5AQUA

Fragment-based screening of hsp70 sheds light on the functional role of atp-binding site residues
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
381
structure length
381
Chain Sequence
MSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Chaperone
molecule keywords HEAT SHOCK COGNATE 71 KDA PROTEIN
publication title A fragment-based approach applied to a highly flexible target: Insights and challenges towards the inhibition of HSP70 isoforms.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 122
structure length 381
sequence length 381
ec nomenclature ec 3.6.3.51: Transferred entry: 7.4.2.3.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5aquA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aquA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aquA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5aquA04
1OKJA 4FWPA 2P9PA 3RSEB 3VESA 4HWIA 3O4WA 2QW9A 4H5VA 4C23A 4CD1A 4GY2B 2P9LA 4JN4A 3VEOA 2P9KB 4FWMA 4K25A 1HKBA 4NO7A 1HX1A 3MN5A 4XH1A 3AAPA 4BRAA 4JNEA 4BRCA 4CZGA 5AZJB 3QBXA 4H5RA 4FWQA 1QHAA 1GLJO 2P9IB 2BTFA 2E2QA 5FPDA 3VEZA 4DHYA 2VYPA 3A5OC 1NMDA 3BP8A 4K41A 2GTDA 3D2EB 5BRFA 1QQMA 3DXKA 1WUAA 3JXUA 3DXMA 3R6MA 1DEJA 5AQFA 3CQXA 3CERA 4FWLA 4B9QA 5CE3A 3FZMA 1IG8A 5BN8A 4JHDB 2Q97A 2YCHA 3GG4A 3IFRA 3ZX2A 5AQLA 1BG3A 1BO5O 1GLAG 4E1JA 3TU5A 3A8YA 1U2VA 5AZIB 1QZ5A 4YDUC 1D4XA 3JS6A 3BEXA 2E2PA 3SLCA 3CJBA 4BRFA 5FPNA 3EZWA 3GBTA 2GWKA 3QB0A 1XUPO 1R59O 5F1XA 1NGHA 2QWOA 4QS9A 1YVNA 4BRHA 1KXPA 3VF2A 3GOIA 4IWVA 4CZJA 4ISEA 4BVPA 5AZJA 2E2NA 1NWKA 5AQJA 3AAQA 4WQ4A 1MDUB 2E20A 1LCUA 3ATUA 5BN9A 2DPNA 2AP1A 3SK3A 3UKUA 4BG9A 3SMSA 5I9EB 5BRDA 3KZBA 4H5WA 5AFUA 2ASPA 4EHUA 4RWTA 3MN6A 1K8KB 4JAXA 4CZFA 3WEEA 3CJ7A 4A2BA 5FPEA 1SQKA 5BRHA 4FOEA 4BRGA 2VCPA 4J8FA 3U9ZA 3WXIA 3ZETB 4AM6A 4BVOA 4IZ9A 2GWJA 3S41A 1KAYA 1DGKN 5AQVA 5AZIA 2E88A 5LJWA 3H3NO 3HM8A 3EN9A 2UYTA 4B1UB 1ATNA 1JCEA 1LOTB 5JICA 4BG8A 2IIRA 3U4LA 2I7NA 3D2FA 4BREA 1C0FA 2GELA 3BF3A 4BR7A 3FLCO 1ATSA 2V7ZA 1T6CA 2Q0UA 1NGDA 2GUPA 3R8EA 3ZEUB 4BQLA 3A5NC 5EOYA 2ASOA 1ESVA 3J8AA 3MK6A 2FSKA 5E26A 1HLUA 4CZMA 2D1KA 1BA0A 5EXWA 4YDUA 3AY9A 5KPTA 3ZX3A 4PKGA 3QFUA 2P9NA 4B1VA 3R9PA 1QQNA 5BREA 2W41A 1T44A 4WQ4C 3VENA 3M3ZA 1MWKA 3O1BA 5F2RA 3UB5A 4DB3A 2P9SB 5AQKA 5AQYA 2FF3B 1Y64A 3FZKA 4CI6A 1X9JA 1V4TA 4CJ7A 2IVOA 4WQ5A 5AQIA 3VF4A 2ASMA 4CD3A 5FPMA 1JCGA 3FE1A 3QICA 3IUCA 3C7NB 4FWSA 3FZFA 1G99A 4PL8A 2A5XA 2V52B 3DAWA 1GLDG 4EFHA 2HOEA 3ULEB 3CHWA 1YUWA 1BDGA 4H03B 2V51B 4MO5A 1J6ZA 5AQNA 3QMLA 4JD2B 2Q0RA 3H1QA 2FXUA 3MMVA 5AQHA 4I6MB 4K42A 1Z05A 5AQGA 1GLLO 4BC5A 5ADXH 3KVGA 1JCFA 3WUHA 3HTVA 2CGJA 3RSEA 1C0GA 2QM1A 3BUZB 1XC3A 1NGFA 3LDLA 1CZAN 2IVNA 2I7PA 3FZHA 4FWKA 2Q1NA 4B1XB 2P9KA 4B1WB 3B8AX 5AQUA 3GL1A 4A2AA 3HSCA 5BPMA 4H0PA 4DQ8A 5AQXA 4RTFD 4FWRA 2QWRA 3CJ1A 4BRPA 1GLCG 1X3MA 2J4RA 1NGAA 5KPRA 4BC2A 4PKHA 2F9WA 3QDKA 2VWBA 4BRQA 3FR0A 1SZ2A 2P9IA 3ENOA 4LC9B 2E8AA 3ATVA 3W3DA 2FSJA 2E1YA 2FF6A 2P9UB 3EL2A 4WQ5C 2OANA 3FGUA 4F9OA 3CJAA 3D2EA 3CI5A 3ID8A 2A41A 3O8MA 4FSVA 2Q36A 2QWLA 3VOVA 3VPZA 3VERA 2W40A 1HKCA 3MN9A 3M1FA 1SAZA 3CETA 4JHDA 4XH4A 3VEXA 3O1WA 3WQTA 3WQUA 4BR4A 1TYQB 4MLHA 5TKYA 2PBDA 2D4WA 4AM7A 4RCHA 4BC3A 1P8ZA 1Q18A 3SJHA 4EAHD 3A5LC 1DKGD 1XQSC 4BRMA 4BR9A 5E84A 1GLFO 4BR2A 3LDOA 5AQSA 3EKSA 2A6AA 1BOTO 1NGGA 1YXQA 2F9TA 3EO3A 4BQZA 3H3OB 5KQ8A 2PAVA 4M7XA 2P9PB 4H0TB 3OHRA 4QS8A 2D0PA 3L4IA 2HF3A 2A42A 4HTLA 3F9MA 5BR9A 2FLOA 1HPMA 1ATRA 3VGKA 1NLVA 5AQWA 1KAXA 2P9UA 3M6GA 2Q31A 5ELZA 5EVZA 1YAGA 3LM2A 1NGEA 4H0YB 4ISFA 4L3QA 2Q2RA 4CZEA 4CZHA 4DCHA 3H1VX 1GLBG 1K8KA 4BRKA 4CZKA 3UE5A 3I33A 3A5MC 3UKRB 1NGIA 3VF6A 3SMPA 3ZETA 4BC4A 1NGJA 5EX5A 2KHOA 1WOQA 3WT0A 4MLEA 2V7YA 4BR0A 5BPLA 2YI1A 4A62A 5EY4A 3GE1A 3WXKA 2YHXA 2WUSA 2YHYA 5ADXA 2HMPA 3DXKB 1QZ6A 4XH5A 3DXMB 3MCPA 4H0XB 2ZGZA 4H5NA 4CZLA 2YJFA 1BWFO 2YHWA 1U2VB 1HJOA 2QWMA 1TUYA 4O8KA 3VEWA 3VGMA 1MWMA 4EIAA 1U6ZA 3ZEUA 3VGLA 4BROA 1X3NA 1BU6O 5AQTA 3FZLA 2GEMA 2ZGYA 3TPQA 3P4IA 2ZWHA 3H46O 2ITMA 2NRHA 4QS7A 3EKUA 3LL3A 3VEVA 4FPAA 4M63C 3MDQA 3UKRA 3O6WA 3UKUB 1HUXA 4NB4A 4BGAA 1RDWX 1TUUA 2P9SA 3VEYA 5LJVA 3I8BA 3ZX0A 4BRLA 1ZC6A 1S22A 5AQMA 2CH5A 2QWPA 5JLHA 3HBTA 2E2OA 3WEEB 4FL9A 5AQPA 3C0BA 2D0OA 4M7YA 3LM9A 3QBWA 4IXCA 4A61A 5LY3A 4BR5A 5AR0A 1BUPA 3DWLA 3KHYA 3C7NA 3AARA 4O5FA 2QWNA 3VETA 1IJJA 1Z6RA 2A3ZA 1S3XA 3GDQA 5F0XA 2ZF5O 3W0LA 3HI0A 4FWOA 3D2FB 2CGLA 3ULEA 3HZ6A 1RFQA 5BPNA 4FO0A 4IJAA 4BRDA 4PL7A 4Y0WA 4CZIA 4FPBA 4JD2A 4I6MA 4KBOA 3WXJA 4IO8A 4FWNA 3D7EO 4Z94A 3H45C 2P9NB 3H6EA 4BRIA 2NLXA 1QQOA 2BUPA 1EQYA 4BGBA 3U9DA 4PKIA 5JLFA 1GLEG 1E4FT 4CBUA 2H3GX 3CJ9A 3ENHA 3CJCA 2P9LB 1ZXOA 3QFPA 4H0VB 3U8XA 4ISGA 3L0QA 5JMVA 1NGCA 4B1YB 4XEIA 5AQQA 1NGBA 4B1ZA 2HF4A 2NZTA 2A40A 3CIPA 1ZBSA 3MN7A 1E4GT 1H1VA 3IDHA 4FOIA 4H5TA 1HKGA 5AFUH 3FFKB 1MA9B 3O5BA 2CGKA 4K43A 4BRNA 3WXLA 4H0OA 4MO4A 1KAZA 3L6QA 2E1ZA 3O80A 5B8HA 1T6DA 1NM1A 4CBXA 3CQYA 3IMXA 1RGIA 5AQZA 3LDQA 1TYQA 3BF1A 5AQOA 4EHTA 3A0IX 5KPZA 5AQRA 2CH6A 1BA1A 2YJEA 2EWSA 5KQDA 3O08A 2FSNA 2QWQA 3DJCA 4CBWA 3LDNA 3LDPA 4WYBA 1V4SA 2QXLA 2IVPA 2AA4A 1NBWA 3G25A 4IJNA 4GNIA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4FWPA 3MEDA 2HHQA 1RT7A 1NU0A 2YNGA 1UWBA 2UUAK 4CF8A 2QW9A 1WSJA 3V9XA 4H5VA 4DSEA 2DY4A 3PUFA 4JN4A 3VEOA 4CF2A 2O8BB 4FWMA 1J5OA 4TSXA 3MN5A 1Z25A 4XH1A 1RT3A 4CJTA 1Q7YO 3R1XA 4BRAA 4CZGA 4C8KA 4FWQA 2P9IB 5KK4A 2QA4N 1WAJA 1N34K 2W42A 1VQNN 1SL1A 4X64K 3CYGA 2VYPA 2DTUA 4K41A 3D2EB 3LZJA 5BRFA 1LQHA 1L4VA 4M42A 1BIUA 3R6MA 1TL1A 1JL1A 5AQFA 3E1YA 5CE3A 2Q97A 3GG4A 5HBMA 3ZX2A 1Q86O 5AQLA 2B3CA 1QSYA 1BO5O 4EZ9A 1GLAG 4AHCA 3A8YA 1U2VA 2G8UA 2YIPA 1QZ5A 4YDUC 3QEWA 3ZSXA 3SBTA 1VQLN 3HP6A 1T3VA 3JS6A 2HVIA 3WXMB 1CN2A 2E2PA 3BEXA 3KLIA 3P31A 2GWKA 3QB0A 4KTWA 2IOCA 2QKKA 2KFNA 4CJFA 5TKWA 3VF2A 4KHYA 1IG9A 4M45A 4AHVA 5AQJA 3V1RA 1LCUA 1Q81O 2DPNA 3K59A 3VQDA 3UKUA 3I55N 4BG9A 3DRRA 3SMSA 4FM0A 3KZBA 4H5WA 1U47A 2ASPA 4RWTA 1B7DA 3NE6A 2QXFA 1K8KB 4C8LA 2VCPA 4E19A 3WXIA 4BVOA 2F8TA 4AAZA 3AVMA 1LWCA 4AHTA 1HNXK 3LP2A 1NOZA 3DRSA 2LN8A 4EP4A 2OA8A 3E7RL 3AA4A 1B92A 4OKEA 3RRGA 3WNEA 4O44A 1IBMK 1ATSA 4CQKA 2V7ZA 3TTCA 1QSLA 1T6CA 4WFAL 2Q0UA 2GUPA 3ZEUB 3SPZA 4CZMA 5E26A 4FJ7A 5FROA 3Q7BA 4YOWA 1BA0A 3J7YP 5JS1A 4CJQA 3SQ1A 1C1CA 4YOXA 3ITHA 3AVAA 4DTSA 4PKGA 4CEDA 1WSFA 3DLGA 3QFUA 3CCUN 2W41A 3VENA 3OYHA 1I39A 1FJGK 3AVGA 4YY3K 1KLNA 2P9SB 5AQKA 4J2DA 1RBVA 4M3TA 5AQYA 4DTPA 2FF3B 2AJQA 1VSIA 4CI6A 3CPEA 2IVOA 3AVJA 4WQ5A 5AQIA 1BCMA 2ASMA 3PX0A 5EU7A 2Z1IA 5CYMA 3QNNA 4B9VA 3IUCA 4KHUA 3C7NB 3SQ4A 4EP5A 1O13A 5J2NA 2XRIA 4PL8A 2YX6A 1T7EA 2A5XA 4H4MA 1XI1A 2G8FA 1ZBFA 4JK7A 2OTLN 4YOVA 3ULEB 3CHWA 1RNHA 4WFBL 3KWGA 3BZCA 1YUWA 3NF7A 4MO5A 3QMLA 1JLQA 3IRXA 2Q0RA 3H1QA 1SKRA 2KZZA 4Z4EA 1GLLO 1RTJA 4BC5A 1NK7A 1JCFA 4JYAK 2CGJA 4DG1A 2JWLA 3RSEA 4DFMA 5MLCQ 1XC3A 4RG8A 1NGFA 1CZAN 1VRUA 4FWKA 2Q1NA 1VSJA 2P9KA 3OYLA 4B1WB 5AQUA 4ILJA 4A2AA 1PX9A 1DJTA 4H0PA 4CEAA 4RW4A 2BH1A 4DTOA 4FZYA 2J4RA 1NGAA 4BC2A 4PKHA 2F9WA 4V1DC 1SKSA 3FR0A 1RCHA 3ENOA 3HM9A 3HP9A 4DU1A 3SNNA 3KJVA 1S5JA 3CCLN 4WQ5C 5DM7L 1IO2A 4JS4A 4C8OA 3WNHA 4DF4A 4K8ZA 4FJLA 3SUQA 3C6UA 2O8FA 4KYPA 2A41A 4IEIA 4NLCA 2Y1JA 4ILHA 3VN5A 3J7ZO 3VPZA 3VERA 3KP1A 5HRPA 4CEEA 3PSIA 4XH4A 4KH4A 1LQIA 3QIPA 5M1OA 1HYVA 3NAEA 3M8QA 3U6FA 2NUBA 3SBGA 4AF1A 4BR4A 2P5OA 4CEZA 4KTQA 4AM7A 3SCXA 4KHNA 3VMFB 4BRMA 4BDZA 4E0DA 4N41A 2A6AA 1NGGA 1YXQA 3J81O 1MR4A 3H3OB 5KQ8A 1XHXA 1KD1O 5J2QA 4H0TB 4B8CA 2ITGA 1RILA 3E9OA 2HF3A 4U7BA 3TANA 4IBNA 2LSNA 4KKOA 4DUZK 1JLFA 2XO7A 4JRQA 4I2QA 2VGMA 3M6GA 2G8IA 5EVZA 3LM2A 2IAJA 1S1VA 3D45A 3H1VX 1GLBG 4BRKA 4CZKA 2PFUA 1WSHA 1VSKA 4DU4A 1TL3A 3L2RA 3VF6A 4CGGA 3M8RA 1U45A 3K2PA 4JI3K 2V7YA 5BPLA 4A62A 4MDAA 3E9PA 3GE1A 1EO1A 3T69A 4LH4A 2G8WA 4XH5A 4JI7K 3MCPA 3K9JA 2ZGZA 5CHIA 2YJFA 3CC7N 1PTXA 1QS4A 1HJOA 3VEWA 5FRNA 1HPZA 3KC6A 4ID1A 1TAUA 4YOYA 1U6ZA 5GIOA 1QE1A 3RR7A 5C12A 4FJ5A 1QQCA 3EE9A 5HRRA 1OH5A 1K6YA 4BWMA 3DRPA 2ITMA 2NRHA 1VQON 2D0CA 4QS7A 1D9FA 1I6GA 3KLFA 4O0JA 3KK2A 1KLMA 3O6WA 3SPYA 4NB4A 1BISA 1TUUA 3MWPA 3I8BA 1S22A 5AQMA 2CH5A 3ZSYA 3CQ8A 2OZMA 1Q8IA 2E2OA 3WEEB 3C0BA 3S3NA 1S6PA 2ZJQL 1WSGA 5DMRA 1BI4A 4IXCA 4HCCA 3TSQA 4LF4K 4LF6K 3BK3C 2KBJA 4FZZA 5AR0A 4JLHA 4CHZA 2HBLA 3DWLA 2MBKA 1QVFM 1UGLA 3VETA 2QWNA 3ZSWA 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3VTHA 1LW2A 3FZMA 1IG8A 4JHDB 3IFRA 4NLBA 4B9MA 4W5TA 1BG3A 5HP1A 2LR3A 4E1JA 4HUFA 1YI2N 4E89A 1U04A 1N8RO 3CJBA 2HBJA 3EZWA 3GBTA 3CFRA 1NGHA 1XWLA 4FLTA 1YVNA 1VQ5N 3DYAA 4IWVA 3C6HA 2ASCA 2KTQA 1SNBA 2E20A 2NNWA 5BN9A 3SK3A 3OYEA 3DLBA 1EKEA 1RDCA 5AFUA 2O8EB 4CF0A 1VQ4N 3O9QA 4JAXA 5FPEA 1SQKA 3PSMA 4J8FA 3U9ZA 4F2SA 3ZETB 4NXNK 5CZ1A 1T1TA 2GWJA 3VQPA 3S41A 4B8AB 3O4QA 1WNSA 1VSDA 5JS2A 5AQVA 3H3NO 3HM8A 5JICA 1JCEA 5M1PA 4FJNA 1M1KO 2RN2A 3LDSA 1KFDA 2GUIA 2IIRA 2Q3SA 3U4LA 4AHSA 2I7NA 4FJJA 5CY0A 3AVBA 2VQFK 1KFSA 4DV2K 1NGDA 2FC0A 3J7AP 2KKZA 3A5NC 1C0TA 2ASOA 5EOYA 3J8AA 1I2VA 4K0KK 1LW0A 2D1KA 5EXWA 4YDUA 3RVCA 3AY9A 2NRTA 4Z4GA 2O8EA 1JJ2M 2P9NA 4GVMA 3TAEA 1NK9A 4B1VA 3CM5A 4CGJA 5BREA 1X9MA 4O4GA 1MWKA 3O1BA 4IKFA 4B9LA 4DB3A 4DSFA 3FFIA 4CGFA 4KFBA 2E5LK 1NK0A 2YHBA 4ZTFA 1Y64A 4I9QA 3V9SA 1IKXA 1X9JA 4M3YA 2YHAA 2HHHK 3OBYA 1MYNA 1RDUA 3T3FA 4X65K 1WBDA 3SAFA 5FPMA 4CJEA 1K9MO 3QICA 4F4KA 3FZFA 4BECA 4M3RA 3PX4A 4KO0A 2VWKA 1G99A 3QEIA 5GIPA 3OYDA 1S1WA 2V52B 5M1NA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 4FWP A;  3MED A;  2HHQ A;  1RT7 A;  1NU0 A;  2YNG A;  1UWB A;  2UUA K;  4CF8 A;  2QW9 A;  1WSJ A;  3V9X A;  4H5V A;  4DSE A;  2DY4 A;  3PUF A;  4JN4 A;  3VEO A;  4CF2 A;  2O8B B;  4FWM A;  1J5O A;  4TSX A;  3MN5 A;  1Z25 A;  4XH1 A;  1RT3 A;  4CJT A;  1Q7Y O;  3R1X A;  4BRA A;  4CZG A;  4C8K A;  4FWQ A;  2P9I B;  5KK4 A;  2QA4 N;  1WAJ A;  1N34 K;  2W42 A;  1VQN N;  1SL1 A;  4X64 K;  3CYG A;  2VYP A;  2DTU A;  4K41 A;  3D2E B;  3LZJ A;  5BRF A;  1LQH A;  1L4V A;  4M42 A;  1BIU A;  3R6M A;  1TL1 A;  1JL1 A;  5AQF A;  3E1Y A;  5CE3 A;  2Q97 A;  3GG4 A;  5HBM A;  3ZX2 A;  1Q86 O;  5AQL A;  2B3C A;  1QSY A;  1BO5 O;  4EZ9 A;  1GLA G;  4AHC A;  3A8Y A;  1U2V A;  2G8U A;  2YIP A;  1QZ5 A;  4YDU C;  3QEW A;  3ZSX A;  3SBT A;  1VQL N;  3HP6 A;  1T3V A;  3JS6 A;  2HVI A;  3WXM B;  1CN2 A;  2E2P A;  3BEX A;  3KLI A;  3P31 A;  2GWK A;  3QB0 A;  4KTW A;  2IOC A;  2QKK A;  2KFN A;  4CJF A;  5TKW A;  3VF2 A;  4KHY A;  1IG9 A;  4M45 A;  4AHV A;  5AQJ A;  3V1R A;  1LCU A;  1Q81 O;  2DPN A;  3K59 A;  3VQD A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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