5AQLA

Fragment-based screening of hsp70 sheds light on the functional role of atp-binding site residues
Total Genus 123
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
123
sequence length
381
structure length
381
Chain Sequence
MSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLWSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Chaperone
molecule keywords HEAT SHOCK COGNATE 71 KDA PROTEIN
publication title A fragment-based approach applied to a highly flexible target: Insights and challenges towards the inhibition of HSP70 isoforms.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 123
structure length 381
sequence length 381
chains with identical sequence C
ec nomenclature ec 3.6.3.51: Transferred entry: 7.4.2.3.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5aqlA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqlA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqlA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5aqlA04
4NO7A 4H0VB 2FSNA 4BC5A 3ZX2A 1IJJA 4RCHA 4KBOA 5I9EB 4QS7A 4O8KA 4BC3A 4BC4A 1TUYA 3BEXA 5E26A 2Q97A 2V7ZA 1NGGA 5AQVA 1QZ6A 1C0FA 4WYBA 4EHTA 5BREA 3R8EA 3LDPA 5KQ8A 4H5WA 1GLJO 3EN9A 2H3GX 3UKRA 3UKRB 4BRCA 5JICA 2QWRA 1RDWX 1MDUB 3AY9A 3VGLA 2P9NB 3C7NB 2D0PA 1R59O 4K42A 3VEZA 3VETA 3HBTA 4FWRA 4BGBA 1LOTB 3VEXA 2QW9A 1NWKA 2VCPA 4BGAA 2E1YA 2UYTA 4WQ4C 1XC3A 4BVOA 4GY2B 1BUPA 1NM1A 2A6AA 3FGUA 2P9PB 4IZ9A 4A61A 3UE5A 4K41A 2Q2RA 1E4FT 2GUPA 4IWVA 3ZETA 4WQ4A 3VPZA 1QQMA 3ZETB 4QS9A 3ZX0A 3DJCA 2E2NA 5F0XA 1JCGA 1XQSC 1QQNA 3S41A 2A41A 1NGFA 3MN6A 2A5XA 3MK6A 3MN7A 3KVGA 3RSEA 2W40A 3RSEB 3DXMA 4CZKA 2ZWHA 3WEEA 5AFUH 3FE1A 5AQTA 2FSKA 2BUPA 4BRDA 3F9MA 5AZJA 2AP1A 3QFPA 3HTVA 5AZJB 1J6ZA 5AQHA 3SLCA 4BR9A 4BR4A 1GLEG 1KAYA 1G99A 1U6ZA 4CD3A 3A5NC 3ENHA 1ATRA 3FLCO 3D2FB 1S22A 3C0BA 4JD2A 4FWPA 3CQXA 2CGJA 4K43A 3GL1A 5AQWA 1YVNA 4CZLA 5AQRA 4CZIA 1ZC6A 3CERA 2PAVA 3ID8A 3VGMA 5JLHA 1K8KA 3O1BA 3ZEUA 1GLAG 1K8KB 3ZEUB 2GELA 1SZ2A 5AQFA 2CGKA 3CHWA 4BC2A 1HKGA 2YJEA 2E88A 4FSVA 4XH5A 3GDQA 2GTDA 3CJCA 4Z94A 3U8XA 2E2PA 1KAXA 1NLVA 1XUPO 1GLBG 1MWKA 3VEWA 2KHOA 3L0QA 1HLUA 2Q0UA 1MWMA 1DEJA 2ZF5O 5AZIA 1ZBSA 1LCUA 5AZIB 3D7EO 2DPNA 1CZAN 1KXPA 1P8ZA 2A42A 2ZGZA 3DXKA 3H1QA 3DXKB 2I7NA 5AQZA 3EO3A 4FPAA 4XH4A 2OANA 5AQOA 2YHWA 4FWKA 4CD1A 4BREA 3IFRA 3CIPA 3O8MA 3VOVA 4EAHD 3CJAA 2D4WA 3EZWA 3IDHA 4B1ZA 2IVOA 3IMXA 3QBXA 2FF3B 3HM8A 2A40A 2P9SA 5AQSA 1DGKN 3DWLA 2V51B 2P9SB 3FZFA 2EWSA 5BPLA 4B1UB 4M63C 1DKGD 5AQPA 1H1VA 5AFUA 3UKUA 4MO4A 3IUCA 1GLCG 2YJFA 4DCHA 5ADXH 3SMSA 1SAZA 1BU6O 5F1XA 5B8HA 1Z05A 5E84A 1JCEA 2FXUA 4BRAA 1IG8A 5BN8A 3ZX3A 1JCFA 5FPMA 2P9KA 3O4WA 5FPNA 2IVPA 5FPEA 5LJWA 3CQYA 5EY4A 5AQIA 2E2QA 1TYQA 1WOQA 2V52B 3MN9A 3VGKA 1TYQB 2I7PA 1E4GT 2Q0RA 3ATVA 2ITMA 1KAZA 5AQXA 1QZ5A 1T6DA 3OHRA 3VEYA 1TUUA 4EIAA 1YUWA 3FZMA 4FWNA 3QMLA 1Q18A 5BRHA 2QWNA 3DXMB 3VENA 1YXQA 4ISEA 4BRLA 4BRIA 1NMDA 4IJNA 1YAGA 3WEEB 2WUSA 3A5OC 4MLHA 3WXKA 3WUHA 5CE3A 3HSCA 1NGJA 3VF4A 1X9JA 3BF3A 3CETA 4H0XB 5AQGA 2YCHA 1EQYA 3LDQA 4RWTA 4C23A 3D2EA 4XEIA 3ULEA 3W3DA 3L6QA 4DQ8A 1ESVA 3QDKA 4K25A 1MA9B 1X3NA 4BR2A 4IJAA 4O5FA 3WT0A 4BRFA 4BQZA 2IIRA 3I8BA 4H0OA 4JD2B 4CZEA 2FF6A 1ATSA 4A2AA 4EFHA 4JNEA 3U4LA 4ISFA 1GLDG 4JHDA 4WQ5C 4JHDB 4PL8A 2A3ZA 3O80A 3SMPA 4CZFA 3TU5A 4BRKA 4A62A 4FWOA 4BRPA 4HWIA 2ASOA 4HTLA 3QFUA 1C0GA 4XH1A 4BR7A 3AAPA 3EKSA 2J4RA 4IXCA 5AQQA 4B1XB 4B1WB 1NGAA 4WQ5A 3LDOA 5AR0A 5KPRA 1HUXA 3H3OB 4RTFD 1NGEA 3M1FA 5BRDA 5ADXA 3L4IA 3MN5A 2D1KA 5AQUA 2E2OA 2E1ZA 3VERA 4BQLA 3QBWA 2YHXA 4BVPA 3GBTA 4AM6A 3LM2A 3ATUA 3O1WA 3EKUA 3HI0A 2QM1A 2NZTA 2QWOA 1Y64A 3O6WA 3WQTA 3MDQA 1HKBA 4H0TB 1ZXOA 4BG8A 3H46O 3KZBA 1OKJA 2IVNA 3H6EA 1BA1A 2D0OA 3VESA 2NLXA 3LDLA 4J8FA 3U9DA 4I6MA 1BDGA 4NB4A 3MMVA 4BRQA 3B8AX 3I33A 4PKHA 2F9WA 1Z6RA 4Y0WA 3ENOA 4BR0A 1NGIA 4YDUC 1BG3A 3KHYA 1T44A 2ASMA 3LL3A 4AM7A 3SJHA 1NGCA 2HF3A 3JS6A 5EOYA 3UKUB 5BR9A 3P4IA 4H5VA 4B9QA 4M7XA 4E1JA 3A5MC 2HF4A 3MCPA 4M7YA 3A5LC 4QS8A 3WQUA 4YDUA 4DB3A 2Q31A 3DAWA 4PL7A 3M3ZA 2QWLA 4FPBA 2P9NA 3C7NA 1V4TA 2VYPA 3QB0A 3VEOA 2P9KB 4BRNA 4CBXA 2FSJA 1BWFO 2YI1A 4H5TA 3CI5A 4JAXA 3FZKA 5AQYA 4LC9B 3O5BA 4FWSA 3VF6A 3WXLA 5JLFA 3CJ7A 3GG4A 4MO5A 5AQNA 1NGBA 4BRHA 2QWQA 4BRGA 3FZLA 2E8AA 2CGLA 1NGDA 1S3XA 5AQKA 5AQJA 1X3MA 3A0IX 5ELZA 3SK3A 5BRFA 3AAQA 3O08A 3LM9A 4EHUA 5EVZA 3BUZB 5EXWA 1SQKA 1HKCA 2P9PA 1BO5O 2GWJA 4H0PA 3WXJA 4CZHA 3R6MA 2YHYA 3BF1A 3G25A 4F9OA 4FOEA 3WXIA 3VEVA 4MLEA 4BROA 1BA0A 3JXUA 2V7YA 1HPMA 5AQMA 2Q36A 1QHAA 3D2EB 3R9PA 3ULEB 4B1YB 2Q1NA 5KPTA 3CJBA 3H3NO 5AQLA 2ZGYA 4FO0A 2ASPA 4H03B 5JMVA 2NRHA 2HMPA 3TPQA 5FPDA 4H5RA 5KQDA 3W0LA 1BOTO 4GNIA 3LDNA 5KPZA 4FWMA 4CBWA 5BPMA 1D4XA 4JN4A 5LJVA 1GLFO 1V4SA 1WUAA 4BR5A 2PBDA 2E20A 3AARA 2P9LA 4H5NA 1NGHA 2P9LB 4PKGA 4FWLA 2P9UA 2GWKA 3GE1A 2P9UB 3H45C 5LY3A 2HOEA 4H0YB 1T6CA 4B1VA 3FR0A 3D2FA 1HX1A 2BTFA 3J8AA 2W41A 1RFQA 4BG9A 4IO8A 4ISGA 3M6GA 4CI6A 2FLOA 4L3QA 5EX5A 3EL2A 4CZMA 4FL9A 4CZGA 1U2VA 3CJ9A 1RGIA 1ATNA 4PKIA 1U2VB 3A8YA 2AA4A 3GOIA 3CJ1A 2P9IA 4CZJA 3FFKB 2P9IB 4DHYA 2GEMA 1HJOA 5BN9A 2F9TA 5BPNA 5TKYA 2CH5A 3QICA 4FOIA 2QXLA 3H1VX 4CBUA 4FWQA 1NBWA 4CJ7A 4BRMA 2QWPA 4A2BA 3FZHA 3BP8A 3HZ6A 3VF2A 1QQOA 1GLLO 5F2RA 2CH6A 2QWMA 4I6MB 3U9ZA 3UB5A 2VWBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4NCGA 4E1MA 2FSNA 1MR4A 5KRTA 2OCEA 3CPEA 2NUBA 3SAGA 5I9EB 5M1QA 2GL1A 4O8KA 4F3TA 3BEXA 3ZSVA 5AQVA 3MX2A 4EHTA 4FJJA 3M8SA 2OTJN 2E5LK 4H5WA 1GLJO 2G8WA 4DSKA 4Z4IA 5K14A 4GKJK 1ZVGA 1RDWX 5GIPA 3O4QA 3QI7A 1ASVA 4NCAA 2D0AA 1WSFA 5HRSA 2OPPA 3VEZA 3VETA 1NJZA 5TKWA 1W7AA 1U45A 3E7RL 1J9AA 4BGBA 3C65A 3C6UA 5C12A 3LPUA 2QW9A 2VCPA 4A5AA 3V81A 3HP6A 1KQSM 1IBMK 5I42A 1NM1A 2A6AA 3PX4A 1VQ5N 4UY8O 1YF5L 1AYJA 3OYLA 2P9PB 4A61A 1HRHA 1XHXA 4K41A 2HHXA 1E4FT 5JS1A 1QQMA 4KHUA 3SAHA 3RVCA 4HUEA 3OJSA 5F0XA 4CEEA 3S41A 2A5XA 4KTWA 2OPSA 2BH1A 3RSEA 2WFBA 1AHOA 3RSEB 3DXMA 2B5JA 3VTIA 3EZ5A 1YITN 1I94K 3CYGA 5FLXO 3SZ2A 1KLNA 2BUPA 3SQ4A 3QFPA 1PE4A 2KBKA 1RT3A 4JLHA 4BR4A 1VQ8N 3ENHA 4DG1A 1S22A 4JD2A 1NK9A 4FWPA 4KYPA 2F7TA 3DLLL 1JKZA 3GL1A 5AQWA 3RMCA 4B08A 4BDYA 3AO5A 4CZIA 1OH8A 2PAVA 3ID8A 4Q0BA 1B3CA 1SL2A 4DTNA 3NH0A 1K8KA 4C8MA 2UXCK 2YEOA 1K8KB 1LAVA 2XY8A 2YX6A 2C1GA 3CHWA 4CF9A 3JSMA 4IDKA 4DR4K 3CYMA 3KLFA 1ZFUA 4DTSA 4BACA 4JYAK 2GTDA 2I61A 1XI1A 1D9FA 4DV5K 2E2PA 1ITGA 1P00A 2HBMA 3LZJA 5CY0A 1MWKA 3PO4A 3K9KA 1HLUA 3AA4A 1MWMA 3E9OA 5AZIA 2ZM6K 4J2DA 5AZIB 1BL3A 3D7EO 2DPNA 3DXKA 2A42A 3DYAA 4QAGA 2E6LA 3NH1A 3DXKB 1XMQK 2LJ7A 4ELTA 2OYQA 3AVAA 3TWHA 4E3SA 1YJNN 1L4VA 2VGNA 5GAHP 4CFCA 3HOTA 3EZWA 5C10A 3IDHA 2ITGA 1VRTA 3HM9A 4HTUA 2FF3B 2KTQA 2GMOA 1Q8IA 4O0IA 4J2AA 3SUQA 3DWLA 4Z4CA 2VGMA 3HK2A 4CK2A 2X6NA 3KD1E 3IUCA 1WNSA 4BY9C 4ILHA 1GLCG 1HMVA 3D6RA 1BHLA 4ICLA 4RW7A 4IFYA 1VQPN 5F1XA 2QTDA 5E84A 5B8HA 2YIPA 1WSGA 4JKBA 5J2NA 5KK4A 3DLGA 3ZSWA 1JCFA 5FPMA 2KPYA 3HVTA 3IS9A 1N36K 1JXBA 4O0JA 3VQ4A 2BANA 2V52B 2E2QA 2I7PA 4CF1A 2GV9A 1IBKK 3ATVA 3ZT1A 4FJGA 3CFRA 4MDAA 5AQXA 3OHRA 4E89A 1BISA 4JRPA 5BRHA 1Q18A 4GVEA 1C0UA 1NJYA 4I2PA 4ISEA 3A5OC 1NGJA 3BF3A 1OH7A 2GUIA 4NYFA 4IBNA 3CETA 4H0XB 3NAEA 4N76A 2MBKA 2C1IA 1Q86O 1K73O 1ESVA 3QDKA 3CFOA 4IJAA 2G8KA 4BQZA 3I8BA 3QEXA 4FK4A 5FRMA 2KZMA 3M5RA 1RDBA 1N8RO 2UU9K 1S6PA 4JNEA 1ZUTA 1T8EA 1P0AA 3C6AA 3CCSN 3AO3A 5J2QA 5HLFA 3CF5L 2A3ZA 2YIOA 4CZFA 1BQNA 1ZBLA 4BRKA 1RDAA 4HWIA 4HTLA 1C0GA 3GKUA 4XH1A 4CHZA 4B1XB 4B1WB 1NGAA 2FBVA 4WQ5A 3HPOA 3SYZA 1SNBA 5AR0A 3SJJA 1J5OA 1HNIA 3ZT0A 4E0DA 1PX9A 3M1FA 5BRDA 1CXUA 3KOYA 3MN5A 1C1CA 2HHIA 2G2KA 4DQQA 2E2OA 4KB0A 4KV8A 1HJRA 2YHXA 1POIA 4AM6A 3O1WA 4CEOA 3TAQA 2QWOA 3WQTA 1DTTA 4H0TB 4IO9L 3G4SN 1NU0A 3OW2M 3H46O 3K5LA 3QEVA 2NLXA 3LDLA 3NF8A 3G71N 4G1QA 4JS5A 3I8DA 1HNXK 2OA8A 4BRQA 1ASWA 4DSLA 1ILYA 3ULDA 1ZYWA 1RT1A 4PKHA 2PY5A 3HT3A 1PTXA 3ENOA 4BR0A 4DTOA 3R1XA 2X6SA 4DS4A 4AM7A 3LL3A 1CHZA 1NJIO 4B9UA 2O8DA 3LDSA 2O8DB 2SN3A 4B9QA 3AO2A 4JKFA 3KTQA 3MCPA 4LY7A 3PSFA 4DR7K 1RBSA 1S1XA 4O44A 5J2MA 5IT9O 3VEOA 3THYA 1N33K 3AVLA 3THYB 2OZSA 2XO7A 3VN5A 2IS3A 1VQKN 3O5BA 4FWSA 2KLAA 3WXLA 2PZSA 1NGBA 3E66A 4BRGA 1XWLA 4OKJA 1X3MA 3RTVA 4W5TA 3SK3A 3SCXA 3K57A 5EVZA 2HBJA 2HNZA 1QSYA 3EE9A 4LFAK 1BO5O 2RN2A 2VG6A 4KREA 3BF1A 3CW4A 2P5OA 1BA0A 3JXUA 1TL3A 2VQEK 1HPMA 3AVNA 3VA3A 3D2EB 4B3RK 3KP0A 4E7HA 3RMBA 4OGEA 4CIFA 4ILGB 4ID5A 1IG9A 4M3UA 3HRGA 2LR3A 1L5UA 3CJBA 4ELUA 4CHPA 1NRBA 1JLEA 1BOTO 5KPZA 3V9SA 2KSKA 5LJVA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4NCG A;  4E1M A;  2FSN A;  1MR4 A;  5KRT A;  2OCE A;  3CPE A;  2NUB A;  3SAG A;  5I9E B;  5M1Q A;  2GL1 A;  4O8K A;  4F3T A;  3BEX A;  3ZSV A;  5AQV A;  3MX2 A;  4EHT A;  4FJJ A;  3M8S A;  2OTJ N;  2E5L K;  4H5W A;  1GLJ O;  2G8W A;  4DSK A;  4Z4I A;  5K14 A;  4GKJ K;  1ZVG A;  1RDW X;  5GIP A;  3O4Q A;  3QI7 A;  1ASV A;  4NCA A;  2D0A A;  1WSF A;  5HRS A;  2OPP A;  3VEZ A;  3VET A;  1NJZ A;  5TKW A;  1W7A A;  1U45 A;  3E7R L;  1J9A A;  4BGB A;  3C65 A;  3C6U A;  5C12 A;  3LPU A;  2QW9 A;  2VCP A;  4A5A A;  3V81 A;  3HP6 A;  1KQS M;  1IBM K;  5I42 A;  1NM1 A;  2A6A A;  3PX4 A;  1VQ5 N;  4UY8 O;  1YF5 L;  1AYJ A;  3OYL A;  2P9P B;  4A61 A;  1HRH A;  1XHX A;  4K41 A;  2HHX A;  1E4F T;  5JS1 A;  1QQM A;  4KHU A;  3SAH A;  3RVC A;  4HUE A;  3OJS A;  5F0X A;  4CEE A;  3S41 A;  2A5X A;  4KTW A;  2OPS A;  2BH1 A;  3RSE A;  2WFB A;  1AHO A;  3RSE B;  3DXM A;  2B5J A;  3VTI A;  3EZ5 A;  1YIT N;  1I94 K;  3CYG A;  5FLX O;  3SZ2 A;  1KLN A;  2BUP A;  3SQ4 A;  3QFP A;  1PE4 A;  2KBK A;  1RT3 A;  4JLH A; 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