5AQXA

Fragment-based screening of hsp70 sheds light on the functional role of atp-binding site residues
Total Genus 118
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
118
sequence length
387
structure length
387
Chain Sequence
KAAAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVALNPQNTVFDAKRLIGRKFGDPVVQSDMKHWPFQVINDGDKPKVQVSYKGETKAFYPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDRTGKGERNVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVNHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASLEIDSLFEGIDFYTSITRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDLVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILIKSTRAAAS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Chaperone
molecule keywords HEAT SHOCK 70 KDA PROTEIN 1A
publication title A fragment-based approach applied to a highly flexible target: Insights and challenges towards the inhibition of HSP70 isoforms.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 118
structure length 387
sequence length 387
ec nomenclature ec 3.6.3.51: Transferred entry: 7.4.2.3.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5aqxA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqxA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqxA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5aqxA04
2OANA 4IJNA 3WQUA 1YVNA 3H6EA 3GDQA 4GY2B 1U2VA 4CBWA 5ADXH 3WUHA 2EWSA 3C7NB 4CZJA 2P9UB 1HKGA 4MLEA 4J8FA 3AY9A 4FSVA 1NMDA 3ZX2A 1NGHA 1SAZA 4ISGA 5LY3A 1G99A 1Q18A 4JD2A 3L6QA 4AM6A 1NGBA 1Z05A 4K42A 4JNEA 4FWQA 2QWMA 5EVZA 5AQPA 4BR4A 3O8MA 1YAGA 3C7NA 4B9QA 1QZ5A 2P9UA 1GLBG 2UYTA 3WXIA 3JXUA 2YHWA 3H3NO 4BRLA 3CJ7A 1NGFA 4PL8A 2V7ZA 2ASPA 2ZGZA 4DHYA 4I6MB 3FZLA 2VYPA 5BRDA 4PKHA 1BDGA 1NWKA 4EIAA 1S3XA 2GTDA 3EL2A 3QB0A 4CZEA 2PBDA 3HM8A 3LM9A 3GE1A 3BF3A 4XH1A 4WQ4A 3CIPA 2IVPA 3UKUB 4BVPA 3SMPA 1BA1A 3S41A 3VEYA 3QDKA 3U9DA 3ZETB 2WUSA 4CD1A 1DEJA 4RCHA 4I6MA 1V4SA 3IMXA 2E8AA 4FWOA 4BR2A 3FGUA 2FSNA 3L0QA 4H0TB 4CD3A 3MMVA 5JLHA 5AQOA 3D2EB 3FLCO 3H45C 1BG3A 4B1UB 5BR9A 2BUPA 4BQZA 3VEVA 3LDPA 2E2OA 1NBWA 5AQRA 3WXKA 3UKUA 4BRNA 2CGKA 1WOQA 5AZJB 4M7YA 3ZETA 4IXCA 3H1QA 3AAPA 3W0LA 2YCHA 4KBOA 5AR0A 4RTFD 4DB3A 3CJAA 1IG8A 2GEMA 1Y64A 3DXKB 5AQQA 4M63C 5KPRA 3D2EA 3KZBA 1E4FT 4BRFA 4IJAA 1MWKA 5JMVA 1C0FA 4WQ4C 3FZHA 3KVGA 2HF3A 5AQZA 3ATUA 1NM1A 4B1WB 4CZGA 4FPBA 5AZJA 4QS8A 2Q0RA 4C23A 5FPNA 5FPMA 4BRDA 1KAZA 2HMPA 2YHXA 4CI6A 4A61A 2CH6A 3DXKA 2NRHA 5AFUH 1NGAA 3VETA 3VPZA 1QHAA 5TKYA 4B1YB 2AP1A 2FSKA 3BEXA 5AQKA 3HBTA 3HSCA 4FL9A 3O4WA 5AQSA 2Q1NA 3DWLA 1MA9B 3QFUA 4H5WA 1S22A 4DQ8A 2W41A 4JN4A 5JLFA 4HWIA 1KAXA 4A2AA 1NGCA 2VWBA 1SZ2A 3M1FA 4H03B 4BRQA 1BU6O 3A5LC 3MN6A 3F9MA 1ZXOA 4BG9A 1RDWX 4BGAA 3B8AX 3EKUA 3BP8A 2Q97A 4FWLA 5BREA 3GBTA 5BPNA 3G25A 4H0OA 2NZTA 3QBWA 4LC9B 3H3OB 4BRGA 3AARA 1OKJA 2BTFA 2V51B 3HZ6A 5B8HA 3A5NC 2YJEA 4BR5A 3TU5A 3FZMA 1QQNA 3RSEB 4CBUA 2NLXA 5EXWA 3DXMB 2P9PA 2Q36A 5FPEA 4MLHA 4CZLA 4RWTA 4E1JA 2GUPA 2DPNA 2ITMA 1BO5O 3EN9A 4XH5A 3VEOA 5BPMA 5AQLA 1D4XA 2AA4A 3A0IX 3O1WA 3WQTA 2CH5A 2Q31A 3RSEA 3DJCA 3DXMA 1JCEA 3QBXA 3ULEB 4EHTA 3FZFA 4FO0A 4H0PA 4BRKA 4BR0A 2Q0UA 3VEWA 5AQXA 3SMSA 4GNIA 3JS6A 5AQNA 3IUCA 4K43A 3WEEB 1DGKN 3QICA 1BA0A 1RGIA 3GL1A 5KQ8A 3SK3A 4ISEA 5AZIB 3O1BA 3ULEA 3VGKA 1MWMA 1T6CA 5ELZA 3VEZA 3LDLA 5BRFA 2QWQA 3WEEA 3VGMA 1BWFO 3CI5A 2V7YA 3FR0A 2E88A 2CGJA 3MN7A 1HX1A 4BC3A 3H46O 3UB5A 4PKIA 3LDQA 4QS7A 4H5TA 1QQMA 1NGJA 3ZEUB 3TPQA 2E1YA 2I7PA 3U9ZA 4O8KA 3DAWA 3R8EA 1YUWA 4BR7A 5F1XA 1HLUA 2D4WA 3A5MC 2ASOA 3MK6A 4CZKA 2P9IB 4HTLA 1QZ6A 2FF6A 4FWMA 1NGGA 3HTVA 4BRPA 3O08A 4MO4A 3W3DA 1R59O 1TUUA 1MDUB 4H5NA 5I9EB 3ATVA 2HF4A 3ZEUA 4YDUA 3QMLA 4H0XB 4JAXA 4BG8A 5AQYA 1KAYA 3MCPA 3A8YA 3UKRB 2VCPA 2YJFA 3O80A 4CZHA 2ZWHA 1ESVA 4NB4A 2A6AA 3LL3A 3ZX3A 5EY4A 4BC2A 4AM7A 4FWPA 1DKGD 3ENOA 5AQWA 1C0GA 3J8AA 1NGIA 3CQXA 3VENA 2ZF5O 4EHUA 4FPAA 3UKRA 1X9JA 2P9KB 3HI0A 2QWRA 4A62A 4H0YB 1HUXA 1HJOA 5BN9A 3CQYA 4IWVA 3U8XA 1QQOA 1HKBA 1JCFA 4BC5A 3VEXA 4IO8A 2J4RA 1K8KB 4IZ9A 3R9PA 4YDUC 2Q2RA 2GWKA 2QWOA 5EX5A 4JHDB 4CZFA 3QFPA 4MO5A 2A5XA 2D0PA 4FOEA 4A2BA 3I8BA 4BC4A 1H1VA 2P9KA 3AAQA 1Z6RA 5AQHA 2ZGYA 3VOVA 2A3ZA 1ATSA 3WXJA 3FE1A 2W40A 2ASMA 5F0XA 4FWSA 1GLFO 3L4IA 1K8KA 4XH4A 1IJJA 4CZMA 5JICA 1ZBSA 4B1ZA 4JHDA 4L3QA 2FF3B 1HPMA 4Y0WA 3VESA 2QWPA 3ID8A 1TUYA 5E84A 5AQIA 4QS9A 4WQ5A 4BR9A 2QXLA 1E4GT 4K25A 2E1ZA 1NGDA 1GLJO 1XQSC 2FLOA 4FOIA 3CJ9A 4CZIA 3CERA 2HOEA 4DCHA 1GLLO 3FZKA 1GLAG 1XC3A 3OHRA 2PAVA 2V52B 2YHYA 2E2QA 1J6ZA 1ATRA 1T6DA 1GLEG 4CJ7A 5EOYA 1YXQA 3LDNA 5AQTA 5AQMA 1SQKA 3D7EO 3GG4A 4H0VB 5ADXA 1ATNA 1XUPO 3CETA 4BQLA 2IVNA 1X3MA 5KPZA 2H3GX 4BGBA 3M3ZA 1T44A 2P9SB 5KPTA 5BRHA 4H5RA 5BPLA 3D2FB 4WQ5C 1LOTB 5AQFA 3MN9A 5E26A 5AZIA 3WT0A 1U6ZA 1ZC6A 3R6MA 3BUZB 1WUAA 3EKSA 4Z94A 4BRHA 1KXPA 3A5OC 3O6WA 2P9SA 5LJVA 3CJBA 4PKGA 3SLCA 3D2FA 3CJCA 1JCGA 5AQJA 3U4LA 3KHYA 2E2NA 5KQDA 3VERA 4BRAA 2D0OA 3ZX0A 2QWLA 1HKCA 2GELA 3C0BA 3MN5A 2D1KA 3SJHA 2GWJA 2I7NA 1NGEA 3I33A 5BN8A 2A41A 5AQVA 2P9IA 2E20A 4B1XB 2KHOA 3GOIA 3CJ1A 4FWKA 4EFHA 4BRIA 1TYQB 2P9NB 5AFUA 4BRCA 1NLVA 4BRMA 4BVOA 2E2PA 5CE3A 4CBXA 3M6GA 4FWNA 3FFKB 1EQYA 4ISFA 3UE5A 3ENHA 2P9LB 4H5VA 2CGLA 1LCUA 1X3NA 1GLDG 4B1VA 4BREA 2IIRA 3EZWA 4WYBA 3MDQA 5AQGA 3LM2A 3BF1A 3VF4A 1TYQA 4O5FA 4PL7A 2P9NA 1CZAN 4F9OA 3LDOA 3CHWA 3P4IA 5LJWA 4K41A 2A42A 4XEIA 5FPDA 2FXUA 5AQUA 3WXLA 1BUPA 2F9TA 2QW9A 3IDHA 1U2VB 1GLCG 1V4TA 2P9LA 1RFQA 3VGLA 5F2RA 2FSJA 2A40A 2YI1A 1BOTO 3VF2A 2QWNA 2IVOA 3EO3A 3H1VX 2P9PB 1P8ZA 2F9WA 4JD2B 4M7XA 4BROA 4NO7A 2QM1A 3O5BA 3IFRA 3VF6A 4EAHD 4FWRA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4B8AB 1ZBLA 3EE8A 3AVMA 5HLFA 4AAZA 1GOBA 2YIPA 3C7NB 1WBDA 1HKGA 4R79A 3T1HK 1U4BA 3ZSXA 3J81O 4ISGA 5LY3A 4JD2A 3CYGA 3LWMA 3CCVN 4DV4K 1SKRA 1L3VA 2VGMA 3AVCA 4CJEA 3L3VA 5C25A 4B9QA 2OA8A 5GAEP 1I94K 3HOSA 4KHQA 2DFHA 3ZLJA 4DHYA 4I6MB 3FZLA 1L3SA 3JYTA 3AO3A 4PKHA 1BDGA 3V81A 1S3XA 2GTDA 3QB0A 5C2FA 1KTQA 1UAXA 3HM8A 4FJ5A 3HRGA 4Z4IA 2OZMA 1BISA 3BF3A 1S1XA 4WQ4A 5JS2A 3L2QA 2WTUA 3CIPA 4LSNA 1OH6A 1JKZA 4JI2K 1Q8IA 4BVPA 3SMPA 3NBPA 3VEYA 5CZ1A 1WNSA 4Q0BA 3ZETB 1HYSA 1CZ9A 4RCHA 3VQ6A 2F4VK 4BR2A 2E8AA 4DSKA 3TAEA 2K35A 4YY3K 3OYJA 3OYAA 1KV0A 2B5JA 2G8UA 5JLHA 4PQUA 3D2EB 3H45C 5BR9A 4UJ0A 5C12A 4FLXA 2LR3A 1KFSA 3OY9A 4FXDA 4IG3A 3WXKA 1VQON 1D8YA 1N36K 1WOQA 5AZJB 1UA1A 2E3GA 3H1QA 1NU0A 3I8DA 1IG8A 1Y64A 5KPRA 4KB1A 1K8AO 4M41A 4C8LA 4IJAA 1MWKA 2G8KA 3E1YA 4JI0K 1LV5A 4CJ4A 2OPPA 2HF3A 3G4SN 2C1GA 4WFBL 1NM1A 3VQBA 1YIJN 2BE2A 2Q0RA 3ASMA 4AQYK 1NJXA 2G8VA 2UXDK 3E7RL 5C42A 2HMPA 2Y1JA 2IS3A 1ITGA 4Y1DA 2CH6A 4DR7K 3QESA 2NRHA 4DLGA 5LMNK 4B3OA 1SUQA 4RW8A 5TKYA 2MBKA 4BWJA 3PX4A 5AQKA 4CJFA 4DTUA 1KD1O 3O9TA 4FL9A 3WNEA 3O4WA 4FZXC 3MXMA 1GOAA 5HRSA 2GV9A 5AQSA 2Q1NA 2GMOA 4FJIA 1G15A 4J2DA 3AGKA 3QFUA 2W41A 3SPZA 1N5YA 4DS5A 2P1JA 4JI5K 2VWBA 1SZ2A 2KLAA 2HHWA 4BRQA 1HYZA 5GINA 2E2FA 3KIOA 1ZXOA 4BG9A 3BP8A 4KRFA 1NPIA 2Q97A 4JKGB 3SBGA 1HR0K 5CY0A 3BY5A 3J7ZO 1LWEA 2NZTA 4O44A 4KTQA 3A2FA 4O4GA 3TSUA 4HUEA 4KHUA 4BRGA 3TARA 3AARA 1T05A 1MU2A 4NCBA 2BTFA 2N66A 1TKXA 4KPYA 3TU5A 3FZMA 4W5RA 2F7TA 2YKNA 1DTQA 3K58A 2FBXA 2OTLN 4RWTA 1QHTA 3SAGA 5KGXA 2DPNA 4UAEF 3EN9A 4XH5A 1E3MA 1D4XA 1RBTA 3NE6A 3O1WA 2XO7A 1VQ7N 1EWQA 3THWA 1TL1A 2FC0A 3RSEA 3DXMA 3KTQA 3TSPA 1RT2A 3V9SA 4BR0A 3VEWA 4I7FA 4DUYK 4GNIA 4CEDA 1NK0A 4DSJA 3P38A 1S5JA 1BA0A 2QXFA 4JLHA 4GV9A 4DQQA 4ISEA 4MFBA 1N32K 1D9DA 3O1BA 3ULEA 5HRPA 4YNQA 4E0DA 3KLGA 1CLQA 1MWMA 2IAJA 5IT9O 1UOCA 4AILC 3LDLA 5BRFA 3CFPA 3SAFA 3HM9A 1XHZA 3THXA 4CIEA 2HB5A 1TKTA 2WC9A 4IEEA 5JENA 1VSMA 3DOKA 4CF8A 3BZKA 3ZT4A 1BI4A 4PKIA 3NGYA 3PO4A 4FVUA 2LSNA 2WBNA 4CK2A 3K5OA 4O8KA 5DM7L 4LF4K 4DQIA 3DAWA 3KK1A 2OPSA 3MK6A 1SL1A 2O8FB 4KI4A 3OA9A 2FF6A 1NGGA 4BRPA 3O08A 1HQEA 3VQDA 4B9UA 4CHOA 4A5AA 3CCMN 2HF4A 5C10A 4JAXA 4BG8A 2DTUA 3KLIA 3KOWA 4HHFA 2G2KA 3LP0A 3UKRB 2VCPA 4RW4A 2ZWHA 1ESVA 3E9LA 1T7EA 4AB0A 3LL3A 2UXBK 1OVYA 4CGFA 5EY4A 4BC2A 2ATBA 1DKGD 3ENOA 3KK2A 3NDKA 3QINA 2ZJQL 4JRQA 2NRVA 3SNNA 1NGIA 4X62K 4NYNA 4CERA 1LWCA 4FK2A 4DV3K 4EHUA 2W6LA 4OGCA 1EXQA 3AA2A 3OYKA 3HOTA 1VK0A 4WF9L 1HJOA 2QA4N 2FBTA 4IWVA 3U8XA 3EZ5A 3OJSA 2KTQA 1TI5A 3VEXA 3TAMA 1K8KB 4KTWA 2QWOA 1HQUA 1IKWA 5KRSA 4CZFA 1WAFA 1UWBA 4FOEA 3I8BA 4KREA 3FFIA 2A3ZA 3QERA 2HHIA 3MAQA 4CJSA 1RT7A 4ILHA 4DU4A 3V9ZA 3KKSA 3F2KA 2KZMA 2ZE2A 4JK7A 4DF4A 1YTUA 4JS4A 3TR8A 2X74A 4L3QA 4K8ZA 2FF3B 1OZZA 1HPMA 3VESA 3VQ8A 4LFBK 1RBUA 3V6DA 4IFVA 4X66K 1QVGM 5LL6Z 4CHYA 1XMOK 5CYMA 4BR9A 1E4GT 3CM5A 2DFEA 4CFCA 4ELUA 2PYJA 1NGDA 1GLJO 4Z4HA 3R2VA 3CERA 4FK0A 1X9SA 2HOEA 3FZKA 3VQQA 1WSIA 2PAVA 4UQGA 2B6AA 2B4JA 2W00A 1GLEG 4KH5A 2IDOA 4CJ7A 4RW6A 3OYBA 4DR6K 2BDPA 3CC2N 1SQKA 3PSFA 3GG4A 4H0VB 1OH7A 3D6RA 4FLZA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4B8A B;  1ZBL A;  3EE8 A;  3AVM A;  5HLF A;  4AAZ A;  1GOB A;  2YIP A;  3C7N B;  1WBD A;  1HKG A;  4R79 A;  3T1H K;  1U4B A;  3ZSX A;  3J81 O;  4ISG A;  5LY3 A;  4JD2 A;  3CYG A;  3LWM A;  3CCV N;  4DV4 K;  1SKR A;  1L3V A;  2VGM A;  3AVC A;  4CJE A;  3L3V A;  5C25 A;  4B9Q A;  2OA8 A;  5GAE P;  1I94 K;  3HOS A;  4KHQ A;  2DFH A;  3ZLJ A;  4DHY A;  4I6M B;  3FZL A;  1L3S A;  3JYT A;  3AO3 A;  4PKH A;  1BDG A;  3V81 A;  1S3X A;  2GTD A;  3QB0 A;  5C2F A;  1KTQ A;  1UAX A;  3HM8 A;  4FJ5 A;  3HRG A;  4Z4I A;  2OZM A;  1BIS A;  3BF3 A;  1S1X A;  4WQ4 A;  5JS2 A;  3L2Q A;  2WTU A;  3CIP A;  4LSN A;  1OH6 A;  1JKZ A;  4JI2 K;  1Q8I A;  4BVP A;  3SMP A;  3NBP A;  3VEY A;  5CZ1 A;  1WNS A;  4Q0B A;  3ZET B;  1HYS A;  1CZ9 A;  4RCH A;  3VQ6 A;  2F4V K;  4BR2 A;  2E8A A;  4DSK A;  3TAE A;  2K35 A;  4YY3 K;  3OYJ A;  3OYA A;  1KV0 A;  2B5J A;  2G8U A;  5JLH A;  4PQU A;  3D2E B;  3H45 C;  5BR9 A;  4UJ0 A;  5C12 A;  4FLX A;  2LR3 A;  1KFS A;  3OY9 A;  4FXD A;  4IG3 A;  3WXK A;  1VQO N;  1D8Y A;  1N36 K; 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