5AQKA

Fragment-based screening of hsp70 sheds light on the functional role of atp-binding site residues
Total Genus 121
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
121
sequence length
378
structure length
378
Chain Sequence
GPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Chaperone
molecule keywords HEAT SHOCK COGNATE 71 KDA PROTEIN
publication title A fragment-based approach applied to a highly flexible target: Insights and challenges towards the inhibition of HSP70 isoforms.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 121
structure length 378
sequence length 378
ec nomenclature ec 3.6.3.51: Transferred entry: 7.4.2.3.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5aqkA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqkA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqkA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5aqkA04
3O4WA 2GEMA 3J8AA 2AA4A 3H3NO 1ZBSA 2CGJA 2A5XA 3DAWA 4BRGA 1NMDA 5AFUA 3HI0A 4BRHA 2ZWHA 1MA9B 1MWKA 2CH6A 4IJNA 3VEOA 1GLAG 3KHYA 3VF2A 4H5RA 4FWRA 1OKJA 3JS6A 1GLFO 1NM1A 3O08A 1ATNA 4BRIA 3M1FA 4B9QA 2IVOA 4JD2A 1S22A 2PAVA 1SZ2A 1V4TA 4I6MA 3F9MA 1HKCA 3RSEA 5AZIB 4BQZA 5AQWA 4JN4A 3VEZA 3AAQA 5CE3A 4BC4A 2F9WA 3FZHA 1JCFA 4YDUA 4BVPA 3LDOA 4H5TA 1C0GA 4KBOA 2QWNA 3JXUA 3VESA 2ZGZA 4BGBA 2GUPA 1BO5O 3UB5A 3VGKA 3EZWA 3LM2A 1QZ5A 1U6ZA 3BF3A 2GTDA 1BA1A 1U2VB 4QS8A 3IMXA 2E2OA 4FPBA 4PKGA 5BN9A 3LDNA 2QW9A 1V4SA 4F9OA 3C7NA 3QMLA 1GLLO 3FZLA 2ZGYA 3DXKA 3QICA 4B1ZA 2Q36A 3S41A 2QWLA 5BPNA 3CI5A 4LC9B 4BR9A 1Y64A 2BTFA 3MN9A 4H5VA 1GLDG 4BR4A 3VETA 3LL3A 3HZ6A 1YUWA 3VERA 5EX5A 4M63C 4BVOA 3ENHA 3SMPA 1E4GT 1NGJA 1X9JA 4DCHA 3A5OC 3VEVA 2P9IA 2FSKA 1Z6RA 4BG9A 2CH5A 3U9DA 3WXJA 3QB0A 3WQTA 5BRDA 2P9UB 4BRDA 1WUAA 2I7NA 2E1YA 1NGBA 4BR5A 4AM6A 4CJ7A 3QFPA 1BU6O 5AZJB 1TUUA 1KAXA 1TYQA 3C0BA 1GLBG 1X3NA 3D2FB 3H1VX 3ULEA 3W0LA 5AQZA 3H46O 5AQKA 5F1XA 1BOTO 4GNIA 4B1XB 4BR2A 2Q0RA 4EAHD 2ASPA 2V7YA 1RFQA 1NLVA 2HF3A 3BF1A 4B1VA 2FXUA 1NGCA 4FWMA 4C23A 1BA0A 3KVGA 1RGIA 1DKGD 3MMVA 4NO7A 4EHTA 3FGUA 4FPAA 5AQSA 4H0VB 4FWOA 3A5NC 2QWQA 1HPMA 2P9IB 5AQPA 3UKRA 3CJAA 5BPLA 2VCPA 5JMVA 2EWSA 4XH4A 4B1YB 3CQXA 3KZBA 3O80A 5AZIA 2KHOA 2YJEA 2P9LB 3MK6A 4H5WA 1DEJA 3I8BA 5BPMA 3O8MA 4JHDB 3ULEB 2GWKA 2YJFA 2V52B 3ID8A 5AR0A 4WQ5A 3ZX2A 3FFKB 3CJ9A 3R6MA 5EVZA 1MWMA 1MDUB 5AQXA 2A3ZA 3MN7A 4BRLA 1BUPA 3R9PA 4HWIA 3GDQA 2Q97A 4CD1A 5AQVA 1U2VA 4CBWA 4BGAA 2QWMA 3LDLA 3UE5A 4A62A 4FWKA 3H6EA 1Q18A 3D2EA 3CJBA 3EKSA 3QDKA 3U9ZA 4FSVA 3UKRB 3M6GA 1BG3A 3GE1A 3UKUB 3ATVA 4IZ9A 2HMPA 3MDQA 4ISEA 4GY2B 3GG4A 4H5NA 5JICA 2ASOA 3ATUA 4BRMA 2D1KA 1QZ6A 4MO5A 5AQJA 1IG8A 4L3QA 5EY4A 4BR0A 2OANA 5BRFA 3LDQA 4BRKA 3FZMA 2FF6A 3VGLA 4MLEA 4FL9A 4O5FA 5AQHA 2ASMA 2IVPA 4BC2A 2CGKA 2P9UA 1GLEG 1SAZA 4EHUA 3H1QA 2QXLA 4BG8A 5ELZA 1E4FT 1NGAA 3D2EB 3CETA 5AZJA 3EO3A 4CZIA 2VYPA 1HX1A 3O1BA 2W41A 3D2FA 3WEEB 4JNEA 4ISGA 1HUXA 4E1JA 3EKUA 5BR9A 1HKBA 4BROA 2FLOA 2GELA 1T6DA 4M7YA 3SK3A 2CGLA 3A5LC 3O1WA 4BRAA 3WXKA 4B1UB 5AQNA 1JCEA 3WXLA 3CJ7A 1SQKA 4FWLA 2Q2RA 4MO4A 3O6WA 2E2QA 1K8KB 4RTFD 3DXMA 5BREA 3L6QA 1WOQA 3D7EO 1GLJO 5AQQA 2WUSA 5E84A 2QWRA 2HF4A 1T44A 2I7PA 3H45C 4H0XB 2P9LA 1Z05A 2NLXA 5F0XA 3ZEUB 3DJCA 4JHDA 4K25A 5LJWA 3G25A 5AQOA 2HOEA 4CD3A 5FPMA 2YHWA 3FLCO 3U4LA 3ZX0A 4IXCA 4A61A 1G99A 4H0PA 4WQ4C 1R59O 4QS9A 3VEWA 3GL1A 3BEXA 3CIPA 3WUHA 4RCHA 3DXMB 1YAGA 3ZETB 5ADXH 2ITMA 5B8HA 4FOIA 3UKUA 3W3DA 4FWQA 1ZC6A 2GWJA 3O5BA 5BN8A 1NGIA 2F9TA 3ENOA 3EN9A 2V51B 4NB4A 1NGGA 2QM1A 5LY3A 1D4XA 2H3GX 4H0OA 4PKHA 4CZFA 2DPNA 3MCPA 1NGHA 3L0QA 3TU5A 1ZXOA 4BRCA 4K42A 1QQOA 3GOIA 4CBUA 3HM8A 5FPDA 4BR7A 3SJHA 2E20A 4XH1A 2A42A 3EL2A 1QHAA 1KAYA 4CZEA 1YXQA 2D0OA 3AARA 2P9PB 3WXIA 2NRHA 4K41A 3CQYA 4YDUC 1S3XA 4CI6A 1HJOA 3VENA 1KAZA 1NGDA 2V7ZA 2D0PA 3HBTA 4CZGA 1BWFO 3OHRA 5AQIA 5AQGA 3A8YA 3WEEA 3ZX3A 4BREA 3IFRA 1HKGA 3IUCA 2IVNA 2W40A 1T6CA 4QS7A 2UYTA 2YHYA 1H1VA 4CZJA 2QWOA 2IIRA 4Y0WA 5E26A 1LOTB 2FSNA 3CJCA 5LJVA 1BDGA 4HTLA 3SMSA 5KPZA 3CJ1A 1QQNA 3R8EA 2D4WA 1K8KA 3TPQA 3VEYA 4DQ8A 4RWTA 2P9NA 1J6ZA 4AM7A 4CZLA 1XQSC 5KPRA 3LDPA 5ADXA 4WYBA 3CERA 5KQDA 1NGEA 3QBXA 4MLHA 1RDWX 2Q31A 1NBWA 2A41A 2P9SA 2ZF5O 3ZEUA 3QBWA 4PKIA 3SLCA 4B1WB 4A2BA 2Q0UA 4BC5A 4IJAA 4BRQA 2E1ZA 4H03B 3WT0A 4BQLA 4Z94A 1X3MA 1ATRA 2NZTA 1XUPO 2E2PA 3WQUA 4JAXA 4DB3A 3H3OB 3A0IX 4CZHA 5I9EB 4PL8A 2YHXA 5AQUA 3HSCA 2Q1NA 4JD2B 3B8AX 3FZKA 3FZFA 2AP1A 2FF3B 4I6MB 1IJJA 1NWKA 2E8AA 3FE1A 1CZAN 1DGKN 3RSEB 3ZETA 2E88A 4K43A 2P9NB 3VF6A 4DHYA 2YI1A 3A5MC 5AQFA 1KXPA 2QWPA 1C0FA 3AAPA 2P9SB 1TUYA 3VOVA 4XH5A 2YCHA 3LM9A 4BRPA 3P4IA 4BRFA 5AFUH 5EOYA 4EIAA 3VF4A 2P9KA 4IO8A 1ESVA 4FWSA 2E2NA 4CZKA 3BP8A 5FPNA 3MN5A 1LCUA 5FPEA 4A2AA 3L4IA 1QQMA 3VGMA 2P9PA 4PL7A 3GBTA 3C7NB 3DXKB 4IWVA 4H0TB 4ISFA 4BRNA 5AQTA 4WQ5C 1HLUA 3CHWA 4CBXA 3VPZA 3M3ZA 5KPTA 4FO0A 5AQRA 3AY9A 2A40A 5AQYA 5JLFA 4CZMA 5TKYA 1ATSA 5JLHA 3QFUA 5AQLA 1EQYA 1P8ZA 2PBDA 4FWPA 1JCGA 2P9KB 4XEIA 4M7XA 3MN6A 5F2RA 4O8KA 4J8FA 4FWNA 2FSJA 5EXWA 4FOEA 4H0YB 2VWBA 3VEXA 2J4RA 3I33A 5BRHA 5AQMA 2A6AA 3DWLA 3FR0A 1XC3A 4WQ4A 3HTVA 4EFHA 3U8XA 3BUZB 2BUPA 1NGFA 1GLCG 1TYQB 1YVNA 4BC3A 3IDHA 5KQ8A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3O4WA 2AA4A 4LH5A 1KC8O 1JKHA 4B3TK 4N5SA 2A5XA 2O8CA 3VA3A 3DAWA 5AFUA 4BRHA 2RKIA 4IFYA 1MWKA 4O0IA 5KTQA 3PX6A 2PYLA 1TVRA 2R7YA 2HW3A 4KHPK 4H5RA 4FWRA 3KOXA 4BRIA 3O08A 1ATNA 3OYMA 1RT7A 3KD1E 3S5TA 1SL1A 2IVOA 1XMQK 2VWKA 3F9MA 1FKOA 1UA0A 4MDBA 3KLEA 2IS3A 3HO1A 3HP6A 1GPSA 4DR5K 1EX4A 4QCLA 4WFBL 2F9WA 1NOZA 3FZHA 2O8EA 3AO2A 5GINA 1HQUA 3LDOA 4H5TA 4YOTA 5FLXO 2QWNA 3JXUA 2YILA 2ZGZA 3V6DA 3KLIA 2WONA 3K5NA 3UIQA 2KKZA 4DLEA 4JKFA 3SAGA 3EZWA 1S1UA 2GTDA 1U2VB 3IMXA 2E2OA 4C8OA 1AYJA 4MDAA 3OYNA 1NJZA 4BWJA 2Z1JA 1HYVA 1RTJA 2C1IA 3LPUA 2FBXA 2ZGYA 1N5YA 3V4IA 3WNGA 3S41A 3PV8A 4DV7K 1L5UA 2QWLA 2NRVA 2NUBA 2F4VK 4H5VA 2RE2A 2VGMA 3DLLL 3HZ6A 4HCCA 2O8BB 3VERA 5CZ1A 3KOZA 2E3FA 1VQ4N 3QEVA 5KI6A 3HPGA 1NGJA 3KLFA 2W00A 2P9IA 2OPPA 3QIOA 1Z6RA 4BG9A 4LF4K 5D3GA 5C15A 5BRDA 3QNOA 2I7NA 2E1YA 2ZJQL 1R0AA 3HPHA 4FJ9A 1NGBA 4GVMA 1YTUA 4AM6A 3AO1A 3CCQN 4G1QA 1GLBG 4FJKA 2WOMA 3ULEA 2QKBA 1Y97A 3NBPA 4B1XB 4E89A 4BR2A 3CYGA 5HRNA 1HQEA 2Q0RA 1NG9A 2V7YA 4O4GA 1FW6A 1NGCA 4C23A 1SKSA 1BA0A 3KVGA 2BDPA 4B3RK 5LL6Z 1FK9A 4OGCA 2G8UA 2QWQA 3C6HA 1WB9A 1HJRA 4IOCL 3SQ0A 4XH4A 3G0ZA 2KBHA 3WNEA 4DKWA 4JI6K 3AVGA 3KZBA 3V81A 2NRTA 4DV0K 1DEJA 3O8MA 3TAEA 1TL1A 1MYNA 2YJFA 2QTDA 1T1TA 3EYZA 3TAPA 1JJ2M 3NF9A 4LF7K 1KCFA 1RCHA 5AR0A 3ZX2A 4OGEA 5EVZA 1MWMA 3MN7A 2A3ZA 4DR1K 4CJEA 2OA8A 4UADE 3R9PA 1T7BA 2Q97A 4JKCA 5AQVA 3TAMA 1YHQN 3UE5A 1ITGA 5GIPA 4CF1A 3CJBA 3U9ZA 5H1SQ 5HLFA 2DFEA 5GAGP 1BG3A 2HNDA 4IZ9A 2HMPA 1VNAA 3QIPA 4B9SA 1LQQA 4GY2B 3GG4A 1XI1A 3V1QA 3SV4A 1L3VA 1EXQA 1Z25A 3KTQA 2KZZA 1JLCA 4RW6A 1IG8A 4CJ5A 1XHXA 2HHTA 3VQ7A 3HK2A 5BRFA 1U4BA 4BRKA 1GOBA 4MLEA 4DS5A 3OYEA 5AQHA 4FK0A 4ID5A 4Y1DA 2UU9K 1SAZA 4WFAL 4YOUA 4QAGA 5C12A 3D2EB 4DR6K 3KOYA 4JI2K 4JNEA 4UQGA 2A1RA 1C1BA 2XY8A 1HKBA 4BROA 3OYIA 4EP4A 4C8NA 4IDKA 3QI7A 4DR2K 2KGQA 2ZD1A 4CFCA 4DSJA 1TKXA 4CF2A 4A5BA 1A5VA 3CG7A 3ZSYA 5J1EA 4OPHA 4FWLA 1N32K 1NKEA 3O6WA 1K8KB 4RTFD 5BREA 3SAFA 3L6QA 1WOQA 3D7EO 3TSQA 2KQ2A 4EP5A 5M1NA 4H0XB 3T7ZA 5DM7L 3K5MA 4JHDA 1NKBA 4CD3A 3U4LA 2YHAA 3O3FA 2HBMA 1S9GA 4O8UA 1Q86O 5CY0A 1HR0K 4PY5A 1KRPA 2D0CA 4CF8A 5DM6L 3SQ2A 4ID1A 4RW4A 3WUHA 4CFDA 1JZBA 4L8RB 1NK9A 3THWB 1WSJA 3WNHA 3VTHA 2ITMA 4FOIA 3UKUA 4W5QA 3W3DA 4CEQA 4FWQA 1SN4A 1B92A 4X65K 4DV3K 3R2VA 3THXB 3ENOA 3E01A 1C0UA 2V51B 3J7ZO 4CEEA 3MEGA 5LY3A 1JXCA 3DLGA 4RG8A 1ZBHA 4PKHA 3EEQA 3CPEA 1JL1A 4JRPA 3SUOA 4N41A 4BRCA 4K42A 3GOIA 3LWLA 1BL3A 5FPDA 1J5OA 2XY5A 3TABA 4GVEA 4Z4GA 4J2AA 2KW4A 4ILGB 5M1PA 1KAYA 2P9PB 4F4KA 4UY8O 3SQ4A 4DU4A 1HJOA 1NGDA 1Q82O 2B6AA 3HBTA 4H4OA 4IOXA 1IV0A 1BWFO 1SV5A 5AQIA 3O4QA 3OS0A 3OJSA 1VRTA 3L2QA 5C10A 1LW2A 2YHYA 1VSDA 2GX9A 1H1VA 1NOYA 2BH1A 3PO5A 2QWOA 4DV5K 4Z0UA 3LAKA 5LJVA 4OLBA 5GADP 1VSHA 4CEBA 2JWLA 1NJIO 3R8EA 3VQEA 5JVHL 3TPQA 1U47A 4FK2A 4DQ8A 2KBJA 1XC9A 3BZKA 3G4SN 4RWTA 1VK0A 1ASUA 2IC3A 1XQSC 4ELTA 2HHXA 5KQDA 1NGEA 4IO9L 1NK7A 3T1HK 2DFFA 1NBWA 2P9SA 4LSLA 1DLOA 3NHGA 1KTQA 4BRQA 1ZVGA 1D9FA 3WT0A 3VN5A 4X64K 1X3MA 4FLZA 3KKSA 4RW7A 4JAXA 1XRSB 3PUFA 1D5AA 2YKNA 2YX6A 3BY5A 2N69A 4Y1CA 4CZHA 4HHTA 3BDPA 1BK8A 3QERA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3O4W A;  2AA4 A;  4LH5 A;  1KC8 O;  1JKH A;  4B3T K;  4N5S A;  2A5X A;  2O8C A;  3VA3 A;  3DAW A;  5AFU A;  4BRH A;  2RKI A;  4IFY A;  1MWK A;  4O0I A;  5KTQ A;  3PX6 A;  2PYL A;  1TVR A;  2R7Y A;  2HW3 A;  4KHP K;  4H5R A;  4FWR A;  3KOX A;  4BRI A;  3O08 A;  1ATN A;  3OYM A;  1RT7 A;  3KD1 E;  3S5T A;  1SL1 A;  2IVO A;  1XMQ K;  2VWK A;  3F9M A;  1FKO A;  1UA0 A;  4MDB A;  3KLE A;  2IS3 A;  3HO1 A;  3HP6 A;  1GPS A;  4DR5 K;  1EX4 A;  4QCL A;  4WFB L;  2F9W A;  1NOZ A;  3FZH A;  2O8E A;  3AO2 A;  5GIN A;  1HQU A;  3LDO A;  4H5T A;  4YOT A;  5FLX O;  2QWN A;  3JXU A;  2YIL A;  2ZGZ A;  3V6D A;  3KLI A;  2WON A;  3K5N A;  3UIQ A;  2KKZ A;  4DLE A;  4JKF A;  3SAG A;  3EZW A;  1S1U A;  2GTD A;  1U2V B;  3IMX A;  2E2O A;  4C8O A;  1AYJ A;  4MDA A;  3OYN A;  1NJZ A;  4BWJ A;  2Z1J A;  1HYV A;  1RTJ A;  2C1I A;  3LPU A;  2FBX A;  2ZGY A;  1N5Y A;  3V4I A;  3WNG A;  3S41 A;  3PV8 A;  4DV7 K;  1L5U A;  2QWL A;  2NRV A;  2NUB A;  2F4V K;  4H5V A;  2RE2 A;  2VGM A;  3DLL L;  3HZ6 A;  4HCC A;  2O8B B; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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