5AQHA

Fragment-based screening of hsp70 sheds light on the functional role of atp-binding site residues
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
381
structure length
381
Chain Sequence
MSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Chaperone
molecule keywords HEAT SHOCK COGNATE 71 KDA PROTEIN
publication title A fragment-based approach applied to a highly flexible target: Insights and challenges towards the inhibition of HSP70 isoforms.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 120
structure length 381
sequence length 381
ec nomenclature ec 3.6.3.51: Transferred entry: 7.4.2.3.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5aqhA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqhA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqhA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5aqhA04
3WXKA 5AQJA 4H03B 4WYBA 4Y0WA 5EOYA 5AQSA 3FGUA 1WOQA 4QS7A 2H3GX 4PKHA 2A40A 3VF6A 5LJVA 3H1QA 4K43A 1HJOA 3D2FB 3W3DA 2YCHA 4FWLA 1NGIA 2VWBA 1TUYA 2D0OA 3WXJA 1BA1A 2F9WA 2OANA 4I6MB 3DXKA 4PL8A 3GOIA 2AA4A 4FPBA 4FPAA 3O6WA 2E2NA 3CJCA 4IJAA 3VESA 5KQ8A 2NRHA 4BG8A 3VGKA 2NZTA 5ELZA 2UYTA 3A5MC 4MLHA 1QQNA 1SAZA 2Q0UA 4BRIA 1Y64A 2GTDA 4JHDB 2IIRA 2E1YA 3VETA 5AQTA 2P9PA 1TYQB 4JNEA 3H3NO 3ZETA 2FXUA 5AQPA 4BC3A 4AM7A 5AR0A 1YAGA 4CZGA 3M1FA 4GNIA 3QB0A 2A42A 2PAVA 3WQTA 4MO4A 3WUHA 1QQOA 1H1VA 3UKRB 3CJ1A 3WXIA 2IVOA 3WEEB 5AZIB 2QWRA 2P9UB 1NGHA 3LL3A 4BRLA 2YHYA 2P9LA 4WQ5C 3HM8A 1V4TA 3HZ6A 1D4XA 4EIAA 2P9IB 4JD2B 2Q0RA 2V51B 3WXLA 1QHAA 1E4FT 1HLUA 1E4GT 1SZ2A 2DPNA 5FPMA 3B8AX 4H5NA 2QW9A 2CH5A 2CGKA 1RDWX 2PBDA 3ID8A 3ATUA 3I33A 3D2FA 4K41A 3O1WA 3VOVA 3AARA 3FLCO 4F9OA 4CD3A 4H0XB 2QWOA 2ZGZA 1RGIA 5F0XA 4M7XA 5ADXH 3CHWA 1BO5O 1P8ZA 2Q1NA 3FZMA 3R8EA 1G99A 2HF3A 5AQVA 4BROA 1J6ZA 3EO3A 4ISFA 3DWLA 2P9NB 4B1VA 5JLFA 2WUSA 3ZEUB 4IWVA 5AQMA 3MN9A 3MN5A 5CE3A 3AY9A 4BR5A 5BRDA 1XUPO 4O5FA 3GDQA 2A5XA 4JHDA 4BQZA 1NGFA 5BPNA 5AQQA 3QBXA 4CBXA 2E2QA 4H5RA 1TYQA 1YVNA 2FSJA 4BC5A 3IUCA 4EHUA 3WQUA 4BR0A 4H0PA 3HTVA 1NWKA 5AQNA 3L0QA 3A5NC 3ZX3A 3DAWA 1GLEG 3VEZA 1WUAA 4BC4A 4B1WB 4BRMA 1S3XA 3EKUA 4FOEA 4CZIA 3D2EB 3UKRA 4FWPA 3QBWA 3A8YA 3HSCA 4M63C 4IO8A 4YDUA 5KPTA 2I7PA 5AZIA 3CQXA 2QWPA 1U2VB 1GLLO 2QM1A 1HKBA 3QFUA 2V52B 4MO5A 1QQMA 2Q97A 1LCUA 3MN6A 3LDNA 2YHXA 3C7NB 1T6CA 4LC9B 2GUPA 5BN9A 1NGDA 4RTFD 3CERA 3R6MA 2QWMA 4A2BA 2ZF5O 3O8MA 2P9SA 3QICA 5BR9A 4CZEA 4GY2B 2EWSA 3VEWA 1NGJA 4B1YB 3RSEB 3TU5A 2E1ZA 5AQUA 1YXQA 3OHRA 4BVOA 4C23A 4BRHA 1NGBA 3CQYA 4IJNA 3BUZB 4AM6A 2Q2RA 3U9ZA 4M7YA 2P9NA 4BRAA 4FWSA 3ZEUA 5JICA 3IMXA 2Q36A 1XC3A 5JMVA 1ZXOA 3LM9A 1GLBG 4Z94A 4BQLA 4O8KA 4WQ4A 3BEXA 3AAQA 1KAYA 5KQDA 4BRKA 1HX1A 1ZBSA 3GL1A 3LM2A 4DHYA 4FSVA 2YHWA 3CJ9A 3H45C 3H6EA 4H0VB 4FWKA 4XH1A 4B1ZA 4A61A 5AQFA 2QWQA 1CZAN 3M6GA 4IXCA 3O1BA 5B8HA 1NGGA 5I9EB 4RWTA 3SJHA 2IVPA 1BA0A 3FZHA 1HPMA 2HMPA 3ULEB 4CI6A 4QS9A 2BUPA 3D2EA 2HF4A 5KPRA 1MA9B 3P4IA 5AZJB 2GELA 2YJFA 3A0IX 3VEXA 1BWFO 3U8XA 1GLAG 4CZLA 3ZX2A 2E88A 1BDGA 3EL2A 1IG8A 3CIPA 3C7NA 1U6ZA 1KXPA 2J4RA 3DXMB 1K8KB 3EN9A 2P9KB 4BRQA 3ENHA 5FPEA 3QMLA 5AQHA 5AQXA 3RSEA 4E1JA 4FOIA 2A6AA 4CJ7A 3VGMA 3AAPA 4I6MA 2HOEA 3JXUA 4BRGA 4BRPA 5AQIA 5FPDA 2AP1A 4DB3A 2V7ZA 2FF6A 4A62A 4BR4A 1C0GA 2W40A 4IZ9A 5AQOA 3L4IA 2ZGYA 4FWQA 1C0FA 3ENOA 4BRDA 1X3MA 3VEVA 3F9MA 3MMVA 3G25A 3SMPA 1NGCA 3EZWA 4QS8A 5EVZA 1V4SA 2FLOA 3VEOA 5BN8A 5AQRA 1KAXA 4HTLA 3SK3A 4B1UB 3BF3A 4BR9A 4H5WA 3U9DA 2V7YA 5BREA 3A5LC 3VPZA 4PL7A 3ULEA 3CI5A 2P9PB 2GWKA 4H0TB 4K25A 2ITMA 3WEEA 1T44A 2Q31A 4XH4A 3ZETB 3LDQA 2P9UA 3L6QA 3H46O 3MK6A 1KAZA 3R9PA 1LOTB 3KVGA 1IJJA 5AFUA 3FR0A 4JAXA 1MWMA 4CZFA 2P9IA 4JD2A 4CZHA 4ISEA 1K8KA 3UB5A 3HI0A 3VEYA 2P9KA 4FWMA 2D0PA 3I8BA 2QXLA 4PKIA 1DKGD 1GLFO 2FSNA 3CJAA 3TPQA 2FF3B 3BP8A 4H5VA 1YUWA 5F2RA 2E2PA 2A3ZA 1BUPA 3KZBA 3WT0A 3GG4A 4FO0A 5F1XA 4CD1A 5BRFA 2ASMA 4H0YB 4CZJA 3FFKB 2A41A 2KHOA 4A2AA 1NLVA 3EKSA 3H3OB 2E20A 1NM1A 4WQ5A 4K42A 2CH6A 2D4WA 3UKUB 5AQLA 1JCEA 1GLDG 1EQYA 4BRFA 4J8FA 2E8AA 1NMDA 3LDLA 3O80A 3JS6A 5AQZA 2FSKA 4YDUC 4RCHA 3DJCA 4DQ8A 3MN7A 4NO7A 2ASOA 3SMSA 4B1XB 4NB4A 2CGJA 3VF4A 1GLCG 3LDPA 2ZWHA 3BF1A 2QWNA 3SLCA 3IDHA 1RFQA 3FZFA 1BG3A 4ISGA 3IFRA 3W0LA 3D7EO 1ATNA 1GLJO 2NLXA 1BU6O 5JLHA 1QZ5A 1DGKN 3KHYA 1U2VA 1Z6RA 4BC2A 1Z05A 2ASPA 3O4WA 4CBUA 3C0BA 3MDQA 4JN4A 3A5OC 2BTFA 1T6DA 3HBTA 3S41A 2D1KA 5BPLA 3VENA 3U4LA 4BR2A 2YJEA 3UE5A 5BRHA 5EXWA 1ESVA 4H0OA 5AQWA 1NGAA 3O5BA 2VCPA 2QWLA 4BREA 3MCPA 2F9TA 4FL9A 4FWRA 1X9JA 3VGLA 4CZKA 4HWIA 3FZLA 3CJBA 1QZ6A 4WQ4C 4CBWA 2CGLA 2P9SB 3FZKA 4EFHA 1TUUA 5LJWA 4PKGA 2W41A 5AFUH 4EAHD 1ATSA 4CZMA 4DCHA 2E2OA 4BGAA 5KPZA 3ATVA 1NGEA 1DEJA 3UKUA 3DXKB 5AQGA 4XH5A 4FWOA 3VF2A 4BGBA 4B9QA 5EY4A 4EHTA 1HKGA 3O08A 1HKCA 3CJ7A 3ZX0A 4H5TA 3FE1A 4BR7A 1OKJA 1XQSC 1JCGA 5AQKA 4MLEA 4BG9A 1NBWA 3J8AA 1MWKA 2I7NA 4FWNA 1Q18A 2VYPA 4XEIA 5AZJA 3LDOA 2IVNA 1SQKA 1X3NA 5EX5A 3H1VX 1JCFA 3M3ZA 5TKYA 5LY3A 3DXMA 1R59O 2YI1A 3CETA 5ADXA 4KBOA 2GEMA 3QFPA 1S22A 1ZC6A 5BPMA 1ATRA 1HUXA 3VERA 5AQYA 3QDKA 2GWJA 5E26A 4BVPA 2P9LB 4L3QA 3GE1A 4BRCA 1BOTO 4BRNA 3GBTA 5FPNA 1MDUB 5E84A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1E3MA 4PKHA 3H1QA 1NOZA 4FZYA 3AA3A 1S6QA 3W3DA 4FWLA 3AO5A 3G6EN 1EXQA 2HVHA 2ZQBA 4PL8A 4JKGB 2AA4A 3J80O 3V1QA 2NRHA 2XY7A 4FM2A 3A5MC 5HOOA 3OYNA 4DSFA 1HNVA 1SAZA 1C6VA 2Q0UA 3AA5X 3SV3A 3ZSOA 2OTLN 2IIRA 4KREA 4C8NA 3CC7N 2P9PA 3THXB 3NGZA 4JNEA 1BI4B 2FBVA 3ZETA 4WFNL 4OLBA 3OYJA 4E19A 4CJTA 3OYGA 4JI6K 3TABA 2BANA 1L4VA 3HM9A 2ZM6K 4Q5VA 5I42A 4IFEA 3OYEA 4KHPK 2YEOA 3UKRB 1L5UA 3CJ1A 3WXIA 3OBWA 2IVOA 4MQ3A 2RPIA 1XHZA 1WLJA 2B4JA 4CHOA 4BRLA 2YHYA 2P9LA 4CJ4A 2OPQA 3HM8A 1V4TA 1D4XA 3CCEN 1QVGM 4CQKA 4CJKA 3CD6N 1E4GT 3L2VA 3ZSRA 1XI1A 1KCFA 3L2UA 2PBDA 1YIJN 4DFKA 3I33A 4GKJK 4FM0A 3O1WA 3VOVA 4C8OA 1N8RO 4FJXA 4CD3A 1RGIA 1HPZA 3SPYA 1BO5O 4FJGA 4CJRA 4EZ9A 1C0UA 5HP1A 4ISFA 2WOMA 3ZEUB 3D0PA 4IWVA 3MN9A 4MDAA 3MN5A 5CE3A 2ZJRL 1BCMA 1REVA 3SAFA 4O5FA 1KFSA 3DI6A 4KKOA 1LWCA 3QBXA 2QK9A 1NK8A 3IS9A 1TYQA 3ID6A 1VRUA 1TKTA 3KLIA 4OVLA 4O0JA 2XY8A 4EHUA 2GUIA 1HQUA 3CCQN 2SN3A 1IO2A 4FJMA 5AQNA 2KQ2A 3A5NC 3AVAA 3DAWA 1S72N 1XMOK 2F8SA 5GINA 4E7JA 1VSMA 5K14A 4LFCK 4CZIA 1EO1A 3OTOK 2IDOA 3QBWA 3P39A 2UU9K 3HSCA 4M63C 4IO8A 4CFBA 4DSEA 4HCBA 3KOWA 5JS1A 3E9PA 3LWMA 1U2VB 3NF8A 2QM1A 1HKBA 3ISNC 2V52B 3AVFA 1K6YA 2NRTA 5HBMA 2YNGA 2E0HA 1RT5A 5BN9A 3C95A 4RTFD 4JKHA 4PA1A 3QNOA 3PO4A 3QICA 5BR9A 1JZAA 4GY2B 1OH6A 3IRXA 4JI7K 4DS4A 2D0AA 3VQ4A 2O4GA 5AQUA 2WC9A 1VHXA 1SNBA 4ICLA 1YT3A 4CESA 4BVOA 5GIPA 4BRHA 1Q82O 1NGBA 4CGDA 2OZMA 2M8BB 5LMUK 4AM6A 2Q2RA 1C55A 3U9ZA 2P9NA 3AO2A 2HBJA 1EX4A 3O3GA 4KTQA 2Q36A 4A57A 2LJ7A 3C6HA 1POIA 1LAWA 3LAKA 4WFBL 1ZXOA 3LM9A 3PIOL 1TKZA 4DTSA 4O8KA 1VAZA 2PY5A 3TANA 4Z4FA 3SPZA 2VWJA 4C8MA 3GL1A 4DHYA 1U49A 4B9SA 3L56A 4HHFA 2YKMA 4JI1K 4B1ZA 3KWIA 5AQFA 3NF9A 4A61A 4RWTA 3OYHA 3PV8A 3RR8A 2HHWA 3FZHA 1YTAA 2HMPA 2G2KA 1LWEA 4CI6A 1SUQA 1U45A 3AVCA 5J1EA 3VQEA 2BUPA 1B9DA 3D2EA 2HF4A 2W00A 5HRSA 1DQ7A 1D9FA 5AZJB 4B9NA 5JS2A 3QLHA 3A0IX 1R0AA 3R2VA 4ZHRA 3EL2A 1IG8A 1KXPA 2GX9A 2P9KB 4DFJA 3ENHA 4CGGA 3JYTA 5I3UA 1IH7A 2A1RA 3V81A 1VNBA 1Z26A 4CEZA 1NK9A 3QMLA 4LSLA 1TI5A 5AQHA 4E1JA 4FOIA 3KTQA 3IKMA 2HHXA 3AAPA 2HOEA 4CK2A 3JXUA 4JI8K 1BMRA 1TAQA 2AP1A 1L3TA 5FRNA 3AVKA 4OKEA 1C0GA 3QI7A 3VQ8A 4DQSA 4O4GA 2OYQA 4YOTA 2PFUA 3ENOA 4BRDA 3SQ4A 4LF8K 2B68A 1WN7A 4HHTA 4KH4A 4NXMK 3E7RL 1NGCA 1NJIO 2OZSA 3SK3A 1BISA 2PZSA 4JI0K 4DU3A 2LY5A 4I9LA 4H5WA 4R5PA 1B9FA 3ULEA 3CI5A 4AHVA 2YIOA 4AAZA 2P9PB 2VQFK 4K25A 4FZZA 3DM2A 4HCCA 4WCEL 3ZETB 1ZYWA 2P9UA 5HRPA 3KVGA 5AFUA 3L2QA 3O4NA 3VQBA 4CZFA 4JD2A 3HT3A 4CZHA 1J5OA 1ZUTA 4ILGB 2KBKA 3VEYA 3QIOA 1EWRA 4IBNA 2O8DB 2X6SA 2FSNA 5J2MA 1QSLA 2OPRA 3TPQA 4B9MA 4H5VA 4JI2K 4CIFA 5F2RA 4PHTX 1BUPA 3GG4A 5BRFA 4H0YB 2KFNA 3T7ZA 5GAHP 4RW4A 4ZTJA 2G8VA 1NM1A 1JXBA 4K42A 1VSHA 2W6LA 1ASWA 4O8UA 4J8FA 1W7AA 3QEWA 5EU7A 1NMDA 3ITHA 3LDLA 3K2PA 2YNFA 1ICAA 4JV5K 3ZSYA 5AQZA 4YDUC 3R3LA 3NMUA 1BCGA 3MN7A 4NO7A 4KRFA 2ASOA 1YVUA 5HRNA 4B1XB 3MAQA 4OPAA 3LPTA 4IEIA 3VF4A 3LDPA 4DG1A 1RDAA 2ATQA 4CW7B 4CHPA 5C10A 3QERA 4YY3K 4ISGA 3W0LA 3L4QA 1ATNA 3J7YP 1GLJO 4C8KA 1QZ5A 3KHYA 4FJKA 1JKZA 5KGWA 4BC2A 1VQON 3A2FA 3O4WA 3C0BA 4CGFA 4FVUA 1T6DA 1KLNA 4Z4HA 3VENA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 1E3M A;  4PKH A;  3H1Q A;  1NOZ A;  4FZY A;  3AA3 A;  1S6Q A;  3W3D A;  4FWL A;  3AO5 A;  3G6E N;  1EXQ A;  2HVH A;  2ZQB A;  4PL8 A;  4JKG B;  2AA4 A;  3J80 O;  3V1Q A;  2NRH A;  2XY7 A;  4FM2 A;  3A5M C;  5HOO A;  3OYN A;  4DSF A;  1HNV A;  1SAZ A;  1C6V A;  2Q0U A;  3AA5 X;  3SV3 A;  3ZSO A;  2OTL N;  2IIR A;  4KRE A;  4C8N A;  3CC7 N;  2P9P A;  3THX B;  3NGZ A;  4JNE A;  1BI4 B;  2FBV A;  3ZET A;  4WFN L;  4OLB A;  3OYJ A;  4E19 A;  4CJT A;  3OYG A;  4JI6 K;  3TAB A;  2BAN A;  1L4V A;  3HM9 A;  2ZM6 K;  4Q5V A;  5I42 A;  4IFE A;  3OYE A;  4KHP K;  2YEO A;  3UKR B;  1L5U A;  3CJ1 A;  3WXI A;  3OBW A;  2IVO A;  4MQ3 A;  2RPI A;  1XHZ A;  1WLJ A;  2B4J A;  4CHO A;  4BRL A;  2YHY A;  2P9L A;  4CJ4 A;  2OPQ A;  3HM8 A;  1V4T A;  1D4X A;  3CCE N;  1QVG M;  4CQK A;  4CJK A;  3CD6 N;  1E4G T;  3L2V A;  3ZSR A;  1XI1 A;  1KCF A;  3L2U A;  2PBD A;  1YIJ N;  4DFK A;  3I33 A;  4GKJ K;  4FM0 A;  3O1W A;  3VOV A;  4C8O A;  1N8R O;  4FJX A;  4CD3 A;  1RGI A;  1HPZ A;  3SPY A;  1BO5 O;  4FJG A;  4CJR A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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