5BN8A

Crystal structure of nucleotide-free human hsp70 nbd.
Total Genus 127
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
127
sequence length
379
structure length
379
Chain Sequence
AAAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVALNPQNTVFDAKRLIGRKFGDPVVQSDMKHWPFQVINDGDKPKVQVSYKGETKAFYPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDRTGKGERNVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVNHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASLEIDSLFEGIDFYTSITRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDLVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILMG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Heat shock 70 kDa protein 1A
publication title Nucleotide binding to variants of the HSP70-NBD.
rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 127
structure length 379
sequence length 379
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-05-25
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5bn8A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5bn8A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5bn8A03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5bn8A04
5AQSA 4H5RA 2AA4A 4C23A 2P9SA 3UKUB 3VF6A 3DXMA 3VOVA 4K25A 1IJJA 2QWLA 4CZFA 3RSEA 2GWJA 5AZIB 2CGJA 1NGIA 2J4RA 3CETA 4CZLA 1V4TA 3VERA 4IJNA 2KHOA 1NM1A 1BWFO 1XQSC 4BRKA 1OKJA 4PKGA 1ZC6A 2Q0RA 3A5NC 4XH4A 4CZIA 5JLFA 4BG9A 3QMLA 3F9MA 1E4FT 4FOEA 4JD2B 1DGKN 3GDQA 4BRPA 3D2EA 4Z94A 2GTDA 4A2BA 4CZMA 2VWBA 3SK3A 4MO5A 2P9LA 4E1JA 1GLAG 4H03B 4JAXA 4H5VA 4JHDA 4BRQA 1NGBA 3M1FA 2A6AA 2E2OA 2F9WA 1G99A 3O8MA 4B1XB 3I33A 1RDWX 2A40A 5KPRA 2P9UB 3LDPA 4QS7A 3ZETB 3H1VX 3R6MA 3GL1A 1HJOA 4Y0WA 3W0LA 5AQTA 4K42A 3H6EA 1WOQA 2BTFA 2H3GX 1K8KA 2V52B 3HTVA 5AQRA 3A5MC 4BC3A 3MMVA 2WUSA 2Q97A 3EKSA 3WXIA 4EHTA 4CZGA 5AR0A 4BRHA 2I7PA 2HF3A 2OANA 2V7YA 5BPMA 3CJBA 4H5NA 5AQVA 1T6DA 4BVPA 5AQMA 4IO8A 1NGFA 4M63C 1HX1A 3IUCA 4EIAA 3JS6A 4MLHA 1C0GA 1KAYA 1MWKA 4B1VA 4A61A 5I9EB 4BR9A 4ISEA 2ASMA 2P9SB 2FF3B 5CE3A 3DXMB 3DJCA 5BRDA 3RSEB 4BRCA 3FZMA 1XC3A 4F9OA 1MA9B 2ASPA 4AM7A 1ATSA 5LY3A 3P4IA 3CJ9A 2NZTA 1GLEG 2D1KA 3QICA 2CH6A 4RCHA 2CGLA 4YDUC 3BF3A 2IVOA 3UB5A 4H0TB 4HWIA 5FPEA 1ZBSA 3SJHA 3FZFA 1NMDA 1JCGA 3A5OC 5TKYA 1QZ5A 3MK6A 1SZ2A 3FZHA 4CBUA 3D2EB 2E20A 4BRDA 4RWTA 4EHUA 3VGKA 4H0VB 3WEEA 2P9LB 3H3NO 4BR2A 4HTLA 5AQPA 2QXLA 3JXUA 3CJAA 2FSJA 3U4LA 2NLXA 4JHDB 2IIRA 5EOYA 3WXKA 1QHAA 1MDUB 5AQXA 4KBOA 2Q2RA 5JMVA 3VEZA 3IFRA 4H0PA 4WQ4A 2Q31A 2GELA 3MN7A 1KXPA 5BN9A 4PL7A 3C7NA 3EN9A 2E8AA 3QFUA 1K8KB 1Z6RA 1X9JA 3BP8A 4PKIA 3GG4A 1D4XA 2E1ZA 5AQQA 5JICA 5KQDA 1GLFO 3CQXA 4BR5A 1CZAN 2GWKA 3LDLA 3HM8A 1TYQA 2Q1NA 3O08A 4FWMA 5EXWA 5FPDA 2YHXA 3LM9A 3O5BA 2DPNA 3L0QA 3FR0A 5ELZA 4M7YA 3VESA 5EX5A 5JLHA 4GY2B 1LOTB 3A5LC 4H0XB 5KPZA 3CIPA 4BR7A 1HKCA 4ISFA 3WUHA 1GLBG 3CERA 5AQHA 1DEJA 4RTFD 3LDOA 1XUPO 2YJEA 3ENHA 3VEXA 1NBWA 1DKGD 2E88A 4WYBA 5AQGA 1QZ6A 2V7ZA 2Q0UA 3J8AA 5F2RA 3DXKA 3WQUA 2GUPA 4H0YB 4J8FA 2FLOA 3MCPA 4CD1A 3GOIA 4A62A 2IVPA 2AP1A 4BRIA 3A8YA 4H0OA 1E4GT 1TUUA 4FWSA 4JN4A 4DCHA 3GE1A 3TU5A 2HOEA 4AM6A 2QWOA 4CJ7A 2ASOA 4BVOA 5AQLA 3L6QA 3MN5A 3HZ6A 4LC9B 3VGLA 3WEEB 3M3ZA 2P9NA 2D0PA 1ATNA 4FPAA 3SMSA 2P9IA 4CZJA 4XH1A 4WQ5A 5LJWA 1QQMA 3UE5A 3FZKA 3HSCA 1GLJO 5EY4A 3R9PA 2YHYA 1JCFA 3CJCA 5ADXA 1V4SA 1NGEA 5AQNA 5AQJA 1BO5O 1BG3A 2QWMA 5B8HA 3VETA 2I7NA 3ID8A 1GLLO 5E84A 5BPLA 4BREA 4NB4A 3C7NB 3VEWA 2ZGZA 4A2AA 3VF4A 1YAGA 1YVNA 3HBTA 3LL3A 4FWNA 3WXLA 1H1VA 2A5XA 1RFQA 3D2FB 3OHRA 3VPZA 1C0FA 3DWLA 1TYQB 1EQYA 3BEXA 1NGJA 4IXCA 3WT0A 3EZWA 1SQKA 4DQ8A 1BOTO 1NGDA 3AAPA 4CBWA 3U9DA 1X3MA 4BC5A 2A3ZA 3EL2A 3FE1A 5AQUA 4BRMA 4IZ9A 3SLCA 4BRLA 3QBWA 4ISGA 3KVGA 3ATVA 5BN8A 1HKGA 4I6MA 4K41A 2E1YA 4QS9A 3WXJA 1U2VA 4BROA 4CBXA 3H46O 1NLVA 1TUYA 1NGGA 3ZX3A 2ZF5O 1NGCA 3DXKB 1Y64A 4BRGA 4CD3A 1HKBA 2P9KA 1BDGA 1BU6O 2W41A 5AFUA 3ATUA 4FO0A 3CHWA 2CGKA 1S22A 3IDHA 3D2FA 1WUAA 5AZJA 3I8BA 3B8AX 4XEIA 4FL9A 1T44A 4FWPA 4B9QA 3G25A 4CZEA 4O5FA 3VEYA 3AY9A 2VCPA 4FOIA 3ULEA 3H1QA 2P9NB 3W3DA 5KQ8A 1LCUA 2P9IB 3H45C 5F1XA 4BQLA 3CJ7A 3EKUA 4H5TA 5AQOA 5AQKA 3ENOA 4MO4A 3MN6A 4BQZA 5AFUH 4BG8A 3ZX0A 1QQOA 3QFPA 2EWSA 1ESVA 2HF4A 2P9PA 3ZEUA 2QWQA 5AQZA 5LJVA 1RGIA 2YI1A 4PKHA 1P8ZA 4B1WB 5FPNA 2FF6A 1KAXA 2D4WA 2D0OA 5KPTA 3VGMA 5FPMA 2A42A 5F0XA 4BRNA 1SAZA 2PAVA 1HPMA 3L4IA 3CJ1A 3EO3A 2QW9A 1T6CA 2UYTA 3O80A 4BR4A 1YXQA 3BF1A 4B1ZA 3A0IX 4BC4A 4BGAA 4GNIA 3AARA 4K43A 4CZHA 4O8KA 1MWMA 2YCHA 1GLDG 4B1YB 2A41A 3ZX2A 2FXUA 5BR9A 2ITMA 3WQTA 3UKRA 2BUPA 4BC2A 4FWQA 2IVNA 4BGBA 4BRFA 2HMPA 4H5WA 3LDNA 4FWLA 4IWVA 3UKUA 4MLEA 4I6MB 5BREA 5AZIA 1J6ZA 5BPNA 1U2VB 1HLUA 3IMXA 3KZBA 3O1BA 2ZWHA 3BUZB 4XH5A 5EVZA 3O1WA 4CI6A 3QDKA 1IG8A 4B1UB 3U9ZA 2YHWA 4QS8A 1Z05A 3KHYA 1ATRA 4DHYA 1GLCG 2FSKA 1HUXA 4BR0A 4CZKA 2P9KB 4WQ5C 2E2NA 2Q36A 4JD2A 5BRFA 5AQFA 3LDQA 2VYPA 3LM2A 3HI0A 3FGUA 4L3QA 3FLCO 3MDQA 5AZJB 5ADXH 4FWOA 1YUWA 4YDUA 3ULEB 3SMPA 1X3NA 3VEVA 3C0BA 3U8XA 3S41A 3MN9A 3VENA 2QWRA 1S3XA 2QWNA 2E2QA 3DAWA 1JCEA 3QBXA 2P9UA 4EFHA 1BA0A 5BRHA 3ZETA 5AQWA 3AAQA 1NWKA 3FFKB 3TPQA 3FZLA 3VEOA 4NO7A 1Q18A 3D7EO 2P9PB 3ZEUB 3M6GA 4FWKA 2ZGYA 2CH5A 2E2PA 4JNEA 4M7XA 3R8EA 2V51B 2W40A 2GEMA 1R59O 5AQIA 5AQYA 1ZXOA 3GBTA 1NGAA 4BRAA 2NRHA 4IJAA 3O4WA 4PL8A 2QWPA 1QQNA 5E26A 1KAZA 3CI5A 2FSNA 3H3OB 4FWRA 4FPBA 3O6WA 2F9TA 1NGHA 4FSVA 3QB0A 3VF2A 1BA1A 4EAHD 3CQYA 1U6ZA 2PBDA 4DB3A 2YJFA 4WQ4C 1BUPA 3UKRB 2QM1A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5AQSA 4QCLA 3ZT0A 3L8BA 3UKUB 3VF6A 3DXMA 5HP1A 4K25A 4LF8K 1UGLA 2GWJA 1GOAA 5AZIB 2Q3SA 2UUAK 2J4RA 1DJTA 1SUQA 3QEXA 4KH4A 3VERA 5J2NA 2VGNA 2ATBA 1BWFO 1XQSC 4OPHA 2MBKA 2F7TA 1QS4A 2VWJA 2Q0RA 4XH4A 4CZIA 1Q7YO 3QMLA 1E4FT 1NMNA 4FOEA 4N47A 4YNQA 1VSKA 3D2EA 4Z94A 1XNQK 3M8SA 3SBTA 3SCXA 4E1JA 2E6MA 4HCBA 4Z4EA 4OX9K 4JAXA 3C65A 2BRZA 4KYPA 1JLGA 3AGKA 4Z0UA 2FBVA 3ZSVA 2E2OA 4EP5A 3V1QA 1CN2A 1YIJN 4FJKA 2P5OA 1C6VA 4UAFE 4QS7A 1A5XA 3K0SA 1BIZA 3KLFA 2BTFA 1I94K 1K8KA 3KKRA 3LWLA 1OZZA 4AHVA 1NH5A 2O8FB 2V52B 2HBMA 5CY4A 3G71N 4BC3A 2NNWA 3PO4A 3MMVA 1ZVEA 4A5AA 1XHXA 1Q9YA 1LW0A 1HYSA 4EHTA 3THWB 1L4VA 3VQEA 2OANA 3KK7A 3OS1A 4FZYA 1RDBA 4CHQA 1YTAA 3K5NA 3NHGA 3CJBA 4DG1A 4H5NA 4CVNE 1LWEA 2D5RA 3KD1E 4FJLA 1NKCA 1HX1A 1UWBA 4MLHA 1NOZA 4DV4K 1KAYA 4B1VA 2YHAA 3AO5A 5I9EB 4LF9K 4OGEA 3VMFB 3K9JA 1XWLA 3RSEB 4BRCA 3DMJA 4BECA 3VTHA 3CF5L 2JWLA 1W0HA 2N69A 3P4IA 3CJ9A 2NZTA 1CLQA 3HPGA 4OJRA 4FLYA 4J2BA 2F96A 4B8CA 2OA8A 4HWIA 3SJHA 3L2UA 3FZFA 4JKDA 1NMDA 1SL2A 1VRTA 3E9OA 4PHTX 1J54A 2QI2A 3PUFA 4JI5K 4ELVA 4OO1J 1WAFA 3RTVA 3WEEA 3J80O 4Z4CA 2P9LB 2VQEK 3QEVA 2VG5A 3U4LA 4DFMA 4UADE 3O9QA 5I3UA 3KJVA 4AAZA 4HHTA 3VQ7A 4IOAL 5AQXA 1TAUA 4KBOA 5JMVA 1K8AO 3OYEA 4N76A 3TSQA 4ZHRA 4WQ4A 2Q31A 4E7IA 1KXPA 5BN9A 3ID6A 2OPQA 3EN9A 1Z6RA 2OTLN 3DRPA 3BP8A 4PKIA 1N36K 3MWPA 1KTQA 5JICA 1GLFO 1ZFUA 2KW4A 2HHIA 4DV7K 1SL0A 4FXDA 3AVHA 2KGQA 3LM9A 3LDSA 4EZ6A 3FR0A 1B92A 3PIOL 3THYA 2LSNA 3E9LA 1Y97A 1B7DA 4GY2B 4DR5K 1LOTB 2ZD1A 1VAZA 3C6AA 4JI4K 1KVCA 4DTXA 1LAWA 4PQUA 4O44A 3AVKA 3J7AP 3CERA 4OLBA 1RTHA 1VSHA 1VQ4N 3LP1A 2YIOA 3CFPA 4CESA 1TK5A 4RTFD 4M3WA 2X78A 3TSPA 4DU3A 2GX9A 5CY0A 4GVMA 1FH3A 1JKHA 2I5JA 3HXMA 1QZ6A 4CJUA 2FC0A 1KFSA 3WQUA 3CYGA 4NCAA 4E72A 3PSFA 1KLMA 1NK8A 2HSTA 4J8FA 4NYNA 2FLOA 3KOYA 3A8YA 4JN4A 4DCHA 2HOEA 4AM6A 4CJ7A 2ASOA 4BVOA 3AVBA 4V19S 3L6QA 4LC9B 4F3OA 3VGLA 3VN5A 2B3CA 3M3ZA 1ZYVA 2P9IA 1TI5A 4CZJA 4QAGA 3UE5A 3FZKA 5E41A 1FW6A 4DFPA 3DLHA 4C1NK 1WWNA 3LPTA 1C1AA 5JVHL 3V9UA 4FJGA 4MDBA 4CW7B 3OJUA 5J2PA 5E84A 2B6AA 3NDKA 3T1AA 3S3NA 1KC8O 4BWMA 4CK2A 4NB4A 3H08A 4PUOA 2VGMA 4YY3K 2O4IA 1WN7A 1YAGA 3NF7A 1YVNA 3HBTA 4FWNA 4C8OA 3WXLA 4R5PA 1Q81O 1S6QA 1HPZA 1RFQA 3SQ1A 4NLCA 3RMBA 4WFAL 4OPJA 1OMYA 4J2DA 3AVMA 3DWLA 1TYQB 4CK1A 3HPOA 2LN8A 5J1EA 5HLFA 1SQKA 4JLHA 3NGYA 3OYCA 4YOVA 1BOTO 4JRPA 3CCMN 5A2QO 3FE1A 5AQUA 3SLCA 1HQUA 3CCSN 4ISGA 3ATVA 3HSTB 4I6MA 1C0UA 1LQQA 2E1YA 2E3FA 3DYAA 1HR0K 4M3UA 4CBXA 4TSXA 1NLVA 1TUYA 1D5AA 3ZSXA 3RRHA 3P31A 3DXKB 4BRGA 3THXA 1X9WA 3L3UA 1BDGA 2W41A 3ATUA 4FO0A 4BDPA 3IDHA 4L8RB 4B9QA 1T44A 1TK0A 3G25A 4B9NA 3U3YA 1S9GA 3VQDA 3VEYA 2YILA 3H1QA 2P9NB 4JKHA 1KQSM 4K8XA 4FLWA 4DMNA 4CEAA 5J2QA 1WNSA 4C8MA 4MO4A 5M1NA 5M1KA 5AFUH 4DR2K 1JXEA 4BG8A 3ZX0A 2EWSA 1ESVA 1CHZA 2XY7A 1SKWA 4CEQA 2LI7A 2YNFA 3CPEA 2B4JA 3ZEUA 3OS2A 4KFBA 3OYHA 4PKHA 1TVRA 4B3SK 2FF6A 2OYQA 4DQQA 3NF6A 2D0OA 2ZE2A 4M45A 1N32K 4AHUA 1HPMA 3EO3A 1OH8A 1ITGA 2GBZA 3AVNA 4UAEF 4O5BA 2Z1IA 3A0IX 1W7AA 4BC4A 4BGAA 4OKJA 4K43A 3HVTA 4M3YA 2BDPA 1MWMA 4CJVA 3E9PA 2UXDK 2O8EA 3TAEA 4LY7A 2FXUA 3WQTA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 5AQS A;  4QCL A;  3ZT0 A;  3L8B A;  3UKU B;  3VF6 A;  3DXM A;  5HP1 A;  4K25 A;  4LF8 K;  1UGL A;  2GWJ A;  1GOA A;  5AZI B;  2Q3S A;  2UUA K;  2J4R A;  1DJT A;  1SUQ A;  3QEX A;  4KH4 A;  3VER A;  5J2N A;  2VGN A;  2ATB A;  1BWF O;  1XQS C;  4OPH A;  2MBK A;  2F7T A;  1QS4 A;  2VWJ A;  2Q0R A;  4XH4 A;  4CZI A;  1Q7Y O;  3QML A;  1E4F T;  1NMN A;  4FOE A;  4N47 A;  4YNQ A;  1VSK A;  3D2E A;  4Z94 A;  1XNQ K;  3M8S A;  3SBT A;  3SCX A;  4E1J A;  2E6M A;  4HCB A;  4Z4E A;  4OX9 K;  4JAX A;  3C65 A;  2BRZ A;  4KYP A;  1JLG A;  3AGK A;  4Z0U A;  2FBV A;  3ZSV A;  2E2O A;  4EP5 A;  3V1Q A;  1CN2 A;  1YIJ N;  4FJK A;  2P5O A;  1C6V A;  4UAF E;  4QS7 A;  1A5X A;  3K0S A;  1BIZ A;  3KLF A;  2BTF A;  1I94 K;  1K8K A;  3KKR A;  3LWL A;  1OZZ A;  4AHV A;  1NH5 A;  2O8F B;  2V52 B;  2HBM A;  5CY4 A;  3G71 N;  4BC3 A;  2NNW A;  3PO4 A;  3MMV A;  1ZVE A;  4A5A A;  1XHX A;  1Q9Y A;  1LW0 A;  1HYS A;  4EHT A;  3THW B;  1L4V A;  3VQE A;  2OAN A;  3KK7 A;  3OS1 A;  4FZY A;  1RDB A;  4CHQ A;  1YTA A;  3K5N A; 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