5AQOA

Fragment-based screening of hsp70 sheds light on the functional role of atp-binding site residues
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
381
structure length
381
Chain Sequence
MSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Chaperone
molecule keywords HEAT SHOCK COGNATE 71 KDA PROTEIN
publication title A fragment-based approach applied to a highly flexible target: Insights and challenges towards the inhibition of HSP70 isoforms.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 120
structure length 381
sequence length 381
chains with identical sequence C, E
ec nomenclature ec 3.6.3.51: Transferred entry: 7.4.2.3.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5aqoA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqoA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqoA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5aqoA04
2H3GX 1TUYA 3F9MA 2V7YA 4BR2A 5AQIA 5AQXA 3M1FA 2BTFA 4AM6A 1P8ZA 2ASOA 1NGDA 3H45C 4FWLA 1SAZA 2P9LB 1YAGA 3CJ1A 3VEVA 2V52B 3W0LA 2P9LA 3DAWA 1NGJA 3ATUA 3ZETB 3SJHA 3IFRA 4ISFA 4ISEA 5AQQA 3ZETA 3WT0A 4BRGA 3EO3A 1Q18A 3H3NO 4FWNA 4I6MB 2Q0RA 4I6MA 2PAVA 3SMPA 1C0GA 3ZEUB 3GOIA 4BREA 4EIAA 2YHXA 1DGKN 2GELA 3DWLA 5JMVA 5LY3A 3G25A 5AQYA 2QWPA 1GLFO 2HF3A 3MDQA 1SQKA 4CD1A 1HX1A 3O08A 1J6ZA 1ZC6A 3CETA 1KAYA 1ATNA 4BRIA 1GLDG 3A5LC 4M7YA 2IIRA 4CZIA 3CHWA 1NGGA 4CZMA 3O1BA 4H0OA 5CE3A 1MA9B 1SZ2A 4JD2B 4QS9A 3WQUA 3O8MA 1ZXOA 3DXKB 3M3ZA 3CQYA 5AQRA 4JD2A 2ZGYA 3VGKA 3DXKA 2A3ZA 4DB3A 2QWLA 4BR0A 2FSJA 1YXQA 3QDKA 3R9PA 4BRMA 4DHYA 5BRHA 1NM1A 4HWIA 4H5RA 2F9TA 5BRFA 1YVNA 5KQ8A 4K41A 1ATSA 3C7NB 4IJNA 4MO4A 4WQ4C 3WUHA 3TU5A 3WXKA 3ULEB 4BQLA 3C7NA 2YHYA 2YJEA 5AQLA 2WUSA 3ZX0A 4CBXA 3ULEA 1R59O 4FWSA 2E1YA 2CGJA 2P9KA 4RWTA 1DKGD 5F2RA 2QWMA 3EKSA 4BRCA 2D0OA 4BVPA 4B1XB 2FLOA 1HUXA 4GY2B 4YDUA 4AM7A 4Y0WA 3UKUB 2VYPA 3ZX3A 3CQXA 3UKUA 1RGIA 4JAXA 4FWPA 3BF1A 3WQTA 5AQMA 4BRLA 4BRHA 1HLUA 3LM9A 4IZ9A 4CI6A 2D4WA 3MN9A 5LJWA 1IJJA 3MMVA 1XQSC 3RSEB 3A5OC 4J8FA 3BUZB 3RSEA 4XH4A 2E2NA 2E88A 4FWOA 3VESA 3U4LA 1TUUA 1GLLO 3ATVA 2VWBA 4EAHD 3FZFA 3EZWA 3A0IX 4FOEA 4H0TB 5I9EB 4BG9A 3SK3A 3HM8A 4B9QA 3H6EA 5KQDA 1GLAG 3W3DA 3QBXA 2Q2RA 5BPMA 3CI5A 3M6GA 3ZX2A 1HPMA 4H5TA 4H0VB 4FO0A 5FPNA 2QWRA 3EKUA 1GLJO 2E2OA 3VEWA 2P9PB 1X3MA 2IVOA 4BC3A 2NLXA 2P9PA 3I8BA 5LJVA 3FFKB 4BR5A 4FSVA 3FZKA 3QICA 5B8HA 1HKGA 3GG4A 1T6DA 5AQPA 4PKHA 2E1ZA 5KPRA 4H5WA 2Q97A 4B1ZA 3GDQA 2D1KA 3AY9A 4H0PA 4O8KA 4FWKA 5AQHA 3DJCA 5KPTA 2E2QA 5JLHA 5BPLA 5AQWA 1JCEA 3WXIA 3R6MA 4M63C 3L0QA 2AP1A 4WQ5A 1QZ5A 1T6CA 3GBTA 4BRQA 4KBOA 4BRFA 5AQSA 4M7XA 3UE5A 2W40A 3VERA 1U2VB 4BG8A 1Y64A 2P9IB 1U2VA 5KPZA 3O4WA 2P9IA 4CZHA 3MN7A 4C23A 3FZMA 3A8YA 1NGBA 4CZGA 3EN9A 1T44A 4JHDB 3HZ6A 2YHWA 3U8XA 4JHDA 5E84A 2HF4A 4BR4A 5F1XA 4H5NA 2NZTA 4GNIA 5JICA 2HMPA 2HOEA 3VEXA 1NMDA 3LM2A 3HTVA 3LL3A 4B1WB 1NGCA 2D0PA 4BC2A 3GE1A 4DCHA 1ZBSA 4FL9A 3HBTA 1HKBA 1HKCA 2Q36A 3IDHA 2V7ZA 1GLEG 4BR7A 4BGBA 5ADXA 2A6AA 4H0YB 1NWKA 3VPZA 4K25A 1X9JA 5AQGA 2P9KB 4EHTA 3TPQA 3KHYA 3DXMB 4FPAA 4MO5A 1NLVA 4PKIA 4BR9A 3DXMA 4CZEA 2YJFA 4H0XB 5BR9A 5BPNA 2A40A 3IMXA 4FPBA 4CZLA 1WUAA 5AZJB 1XUPO 4F9OA 1XC3A 2ZF5O 2UYTA 5AZJA 3SLCA 2E2PA 3QMLA 1BU6O 2W41A 1CZAN 4HTLA 4XEIA 3VGLA 1DEJA 3VEZA 1YUWA 2J4RA 3FE1A 4CZJA 4JNEA 3I33A 4CZFA 5AQFA 3CERA 3HSCA 2QM1A 5AQZA 2ZWHA 1QHAA 3QFPA 3MK6A 1NBWA 2P9SB 3B8AX 2QXLA 2P9SA 4BC5A 4MLHA 2QWOA 2E20A 5ELZA 1C0FA 4BROA 4CD3A 5AQTA 2GWKA 3IUCA 2CH5A 1RFQA 3O1WA 2GEMA 1BDGA 3CJ9A 3FZLA 2IVPA 4YDUC 2A5XA 2EWSA 1QQOA 1TYQB 2Q0UA 2V51B 4CZKA 1TYQA 3VETA 4BRPA 1LCUA 1GLBG 4IWVA 3CJCA 2KHOA 1HJOA 4CJ7A 5EVZA 3MN5A 1QQMA 4FWQA 2OANA 5AQUA 2P9NB 4QS8A 2ITMA 2F9WA 4H5VA 2P9NA 4B1YB 3JXUA 5BN9A 5AFUH 1K8KB 3VENA 5FPDA 4BRKA 4H03B 1K8KA 5AQKA 3VGMA 3VOVA 4K42A 1BOTO 3SMSA 3D2EB 5TKYA 3CIPA 3CJBA 4QS7A 4BVOA 3D2EA 3QBWA 1E4FT 3HI0A 1D4XA 1NGIA 2E8AA 3BF3A 1KAZA 1KXPA 3ENHA 3LDQA 3H3OB 4MLEA 5AQJA 3J8AA 1OKJA 5AQNA 3EL2A 1ESVA 2IVNA 4L3QA 4DQ8A 3L6QA 3KVGA 3WXLA 2I7NA 4PL8A 4ISGA 1V4SA 3BP8A 2A42A 3JS6A 4WYBA 2P9UB 5FPMA 4EFHA 5F0XA 3ZEUA 2P9UA 1MWMA 2CGKA 4IXCA 4WQ4A 3VEYA 2I7PA 3LDNA 3UKRB 2ASMA 4K43A 4NO7A 4O5FA 4BRAA 2ZGZA 4A2BA 1Z6RA 4JN4A 3UKRA 1MWKA 2ASPA 3C0BA 5EX5A 3MCPA 3BEXA 4A61A 3ENOA 1BO5O 1S3XA 3KZBA 4RCHA 3U9ZA 2GWJA 1MDUB 3U9DA 3CJ7A 4PL7A 3CJAA 4WQ5C 4NB4A 3H1VX 4XH5A 1WOQA 4FWRA 3VF2A 3WEEB 5EOYA 2CH6A 1U6ZA 5AR0A 3WEEA 4A62A 4Z94A 2QWQA 2GUPA 1JCFA 2PBDA 1S22A 2QWNA 1BWFO 4BRDA 3AAQA 5EY4A 3AARA 1NGHA 1H1VA 3D2FB 1NGEA 3O5BA 3FZHA 3D2FA 4XH1A 4CBWA 3QFUA 2Q31A 4BC4A 2FSNA 3ID8A 1NGAA 4IO8A 3LDLA 1Z05A 2CGLA 4B1UB 1G99A 4BRNA 4EHUA 2VCPA 3VEOA 5EXWA 1BUPA 3L4IA 3O6WA 3VF6A 3VF4A 2YI1A 1V4TA 2DPNA 3R8EA 2FXUA 5JLFA 1BA0A 5FPEA 3LDOA 4PKGA 2FF6A 3AAPA 4A2AA 4BQZA 1EQYA 1LOTB 1E4GT 3QB0A 5BN8A 4LC9B 5ADXH 3A5MC 1QQNA 1BG3A 3FR0A 2A41A 4B1VA 4CBUA 5AFUA 5BREA 5AQOA 5AQVA 4FOIA 1NGFA 3FGUA 1GLCG 2GTDA 1JCGA 2FF3B 1X3NA 3P4IA 4BGAA 2FSKA 5BRDA 2YCHA 2Q1NA 1BA1A 3H46O 4FWMA 3S41A 1KAXA 2NRHA 5AZIB 3D7EO 1QZ6A 4RTFD 5AZIA 1ATRA 1IG8A 1RDWX 3FLCO 2QW9A 3LDPA 3OHRA 3GL1A 4IJAA 3WXJA 3H1QA 5E26A 3UB5A 4E1JA 3O80A 3A5NC 3MN6A 2AA4A 2BUPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4A5BA 2PZSA 2O4GA 4M3WA 3EZ5A 4Y1CA 2BTFA 4E19A 2RPIA 1NGDA 1IKWA 4KO0A 4CJQA 2P9LB 3VEVA 3I55N 3L2UA 3QI7A 5FRMA 1HJRA 3ZSWA 4HCCA 3SJHA 1YTUA 4ISFA 3EYZA 1RBRA 3WT0A 3KK3A 4LFBK 3EO3A 4FWNA 4I6MB 3HK2A 1GPSA 4DMNA 1VSEA 4CJLA 3K9KA 1Q86O 3ZEUB 3D45A 2KBHA 5C25A 4CD1A 1KVAA 1T1TA 4DTMA 4NYFA 1N33K 4FYDA 2HHVA 1JZBA 1S5JA 2C1GA 3THWA 4CZIA 4KHWA 1M90O 1TK8A 1RT4A 3AVFA 2OZMA 4KHPK 2NRZA 3LWLA 1VQ8N 1QVGM 3ZLJA 3LZJA 1B9FA 2HHIA 4DHYA 5BRHA 3M8SA 1J54A 4HWIA 2F9TA 1YVNA 3QINA 1WNSA 3DOLA 3OYFA 2LJMA 3ULEB 3WXKA 3C7NA 3N4QA 2YC1C 2WUSA 1R59O 5KRTA 4GV9A 1DKGD 5F2RA 1B9DA 4BRCA 2D0OA 4BVPA 4B1XB 4KH5A 2NNWA 4YDUA 2ETJA 2OTLN 1QSSA 4HUFA 4CK2A 2HNDA 1IKVA 1HNXK 4O55A 1NK7A 2D0BA 3J7AP 4W5QA 1NKBA 4B3RK 2D4WA 3QEWA 3MN9A 5LMUK 4FJXA 1RDDA 1XQSC 1L3SA 3RSEB 5T7BA 3TABA 4B8CA 1S1UA 4CEDA 1LWCA 2W42A 1J9AA 4YY3K 3KP0A 2E2NA 4IDKA 2E88A 4KTWA 3ZSQA 1D9FA 3DLKA 2QA4N 3E1YA 3S3NA 3OW2M 3ATVA 4EAHD 3RRHA 3FZFA 3EZWA 4KPYA 1LAVA 4B9QA 3OYEA 4DU1A 3HO1A 3V9XA 2Q2RA 3M6GA 5SWMA 1Q82O 4H0VB 1PX9A 2OCEA 4ID5A 2QWRA 3EKUA 3VQ5A 3VEWA 1ZVEA 2IVOA 1TAQA 2OPSA 3OBWA 3KC6A 3P83D 3I8BA 4LFCK 2HBJA 3FFKB 5EU7A 3SAFA 3G0ZA 1RT2A 5C42A 1CZ9A 1EWQA 1T6DA 5AQPA 1NK9A 5CYMA 2UXBK 2W00A 1CXQA 4FWKA 2O8EB 5AQWA 1JCEA 4ZHRA 1X9MA 4FJKA 1WSGA 1EXQA 5H1SQ 1XNRK 1U49A 5J2QA 1POIA 1T6CA 2W6LA 3GBTA 2O8DB 4BRFA 2IS3A 3G4SN 2RE2A 2NRRA 3LAKA 3UE5A 2YX6A 4E0DA 4FM1A 4BG8A 5HOOA 1OMYA 3A2FA 3AO2A 3O3FA 1C6VA 2P1JA 1WN7A 4DR7K 1O13A 4FLZA 1HYSA 4JHDB 3DLEA 2O8FB 2HNZA 4ELTA 3MEEA 4DSEA 5C24A 2DFEA 3S9HA 2HMPA 2HOEA 5KGXA 1QS4A 1P0AA 3KKSA 2YEOA 3LL3A 4B1WB 4BC2A 4AHRA 3LZIA 4B9UA 3HBTA 1HKBA 1HKCA 3IDHA 4DG1A 4CGFA 4CF8A 5M1PA 2LJ7A 3VPZA 2EX3A 4OLAA 3DLRA 1BIUA 4FJLA 4BE7B 4L8RB 4BECA 5J2PA 5BR9A 5BPNA 3IMXA 4C8MA 4DV3K 1XC3A 5KTQA 3BZCA 4JKFA 2E2PA 4DV1K 5M1KA 4OPAA 4CW7B 4M3UA 1NKCA 1YJWN 3KJVA 3CC7N 4DWIA 4HVJA 3FE1A 1RBUA 3LP0A 4F2SA 5AQZA 5CY4A 4Z4IA 3CCJN 2UUBK 2D56A 3SYZA 4BY9C 4V1DC 2QXLA 2P9SA 4BC5A 2E20A 1C0FA 5AQTA 4MDAA 1GOAA 4QAGA 3OYNA 2YILA 4J2BA 3O1WA 3VQDA 2HHHK 3KOZA 1PTXA 1IO2A 1KLMA 2IVPA 4YDUC 2A5XA 2YKNA 1IBMK 3HM9A 3WNEA 2XY8A 2F96A 2Q0UA 4LH5A 2G8WA 1JLBA 1TYQA 3VETA 4BRPA 4DV4K 2OYQA 2PYLA 4OPHA 3CJCA 3ZSOA 4J2AA 3L2WA 1SUQA 4JI6K 4E89A 4CJ7A 4Z4HA 3AGRA 1JL2A 1SKRA 1XHXA 5AQUA 4H5VA 2P9NA 4C8NA 3E01A 3R2VA 5BN9A 4CJKA 5FPDA 1SL0A 4H03B 3VN5A 1K8KA 4IEEA 3NGZA 3QESA 4ZTJA 1Q7YO 3HOSA 4LH4A 3CJBA 4QS7A 4BVOA 4J2DA 1VQKN 1SV5A 2N2QA 3TTCA 1HPZA 1D4XA 4PWDA 2E8AA 4M3XA 3DYAA 2Z1JA 2N66A 3IRXA 1KXPA 3ENHA 1DQ7A 3OVNA 1RTHA 2ZJPL 5AQNA 4JEPA 2IVNA 5HRRA 3WXLA 3PUFA 3THXA 4TSXA 5FDLA 3V6DA 1VQ5N 1QE1A 2JWKA 4EP4A 4WYBA 3OYJA 3TI0A 3RR8A 4FJHA 2CGKA 4WQ4A 3LDNA 3VQ7A 4GV3A 4O5FA 3LANA 2ZGZA 1Z6RA 1MWKA 3KLEA 2ASPA 2PYJA 2HHTA 3BEXA 4CIFA 4FLUA 1VQMN 2ZD1A 4M3RA 3T1AA 3ALYA 4GKJK 3NH2A 1S9EA 1WLJA 5KGWA 1VNAA 1HNIA 1RT1A 1BQMA 3EEQA 1M1KO 1C0MA 3KIOA 4FWRA 3KD1E 4AHCA 1VRTA 1WSIA 1U6ZA 5EOYA 4AILC 2GUIA 2OPPA 4Z4FA 2M8BB 5EY4A 3AARA 3B6OA 3KK2A 4I2PA 1H1VA 2ZM6K 1Z26A 2OA8A 4W5RA 3D2FA 4CBWA 2A1RA 3NGIA 3AVCA 2FSNA 3OY9A 4A5AA 1Z05A 2CGLA 2HBMA 2VCPA 3U3YA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 3WEE A;  4A62 A;  4Z94 A;  2QWQ A;  2GUP A;  1JCF A;  2PBD A;  1S22 A;  2QWN A;  1BWF O;  4BRD A;  3AAQ A;  5EY4 A;  3AAR A;  1NGH A;  1H1V A;  3D2F B;  1NGE A;  3O5B A;  3FZH A;  3D2F A;  4XH1 A;  4CBW A;  3QFU A;  2Q31 A;  4BC4 A;  2FSN A;  3ID8 A;  1NGA A;  4IO8 A;  3LDL A;  1Z05 A;  2CGL A;  4B1U B;  1G99 A;  4BRN A;  4EHU A;  2VCP A;  3VEO A;  5EXW A;  1BUP A;  3L4I A;  3O6W A;  3VF6 A;  3VF4 A;  2YI1 A;  1V4T A;  2DPN A;  3R8E A;  2FXU A;  5JLF A;  1BA0 A;  5FPE A;  3LDO A;  4PKG A;  2FF6 A;  3AAP A;  4A2A A;  4BQZ A;  1EQY A;  1LOT B;  1E4G T;  3QB0 A;  5BN8 A;  4LC9 B;  5ADX H;  3A5M C;  1QQN A;  1BG3 A;  3FR0 A;  2A41 A;  4B1V A;  4CBU A;  5AFU A;  5BRE A;  5AQO A;  5AQV A;  4FOI A;  1NGF A;  3FGU A;  1GLC G;  2GTD A;  1JCG A;  2FF3 B;  1X3N A;  3P4I A;  4BGA A;  2FSK A;  5BRD A;  2YCH A;  2Q1N A;  1BA1 A;  3H46 O;  4FWM A;  3S41 A;  1KAX A;  2NRH A;  5AZI B;  3D7E O;  1QZ6 A;  4RTF D;  5AZI A;  1ATR A;  1IG8 A;  1RDW X;  3FLC O;  2QW9 A;  3LDP A;  3OHR A;  3GL1 A;  4IJA A;  3WXJ A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4A5B A;  2PZS A;  2O4G A;  4M3W A;  3EZ5 A;  4Y1C A;  2BTF A;  4E19 A;  2RPI A;  1NGD A;  1IKW A;  4KO0 A;  4CJQ A;  2P9L B;  3VEV A;  3I55 N;  3L2U A;  3QI7 A;  5FRM A;  1HJR A;  3ZSW A;  4HCC A;  3SJH A;  1YTU A;  4ISF A;  3EYZ A;  1RBR A;  3WT0 A;  3KK3 A;  4LFB K;  3EO3 A;  4FWN A;  4I6M B;  3HK2 A;  1GPS A;  4DMN A;  1VSE A;  4CJL A;  3K9K A;  1Q86 O;  3ZEU B;  3D45 A;  2KBH A;  5C25 A;  4CD1 A;  1KVA A;  1T1T A;  4DTM A;  4NYF A;  1N33 K;  4FYD A;  2HHV A;  1JZB A;  1S5J A;  2C1G A;  3THW A;  4CZI A;  4KHW A;  1M90 O;  1TK8 A;  1RT4 A;  3AVF A;  2OZM A;  4KHP K;  2NRZ A;  3LWL A;  1VQ8 N;  1QVG M;  3ZLJ A;  3LZJ A;  1B9F A;  2HHI A;  4DHY A;  5BRH A;  3M8S A;  1J54 A;  4HWI A;  2F9T A;  1YVN A;  3QIN A;  1WNS A;  3DOL A;  3OYF A;  2LJM A;  3ULE B;  3WXK A;  3C7N A;  3N4Q A;  2YC1 C;  2WUS A;  1R59 O;  5KRT A;  4GV9 A;  1DKG D;  5F2R A;  1B9D A;  4BRC A;  2D0O A;  4BVP A;  4B1X B;  4KH5 A;  2NNW A;  4YDU A;  2ETJ A;  2OTL N;  1QSS A;  4HUF A;  4CK2 A;  2HND A;  1IKV A;  1HNX K;  4O55 A; 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