5BN8A

Crystal structure of nucleotide-free human hsp70 nbd.
Total Genus 127
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
127
sequence length
379
structure length
379
Chain Sequence
AAAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVALNPQNTVFDAKRLIGRKFGDPVVQSDMKHWPFQVINDGDKPKVQVSYKGETKAFYPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDRTGKGERNVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVNHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASLEIDSLFEGIDFYTSITRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDLVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILMG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Nucleotide binding to variants of the HSP70-NBD.
rcsb
molecule tags Hydrolase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Heat shock 70 kDa protein 1A
total genus 127
structure length 379
sequence length 379
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-05-25
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5bn8A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5bn8A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5bn8A03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5bn8A04
4BR0A 5AQXA 2FSJA 1NGCA 4DB3A 1HKGA 3MK6A 5EXWA 2EWSA 1HLUA 3R9PA 3L0QA 2YHWA 5LJVA 4BRHA 2YCHA 2QWNA 3HBTA 2W41A 2A41A 2I7PA 4BR5A 1GLCG 4H03B 5JLFA 2P9SB 1K8KA 4K41A 2OANA 2P9IB 1YXQA 3FR0A 2IIRA 2D0OA 4QS7A 5AQMA 4CZKA 2PAVA 3H3NO 4B1UB 5EY4A 4MLHA 3CJAA 1KXPA 3A5NC 3O08A 3ZEUA 2HMPA 5KPTA 3C7NB 3VETA 3DXKB 1U6ZA 3VEZA 2AA4A 3BP8A 3L4IA 3VF6A 5AQNA 3LDNA 3RSEB 3HSCA 2NLXA 4BGAA 5BN9A 2A42A 4GY2B 1BOTO 2V7YA 4BQZA 2ASPA 1NGHA 3H45C 1NGJA 3ULEA 5JICA 3VEXA 3UKRA 4BC5A 4BG8A 1DEJA 3KZBA 4IZ9A 2YJEA 2CGJA 2BUPA 4EIAA 4FWMA 4IO8A 4FSVA 3VF2A 5ELZA 3JXUA 5AQLA 1J6ZA 3B8AX 3ZX2A 5AQJA 3W3DA 3FE1A 3KHYA 4PKIA 2E2PA 1NGIA 2QM1A 3WXIA 4XH5A 5BREA 5AQSA 4H5TA 4M7XA 2D1KA 4B1ZA 3D2EA 1NGDA 1ATNA 3FZMA 3QBWA 5I9EB 1HX1A 3AAQA 2GTDA 1YAGA 3UKUB 1NGBA 3D2FB 5AQHA 4XH1A 2IVPA 1QQMA 3L6QA 2D0PA 4XH4A 4CD3A 4A62A 4CI6A 3LDLA 2P9LA 1ATSA 1GLAG 4H0XB 4IJAA 3U9ZA 1BA0A 1IG8A 4JNEA 4CBUA 4Y0WA 5AQFA 1BDGA 4PL8A 1NBWA 3WEEB 3A5LC 1ATRA 4HTLA 4YDUC 3IDHA 2P9PB 3FZHA 3CI5A 4FWRA 1TYQB 5AQVA 3D7EO 5E26A 5FPEA 1CZAN 2NZTA 1JCFA 5AZJB 4BC4A 4YDUA 1C0FA 1XUPO 2V7ZA 2AP1A 3O80A 3U4LA 2QWRA 3GDQA 1NGEA 4BR4A 3LM2A 5BN8A 3CERA 1QQOA 5B8HA 4FWNA 1BA1A 4I6MA 1NLVA 2QWQA 3WT0A 5LY3A 3DXMB 3UE5A 4E1JA 4EFHA 2ASOA 5KPZA 3GG4A 2FLOA 3VF4A 4BRFA 3EZWA 4IJNA 3LDOA 5AZIB 4BR2A 5LJWA 2ZF5O 3MMVA 3ZEUB 5AQPA 2GELA 4LC9B 3A0IX 1SAZA 4FPBA 4CZFA 5AQKA 5AQRA 3WXKA 4RWTA 2GWKA 4H0PA 3SLCA 2P9KB 5AR0A 4CZIA 4CBWA 2P9NB 1ESVA 3H1QA 4BG9A 1C0GA 3IUCA 1DKGD 2CGLA 5EVZA 1BUPA 4B1YB 5KPRA 4JD2B 4JHDA 3CJ7A 3HI0A 4M63C 3UKRB 4FO0A 2ZWHA 1D4XA 1QQNA 4IWVA 2Q36A 2QXLA 5BPNA 1HKBA 3FGUA 2YJFA 1XQSC 4AM7A 1MA9B 3IMXA 1LOTB 1ZBSA 3VPZA 3EKSA 4ISFA 4AM6A 2E2NA 3F9MA 2GEMA 2YI1A 2YHXA 3O5BA 4C23A 2QWMA 2V51B 2ITMA 1X9JA 4H0OA 3MN5A 4H5VA 3ID8A 4BR9A 3M6GA 1U2VA 1T6CA 2CGKA 3FZLA 3QICA 2IVOA 5AQTA 3VEVA 5AFUH 3VEWA 1Q18A 1DGKN 2Q2RA 3ZX0A 4FWPA 4BRKA 4BRAA 5BRFA 3C0BA 4JN4A 2E2OA 4EHTA 2GUPA 3CIPA 3TPQA 4Z94A 3SJHA 2P9SA 3QB0A 4FWSA 4BROA 2FSNA 4WQ5C 3ZETB 4CBXA 2P9IA 4BGBA 2F9TA 4NB4A 4BRDA 2IVNA 1Z05A 2A40A 5EOYA 5BRDA 3C7NA 3G25A 3DXKA 2KHOA 3M1FA 4WQ5A 2D4WA 3QFPA 4MO5A 3CHWA 2J4RA 4BC2A 1QZ5A 3MDQA 4PKGA 3SMPA 5KQDA 2P9UA 4FL9A 2ZGZA 3HZ6A 3AAPA 4FPAA 1T6DA 4BRGA 4B1VA 4CZHA 4H5WA 1JCEA 2W40A 3VGKA 5EX5A 2QWLA 3GBTA 1KAXA 1QHAA 3KVGA 5CE3A 2QWPA 1MWMA 4BC3A 4F9OA 3BUZB 1SQKA 1P8ZA 3I33A 1E4GT 3GL1A 4A61A 3WQUA 2Q97A 2QWOA 3LDQA 4BRMA 2I7NA 3MN9A 3CETA 2FF6A 3HM8A 2BTFA 3HTVA 1LCUA 1WUAA 3P4IA 4CJ7A 3CQYA 1NWKA 4BRQA 3W0LA 4IXCA 3CJ9A 2CH6A 4BRPA 3FLCO 3LL3A 3H46O 4J8FA 3BF3A 4H0TB 3MN7A 3O6WA 4PL7A 2E88A 5F1XA 1ZXOA 2VWBA 3O4WA 1K8KB 3UKUA 2HOEA 3CJ1A 3D2FA 3ENOA 1KAYA 1BU6O 5TKYA 5BRHA 1T44A 3U9DA 4JHDB 2DPNA 4H5NA 3FFKB 3H6EA 2FSKA 2Q0RA 3CJCA 1OKJA 3QBXA 3M3ZA 4B9QA 2FXUA 1Z6RA 4DQ8A 1HUXA 4ISEA 4K42A 3H3OB 3WEEA 3ATUA 3DAWA 3WXJA 1GLBG 1ZC6A 3ATVA 4CZGA 1V4SA 3LM9A 2A5XA 2P9PA 1Y64A 5AQQA 1TYQA 3WUHA 1S22A 1RDWX 2E1YA 2VYPA 4H5RA 5AZJA 3VERA 2VCPA 5ADXH 2GWJA 2FF3B 4FOEA 3DJCA 1U2VB 3CJBA 4H0VB 3ULEB 4DCHA 4EAHD 5AFUA 5AQUA 2Q31A 2Q0UA 3UB5A 2A3ZA 3BEXA 4B1XB 1YUWA 5BPLA 3ZX3A 3AARA 1JCGA 3FZFA 1RFQA 2E1ZA 3MCPA 3U8XA 2Q1NA 3DXMA 4ISGA 1BG3A 5BR9A 3SMSA 2E8AA 5F2RA 2E20A 1KAZA 4CZLA 2A6AA 3O1WA 4PKHA 2UYTA 4L3QA 5AQIA 3OHRA 5AZIA 4B1WB 4JAXA 4BR7A 3D2EB 4FWKA 1GLJO 3WQTA 1NGFA 3GOIA 1WOQA 3A5OC 4XEIA 3H1VX 4NO7A 4QS8A 2P9UB 3QDKA 2P9KA 2YHYA 1TUUA 4QS9A 2P9LB 1HJOA 2H3GX 2P9NA 3MN6A 1MWKA 4A2BA 1GLLO 1SZ2A 4JD2A 1IJJA 3R6MA 3R8EA 5F0XA 4FWOA 3QMLA 1X3NA 1GLDG 3VGMA 2HF3A 5AQYA 1GLFO 5FPMA 4EHUA 1QZ6A 4BRNA 1XC3A 3VENA 2WUSA 4M7YA 3A8YA 3O1BA 4CZMA 4HWIA 3A5MC 2E2QA 4FWLA 3RSEA 1NGAA 5FPNA 1NM1A 1RGIA 3VOVA 4CZEA 1BWFO 4WYBA 5KQ8A 3WXLA 4CD1A 3EO3A 4I6MB 4FWQA 4KBOA 5FPDA 1YVNA 4BVOA 3O8MA 3VGLA 1MDUB 1HKCA 1V4TA 3ENHA 5AQGA 3SK3A 4BRLA 3ZETA 3I8BA 1HPMA 3VESA 1G99A 3GE1A 3IFRA 2HF4A 4H0YB 3QFUA 2ASMA 4O8KA 4MO4A 4BQLA 2PBDA 3JS6A 5AQWA 4MLEA 3CQXA 3LDPA 4WQ4C 3S41A 1X3MA 1GLEG 3AY9A 1S3XA 1BO5O 3TU5A 4BREA 4BVPA 4GNIA 3FZKA 5AQZA 5ADXA 2QW9A 4A2AA 5BPMA 5JMVA 3VEYA 5E84A 3VEOA 3DWLA 4O5FA 1E4FT 2ZGYA 4WQ4A 4DHYA 5AQOA 1NMDA 4FOIA 2NRHA 3EN9A 1H1VA 4RCHA 3EKUA 3J8AA 4BRIA 4CZJA 2CH5A 1TUYA 3BF1A 4RTFD 1EQYA 2F9WA 1NGGA 3EL2A 4K25A 2V52B 4BRCA 4K43A 5JLHA 1R59O
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1A5VA 4C8LA 3CMEN 1S5JA 4DB3A 3KOXA 1LW2A 4JKGB 3THXA 2HMIA 2EWSA 4YHHK 3THYB 3S3MA 4HUGA 2HBJA 3DLEA 4Y1CA 4FZZA 2E5LK 2YCHA 4JI7K 4KREA 4CEDA 1PX9A 3OYCA 3DLLL 4BR5A 2OPPA 1RT4A 1OVQA 4RW6A 4HE7A 4PY5A 2P9SB 3AA5X 4BE2A 2P9IB 4DSIA 2P51A 1HNZK 5AQMA 1N5YA 2XY5A 4MLHA 3E7UX 1MYNA 3O08A 1JLCA 3ULDA 2UU9K 2LY5A 1CXUA 4J2DA 2GBZA 3OS2A 2F8SA 4OJRA 3O4NA 3BP8A 1XC9A 3LDNA 1NJXA 3RSEB 3HSCA 1ZFUA 4EZ6A 2YV0X 3NHGA 1TK5A 3AO4A 4N47A 3NDKA 2B6AA 1BIZA 5GAEP 4Z0UA 1DEJA 4AHRA 4FCYA 3SUPA 1XI1A 4YFUA 2IAJA 4FWMA 2NRXA 3CPEA 3VF2A 1I2VA 2LSNA 3B8AX 5AQJA 2OZMA 3NH2A 2O4GA 1I3AA 5GADP 4DR7K 4IKFA 3PX4A 4XH5A 4B9VA 5AQSA 4J2BA 4CJRA 2F8TA 3DYAA 3CCVN 3T3FA 4DTXA 4E7JA 3NCIA 3QBWA 3AAQA 1PE4A 1SL2A 3BZCA 1NGBA 3D2FB 5AQHA 1C0MA 4LSNA 4DFJA 3TANA 3K5MA 3L6QA 2D0PA 1NJWA 4M3ZA 2QA4N 4DUZK 4CEOA 4A62A 4CI6A 5KRTA 1GLAG 3ZT2A 3LWMA 4LF9K 1SKSA 1B7DA 1OMYA 4LF8K 3WEEB 4I9QA 1HNWK 4YDUC 4PA1A 1WMTA 1JLBA 1XHZA 1RBSA 4FWRA 1TYQB 5AQVA 4AHTA 3EYZA 5FPEA 3ZSYA 3MEEA 1CZAN 2NZTA 4JI0K 2XRIA 4BC4A 4YDUA 1XUPO 2AP1A 1CXQA 3DMJA 3U4LA 2QWRA 1T7BA 1JLFA 3CC7N 4CQKA 3CERA 1N32K 1BA1A 4CFDA 4O0IA 1QHTA 4GV9A 5LY3A 3KK3A 3UE5A 2G8IA 1C1AA 4JI1K 3K0SA 4EFHA 2KQ2A 4DQSA 2E3GA 2JDQD 1B3CA 4HVJA 4BRFA 3L2QA 5HL7L 4KHQA 3MXJA 2O8DA 5C12A 3AO3A 5LJWA 3MMVA 4O55A 1T8EA 4DS5A 2JGUA 3A0IX 4FPBA 1BRZA 1LAVA 1VSFA 2P9KB 3E66A 1T05A 2O8EB 2P9NB 2NRZA 4GV6A 4BG9A 1D9DA 3IUCA 4U7BA 4JD2B 3OYAA 1QVGM 1BHLA 4JHDA 3CJ7A 4FO0A 4BEBA 3F5TA 4DV2K 3U3GA 2HHHK 4OO1J 3LP2A 4DLEA 3FGUA 4W5RA 2YJFA 1YHQN 4AM7A 4B3TK 1LOTB 4IOXA 4OPJA 1Q9YA 4DU3A 4ISFA 1UA1A 3LP0A 3F9MA 2YI1A 3O5BA 4C23A 4BWMA 3QNOA 3V1RA 1EKEA 4B9SA 4H5VA 3PX6A 1U2VA 3VQ4A 3C6UA 4DS4A 5AFUH 4JKHA 3LPTA 2EX3A 4BRKA 3G4SN 1D8YA 4BRAA 4CF1A 3HP9A 3C0BA 4CGDA 1HYZA 2OTJN 3PIOL 4KAZA 3KHWA 2E2OA 3C94A 4FJLA 1C55A 5T7BA 1WN7A 3ASMA 4BROA 3ZSXA 3IKMA 4BGBA 4UY8O 4CJ4A 1AYJA 1BGXT 3HP6A 5EOYA 2YNFA 5CR4A 5BRDA 4Z4IA 3O3HA 3T19A 1Z25A 3DXKA 2Q3SA 4MO5A 2YC1C 1VRTA 1NKEA 2YBRC 3CFOA 5C2FA 3SMPA 4E89A 4FL9A 1S1VA 1X9MA 3AAPA 4YOWA 3TTFA 4BRGA 1KFDA 3C6AA 4CZHA 1JCEA 2LJ7A 4M3XA 3WXMB 1KV0A 3VGKA 1IKXA 1N33K 1CHZA 1WAJA 4F8RA 4OKKA 1QHAA 4F9OA 3BUZB 4OKJA 1P8ZA 4EZ9A 2UUBK 1E4GT 2QWOA 2P5OA 4A5AA 2I7NA 3MN9A 2O8CB 1N6QA 3AVAA 1L3SA 2O4IA 1LCUA 1WUAA 1QVFM 1OZZA 1EP4A 2IGIA 1SKWA 2CH6A 1KVBA 4BRPA 3FLCO 4M3YA 3BF3A 1M90O 1VQ8N 2KW4A 4CJPA 1MR4A 1JKZA 1ZXOA 2VWBA 4NYNA 1LQQA 3UKUA 2LKBA 3NFAA 4FJJA 3PSMA 3MEDA 2YIOA 2GL1A 3U9DA 2Z1JA 2D56A 3TAMA 4AHUA 1UOCA 2FSKA 4X65K 2KBKA 4CF8A 3KK1A 3BZKA 1IKVA 4IOCL 4ISEA 5C24A 3ATUA 4N76A 2UUAK 3WXJA 2N2QA 4Z4CA 3ATVA 4CZGA 3AO2A 1OH7A 3MCAB 5JS1A 4OX9K 3LWLA 2R7YA 1RT6A 3WUHA 1YTAA 2ZD1A 1U48A 1VQNN 4DSKA 4AH9A 3RMDA 1BCMA 1C6VA 5AFUA 2Q31A 3UB5A 2MZ0A 1QS4A 4CIGA 1XNQK 4AQYK 4OPKA 4B1XB 3ZX3A 5BPLA 4FW1A 2N2RA 4J2AA 1P00A 2E1ZA 3T7ZA 1YVUA 1BCOA 3MCPA 3SAFA 4CJFA 3U8XA 3QI7A 1ILYA 4ICLA 4DV7K 2OYQA 4DU1A 3EY1A 1GPSA 1SV5A 3CXCM 2UYTA 4E19A 2M8BB 5AZIA 4IEIA 4JKGA 1VSHA 3Q7CA 3G0ZA 4DSFA 3CM6A 4M3WA 1NGFA 1XNRK 3GOIA 1WOQA 3A5OC 4JRPA 4XEIA 4CCHA 1EWRA 4B3SK 5EU7A 4IFEA 1SKRA 4GVEA 4QS9A 2OZSA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1A5V A;  4C8L A;  3CME N;  1S5J A;  4DB3 A;  3KOX A;  1LW2 A;  4JKG B;  3THX A;  2HMI A;  2EWS A;  4YHH K;  3THY B;  3S3M A;  4HUG A;  2HBJ A;  3DLE A;  4Y1C A;  4FZZ A;  2E5L K;  2YCH A;  4JI7 K;  4KRE A;  4CED A;  1PX9 A;  3OYC A;  3DLL L;  4BR5 A;  2OPP A;  1RT4 A;  1OVQ A;  4RW6 A;  4HE7 A;  4PY5 A;  2P9S B;  3AA5 X;  4BE2 A;  2P9I B;  4DSI A;  2P51 A;  1HNZ K;  5AQM A;  1N5Y A;  2XY5 A;  4MLH A;  3E7U X;  1MYN A;  3O08 A;  1JLC A;  3ULD A;  2UU9 K;  2LY5 A;  1CXU A;  4J2D A;  2GBZ A;  3OS2 A;  2F8S A;  4OJR A;  3O4N A;  3BP8 A;  1XC9 A;  3LDN A;  1NJX A;  3RSE B;  3HSC A;  1ZFU A;  4EZ6 A;  2YV0 X;  3NHG A;  1TK5 A;  3AO4 A;  4N47 A;  3NDK A;  2B6A A;  1BIZ A;  5GAE P;  4Z0U A;  1DEJ A;  4AHR A;  4FCY A;  3SUP A;  1XI1 A;  4YFU A;  2IAJ A;  4FWM A;  2NRX A;  3CPE A;  3VF2 A;  1I2V A;  2LSN A;  3B8A X;  5AQJ A;  2OZM A;  3NH2 A;  2O4G A;  1I3A A;  5GAD P;  4DR7 K;  4IKF A;  3PX4 A;  4XH5 A;  4B9V A;  5AQS A;  4J2B A;  4CJR A;  2F8T A;  3DYA A;  3CCV N;  3T3F A;  4DTX A;  4E7J A;  3NCI A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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