5AR0A

Hsp72 with adenosine-derived inhibitor
Total Genus 128
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
128
sequence length
381
structure length
379
Chain Sequence
KAAAIGIDLGTTYSCVGVFQKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVALNPQNTVFDAKRLIGRKFGDPVVQSDMKHWPFQVINDGDKPKVQVSYKGETKAFYPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDRTGKGERNVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVNHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASLEIDSLFEGIDFYTSITRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDLVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILIKS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Exploiting Protein Conformational Change to Optimize Adenosine-Derived Inhibitors of Hsp70.
pubmed doi rcsb
molecule keywords HEAT SHOCK 70 KDA PROTEIN 1A
molecule tags Chaperone
source organism Homo sapiens
total genus 128
structure length 379
sequence length 381
ec nomenclature ec 3.6.3.51: Transferred entry: 7.4.2.3.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5ar0A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5ar0A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5ar0A03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5ar0A04
2BUPA 3DXKB 4FWLA 1T44A 2A41A 2V52B 4I6MA 2Q31A 5AQGA 1TYQB 4PKHA 4YDUA 2QWQA 3ATVA 5BPMA 1YVNA 5ELZA 3ZX0A 3M3ZA 4I6MB 5AQFA 1SQKA 2ASPA 2QM1A 1HKBA 1V4TA 3WXKA 2HOEA 1BG3A 4CJ7A 2YJFA 3VF4A 2E2NA 1KAZA 5AQWA 4CZIA 3DXMB 2YHWA 3AAPA 3ENHA 1GLLO 4BR5A 4WYBA 4L3QA 3U9DA 3MN6A 3LM9A 4BRPA 2IVNA 2QWMA 4FPBA 3O6WA 3LDOA 4IO8A 2P9SA 1KXPA 4BQLA 3W3DA 3QBWA 4FOIA 3L6QA 4GY2B 3C7NB 3VF2A 3J8AA 5KPTA 3H6EA 2P9PB 2QWRA 4BROA 2VCPA 3ZEUA 5BN8A 4BG8A 3VENA 5I9EB 1JCEA 5E26A 3FFKB 4WQ4A 4WQ5A 3RSEB 4CZMA 3F9MA 3A5MC 3M6GA 2E20A 3H1VX 4BR2A 4BR7A 1BA0A 3BP8A 1HX1A 3SMPA 4B1UB 3EKUA 4BR9A 2YJEA 4XH4A 3GG4A 4QS8A 1SZ2A 1GLBG 2D0OA 1NGAA 4FPAA 2AP1A 3U4LA 1QZ6A 1T6CA 2P9LA 3KZBA 1Z6RA 3HI0A 3DAWA 3FGUA 2D1KA 4BC4A 3LDQA 3LDPA 2YI1A 3IMXA 2ITMA 2NRHA 1HPMA 4K43A 2E2PA 2P9LB 3TPQA 1K8KA 3H3NO 4MO4A 1DEJA 2Q1NA 4LC9B 4NO7A 3CHWA 3LDNA 2NZTA 2KHOA 2P9IB 3A5NC 5FPDA 1TUUA 3FLCO 4BGAA 3C0BA 1KAXA 2E2OA 3D2FA 4BQZA 3ID8A 4FWQA 5EXWA 3VEWA 4PL8A 4NB4A 3IUCA 4FWRA 1BWFO 4JNEA 4QS7A 2Q0RA 5LY3A 3CIPA 3D2FB 3ZX2A 2ASOA 3D2EB 3EZWA 3TU5A 3QDKA 3DWLA 3BUZB 3R6MA 2FF3B 5F1XA 5JICA 1NGEA 4MLEA 3U9ZA 4B9QA 4FL9A 1QHAA 2A6AA 3GBTA 4RTFD 4M7XA 4AM7A 5AQUA 1XQSC 3FZLA 3R8EA 1BDGA 3WXIA 5AQQA 1S22A 4XH1A 3VEXA 3DJCA 3MMVA 1R59O 3VPZA 2I7NA 5AQPA 3H46O 4CBWA 5ADXA 2E1ZA 4WQ4C 3OHRA 4BRAA 3CI5A 3VEVA 3DXKA 5LJVA 3D7EO 3O4WA 4IZ9A 3HTVA 4H5NA 2FSJA 1TYQA 3O08A 1EQYA 1LCUA 5AZJB 5KQDA 1H1VA 4PKIA 3KVGA 1U6ZA 5BRFA 2A5XA 4BRKA 3FZHA 1GLFO 1HKCA 1X9JA 2H3GX 3B8AX 3H45C 1NLVA 3CJCA 4CBUA 4IJNA 2GTDA 1ESVA 4BRFA 4ISGA 1X3MA 4PL7A 1ZBSA 3WQTA 2ZF5O 5BRDA 3M1FA 3L4IA 3DXMA 2UYTA 4FWMA 3MDQA 3G25A 3VOVA 5E84A 4FWPA 5BR9A 3JXUA 1E4GT 4XH5A 3CERA 5JMVA 1ZC6A 2CH6A 3R9PA 3S41A 2A3ZA 4E1JA 2VYPA 3ZETA 1KAYA 2NLXA 3VGMA 3C7NA 4IJAA 4PKGA 1NGIA 3ZETB 2EWSA 2P9PA 1ATNA 4H0XB 2I7PA 4BRCA 3EO3A 1Q18A 2QWOA 4FOEA 1OKJA 4CZLA 4XEIA 3A5LC 4BG9A 3GL1A 3RSEA 1DGKN 4EIAA 1D4XA 3W0LA 1ATRA 5AZIB 1GLAG 4Z94A 3ENOA 4BRMA 4B1VA 2YHXA 3BEXA 1HKGA 2V51B 1HJOA 3I33A 3EN9A 1E4FT 2W41A 1C0GA 2V7YA 2P9NA 5CE3A 3QICA 4CD1A 4QS9A 5F2RA 1WOQA 4H0VB 2P9NB 2FXUA 4EFHA 3QMLA 4CZFA 3A0IX 3LDLA 1U2VA 4JN4A 5AQJA 2IIRA 2P9IA 1NGDA 4FWKA 2CH5A 1NMDA 1U2VB 1XC3A 2QWPA 2YHYA 5AQRA 3VGKA 3MK6A 3WXJA 5AQVA 2GWKA 3D2EA 3QB0A 1HUXA 4A2BA 4DCHA 4B1YB 4A2AA 4BRHA 1G99A 3FR0A 3JS6A 5JLFA 4Y0WA 4BGBA 1T6DA 1XUPO 3L0QA 3CJAA 5F0XA 5AQSA 1JCGA 3LM2A 2QWLA 3O1BA 2ASMA 1BO5O 2YCHA 5FPMA 4B1XB 4BRIA 2DPNA 3A5OC 3EL2A 5JLHA 3H1QA 4JHDB 3ULEB 3FE1A 3QFUA 2FLOA 4IWVA 3VETA 4FWOA 1YXQA 4H0YB 3VEZA 4JAXA 5AZJA 4H5TA 4H0PA 5AQOA 3HZ6A 4FWNA 5AQTA 3VEYA 2A40A 5EY4A 3UKRB 1ZXOA 3CQXA 2WUSA 2QWNA 3AAQA 4H0OA 3WQUA 3FZMA 4B1WB 3GDQA 1GLEG 1MDUB 2CGLA 1Z05A 3MN7A 4J8FA 4BVPA 5AFUA 1JCFA 2QXLA 1GLJO 1QQNA 3VESA 2Q36A 1NGBA 1BUPA 3VF6A 4EHUA 3GE1A 1NGFA 4M7YA 3I8BA 1NBWA 4K41A 2D0PA 4FSVA 1HLUA 3QFPA 5BPNA 2F9TA 4JD2B 1CZAN 1MWKA 2GWJA 3KHYA 4CZHA 3UKUA 4K42A 4BC2A 4CD3A 1C0FA 3WEEA 1NGGA 3HM8A 1RGIA 3P4IA 2GUPA 2PAVA 5ADXH 1WUAA 4GNIA 3MN5A 3UKUB 3WEEB 2CGKA 5FPEA 1GLDG 5B8HA 2V7ZA 1X3NA 4BRGA 5AZIA 4AM6A 3SLCA 4CZJA 4H5RA 3IFRA 1NM1A 2FSNA 2HF3A 2CGJA 4RWTA 2E8AA 4A62A 3CJ7A 3WT0A 4M63C 2OANA 5BPLA 3WUHA 3GOIA 3VGLA 5BN9A 5AFUH 3H3OB 4BR0A 3O8MA 5KPZA 2AA4A 3VEOA 1P8ZA 1QQMA 5KQ8A 5AR0A 4BREA 1S3XA 3CJBA 3BF3A 4CZEA 4HWIA 4CI6A 1GLCG 2W40A 5AQYA 2E2QA 2P9SB 4F9OA 1IJJA 2IVPA 2QW9A 3BF1A 5LJWA 2IVOA 2P9KA 3O1WA 1MWMA 3UB5A 3CJ9A 3VERA 5AQXA 3ZEUB 2Q0UA 2P9KB 5FPNA 1RFQA 5TKYA 4MLHA 1BOTO 5AQKA 3FZKA 4H5VA 2VWBA 3CQYA 4BRQA 3QBXA 4CZGA 2FSKA 4EAHD 3U8XA 3HSCA 2ZGZA 2BTFA 4CZKA 1YUWA 5KPRA 4B1ZA 5AQMA 4BC5A 4BR4A 1BU6O 4A61A 3MCPA 5AQIA 4IXCA 1Y64A 4O5FA 4BC3A 1RDWX 3A8YA 1ATSA 1J6ZA 3WXLA 3FZFA 2D4WA 3CJ1A 4O8KA 4YDUC 1TUYA 4BRLA 5EVZA 4DQ8A 1NWKA 2PBDA 4BRNA 4K25A 3AY9A 1K8KB 4JHDA 3ULEA 4C23A 1QZ5A 3SJHA 3O5BA 4DHYA 2HF4A 2GELA 4ISFA 2Q97A 2A42A 3SMSA 1NGJA 4HTLA 4KBOA 3UKRA 1MA9B 2E1YA 1SAZA 4EHTA 2F9WA 2Q2RA 1YAGA 4MO5A 3ATUA 3EKSA 5BREA 3UE5A 1QQOA 2E88A 4H03B 4ISEA 1BA1A 2HMPA 2J4RA 4FO0A 5AQHA 1DKGD 3HBTA 5AQNA 2ZWHA 4CBXA 5EOYA 3SK3A 5AQZA 3ZX3A 4H0TB 3AARA 5EX5A 3LL3A 1LOTB 3CETA 3O80A 1IG8A 5AQLA 1V4SA 4DB3A 4BVOA 1NGCA 2P9UA 4WQ5C 4JD2A 2FF6A 3IDHA 4RCHA 4BRDA 1NGHA 2GEMA 5BRHA 2ZGYA 4FWSA 4H5WA 2P9UB 3MN9A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2BUPA 3OYMA 2DFFA 3V9XA 3SJJA 3CCJN 3CYMA 2A41A 3ZSOA 4YDUA 5I3UA 5BPMA 3ATVA 4B3OA 2P1JA 5ELZA 3ZX0A 5AQFA 2ASPA 4OPJA 3MXIA 2QEXN 2VWKA 4CJ7A 1KAZA 1LWFA 3DXMB 1NJIO 3DLLL 4L3QA 3U9DA 3RRGA 1EWRA 1RT3A 5CHIA 4YOTA 3CCLN 4IO8A 4Q5VA 1KXPA 4DTRA 2G8IA 3W3DA 3L6QA 3C7NB 4DV4K 5HLFA 3D0PA 4HCBA 2BE2A 3CYGA 1PX9A 3AO4A 2P9PB 4DTSA 4KTQA 2VCPA 2G8FA 3AVAA 4BG8A 4NCGA 1VSDA 4FVMA 1M1KO 4C8KA 3G6EN 3O3FA 5E26A 3DLHA 4LFBK 4WQ4A 4J2DA 1BI4A 3H08A 4WQ5A 1S1VA 1N8RO 3F9MA 3M6GA 3L2RA 4DQQA 3CCSN 4CFAA 3BP8A 2OZSA 2RF2A 1XC9A 4JV5K 1HX1A 4BR9A 2YJEA 3SUNA 1N6QA 4FLWA 4QS8A 4FLXA 2D0OA 4FPAA 2GL1A 5HRNA 3U4LA 4I9LA 1LW2A 3P83D 2W6LA 3FGUA 2D1KA 3KWIA 1SEGA 3SUPA 3RMDA 2PFUA 2P9LB 2WOMA 3H3NO 3ALYA 2Q1NA 4DLGA 3A5NC 3P1GA 4BGAA 2DFEA 3RMAA 3THWB 1YT3A 4DQPA 1RBRA 1KAXA 1G15A 1VSMA 4BQZA 5C2FA 4B9TA 4PL8A 1QSYA 4C1NK 4KHUA 3G10A 1C56A 1BWFO 4JNEA 2Q0RA 3D2FB 2YV0X 1RILA 3K59A 1VQ4N 3OW2M 4K8XA 2X74A 4DSFA 3EZWA 4CGJA 3TU5A 2FF3B 3OYAA 4KPYA 2KPYA 2F96A 4FL9A 1QHAA 2A6AA 4UY8O 4E7IA 4X66K 3FZLA 3R8EA 1M90O 3WXIA 4E7JA 1QVGM 2KFNA 4IOCL 3MMVA 1R59O 2I7NA 1TK5A 1N5YA 5ADXA 1AHOA 2O8CB 1BGXT 3VEVA 1T03A 5LJVA 3D7EO 5JS1A 2R7YA 3O4WA 4DTNA 2IAJA 1EQYA 4CW7B 4FW1A 2E6MA 5M1FA 2LKBA 3KVGA 4BRKA 2MZ0A 1VK0A 1KCFA 3TAFA 1OH8A 1NLVA 3CJCA 2Y1IA 4Z4IA 4QOZB 4N47A 4YOWA 2GTDA 4BRFA 3WNEA 3WQTA 5BRDA 3DXMA 3C6TA 2UXCK 1N4NA 3CCEN 5E84A 4FWPA 1RDCA 4XH5A 1T7EA 2O8DB 1VQ8N 4CCHA 1WBDA 2XY6A 3CFPA 3S41A 2B4JA 2NLXA 4E7KA 4DSEA 4FJIA 1GPTA 1U4BA 2HBMA 3C7NA 1HR0K 4IJAA 2NRXA 2P9PA 2I7PA 3SQ2A 3LAKA 1Q18A 2QWOA 4FOEA 4DTMA 2PY5A 3O4NA 3AVGA 4XEIA 3EY1A 3V1RA 1S72N 4CEAA 3ULDA 3P39A 5AZIB 1GLAG 1C6VA 4FJ9A 3ENOA 4F3TA 2G2KA 1SS6A 3VQ9A 5J2MA 1IKXA 3VQ8A 4FK2A 3B6OA 3BEXA 1FKOA 3CCUN 3I33A 3NF8A 5CY4A 3KOYA 4M45A 3SAGA 1FXXA 1YIJN 1K9MO 1CZBA 4OPAA 4PUOA 2NNWA 3DOLA 1CN2A 1GPSA 2P9NB 1EXQA 2FXUA 3AVBA 2OTLN 1U2VA 3PSFA 1IV0A 3VMFB 4DG1A 5AQJA 2IIRA 3B6PA 1NGDA 3THWA 4LF7K 2CH5A 3O9RA 4F2RA 3VTHA 2K35A 3P5JA 4DSJA 3DLRA 3VQ6A 2JWLA 2YHYA 4LSNA 5CYMA 5AQVA 2UUCK 2D0AA 1N32K 1VQPN 1YJ9N 3SCXA 2IDOA 1HUXA 4IDHA 1G99A 3JS6A 3M8PA 5JLFA 4WE1A 3NF9A 1T6DA 3MX2A 3L2VA 3OBWA 5F0XA 5AQSA 1NK0A 3DRRA 4I7FA 2ASMA 1S1WA 2KLAA 4LF9K 2KKZA 4Q0BA 2O8EA 4B1XB 1I2UA 4CHOA 1QHTA 3DLKA 2KSKA 3TWHA 3R3LA 3H1QA 5DK5A 1HYSA 4JKGB 2IGIA 4H0YB 1LQQA 4I2PA 4H5TA 1SL0A 1KLNA 3VEYA 2YKNA 1WLJA 3M5RA 2OZMA 3CQXA 3AVLA 3AAQA 4H0OA 1LAWA 4GV6A 3L8BA 1GLEG 1VSJA 3SF4D 4GVEA 4BVPA 1S1XA 2OA8A 3QNOA 1NGBA 3MX5A 5CZ1A 1BUPA 5FRNA 1ILYA 2D0CA 1NGFA 5DMRA 4X64K 4FXDA 4DR4K 4K41A 2D0PA 1HLUA 3QFPA 2B5JA 2YNGA 3KLFA 4DS5A 4JD2B 3TI0A 1CZAN 1C0FA 3WEEA 3G0ZA 4JI5K 4DR1K 1NGGA 2B68A 3HM8A 1O13A 2FBYA 2PAVA 1ZBHA 2A7TA 1WB9A 1S1TA 2CGKA 5FPEA 3HP6A 2B3CA 2YHAA 3HPHA 4HHTA 2V7ZA 1NJYA 1WSGA 1U49A 5AZIA 4CE9A 4DFJA 1CHZA 3IFRA 2FSNA 4DR2K 4RWTA 4F8RA 2OPSA 3GOIA 4E1NA 5BN9A 5AFUH 1WWNA 1O1WA 3O8MA 5KPZA 3HRGA 3DM2A 5HRSA 4JS4A 5EU7A 3SPZA 3TTDA 1NE5A 4LH5A 4CZEA 1RBTA 3ZSVA 2HHHK 3RRHA 3V9WA 1NRBA 2NRWA 5AQYA 2HMIA 1IJJA 4CF1A 3QNNA 2ITGA 2IVOA 2P9KA 3BZCA 4IO9L 4ICLA 3VQ4A 1MU2A 4PQUA 5SZTA 2Q0UA 4BWJA 2DY4A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2BUP A;  3OYM A;  2DFF A;  3V9X A;  3SJJ A;  3CCJ N;  3CYM A;  2A41 A;  3ZSO A;  4YDU A;  5I3U A;  5BPM A;  3ATV A;  4B3O A;  2P1J A;  5ELZ A;  3ZX0 A;  5AQF A;  2ASP A;  4OPJ A;  3MXI A;  2QEX N;  2VWK A;  4CJ7 A;  1KAZ A;  1LWF A;  3DXM B;  1NJI O;  3DLL L;  4L3Q A;  3U9D A;  3RRG A;  1EWR A;  1RT3 A;  5CHI A;  4YOT A;  3CCL N;  4IO8 A;  4Q5V A;  1KXP A;  4DTR A;  2G8I A;  3W3D A;  3L6Q A;  3C7N B;  4DV4 K;  5HLF A;  3D0P A;  4HCB A;  2BE2 A;  3CYG A;  1PX9 A;  3AO4 A;  2P9P B;  4DTS A;  4KTQ A;  2VCP A;  2G8F A;  3AVA A;  4BG8 A;  4NCG A;  1VSD A;  4FVM A;  1M1K O;  4C8K A;  3G6E N;  3O3F A;  5E26 A;  3DLH A;  4LFB K;  4WQ4 A;  4J2D A;  1BI4 A;  3H08 A;  4WQ5 A;  1S1V A;  1N8R O;  3F9M A;  3M6G A;  3L2R A;  4DQQ A;  3CCS N;  4CFA A;  3BP8 A;  2OZS A;  2RF2 A;  1XC9 A;  4JV5 K;  1HX1 A;  4BR9 A;  2YJE A;  3SUN A;  1N6Q A;  4FLW A;  4QS8 A;  4FLX A;  2D0O A;  4FPA A;  2GL1 A;  5HRN A;  3U4L A;  4I9L A;  1LW2 A;  3P83 D;  2W6L A;  3FGU A;  2D1K A;  3KWI A;  1SEG A;  3SUP A;  3RMD A;  2PFU A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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