 1GLBG 2V7YA 5AQNA 3CI5A 4FWSA 4FWPA 5BRFA 2E88A 1IG8A 4M63C 3VPZA 2YHYA 3MN7A 3WT0A 4K41A 2P9PA 1QQNA 2P9IA 3JS6A 3D7EO 4GNIA 1XUPO 1RGIA 3KVGA 1Z6RA 5AZIB 5FPEA 3H45C 1JCFA 3VF2A 2IVNA 3LDOA 1KAYA 3EN9A 1HUXA 5EXWA 1K8KB 2QM1A 1T6DA 3RSEA 1U2VB 2YHXA 3AARA 3GDQA 2D0OA 2EWSA 3FZFA 2ZGZA 2GWJA 2E2NA 3H46O 4PKHA 3W3DA 1RFQA 4BQLA 1Z05A 4WQ5A 3LDNA 3TU5A 1KAZA 4BG9A 2CH6A 4AM7A 4BRIA 3VEYA 3D2FA 3UKRA 2Q0RA 2PBDA 4NB4A 3ZEUB 1GLDG 3FGUA 5FPMA 1RDWX 3CJ1A 2UYTA 1GLJO 2FLOA 2F9TA 3ZETA 1CZAN 4O5FA 1HX1A 3O08A 3WEEA 1MDUB 1T6CA 2OANA 4BR5A 2QW9A 5AQQA 1WOQA 5F2RA 3FFKB 3GL1A 2FF3B 5ADXH 2A41A 3IMXA 4JN4A 3F9MA 1C0GA 5F0XA 3VGMA 5JMVA 3MK6A 4BC5A 3OHRA 4EFHA 1ZXOA 3ENOA 3ZX3A 4CI6A 4H5NA 3JXUA 2Q2RA 3ZX0A 2E20A 4BRKA 4CBUA 1ATSA 4HWIA 2A40A 4BG8A 4DQ8A 1J6ZA 1LCUA 4MLEA 1NGCA 2PAVA 3HZ6A 2YI1A 3VF6A 1HKCA 2QWPA 3H1VX 3VEWA 3QBXA 2P9NB 3M3ZA 5AQHA 2NZTA 2E2QA 4EHUA 5AQGA 1DKGD 4BRPA 5BN8A 3P4IA 2AP1A 5AQPA 4GY2B 4I6MB 4CZGA 4B1VA 4CD3A 2I7NA 3WUHA 4PL8A 3LL3A 3FZMA 3B8AX 4BRQA 1NGGA 1BO5O 2F9WA 4JHDB 3QFUA 2W41A 4DHYA 4BR9A 1DEJA 3DXMA 4B9QA 5JLFA 4KBOA 3O5BA 4ISFA 4BRLA 4H03B 3BEXA 4J8FA 2P9UA 5AZJB 5I9EB 3O4WA 3SK3A 2E1ZA 2D1KA 1NGIA 3AY9A 2IVOA 4K25A 2P9LB 4CZLA 4FO0A 2ITMA 3CHWA 2E2OA 4FPBA 4BRNA 2QWQA 3L6QA 4XEIA 2CGJA 1MA9B 2VCPA 3ZEUA 1KAXA 3IDHA 2NRHA 3QBWA 1BWFO 3CETA 5BN9A 4BRCA 1P8ZA 3CJBA 3DXKA 3W0LA 3FZLA 5AQOA 2HF4A 3CJCA 3L4IA 3D2EA 3HSCA 1GLLO 2P9KA 3C7NB 2VWBA 3VEXA 4BROA 5BREA 3QDKA 2P9SA 3O1WA 3A5NC 1MWMA 3FZHA 5EVZA 4H0XB 1NGAA 1S22A 1YXQA 3WXIA 1NGBA 4H5VA 2HOEA 3KZBA 4BC3A 1SZ2A 2W40A 2E2PA 4FOEA 2QXLA 1TYQB 3WXKA 2ZF5O 5TKYA 2A3ZA 3A0IX 2Q36A 5AQYA 5ELZA 5BR9A 1IJJA 2HF3A 3A8YA 4B1YB 3VF4A 5AQJA 3SJHA 5AQRA 2WUSA 2ZGYA 3WQUA 4BC4A 2ASMA 5KPZA 3O1BA 3R9PA 3ATVA 4PKGA 3O8MA 2D0PA 4LC9B 1JCEA 1X3NA 3I33A 3VEOA 4A2BA 1KXPA 3SMPA 1HLUA 4WQ4C 4M7YA 2NLXA 3ULEB 3AAQA 2AA4A 4CBWA 3SMSA 2QWRA 2E8AA 1X9JA 4BREA 4BR2A 4BVOA 4B1WB 3QFPA 3TPQA 4H5TA 3EKUA 4JNEA 4A62A 3GBTA 1R59O 4NO7A 2Q0UA 2A5XA 2YHWA 3UB5A 5KPTA 1NGEA 3VENA 3UE5A 5E26A 2J4RA 4BGAA 1ZBSA 3UKUB 4PL7A 3KHYA 5JLHA 1QHAA 3R8EA 1BUPA 2BUPA 3AAPA 5B8HA 4QS8A 4CZIA 2CGKA 3A5OC 1SQKA 5AQZA 4DCHA 4BRHA 4YDUC 3ZX2A 1E4GT 3H6EA 2GUPA 1ATNA 4ISEA 2P9PB 3IUCA 2P9IB 3U4LA 3M6GA 4H5RA 5AZIA 4XH4A 1TYQA 4QS9A 1NGHA 5FPDA 4FPAA 1V4TA 4HTLA 1K8KA 1JCGA 1NMDA 4FWNA 4CZEA 1U2VA 5BPNA 2GWKA 5AQLA 1XC3A 4FSVA 1H1VA 5KQ8A 4C23A 2E1YA 4CBXA 3RSEB 2A6AA 2CGLA 4A61A 1TUYA 3IFRA 3VEZA 4IJAA 4CZFA 3FZKA 3A5LC 5AQTA 3EL2A 5AQXA 2YJEA 3GOIA 4IO8A 4B1ZA 3CJ7A 5ADXA 2V52B 1BG3A 5EX5A 2FSJA 3C0BA 3CJ9A 3MCPA 3MDQA 3H1QA 1S3XA 5AFUH 1NGFA 4BRMA 1Q18A 1TUUA 4BRGA 3ZETB 3WEEB 1XQSC 3EO3A 2I7PA 4K42A 3EZWA 5F1XA 1MWKA 1GLFO 4FWMA 2Q1NA 4FOIA 2BTFA 4BR7A 1GLAG 1E4FT 3U9DA 5E84A 5KQDA 2FSNA 3WXJA 3LDLA 3DJCA 1NBWA 4FL9A 1Y64A 1V4SA 2P9NA 4FWRA 1YAGA 3SLCA 4IXCA 4BRAA 4H0VB 4DB3A 4JAXA 1QZ6A 1ZC6A 3HBTA 5AR0A 3CIPA 4XH1A 4CZHA 3HTVA 1HJOA 5AQUA 4I6MA 1D4XA 3U8XA 1HPMA 2YJFA 3BF3A 2QWMA 3G25A 4FWQA 4JD2B 1BDGA 3GE1A 5BRHA 3GG4A 2ZWHA 4JHDA 4CD1A 2QWNA 3ATUA 3DWLA 1SAZA 3S41A 5FPNA 5LY3A 2FF6A 5CE3A 3DXMB 1LOTB 1BA1A 5AQWA 5AZJA 3VESA 4BRFA 3BUZB 5BPLA 4A2AA 1ATRA 3H3OB 4H0TB 4H0OA 2P9LA 2P9UB 4H0PA 5AFUA 1BU6O 4IJNA 2QWLA 4B1UB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3HPHA 1YJNN 3FE1A 3QEPA 5LMNK 1HYSA 1NJYA 4F9OA 3MN5A 4CF8A 4E7LA 1NKEA 2G8FA 4CJ7A 2GX9A 5HRSA 2HMPA 5EU7A 3DXKB 4DV0K 3OYKA 3O4QA 4BE1A 4B3MK 4CJFA 3VQBA 3MN6A 2QI2A 3VQ8A 1U6ZA 1CLQA 4CZMA 2E6LA 4RW7A 4CFCA 4YHHK 5CYQA 3CPEA 4CJ4A 4OLAA 2P9SB 1VSDA 1QSYA 4IFVA 5GIOA 3TARA 3HPGA 4B1XB 1VQ9N 3OYAA 4DG1A 5CY4A 1VK0A 5J1EA 1ILYA 4FWOA 3SUPA 3CXCM 4FLXA 2X6SA 3ZSWA 3PIPL 2VQFK 3ENHA 4L3QA 3M1FA 3WXLA 2YCHA 3HVTA 4LH5A 1HKBA 4G1QA 1N34K 4C1NI 4JI7K 4X66K 3KLGA 3Q7BA 3A5MC 1YJWN 4K43A 5AQKA 4QOZB 1NK4A 1NGJA 4KYPA 3A2FA 1VQ7N 2JWKA 3QICA 4H5WA 4O4GA 3EKSA 4CJLA 5JENA 2FBTA 3M8RA 3D2FB 1QQOA 3THWA 2OZMA 3VETA 4CESA 4YDUA 2KSKA 2R7YA 4HVJA 3OA9A 1ZUTA 3CMEN 2CH5A 2UXDK 1TK8A 3CG7A 2WBNA 3AGRA 1BIZA 1NKBA 1BISA 2VYPA 4FXDA 1C0FA 1RDAA 2W6KA 4CECA 3RRGA 2FXUA 3HI0A 4CJSA 3PV8A 2IIRA 3NGYA 5AQVA 5C0YA 4CJVA 4E1JA 2QXFA 4X62K 1RT7A 3K58A 4MLHA 3BK3C 5EY4A 3JAMO 3NVMA 1GLBG 4FWPA 5BRFA 3SBTA 4M63C 2YHYA 1OH6A 3JS6A 3EEQA 4DTRA 1F21A 4JEPA 2LT8A 4MFBA 4DKWA 2OPSA 3TTFA 3KVGA 2LJMA 5FPEA 3H45C 3VF2A 2IVNA 4X65K 3LDOA 2B68A 2YC1C 3PSIA 4JV5K 3LP1A 1EX4A 4KI6A 3SZ2A 2QM1A 1XMQK 4IEEA 1TK0A 1BCMA 4F4KA 4GW6A 4W5TA 4V1DC 2GWJA 2E2NA 2VG5A 2B4JA 3G10A 4XIUA 2HHVA 1RFQA 2DFFA 4GMJB 4WQ5A 5HLFA 4CW7B 4BG9A 4AM7A 5M1NA 2YV0X 5C24A 4HCBA 1BQMA 1TVRA 3FGUA 4PQUA 1RDWX 1T7PA 4O5BA 1KSPA 3E9PA 4AHVA 4EP4A 1HX1A 2KKZA 3WEEA 1MDUB 4FVMA 4BR5A 4UQGA 3PX6A 2HHTA 2FF3B 3R3LA 4W5OA 4AB0A 3RRHA 1YIJN 1NOZA 3IMXA 1C0GA 2A1RA 5F0XA 3CQ8A 3MK6A 3CCLN 4YOVA 3VQ4A 4EFHA 1QSLA 3ENOA 1TGOA 4JYAK 4AHTA 1ATSA 2A40A 3QESA 2HNZA 2F8SA 1T8EA 4AHCA 1E3MA 2P9NB 4KH6A 3K59A 2UU9K 1NK0A 4OPHA 4H4MA 4YFUA 3U3YA 1CZBA 3RR8A 4AILC 1A5WA 4E0DA 1OH7A 4DQRA 3L3UA 4B1VA 1GOCA 3KC6A 4RW6A 1Y97A 2P51A 3FZMA 5KGXA 5GAEP 2Z1JA 3B8AX 2QTDA 1NGGA 3QFUA 5M1PA 5TKWA 4DHYA 2XY7A 4BR9A 4LF5K 4V19S 3AVAA 2OTLN 3P31A 3E9OA 4CVNE 4BRLA 4BE2A 3CPWM 2ZD1A 5AZJB 3S3NA 3F9KA 1WAFA 4PA1A 4HUFA 2D1KA 3THYA 3AY9A 2LI7A 1TI5A 1Q82O 1NK9A 4XEIA 3TAQA 3G4SN 4GKKK 2A1SA 1KAXA 1T03A 5D3GA 2HB5A 1RT4A 3DXKA 3NF7A 3W0LA 4DU3A 3ZT3A 1X9SA 4KREA 3NGZA 1Q7YO 1TKXA 3HSCA 1RNHA 4JI0K 1W2BM 2VWBA 3VEXA 4HUEA 5BREA 3KOXA 3LDSA 1ASWA 2P9SA 4CEAA 5C10A 1MWMA 1RBSA 1HQUA 5EVZA 4B9NA 4DU1A 4H0XB 3L3VA 3LANA 1YJ9N 3CW4A 3J81O 4W5RA 4DV4K 3AO1A 4CGGA 2W40A 1QHTA 2OTJN 1HNIA 2QXLA 3OS1A 1TYQB 1EP4A 2D0AA 3IAYA 1D9DA 1GPSA 3ENBA 4M3WA 5ELZA 3E9LA 1IJJA 3A8YA 2ETJA 2UXBK 4DS4A 2Z1IA 5AQJA 1NNEA 3KHWA 4CF2A 4BC4A 1U47A 5KPZA 2BE2A 1RTDA 1WN7A 2XY8A 4PKGA 3OYHA 3M8SA 3KWGA 4B9SA 1JCEA 1X3NA 1FKOA 4K0KK 3I33A 3AO5A 3TANA 4F2RA 4UADE 2K35A 1J9AA 4FK0A 3M8QA 3KLFA 4CHYA 3AV9A 3ZSRA 1ZYVA 2WTUA 3CFRA 3ULEB 3AAQA 4O0IA 4RW8A 3SMSA 2QWRA 1X9JA 3V9UA 3QFPA 4DTSA 3OJSA 2PYJA 1R59O 4OGCA 1NGEA 4CERA 3CM6A 5E26A 1RTHA 3AVLA 3UKUB 3K5OA 5JLHA 1J5OA 2JLEA 3KTQA 1T3VA 2BUPA 1M90O 2XY6A 3A5OC 3HYFA 1O1WA 3ZX2A 3H6EA 4JKAA 3F73A 4JKBA 1JZAA 1KFDA 3KLHA 4ZTJA 4DSKA 1TAQA 5M1QA 1QVFM 1YI2N 4XH4A 1D8YA 5LL6Z 2E4LA 4FW1A 3VN5A 2HNYA 4FZYA 1JCGA 1L4VA 3QNNA 5BPNA 3AVHA 2X6NA 4E72A 5J2MA 3PSFA 1JLAA 1U4BA 1SL1A 4KKOA 3O3GA 2N2RA 1I39A 4OPJA 2LY5A 3MEDA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3HPH A;  1YJN N;  3FE1 A;  3QEP A;  5LMN K;  1HYS A;  1NJY A;  4F9O A;  3MN5 A;  4CF8 A;  4E7L A;  1NKE A;  2G8F A;  4CJ7 A;  2GX9 A;  5HRS A;  2HMP A;  5EU7 A;  3DXK B;  4DV0 K;  3OYK A;  3O4Q A;  4BE1 A;  4B3M K;  4CJF A;  3VQB A;  3MN6 A;  2QI2 A;  3VQ8 A;  1U6Z A;  1CLQ A;  4CZM A;  2E6L A;  4RW7 A;  4CFC A;  4YHH K;  5CYQ A;  3CPE A;  4CJ4 A;  4OLA A;  2P9S B;  1VSD A;  1QSY A;  4IFV A;  5GIO A;  3TAR A;  3HPG A;  4B1X B;  1VQ9 N;  3OYA A;  4DG1 A;  5CY4 A;  1VK0 A;  5J1E A;  1ILY A;  4FWO A;  3SUP A;  3CXC M;  4FLX A;  2X6S A;  3ZSW A;  3PIP L;  2VQF K;  3ENH A;  4L3Q A;  3M1F A;  3WXL A;  2YCH A;  3HVT A;  4LH5 A;  1HKB A;  4G1Q A;  1N34 K;  4C1N I;  4JI7 K;  4X66 K;  3KLG A;  3Q7B A;  3A5M C;  1YJW N;  4K43 A;  5AQK A;  4QOZ B;  1NK4 A;  1NGJ A;  4KYP A;  3A2F A;  1VQ7 N;  2JWK A;  3QIC A;  4H5W A;  4O4G A;  3EKS A;  4CJL A;  5JEN A;  2FBT A;  3M8R A;  3D2F B;  1QQO A;  3THW A;  2OZM A;  3VET A;  4CES A;  4YDU A;  2KSK A;  2R7Y A;  4HVJ A;  3OA9 A;  1ZUT A;  3CME N;  2CH5 A;  2UXD K; 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