5AQSA

Fragment-based screening of hsp70 sheds light on the functional role of atp-binding site residues
Total Genus 119
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
119
sequence length
382
structure length
382
Chain Sequence
SMSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Chaperone
molecule keywords HEAT SHOCK COGNATE 71 KDA PROTEIN
publication title A fragment-based approach applied to a highly flexible target: Insights and challenges towards the inhibition of HSP70 isoforms.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 119
structure length 382
sequence length 382
chains with identical sequence C
ec nomenclature ec 3.6.3.51: Transferred entry: 7.4.2.3.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5aqsA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqsA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqsA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5aqsA04
4O8KA 2P9PB 4FWSA 4H0VB 3SK3A 4BC5A 3BUZB 4B1XB 2QWRA 4KBOA 2Q31A 3QB0A 5AQWA 2Q0RA 4EFHA 1JCGA 1X3MA 3CJ1A 1MWMA 3D7EO 4QS8A 4A61A 4IWVA 2NRHA 1IJJA 4CZKA 1ZC6A 5AQPA 3FZHA 3WXJA 4BC4A 1T44A 1CZAN 2E8AA 5AQXA 3A0IX 2J4RA 2EWSA 4FWMA 5EVZA 4BRKA 5KPRA 2PAVA 3JS6A 4RTFD 4PKGA 3L4IA 3EN9A 4PL8A 2D0PA 3GOIA 1BUPA 3HBTA 1T6DA 3R6MA 5BN8A 1C0GA 4HTLA 5AQJA 2YJEA 1HPMA 1H1VA 3MN7A 4CZLA 1KAZA 4BRCA 4H5VA 5AQIA 2VYPA 4FPAA 1R59O 1GLJO 2FF3B 3MK6A 5KPTA 3F9MA 4MO4A 2ASOA 1TUYA 3H45C 3A8YA 5AZIB 5ADXA 3KHYA 1G99A 4IJNA 3UE5A 3VETA 4M63C 3FLCO 5JLFA 4RCHA 5FPMA 3LDNA 2FF6A 3AY9A 4O5FA 1WUAA 2BUPA 1DEJA 1NGDA 1E4GT 3ZX0A 5TKYA 1SAZA 4CZFA 3ZETA 2D4WA 4CBWA 4XEIA 3CETA 4PKHA 2ZGYA 3H1QA 3SMSA 4BQLA 2E2OA 5AFUH 4EHUA 4CI6A 3BEXA 1BOTO 5KPZA 1Q18A 3J8AA 5AQQA 3H3OB 2P9PA 4WQ5C 3OHRA 3R8EA 1HLUA 4CBXA 2A5XA 4BQZA 5AQYA 3D2EB 1C0FA 1S3XA 1NGEA 4B1ZA 3EZWA 1LOTB 5KQDA 5FPDA 5FPEA 1BG3A 1XC3A 1HKBA 4YDUC 3A5OC 5BRDA 1YUWA 5BRFA 2P9NA 2HF3A 4FWOA 2E2PA 3CJBA 3ENOA 4BROA 3U9ZA 2P9IB 1BU6O 4BR9A 4A2BA 1WOQA 5AR0A 3H46O 2I7PA 2YCHA 3VGKA 5AZIA 4DQ8A 3EKSA 4BG8A 2A41A 5LJWA 1QZ6A 4WYBA 3WT0A 4Z94A 1P8ZA 5B8HA 4H5WA 1V4TA 2QXLA 4JN4A 1OKJA 3GG4A 1LCUA 5AQKA 3O8MA 5ADXH 4B1YB 2CH5A 3QFUA 4BRNA 2NZTA 3TPQA 2QM1A 5AQLA 4JHDB 1E4FT 3A5MC 3VEYA 3O08A 1NGCA 2NLXA 3VGMA 2V7YA 2IIRA 3VEWA 3VGLA 4FWQA 2KHOA 1NGAA 2D0OA 4IO8A 1QHAA 2ZGZA 2YHWA 3VESA 3ATUA 3A5NC 3I8BA 4B9QA 4EHTA 4CZMA 5KQ8A 5FPNA 4CZJA 3O5BA 2GUPA 3FGUA 4Y0WA 3D2EA 1DKGD 3H6EA 1GLEG 2FSNA 3GBTA 3DAWA 1JCEA 3UKRB 3WQUA 4BRIA 3DWLA 5AQOA 4K42A 1GLFO 2F9TA 3ENHA 4WQ4C 3LL3A 4JNEA 3ZX3A 2IVOA 2P9NB 4WQ5A 2ZF5O 3HI0A 1RGIA 3TU5A 3ID8A 4CZGA 2QWPA 3M3ZA 3VF4A 1ATNA 4H5TA 1T6CA 1MWKA 4A62A 3VERA 1NGJA 2YI1A 4BREA 2P9IA 5BPMA 3EO3A 2E2NA 4BRMA 4H5NA 3C0BA 3UB5A 1Y64A 4A2AA 4FWRA 2QWNA 3CI5A 3QBWA 4C23A 1ATSA 4DB3A 4FWNA 1Z05A 4YDUA 3VEZA 4BR2A 4BGBA 4B1WB 2P9KB 2CGKA 1NGHA 3GL1A 3W0LA 3WXIA 2ASMA 4BRHA 2WUSA 4XH1A 3WEEA 2YHXA 3FE1A 4GNIA 2CGJA 4H03B 4H0PA 3U4LA 2IVPA 4JHDA 3L6QA 1NMDA 2HMPA 3QICA 3KVGA 2FLOA 3MMVA 1GLBG 3FZFA 4H0YB 3FR0A 5I9EB 5AQRA 4BRPA 3VOVA 5F0XA 1DGKN 1QZ5A 4CD3A 3VEOA 1QQOA 4JAXA 3CIPA 1TUUA 3CERA 1SZ2A 2P9SB 2V52B 3ZEUB 3SJHA 1MA9B 1HKCA 2I7NA 2YHYA 1GLCG 3O80A 4FWKA 3LDOA 4B1UB 3UKRA 4K25A 2ITMA 2A40A 2QW9A 3WXLA 5EXWA 2Q0UA 5ELZA 3SMPA 3ULEB 4K43A 3D2FB 4CD1A 1ZXOA 3UKUB 3VF6A 4F9OA 3ZX2A 4DCHA 4E1JA 4IJAA 5LJVA 3S41A 4BVPA 3SLCA 3FZMA 4BR4A 4I6MB 4MLEA 4WQ4A 3LDQA 2A3ZA 2VWBA 1HKGA 5BN9A 3CJCA 4DHYA 5CE3A 3VEVA 4JD2B 1RDWX 2VCPA 2OANA 2P9KA 3MN5A 2P9UB 3U8XA 1K8KB 4RWTA 4MO5A 4H0TB 3VENA 2PBDA 3ATVA 3QFPA 2YJFA 3O6WA 4FO0A 3WEEB 3GE1A 1X3NA 1NBWA 5AQTA 3WXKA 1ATRA 4AM6A 2F9WA 5AFUA 4ISFA 1XQSC 3A5LC 2P9LB 5BREA 3DJCA 2E2QA 2E88A 2Q2RA 4LC9B 4PKIA 3M6GA 1GLDG 3DXMA 3RSEB 3MN6A 4BGAA 4FWLA 4CBUA 5LY3A 2QWQA 3VF2A 2P9SA 4IXCA 3ZEUA 4BC2A 3FFKB 5BRHA 1EQYA 4IZ9A 1GLLO 3H3NO 3I33A 1KXPA 1BA1A 2HOEA 1YXQA 5AQZA 5BPNA 4H0OA 5AQSA 3QBXA 3H1VX 5E26A 2UYTA 3U9DA 1QQMA 3ULEA 3WUHA 2H3GX 3CQYA 4GY2B 3D2FA 4MLHA 1GLAG 4AM7A 3IFRA 3UKUA 3M1FA 1MDUB 2GELA 3VEXA 3JXUA 3CHWA 2V7ZA 2FSKA 2Q1NA 1HX1A 2IVNA 5AZJB 4I6MA 4FL9A 2E20A 5AQUA 1ZBSA 3G25A 3LM9A 2HF4A 4CZHA 3C7NB 4JD2A 4QS9A 3MDQA 2GEMA 3LDLA 2P9UA 1K8KA 3B8AX 4ISGA 1YAGA 4J8FA 3EL2A 3DXKB 3LM2A 5EOYA 5F1XA 4HWIA 1TYQB 1NM1A 5JICA 4EIAA 3HZ6A 1NGFA 4XH5A 2W40A 5AQFA 4FOIA 1XUPO 2D1KA 2CH6A 2P9LA 3IUCA 4XH4A 3DXMB 4BG9A 4BRGA 4FPBA 5F2RA 3P4IA 1U2VA 3RSEA 1HUXA 2E1YA 4CJ7A 5BPLA 4H5RA 3MN9A 3LDPA 3CJAA 4BR7A 2A42A 1JCFA 2E1ZA 3O4WA 1V4SA 2GWKA 2Q97A 1BA0A 3CJ7A 4BRFA 3GDQA 5JMVA 5AQVA 4CZEA 1BDGA 4NO7A 4BRLA 1U6ZA 4ISEA 4QS7A 5E84A 3EKUA 1KAXA 4NB4A 1BO5O 3HM8A 2BTFA 2FXUA 2ASPA 3QDKA 4BRQA 3HTVA 3WQTA 3HSCA 5AQNA 5AQHA 4M7YA 5JLHA 3BF3A 1ESVA 1HJOA 3QMLA 5AQMA 4H0XB 1NLVA 3W3DA 3CQXA 1D4XA 2CGLA 2GTDA 3AAQA 4BR5A 2QWOA 1Z6RA 3O1WA 5AZJA 4FOEA 4L3QA 5AQGA 3KZBA 2QWLA 2QWMA 3MCPA 3C7NA 1NWKA 4BR0A 4K41A 1YVNA 3AAPA 4BC3A 2AP1A 5BR9A 3BF1A 4EAHD 1NGIA 3DXKA 4BRDA 4BRAA 2A6AA 4FWPA 1IG8A 3O1BA 3AARA 2V51B 1X9JA 3BP8A 1TYQA 3FZKA 4FSVA 2DPNA 3CJ9A 2GWJA 3R9PA 1QQNA 1SQKA 1BWFO 3L0QA 4PL7A 4M7XA 4B1VA 1NGBA 3IMXA 4BVOA 1U2VB 2ZWHA 4CZIA 3ZETB 3FZLA 1RFQA 1S22A 2W41A 3VPZA 5EY4A 1J6ZA 2FSJA 5EX5A 2Q36A 2AA4A 3IDHA 1KAYA 1NGGA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2P9PB 2HB5A 4BC5A 3SK3A 2PYLA 4W5TA 5AQWA 3CCQN 1NMNA 3CJ1A 1X3MA 2YHBA 2NRHA 1CXQA 5C10A 3UIQA 4NXMK 3RMBA 2OPQA 3WXJA 5HOOA 3V9XA 3VTIA 3T1YK 3TAQA 3A0IX 2J4RA 1JZBA 5EVZA 4BRKA 4JI0K 2NY8X 2YKMA 4YY3K 2Z1HA 2D0PA 2WTUA 4DV6K 3HBTA 4FK2A 3CYGA 5AQJA 4CZLA 1HPMA 3MN7A 1KAZA 3E9PA 3SF4D 3CCUN 4K8XA 5KPTA 3OS1A 2YILA 1R0AA 1ZBIA 1BL3A 3HO1A 1VQ8N 4FZYA 1MU2A 3JAMO 1Z25A 1RTIA 4M63C 3FLCO 5GIPA 4AHTA 5JLFA 1VQPN 1YHQN 5HP1A 4BY9C 3HL8A 1VK0A 1IH7A 3KJVA 1DEJA 2LY5A 2HHTA 4ILGB 3AA5X 2UXCK 3CETA 3SMSA 4HHTA 2HHWA 4CVNE 3L56A 3SBGA 3ZCMA 3CMEN 4E3SA 4OO1J 1BOTO 1BIUA 3ZSXA 4FLVA 5KPZA 5FRNA 4FZZA 2QEXN 3H3OB 4JKGB 3WNGA 3KC6A 3OHRA 4CJEA 1HLUA 4CBXA 3NGYA 2K35A 2GX9A 4KHSA 1WSJA 3O9TA 3D0PA 1S3XA 1XC9A 5C25A 4CIGA 4YNQA 5FPEA 5FLXO 4LF4K 1A5XA 1I3AA 4CF2A 4DQPA 3A5OC 4DR6K 3PIPL 1YUWA 2P9NA 4FWOA 2ZD1A 2E2PA 3MXJA 4F8RA 1OVQA 4ELTA 3KHWA 1WBDA 3H46O 4DS5A 1K9MO 1FKOA 4DQ8A 1UWBA 4X65K 1NG9A 2A41A 1RTHA 4E0DA 1C1CA 3BZCA 4B3OA 1XHZA 4A5AA 2VGNA 1P8ZA 3V1QA 1FW6A 2IDOA 2QA4N 3NH2A 2HHSA 2CH5A 2QM1A 4FJHA 5AQLA 3KLEA 3OYJA 4AHRA 1NK9A 3SPZA 4B9TA 3MCAB 2KLAA 4LY7A 2V7YA 2IIRA 3NH1A 4FLZA 3OVNA 4WFAL 4E1MA 3NHGA 3AGKA 2ZGZA 4AHCA 3NH0A 4JV5K 5FPNA 4YHHK 3FGUA 4JI6K 4KHNA 2YC1C 4O0IA 4BRIA 3DAWA 3S5TA 4K42A 1GLFO 5KRTA 4WQ4C 3LL3A 4JNEA 4V19S 1FKPA 3MWPA 3K5LA 2ATQA 3ID8A 2QWPA 1ATNA 1YI2N 4JI2K 4A62A 5E41A 2O8DA 1ZBLA 3J80O 1NPIA 2N2RA 2O8CA 1K73O 4BRMA 4CK3A 4CGHA 3HXMA 3HPHA 1WT7A 4A2AA 3G0ZA 1T7PA 1NNEA 2HVHA 3QBWA 4C1NK 3NE6A 3VEZA 4DU3A 4DR1K 2CGKA 3SBTA 3KOWA 1JLQA 2O8BA 2OYQA 3GL1A 1NRAA 1J53A 3CYMA 2VG5A 3IS9A 4DS4A 4IBNA 3G71N 2CGJA 4UJ0A 3IKMA 4FJ5A 2RHKA 1CN2A 2IOCA 3SNNA 2FBXA 3E9LA 2HHHK 3CG7A 4OPHA 4OPJA 2E6LA 2HHVA 2OZMA 3VEOA 4JAXA 3CIPA 1VSIA 1TUUA 2XY6A 2NRVA 2I5JA 1B9FA 1MA9B 5IT9O 4CJRA 1Q81O 4NLCA 5HLFA 1HKCA 3O80A 1GLCG 3SYZA 3LDOA 2VQEK 4M3TA 2GBZA 4B1UB 1OMYA 2B6AA 4GV3A 3SUNA 2QW9A 4LF6K 1WLJA 5K14A 3J7AP 3D2FB 4CEDA 4M42A 4OGEA 4FXDA 3B6PA 4JS5A 4DQRA 1FK9A 1N32K 2HHIA 4HUFA 3Q7BA 1RNHA 3TTCA 4HCCA 4E72A 2VGMA 3DI6A 1VQON 4Z4EA 3VQ7A 3CJCA 4M45A 3ENBA 1CZ9A 3AVBA 1HMVA 4MDBA 2OANA 4JK9A 4M3UA 2F4VK 1DJTA 3T69A 4H0TB 5HRPA 2YJFA 1C6VA 2QK9A 3GE1A 4KPYA 3DLEA 1TV6A 2GV9A 4CFBA 4DU4A 4KHYA 1DT9A 4CFCA 1XNQK 5SWMA 3A5LC 2VWJA 5BREA 1GOBA 2E2QA 3M5RA 1C56A 4GMJB 2Q2RA 4PKIA 1U49A 2VG7A 1I94K 3DXMA 3CF5L 4FWLA 1T7EA 4LFAK 3VF2A 3K59A 1Z26A 2NY9X 4JK8A 3QEWA 4KYPA 4FZXC 1J5EK 1WAJA 2UU9K 3KLIA 3QEPA 3KLGA 3M8PA 4WF9L 2UYTA 2PYJA 2O4IA 1QQMA 4KH6A 3NF8A 3OS0A 3ULEA 3WUHA 2H3GX 2YX6A 4GY2B 1CXUA 4B9UA 4MLHA 3IFRA 4IOCL 3UKUA 2M8BB 1ZVGA 1S1UA 3CM5A 5MLCQ 3M1FA 2GELA 3VEXA 5AZJB 3DOKA 4I6MA 3S3MA 2E20A 1ZBSA 2HF4A 3OYBA 1MR4A 3AO4A 4JD2A 3LZJA 3CXCM 4BE2A 4DSFA 1NK7A 1IO2A 1K8KA 4ID1A 4BDZA 3HOTA 3EL2A 3HSTB 4IEIA 1XI1A 1NM1A 3VTHA 4EIAA 4DFPA 3O9RA 1NGFA 1LWEA 2FBYA 5KGXA 1OH8A 1XUPO 4C8NA 3LALA 3IUCA 2HSTA 5HROA 4DSJA 1ZU3A 1VHXA 2E1YA 1JXCA 4CJ7A 4DFKA 4H5RA 2LSNA 3O9SA 1RT6A 3OY9A 3LWMA 3CJAA 2A42A 2D0AA 3DLHA 1VQ7N 1SS6A 2GWKA 3E7RL 3OYNA 1XMOK 4F2SA 3DMJA 1ZVEA 4FM2A 4GV6A 2LJMA 4ZTFA 4BRFA 3GDQA 1KD1O 3P83D 4KH5A 1T1TA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2P9P B;  2HB5 A;  4BC5 A;  3SK3 A;  2PYL A;  4W5T A;  5AQW A;  3CCQ N;  1NMN A;  3CJ1 A;  1X3M A;  2YHB A;  2NRH A;  1CXQ A;  5C10 A;  3UIQ A;  4NXM K;  3RMB A;  2OPQ A;  3WXJ A;  5HOO A;  3V9X A;  3VTI A;  3T1Y K;  3TAQ A;  3A0I X;  2J4R A;  1JZB A;  5EVZ A;  4BRK A;  4JI0 K;  2NY8 X;  2YKM A;  4YY3 K;  2Z1H A;  2D0P A;  2WTU A;  4DV6 K;  3HBT A;  4FK2 A;  3CYG A;  5AQJ A;  4CZL A;  1HPM A;  3MN7 A;  1KAZ A;  3E9P A;  3SF4 D;  3CCU N;  4K8X A;  5KPT A;  3OS1 A;  2YIL A;  1R0A A;  1ZBI A;  1BL3 A;  3HO1 A;  1VQ8 N;  4FZY A;  1MU2 A;  3JAM O;  1Z25 A;  1RTI A;  4M63 C;  3FLC O;  5GIP A;  4AHT A;  5JLF A;  1VQP N;  1YHQ N;  5HP1 A;  4BY9 C;  3HL8 A;  1VK0 A;  1IH7 A;  3KJV A;  1DEJ A;  2LY5 A;  2HHT A;  4ILG B;  3AA5 X;  2UXC K;  3CET A;  3SMS A;  4HHT A;  2HHW A;  4CVN E;  3L56 A;  3SBG A;  3ZCM A;  3CME N;  4E3S A;  4OO1 J;  1BOT O;  1BIU A;  3ZSX A;  4FLV A;  5KPZ A;  5FRN A;  4FZZ A;  2QEX N;  3H3O B;  4JKG B;  3WNG A;  3KC6 A;  3OHR A;  4CJE A;  1HLU A;  4CBX A;  3NGY A;  2K35 A;  2GX9 A; 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