5AQHA

Fragment-based screening of hsp70 sheds light on the functional role of atp-binding site residues
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
381
structure length
381
Chain Sequence
MSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Chaperone
molecule keywords HEAT SHOCK COGNATE 71 KDA PROTEIN
publication title A fragment-based approach applied to a highly flexible target: Insights and challenges towards the inhibition of HSP70 isoforms.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 120
structure length 381
sequence length 381
ec nomenclature ec 3.6.3.51: Transferred entry: 7.4.2.3.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5aqhA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqhA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqhA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5aqhA04
1DKGD 5LJVA 4BR2A 4CBUA 3ZEUA 4FWSA 3EN9A 1H1VA 4YDUC 3VEOA 4AM7A 3HBTA 5AZIA 3CERA 1C0GA 1S3XA 1U2VB 4FSVA 2FLOA 5AZJB 3CQXA 3W0LA 3DWLA 3DAWA 4BRKA 1NGIA 3A5LC 2GTDA 3BEXA 1NGJA 5BPLA 1LCUA 5KPRA 5FPMA 1YVNA 4DB3A 4WQ4C 3ULEA 2CH6A 1YUWA 2GEMA 2VWBA 3L4IA 5KPTA 3AARA 3QB0A 3U8XA 3VF2A 1BWFO 3UKUB 5CE3A 4H5VA 5AQQA 4A62A 4FOEA 2IVOA 3W3DA 5AFUA 1T6DA 2FXUA 1GLDG 3U9ZA 2WUSA 5BR9A 3UE5A 1BO5O 1V4SA 1E4FT 3EZWA 5BREA 5FPNA 3U4LA 1ATSA 3MN9A 5TKYA 4BRHA 3MN7A 2V52B 3GE1A 5BRFA 2YHYA 3MDQA 5EXWA 4YDUA 3O6WA 1RDWX 4M7XA 2D4WA 4A2AA 3LDPA 3JXUA 4BGBA 1NGGA 2F9WA 2NLXA 3VERA 5AQUA 3SLCA 3CI5A 1BDGA 3DXKB 3O80A 1WUAA 1QZ5A 3L6QA 5JLFA 4K43A 3HI0A 3CIPA 3C7NA 3QFUA 4WYBA 4B1ZA 1TUYA 4BR7A 3WXLA 4BC2A 3AAPA 1K8KB 5AQRA 1SAZA 4JNEA 1XC3A 2P9IA 4BVOA 3QDKA 4FWKA 4I6MB 2CH5A 4EIAA 2YJFA 4FWRA 3S41A 2E2NA 1NGAA 2H3GX 4B9QA 3DXMA 3KZBA 4K41A 1BOTO 1YXQA 2QXLA 1TUUA 2V7YA 3GBTA 4BGAA 5AR0A 2HMPA 4ISGA 4MO5A 1KAZA 2P9KB 3CJAA 3FZMA 4CZHA 1KAYA 3U9DA 4XH4A 3LL3A 1X9JA 2BTFA 3VPZA 4CZKA 5AQGA 5ELZA 1WOQA 3CJ7A 1HJOA 2GELA 2J4RA 1IG8A 3CHWA 1RFQA 3DJCA 4H0PA 3H6EA 3H46O 5BN8A 5AQWA 4H5NA 4PKHA 5F2RA 5AQVA 1DEJA 3GDQA 4J8FA 4JD2B 3O08A 2ASOA 2GWJA 4H5WA 3VEVA 1GLBG 1TYQA 4Y0WA 3SMSA 3UKRA 2ZGZA 5ADXA 3H1QA 4B1UB 1R59O 2P9NB 3VGLA 5AFUH 4H0YB 3HTVA 3B8AX 3D2FA 2YHWA 1Y64A 1GLAG 1JCFA 1QZ6A 3CJCA 2FF6A 2QWRA 2YI1A 4FWOA 3ZX3A 5AQNA 1J6ZA 3F9MA 5KQDA 4WQ5A 5BRDA 2KHOA 3LDQA 2FF3B 3FGUA 4BRIA 4QS7A 5BPNA 2HF4A 3D2EA 4F9OA 1HLUA 1ZBSA 4BRNA 3A0IX 4FPBA 1S22A 4BR9A 5BPMA 1D4XA 4CD1A 2P9UB 4CZMA 2P9PA 5BRHA 3ZX0A 1BUPA 4CZFA 1U6ZA 4JN4A 2IIRA 3RSEB 4ISEA 3FZLA 1HX1A 3ZETB 2P9SA 4BREA 3WEEB 2A3ZA 4BRCA 2IVPA 2NRHA 4BC4A 4FWQA 3UB5A 4JHDB 4H5RA 4FWMA 5BN9A 2CGKA 2Q31A 3M3ZA 2Q36A 3WQUA 1BU6O 1C0FA 1HKBA 4HWIA 2Q0RA 4RCHA 1T44A 1NGEA 3CETA 1GLCG 3WXJA 1HPMA 1P8ZA 5LJWA 5AQSA 2QWOA 4XH1A 5E84A 5AQHA 3QICA 3VF6A 2I7NA 4K42A 3P4IA 3QFPA 1Q18A 2QWLA 3MMVA 5AQYA 1U2VA 4CBXA 5AZJA 4EFHA 5FPEA 4DHYA 1ESVA 2ZWHA 4RWTA 3FZKA 5EY4A 3J8AA 1ATNA 2VCPA 5F1XA 1QQMA 4M63C 3VF4A 3VEYA 3BF1A 2A41A 5AQJA 4BG8A 4BRDA 4H0XB 3VEXA 2Q2RA 1QQOA 5AQMA 3ID8A 5LY3A 3M6GA 1BG3A 4FOIA 1HKGA 1SZ2A 2ASMA 3UKUA 3WT0A 4NO7A 1YAGA 3VOVA 1SQKA 2IVNA 3O5BA 4MLHA 5ADXH 2Q97A 5F0XA 2CGLA 4IO8A 1IJJA 3OHRA 2HOEA 3VENA 4H0OA 2E20A 4CBWA 5EVZA 5AQTA 3JS6A 4BRMA 2ZGYA 3HM8A 4HTLA 3TPQA 4FWNA 3FLCO 4MO4A 3ZX2A 4E1JA 4CZGA 2BUPA 3IDHA 2HF3A 1JCGA 3BP8A 3MN6A 4BC5A 4BRQA 2Q1NA 2QW9A 3DXKA 4WQ5C 3GL1A 3MK6A 1HKCA 4EHTA 3CQYA 3TU5A 1MWMA 1K8KA 2W40A 4BRPA 2P9LB 3WXIA 4CZIA 4QS8A 1ZXOA 3VESA 3ATVA 3VEWA 4IZ9A 4I6MA 1GLLO 1BA0A 1ATRA 1GLFO 2ITMA 3ZEUB 4EAHD 1NWKA 5AQFA 4FPAA 1Z05A 5KQ8A 3FR0A 5JICA 4BRLA 2DPNA 2OANA 5AZIB 4H5TA 4IWVA 2P9KA 1JCEA 2QWNA 2YJEA 2QM1A 2A40A 3M1FA 4BC3A 3VGMA 4A61A 2E2OA 2A6AA 2GWKA 3ULEB 5B8HA 3LDNA 4H0VB 4C23A 3H45C 1OKJA 2W41A 4DCHA 5AQOA 3R9PA 4CZJA 5E26A 3I8BA 4JD2A 4RTFD 3VEZA 3FE1A 4ISFA 4BR5A 4PL7A 1DGKN 3LM2A 4CZEA 2E2PA 2P9NA 2E1ZA 3I33A 1X3MA 3GG4A 1MDUB 2UYTA 4PKIA 4PL8A 1XQSC 4QS9A 4PKGA 4B1XB 3WUHA 1G99A 5EOYA 4EHUA 4A2BA 5KPZA 2D0PA 3GOIA 4BQZA 1V4TA 1XUPO 2FSKA 3IMXA 1QHAA 4K25A 3H1VX 2ASPA 4JAXA 3C0BA 3A5OC 4B1VA 3BF3A 4H03B 3A5NC 2CGJA 3R6MA 1QQNA 3KHYA 3EL2A 3HZ6A 3LDLA 3C7NB 4L3QA 4BG9A 1Z6RA 1NGFA 5AQKA 3LDOA 4BROA 1KXPA 3KVGA 2P9UA 4XEIA 3MN5A 1NGHA 4CJ7A 3RSEA 2P9IB 3FFKB 3EKUA 3ZETA 3WEEA 1RGIA 1NLVA 3CJ9A 5AQXA 4JHDA 1E4GT 2QWMA 2D0OA 3ENHA 5JLHA 5AQZA 4BR0A 3QMLA 3O1WA 4O8KA 2QWQA 1MWKA 3DXMB 4BRFA 2E1YA 5AQLA 3CJ1A 3H3NO 5EX5A 3LM9A 4GY2B 1NGBA 3IFRA 4O5FA 4BVPA 3FZFA 1GLJO 4WQ4A 1ZC6A 2YCHA 3ENOA 3QBWA 3O1BA 3O8MA 2E8AA 4AM6A 2D1KA 2FSNA 2E88A 4DQ8A 4NB4A 2PAVA 3AAQA 4BRGA 5AQIA 2QWPA 4IJAA 3VGKA 3ATUA 3MCPA 4KBOA 1KAXA 2E2QA 5FPDA 3R8EA 3UKRB 1TYQB 4M7YA 4FL9A 3D7EO 4XH5A 4BR4A 4CD3A 3SJHA 2A42A 3D2FB 5AQPA 2VYPA 4H0TB 1BA1A 3HSCA 3IUCA 3BUZB 2YHXA 4B1WB 1NMDA 2F9TA 3O4WA 3AY9A 2I7PA 4CI6A 4MLEA 1NGCA 3VETA 3QBXA 3WXKA 4FWPA 3H3OB 4FO0A 2A5XA 3L0QA 2AA4A 5JMVA 3D2EB 4CZLA 4Z94A 2FSJA 3SK3A 1LOTB 4FWLA 4BQLA 1NM1A 5I9EB 2P9PB 3SMPA 2NZTA 2EWSA 2V51B 3EO3A 1X3NA 3A8YA 4IJNA 2Q0UA 3CJBA 4BRAA 2P9SB 1NGDA 3FZHA 1T6CA 2ZF5O 3A5MC 1GLEG 4LC9B 2GUPA 2P9LA 1HUXA 1CZAN 1EQYA 4B1YB 3G25A 2V7ZA 2AP1A 4IXCA 3WQTA 1MA9B 2PBDA 3EKSA 1NBWA 4GNIA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5LJVA 1REVA 4FZXC 3PX0A 1KVAA 4F4KA 3MWTA 1HJRA 4YDUC 1C0GA 1T7AA 3DWLA 4KKOA 2GTDA 3BEXA 5BPLA 3C6HA 3E66A 4CESA 1YVNA 1KVCA 3QLHA 4DF4A 2O8DB 5CR4A 3CM6A 2HHIA 5T7BA 1WN7A 4LSNA 3L4IA 3AA3A 3J7ZO 3HSTB 5M1QA 3U8XA 5DK5A 1BWFO 3CPWM 1IKVA 3KHWA 2IDOA 4H5VA 1UOCA 2QKBA 4FOEA 4OJRA 4BE0A 1SKRA 3U9ZA 3RMBA 3K59A 3J7YP 2LY6A 1RT3A 4RW7A 2KLAA 5FPNA 1ATSA 5HP1A 1WSEA 2HBLA 3MDQA 4GV9A 2NY9X 1NJIO 3NH2A 4HHTA 5J2PA 3JXUA 4X64K 2G8IA 4CK2A 1NGGA 3BZKA 1RT6A 4U67L 4GV3A 4HCBA 3HO1A 3O80A 1D9DA 1QZ5A 3L6QA 2KW4A 4FJ9A 4WYBA 3QFUA 3T69A 4M3YA 4NYFA 4BR7A 5HRNA 4AAZA 1SAZA 3VQEA 3OJSA 4CJFA 3L2RA 1JJ2M 3PO4A 3BZCA 4Z4HA 3E9OA 2P9IA 4DQIA 3QDKA 4B08A 4FWKA 3V9XA 4W5NA 2Y1JA 4FWRA 3KLGA 4DMNA 3TABA 1RBRA 4CFAA 1BCOA 2E2NA 2YBRC 1N8RO 2H3GX 4OPJA 3DXMA 1JZAA 1TUUA 4CJUA 3ZT4A 3OYIA 4AB0A 4MO5A 3CCVN 2ATBA 4CZHA 2VQEK 1HNXK 4XH4A 2O8CA 3TSUA 4BDZA 2BTFA 4I7FA 4JKDA 1WOQA 4YOXA 2J4RA 3CHWA 3CMEN 4DSFA 3DJCA 3S9HA 3H6EA 3SQ2A 5BN8A 1N6QA 5AQVA 1XC9A 2ASOA 1X9SA 3SPZA 4KTZA 5D3GA 2LSNA 4Y0WA 1OH7A 2P9NB 1T3VA 1ZYWA 3B8AX 4FLXA 3D2FA 2YHWA 4DV0K 1GLAG 3C6AA 1JCFA 1QSYA 2Z1JA 4KTQA 4CGJA 3K57A 4FZYA 2QWRA 2ZQBA 3ZX3A 3VA3A 1X9WA 1J5EK 4DFKA 3QO9A 1S6PA 3LDQA 2FF3B 3FGUA 5BPNA 2OZMA 2QI2A 4JKFA 4LFBK 5BPMA 1SEGA 3OYAA 1WT7A 4CD1A 2P9UB 5BRHA 4FK4A 1XRSB 2NRRA 1IBLK 4AEIA 4CZFA 4ILHA 1U6ZA 4CIEA 3AO3A 4BREA 1HX1A 4RW4A 3LZIA 3T19A 4B9UA 4KHWA 1GPTA 4JHDB 4GKJK 4FWMA 2CGKA 3NAEA 2Q36A 3WQUA 1C0FA 1Q81O 4YOUA 3T1AA 2Q0RA 3WNGA 4JK7A 3OYKA 1K6YA 1GLCG 5GIPA 4CGHA 5LJWA 5AQHA 1BCGA 2E6MA 2HHWA 4K42A 3SZ2A 3CXCM 2KPYA 5FPEA 3VQ9A 3RR7A 3NVKA 1ATNA 1QQMA 2B5JA 1VQ7N 2FBYA 4BRDA 3VEXA 5LY3A 5AQMA 2LKBA 3M6GA 4FOIA 4FK0A 1NJZA 4B9TA 4CF2A 3LDSA 1SZ2A 3NVMA 1B9FA 4MFBA 5SWMA 4FK2A 2JWLA 3PSMA 3VQPA 1W2BM 4IO9L 5CY4A 5DMRA 2VWKA 1IKXA 4ILJA 4MLHA 4CJSA 4CCHA 3ZSVA 1T7BA 2GX9A 5EU7A 3VENA 2HOEA 1JLQA 3AVIA 1C0UA 1RTHA 2E20A 1ICAA 2HBKA 1JLFA 1U48A 4X62K 2ZGYA 4HTLA 1HQUA 4MO4A 3ZX2A 5KTQA 2XY8A 4JI4K 4CIFA 4B3TK 2RN2A 4CJPA 2JLEA 4IEIA 4BRQA 5GINA 2RF2A 4E7IA 4LY7A 2XRIA 4XJXA 1B92A 3OYNA 3DXKA 1J54A 4WQ5C 1SNBA 4RW9A 4EHTA 1BHLA 3U3YA 3TU5A 4CJVA 1LAWA 2W40A 3TI0A 3Q7BA 4WCEL 2KFNA 4QS8A 1EXQA 4I6MA 1GLLO 4NXNK 4M3RA 2HHQA 3G10A 1ATRA 3MX2A 2PYJA 2ITMA 3K5OA 4M3TA 2YIOA 4ELTA 5KQ8A 2D56A 5JICA 3PSFA 4PWDA 3MEGA 2MBKA 1NNEA 1JCEA 3LP3A 2QWNA 4O44A 2A7TA 3PLAA 3OA9A 4ILGB 1FXXA 4AHTA 2GL1A 3ULDA 4LFCK 3K5MA 2W41A 1FKPA 4DCHA 1LAVA 2DTUA 3AGKA 3KKSA 3HOTA 4FJ7A 4E0DA 4O5BA 3VEZA 1OMYA 2E2FA 4BR5A 4CF9A 1DGKN 3AVJA 3RMAA 4KHUA 3O9UA 2E2PA 3GG4A 4AHCA 2DFFA 1Q9YA 3NGZA 1QS4A 4QS9A 4N41A 1X1PA 1KC8O 4FW1A 5EOYA 1RDAA 1LQIA 1SL2A 1VQPN 1OVYA 3GOIA 1Z25A 1V4TA 4K25A 4CGDA 3C0BA 3A5OC 2LI7A 2IGIA 2F7TA 3A5NC 4OGEA 3G4SN 4JI7K 2KTQA 3R6MA 3QEWA 3HZ6A 4FJMA 2D0AA 4B9NA 4L3QA 3SNNA 3LDOA 3KVGA 4O0JA 3SAGA 4O8UA 2HHVA 3RWUA 4IOXA 1U49A 2P9IB 5CYQA 1KD1O 4CK1A 3WEEA 3LAMA 1RGIA 1YIJN 4M3XA 2C1IA 5AQXA 5H1SQ 5JLHA 4BR0A 3O1WA 4AH9A 1NJYA 1MWKA 3KLEA 3DXMB 2JWKA 1KLMA 5M1KA 4DTUA 2NUBA 1QVFM 5EX5A 3LM9A 3AA2A 1NGBA 3IFRA 1IO2A 1RTJA 4BVPA 3WNFA 3AVKA 3SBTA 2O8CB 1XI1A 3NGYA 3LPUA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 5LJV A;  1REV A;  4FZX C;  3PX0 A;  1KVA A;  4F4K A;  3MWT A;  1HJR A;  4YDU C;  1C0G A;  1T7A A;  3DWL A;  4KKO A;  2GTD A;  3BEX A;  5BPL A;  3C6H A;  3E66 A;  4CES A;  1YVN A;  1KVC A;  3QLH A;  4DF4 A;  2O8D B;  5CR4 A;  3CM6 A;  2HHI A;  5T7B A;  1WN7 A;  4LSN A;  3L4I A;  3AA3 A;  3J7Z O;  3HST B;  5M1Q A;  3U8X A;  5DK5 A;  1BWF O;  3CPW M;  1IKV A;  3KHW A;  2IDO A;  4H5V A;  1UOC A;  2QKB A;  4FOE A;  4OJR A;  4BE0 A;  1SKR A;  3U9Z A;  3RMB A;  3K59 A;  3J7Y P;  2LY6 A;  1RT3 A;  4RW7 A;  2KLA A;  5FPN A;  1ATS A;  5HP1 A;  1WSE A;  2HBL A;  3MDQ A;  4GV9 A;  2NY9 X;  1NJI O;  3NH2 A;  4HHT A;  5J2P A;  3JXU A;  4X64 K;  2G8I A;  4CK2 A;  1NGG A;  3BZK A;  1RT6 A;  4U67 L;  4GV3 A;  4HCB A;  3HO1 A;  3O80 A;  1D9D A;  1QZ5 A;  3L6Q A;  2KW4 A;  4FJ9 A;  4WYB A;  3QFU A;  3T69 A;  4M3Y A;  4NYF A;  4BR7 A;  5HRN A;  4AAZ A;  1SAZ A;  3VQE A;  3OJS A;  4CJF A;  3L2R A;  1JJ2 M;  3PO4 A;  3BZC A;  4Z4H A;  3E9O A;  2P9I A;  4DQI A;  3QDK A;  4B08 A;  4FWK A;  3V9X A;  4W5N A;  2Y1J A; 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