5AQTA

Fragment-based screening of hsp70 sheds light on the functional role of atp-binding site residues
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
380
structure length
380
Chain Sequence
MSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAIL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Chaperone
molecule keywords HEAT SHOCK COGNATE 71 KDA PROTEIN
publication title A fragment-based approach applied to a highly flexible target: Insights and challenges towards the inhibition of HSP70 isoforms.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 122
structure length 380
sequence length 380
ec nomenclature ec 3.6.3.51: Transferred entry: 7.4.2.3.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5aqtA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqtA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqtA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5aqtA04
2P9LB 3VF6A 1TUYA 1QQOA 3H3OB 4FSVA 3VGKA 2FF3B 2E2NA 1ATNA 4BRNA 1IJJA 4M63C 3LDOA 3O5BA 5AQVA 1YAGA 4IO8A 3R9PA 2E1YA 3UKRB 3WQUA 4WQ4C 4IWVA 1BO5O 4XH1A 3HBTA 4FPAA 5EX5A 4O8KA 2VWBA 3QMLA 4CD1A 2QWQA 1Z05A 2UYTA 2P9PA 5AZJB 3BF3A 3VEOA 3WEEB 3ZEUB 5BRFA 2F9WA 4BR7A 5E84A 1H1VA 3CETA 3EO3A 1NBWA 3OHRA 2IIRA 3AY9A 2D1KA 3MMVA 2P9IA 2VCPA 4PL7A 3EKSA 5BRDA 5AQLA 3ULEA 4A61A 4A2BA 3QBWA 4LC9B 3KZBA 3VGLA 2E2QA 4BR2A 4NO7A 4MO5A 3TU5A 1TYQB 2F9TA 2E1ZA 4QS8A 2BTFA 4B1WB 3ATVA 3ZX0A 2QWPA 1S3XA 2GWJA 3W0LA 2E2OA 1NM1A 1GLEG 1QZ5A 3M1FA 3IFRA 5FPEA 4JD2A 4E1JA 3O6WA 2ZWHA 4Y0WA 3EN9A 4H03B 3WXLA 3LDPA 3HM8A 2Q36A 1U2VA 5I9EB 4CZKA 4BRHA 3CI5A 5KPZA 2A3ZA 2V51B 3SLCA 4FO0A 1HKGA 3FZMA 4ISGA 1KAZA 5KPTA 3QFPA 5F1XA 2Q0RA 4O5FA 3L0QA 2GELA 5F0XA 5BPNA 1DEJA 1GLJO 3O80A 4JHDB 4CBXA 5AQZA 3CHWA 3QBXA 3C0BA 2YCHA 5EY4A 3VEZA 3ZX2A 1YUWA 3BF1A 4FWMA 5ADXA 3MN9A 3O08A 2E20A 3DWLA 4BG8A 4DHYA 2GEMA 1X9JA 4M7YA 3FR0A 5AQYA 4QS7A 2ZGZA 3M6GA 4ISEA 3GE1A 2GTDA 2QM1A 3QFUA 2CH5A 2YHYA 3ENOA 2DPNA 3VESA 1X3NA 4RTFD 4BC3A 4WQ4A 3H1QA 4FWNA 5AQSA 2IVNA 2ITMA 1X3MA 2CGKA 4FWRA 4BG9A 3U8XA 2V7ZA 3SJHA 2QWMA 4CZLA 3H6EA 1HKBA 4BRAA 4J8FA 5LY3A 3LM9A 4PKIA 3TPQA 5LJVA 3AAQA 1G99A 3R8EA 3CJBA 2P9KB 1V4SA 5EOYA 5KQ8A 4RCHA 2H3GX 5EXWA 3BP8A 1LCUA 1XUPO 5AQUA 3WXKA 1NGGA 1HPMA 1GLCG 2ZGYA 3U9ZA 4BROA 4RWTA 5FPDA 1XQSC 3VEYA 4DQ8A 3DXKA 2QWNA 4K25A 1NGHA 4BRLA 4IJNA 2V7YA 1SZ2A 2D4WA 4A62A 1JCFA 1ATRA 3KVGA 2VYPA 4FWLA 3SMSA 1BA1A 1NGFA 2Q97A 3DXMB 1MWMA 4CZGA 4BC4A 4AM6A 3KHYA 4FL9A 3A5LC 4I6MB 1ZBSA 2KHOA 3EZWA 3DJCA 5AQHA 1NLVA 4CZJA 3GOIA 3U4LA 3JXUA 1CZAN 3BEXA 3A5NC 4FWOA 3W3DA 5AQGA 5F2RA 5AQFA 2E88A 1ESVA 3JS6A 1T44A 1Z6RA 2IVPA 1LOTB 2NZTA 3CJ1A 1BUPA 5AQNA 5BN9A 3MK6A 2P9SA 5ELZA 2QWRA 2P9NA 4WQ5A 3VF2A 1K8KB 2Q0UA 4EAHD 4BR4A 2YI1A 3B8AX 3LDQA 1NGCA 4H0YB 3LL3A 2HOEA 4A2AA 5AQWA 3GDQA 5AQJA 5AQXA 5AQRA 3G25A 2HF3A 4H0VB 1SQKA 1WOQA 3WQTA 1BU6O 1E4GT 1KXPA 2OANA 4CZHA 2P9PB 3BUZB 2YJEA 4WQ5C 2ASMA 3I33A 4IZ9A 4BRKA 2P9UA 3D7EO 2A42A 3MN5A 3ZETA 2AP1A 5JLFA 4PL8A 5B8HA 5BRHA 1C0GA 4H5VA 3MN7A 3O1BA 2P9IB 4YDUC 1MA9B 5JLHA 4Z94A 3FZKA 3C7NA 3QICA 2Q31A 5BPMA 4H5NA 3ULEB 1BOTO 3R6MA 3VEXA 2D0OA 4B1ZA 4BR5A 3FZLA 4B1YB 2A41A 3IUCA 3WXJA 2CH6A 3EKUA 2I7PA 2W40A 4DB3A 3ID8A 5FPMA 4HTLA 5KQDA 3F9MA 3I8BA 3IDHA 4B1XB 1NGEA 4BRFA 5EVZA 4XH4A 1R59O 4B1UB 3A8YA 1ZXOA 4BR0A 5AZJA 1ZC6A 3ATUA 4CBWA 4JD2B 4MLEA 4GY2B 4H0OA 1EQYA 5AQMA 4CI6A 3H1VX 5AFUH 3RSEA 2GUPA 2ASPA 3CIPA 5AQTA 4EIAA 3QB0A 3O8MA 3HI0A 1DKGD 1U2VB 2FSNA 3UE5A 1DGKN 3VENA 1D4XA 4BC2A 3UKUA 1XC3A 2HF4A 1NGIA 1NGBA 3D2EA 2IVOA 3SK3A 5E26A 2FSKA 1J6ZA 3VEWA 4H5WA 3P4IA 4CD3A 1YVNA 2QXLA 5FPNA 1MWKA 4H5TA 1HLUA 2A40A 1TYQA 5JMVA 3VF4A 1RDWX 1TUUA 2J4RA 5AR0A 3DAWA 4FWQA 5BR9A 1QQNA 3O1WA 5KPRA 3MN6A 4H0TB 1NGJA 1WUAA 4PKGA 5LJWA 2W41A 3AAPA 4IXCA 1ATSA 3CQYA 3C7NB 1E4FT 3ENHA 4CZMA 1BA0A 2YJFA 4BC5A 2E2PA 3CJ9A 5AQKA 4JN4A 4CZFA 1BG3A 3LDNA 3EL2A 2YHXA 1NWKA 3A0IX 2I7NA 4FWSA 1BWFO 3A5MC 4H0XB 1HJOA 1JCEA 3VERA 3A5OC 2E8AA 5AZIA 2WUSA 3HTVA 1GLLO 1RGIA 4FOIA 3CJ7A 3AARA 3RSEB 4GNIA 4JHDA 4CZEA 4FOEA 4K41A 4B9QA 4BR9A 3UB5A 1HUXA 5CE3A 1IG8A 1S22A 1KAXA 4NB4A 1QQMA 3WUHA 4H0PA 3UKUB 3LM2A 4BRMA 3L6QA 4CJ7A 4QS9A 4C23A 1C0FA 2QW9A 3D2EB 1QZ6A 1V4TA 5AQIA 2Q2RA 4K43A 3IMXA 3U9DA 4YDUA 1MDUB 1RFQA 1GLAG 1OKJA 3MDQA 4BRCA 4ISFA 1NMDA 3FZFA 4CBUA 2AA4A 1NGAA 3HZ6A 4JAXA 4BRQA 4MO4A 2GWKA 4JNEA 3WXIA 3DXKB 3L4IA 2ASOA 3WT0A 2Q1NA 1GLBG 1GLDG 2V52B 4M7XA 3S41A 3CQXA 2QWOA 1T6DA 4KBOA 4L3QA 3MCPA 3CJAA 1QHAA 2EWSA 4BVOA 3D2FA 1Q18A 4BQZA 2YHWA 4F9OA 3FE1A 4BGAA 1HX1A 2FF6A 2A6AA 4FPBA 4BVPA 4IJAA 4AM7A 2P9LA 1Y64A 3M3ZA 2P9KA 3CERA 5JICA 3GG4A 4EFHA 2FLOA 2PAVA 4WYBA 3FFKB 4BREA 2HMPA 3GL1A 5AQOA 5TKYA 1JCGA 1YXQA 4DCHA 3J8AA 1U6ZA 2NRHA 5AZIB 2FXUA 3UKRA 3VGMA 2D0PA 3VETA 5ADXH 1P8ZA 4K42A 2P9SB 2P9NB 5BPLA 3FLCO 3LDLA 5BREA 4BRGA 3H46O 4PKHA 4EHUA 2QWLA 1BDGA 2NLXA 3GBTA 3QDKA 3O4WA 2FSJA 4B1VA 2CGLA 3WEEA 2A5XA 2CGJA 4FWPA 4BRIA 3ZEUA 1NGDA 3DXMA 2PBDA 3SMPA 1HKCA 4EHTA 3ZX3A 4XH5A 4BRDA 4I6MA 3HSCA 4BQLA 1KAYA 5AQQA 3CJCA 4BGBA 3VPZA 5AFUA 3VOVA 3FGUA 1GLFO 4HWIA 3H3NO 4FWKA 5AQPA 4BRPA 4H5RA 4CZIA 2ZF5O 4XEIA 2BUPA 3VEVA 3D2FB 3H45C 4MLHA 2P9UB 1T6CA 1K8KA 3ZETB 3FZHA 1SAZA 5BN8A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1XC9A 4FJ9A 2P9LB 2IGIA 4E89A 2OTJN 1QQOA 3CC2N 4B3MK 1VQ9N 5J1EA 4OX9K 4JI4K 4CIFA 1BCOA 4BRNA 4O5BA 1IJJA 1VQ4N 1YAGA 4IO8A 2XY6A 3OBYA 3UKRB 3WQUA 1JXBA 1TGOA 4MDAA 4ZTFA 4L8RB 4ILHA 4FPAA 4O8KA 4FZZA 2QWQA 2LR3A 4HHFA 4IO9L 3BF3A 3ZEUB 1HJRA 4FLVA 4DQIA 4CJ4A 3CQ8A 4F2RA 4DFMA 1H1VA 1L3TA 1L3VA 1NBWA 3OHRA 2OPSA 1PX9A 3MEGA 1FH3A 1NK4A 4PL7A 2P5GA 4BEBA 4DTRA 2B6AA 1K6YA 2KW4A 3CPWM 4LF9K 1KQSM 1ZBHA 3U3YA 3E1YA 2GWJA 2E2OA 1NM1A 1NKBA 1UWBA 3QI7A 3RMBA 1T3VA 1EXQA 5T7BA 3KLGA 1NG9A 3M8PA 1W9HA 3CCMN 4AHRA 3HM8A 3SQ1A 2YHAA 4KB0A 2A3ZA 1K9MO 1Q86O 3SUOA 1N4NA 5KPTA 3QFPA 4ID5A 2G8IA 1RBSA 2N66A 4JK7A 3L3UA 3NHGA 5F0XA 1DEJA 4FJ8A 4CBXA 4CGGA 4E7HA 2YIOA 2I5JA 4CK1A 3ZX2A 1WWNA 4FWMA 5C25A 4F3OA 4CJPA 3DWLA 3OYBA 2DY4A 4B8AB 1FKOA 1X9JA 2ATBA 3IS9A 4CFBA 5GIOA 3VQBA 1S6PA 2ZGZA 4ISEA 4AF1A 3E7UX 2GTDA 4HUGA 2KBJA 2YHYA 2KYQA 3ENOA 2UUBK 3CC7N 1X3NA 4OPHA 4RTFD 1HNVA 4FWNA 1VNBA 2IVNA 3SQ4A 2RHKA 2CGKA 4JKAA 3NH2A 3MX2A 3THXB 3L2UA 3LAKA 2BE2A 4FVMA 2KGQA 2LN8A 1ASWA 3QIPA 3H6EA 1NOZA 3LM9A 3AAQA 4LSLA 3PIOL 4FLTA 2GX9A 2P9KB 4K8XA 1V4SA 3VQQA 4BDPA 2C1IA 4RCHA 1NRAA 3RMCA 3OYNA 2YEOA 3KC6A 3P83D 3WXKA 2O4GA 1ZU3A 1RT4A 3AVLA 4W5QA 3OS1A 3SUQA 2RPIA 3VEYA 4FJJA 4DQ8A 3DXKA 1OH8A 1I39A 1RTHA 1HR0K 4B9SA 3QEVA 4WCEL 4FLYA 3HVRA 1NGFA 2Q97A 3DXMB 4DU4A 4OVLA 4FL9A 3A5LC 4I6MB 3BZCA 4B3TK 2KHOA 3EZWA 3DJCA 5AQHA 1B92A 1C6VA 3U4LA 3PLAA 3QIOA 1JLBA 4BDZA 4LY7A 3D6RA 2HNYA 1JKHA 1HNXK 1ESVA 4EZ6A 1Z6RA 3O9RA 2O8EA 5AQNA 1RDDA 3OVNA 1MYNA 4WQ5A 1HYVA 4M3UA 4FJIA 2Q0UA 3L3VA 1M1KO 4EAHD 5E41A 3VQPA 1L3SA 1NGCA 2G8VA 1NJZA 5C2DA 4RG8A 3CF5L 3KLEA 4A2AA 1UA1A 2HVIA 2M8BB 3KLFA 4N47A 1VQ5N 5AQRA 2Z1GA 3G25A 4R79A 4OO1J 1Q82O 2HF3A 5H1SQ 4H0VB 1WSGA 1RDAA 4W5TA 2XHBA 3AA3A 1XNRK 4AHVA 1BCMA 3BUZB 3OW2M 3VA0A 4IZ9A 2LKBA 3SBGA 2ZJQL 2ZE2A 3KJVA 1U47A 1P0AA 1J5EK 2MZ0A 4M3XA 3ZT0A 2P9IB 1VSDA 5JLHA 4Z94A 3ZSOA 1RNHA 5BPMA 3TSPA 4H5NA 3R6MA 1HYSA 1VSLA 2D0OA 2QKBA 4BDYA 3OYFA 2A41A 1EKEA 4YOUA 3L56A 2CH6A 1FKPA 2NNWA 3KK3A 3EKUA 4DB3A 4HTLA 4JI7K 4Q5VA 2OA8A 2GBZA 3ZT1A 4FK0A 4C1NI 1UA0A 1RBRA 1ZXOA 4BR0A 4AH9A 4CHPA 4JD2B 1RILA 2DTUA 3ZT4A 4GY2B 3DOLA 4H0OA 1EQYA 3J80O 3K59A 2GUPA 3CIPA 3PX4A 5AQTA 2G2KA 4EIAA 3QB0A 3VQEA 2F4VK 2KKZA 3NH0A 4UQGA 4KH4A 3EEQA 1DGKN 4KO0A 2ASCA 1CLQA 1S1UA 3UKUA 4FLXA 2NRVA 4FLWA 3T69A 4A5AA 3OY9A 1WMTA 4N56A 3AVCA 1JXCA 3TTCA 3P4IA 3BK3C 4DSEA 5HL7L 4JLHA 4FK4A 3K5LA 1N5YA 5JMVA 3VF4A 1TUUA 2J4RA 3DAWA 4FWQA 1T7PA 1FJGK 1BI4B 3MN6A 4N5SA 1MU2A 4DTUA 5EU7A 1GOBA 2W41A 3K0SA 1T05A 4FJGA 1K8BA 2E2PA 3AO1A 4JN4A 1BG3A 4DUYK 3KTQA 3EL2A 4E7LA 3AVAA 3P1GA 4HUEA 2I7NA 1TL1A 3NCIA 4CHZA 1HJOA 3THVA 3HRGA 2IAJA 3VERA 2QEXN 3DRSA 2F8TA 1KC8O 2E8AA 5AZIA 4AILC 1CXQA 1HNWK 3BGRA 4CGHA 4IKFA 5JS1A 3SPYA 3AARA 1RT7A 4FOEA 2HMIA 2WOMA 1S22A 3M5RA 1QQMA 4OKEA 1N8RO 4DR4K 4DR7K 4BRMA 4NLCA 3L6QA 3SUPA 4QS9A 4JK9A 1C0FA 3P5JA 2OZSA 1NK9A 3QINA 4DSKA 1HRHA 2N2QA 1GLAG 4BRCA 3MDQA 5C15A 3TAFA 2OZMA 1NMDA 4E72A 3PUFA 1NGAA 4Z4IA 4JNEA 5M1KA 4QAGA 5IT9O 2ASOA 3O9TA 4DTPA 4DFJA 1GLDG 4E1NA 3V1OA 4I2PA 3THXA 3HSTB 1QHAA 4JI6K 1QHTA 1VSEA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1XC9 A;  4FJ9 A;  2P9L B;  2IGI A;  4E89 A;  2OTJ N;  1QQO A;  3CC2 N;  4B3M K;  1VQ9 N;  5J1E A;  4OX9 K;  4JI4 K;  4CIF A;  1BCO A;  4BRN A;  4O5B A;  1IJJ A;  1VQ4 N;  1YAG A;  4IO8 A;  2XY6 A;  3OBY A;  3UKR B;  3WQU A;  1JXB A;  1TGO A;  4MDA A;  4ZTF A;  4L8R B;  4ILH A;  4FPA A;  4O8K A;  4FZZ A;  2QWQ A;  2LR3 A;  4HHF A;  4IO9 L;  3BF3 A;  3ZEU B;  1HJR A;  4FLV A;  4DQI A;  4CJ4 A;  3CQ8 A;  4F2R A;  4DFM A;  1H1V A;  1L3T A;  1L3V A;  1NBW A;  3OHR A;  2OPS A;  1PX9 A;  3MEG A;  1FH3 A;  1NK4 A;  4PL7 A;  2P5G A;  4BEB A;  4DTR A;  2B6A A;  1K6Y A;  2KW4 A;  3CPW M;  4LF9 K;  1KQS M;  1ZBH A;  3U3Y A;  3E1Y A;  2GWJ A;  2E2O A;  1NM1 A;  1NKB A;  1UWB A;  3QI7 A;  3RMB A;  1T3V A;  1EXQ A;  5T7B A;  3KLG A;  1NG9 A;  3M8P A;  1W9H A;  3CCM N;  4AHR A;  3HM8 A;  3SQ1 A;  2YHA A;  4KB0 A;  2A3Z A;  1K9M O;  1Q86 O;  3SUO A;  1N4N A;  5KPT A;  3QFP A;  4ID5 A;  2G8I A;  1RBS A;  2N66 A;  4JK7 A;  3L3U A;  3NHG A;  5F0X A;  1DEJ A;  4FJ8 A;  4CBX A;  4CGG A;  4E7H A;  2YIO A;  2I5J A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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