5AQOA

Fragment-based screening of hsp70 sheds light on the functional role of atp-binding site residues
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
381
structure length
381
Chain Sequence
MSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Chaperone
molecule keywords HEAT SHOCK COGNATE 71 KDA PROTEIN
publication title A fragment-based approach applied to a highly flexible target: Insights and challenges towards the inhibition of HSP70 isoforms.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 120
structure length 381
sequence length 381
chains with identical sequence C, E
ec nomenclature ec 3.6.3.51: Transferred entry: 7.4.2.3.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5aqoA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqoA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqoA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5aqoA04
2IVNA 5AQVA 1BOTO 1HKGA 1NGEA 3DXMA 1KAXA 4Y0WA 4BGAA 3O4WA 4BRQA 3HBTA 3AY9A 3A0IX 5F2RA 1NWKA 3BP8A 3KZBA 4IXCA 1V4SA 5JLHA 5AQZA 1IG8A 4CBWA 3WUHA 4A2BA 3CHWA 2YJEA 2P9PB 5LJWA 3MDQA 5JMVA 4H5TA 3C7NB 3H3NO 4BRKA 4BVOA 4JHDB 3SJHA 1JCGA 3LL3A 2YI1A 3ENHA 3L4IA 1KAYA 4FWKA 1T6DA 2UYTA 3VESA 4NO7A 2P9UA 3WXKA 2J4RA 4BRGA 5BPNA 5EXWA 1GLLO 1WOQA 3VETA 3P4IA 2CH6A 4FWNA 2HF4A 3VGMA 2W41A 2HMPA 2GUPA 3CIPA 3ZX2A 1WUAA 3VEOA 2P9NB 2NZTA 2P9LB 4BRHA 4BRCA 4BRDA 1ATSA 1RFQA 4FPBA 3AAPA 1GLJO 4PKGA 4WQ4C 2ZF5O 3MN5A 2P9IA 3OHRA 5AZIA 2QWLA 3LDNA 2E8AA 4CZLA 4CBUA 2H3GX 4XEIA 3JS6A 3BF1A 4BC5A 3ULEB 4XH4A 1BWFO 2FSKA 5AQPA 1GLFO 2I7PA 3QBWA 5LJVA 2QW9A 3FZFA 2P9KB 2Q0RA 3H1VX 4O8KA 2VYPA 3CJAA 2VWBA 5AFUA 4KBOA 3RSEB 5EOYA 1Q18A 4BRNA 1ZBSA 4IJNA 3VERA 1HX1A 4L3QA 3IDHA 3HM8A 4B1VA 3EKSA 3VGLA 4H0TB 1BA0A 1YXQA 4B1YB 5BN8A 2F9WA 4H0YB 1QQOA 4BR0A 2AP1A 4IO8A 5KPZA 1TUYA 4RWTA 1K8KA 5AQLA 4H0XB 1ATRA 3MN6A 2ASMA 3WEEA 4M63C 4BVPA 3SK3A 3D2EB 3HZ6A 3CQYA 3W0LA 3C7NA 4K43A 2EWSA 1NM1A 2D1KA 4JHDA 3WQTA 2ZGZA 4BROA 4WQ5C 1BG3A 2FLOA 4BG9A 1QQMA 2FSNA 3H3OB 5TKYA 2YHYA 1NGCA 3U9ZA 3FZKA 2E1YA 1CZAN 1GLBG 1QQNA 4ISFA 3W3DA 4CI6A 3UKUB 3L0QA 4HTLA 1QZ5A 4YDUA 4EIAA 5AZJB 1Y64A 3CQXA 2Q0UA 1XQSC 2P9LA 1X3MA 2IIRA 3EN9A 1NGHA 3VEZA 4HWIA 1JCFA 2ZWHA 4AM6A 2CGKA 5AQFA 1EQYA 3LM9A 1NBWA 4ISGA 3IUCA 4MLEA 4BRMA 5ADXA 3ZX3A 1T44A 3HI0A 4XH5A 3A5MC 3ULEA 1BO5O 1GLEG 4EAHD 1SQKA 4JAXA 2E1ZA 1Z6RA 2P9KA 1SAZA 4BR4A 2QXLA 1NGBA 4CZKA 3RSEA 4I6MB 2IVOA 2YCHA 1JCEA 4JD2B 2HF3A 1NGAA 2ASPA 1C0FA 4PL8A 4BRPA 2HOEA 2BUPA 3ZX0A 3G25A 4CZMA 4BQLA 2AA4A 1ESVA 3I8BA 4GY2B 2CGJA 1NGFA 4BR7A 4BR5A 5BRHA 3VEYA 1DEJA 4C23A 3GE1A 3UB5A 3R8EA 1TYQB 3U8XA 5BRDA 2QWOA 3D2EA 3DXKA 5FPMA 1RGIA 5AQHA 4CZHA 3GBTA 5AQSA 3BEXA 4H0PA 2QWQA 4PKHA 2GEMA 1YUWA 1DGKN 2A6AA 4DCHA 5AQIA 4FOEA 4DB3A 4PKIA 2YJFA 4BC3A 4CD3A 2NRHA 3CERA 4B1ZA 3D2FB 4FSVA 4XH1A 3VGKA 5KQDA 5LY3A 4B1XB 3UKUA 3CJCA 3FFKB 1G99A 3ZETA 2VCPA 1J6ZA 2QM1A 3IMXA 5AQJA 5BN9A 2E88A 1S22A 2YHXA 1KAZA 4H5VA 5AQUA 3H6EA 4FWPA 3M1FA 3VF4A 1S3XA 1E4GT 1ZC6A 3KHYA 4BRIA 4MO4A 4FL9A 1MWKA 4FWMA 1V4TA 2ZGYA 4Z94A 1YAGA 3DAWA 1GLAG 3DWLA 3SMSA 4BR2A 5EVZA 1HPMA 2Q1NA 4I6MA 4QS8A 4K25A 5BPMA 5BPLA 5AQXA 4JD2A 3L6QA 3A5OC 1LCUA 4CZIA 2P9PA 2V7ZA 3GOIA 1ZXOA 3FLCO 3WQUA 5FPDA 5JICA 2A40A 3IFRA 3DXMB 3O5BA 4JNEA 4E1JA 3QMLA 4H03B 2V51B 3B8AX 1YVNA 4A61A 1H1VA 3CJ1A 4O5FA 4CZGA 5AQQA 2D0PA 3U9DA 2WUSA 1XC3A 5JLFA 2DPNA 1QHAA 2GWJA 1MWMA 1ATNA 1TUUA 1HJOA 2GTDA 1MA9B 4EHUA 5AQWA 3EKUA 2QWMA 4EFHA 3H46O 2Q2RA 2P9NA 2V7YA 3D2FA 3WXJA 3MN7A 4EHTA 4AM7A 4BRAA 2GELA 4WYBA 2P9UB 3VF6A 2E2PA 3MCPA 2NLXA 1GLCG 3VEVA 3ZEUB 2BTFA 3SMPA 2PAVA 4NB4A 3VEWA 1NMDA 3HSCA 5F1XA 4WQ4A 4CJ7A 2QWNA 3H1QA 4CD1A 3O8MA 2OANA 3BUZB 5B8HA 2IVPA 5FPEA 2D4WA 5AR0A 4FWSA 2FXUA 2P9SB 4MO5A 3LDQA 3CI5A 2W40A 3D7EO 4A62A 3O1BA 3TU5A 2CH5A 3FZLA 2A41A 3O08A 3QFUA 1P8ZA 1BA1A 3FZHA 3QB0A 4DQ8A 3F9MA 5E26A 1NGJA 4K42A 5AFUH 4RCHA 1U2VB 3WXIA 3QBXA 4BQZA 1X9JA 4M7YA 1BDGA 4H5WA 4BGBA 3DJCA 3QDKA 4H5RA 1HLUA 2E2NA 2F9TA 4B1WB 3TPQA 4B9QA 4FOIA 1HKBA 4BR9A 1K8KB 4QS7A 3CJBA 4IWVA 5AQNA 4CZEA 3WEEB 4JN4A 3GDQA 2FSJA 4FWLA 4FPAA 1MDUB 1GLDG 3CJ7A 3EO3A 3GG4A 4LC9B 5EY4A 4WQ5A 2ASOA 3EL2A 5AZJA 3A5NC 1BU6O 1OKJA 4YDUC 5BREA 3LM2A 4J8FA 2GWKA 5FPNA 5AQMA 5F0XA 3M6GA 3A8YA 2A3ZA 5EX5A 3FZMA 2Q97A 3UE5A 3MN9A 1BUPA 3I33A 5ELZA 4H5NA 3VOVA 3ZEUA 3S41A 3SLCA 3FR0A 4H0OA 5AQYA 1NLVA 5E84A 4BRLA 3UKRB 1NGDA 2KHOA 3LDOA 2E2OA 4FWRA 4PL7A 3ATUA 2V52B 1XUPO 3VEXA 4F9OA 4IJAA 4CZFA 2P9SA 1R59O 4BREA 5ADXH 5KQ8A 3FGUA 1HUXA 3AARA 1QZ6A 1LOTB 4RTFD 5AQGA 1IJJA 1Z05A 2FF6A 3MK6A 1U2VA 1D4XA 1TYQA 1U6ZA 1X3NA 4IZ9A 3LDLA 4GNIA 3BF3A 3WT0A 2PBDA 3C0BA 3H45C 5CE3A 5AQKA 2ITMA 3O80A 3U4LA 4M7XA 4ISEA 3EZWA 2Q36A 3ID8A 3QFPA 3MMVA 1T6CA 5AQRA 4BC2A 3WXLA 2QWPA 4MLHA 3QICA 3J8AA 2A42A 3GL1A 3DXKB 1SZ2A 4CZJA 3HTVA 3M3ZA 1RDWX 4FO0A 3O6WA 3ATVA 2FF3B 3JXUA 2YHWA 5BRFA 3KVGA 3VENA 4BRFA 1C0GA 2E20A 2D0OA 3VF2A 1NGIA 2Q31A 5KPRA 4K41A 2I7NA 3ENOA 3FE1A 3R9PA 3ZETB 4QS9A 5I9EB 1KXPA 2CGLA 3A5LC 2P9IB 4H0VB 4CBXA 1HKCA 5AQTA 3R6MA 5AZIB 4B1UB 3O1WA 4BC4A 1DKGD 2QWRA 1E4FT 3CJ9A 3UKRA 2E2QA 4A2AA 2A5XA 3LDPA 4DHYA 3AAQA 1NGGA 3VPZA 4FWOA 4BG8A 4FWQA 3CETA 5AQOA 5BR9A 5KPTA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3THXA 4YOWA 3TANA 3NBPA 4N47A 4DLEA 5M1NA 4UAFE 2UU9K 3LWLA 4DFMA 3O4WA 4BY9C 3HBTA 2GX9A 3BP8A 4CBWA 4U67L 3K57A 4CECA 3DLLL 3MXMA 3V1OA 4JYAK 1B9FA 4QCLA 1T7EA 3CMAN 1JLGA 4CJVA 3K59A 1YT3A 3KLIA 4BVOA 3ENHA 4B08A 3RMAA 1KAYA 1BQNA 1P90A 1T6DA 3VESA 4NO7A 4Q5VA 1MU2A 1SL2A 4E3SA 2P9UA 3WXKA 1W0HA 1SV5A 4C8NA 3Q7BA 4FVMA 3CF5L 4YHHK 2NZTA 1OH8A 4BRDA 2Y1JA 4DSIA 1RFQA 1HNVA 3L4QA 1NJXA 1GLJO 3KWGA 4PKGA 3ZT0A 5AZIA 3LDNA 3HPHA 2H3GX 4B9TA 1RT1A 3BF1A 2XY6A 1AYJA 4PY5A 2O8EB 2WOMA 3H1VX 2RPIA 4O8KA 4CF9A 1S72N 2VYPA 2YEOA 3ZSZA 5EOYA 2X74A 3OS0A 3OW2M 1TGOA 1HX1A 5TKWA 4DLGA 1ZYQA 3IDHA 4B1VA 5KI6A 3HJFA 3RR7A 1TKZA 4AAZA 2HNYA 2F9WA 1ASWA 4BR0A 3V9XA 5HROA 3KLGA 3MECA 1IO2A 4FJJA 3MN6A 1D9FA 2ASMA 4BVPA 3F5TA 3SK3A 3OYAA 4E0DA 3HZ6A 4DQQA 4JLHA 3CCQN 4JHDA 1R0AA 1A5WA 3O3HA 2ZJRL 1DLOA 3TARA 1BG3A 3P38A 4KHWA 3NGYA 1JZAA 5GIPA 2E1YA 3O9UA 2IS3A 4CCHA 5KK4A 1ILYA 3DRPA 1ITGA 1QZ5A 1K9MO 4QOZB 3KK7A 2YNHA 4HUGA 1Y64A 2FC0A 3CXCM 2P9LA 4FZZA 4AHTA 1VQON 4HWIA 3OYMA 2ZWHA 2CGKA 5HRNA 5AQFA 3LM9A 1NBWA 4DV6K 1W97L 5FLXO 4NXNK 4XH5A 3ULEA 1BO5O 4EAHD 4B9VA 1I39A 2P9KA 1SAZA 4CEDA 2UUBK 1VQ8N 3RSEA 4ELUA 1X9MA 4G1QA 3QEVA 2VQFK 4DUYK 2ASPA 3NF6A 4MFBA 2HOEA 3SNNA 4A5BA 3TTCA 2BUPA 3ZX0A 3G25A 4BE1A 1BQMA 1Y97A 5BRHA 1N4NA 4YNQA 4FM1A 2E6LA 5KRSA 4FVUA 4DKWA 3NVKA 4AB0A 4N5SA 1HYVA 1KFDA 3U8XA 3T7ZA 5CHIA 3I56N 3QNOA 2KZMA 4DR2K 2HHUA 5FPMA 4CZHA 1B9DA 4LF8K 3NFAA 1MR4A 2OZSA 1FK9A 3M8QA 1D8YA 3S3MA 1I6GA 2AJQA 3HOSA 1WB9A 1A5VA 3SPZA 3I0SA 4ZHRA 1RBRA 3CERA 3LZIA 5LY3A 3VGKA 4FSVA 4FZYA 3DLGA 3UKUA 1FXXA 3FFKB 3IG1A 1E3MA 1Z26A 1RT5A 4O44A 1I94K 1C1CA 5BN9A 2E88A 2YHXA 2G8HA 1XC9A 1I2UA 3H6EA 1PTXA 2EX3A 3QETA 2OTJN 2C1GA 3KHYA 4MQ3A 2E4LA 2XY8A 3AVAA 2E6MA 4RW8A 4E1NA 3SI6A 4F4KA 4Z94A 1YAGA 4BR2A 2D0AA 1JKHA 4E19A 2Q1NA 5BPMA 5BPLA 2NRRA 4Z4IA 1NKEA 3NCIA 4JD2A 4AHVA 3OYLA 5DMRA 3O3GA 4A59A 4GVEA 2KLAA 4AH9A 1S9EA 2P9PA 2V7ZA 1RDAA 1VSLA 1QQCA 1QSLA 5IWAK 4JNEA 2WFBA 4H03B 5SZTA 2YC1C 5CYMA 3THYA 2G8FA 3IAYA 1YTUA 3CJ1A 3JYTA 1JLAA 1YTAA 4DTUA 1C56A 2JWLA 2WUSA 4BECA 3N4PA 3OYJA 2GWJA 3IS9A 1TUUA 1HJOA 4DQPA 1B3CA 2G8VA 3F73A 1YJ9N 4ILJA 3EKUA 2JDQD 2LY5A 4DFKA 2P9NA 1XRSB 4AM7A 3BZCA 1JL1A 3KWIA 2QTDA 4WYBA 3M8SA 3ZSVA 1AHOA 4CFBA 2BDPA 2E2PA 4LH4A 2NLXA 1GLCG 4KH6A 4CEOA 4DV4K 3SV4A 4NB4A 3HSCA 5FDLA 3PY8A 4CESA 2XY5A 1OVQA 5HBMA 3HXMA 3O8MA 4CHOA 1SN1A 2OANA 5B8HA 4B9SA 5FPEA 2D4WA 2OCEA 4FWSA 2YV0X 3NMUA 1U04A 2P9SB 1I3AA 2W40A 4A62A 3THWB 3O3FA 3LAMA 3O1BA 2OPPA 1GOBA 3TU5A 3QERA 2HHVA 1CLQA 4FJLA 4RG8A 3TAGA 4DQ8A 1P00A 5E26A 4EZ6A 3CD6N 3SV3A 2LY6A 4BQZA 2UXBK 1BDGA 1TKTA 3DJCA 3QDKA 2F9TA 4B1WB 1TK0A 1HKBA 1S1TA 2B3CA 1Z25A 3NVMA 4JKHA 3WEEB 4JN4A 3CCUN 3RMCA 3AVFA 2E3GA 1BCMA 4BWMA 1KLMA 1MDUB 2YX6A 2G8WA 2QXFA 2E2FA 1PE4A 3GG4A 4KI4A 4WCEL 3EL2A 1JZBA 4YOVA 3LM2A 2GWKA 5FPNA 2Q3SA 2W6KA 1WNSA 3V81A 1TVRA 3UE5A 2I61A 3ZEUA 3FR0A 1JJ2M 1DQ7A 2QEXN 2R7YA 1C0TA 1LQHA 2KHOA 1ZU3A 4YOYA 2E2OA 4FWRA 3KLHA 2JLEA 3VA3A 2HBMA 4ZTJA 2V52B 4CZFA 1RT7A 2ZM6K 4J2BA 4JKGB 1N6QA 4CHZA 3HM9A 1Q9YA 2RE2A 5HP1A 4J2AA 3SQ2A 3OYEA 3AGKA 4RTFD 5C10A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 1NGG A;  3VPZ A;  4FWO A;  4BG8 A;  4FWQ A;  3CET A;  5AQO A;  5BR9 A;  5KPT A; 
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 3THX A;  4YOW A;  3TAN A;  3NBP A;  4N47 A;  4DLE A;  5M1N A;  4UAF E;  2UU9 K;  3LWL A;  4DFM A;  3O4W A;  4BY9 C;  3HBT A;  2GX9 A;  3BP8 A;  4CBW A;  4U67 L;  3K57 A;  4CEC A;  3DLL L;  3MXM A;  3V1O A;  4JYA K;  1B9F A;  4QCL A;  1T7E A;  3CMA N;  1JLG A;  4CJV A;  3K59 A;  1YT3 A;  3KLI A;  4BVO A;  3ENH A;  4B08 A;  3RMA A;  1KAY A;  1BQN A;  1P90 A;  1T6D A;  3VES A;  4NO7 A;  4Q5V A;  1MU2 A;  1SL2 A;  4E3S A;  2P9U A;  3WXK A;  1W0H A;  1SV5 A;  4C8N A;  3Q7B A;  4FVM A;  3CF5 L;  4YHH K;  2NZT A;  1OH8 A;  4BRD A;  2Y1J A;  4DSI A;  1RFQ A;  1HNV A;  3L4Q A;  1NJX A;  1GLJ O;  3KWG A;  4PKG A;  3ZT0 A;  5AZI A;  3LDN A;  3HPH A;  2H3G X;  4B9T A;  1RT1 A;  3BF1 A;  2XY6 A;  1AYJ A;  4PY5 A;  2O8E B;  2WOM A;  3H1V X;  2RPI A;  4O8K A;  4CF9 A;  1S72 N;  2VYP A;  2YEO A;  3ZSZ A;  5EOY A;  2X74 A;  3OS0 A;  3OW2 M;  1TGO A;  1HX1 A;  5TKW A;  4DLG A;  1ZYQ A;  3IDH A;  4B1V A;  5KI6 A;  3HJF A;  3RR7 A;  1TKZ A;  4AAZ A;  2HNY A;  2F9W A;  1ASW A;  4BR0 A;  3V9X A;  5HRO A;  3KLG A; 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