5AQYA

Fragment-based screening of hsp70 sheds light on the functional role of atp-binding site residues
Total Genus 121
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
121
sequence length
387
structure length
387
Chain Sequence
AKAAAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVALNPQNTVFDAKRLIGRKFGDPVVQSDMKHWPFQVINDGDKPKVQVSYKGETKAFYPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDRTGKGERNVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVNHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASLEIDSLFEGIDFYTSITRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDLVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILIKSTRAAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Chaperone
molecule keywords HEAT SHOCK 70 KDA PROTEIN 1A
publication title A fragment-based approach applied to a highly flexible target: Insights and challenges towards the inhibition of HSP70 isoforms.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 121
structure length 387
sequence length 387
ec nomenclature ec 3.6.3.51: Transferred entry: 7.4.2.3.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5aqyA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqyA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqyA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5aqyA04
5AQTA 3KZBA 4JHDB 1Q18A 2ASPA 3O6WA 4I6MB 3GE1A 4CZGA 2Q36A 1V4TA 4CZFA 3B8AX 4RCHA 3ZX0A 2CGKA 2HOEA 2P9LB 3QBXA 1BO5O 2A40A 2VWBA 3MK6A 4BRFA 1JCFA 3QBWA 2E2PA 3MN7A 4BR7A 3CJBA 4CD1A 5EY4A 4EHTA 3AY9A 2FSJA 3FZMA 4FOEA 3GL1A 5F0XA 4PKHA 2P9NB 3TPQA 2QM1A 3O08A 3LDLA 5FPMA 3A5OC 5TKYA 3GBTA 4DB3A 3VGKA 2V7ZA 3BP8A 5JICA 2D1KA 4H5RA 3GG4A 3MN6A 2GWJA 3VF4A 5FPDA 2P9PA 3MCPA 1JCGA 2F9WA 1G99A 2GUPA 1T6CA 3LL3A 4CI6A 3D2EB 2ZGYA 4BC2A 2E1ZA 4H5VA 1MA9B 3DXMA 4FWQA 2D0OA 3U8XA 2VCPA 5KPTA 3WUHA 1ATNA 4JD2A 1Z05A 2YHWA 5AQGA 4A62A 3UE5A 4FWOA 4NO7A 4BVOA 3CJAA 2V52B 1RDWX 3JS6A 2V51B 3KVGA 2V7YA 4FWSA 3VF6A 2P9KB 1NGJA 1DEJA 3EN9A 1QQMA 4FO0A 2QWNA 3HM8A 1E4FT 4FPAA 4DCHA 5AZIA 4BVPA 4BG9A 4GNIA 1V4SA 5KQ8A 3MN5A 2YI1A 4M63C 2W40A 5BR9A 2NLXA 2P9UA 3U9DA 3QB0A 4AM6A 3RSEA 4BR5A 3O4WA 3VESA 3D2FB 1IJJA 3CIPA 4Z94A 1U2VA 3CJ9A 1QQNA 3CERA 2J4RA 3O1WA 2ASMA 3VEVA 3I8BA 4DQ8A 3IMXA 3DAWA 2Q31A 3VEZA 3MDQA 3GOIA 3O8MA 1HPMA 2FF3B 1RFQA 4CZEA 1YUWA 4HWIA 1E4GT 3DJCA 3IDHA 4FWLA 2Q97A 1GLBG 2KHOA 3C0BA 4BRQA 1BU6O 3WXIA 1KAYA 2ITMA 1BA0A 1NGBA 2P9SA 4K43A 5AQRA 4C23A 3WEEA 3CI5A 1GLFO 4BROA 4LC9B 5AQVA 3FZLA 4KBOA 2QWOA 1C0FA 2NRHA 3DXKA 5AFUH 1QZ6A 3LDQA 3WXLA 4H0OA 1BG3A 5AQXA 3LDNA 5AQKA 2Q0UA 1TYQA 5AQHA 1H1VA 4RTFD 4H0VB 2QXLA 2CH6A 2A5XA 2VYPA 5BREA 1OKJA 1ZXOA 1DGKN 3ULEB 1QQOA 4FSVA 4JAXA 4BRLA 1YAGA 3UKUB 2QW9A 1CZAN 4RWTA 5AQWA 1NMDA 1NGIA 3FFKB 4BR4A 4BRIA 1GLEG 3LDOA 2GTDA 3HSCA 5AQSA 4MLEA 1MDUB 1BUPA 1K8KA 4M7XA 3FE1A 4K42A 4CZMA 3FZFA 1BOTO 5KPRA 3VENA 4O8KA 4XEIA 2YHXA 3QFUA 4JHDA 4IO8A 4I6MA 2ZGZA 5LJWA 3F9MA 3R8EA 5AQFA 3VF2A 1NGDA 4Y0WA 3FR0A 3R9PA 4WQ5A 1J6ZA 2P9LA 4BRKA 3ZX3A 1WUAA 3C7NB 1X9JA 4IXCA 2IVNA 4BRDA 3EKUA 1ATRA 2HMPA 1KAZA 3OHRA 3UKRB 3H45C 4BRAA 4FOIA 3VEOA 3DWLA 2ZF5O 2A42A 2E88A 4BRPA 4B1XB 3A0IX 1Z6RA 2GELA 2P9NA 5BPMA 3WXKA 4BC3A 2BUPA 4WYBA 5AZJB 3EKSA 4CZKA 4MO4A 2Q0RA 4CD3A 4CBXA 1MWKA 1X3NA 4BC4A 1YXQA 3L4IA 5F1XA 4MLHA 1WOQA 1NM1A 1NGAA 5I9EB 5LY3A 3P4IA 3BF1A 4AM7A 4B1VA 3D2EA 4M7YA 2WUSA 3SMSA 5JLHA 5AQIA 2BTFA 1XC3A 2FSKA 3L0QA 2D4WA 3I33A 1T44A 3MN9A 2QWLA 3A5NC 3ZEUB 3FLCO 4B9QA 5AQYA 4BR9A 3UB5A 4H5NA 2E20A 2IVOA 4K25A 3IFRA 1D4XA 1LCUA 4BRCA 2PBDA 3U9ZA 2GEMA 5KPZA 4IWVA 2YHYA 4ISEA 4EIAA 1HX1A 2F9TA 2P9KA 3VEYA 5FPEA 4PL7A 5BN8A 1HLUA 4FL9A 5BRDA 3M1FA 1GLAG 2E2OA 3H3OB 4HTLA 4IZ9A 5BPNA 2W41A 4BRHA 2E8AA 4XH1A 4H0XB 5ADXH 4H0YB 1ZC6A 3H46O 3VEXA 3G25A 3TU5A 4CZLA 5CE3A 2CGLA 3ZETB 4YDUA 1NGFA 2D0PA 4YDUC 5EVZA 4FPBA 2OANA 5BRFA 2Q2RA 2QWMA 3ATUA 4H0TB 4B1ZA 3D2FA 3BF3A 5B8HA 5FPNA 3CHWA 3ZX2A 1HKGA 3A5MC 4MO5A 2P9SB 5AQZA 3R6MA 1C0GA 3AARA 1GLCG 3O1BA 4WQ4A 4B1YB 1TUYA 4EAHD 4FWNA 2QWPA 4H0PA 3QMLA 4B1UB 2P9IB 2H3GX 2E2QA 2A6AA 4E1JA 1QZ5A 2CGJA 3JXUA 5E84A 2FSNA 3M6GA 1BA1A 1BDGA 3L6QA 3WXJA 3AAPA 3O5BA 4B1WB 3BUZB 4A2AA 2HF4A 3SJHA 3SMPA 3H6EA 3CQYA 2YCHA 3AAQA 5AQNA 1Y64A 3GDQA 3H3NO 2E2NA 1NWKA 4BGAA 1S22A 5KQDA 4J8FA 1KAXA 1LOTB 3ULEA 4H03B 3A5LC 5EX5A 1U6ZA 4IJAA 2QWRA 4BR0A 5LJVA 2Q1NA 4NB4A 1DKGD 3WT0A 3UKUA 4WQ5C 4BR2A 2A3ZA 2P9PB 2AP1A 2GWKA 5JMVA 3O80A 3QFPA 3EL2A 1ESVA 4BREA 3J8AA 2YJFA 3QICA 5AQPA 4PKGA 3DXMB 1NBWA 1XUPO 4BQZA 2CH5A 5AR0A 2ZWHA 3EZWA 2YJEA 3A8YA 4ISFA 3FZKA 4JD2B 1HUXA 2I7PA 5AQQA 1QHAA 2FF6A 3WQUA 3H1QA 3CQXA 4CBWA 3C7NA 2ASOA 5EXWA 3S41A 1ATSA 4FWRA 3UKRA 1IG8A 4O5FA 4PL8A 2EWSA 5AQLA 2NZTA 3CETA 3VERA 4CBUA 2IVPA 4BRMA 5AZJA 4BC5A 4JN4A 5AZIB 3CJCA 1JCEA 4JNEA 3LDPA 4QS7A 1GLDG 2P9UB 3H1VX 3RSEB 1KXPA 1ZBSA 1HKCA 3KHYA 4EHUA 3ENHA 1SZ2A 4QS9A 1NLVA 3FGUA 4EFHA 1XQSC 3SK3A 1NGGA 3LM2A 4CZIA 1NGHA 1SAZA 5BN9A 1U2VB 1YVNA 5JLFA 3HI0A 3QDKA 1S3XA 2AA4A 1HKBA 3ZEUA 3LM9A 4XH4A 3VGLA 4IJNA 5AQOA 4DHYA 5ADXA 3HBTA 4CZHA 2A41A 3IUCA 3ATVA 5AQUA 1NGCA 4XH5A 5EOYA 1BWFO 2PAVA 1HJOA 1NGEA 3U4LA 4BGBA 2QWQA 2FLOA 3W3DA 3WEEB 4A2BA 4CZJA 4WQ4C 3ZETA 4CJ7A 3WQTA 2E1YA 3HTVA 3DXKB 3VETA 3MMVA 5ELZA 1X3MA 4BQLA 3EO3A 4PKIA 2UYTA 2I7NA 5AFUA 3VPZA 1TYQB 1R59O 2HF3A 3ENOA 2FXUA 5BPLA 1GLLO 4GY2B 4H5TA 4ISGA 3SLCA 3W0LA 3M3ZA 3HZ6A 3D7EO 3ID8A 3VGMA 3CJ1A 4K41A 5F2RA 2DPNA 2P9IA 1TUUA 4QS8A 4A61A 3FZHA 1MWMA 2IIRA 4BRNA 4FWMA 3CJ7A 4FWKA 5BRHA 1T6DA 1EQYA 5E26A 1P8ZA 3VOVA 4H5WA 1K8KB 5AQMA 4BRGA 4L3QA 3BEXA 1SQKA 4FWPA 3VEWA 4BG8A 5AQJA 4F9OA 1GLJO 1RGIA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1ZBLA 1IV0A 5AQTA 3KZBA 1Q18A 2ASPA 4I6MB 3ID6A 2ZJPL 5C42A 1ZBHA 3B8AX 1ZYVA 2A40A 3C6HA 3J7ZO 3E9OA 3MK6A 4CEDA 2G8WA 1JCFA 4WFNL 1RDCA 4BR7A 3G6EN 4CD1A 3AY9A 2FSJA 2C1IA 5JVGL 2V7ZA 3BP8A 2KLAA 2BH1A 2D1KA 4H5RA 3GG4A 2HMIA 1SS6A 3F5TA 5FPDA 2A1RA 2P9PA 1HRHA 4DR1K 4DTXA 2XY7A 4EZ9A 2ZGYA 4LF9K 4GKJK 1VSDA 4DG1A 2UUCK 3V1RA 3U8XA 4B9TA 4JI6K 4BDYA 1NJZA 2GV9A 4FYDA 3WUHA 1ATNA 1Z05A 2YHWA 2X74A 2BE2A 3CJAA 2V52B 3SBTA 4Q5VA 1RDWX 3CPWM 3DLBA 3J81O 3KVGA 4N76A 1FW6A 1MYNA 1RT6A 3SUNA 1DEJA 3ZLJA 1QQMA 2O8CB 2QWNA 1K8BA 4E89A 4KAZA 3J7AP 2D5RA 5LL6Z 4O0IA 4BG9A 4EP4A 4GNIA 5T7BA 4DWIA 3VQ4A 2NLXA 2P9UA 3U9DA 3QB0A 3RSEA 4YY3K 3MX2A 2P5GA 3AVHA 3O4WA 2KBHA 1IJJA 3ZSXA 3SQ2A 3CJ9A 2P51A 1YVUA 3LAMA 1YF5L 4B08A 1QQNA 4Z4GA 3SI6A 4YOYA 3IMXA 1C6VA 3VEZA 1SUQA 4DF8A 1RFQA 4CGIA 4E0DA 1ZYWA 4JKGA 1L5UA 3M8SA 3V9WA 1DJTA 1J9AA 4DU1A 4K0KK 2ITMA 4JYAK 3VA3A 2NNWA 3LPUA 3AVMA 1LW2A 4Z0UA 4FJXA 1Q9YA 4KBOA 1C0FA 3TAMA 1S6PA 3LDQA 1NJWA 1TAQA 5C15A 4QOZB 1WSEA 3WXLA 3SAGA 4H0OA 1BG3A 2B3CA 1RNHA 3LDNA 2Q0UA 2O8DB 1H1VA 4C1NI 4NLBA 4H0VB 4C8NA 4L8RB 3L2UA 5BREA 1B92A 2RN2A 1XC9A 5GIPA 3ALYA 3I8DA 1HNWK 1YAGA 4I2QA 2QW9A 4RWTA 3HK2A 2E6MA 1OMYA 2BRZA 3CM6A 5AQSA 1MDUB 1K8KA 3FE1A 4CZMA 3FZFA 3PO5A 1BOTO 5KPRA 4E1NA 4I6MA 2O8BB 3S3OA 3S9HA 1N5YA 4WQ5A 1J6ZA 4OPKA 4BRKA 4WFBL 5CHIA 1F21A 3OVNA 2HHTA 1ATRA 2HMPA 4LF6K 1U49A 5HROA 4FLYA 4FOIA 2E88A 4CIGA 5JENA 4B1XB 3A0IX 4FJLA 2AJQA 2HHHK 4GV9A 5KGWA 4WYBA 4CCHA 3WXMB 4CZKA 4ILJA 4RW7A 4DMNA 4CD3A 1N6QA 4E19A 1OVQA 1MWKA 1X3NA 4BC4A 4IOCL 1NRAA 4FZYA 3T69A 5I9EB 2N69A 3RMBA 5DK5A 4DR6K 3VN5A 4B1VA 1NE5A 4M7YA 4M41A 3HXMA 4DF4A 1TK0A 4FJJA 3JAMO 4CHNA 1M90O 3N4QA 4G1QA 2JWKA 3MN9A 4JS5A 1HR0K 3A5NC 4H5NA 3HJFA 3RR8A 1D4XA 2KYQA 4CEBA 3U9ZA 2GEMA 4HUGA 3CCMN 4IWVA 2YHYA 3D0PA 2LY6A 4CJSA 2O8CA 2BGGA 5BRDA 3M1FA 1RT7A 2NRWA 4HTLA 2ZJRL 2W41A 3Q7CA 4BRHA 2HVHA 5HOOA 2WONA 4CJ3A 1L3VA 3H46O 4YOUA 2KZMA 4GKKK 1NGFA 4YDUC 2YIPA 2Z1GA 4AHRA 3PSIA 3THXB 3ATUA 1JLFA 4UY8O 4B1ZA 4IEIA 3S3NA 4DU3A 3KLHA 3KC6A 3ZX2A 4KREA 2UXCK 3EY1A 4M3TA 2P9SB 5AQZA 3OYEA 3KOXA 4WQ4A 3I0SA 3AO2A 3E9PA 3QMLA 5M1NA 1JLAA 2H3GX 4CGDA 2CGJA 4WF9L 4W5NA 2KGQA 2LT8A 3CYGA 2B68A 3CCJN 3ISNC 5M1FA 2FSNA 1D8YA 3L6QA 3AAPA 1KVBA 2G8FA 4A2AA 2HF4A 4JKBA 4FLXA 4C8LA 3SQ4A 1RTJA 3KLEA 3KK1A 1ZYQA 2VWJA 5SWMA 1Q86O 3TSPA 4KB1A 1VQKN 2E3GA 1J53A 2E2NA 4BGAA 2O8DA 3G0ZA 4BWMA 3WNGA 3L3VA 4W5QA 3A5LC 5LJVA 4KHSA 3QLHA 1DKGD 4WQ5C 1E3MA 4LSNA 3PLAA 1RBVA 2AP1A 3KK2A 3QETA 3IS9A 1VAZA 3O80A 4OGEA 1ESVA 3M8PA 4BREA 1EWQA 1YJWN 4LF5K 3DXMB 4Z4EA 1TL3A 5AR0A 4JKFA 4W5RA 3C94A 2O8BA 4IG3A 4DQSA 4HCBA 3M8QA 1HUXA 3RVCA 1TK8A 3CQ8A 1RDBA 3H1QA 3TTFA 1BCOA 4CERA 1R0AA 1DQ7A 4ZHRA 1KSPA 2JGUA 5KRTA 2N2RA 4KB0A 3SUOA 1VQON 5AQLA 1RT3A 2NZTA 3CETA 1KVCA 4IOXA 2HSTA 1XWLA 1L3UA 3OS1A 3LDPA 2C1GA 1TGOA 1B7DA 4K8XA 3CCVN 5KTQA 3H1VX 1HKCA 1EKEA 3HRGA 3KHYA 1C1AA 1A5VA 3ENHA 5K14A 2ZQBA 4QS9A 1NLVA 3LM2A 3QINA 4JI3K 1U2VB 1RCHA 1YVNA 4Y1DA 5JLFA 1PE4A 3QDKA 2AA4A 1UAXA 3WNFA 3MEGA 3NH1A 2LY5A 2UXBK 4CJRA 4J2AA 5KK4A 2F7TA 5ADXA 4EP5A 4DR3K 3ATVA 3AVIA 3ZSOA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1ZBL A;  1IV0 A;  5AQT A;  3KZB A;  1Q18 A;  2ASP A;  4I6M B;  3ID6 A;  2ZJP L;  5C42 A;  1ZBH A;  3B8A X;  1ZYV A;  2A40 A;  3C6H A;  3J7Z O;  3E9O A;  3MK6 A;  4CED A;  2G8W A;  1JCF A;  4WFN L;  1RDC A;  4BR7 A;  3G6E N;  4CD1 A;  3AY9 A;  2FSJ A;  2C1I A;  5JVG L;  2V7Z A;  3BP8 A;  2KLA A;  2BH1 A;  2D1K A;  4H5R A;  3GG4 A;  2HMI A;  1SS6 A;  3F5T A;  5FPD A;  2A1R A;  2P9P A;  1HRH A;  4DR1 K;  4DTX A;  2XY7 A;  4EZ9 A;  2ZGY A;  4LF9 K;  4GKJ K;  1VSD A;  4DG1 A;  2UUC K;  3V1R A;  3U8X A;  4B9T A;  4JI6 K;  4BDY A;  1NJZ A;  2GV9 A;  4FYD A;  3WUH A;  1ATN A;  1Z05 A;  2YHW A;  2X74 A;  2BE2 A;  3CJA A;  2V52 B;  3SBT A;  4Q5V A;  1RDW X;  3CPW M;  3DLB A;  3J81 O;  3KVG A;  4N76 A;  1FW6 A;  1MYN A;  1RT6 A;  3SUN A;  1DEJ A;  3ZLJ A;  1QQM A;  2O8C B;  2QWN A;  1K8B A;  4E89 A;  4KAZ A;  3J7A P;  2D5R A;  5LL6 Z;  4O0I A;  4BG9 A;  4EP4 A;  4GNI A;  5T7B A;  4DWI A;  3VQ4 A;  2NLX A;  2P9U A;  3U9D A;  3QB0 A;  3RSE A;  4YY3 K;  3MX2 A;  2P5G A;  3AVH A;  3O4W A;  2KBH A;  1IJJ A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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