5AQMA

Fragment-based screening of hsp70 sheds light on the functional role of atp-binding site residues
Total Genus 124
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
124
sequence length
382
structure length
382
Chain Sequence
SMSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLFSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Chaperone
molecule keywords HEAT SHOCK COGNATE 71 KDA PROTEIN
publication title A fragment-based approach applied to a highly flexible target: Insights and challenges towards the inhibition of HSP70 isoforms.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 124
structure length 382
sequence length 382
chains with identical sequence C
ec nomenclature ec 3.6.3.51: Transferred entry: 7.4.2.3.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5aqmA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqmA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqmA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5aqmA04
4BRGA 2GWJA 1JCGA 3A8YA 3CJ7A 4CBXA 3ZX3A 1HJOA 2ASPA 2Q97A 1SQKA 5AQUA 5EXWA 3VGKA 4BRDA 3TU5A 4BVPA 3AAPA 2QWQA 5AQVA 1QZ5A 2J4RA 3O5BA 5LY3A 3D7EO 2YI1A 3AAQA 1NGFA 3JXUA 4BRCA 3H6EA 4QS7A 2Q0UA 3WXIA 4FWLA 2P9KA 2Q31A 4MO5A 2F9WA 2QWNA 3A5NC 3CQYA 5B8HA 2V52B 3FE1A 1H1VA 4HTLA 2NLXA 2VYPA 1GLAG 1KAXA 4CI6A 5AQTA 3CERA 3SLCA 4H5WA 1MWKA 3VEXA 3ZETB 2P9SB 3U8XA 2Q36A 3DXKB 4XH1A 2ZGZA 3RSEA 3U4LA 5F2RA 3VESA 3M1FA 4B1VA 5FPNA 3FZKA 4F9OA 2H3GX 4CZGA 2GWKA 2QM1A 5AQFA 1HKBA 2CGJA 3R8EA 1NGGA 1K8KB 1QQOA 4FO0A 1YUWA 1P8ZA 3L0QA 2VCPA 1IG8A 3B8AX 4EAHD 3UKRA 4H03B 5BRDA 2Q1NA 3MDQA 2NRHA 2YCHA 3HSCA 2P9UB 3VF2A 1GLDG 2D0PA 3EL2A 3S41A 3HZ6A 4BRAA 4NB4A 4C23A 3W3DA 5AZIB 1YXQA 3LDNA 4BRLA 4RTFD 3ULEB 3HBTA 3FFKB 2WUSA 3BF1A 2QWOA 1LCUA 2ZWHA 4H0XB 4A61A 3WQUA 1HX1A 3EO3A 2FF6A 3CJAA 1QQMA 1HKCA 5AQPA 2A41A 2ASMA 3CHWA 1NGIA 2E2OA 3O4WA 3L6QA 4H5NA 1X9JA 3JS6A 4FWNA 1TUYA 2A5XA 4CD3A 5AZJB 4B1XB 4FWQA 4XH5A 4YDUA 3WT0A 3SJHA 2P9NA 3UE5A 3BP8A 2NZTA 3VERA 4B1ZA 3G25A 3LDQA 4BROA 5AR0A 3CJCA 3BUZB 4PKIA 4JAXA 3VF6A 4L3QA 2P9LA 3ZX2A 2BTFA 4MLEA 3GE1A 3CI5A 3HI0A 2IVPA 3R6MA 3R9PA 2E8AA 1BA1A 3BF3A 3ZEUB 3O80A 4BR2A 1HPMA 4CZLA 2IIRA 2W40A 4Z94A 3GG4A 5AQNA 1V4SA 5EY4A 3D2EA 1JCEA 4FPBA 1V4TA 2YJEA 3U9ZA 2VWBA 3SK3A 1RFQA 3C7NB 3MN9A 4MLHA 3UB5A 1HKGA 5F1XA 1U2VA 3QB0A 4A2AA 3QBXA 4CZMA 2CH5A 4FWSA 3CQXA 4FSVA 4I6MB 3CJBA 1SZ2A 2E2QA 3H1QA 4CZIA 5E26A 4DQ8A 3HTVA 2QW9A 1BO5O 5AQMA 1ESVA 3SMPA 3IDHA 5CE3A 2P9IB 4WQ4A 3GL1A 4BR4A 4BRNA 1HUXA 1BU6O 3EKUA 2V7YA 3TPQA 4FOIA 3H3OB 4BR0A 1KAYA 3O1BA 4JNEA 3ZETA 2P9SA 5AQSA 5AQJA 4A2BA 1XC3A 1EQYA 1ZBSA 2DPNA 4H5RA 1ZC6A 4QS8A 2E2NA 3MCPA 1LOTB 4BRQA 2QWRA 1NGCA 5BN8A 4BC5A 3D2FA 5EVZA 3VEOA 3QMLA 2UYTA 3FGUA 2IVOA 5EOYA 4BRPA 3DWLA 4BR5A 4CZKA 4B1UB 5JICA 1QQNA 2D4WA 3QICA 1BOTO 1NLVA 4FL9A 2HOEA 1C0FA 5BRHA 1RDWX 1T6CA 2D1KA 1WOQA 3O08A 3A5LC 5KPZA 1Y64A 1X3NA 4BREA 4CJ7A 3H3NO 1GLLO 5E84A 1QZ6A 1BA0A 4Y0WA 3VOVA 2FSJA 5AZIA 5FPEA 1X3MA 3I33A 3M3ZA 2A6AA 4E1JA 4BRHA 3EKSA 3IFRA 3FR0A 4B1WB 4H0TB 4H0OA 2F9TA 4CZEA 2P9PB 5AQLA 2BUPA 3CIPA 3DXMA 5KPRA 5ADXA 4BG8A 3A0IX 4BRIA 3VGLA 4H0YB 3CJ9A 1U6ZA 2EWSA 3A5OC 4H5VA 4B1YB 2I7PA 1XUPO 1BUPA 2CH6A 1G99A 3UKUB 3RSEB 4QS9A 1HLUA 3GBTA 4IJNA 3MN6A 2ZGYA 2FLOA 4FWOA 4BR9A 5BPLA 3AARA 4JHDB 4K25A 4A62A 2CGKA 4BRMA 4CZJA 1TYQB 5BPNA 5AQHA 3F9MA 5AQXA 2GELA 4K41A 1MWMA 4YDUC 4M7XA 2FSNA 4DHYA 4KBOA 3UKRB 5I9EB 3O8MA 1E4GT 2E2PA 3ZEUA 3ZX0A 5AFUA 4M7YA 3WXJA 2HMPA 1ATNA 3I8BA 4BQZA 2E88A 2E20A 5AQYA 4H0PA 1NBWA 5AQQA 3HM8A 4FWMA 1NMDA 2FSKA 3GOIA 4BQLA 4PKGA 1NWKA 3VF4A 4O8KA 3H1VX 3A5MC 4IXCA 4I6MA 3ATUA 4H0VB 4CBUA 5AQZA 5KPTA 1Q18A 5FPMA 2V7ZA 2HF4A 4B9QA 2KHOA 2ITMA 2P9IA 5LJVA 3J8AA 4XH4A 3CETA 3EZWA 4EIAA 3VGMA 5TKYA 1RGIA 3IMXA 4EHUA 3MMVA 4RCHA 3O6WA 2FF3B 3QBWA 3ID8A 3C0BA 4WQ5A 4IO8A 3MN5A 3LDOA 4BC3A 4WQ4C 2QWPA 2IVNA 4J8FA 2AP1A 4PKHA 2I7NA 4NO7A 5JMVA 2A42A 2P9LB 2ZF5O 2QXLA 3QFPA 3VPZA 2Q2RA 2GEMA 5AQIA 3DXKA 4BGBA 4HWIA 1T44A 5BN9A 4EHTA 2AA4A 1R59O 1WUAA 2YHWA 4LC9B 3D2EB 3P4IA 4IZ9A 3WEEB 1Z05A 2QWMA 3FZFA 2YJFA 4EFHA 5ADXH 4JD2B 1D4XA 5AQKA 1ZXOA 3KZBA 1K8KA 3LL3A 1U2VB 4RWTA 4H5TA 4BGAA 1TUUA 3DAWA 4ISFA 5LJWA 1NGHA 4CZFA 2GUPA 2P9PA 4IJAA 1DKGD 4ISGA 3FZMA 1BDGA 2P9UA 1JCFA 1CZAN 5EX5A 3H46O 3VEVA 4AM6A 4FWKA 1C0GA 4JN4A 1GLFO 3ATVA 2P9KB 1GLEG 3M6GA 3ULEA 4IWVA 4BR7A 3UKUA 1NGBA 5KQ8A 4WYBA 3VEZA 3W0LA 5JLFA 1T6DA 2W41A 3VENA 1NGDA 4PL8A 3IUCA 5AFUH 2YHYA 1YAGA 2HF3A 4ISEA 3D2FB 4FWPA 2Q0RA 2YHXA 4BC2A 4JHDA 2PBDA 5AQWA 1TYQA 2OANA 3EN9A 4GNIA 2A3ZA 4FOEA 1KXPA 5AQGA 2V51B 5AZJA 1MDUB 5AQRA 3VEYA 4BVOA 3LM2A 3CJ1A 4K43A 5BR9A 4AM7A 3H45C 1S3XA 1XQSC 3LM9A 1QHAA 4GY2B 3O1WA 3FZLA 3VETA 3KVGA 3LDPA 1KAZA 2E1ZA 3ENHA 4DB3A 1E4FT 1S22A 2QWLA 4K42A 3SMSA 5KQDA 3L4IA 3MN7A 5BREA 1GLCG 3QFUA 1DEJA 3VEWA 5FPDA 3DXMB 4BRFA 3FZHA 1IJJA 1ATRA 5F0XA 3FLCO 3C7NA 1GLBG 4FPAA 1GLJO 4M63C 1MA9B 3BEXA 4O5FA 3WXLA 1NGAA 2CGLA 3WUHA 1ATSA 1NGJA 1YVNA 3QDKA 1NM1A 4CZHA 1SAZA 2PAVA 4FWRA 3AY9A 3WQTA 1DGKN 1Z6RA 4BC4A 4XEIA 3OHRA 3MK6A 3ENOA 2GTDA 4WQ5C 3GDQA 2P9NB 1NGEA 3WXKA 3U9DA 3LDLA 1BWFO 3KHYA 4BRKA 1J6ZA 4PL7A 5AQOA 4CD1A 4BG9A 2E1YA 4DCHA 5BRFA 1OKJA 4CBWA 5BPMA 3WEEA 2D0OA 5ELZA 5JLHA 1BG3A 2A40A 2ASOA 3DJCA 4JD2A 2FXUA 4MO4A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1LQQA 2Q3SA 1N5YA 3CJ7A 3MCAB 1HJOA 3MEGA 2ATBA 1S1WA 3HSTB 3CC7N 3P1GA 1VK0A 3K57A 3S3MA 1HPZA 4YOUA 4BVPA 2QWQA 4EP5A 2UXCK 5M1KA 1EWRA 2WC9A 1QZ5A 4GMJB 5LY3A 4IG3A 4YOYA 1JLEA 2HSTA 3NE6A 4Y1CA 2DFHA 3V1RA 1ZVEA 3H6EA 1C0TA 2F9WA 1VSLA 2RHKA 4Q0BA 2QWNA 1K73O 1RTIA 2X78A 3AO1A 1KLMA 4Y1DA 1HNZK 1T7EA 3SF4D 4HTLA 4KTZA 4BE1A 3SUQA 1KAXA 4CI6A 5HRPA 4JS4A 4E7HA 1X9MA 1OVQA 2UUBK 1MWKA 1NU0A 2P9SB 1ZYQA 2Q36A 4KHUA 2ZGZA 3MEDA 4B1VA 5FPNA 3FZKA 1KTQA 5D3GA 1AHOA 3KWIA 5C2DA 4LFBK 3ZT0A 1P8ZA 4X66K 1VQKN 1IG8A 4LFCK 4DTOA 2KYQA 4XIUA 5BRDA 3J80O 4KFBA 2KFZA 5MLCQ 4UQGA 3S41A 3HZ6A 1YJ9N 3OYCA 1WSGA 4DLEA 1SL1A 2LJ7A 4RTFD 5JS2A 3HBTA 4CGHA 3BF1A 5FRNA 1LCUA 2YEOA 2HHWA 3LDSA 3WNFA 3WQUA 3QEPA 1HX1A 1KVBA 2G8WA 2O4GA 4F3TA 1FKPA 1RT5A 3CHWA 4YY3K 2FBTA 4K8ZA 2KGQA 1NJXA 2XY7A 4DFPA 3L2WA 3L56A 4CD3A 5AZJB 4B1XB 4FWQA 1TAQA 2FBYA 2W6KA 2PZSA 4FW2A 2VG5A 4FJHA 4OLAA 2ETJA 5LL6Z 3SYZA 1SUQA 4DG1A 2KZZA 4J2BA 1LW0A 3BUZB 3TSQA 4LFAK 3VF6A 4L3QA 3HPGA 2P9LA 1ZFUA 3ZT1A 3MECA 3LZJA 3CI5A 3HI0A 1BA1A 2P5OA 3LP0A 3O80A 2IIRA 1V4SA 3QINA 4CEBA 4FPBA 3U9ZA 2ZM6K 1EX4A 3SK3A 3THVA 1JLFA 4WF9L 2BGGA 4MLHA 1UA0A 3UB5A 1HKGA 5F1XA 1U2VA 2GV9A 4K0KK 1XI1A 3QB0A 3HYFA 3O3GA 1BMRA 4CZMA 2CH5A 4BDPA 2X6SA 1BGXT 2NY8X 3CJBA 1SZ2A 2E2QA 3CCLN 3AV9A 2QW9A 1BO5O 2HBKA 3SMPA 1NE5A 1NRAA 3VQBA 2P9IB 4WQ4A 3O4QA 4BR4A 1HUXA 1T3VA 1TK0A 1JXBA 1DLOA 3AVJA 3I0RA 1ZBIA 2QKKA 3MX2A 4DSKA 1SN1A 1ZBSA 2DPNA 3G6EN 4E7LA 1ZC6A 4QS8A 4N47A 2E2NA 1WBBA 1ZBUA 2QWRA 2HB5A 1TKTA 1UAXA 3J7ZO 5EVZA 3ENBA 3ZSVA 5KGXA 4E19A 3FGUA 4BR5A 4CZKA 4B1UB 1ZBHA 1GOAA 2Z1JA 1C1CA 3JSMA 4JKGA 4JI1K 2XY5A 2HOEA 1I39A 3VQ8A 4FM0A 3QEXA 3T69A 1RDWX 1KQSM 2D1KA 1IKWA 4JKBA 1IV0A 3CCVN 1XMOK 3LP2A 3H3NO 3KLHA 2O8CA 4IFYA 5M1PA 4KHNA 4FZXC 4FJ7A 1XNQK 1VQ4N 3M3ZA 2YV0X 4E1JA 4FJ9A 3T1YK 3C95A 3FR0A 5M1FA 2F9TA 4CGFA 4M3YA 3GKUA 5AQLA 5JS1A 5KPRA 3CIPA 1S9GA 4ID1A 2P1JA 4Z4FA 3NF9A 4X64K 1E3MA 1VSEA 4GV3A 4Z4GA 5J2QA 2CH6A 4PUOA 3DLHA 4QS9A 4B9MA 1IKYA 4CJSA 1WAJA 1TVRA 3GBTA 3CC4N 4BDZA 3THXA 3SPYA 2DFFA 1B7DA 4DSLA 4E7JA 2KKZA 4JHDB 4K25A 4CZJA 1KD1O 5BPNA 5AQHA 3VQAA 5M1QA 1UOCA 4M7XA 2HHQA 3ZSWA 2YC1C 4X65K 3L2QA 4KBOA 1NK8A 3NBPA 4FLWA 3TR8A 2E2PA 3ZEUA 4LF5K 3WXJA 3D6RA 1CXQA 3LP1A 2E88A 2YILA 1X9SA 1YITN 3DOLA 2E20A 4HHTA 1Q81O 4H0PA 2NRVA 4FCYA 3SPZA 4F2RA 1VSHA 1NMDA 3SZ2A 4G1QA 4BQLA 4PKGA 4AHRA 2OPPA 3E66A 4IXCA 5C12A 4L8RB 4I6MA 1OMYA 3CPEA 5J1EA 2IGIA 4H0VB 1GOBA 3VTHA 3CCSN 4BWJA 4I7FA 4B9QA 3ULDA 3EZWA 4E1MA 4C8NA 4CHYA 4EHUA 4DV2K 3MMVA 3O6WA 2FF3B 4B08A 3VMFB 3ID8A 3C0BA 2IC3A 3LDOA 4I2QA 2QWPA 3B6PA 3K9KA 5CZ2A 4AILC 2AP1A 1IKVA 4PKHA 5JMVA 3KKRA 4DV0K 4DR2K 4CERA 4DV1K 1YHQN 4U7BA 3VPZA 3G71N 4BDYA 2GEMA 3KOXA 3OY9A 1D9DA 1C0MA 4DTRA 3DXKA 1WN7A 3WEEB 1S5JA 3P4IA 4W5RA 2PYJA 4OPKA 3FZFA 4JD2B 1VSDA 3V9SA 5CY4A 3THYB 4RWTA 4LSNA 3K5MA 4JI5K 1TUUA 1NH5A 3DAWA 2I61A 4ISFA 5LJWA 1KFSA 1JXEA 1NGHA 1DTQA 3HVRA 4DMNA 4HHFA 3KK2A 4KKOA 2XRIA 4FLZA 2O8FA 1WSIA 1QSSA 5HOOA 1EKEA 4ISGA 1DKGD 4DQIA 1W0HA 3H46O 1I94K 2NRTA 3AVMA 4CJUA 4BR7A 2C1GA 4C1NI 3VEZA 3W0LA 5JLFA 4HVJA 2YHYA 1HYZA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1LQQ A;  2Q3S A;  1N5Y A;  3CJ7 A;  3MCA B;  1HJO A;  3MEG A;  2ATB A;  1S1W A;  3HST B;  3CC7 N;  3P1G A;  1VK0 A;  3K57 A;  3S3M A;  1HPZ A;  4YOU A;  4BVP A;  2QWQ A;  4EP5 A;  2UXC K;  5M1K A;  1EWR A;  2WC9 A;  1QZ5 A;  4GMJ B;  5LY3 A;  4IG3 A;  4YOY A;  1JLE A;  2HST A;  3NE6 A;  4Y1C A;  2DFH A;  3V1R A;  1ZVE A;  3H6E A;  1C0T A;  2F9W A;  1VSL A;  2RHK A;  4Q0B A;  2QWN A;  1K73 O;  1RTI A;  2X78 A;  3AO1 A;  1KLM A;  4Y1D A;  1HNZ K;  1T7E A;  3SF4 D;  4HTL A;  4KTZ A;  4BE1 A;  3SUQ A;  1KAX A;  4CI6 A;  5HRP A;  4JS4 A;  4E7H A;  1X9M A;  1OVQ A;  2UUB K;  1MWK A;  1NU0 A;  2P9S B;  1ZYQ A;  2Q36 A;  4KHU A;  2ZGZ A;  3MED A;  4B1V A;  5FPN A;  3FZK A;  1KTQ A;  5D3G A;  1AHO A;  3KWI A;  5C2D A;  4LFB K;  3ZT0 A;  1P8Z A;  4X66 K;  1VQK N;  1IG8 A;  4LFC K;  4DTO A;  2KYQ A;  4XIU A;  5BRD A;  3J80 O;  4KFB A;  2KFZ A;  5MLC Q;  4UQG A;  3S41 A;  3HZ6 A;  1YJ9 N;  3OYC A;  1WSG A;  4DLE A;  1SL1 A;  2LJ7 A;  4RTF D;  5JS2 A;  3HBT A;  4CGH A;  3BF1 A;  5FRN A;  1LCU A;  2YEO A; 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