5AQKA

Fragment-based screening of hsp70 sheds light on the functional role of atp-binding site residues
Total Genus 121
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
121
sequence length
378
structure length
378
Chain Sequence
GPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title A fragment-based approach applied to a highly flexible target: Insights and challenges towards the inhibition of HSP70 isoforms.
pubmed doi rcsb
molecule keywords HEAT SHOCK COGNATE 71 KDA PROTEIN
molecule tags Chaperone
source organism Homo sapiens
total genus 121
structure length 378
sequence length 378
ec nomenclature ec 3.6.3.51: Transferred entry: 7.4.2.3.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5aqkA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqkA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqkA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5aqkA04
2YHYA 3QFPA 1SZ2A 3A5NC 4K41A 1NMDA 3FE1A 3BEXA 3QBXA 4HTLA 3KHYA 2QW9A 2QWNA 5JMVA 5AQRA 3SJHA 1E4FT 3A0IX 3HZ6A 1WUAA 3U9DA 1YXQA 4BG9A 1Y64A 4CZGA 3LL3A 5AQYA 5AQZA 3CJCA 3GG4A 1MWKA 3IFRA 3WQUA 4EAHD 5BN9A 4BRCA 2ASMA 3DXKB 2ASPA 4DQ8A 3MCPA 4BRGA 5AQNA 5AQMA 3MN5A 3SMSA 1G99A 2GTDA 4I6MB 4QS8A 3H3OB 1KAYA 3QBWA 3WQTA 2BTFA 2KHOA 3LDQA 4I6MA 5AZIB 2WUSA 3L6QA 1X3MA 3CQXA 4FWSA 3G25A 2P9SB 4CBWA 1HKCA 4H0OA 5AZIA 1BA1A 2CH6A 2DPNA 1TUYA 3IDHA 4WYBA 5KPTA 1SAZA 2QWLA 1XUPO 2E2PA 5AZJB 2H3GX 3UKRA 4FOEA 5I9EB 5F0XA 3GE1A 4JN4A 1NGEA 1JCGA 4LC9B 1V4SA 4JNEA 2QWRA 4BRLA 1YVNA 1NGCA 1NGAA 4RTFD 3IUCA 2P9IB 4RCHA 3ENOA 4CI6A 4PL7A 2EWSA 3EKUA 2YCHA 4O8KA 5KPZA 3D2FB 3DAWA 3ZETA 2E8AA 1HKGA 1BG3A 4JD2B 3BUZB 4A2BA 2P9UB 2W41A 2D0OA 1DEJA 3AY9A 3ZEUA 1QQOA 3FZKA 2I7NA 4JD2A 4H5RA 2P9UA 4MO4A 2ZF5O 4M7YA 2GUPA 1TYQB 4CZJA 5ADXH 5E26A 4B1WB 1E4GT 4MLEA 4A61A 5F2RA 3QMLA 4KBOA 3ATVA 2P9KA 1TYQA 4BG8A 4WQ4A 4BR0A 3UKUB 1NGDA 4CBXA 3VF2A 4DB3A 1C0GA 3VERA 3H6EA 3FZLA 5EX5A 2E1YA 5TKYA 2P9LB 3UKUA 3MK6A 4BC3A 2YJEA 4XH4A 4MLHA 4FSVA 2J4RA 4BQZA 3O1WA 2NZTA 3QICA 1J6ZA 3WEEB 1GLJO 2FSKA 4H5WA 3CJBA 3WEEA 5AQKA 2GWJA 2QWQA 5BRHA 1T44A 3VGKA 3H3NO 3W3DA 4PKIA 4CZMA 1QQNA 3W0LA 1ZC6A 2ITMA 1D4XA 3CI5A 1GLAG 4H03B 3WXIA 3C0BA 5AQPA 2YI1A 4FWNA 2BUPA 4FWKA 4BC2A 4BRAA 2QXLA 3MMVA 3EN9A 3C7NA 4A2AA 5AQOA 5BPLA 1T6CA 2Q97A 4NO7A 3DJCA 4BR7A 2FLOA 4HWIA 4BR9A 4EHTA 1CZAN 2F9TA 3A5MC 3CERA 5AQFA 3ZX0A 3VPZA 1DGKN 1Q18A 3LDOA 1BWFO 3O1BA 2E88A 2A41A 2VCPA 3VEZA 3O8MA 3SLCA 1LCUA 3TPQA 1KAXA 1ZBSA 3R8EA 4BGAA 3FR0A 4BQLA 5FPEA 2Q2RA 5FPDA 3VGLA 4K43A 3VEWA 2P9NB 2E2OA 3ATUA 4BRDA 3L4IA 3DXKA 3VENA 3FZFA 4BGBA 4H0PA 2A3ZA 2YJFA 4GNIA 5AQTA 1T6DA 1TUUA 3H45C 3AAPA 4FO0A 3GL1A 2YHXA 4BRQA 3CIPA 5AQHA 5AQQA 2QM1A 1IG8A 1S3XA 5AR0A 2P9SA 2IVOA 4CD1A 3U9ZA 1R59O 5ADXA 1YUWA 3VEXA 4H0YB 4FL9A 4CBUA 4BR2A 1NLVA 1NM1A 4FPBA 5AZJA 4BRFA 4BROA 3ID8A 4CZIA 3H46O 4B1XB 2Q0RA 2V51B 1IJJA 5AQLA 3QDKA 1U6ZA 2Q1NA 3I8BA 3AARA 3M6GA 2P9IA 1YAGA 2VYPA 2AP1A 3JXUA 3I33A 3HTVA 1BDGA 4GY2B 3KVGA 4PL8A 4FWQA 3D2FA 5LJVA 1QQMA 3CQYA 2E1ZA 4PKHA 3U4LA 3MDQA 4BRMA 3FZHA 2ZWHA 1BUPA 5AFUH 5AQWA 3M3ZA 1V4TA 1BOTO 2ZGZA 3J8AA 2HMPA 2HF3A 4WQ5A 5BPNA 3R6MA 3VEOA 3B8AX 3O08A 5JLFA 4IJNA 5JICA 3H1VX 3DWLA 4M63C 3CJ9A 3QB0A 3RSEB 4CD3A 1BU6O 3MN9A 4XH1A 5AQJA 1K8KB 4BVOA 1GLBG 1X3NA 3DXMB 4IJAA 4CZKA 2P9LA 3WXKA 1DKGD 3BP8A 1ATSA 2GWKA 3D2EB 5AQIA 1K8KA 2CH5A 3SK3A 2HF4A 4BREA 4F9OA 3WXLA 3FLCO 3ZX2A 4AM7A 4JHDB 4BR5A 1S22A 4XH5A 2VWBA 3D2EA 1KAZA 4BC4A 3GDQA 1HLUA 4WQ5C 4NB4A 1U2VB 4H5NA 4WQ4C 3ULEB 2FF6A 3OHRA 4H0VB 1RGIA 1XQSC 1U2VA 4FWLA 5BR9A 4CZLA 5E84A 5EXWA 3FGUA 2D4WA 4B1VA 1BA0A 1BO5O 3EL2A 4CZEA 3EKSA 3WT0A 4BC5A 4H5TA 2V7ZA 2I7PA 4Y0WA 4B9QA 1WOQA 4DHYA 2D1KA 1RDWX 3QFUA 3CJ7A 1NGFA 3GBTA 3VGMA 2A6AA 2P9PB 2A42A 4IXCA 3BF1A 4EFHA 1MWMA 3LM9A 5BPMA 2CGKA 4CZFA 3MN7A 2P9PA 2A40A 4L3QA 5LJWA 4YDUA 5AQUA 1HKBA 5CE3A 4MO5A 1KXPA 3VEYA 1XC3A 3HBTA 4FWMA 4JAXA 5ELZA 3VF4A 4FWPA 5F1XA 3H1QA 5BREA 2W40A 4EIAA 2NLXA 1RFQA 3M1FA 4H5VA 2QWOA 4ISGA 2UYTA 2P9NA 3F9MA 4CZHA 4K25A 4BRKA 5B8HA 5KQDA 2CGJA 1GLEG 4FWOA 1OKJA 3JS6A 3UB5A 4B1ZA 1Z6RA 4BVPA 2YHWA 5AFUA 4BRHA 2AA4A 3L0QA 1EQYA 1NBWA 2NRHA 4FWRA 4YDUC 1LOTB 2IVPA 1NGGA 3IMXA 4BRNA 3AAQA 5BRDA 4IWVA 2E2NA 3EO3A 2D0PA 2OANA 3VESA 4DCHA 1MA9B 2V7YA 4BR4A 3EZWA 4QS9A 4BRPA 2Q36A 5JLHA 5AQGA 3UKRB 3GOIA 4J8FA 2GELA 4E1JA 2QWPA 3A5OC 3UE5A 3R9PA 2Q0UA 4Z94A 1GLDG 1GLFO 3A5LC 5BRFA 3P4IA 1P8ZA 3ZETB 5FPMA 3FZMA 2ASOA 2V52B 1ATNA 2ZGYA 4C23A 5LY3A 3MN6A 3O6WA 1QZ6A 3HM8A 3ZEUB 3VOVA 3O5BA 1ESVA 3O4WA 2FSNA 3CJ1A 3A8YA 4ISFA 1H1VA 3VEVA 1NWKA 1NGIA 1QZ5A 4K42A 2Q31A 3HI0A 3VF6A 2A5XA 2FSJA 4FPAA 3S41A 2FXUA 3U8XA 4ISEA 2P9KB 4H0TB 1MDUB 3CJAA 3RSEA 1X9JA 4BRIA 4FOIA 1ATRA 1ZXOA 1QHAA 1HPMA 2IIRA 4B1YB 3DXMA 1NGJA 5AQVA 4IO8A 3LDNA 1SQKA 2PAVA 5EY4A 1Z05A 1GLCG 4PKGA 4O5FA 3D7EO 4JHDA 4H0XB 1HUXA 2E20A 3FFKB 3ZX3A 5AQSA 2PBDA 5KQ8A 1HJOA 3ULEA 5KPRA 1C0FA 4A62A 3CETA 3HSCA 2F9WA 1NGHA 2E2QA 3WXJA 3SMPA 3LDPA 3BF3A 1JCEA 1HX1A 1JCFA 5EOYA 5EVZA 3CHWA 2QWMA 1GLLO 4AM6A 3KZBA 3TU5A 5BN8A 3O80A 1NGBA 3ENHA 2CGLA 4M7XA 4B1UB 4QS7A 5FPNA 3WUHA 2HOEA 2GEMA 4EHUA 4RWTA 2IVNA 5AQXA 3LDLA 3C7NB 4CJ7A 2FF3B 3VETA 4XEIA 4IZ9A 3LM2A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3A5NC 4A57A 4NXNK 1NMDA 3K9KA 3SNNA 3V1QA 2QWNA 5AQRA 1E4FT 4E1MA 3A0IX 3LAMA 4CHNA 3TR8A 4XJXA 1YXQA 3EE8A 5AQZA 2LY5A 3RMBA 3CFRA 3IFRA 2PYJA 4F2SA 4CHYA 5JENA 4BRCA 4KHWA 1XHZA 3MX5A 3KTQA 4BRGA 1RBRA 5AQNA 5AQMA 3SMSA 2GTDA 4I6MB 2O8CA 3H3OB 1KAYA 2RF2A 1W2BM 2BTFA 3OYLA 2KHOA 1GPTA 1KVBA 4CESA 1S1TA 4F3OA 2YKMA 4FLVA 2DPNA 1HYVA 2VG6A 3CC2N 1XUPO 2YC1C 3OBYA 1S9EA 2H3GX 4DTUA 4DF4A 4H4MA 4NCGA 5F0XA 4JN4A 4CHOA 4QCLA 1FW6A 3DLLL 2XY7A 5C42A 3QEPA 1XWLA 4DSEA 1T8EA 4FJ5A 1BI4B 3SBTA 3ENOA 3EKUA 4C8LA 3KLHA 3TTFA 1YIJN 3ZETA 2G8UA 5TKWA 3NFAA 3HP9A 2QEXN 2YNHA 4B08A 1DEJA 1GOAA 3S3OA 4HCBA 4JD2A 3J81O 4DV7K 4FLZA 4JRQA 4MO4A 1QTMA 2ZF5O 4K0KK 1IKYA 3ENBA 3PV8A 1N34K 4FJ8A 1WSGA 5ADXH 3L3VA 4MLEA 4A61A 3CW4A 5F2RA 3NH1A 2HVIA 3SF4D 1EO1A 3KOZA 4H8KA 4CBXA 3RTVA 3DLBA 1NKCA 1TAUA 2P5GA 2E1YA 5I3UA 2P9LB 3CYGA 1VSIA 5CZ2A 1ZBFA 4XH4A 4CGHA 4FSVA 1LWFA 3AVKA 3O1WA 2B6AA 1KD1O 1J6ZA 3G4SN 2FSKA 4JS5A 2YNFA 1N33K 4K8XA 3ITHA 4B8AB 1ASWA 2Z1HA 2D0CA 1T44A 1TKDA 3VGKA 4Z4IA 1QQNA 2LR3A 4CF2A 4FJXA 1RTIA 3CI5A 2YV0X 4DS4A 1W9HA 4H03B 1JXEA 5C2DA 3RMAA 2F7TA 3VQ4A 2YI1A 4FWNA 4FWKA 4DSLA 3C7NA 3U3GA 2W42A 1T6CA 1TK0A 3DJCA 2NY8X 4B9TA 4I2QA 3A5MC 2F9TA 2RN2A 1PX9A 4C1NK 2HHIA 3FFIA 4KTWA 3K5NA 1Q18A 2B3CA 3DRSA 1J5OA 3O1BA 4DLEA 2E88A 3OYAA 2VCPA 3HRGA 1U49A 4KAZA 2GX9A 3O8MA 1LCUA 3TPQA 2OA8A 1ZBSA 2HBJA 3MWTA 3R8EA 4BGAA 4BQLA 4CFCA 4DQSA 1VQ8N 1NK9A 2ZJPL 3KOWA 4JLHA 3CXCM 2X78A 4IO9L 1K6YA 3DOKA 2O8BB 3ZYYX 4JKGA 4GNIA 1NJXA 4Z4GA 4ID1A 4YORA 5H1SQ 1ASUA 3TI0A 1RDCA 4JYAK 5AQQA 3KK1A 4CECA 2IVOA 4O0JA 3U9ZA 1RBUA 3VEXA 4K8ZA 2IS3A 1NLVA 1NM1A 4GV3A 4B9LA 3THXB 3ID8A 3SUQA 4B1XB 2Q0RA 3NF7A 2V51B 4J2BA 1N6QA 4DR1K 1TKTA 3I8BA 1LQIA 1BI4A 1Q81O 5HL7L 4RW6A 2WONA 2X6NA 4U67L 3OBWA 4Y1DA 3KIOA 3MEEA 4PKHA 4AQYK 4HCCA 2ZWHA 1V4TA 2OCEA 5IWAK 2E6MA 4IDKA 3V9XA 2KPYA 2HMPA 4DR6K 1YITN 5BPNA 3KC6A 2WOMA 4BDYA 1L3VA 2N69A 5JICA 3LALA 3VQ5A 2HHUA 3RSEB 3MN9A 5AQJA 4LFCK 1GLBG 2KYQA 1X3NA 4IJAA 2P9LA 1Q7YO 1YHQN 3QERA 4KHQA 3VQ9A 3BP8A 3SAHA 2G8KA 2ATBA 2CH5A 3SK3A 1ASVA 2HF4A 3FLCO 3B6PA 3MECA 4DR7K 4CEAA 3TAMA 3VQDA 1KRPA 4CFDA 1WBDA 4DV5K 3CMEN 3LWLA 1NOYA 3O4QA 1NK6A 4H5NA 2FBYA 1XQSC 4GKKK 1U2VA 5BR9A 3OYBA 4KB0A 4KH4A 1YTUA 1BA0A 3V1OA 4CJUA 4H5TA 5C10A 1NPIA 2I7PA 1VSHA 5IT9O 4JEPA 2AJQA 4YOVA 2A6AA 1YF5L 3IKMA 1ZVGA 2MN5A 2P9PB 3EZ5A 3KKRA 4JK8A 4LY7A 3PO5A 2PFUA 4DV3K 4L3QA 3I0SA 5M1OA 4YDUA 2RPIA 4A5BA 1XC3A 4BY9C 4JAXA 4N5SA 4CHZA 1HR0K 2W40A 3JSMA 3L4QA 3V9ZA 2RE2A 2RHKA 5HRSA 4WE1A 4CEQA 4LH5A 4CZHA 2O8BA 5KQDA 2CGJA 2GV9A 1GLEG 4FWOA 3JS6A 2BE2A 1CHZA 1NOZA 1M90O 4PWDA 5AFUA 4FJHA 2ZJRL 3V9WA 1NBWA 4FWRA 3WNFA 4YDUC 2UXBK 1GOBA 1LOTB 1J9AA 3CFOA 3AAQA 4B3RK 3MXIA 4CF8A 2NRRA 4IBNA 4FJLA 3VESA 4DCHA 2E3FA 3OA9A 3THXA 4BRPA 1JLAA 3AA4A 3CCRN 4J8FA 4DV2K 3HPOA 3QNOA 4CW7B 2ITGA 1NRAA 1RTJA 4E1JA 4L8RB 2QWPA 3UE5A 3O9RA 3R9PA 3T3FA 1VQ6N 1FK9A 1UA0A 5DK5A 5BRFA 3P4IA 1U4BA 4OVLA 3FZMA 3CG7A 3O3GA 5LY3A 3KLIA 1KCFA 1KLNA 4FM0A 1OH6A 3VOVA 3E01A 1ESVA 3F2KA 4GVEA 2FSNA 1UOCA 1TL1A 1NWKA 3HI0A 2VWKA 3OTOK 2FSJA 2VWJA 4IEIA 4H0TB 2HNYA 3RSEA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3A5N C;  4A57 A;  4NXN K;  1NMD A;  3K9K A;  3SNN A;  3V1Q A;  2QWN A;  5AQR A;  1E4F T;  4E1M A;  3A0I X;  3LAM A;  4CHN A;  3TR8 A;  4XJX A;  1YXQ A;  3EE8 A;  5AQZ A;  2LY5 A;  3RMB A;  3CFR A;  3IFR A;  2PYJ A;  4F2S A;  4CHY A;  5JEN A;  4BRC A;  4KHW A;  1XHZ A;  3MX5 A;  3KTQ A;  4BRG A;  1RBR A;  5AQN A;  5AQM A;  3SMS A;  2GTD A;  4I6M B;  2O8C A;  3H3O B;  1KAY A;  2RF2 A;  1W2B M;  2BTF A;  3OYL A;  2KHO A;  1GPT A;  1KVB A;  4CES A;  1S1T A;  4F3O A;  2YKM A;  4FLV A;  2DPN A;  1HYV A;  2VG6 A;  3CC2 N;  1XUP O;  2YC1 C;  3OBY A;  1S9E A;  2H3G X;  4DTU A;  4DF4 A;  4H4M A;  4NCG A;  5F0X A;  4JN4 A;  4CHO A;  4QCL A;  1FW6 A;  3DLL L;  2XY7 A;  5C42 A;  3QEP A;  1XWL A;  4DSE A;  1T8E A;  4FJ5 A;  1BI4 B;  3SBT A;  3ENO A;  3EKU A;  4C8L A;  3KLH A;  3TTF A;  1YIJ N;  3ZET A;  2G8U A;  5TKW A;  3NFA A;  3HP9 A;  2QEX N;  2YNH A;  4B08 A;  1DEJ A;  1GOA A;  3S3O A;  4HCB A;  4JD2 A;  3J81 O;  4DV7 K;  4FLZ A;  4JRQ A;  4MO4 A;  1QTM A;  2ZF5 O;  4K0K K;  1IKY A;  3ENB A;  3PV8 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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