5AQJA

Fragment-based screening of hsp70 sheds light on the functional role of atp-binding site residues
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
381
structure length
381
Chain Sequence
MSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Chaperone
molecule keywords HEAT SHOCK COGNATE 71 KDA PROTEIN
publication title A fragment-based approach applied to a highly flexible target: Insights and challenges towards the inhibition of HSP70 isoforms.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 122
structure length 381
sequence length 381
chains with identical sequence C, E
ec nomenclature ec 3.6.3.51: Transferred entry: 7.4.2.3.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5aqjA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqjA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqjA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5aqjA04
1V4TA 3RSEB 1T6CA 3UE5A 4CZJA 3CETA 4BRMA 1Q18A 2E2NA 1JCGA 2GUPA 4JHDA 1GLJO 1T6DA 4BVOA 2Q97A 1NBWA 3U9ZA 3O5BA 2QWOA 2IVNA 5I9EB 3UKRB 2VWBA 1NGFA 1T44A 4M7XA 1QHAA 3AAQA 3GOIA 4EIAA 5AQOA 3CIPA 2YJEA 3HI0A 3GG4A 2J4RA 5AQXA 2E1ZA 5KPTA 2A5XA 2HOEA 2V7ZA 1H1VA 2D4WA 2QWNA 3KHYA 1NWKA 2E2QA 3U4LA 5EVZA 3CQXA 2Q0RA 2V51B 3QBWA 4BGAA 3DJCA 4H5TA 5BPNA 4K25A 3WQTA 4H0TB 4BGBA 4BQLA 2CGLA 5AQHA 4BRNA 1XQSC 1NGEA 4JN4A 2FSKA 2YHXA 5AQVA 5F1XA 1C0GA 3O1BA 5AQYA 1Y64A 4A62A 3WXIA 4B1ZA 3AARA 4FWNA 3VF4A 3IFRA 4BVPA 5FPEA 4WQ5C 4BQZA 4CZEA 1WUAA 3UKUA 2E20A 2ZF5O 3KVGA 4JNEA 3B8AX 2YHYA 2BUPA 3UB5A 4RWTA 1NGHA 1YUWA 3D2EA 5AQIA 5AQJA 1X9JA 2IVOA 3H3NO 5JLHA 4B1VA 2E8AA 4C23A 4CBXA 2NRHA 1NGJA 2D0PA 4FWLA 1V4SA 4EHUA 3M1FA 1HLUA 4BC4A 4EFHA 1DGKN 4FWRA 4WQ4C 4IO8A 3LDLA 3VETA 4BRGA 3ATVA 5CE3A 5AQWA 2P9IA 1P8ZA 1NGBA 4QS7A 4BRHA 5AQZA 5AQKA 3VF6A 4MLEA 5JLFA 3WXLA 5E26A 5AQNA 4M63C 4FWPA 3L4IA 3U8XA 3VEWA 2E2OA 4DHYA 2D1KA 5BPMA 5FPMA 4H5NA 1HKCA 5EX5A 4FPAA 4JD2A 4CZLA 5KPRA 3LDNA 1GLEG 2QWPA 1K8KB 4MO4A 4BRDA 5LJWA 1D4XA 2QWRA 3FZLA 3HBTA 5EXWA 4ISEA 4Y0WA 1JCFA 2FF6A 2A3ZA 4H0PA 3CQYA 4EAHD 5AQMA 3H6EA 4PL8A 3SLCA 2NZTA 4FWKA 3ZX0A 5BN8A 1E4FT 4GNIA 3SMPA 2V52B 2V7YA 3DXMB 1SQKA 2ASOA 1BA1A 1S3XA 1U6ZA 3MN6A 4QS9A 4CZFA 2P9LB 2P9KB 3HZ6A 1NGDA 4IJNA 4BRQA 5ADXH 3QBXA 1C0FA 3MN7A 1WOQA 1BO5O 2D0OA 4L3QA 5AFUA 1HPMA 3BP8A 4B9QA 5LJVA 4BR5A 4BROA 3W0LA 4BRCA 1QZ6A 4BR7A 4NO7A 5EY4A 4WQ5A 4H5VA 3M3ZA 3DAWA 3CERA 1KXPA 2E2PA 3SJHA 2QW9A 3VEYA 4ISFA 1ESVA 4BR4A 3HM8A 3QFPA 5AQRA 2P9UA 3AY9A 3WUHA 2AP1A 4MO5A 3BF3A 3VESA 4RCHA 4IJAA 1ZXOA 4CZIA 3DXKB 1BOTO 5KQDA 3GL1A 2I7NA 3R6MA 2ITMA 1SZ2A 3L6QA 3A5MC 3FZKA 1BUPA 3JXUA 1RDWX 3ZX2A 4FL9A 1GLFO 2WUSA 4FOEA 2ZWHA 1X3MA 4PL7A 1JCEA 5B8HA 4WQ4A 3CJ9A 1MWMA 4IXCA 1RFQA 2FLOA 1NGCA 3H46O 4XH5A 2P9SA 4ISGA 3H3OB 3EZWA 3L0QA 3QICA 3QDKA 1Z05A 4CBUA 4PKGA 3VGKA 3VEXA 2YCHA 3O08A 3LDOA 3O1WA 5ELZA 3F9MA 1S22A 1DEJA 2CGJA 3OHRA 1NM1A 1R59O 2EWSA 4FWOA 3D2FB 2GWJA 2P9PA 1TUUA 1NGAA 3I33A 3CJ7A 4KBOA 4IZ9A 4BRAA 2IIRA 3QMLA 2UYTA 3VGLA 4Z94A 1NGIA 1KAYA 2F9TA 4K42A 4XH1A 4CZKA 4CJ7A 1XC3A 2GEMA 5AQPA 2QWLA 2A41A 3WXJA 3LDQA 1ZBSA 4O8KA 3LM2A 5AZIB 2HF3A 2AA4A 2FSJA 4FWMA 3FZMA 3BEXA 3GE1A 2FXUA 4QS8A 2W41A 4FOIA 2GELA 3R9PA 3QB0A 3FR0A 1TYQB 4H0OA 1YXQA 5AQQA 2YJFA 2E88A 3ULEB 3W3DA 3TU5A 3O6WA 4MLHA 4CZGA 1ATNA 2GTDA 3QFUA 1GLCG 3KZBA 3ZEUA 1QQNA 5AR0A 1ZC6A 1K8KA 1U2VB 2ASMA 1J6ZA 3LM9A 3EL2A 3ZETA 1MWKA 1QZ5A 1XUPO 4A61A 4JAXA 4NB4A 1HJOA 3MDQA 3ATUA 1BG3A 3CI5A 1SAZA 3GDQA 3HSCA 1OKJA 1QQOA 4H5WA 4JD2B 4H5RA 3RSEA 4B1WB 3A0IX 2QXLA 5AQSA 4BREA 4I6MB 3DXMA 4DQ8A 1BDGA 5AZJB 2BTFA 3C7NB 3A5NC 3MN5A 2P9LA 2P9KA 3WEEB 1IG8A 3WXKA 2QWQA 1TUYA 2P9NB 1ATRA 3UKRA 3MMVA 3SMSA 1YAGA 3EO3A 5BN9A 1HKGA 2A40A 4FWSA 3VF2A 4BR2A 1ATSA 4J8FA 4FWQA 1HKBA 5LY3A 1IJJA 2CGKA 2Q36A 1Z6RA 3EKUA 3M6GA 4B1XB 5AQTA 3EKSA 3FZFA 3FLCO 4K41A 4JHDB 2F9WA 3SK3A 4LC9B 2W40A 4DB3A 2ASPA 4FSVA 2KHOA 3MCPA 3IMXA 2IVPA 4H03B 5BRHA 3CJCA 4CD3A 4DCHA 5BRDA 4BRPA 2NLXA 3DXKA 5JICA 3VGMA 4BC3A 1NLVA 4AM6A 2QWMA 3C0BA 5F2RA 4XH4A 1NGGA 3H1VX 4F9OA 3IDHA 2Q0UA 3O80A 5ADXA 1EQYA 4H0VB 3MK6A 4AM7A 4BRIA 3VERA 3U9DA 3H45C 2FF3B 4GY2B 4XEIA 2ZGYA 3G25A 4YDUA 4HTLA 2P9UB 5AQUA 3A5OC 3JS6A 3TPQA 4BRLA 1GLBG 3MN9A 4BR0A 4EHTA 2Q31A 4BC5A 2GWKA 1LOTB 2CH6A 3CHWA 3VENA 4CI6A 3HTVA 1LCUA 2CH5A 3D2FA 3VPZA 5FPNA 5BR9A 2OANA 3ENOA 1YVNA 3VEVA 2P9SB 4RTFD 3GBTA 5EOYA 1X3NA 5TKYA 4FO0A 3UKUB 2HMPA 3ID8A 4BR9A 3LL3A 2PAVA 3FE1A 3A5LC 3D7EO 4H0XB 3CJAA 4A2BA 3BUZB 2YHWA 3D2EB 3R8EA 5BREA 5AZIA 4BC2A 4YDUC 2QM1A 4IWVA 4B1YB 5AQLA 2VCPA 2A42A 1GLAG 3I8BA 3FFKB 2P9PB 2Q2RA 3A8YA 2ZGZA 3J8AA 5AQGA 1BU6O 3FZHA 5F0XA 1QQMA 3IUCA 2I7PA 1TYQA 2DPNA 3CJBA 3O8MA 3S41A 4CZHA 3ULEA 5KQ8A 3CJ1A 3VEZA 3P4IA 4B1UB 2P9IB 2HF4A 4PKHA 1MDUB 4O5FA 5E84A 4HWIA 4CZMA 5JMVA 3WQUA 4A2AA 3FGUA 4CBWA 2E1YA 3DWLA 1U2VA 4E1JA 2H3GX 5FPDA 3BF1A 3LDPA 2VYPA 1HX1A 3ZX3A 3ENHA 3AAPA 1BA0A 1CZAN 4BG9A 1RGIA 4BRFA 4BRKA 3EN9A 4FPBA 1MA9B 2FSNA 3WT0A 3VOVA 1HUXA 2A6AA 5KPZA 2YI1A 4H0YB 3ZEUB 4I6MA 1BWFO 3H1QA 5AFUH 4WYBA 5AZJA 4K43A 4M7YA 4PKIA 1NMDA 3C7NA 5AQFA 3VEOA 3O4WA 3WEEA 4CD1A 2Q1NA 1KAZA 1G99A 3ZETB 2P9NA 5BRFA 2PBDA 1GLLO 1GLDG 1DKGD 4BG8A 1KAXA 1E4GT 5BPLA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3KLEA 5M1FA 3RSEB 3M8RA 5I3UA 1OH8A 4CJQA 1T7EA 3LP1A 4BRMA 4DSKA 2E2NA 4JHDA 1XHZA 2YKNA 1T6DA 3MX5A 3CCSN 1NBWA 3O5BA 1LAWA 3SUNA 1NGFA 1RT7A 3AAQA 1BCMA 3L4QA 2WC9A 4JKHA 3CIPA 5C24A 3KD5E 3GG4A 4DTRA 2FBXA 3DRSA 4OJRA 3DRPA 3CCEN 2A5XA 4HE7A 5HL7L 4NXNK 3OTOK 4CEZA 2Q0RA 4OPHA 1N33K 1JL2A 4K25A 1O13A 4DFMA 1Q9YA 1AYJA 4BGBA 2G8KA 1RDCA 5JVGL 5CZ1A 2G8VA 1RBRA 2Z1JA 3O4QA 3J81O 2G8HA 4O44A 2FSKA 4HCCA 4JI4K 1IBLK 1OVQA 1T1TA 3CC7N 1XRSB 2ATQA 3V4IA 4B1ZA 3UIQA 2MZ0A 2NRXA 3V1OA 4JK8A 4U7BA 2ZJRL 3GKUA 3IFRA 3ASMA 1VQMN 4WQ5C 1N6QA 3O9RA 4F3OA 1VRTA 4AILC 3G6EN 3SZ2A 3SNNA 4JNEA 3TABA 1P90A 2YKMA 3C6HA 1KVAA 3SQ2A 2BUPA 2JDQD 2A1SA 4RW9A 4CHYA 3UB5A 1NJXA 4FJXA 3AA2A 4V19S 4CF1A 2D0CA 5BR8K 2VGMA 3KLFA 2E6LA 1PTXA 2BH1A 3L3UA 1U45A 4JKEA 2E8AA 1XMQK 3CG7A 1NGJA 3LPUA 4FJJA 1D9FA 4FWLA 1V4SA 3VQ4A 4LY7A 1YJNN 4EFHA 1DGKN 1WMTA 4IO8A 4FLXA 2LJMA 3AVKA 3LDLA 4DSFA 4ILGB 2P9IA 4BRHA 3DI6A 1YIJN 3ZSYA 3G71N 3L2VA 2JWKA 1B9FA 2KW4A 3AO4A 3M5RA 4IFVA 3PLAA 2NRTA 5E26A 4KAZA 3NF9A 4M63C 5FLXO 1LQHA 2W6KA 1MR4A 5J2PA 3QEPA 3MEDA 3KKRA 2N69A 5HROA 4FPAA 4DG1A 3CXCM 3RTVA 4JD2A 4E89A 5KPRA 2NRRA 3LDNA 2P5GA 3E01A 2QWPA 1E3MA 4JK7A 1YJWN 1IBKK 2JLEA 3LANA 1S1TA 1BCOA 5LJWA 3FZLA 1JXBA 3HBTA 5EXWA 2FF6A 2A3ZA 3OS0A 3CQYA 3D0PA 5AQMA 3MECA 4X66K 3OYHA 4XIUA 1IKYA 4FWKA 4LH5A 2B4JA 3OVNA 4O0IA 3SMPA 4CEEA 4GKKK 3TAFA 2V7YA 2XY5A 4B9SA 2XY7A 2ASOA 3ZT2A 4CGGA 1S3XA 1LWCA 3KIOA 4CJPA 4C1NK 2P9LB 2P9KB 4DV4K 4GMJB 1SKSA 1QVGM 3DOKA 1KFSA 3HL8A 3V9XA 3K5NA 1BO5O 5AFUA 3BP8A 3S9HA 4KHNA 4BR5A 4BROA 4BDZA 4FJMA 2OYQA 4CJVA 5KRSA 2VQEK 3DYAA 4DTOA 1OH6A 5M1QA 3K5MA 3SJHA 2QW9A 1ZBFA 3OYBA 3VEYA 1TV6A 4ISFA 1ESVA 1C1AA 4BR4A 4OPKA 3MEEA 3QFPA 3AVJA 2UXCK 4YFUA 3BF3A 2RN2A 2D0BA 3THXA 2I7NA 3R6MA 1SL2A 1T3VA 2HHHK 4FL9A 1GLFO 2WUSA 4NLBA 1X3MA 2ETJA 5J2QA 3LALA 1W9HA 2FLOA 4M3TA 2LY5A 1ILYA 3H3OB 3L0QA 2XRIA 3QDKA 4ZTJA 4CBUA 3LAMA 2ZJQL 3ZT4A 3OYEA 2YIPA 3HT3A 1HPZA 3VEXA 1VQ4N 2KBJA 3O08A 2QA4N 5GADP 1VQ6N 5C10A 3F9MA 1S22A 4FWOA 2EWSA 3D2FB 3AVCA 1WN7A 1TUUA 3L8BA 1NGAA 3I33A 3CJ7A 1WB9A 3QEWA 4BRAA 2PYJA 1W0HA 4FK0A 3HJFA 3VGLA 1KFDA 4N5SA 4Z94A 4BECA 3OY9A 4K42A 1UOCA 1SN4A 2GEMA 3O9SA 3LDQA 4O8KA 1ASUA 2SN3A 4FJKA 5AZIB 1HQEA 3QO9A 3HM9A 4CF9A 2P1JA 2FSJA 4FWMA 2IDOA 4H8KA 4CJFA 1JLAA 4E7JA 1DJTA 5KRTA 2IAJA 1C55A 2X74A 4H0OA 4DV2K 3CW4A 3VQ8A 4RG8A 4B3RK 1C1BA 5TKWA 3O3GA 2A7TA 1HNXK 4JKGA 2GMOA 2YNIA 3WNEA 1GLCG 1LQQA 1TL1A 4Z4CA 1KQSM 3AVFA 2KGQA 3AA4A 1A5WA 1LW0A 2YC1C 1EP4A 3RR7A 3DLKA 3IG1A 1SUQA 2NUBA 1T0ZA 1HYVA 1TAQA 4JD2B 3K58A 2VQFK 3KD1E 5AQSA 2LN8A 1L3TA 4DQ8A 3ZSXA 2XHBA 4X65K 4LF4K 1HJRA 1WLJA 2IC3A 3WEEB 3WXKA 2QWQA 4CERA 2QKKA 2UUCK 5E41A 3VQ6A 1G15A 3P5JA 3EO3A 4LFAK 4CJ5A 4UY8O 2O4IA 1BQMA 3VF2A 2WFBA 2YNFA 2D56A 1BIZA 1HKBA 1Z6RA 2UXBK 1KVBA 4LF8K 1L4VA 3FLCO 4K41A 5GIPA 5SWMA 1GOAA 4IG0A 4PA1A 4L8RB 4CD3A 3C6AA 4I7FA 4DCHA 4BRPA 4BC3A 3T19A 4AM6A 3C0BA 4IOAL 4OGCA 4AHUA 4XH4A 1FH3A 3O80A 4H0VB 3PSMA 2WBNA 1IO2A 2FF3B 2ATBA 2KKZA 3G25A 3VQAA 4HTLA 3E9PA 4NYFA 3JS6A 1L5UA 3MN9A 3THXB 3TSQA 2HMIA 3RRHA 2LR3A 3KOXA 2CH6A 3CHWA 4LD0A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 3KLE A;  5M1F A;  3RSE B;  3M8R A;  5I3U A;  1OH8 A;  4CJQ A;  1T7E A;  3LP1 A;  4BRM A;  4DSK A;  2E2N A;  4JHD A;  1XHZ A;  2YKN A;  1T6D A;  3MX5 A;  3CCS N;  1NBW A;  3O5B A;  1LAW A;  3SUN A;  1NGF A;  1RT7 A;  3AAQ A;  1BCM A;  3L4Q A;  2WC9 A;  4JKH A;  3CIP A;  5C24 A;  3KD5 E;  3GG4 A;  4DTR A;  2FBX A;  3DRS A;  4OJR A;  3DRP A;  3CCE N;  2A5X A;  4HE7 A;  5HL7 L;  4NXN K;  3OTO K;  4CEZ A;  2Q0R A;  4OPH A;  1N33 K;  1JL2 A;  4K25 A;  1O13 A;  4DFM A;  1Q9Y A;  1AYJ A;  4BGB A;  2G8K A;  1RDC A;  5JVG L;  5CZ1 A;  2G8V A;  1RBR A;  2Z1J A;  3O4Q A;  3J81 O;  2G8H A;  4O44 A;  2FSK A;  4HCC A;  4JI4 K;  1IBL K;  1OVQ A;  1T1T A;  3CC7 N;  1XRS B;  2ATQ A;  3V4I A;  4B1Z A;  3UIQ A;  2MZ0 A;  2NRX A;  3V1O A;  4JK8 A;  4U7B A;  2ZJR L;  3GKU A;  3IFR A;  3ASM A;  1VQM N;  4WQ5 C;  1N6Q A;  3O9R A;  4F3O A;  1VRT A;  4AIL C;  3G6E N;  3SZ2 A;  3SNN A;  4JNE A;  3TAB A;  1P90 A;  2YKM A;  3C6H A;  1KVA A;  3SQ2 A;  2BUP A;  2JDQ D;  2A1S A;  4RW9 A;  4CHY A;  3UB5 A;  1NJX A;  4FJX A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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