5AQUA

Fragment-based screening of hsp70 sheds light on the functional role of atp-binding site residues
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
381
structure length
381
Chain Sequence
MSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Chaperone
molecule keywords HEAT SHOCK COGNATE 71 KDA PROTEIN
publication title A fragment-based approach applied to a highly flexible target: Insights and challenges towards the inhibition of HSP70 isoforms.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 122
structure length 381
sequence length 381
ec nomenclature ec 3.6.3.51: Transferred entry: 7.4.2.3.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5aquA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aquA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aquA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5aquA04
1GLFO 1HUXA 1DEJA 1NGFA 4ISEA 4BRPA 3W3DA 3MK6A 5AQIA 4MO5A 1S3XA 1BG3A 5BPMA 1V4TA 4M7YA 2OANA 3QB0A 1G99A 4DHYA 2QWQA 3TPQA 3GOIA 1GLEG 4ISGA 4MO4A 1XC3A 4EFHA 3M3ZA 4H03B 4LC9B 3EO3A 4BRFA 2ITMA 1ATSA 3HZ6A 3KHYA 3WEEB 1NGCA 4H0XB 2Q1NA 3FZHA 3AARA 3UKUB 5KPZA 1YVNA 4HWIA 1HKCA 2FSJA 5BPLA 4B1XB 3CJCA 3VPZA 3QICA 3VENA 3H46O 4F9OA 1GLLO 3CERA 5AQRA 2QW9A 1XUPO 4FWKA 3FZKA 3M1FA 3MN5A 4RWTA 5AQWA 2VYPA 2P9LB 1ESVA 4H0OA 3LDNA 3VGMA 3HBTA 4BVOA 5AQMA 5JLFA 1S22A 2E2PA 1KAYA 1NBWA 2E2NA 1HKGA 3WQUA 4BR0A 1Q18A 1TYQB 4BRDA 4CZIA 3BUZB 1X3NA 3A5MC 3DAWA 4EHUA 4BQZA 2P9PB 1QQOA 2J4RA 3UE5A 5BREA 3CI5A 1BU6O 1MWKA 2QWRA 2F9WA 5ADXA 2IIRA 4BR9A 4BREA 2D0PA 5AQUA 4XH1A 2A41A 2I7NA 2CGLA 3LM2A 1YUWA 3A5OC 2NLXA 2IVPA 3DXKB 2QWMA 3MN6A 1H1VA 4FOEA 3SMSA 5AZJA 4M7XA 3J8AA 4BRLA 2HF4A 4JHDB 4YDUC 1K8KA 4YDUA 3U4LA 1T44A 4H5NA 2ZGZA 1P8ZA 3ULEB 4WQ5C 3VF4A 3B8AX 4B1UB 4WQ5A 3VETA 4BRGA 1HJOA 3KVGA 2ZWHA 4QS9A 2NZTA 1E4FT 3WXKA 3IDHA 3I33A 4IWVA 5F2RA 5FPNA 3VEOA 1GLAG 3A0IX 4J8FA 3S41A 5BRHA 3HSCA 5AQJA 2P9NB 3LDQA 3FFKB 5AQTA 1RGIA 3FR0A 4WQ4C 5AQSA 4L3QA 4WQ4A 4BRCA 1OKJA 2YHXA 1LOTB 2FLOA 1YAGA 2Q0RA 3EKUA 4FWMA 4BRMA 4BRQA 4FWQA 2YHWA 3R9PA 4FWOA 3CJ9A 1RFQA 1NGGA 1ZC6A 5LY3A 3D2EB 3WXJA 3WUHA 4FPBA 5AQNA 4BRKA 2E2QA 2Q97A 5BRDA 5BN9A 4FWNA 3GE1A 4CZJA 4PL7A 5BN8A 1NM1A 1NLVA 1WUAA 3O08A 3IMXA 4BG9A 3G25A 5ADXH 1BWFO 5AQLA 4Y0WA 3O80A 3WXLA 4JNEA 2YI1A 1ZBSA 1NGHA 5JLHA 1IJJA 2P9KB 1NGJA 5AFUH 1HX1A 3H1VX 4FSVA 4A62A 3GG4A 3WXIA 3DJCA 3ID8A 3CJBA 3UB5A 1V4SA 4XH4A 4BC5A 1EQYA 4FWPA 3VESA 1SAZA 2YCHA 3MCPA 5AZJB 2CGJA 3MDQA 1NGAA 3LDPA 2DPNA 1BOTO 4CZFA 2PAVA 1BO5O 3WT0A 5LJVA 3C0BA 2P9SB 1K8KB 2HF3A 4CZGA 4IJNA 4K25A 3WQTA 4K41A 1NMDA 5KPTA 5FPDA 3CIPA 4GNIA 3P4IA 4DQ8A 3MN7A 3RSEB 5KQ8A 4BR4A 3LM9A 4H5TA 4IJAA 4B9QA 5AQPA 2P9IB 3CHWA 3VERA 4I6MB 3U8XA 2GUPA 4XH5A 4K42A 3SK3A 5AQGA 4EHTA 3BF1A 2GTDA 5AQHA 1DKGD 5AQOA 3O4WA 4WYBA 1RDWX 4JD2A 1TUYA 4JN4A 5E84A 4CBXA 2YJEA 1R59O 2D4WA 4BC3A 2P9UB 3F9MA 4FWLA 4CZMA 5AQFA 3SMPA 1CZAN 2CGKA 5LJWA 5ELZA 5AR0A 4A2BA 4CD1A 2VWBA 3D2FA 3UKRB 3W0LA 5KQDA 3CQYA 3VGLA 1U6ZA 3IUCA 2BTFA 3M6GA 3SLCA 4EAHD 1QQNA 3AAQA 1QZ6A 3HI0A 3ENHA 4HTLA 5F1XA 4E1JA 4GY2B 1MDUB 2E20A 2W41A 4BROA 5BPNA 4Z94A 1LCUA 1C0GA 4FPAA 1Z6RA 4M63C 2QWPA 4CZEA 5BR9A 2A40A 3CETA 4BVPA 3AY9A 2QWNA 2FF3B 4BRHA 3JXUA 1NGEA 1J6ZA 2GWJA 4CZKA 3BP8A 3VEWA 4H5VA 2Q31A 3ZX2A 3CJ1A 4PKHA 3L6QA 3LL3A 3KZBA 3U9ZA 1SQKA 3EZWA 1XQSC 1ZXOA 1BA0A 4CJ7A 1KXPA 2YHYA 4BRIA 3WEEA 2A42A 4FOIA 3UKUA 2ZGYA 2YJFA 5I9EB 4A61A 4B1YB 1NGBA 4QS8A 1SZ2A 4MLEA 3VGKA 1E4GT 2HOEA 1NGDA 3D7EO 4H0PA 3FZFA 5B8HA 4IZ9A 1JCEA 2P9LA 4H0VB 1TUUA 2QWOA 3LDOA 1BDGA 3VEVA 5AQQA 3GL1A 4H5WA 3ZETA 1HKBA 3O6WA 2PBDA 3ZEUA 1TYQA 3QBXA 4CI6A 3CQXA 3GBTA 2EWSA 4BG8A 1JCFA 1HPMA 3H6EA 3OHRA 2P9PA 4PL8A 1QHAA 3FGUA 3CJAA 5JICA 4CBUA 2E8AA 2VCPA 5CE3A 3R6MA 3VEZA 4B1WB 5E26A 5EX5A 3FZMA 3VEXA 4BR5A 1Z05A 2AA4A 2BUPA 3FZLA 2WUSA 2HMPA 2Q2RA 3H45C 2E1ZA 3BEXA 4BQLA 5AZIA 1YXQA 5EY4A 2ASMA 2GEMA 4IO8A 3L0QA 4BC2A 3DXKA 3ZX3A 2QWLA 3QDKA 2F9TA 1X9JA 4BRAA 3VF2A 2V7ZA 3QMLA 4BRNA 2ZF5O 2A3ZA 2Q0UA 2V7YA 3O1BA 4JHDA 4FL9A 1GLJO 4IXCA 4RCHA 3DXMA 4BGBA 2A6AA 5EVZA 1JCGA 4CBWA 3ULEA 1BUPA 1GLBG 1T6CA 4MLHA 2CH6A 2FXUA 5F0XA 1QQMA 3ATUA 5FPEA 4ISFA 1ATRA 1D4XA 1ATNA 3C7NA 4PKIA 1T6DA 2E1YA 4AM7A 2H3GX 1BA1A 4BR7A 1U2VA 5AQKA 3CJ7A 4H0YB 1IG8A 3BF3A 4RTFD 3ZETB 2P9NA 2GELA 4A2AA 3VOVA 3ZEUB 5AQXA 3EN9A 3ZX0A 4EIAA 2FSNA 4DCHA 4BC4A 1MWMA 3AAPA 3O8MA 2IVNA 4CZLA 3LDLA 3A8YA 2Q36A 4XEIA 4FO0A 4NB4A 4AM6A 5BRFA 3D2EA 4H5RA 3TU5A 2D0OA 4CZHA 3HTVA 2FF6A 2V52B 3H3NO 3ATVA 4FWRA 2AP1A 5AQYA 4CD3A 3GDQA 5AQVA 3FE1A 4QS7A 1HLUA 4O5FA 3O5BA 2KHOA 2A5XA 5AZIB 4KBOA 4H0TB 2CH5A 2ASOA 2FSKA 3QFPA 2GWKA 4DB3A 2P9KA 3QFUA 3IFRA 5TKYA 3SJHA 5AFUA 3L4IA 1X3MA 3VF6A 3ENOA 2UYTA 2QM1A 1NWKA 1NGIA 3HM8A 1WOQA 5EOYA 1Y64A 2QXLA 1QZ5A 4FWSA 4BGAA 3A5LC 4C23A 2E2OA 1KAXA 2IVOA 2P9SA 3DXMB 3DWLA 3EKSA 5KPRA 3MMVA 4B1ZA 5FPMA 3I8BA 3A5NC 1GLCG 4JAXA 3EL2A 1MA9B 4O8KA 2D1KA 2I7PA 2V51B 3RSEA 4JD2B 3FLCO 3O1WA 2P9IA 3C7NB 2ASPA 4I6MA 5JMVA 4NO7A 3JS6A 5AQZA 4B1VA 1U2VB 4PKGA 4K43A 4BR2A 3D2FB 1C0FA 3QBWA 3U9DA 2P9UA 3H1QA 1DGKN 2E88A 1GLDG 3H3OB 1KAZA 3VEYA 3MN9A 3R8EA 5EXWA 2NRHA 2W40A 3UKRA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1DJTA 1DEJA 4G1QA 4ISEA 4BRPA 4C8KA 3W3DA 3MK6A 3GKUA 5AQIA 1VSMA 3PIPL 2UXBK 4DV5K 3S3MA 4MDBA 1EKEA 3K5MA 4CERA 4FZYA 3TTFA 3QB0A 2VG7A 5M1PA 5KRTA 2D0CA 3ZSRA 3D0PA 4DTJA 3HM9A 4DHYA 3TPQA 3E7UX 4ISGA 4MO4A 1VQPN 3CCLN 1IV0A 4H03B 4LC9B 3NH1A 3EO3A 4DU1A 1L3SA 3K9JA 1D9FA 1WAJA 1K6YA 4AILC 3KHYA 3WEEB 1NGCA 2Q1NA 3V9UA 3AARA 4CEFA 1HNIA 4CF8A 2JWKA 4YHHK 2E6MA 3VTIA 3NF7A 4DU4A 1WN7A 5AQRA 3K5OA 1XUPO 4FWKA 4DFPA 3FZKA 2XRIA 4ELUA 4QAGA 2OCEA 5K14A 2E0HA 3SQ2A 4DQSA 1IBMK 3LDNA 4DG1A 1WSEA 3QLHA 3VGMA 3ZCMA 4DFMA 5AQMA 1S22A 2F96A 4IG0A 1HKGA 1QVGM 4BR0A 5GAEP 4BDZA 2HVHA 1X3NA 2ATQA 2OPQA 2O8CA 1ZVGA 2KTQA 4CHZA 1VSEA 4M3ZA 3NCIA 4DTMA 2JLEA 2WOMA 1NK5A 4OX9K 5LMUK 4CFAA 1JLEA 1FXXA 1ZBUA 4YOWA 1M1KO 3RR8A 4BREA 5AQUA 4C8MA 1J53A 4DR4K 4UQGA 2A41A 3AVGA 3DRPA 1VQ7N 2CGLA 4DTNA 3A5OC 2NLXA 3MX2A 4NYNA 4L8RB 3BK3C 4N76A 1JZBA 4O4GA 2O8DB 4RW4A 3OS1A 3NE6A 5J1EA 4FM0A 1VQLN 4M7XA 2SN3A 4M3UA 3AVKA 1X9SA 4YDUC 1YTAA 3CD6N 1RT4A 1VSLA 1OMYA 1T44A 5J2MA 1C0UA 2QKKA 1HNZK 4WQ5C 1PE4A 3F73A 3OYLA 3OYIA 4LF6K 1XI1A 1U48A 3CCUN 4QS9A 3P5JA 1WLJA 2GV9A 3IDHA 3MEEA 4OVLA 4FJ9A 2UUAK 3CM5A 5HRRA 4KTWA 4JV5K 3S41A 3ZT0A 3HSCA 5AQTA 1RGIA 4KHPK 1YJNN 2IDOA 5E41A 3WNFA 2E6LA 3EZ5A 1YAGA 2Q0RA 2EX3A 4FWQA 2YHWA 4Z0UA 3PUFA 3V1RA 3CCRN 1ZC6A 4ICLA 3CXCM 3WUHA 1JLFA 1U49A 3OS2A 2Q97A 3GE1A 2F8SA 3L56A 3MEGA 1WUAA 4BG9A 1BWFO 4Y0WA 3O80A 1XNRK 5M1NA 4AHTA 1ZVEA 1ZBSA 5JLHA 2VWJA 2KSKA 1VQMN 2P9KB 4M3TA 5AFUH 1BCOA 3ISNC 3CG7A 2WC9A 3ID8A 3UB5A 1V4SA 1T1TA 1KVAA 1W0HA 3VESA 1J5OA 3TR8A 2CGJA 4B3SK 1X9WA 3IS9A 2PAVA 3K58A 4FLXA 1KRPA 2A7TA 4IG3A 3DLLL 4JI2K 3TAFA 5FPDA 4Z4FA 1LWCA 3P4IA 4UAEF 1B3CA 4AHVA 2ITGA 3KJVA 4B8AB 4IJAA 4KB1A 3CHWA 4Z4GA 2G8UA 3BF1A 4WYBA 3K57A 4AHCA 5C15A 1J54A 2YJEA 2DTUA 3TTCA 4BC3A 3F9MA 2UUCK 1FW6A 3L2WA 5AQFA 5KK4A 3SMPA 1N34K 1JXCA 2KBHA 4CEAA 4FXDA 4CD1A 2VWBA 2HB5A 3D2FA 3KLEA 3PX6A 4DU3A 5KQDA 3JYTA 3CCEN 3CQYA 1N4NA 3VQPA 3K2PA 3VGLA 1NJZA 1DQ7A 4JLHA 2B5JA 4MFBA 3CC7N 3ENHA 3VQ5A 5F1XA 1DTTA 4JKDA 4R79A 3AA3A 4NCBA 5HRPA 2B68A 1NOZA 5BPNA 1I2VA 2VY6A 4EZ6A 4JKGA 4W5TA 1QQCA 4M42A 2HBKA 3O9QA 4CZEA 3O4NA 4AHUA 5BR9A 2A40A 3TWHA 2BH1A 1WSHA 1LW2A 3ZX2A 4CEZA 4HHFA 1Q8IA 1GPSA 1SQKA 4CIGA 1XQSC 4UY8O 2LY6A 3SF4D 1S1WA 3FFIA 3UKUA 3S3NA 2BDPA 5I9EB 2DFEA 3ZSOA 4DTOA 4JI6K 4Z4IA 2RHKA 4CJVA 2D56A 3O6WA 1T8EA 4HHTA 3AO5A 3S5TA 1RT1A 3CPWM 1Z26A 1IKXA 3SV3A 1U45A 4DTUA 4AHRA 4CESA 1VQON 4DWIA 4ELVA 3OHRA 4GVMA 3T7ZA 3P1GA 2Y1JA 2OPRA 3CM6A 4KHUA 3DLKA 2YNGA 2E8AA 4B9LA 2BE2A 5C25A 5E26A 5EX5A 1I3AA 1Z05A 4DTXA 3K9KA 2UXDK 2QK9A 3FZLA 2WUSA 2Q2RA 1FKPA 4BQLA 1GOCA 5CZ2A 4GV6A 5AZIA 5HLFA 2VWKA 4KAZA 4OKEA 3NVKA 3F5TA 1VQNN 2QWLA 2KYQA 5HOOA 2XO7A 2F9TA 2HVIA 4X65K 3AVJA 4EP5A 4BRAA 1BI4A 1LAVA 3VF2A 3QMLA 5CYQA 4BRNA 3KTQA 4YFUA 2A3ZA 4JHDA 3LPTA 5FROA 2A6AA 3C6HA 2A1RA 1BUPA 2HHXA 3DLEA 3NVMA 4ISFA 2G8HA 2QA4N 1EP4A 1BCMA 3VA3A 1T6DA 4AM7A 5TKWA 1BA1A 4CJQA 5AQKA 3CJ7A 4YOTA 1BQNA 1SEGA 3KKSA 2OPSA 1SL0A 1QHTA 4RTFD 3ZETB 3V9XA 1Q82O 3ZSYA 4A2AA 3VOVA 4DUYK 3IG1A 2FSNA 2N2RA 3CFOA 4BC4A 4E0DA 3O8MA 1RT2A 2IVNA 3LALA 5HBMA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1DJT A;  1DEJ A;  4G1Q A;  4ISE A;  4BRP A;  4C8K A;  3W3D A;  3MK6 A;  3GKU A;  5AQI A;  1VSM A;  3PIP L;  2UXB K;  4DV5 K;  3S3M A;  4MDB A;  1EKE A;  3K5M A;  4CER A;  4FZY A;  3TTF A;  3QB0 A;  2VG7 A;  5M1P A;  5KRT A;  2D0C A;  3ZSR A;  3D0P A;  4DTJ A;  3HM9 A;  4DHY A;  3TPQ A;  3E7U X;  4ISG A;  4MO4 A;  1VQP N;  3CCL N;  1IV0 A;  4H03 B;  4LC9 B;  3NH1 A;  3EO3 A;  4DU1 A;  1L3S A;  3K9J A;  1D9F A;  1WAJ A;  1K6Y A;  4AIL C;  3KHY A;  3WEE B;  1NGC A;  2Q1N A;  3V9U A;  3AAR A;  4CEF A;  1HNI A;  4CF8 A;  2JWK A;  4YHH K;  2E6M A;  3VTI A;  3NF7 A;  4DU4 A;  1WN7 A;  5AQR A;  3K5O A;  1XUP O;  4FWK A;  4DFP A;  3FZK A;  2XRI A;  4ELU A;  4QAG A;  2OCE A;  5K14 A;  2E0H A;  3SQ2 A;  4DQS A;  1IBM K;  3LDN A;  4DG1 A;  1WSE A;  3QLH A;  3VGM A;  3ZCM A;  4DFM A;  5AQM A;  1S22 A;  2F96 A;  4IG0 A;  1HKG A;  1QVG M;  4BR0 A;  5GAE P;  4BDZ A;  2HVH A;  1X3N A;  2ATQ A;  2OPQ A;  2O8C A;  1ZVG A;  2KTQ A;  4CHZ A;  1VSE A;  4M3Z A;  3NCI A;  4DTM A;  2JLE A;  2WOM A;  1NK5 A;  4OX9 K; 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