5AQYA

Fragment-based screening of hsp70 sheds light on the functional role of atp-binding site residues
Total Genus 121
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
121
sequence length
387
structure length
387
Chain Sequence
AKAAAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVALNPQNTVFDAKRLIGRKFGDPVVQSDMKHWPFQVINDGDKPKVQVSYKGETKAFYPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDRTGKGERNVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVNHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASLEIDSLFEGIDFYTSITRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDLVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILIKSTRAAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Chaperone
molecule keywords HEAT SHOCK 70 KDA PROTEIN 1A
publication title A fragment-based approach applied to a highly flexible target: Insights and challenges towards the inhibition of HSP70 isoforms.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 121
structure length 387
sequence length 387
ec nomenclature ec 3.6.3.51: Transferred entry: 7.4.2.3.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5aqyA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqyA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqyA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5aqyA04
3RSEA 4H0PA 4A2BA 5AQVA 3F9MA 3EO3A 2E2OA 2HF3A 2IVNA 3AARA 2ZGYA 4EHTA 3VPZA 3BF1A 1IG8A 4JHDB 4H5NA 1GLLO 5LY3A 1T6CA 3ENHA 3O6WA 3CQXA 4NB4A 3JS6A 5AZIB 3SK3A 1Y64A 4M7YA 1KAXA 2H3GX 3MN7A 3VETA 3A5LC 4JD2A 3FR0A 4JN4A 4A62A 3SMPA 3VEZA 4H0VB 3MMVA 4H0XB 4HWIA 2ITMA 3L6QA 3AAQA 3H1VX 4FSVA 4BRQA 1KAYA 3VENA 3L0QA 4K42A 5AQHA 3H3OB 3W0LA 1GLEG 1NMDA 3HBTA 3ZX0A 3J8AA 4BRFA 3AAPA 2QWOA 3UB5A 3LM9A 1ESVA 2NLXA 4BR4A 5BRFA 4FOEA 3LM2A 4PKIA 2A40A 3VOVA 4DHYA 3TPQA 4I6MA 3C7NB 2I7NA 3WUHA 4FWQA 4PKGA 1TYQB 2P9KA 4GNIA 4CZGA 3VF2A 4YDUA 4WQ4C 2FSKA 4H5VA 5EVZA 5AQGA 3GE1A 4BVPA 4FOIA 5JICA 4FWMA 3HSCA 2A41A 5AQSA 5TKYA 3D7EO 4JAXA 3CJCA 4Z94A 4H03B 1GLBG 2Q36A 3VERA 5B8HA 1KXPA 2D1KA 5ELZA 1K8KB 5BRDA 3BP8A 1CZAN 2DPNA 1QZ6A 3A5MC 5BREA 1GLJO 1GLCG 3HTVA 4BREA 4CZKA 2PBDA 5AQZA 2ZF5O 4BC2A 3ULEA 4A61A 3LDLA 3R6MA 2GUPA 2GTDA 3D2FA 3FZLA 2YHYA 3P4IA 4GY2B 4B1ZA 3GL1A 5AQQA 2YJFA 1NGJA 4FL9A 3WXKA 1OKJA 3SJHA 4CBUA 1IJJA 1QQOA 4M7XA 1NGGA 4EFHA 2GWKA 4JHDA 5BN8A 2HOEA 4MLEA 1NBWA 3KZBA 5AQFA 4B1YB 3A5OC 3H45C 4QS9A 3ENOA 3U9ZA 1WUAA 3ZETB 1ZC6A 3UKRB 3MDQA 2F9TA 4FWOA 1V4SA 4H0TB 5AZIA 2D0OA 2A5XA 5FPNA 2A6AA 3O08A 2Q31A 4BRHA 5FPEA 3DJCA 4BC5A 1P8ZA 1NGCA 2KHOA 1TUUA 3CI5A 5BPNA 3ATVA 2W41A 4M63C 3CETA 1Z05A 1NWKA 3R9PA 5KPTA 4PL8A 3LDOA 5KQ8A 2A42A 4QS7A 4AM7A 3VEXA 4BC3A 4CJ7A 3H46O 3FFKB 4DQ8A 4EHUA 5AQIA 1JCEA 4CZHA 5AQTA 1NGFA 5BN9A 1D4XA 4XH1A 1LCUA 1NM1A 1BG3A 2I7PA 3CIPA 3OHRA 3H6EA 3BUZB 5AQPA 3C7NA 1HUXA 3M6GA 4B1VA 4RTFD 4F9OA 3QFPA 1TYQA 4XH5A 3QB0A 1XQSC 1RGIA 1YAGA 3UKUB 1WOQA 1NGEA 4CD1A 2Q0UA 3DXMB 1JCGA 1K8KA 5E84A 3M1FA 5AQOA 1DGKN 3ID8A 4L3QA 3WT0A 2VWBA 2P9NB 2ASPA 2FXUA 5CE3A 3KVGA 1Z6RA 2Q0RA 2E20A 3VESA 4K25A 3WEEA 2GEMA 1NGHA 4RCHA 3QMLA 4CBWA 3WQTA 3VEOA 3D2EB 2ZGZA 3O1BA 2IIRA 5ADXA 1HPMA 3GOIA 4AM6A 4E1JA 3EKUA 4WQ5A 2D4WA 4ISFA 2CH5A 4BRLA 5LJWA 3QBWA 3ZETA 1NGDA 2YHWA 1X9JA 2W40A 4IO8A 4O5FA 4DB3A 1RDWX 1SAZA 4KBOA 1HJOA 3U4LA 3VEYA 5EOYA 1HKBA 3CJBA 2FSJA 3HI0A 1S22A 4BG9A 2UYTA 2YCHA 4BRGA 1J6ZA 3IMXA 4LC9B 4YDUC 3U8XA 1GLFO 4BRAA 3ZEUB 4FWLA 2P9IB 2V7YA 3RSEB 3VEVA 4IWVA 5JMVA 2YI1A 2V7ZA 5AFUA 3IFRA 3WXIA 1T44A 5AZJB 1BA0A 1S3XA 3A5NC 4FWPA 3WQUA 3H3NO 5BRHA 4NO7A 5AQUA 1MWKA 5EY4A 3LDPA 4IJNA 3CQYA 4BR2A 4CZLA 1XC3A 3O80A 3JXUA 3LDNA 4JD2B 2EWSA 4ISEA 1DEJA 4BRKA 3U9DA 5JLHA 3H1QA 2QWRA 1MA9B 3UE5A 3DXMA 1ATRA 3AY9A 1E4GT 3B8AX 1C0GA 1SQKA 2P9NA 3G25A 1R59O 3VGKA 5ADXH 5AQLA 4CBXA 5F1XA 2Q2RA 2A3ZA 3FLCO 1BUPA 3IDHA 5AQKA 1QQNA 4BR0A 1QHAA 4A2AA 1MWMA 3HZ6A 4FPAA 4HTLA 2P9PB 3D2EA 2GELA 4BRMA 2Q1NA 1X3MA 5BPLA 1LOTB 2HMPA 3GDQA 3LDQA 5BR9A 5EX5A 5KPZA 1H1VA 2AA4A 2PAVA 4XEIA 1SZ2A 5AQYA 4FPBA 4PKHA 3ATUA 2GWJA 2BTFA 1BU6O 2E2NA 5AQJA 1T6DA 2ZWHA 1TUYA 2AP1A 2E2PA 5F0XA 2NZTA 3I8BA 3MN5A 5KQDA 4EIAA 1U2VB 4IJAA 5AFUH 4FWRA 4IZ9A 1QQMA 4DCHA 1C0FA 2OANA 2CH6A 2YHXA 3FGUA 2FSNA 4XH4A 4BQLA 2FF6A 5EXWA 3EKSA 4BRNA 2YJEA 1ATNA 1YVNA 4MO5A 4B1UB 4JNEA 3DXKB 4K43A 3A0IX 3D2FB 2P9LB 1G99A 5E26A 5AZJA 2FF3B 3S41A 2HF4A 2QM1A 4BC4A 3VF4A 3ZX3A 4H5WA 1GLDG 1ZXOA 1BOTO 4BROA 1MDUB 3BF3A 3FZKA 1YUWA 2V52B 1ATSA 4H0OA 3WXJA 3C0BA 4CZJA 4FO0A 3CJ7A 1Q18A 5F2RA 3EZWA 4CZIA 3VEWA 3WXLA 1U6ZA 3QDKA 3VGLA 4BVOA 4EAHD 2Q97A 1DKGD 4Y0WA 4BQZA 3TU5A 4MO4A 4BRCA 1EQYA 3FZMA 4BR9A 2VYPA 3UKRA 3GBTA 4WQ5C 2E1YA 2BUPA 2QWPA 4BG8A 2P9UB 1QZ5A 2P9SB 5AQNA 2D0PA 5JLFA 1BDGA 1BO5O 3KHYA 1KAZA 1JCFA 4FWSA 5AQMA 2QWMA 4BRIA 1NGIA 2F9WA 2WUSA 4BRDA 1BA1A 3O4WA 4O8KA 5I9EB 2P9PA 4CZEA 5AR0A 2E2QA 4WQ4A 1NGAA 4BGAA 2ASOA 4BR5A 3O5BA 1NLVA 1BWFO 3A8YA 1RFQA 5AQRA 5FPDA 2QWNA 3MK6A 3QFUA 1YXQA 4CZFA 3LL3A 2ASMA 2CGJA 3IUCA 4C23A 4MLHA 2QW9A 1U2VA 1HX1A 5AQXA 3CJ1A 3DAWA 4FWKA 3L4IA 3BEXA 5BPMA 1NGBA 4BRPA 3UKUA 1V4TA 5LJVA 4B1XB 4CD3A 3MN9A 4J8FA 3FZFA 3CHWA 3WEEB 4QS8A 2FLOA 3SMSA 3W3DA 3DXKA 2QXLA 2NRHA 2P9LA 3EN9A 2E88A 4H5RA 3EL2A 3SLCA 3CERA 4BR7A 4PL7A 4WYBA 3CJAA 1E4FT 3ZX2A 4RWTA 2VCPA 4B1WB 3DWLA 1X3NA 1ZBSA 3O1WA 4CZMA 4B9QA 2V51B 2IVPA 2J4RA 4I6MB 1HKCA 1XUPO 2P9KB 3QBXA 3CJ9A 4ISGA 3I33A 3M3ZA 5FPMA 1HKGA 3FE1A 4IXCA 3R8EA 3MN6A 1GLAG 3HM8A 3VGMA 3MCPA 3VF6A 4FWNA 2QWQA 4K41A 3FZHA 1HLUA 2P9UA 2CGLA 2P9SA 4H5TA 3GG4A 2IVOA 3QICA 2E8AA 4H0YB 4BGBA 2QWLA 2CGKA 5AQWA 3O8MA 5KPRA 2E1ZA 3ULEB 3ZEUA 2P9IA 4CI6A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3DLRA 2VWJA 1RILA 1W7AA 3KOXA 5AQVA 1TKTA 4DKWA 2ZGYA 3LALA 5CZ1A 2IGIA 4LFCK 3VPZA 1SKRA 2YC1C 4JHDB 1VSFA 3C6HA 1GLLO 1TKDA 4OLBA 4BE2A 1N32K 5LY3A 3ENHA 4YOXA 1JLCA 4DTSA 4NB4A 4FM2A 1RT4A 3MN7A 3K5OA 3A5LC 4JD2A 2ASCA 4A62A 3SMPA 4KI6A 1E3MA 4H0VB 2RE2A 1SNBA 1BRZA 4HWIA 1QE1A 2XY7A 3OYKA 4KH6A 4DR5K 4K8XA 1KAYA 5M1FA 3VENA 1GOAA 1WAFA 5AQHA 3W0LA 1GLEG 1VQ7N 3ZSWA 3ZX0A 1LWEA 2QXFA 4CIFA 1ESVA 1BQNA 2WTUA 4ELUA 3KD5E 4PKIA 2I7NA 4PKGA 1OVQA 5J1EA 4GNIA 2HNZA 4O55A 3SQ2A 4DUYK 1LQQA 2PFUA 4WQ4C 4H5VA 3OYBA 5JICA 3QEXA 5TKYA 1WSJA 1ASVA 3MAQA 4JI8K 4Z94A 4H03B 2Q36A 1Q9YA 3K5MA 4BACA 4FW1A 1K8KB 1CZAN 5C12A 2DPNA 5BREA 4DR7K 5TKWA 4ID1A 1M90O 4CZKA 3ITHA 2YHBA 1SL1A 1CXUA 4DV5K 4E0DA 3PLAA 2GUPA 3QNNA 3P4IA 2HB5A 3GL1A 1XHXA 1VSHA 1OKJA 2QKKA 4CBUA 1IJJA 1FK9A 3QIPA 3OYIA 2VQEK 1IKWA 4FJ5A 4FJNA 1NGGA 2NRXA 4JHDA 2G8UA 4HUGA 4KH5A 2F7TA 5AQFA 4B1YB 3LWLA 4M3TA 3ENOA 1VQ9N 1VQON 1VQ8N 1RTIA 1TK5A 4O0IA 2F9TA 3NBPA 3CCEN 2D0OA 2A5XA 2A6AA 3O08A 4BRHA 3NE6A 3OBYA 5FPEA 1TKXA 3J80O 1VQ6N 1TUUA 4DS5A 3DMJA 3ATVA 1I3AA 2W41A 3AGRA 3CETA 4W5RA 2OPQA 4DQSA 4JKGB 3L56A 4CCHA 3E7UX 1RTHA 3B6OA 2A42A 2IDOA 4CJ7A 2HHHK 3FFKB 1YF5L 1L3SA 4E72A 1DJTA 2D56A 3VQQA 1JCEA 4CZHA 4XH1A 4GKKK 4BE7B 1QSLA 3OHRA 3H6EA 4RTFD 3ZT3A 1IKVA 1WBDA 4CJEA 3CFPA 5HL7L 4FJMA 1YAGA 3SQ4A 3JYTA 2Q0UA 1K8KA 1DGKN 4FJJA 3WT0A 1VSEA 4B9LA 2P9NB 4FK4A 2ASPA 1C0UA 3ZT2A 4FVMA 4FZYA 3OTOK 2ZJQL 3HPHA 3QI7A 1UOCA 2GEMA 5CY0A 3LP2A 1OZZA 4CJWA 4CBWA 3CM6A 4CJQA 3VN5A 4HTUA 1W97L 1K9MO 1HPMA 3OJUA 4GV3A 3UIQA 3EKUA 4AILC 4WQ5A 5E41A 3J7ZO 4CQKA 4LFAK 4JI6K 1WWNA 1K8BA 1VQLN 4FJLA 2YHWA 4IDHA 1WMTA 3O4NA 1WN7A 1JKZA 3MECA 3U4LA 1WSHA 3VEYA 4EP5A 1RDAA 1FW6A 1A5XA 5C0YA 4BG9A 2ETJA 1J6ZA 4KB0A 4PHTX 4JS4A 2DFFA 4JKGA 1S1VA 3ZEUB 4FWLA 3RMDA 4YOUA 4OPKA 1VSJA 2YI1A 2V7ZA 1XMQK 5K14A 1JLFA 3V9WA 3RMCA 1X9SA 1VQ5N 1QQCA 2BDPA 1S3XA 3VQEA 5HP1A 3WQUA 2F96A 2PYJA 3R2VA 2G2KA 2KGQA 4B3OA 1RT7A 4X65K 3THYB 4LF8K 1HR0K 1XC3A 4KTQA 4E1NA 3V1OA 2XO7A 1TVRA 4CHQA 3JXUA 4A59A 4J2EA 5JS2A 3PX0A 3SCXA 5A2QO 3VA3A 1KVCA 3U9DA 3ZCMA 2OTLN 1MA9B 3QERA 1ATRA 3AY9A 1B9DA 2P5GA 1C0GA 2P9NA 1B9FA 3G25A 3G71N 3VGKA 2YX6A 3S9HA 4JS5A 3FLCO 3K9KA 1C1CA 4DFPA 2YIOA 2HBLA 2QEXN 2W6LA 4CJPA 1RDUA 4UQGA 1X3MA 3LDQA 4JKFA 3VTIA 5BR9A 3SBGA 3PO5A 1LAVA 4PKHA 1I2VA 3KK7A 1U04A 3MX5A 3O3GA 1JXBA 5CHIA 4JI3K 1HPZA 4M41A 2O8BB 4CEFA 2HHSA 3I8BA 1U2VB 2YNFA 2ZJPL 4IZ9A 5HRSA 4E7HA 4DCHA 4RW6A 3CC7N 2FBVA 3FGUA 2HMIA 3DLEA 4BQLA 4BRNA 2YJEA 2DTUA 4MO5A 4JNEA 3NMUA 3OYAA 4DU3A 1RDCA 3NGIA 3DOKA 2P5OA 3S41A 4N56A 4BC4A 1GLDG 1ZXOA 3TAGA 3C95A 4FW2A 4OX9K 1MDUB 3THYA 3FZKA 4H0OA 4DSJA 4FO0A 3CJ7A 1TI5A 3OYJA 3EZWA 4CZIA 1U6ZA 4JI7K 3GKUA 1XRSB 4Y0WA 4MO4A 4XIUA 5M1NA 5KTQA 1NKEA 2K35A 3NH2A 2B6AA 2IOCA 2QWPA 1NRAA 2P9UB 4KHQA 4CERA 1CHZA 4LSLA 4ILJA 3SV4A 1KAZA 4B3TK 3KLEA 1JJ2M 4KH4A 3PO4A 3THVA 4BRIA 2F9WA 4EZ9A 3O4WA 5I9EB 1YJ9N 4BGAA 2ASOA 4BR5A 3T3FA 4JK7A 4CJTA 4AHSA 1BWFO 2NRZA 3A8YA 3OYFA 4JI2K 3RMBA 2NY8X 3LL3A 4IG0A 2ASMA 2KBKA 1L4VA 2CGJA 2O8BA 1EX4A 2QW9A 1U2VA 4CGIA 1KQSM 4CHPA 4JI4K 3NF7A 3L4IA 4B3SK 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3DLR A;  2VWJ A;  1RIL A;  1W7A A;  3KOX A;  5AQV A;  1TKT A;  4DKW A;  2ZGY A;  3LAL A;  5CZ1 A;  2IGI A;  4LFC K;  3VPZ A;  1SKR A;  2YC1 C;  4JHD B;  1VSF A;  3C6H A;  1GLL O;  1TKD A;  4OLB A;  4BE2 A;  1N32 K;  5LY3 A;  3ENH A;  4YOX A;  1JLC A;  4DTS A;  4NB4 A;  4FM2 A;  1RT4 A;  3MN7 A;  3K5O A;  3A5L C;  4JD2 A;  2ASC A;  4A62 A;  3SMP A;  4KI6 A;  1E3M A;  4H0V B;  2RE2 A;  1SNB A;  1BRZ A;  4HWI A;  1QE1 A;  2XY7 A;  3OYK A;  4KH6 A;  4DR5 K;  4K8X A;  1KAY A;  5M1F A;  3VEN A;  1GOA A;  1WAF A;  5AQH A;  3W0L A;  1GLE G;  1VQ7 N;  3ZSW A;  3ZX0 A;  1LWE A;  2QXF A;  4CIF A;  1ESV A;  1BQN A;  2WTU A;  4ELU A;  3KD5 E;  4PKI A;  2I7N A;  4PKG A;  1OVQ A;  5J1E A;  4GNI A;  2HNZ A;  4O55 A;  3SQ2 A;  4DUY K;  1LQQ A;  2PFU A;  4WQ4 C;  4H5V A;  3OYB A;  5JIC A;  3QEX A;  5TKY A;  1WSJ A;  1ASV A;  3MAQ A;  4JI8 K;  4Z94 A;  4H03 B;  2Q36 A;  1Q9Y A;  3K5M A;  4BAC A;  4FW1 A;  1K8K B;  1CZA N;  5C12 A;  2DPN A;  5BRE A;  4DR7 K;  5TKW A;  4ID1 A;  1M90 O;  4CZK A;  3ITH A;  2YHB A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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