5AQVA

Fragment-based screening of hsp70 sheds light on the functional role of atp-binding site residues
Total Genus 125
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
125
sequence length
378
structure length
378
Chain Sequence
GPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Chaperone
molecule keywords HEAT SHOCK COGNATE 71 KDA PROTEIN
publication title A fragment-based approach applied to a highly flexible target: Insights and challenges towards the inhibition of HSP70 isoforms.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 125
structure length 378
sequence length 378
ec nomenclature ec 3.6.3.51: Transferred entry: 7.4.2.3.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5aqvA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqvA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqvA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5aqvA04
5AQUA 4BR4A 3H46O 1EQYA 2P9UB 4FWNA 4LC9B 3SMSA 4MO4A 1HJOA 3D7EO 4MO5A 2Q0UA 2V51B 2P9NA 5FPNA 3VEOA 4FWSA 3ZX3A 3VPZA 3HTVA 5AZJB 3W3DA 3EL2A 2E1YA 2Q0RA 3GDQA 1NGAA 4CZEA 5EX5A 5AQFA 2PAVA 4FOIA 1T6CA 2A5XA 3EKSA 3MMVA 3J8AA 3IMXA 1U2VB 2A6AA 1NGHA 3H3OB 3S41A 5FPMA 1OKJA 4BR9A 1V4TA 4CBWA 4BGBA 3UKUA 3ENOA 2Q2RA 3WXJA 4M7YA 3ULEB 4BR0A 2YHWA 4FWPA 3R6MA 5AFUA 2AA4A 1SQKA 3H1QA 3A5MC 3CIPA 4CBXA 3M3ZA 3FZFA 4JHDA 4H0YB 2QWRA 5AQPA 3OHRA 3WEEA 1BUPA 4O8KA 1GLAG 2E2QA 4JAXA 2GEMA 2E8AA 2FSNA 3GE1A 5EVZA 3CI5A 3MN5A 4BRLA 3L0QA 5KQDA 2CH5A 3ATUA 4B1ZA 1GLDG 3AAPA 3LDNA 4GNIA 3DXMA 1U6ZA 1DEJA 1C0GA 2IVNA 4C23A 5ELZA 4Z94A 4CZIA 4H0TB 3IUCA 2F9TA 3KZBA 5AQQA 1S3XA 3QMLA 1NM1A 3SK3A 2GTDA 1BA0A 1QZ6A 3SJHA 4CI6A 5AFUH 3CQXA 4WQ5C 1CZAN 3TPQA 2UYTA 3O1BA 3VGMA 5KQ8A 3WUHA 2DPNA 3D2FA 4H5TA 1H1VA 1MWKA 1NBWA 3D2EA 2GWKA 2V7YA 3MDQA 5JICA 2ASOA 3CJ7A 2IVOA 4DB3A 4CD1A 5CE3A 4B9QA 1NGCA 4XH5A 1MDUB 2HF4A 3VEWA 1MA9B 2A42A 2E2NA 2F9WA 3IDHA 3FGUA 5JLHA 2V52B 5AQZA 3O80A 2QM1A 1HKGA 4DQ8A 1T44A 4FWKA 4JN4A 1WUAA 3VEVA 4CZGA 3VEXA 2E20A 5AQWA 2P9SA 3F9MA 2BUPA 3LM9A 3HBTA 1NGJA 3C0BA 3GL1A 4H0XB 4BC2A 5AQSA 4FWLA 3WT0A 2E2PA 5JLFA 3A5NC 2YJEA 4BROA 1NMDA 3I33A 2FF3B 3CHWA 2QWQA 3HSCA 3JS6A 4K43A 4M63C 4XH4A 3QFUA 3GBTA 5BPNA 3L6QA 3R8EA 1X3MA 3H45C 3GOIA 3KVGA 4FSVA 3BF1A 4RWTA 3WEEB 3QFPA 4O5FA 5F2RA 5AQVA 2GELA 4YDUC 2QW9A 2FXUA 3HM8A 4QS7A 2W41A 3H3NO 4AM6A 4H0PA 4BVPA 3AY9A 4BREA 2QWMA 2GUPA 2D1KA 3O4WA 5F0XA 2A3ZA 3QB0A 3ATVA 2A41A 4FWQA 1KAXA 4FO0A 2D0OA 1C0FA 2H3GX 4K41A 2FLOA 1QQNA 3FZKA 3ZX2A 3B8AX 3QICA 1KAYA 2ZGYA 3AAQA 2NRHA 4GY2B 1XC3A 4B1YB 4A2BA 4BQLA 5BRFA 3DXMB 2D0PA 1LCUA 3RSEB 5BPMA 2HMPA 4BC4A 5AQJA 1GLBG 3VENA 3EKUA 4PKIA 4H0VB 4YDUA 1J6ZA 4A62A 4BRIA 1BG3A 5EY4A 3U9ZA 4B1WB 4ISGA 2EWSA 5AQXA 1RFQA 4IJNA 1BU6O 1QHAA 1TYQA 1YXQA 4XH1A 5LJVA 3H1VX 4HTLA 2VCPA 2Q36A 4A2AA 2J4RA 4B1UB 3LL3A 3O08A 4JNEA 2QXLA 3C7NB 3UB5A 2BTFA 4F9OA 3UKRB 3DXKB 4NB4A 3ZETA 2FF6A 3VF2A 1BO5O 5AZIA 4IO8A 3LDLA 1JCFA 4BR5A 4IXCA 4BRMA 5I9EB 2E88A 2QWPA 1NGGA 4BRKA 5BRHA 4BRHA 5AQOA 1S22A 2HF3A 2P9UA 5ADXA 3VETA 2E1ZA 3IFRA 3FZMA 4QS8A 4BRFA 2WUSA 4E1JA 3AARA 1BOTO 1K8KB 1HPMA 3U9DA 4BQZA 2P9LA 4CD3A 4BRPA 1ATSA 3U8XA 4H03B 3VEZA 3WXLA 4XEIA 3KHYA 4JD2A 3BP8A 3JXUA 4FWMA 2QWNA 4BR2A 5AQMA 4KBOA 3EZWA 5AQYA 5BR9A 3GG4A 3LM2A 1ATNA 2ASPA 3CERA 5AZJA 4H0OA 3A5OC 4B1VA 4CZMA 4EFHA 5BN9A 2I7NA 5TKYA 2P9NB 4CZLA 3HZ6A 1QQOA 4BRQA 5EXWA 1T6DA 4BRGA 3VEYA 2P9KA 1TUYA 4H5NA 1BWFO 3MCPA 3SLCA 2YCHA 3M1FA 4AM7A 5KPRA 3EO3A 4K25A 5ADXH 1NGIA 2D4WA 3FFKB 3G25A 5LY3A 2PBDA 3VF6A 1GLEG 3BUZB 3QBXA 3FR0A 5BN8A 3UKUB 5LJWA 5AQNA 1Y64A 3EN9A 3FZLA 5AQIA 1QQMA 3CJ9A 2P9IA 1V4SA 4CZHA 3L4IA 1KXPA 5BREA 4L3QA 3U4LA 1NGBA 3H6EA 4BRAA 3CJBA 4BG8A 1RDWX 1TYQB 2CGJA 4JHDB 3HI0A 1GLLO 1Z6RA 1NGEA 4CJ7A 1DGKN 1E4GT 1WOQA 1GLJO 1BDGA 1JCEA 3VF4A 3FE1A 4PKHA 1SZ2A 1YVNA 5FPEA 4BR7A 2ITMA 4I6MA 5BPLA 4FWOA 2GWJA 5AQLA 1TUUA 4BC3A 1GLCG 4WQ4C 1X3NA 1NLVA 2CGLA 2IVPA 3ZEUA 1NGDA 4BRDA 1E4FT 2P9LB 5B8HA 2QWOA 3BEXA 4CBUA 3CJ1A 4BG9A 2E2OA 4JD2B 3MK6A 5EOYA 2AP1A 1ATRA 1BA1A 4FL9A 2HOEA 1KAZA 2V7ZA 3FZHA 4H5RA 2VWBA 2CGKA 3VERA 2IIRA 2Q1NA 3D2FB 1P8ZA 3CJAA 2ZF5O 3CETA 4FPBA 4WYBA 3TU5A 3D2EB 3LDQA 1HKCA 4K42A 4WQ4A 4BGAA 3O6WA 1HLUA 3QBWA 4M7XA 2P9KB 3W0LA 1JCGA 2P9PA 2ZWHA 3DAWA 3DWLA 4ISEA 4DCHA 2Q31A 4BRNA 4PL8A 4CZFA 4IWVA 1HX1A 3O1WA 5FPDA 1G99A 5AQTA 1ZC6A 3O5BA 2W40A 4RCHA 2P9SB 4DHYA 2I7PA 3ENHA 3ID8A 3M6GA 2FSKA 4EHUA 5JMVA 3QDKA 5KPTA 1YUWA 5AQHA 3VGLA 4H5VA 2P9IB 1ZXOA 4FPAA 4ISFA 4BC5A 5AQKA 4A61A 3A0IX 4IZ9A 3WXIA 4CZKA 2FSJA 1D4XA 2NZTA 2Q97A 1XUPO 1YAGA 1ZBSA 1DKGD 2ASMA 3RSEA 4FWRA 4I6MB 3BF3A 3WXKA 3MN6A 1R59O 1NGFA 1U2VA 5E84A 4HWIA 1GLFO 3P4IA 4MLEA 3VESA 3VGKA 3FLCO 3I8BA 2OANA 1Q18A 3ZEUB 2YI1A 2YJFA 1RGIA 5AQGA 4QS9A 3DJCA 3ULEA 1IG8A 2YHYA 2ZGZA 4FOEA 1QZ5A 1MWMA 4J8FA 5AQRA 2KHOA 2YHXA 3MN9A 4MLHA 4BRCA 3UE5A 5AR0A 3A8YA 3WQUA 3CJCA 3C7NA 4IJAA 2QWLA 3LDOA 2VYPA 3DXKA 3UKRA 3VOVA 5E26A 4RTFD 5KPZA 1HKBA 3CQYA 4CZJA 3ZX0A 4BVOA 1ESVA 1SAZA 4EIAA 4PL7A 2NLXA 1IJJA 1XQSC 4NO7A 2P9PB 3ZETB 4EHTA 3LDPA 3O8MA 4H5WA 4WQ5A 3SMPA 4Y0WA 3WQTA 1HUXA 5AZIB 4EAHD 4B1XB 1K8KA 1NWKA 1X9JA 3MN7A 1Z05A 4PKGA 2A40A 1LOTB 3R9PA 3A5LC 5BRDA 2CH6A 5F1XA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3ZSZA 1BCOA 4BR4A 1ZVEA 1DLOA 1ASVA 1EQYA 2OTLN 3F2KA 1A5VA 5GIPA 4JKDA 1NKEA 2G8KA 5FRNA 3SMSA 1W7AA 5SWMA 4M3YA 1WN7A 4DTUA 1CXUA 4X64K 3KP1A 2V51B 4CGDA 3ALYA 2P9NA 4DV3K 2O8DA 1BI4A 3O9UA 5FPNA 5FDLA 1Q9XA 3ZX3A 1QSYA 3HTVA 3KLIA 4FK2A 3C65A 3MAQA 4FZXC 3CCEN 4C1NI 3GDQA 1XI1A 1NGAA 4JKEA 4BE2A 4IEIA 4E19A 5AQFA 2PAVA 3KK7A 3THXB 3S3MA 3EKSA 3D45A 1Z26A 4FJKA 3IMXA 1T0ZA 1U2VB 2A6AA 1NGHA 5FPMA 2BANA 4IFVA 4CBWA 4BGBA 3UKUA 1S6PA 3U6FA 3NFAA 4M7YA 3ULEB 4OLBA 2YHWA 3HL8A 5HRNA 3U3GA 3R6MA 3QO9A 3SF4D 4FLVA 3NGZA 2AA4A 1FKOA 4H0YB 3OHRA 3SQ0A 1BUPA 4O8KA 4X65K 1GLAG 1NE5A 1RBVA 3TSQA 4FVUA 3NF6A 4J2AA 1WMTA 1K8BA 1RT2A 3GE1A 5EVZA 1WSGA 3CI5A 4NCBA 4CF1A 2CH5A 4DFMA 4KFBA 1N36K 3LDNA 3AVMA 4E3SA 2O8CB 1C0GA 4PWDA 4H0TB 3IUCA 4G9ZA 3ZSYA 4BWJA 2ASCA 1NM1A 1BA0A 3CQXA 3T19A 4V19S 1IKXA 3HXMA 1CZAN 4W5RA 3DI6A 2UYTA 3DLEA 3O1BA 3AVJA 3VGMA 3NGIA 3D2FA 3QIOA 2IC3A 2A1SA 1NBWA 1XC9A 3MDQA 4LD0A 3TWHA 5JICA 2ASOA 1IKVA 4DB3A 1ITGA 4YOVA 1NGCA 1U4BA 3L2UA 4W5OA 1BCMA 1MA9B 2A42A 5CZ2A 5J1EA 1KVCA 2XRIA 4GV9A 2YKMA 2O8FA 3QERA 2QTDA 2LJMA 1JXEA 1BCGA 1WUAA 4YY3K 1VNAA 2BUPA 4BC2A 1WAFA 1C1CA 4DSJA 3TSPA 5AQSA 4LSNA 1RDAA 4FWLA 3CC4N 5JLFA 4M3TA 4R5PA 1SL1A 2Q3SA 3HSCA 4M63C 3D6RA 1X3MA 2EHGA 4RWTA 3BF1A 4DTSA 3LP1A 1S5JA 5KRSA 5F2RA 5AQVA 1RDUA 1QE1A 1JLEA 1LAVA 3ULDA 4AM6A 4H0PA 3AY9A 2NRXA 2GUPA 4WFBL 4HCCA 4Z4GA 4QAGA 3QB0A 4FWQA 4JKGB 4BECA 2D0OA 1TK5A 1HR0K 3NMUA 1QQNA 2NRWA 4YOTA 3B8AX 2VGMA 3QICA 1KAYA 4BQLA 4KYPA 1LCUA 3LPTA 2HHSA 5AQJA 1GLBG 4DSLA 2UXDK 3EKUA 4PKIA 3TTDA 4H0VB 5C25A 1NK4A 3RMDA 4YDUA 4FJIA 1J6ZA 3BZCA 4KHWA 3ZLJA 4BRIA 3CC7N 1KLMA 1BG3A 5EY4A 5IWAK 1EWQA 4CE9A 1ZBHA 3U9ZA 5TKWA 4IJNA 1L3TA 1TYQA 5LJVA 3SJJA 3H1VX 4HTLA 1MYNA 2W42A 3UB5A 3RTVA 3UKRB 4NB4A 1JKZA 2FF6A 5M1NA 4DTNA 4CJ3A 1BO5O 5KI6A 3LP2A 3LDLA 3NBPA 4FXDA 4BRMA 1NOZA 2QWPA 1Q8IA 1WLJA 1M1KO 4Q5VA 2E3GA 3FZMA 1OZZA 4BRFA 2WUSA 3AARA 1TV6A 1NK9A 3VQ7A 3SPZA 3QEWA 1O1WA 1NG9A 3U8XA 4A5AA 3DLKA 3VQDA 3KHYA 3BP8A 3JXUA 5DM6L 4Z4CA 4CHOA 2YIPA 5AQMA 3EZWA 4DLEA 4EP5A 5AQYA 4KH4A 3E7RL 5I3UA 2HHQA 2DFEA 3QI7A 2I7NA 1S1UA 4IG3A 3VQQA 2F96A 1T6DA 3NDKA 3V1OA 1TUYA 3AO3A 4I7FA 1POIA 2KFZA 3SLCA 4DQQA 1B9DA 4UJ0A 1C55A 5CYMA 3HRGA 1VAZA 2D4WA 4MFBA 3G25A 2UU9K 4B9UA 3KKRA 3QETA 3AO2A 3KWIA 3VF6A 1UA1A 3FR0A 1RBTA 1SKRA 3CCMN 3KLGA 3TAQA 3OYJA 3LWMA 2Y1IA 2A7TA 5LJWA 3KJVA 1Y64A 4C8OA 1FJGK 3FZLA 4UQGA 3KC6A 1V4SA 3THYA 3L4IA 1KXPA 1VSFA 4MDAA 5BREA 4DTJA 1N32K 4L3QA 1K8AO 3TAPA 1NGBA 1RDWX 1NPIA 1TYQB 4CJPA 4JI0K 3KD1E 4JHDB 2OZSA 4MQ3A 1E4GT 3AVLA 1WOQA 3LANA 3PSMA 2G8FA 3J80O 1SZ2A 1T7EA 4I9QA 1AHOA 4BR7A 3T7ZA 4JKAA 2VG5A 1WBBA 2JWKA 5AQLA 3RWUA 1TUUA 2Y1JA 1YIJN 4GKKK 4WQ4C 5M1FA 2CGLA 1NLVA 2IVPA 4C8KA 1VQ6N 1NGDA 2VG7A 2F8SA 1REVA 2QWOA 4CBUA 3SYZA 1SNBA 4BG9A 3MK6A 2AP1A 4KI4A 3J7YP 2O8BB 1RBSA 1QHTA 1KAZA 2OTJN 3D0PA 2BE2A 4Y1DA 4CJQA 2VWBA 3PIPL 1U49A 2PYJA 1L3UA 3VERA 2Q1NA 2XY7A 4BE7B 4DU3A 3CETA 3ZYYX 5KGWA 4JRQA 3D2EB 4Z4FA 1HQUA 2HHUA 4JI1K 3O6WA 4M7XA 1KVBA 1U47A 3K5LA 1I39A 3KP0A 4CJVA 2QA4N 4DV4K 1NRAA 4ELUA 3DAWA 4KH5A 2NY9X 4DCHA 1Z25A 4L8RB 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 5AQU A;  4BR4 A;  3H46 O;  1EQY A;  2P9U B;  4FWN A;  4LC9 B;  3SMS A;  4MO4 A;  1HJO A;  3D7E O;  4MO5 A;  2Q0U A;  2V51 B;  2P9N A;  5FPN A;  3VEO A;  4FWS A;  3ZX3 A;  3VPZ A;  3HTV A;  5AZJ B;  3W3D A;  3EL2 A;  2E1Y A;  2Q0R A;  3GDQ A;  1NGA A;  4CZE A;  5EX5 A;  5AQF A;  2PAV A;  4FOI A;  1T6C A;  2A5X A;  3EKS A;  3MMV A;  3J8A A;  3IMX A;  1U2V B;  2A6A A;  1NGH A;  3H3O B;  3S41 A;  5FPM A;  1OKJ A;  4BR9 A;  1V4T A;  4CBW A;  4BGB A;  3UKU A;  3ENO A;  2Q2R A;  3WXJ A;  4M7Y A;  3ULE B;  4BR0 A;  2YHW A;  4FWP A;  3R6M A;  5AFU A;  2AA4 A;  1SQK A;  3H1Q A;  3A5M C;  3CIP A;  4CBX A;  3M3Z A;  3FZF A;  4JHD A;  4H0Y B;  2QWR A;  5AQP A;  3OHR A;  3WEE A;  1BUP A;  4O8K A;  1GLA G;  2E2Q A;  4JAX A;  2GEM A;  2E8A A;  2FSN A;  3GE1 A;  5EVZ A;  3CI5 A;  3MN5 A;  4BRL A;  3L0Q A;  5KQD A;  2CH5 A;  3ATU A;  4B1Z A;  1GLD G;  3AAP A;  3LDN A;  4GNI A;  3DXM A;  1U6Z A;  1DEJ A;  1C0G A;  2IVN A;  4C23 A;  5ELZ A;  4Z94 A;  4CZI A;  4H0T B;  3IUC A;  2F9T A;  3KZB A;  5AQQ A;  1S3X A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3ZSZ A;  1BCO A;  4BR4 A;  1ZVE A;  1DLO A;  1ASV A;  1EQY A;  2OTL N;  3F2K A;  1A5V A;  5GIP A;  4JKD A;  1NKE A;  2G8K A;  5FRN A;  3SMS A;  1W7A A;  5SWM A;  4M3Y A;  1WN7 A;  4DTU A;  1CXU A;  4X64 K;  3KP1 A;  2V51 B;  4CGD A;  3ALY A;  2P9N A;  4DV3 K;  2O8D A;  1BI4 A;  3O9U A;  5FPN A;  5FDL A;  1Q9X A;  3ZX3 A;  1QSY A;  3HTV A;  3KLI A;  4FK2 A;  3C65 A;  3MAQ A;  4FZX C;  3CCE N;  4C1N I;  3GDQ A;  1XI1 A;  1NGA A;  4JKE A;  4BE2 A;  4IEI A;  4E19 A;  5AQF A;  2PAV A;  3KK7 A;  3THX B;  3S3M A;  3EKS A;  3D45 A;  1Z26 A;  4FJK A;  3IMX A;  1T0Z A;  1U2V B;  2A6A A;  1NGH A;  5FPM A;  2BAN A;  4IFV A;  4CBW A;  4BGB A;  3UKU A;  1S6P A;  3U6F A;  3NFA A;  4M7Y A;  3ULE B;  4OLB A;  2YHW A;  3HL8 A;  5HRN A;  3U3G A;  3R6M A;  3QO9 A;  3SF4 D;  4FLV A;  3NGZ A;  2AA4 A;  1FKO A;  4H0Y B;  3OHR A;  3SQ0 A;  1BUP A;  4O8K A;  4X65 K;  1GLA G;  1NE5 A;  1RBV A;  3TSQ A;  4FVU A;  3NF6 A;  4J2A A;  1WMT A;  1K8B A;  1RT2 A;  3GE1 A;  5EVZ A;  1WSG A;  3CI5 A;  4NCB A;  4CF1 A;  2CH5 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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