5BPLA

Crystal structure of adp and pi bound human hsp70 nbd mutant r272k.
Total Genus 125
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
125
sequence length
380
structure length
380
Chain Sequence
KAAAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVALNPQNTVFDAKRLIGRKFGDPVVQSDMKHWPFQVINDGDKPKVQVSYKGETKAFYPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDRTGKGERNVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVNHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACERAKKTLSSSTQASLEIDSLFEGIDFYTSITRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDLVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILMG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Heat shock 70 kDa protein 1A
publication title Nucleotide binding to variants of the HSP70-NBD.
rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 125
structure length 380
sequence length 380
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-05-28
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5bplA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5bplA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5bplA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5bplA04
5AQPA 2QWPA 3ATUA 2ZGZA 3H6EA 3O1WA 2E1YA 3IDHA 3VEZA 2P9KB 4BC2A 3QBWA 4WQ5A 2HF4A 4BR5A 5AQLA 2A5XA 4RWTA 1T44A 3CIPA 3RSEB 4AM7A 3H1VX 4JD2B 3WQTA 2VYPA 1NGGA 4PKHA 3HZ6A 1H1VA 1HX1A 4BRFA 3MN9A 4M7YA 5JMVA 1WUAA 5F1XA 4BRLA 4BQZA 4BRMA 3VETA 3H45C 4FWPA 2E2OA 2E2PA 3M3ZA 4BRQA 2P9UB 5AZIB 3BP8A 4CZEA 4EIAA 4B1ZA 3GBTA 5FPMA 4CJ7A 4BG8A 5AQYA 4Z94A 4IXCA 3EL2A 5BPLA 1E4FT 4ISEA 2P9NA 1TYQA 1GLAG 3CQYA 3FZHA 3LDNA 1GLEG 3GE1A 4H0YB 3MCPA 5FPEA 4H0OA 4FWNA 2H3GX 4KBOA 4E1JA 1BA1A 2GELA 2QWNA 3AAQA 3WEEA 1X3MA 5AQQA 3FZFA 2P9SB 5BN9A 5AQZA 3A5OC 4MLHA 5JLHA 2P9PA 3GG4A 3O8MA 3O1BA 1G99A 4CZKA 2A40A 4EHTA 4YDUA 4QS7A 3HI0A 4FPBA 1XC3A 1ATRA 4NB4A 1SAZA 3M6GA 2P9LA 1JCEA 3UB5A 4HTLA 4FOEA 1GLFO 5FPDA 3WQUA 5AQIA 5BPNA 1NGJA 4IZ9A 4GY2B 4JN4A 3VEVA 3VF4A 4DHYA 2P9NB 1TYQB 3VGMA 4BRGA 2WUSA 4CI6A 1DEJA 4RCHA 1BUPA 2FF6A 4BR0A 1X3NA 1NLVA 3DXMA 1C0FA 3CI5A 5AQMA 3ZX3A 3U8XA 4DCHA 5AQHA 3FLCO 3R9PA 3SK3A 3UKRA 2CH6A 4O5FA 1Y64A 3WEEB 1EQYA 2Q0UA 3QB0A 3ENHA 4B1YB 1NGFA 2BTFA 3QFUA 1QQNA 4B1WB 3H1QA 3WUHA 2P9PB 4B1VA 3AARA 2ITMA 4K25A 3LDLA 5EY4A 5EX5A 1CZAN 2E2NA 2P9LB 3JS6A 1LOTB 1NGCA 1ATNA 3DWLA 3VOVA 4FWQA 1BWFO 1GLLO 4K42A 4BG9A 4BRIA 1NGDA 4MO4A 4H5VA 3FZMA 4FPAA 4BGAA 5KPRA 2D0PA 3CJ9A 3F9MA 3WXLA 4A61A 3GL1A 1YVNA 4BRHA 2IIRA 4CZGA 2E20A 4FO0A 5AQRA 3UKUA 5JLFA 3DXMB 3DXKA 3C0BA 1RGIA 4F9OA 2F9TA 5AFUH 3MN6A 3UKRB 1HJOA 1V4TA 2PAVA 2QM1A 3ID8A 3QFPA 2A41A 4K43A 2A3ZA 3CETA 1BG3A 3CJAA 1NGHA 4C23A 4GNIA 2NZTA 2E88A 3G25A 4H5RA 1HKGA 2P9SA 2BUPA 3FR0A 1NGIA 4H5NA 2QWMA 2YJEA 1R59O 4H0VB 1GLDG 3O4WA 3ZETA 5F2RA 4QS8A 3HBTA 5B8HA 2ZWHA 5KQDA 5AQFA 4J8FA 3SLCA 5CE3A 2QWLA 1HLUA 3S41A 1IJJA 3KZBA 4B1UB 3WXIA 3UKUB 5AQNA 3DXKB 4H0PA 4CZMA 3H3OB 2D0OA 1TUUA 3FGUA 1ZXOA 2FF3B 5BREA 1JCGA 3QBXA 3J8AA 1MA9B 4EAHD 1GLBG 1HUXA 2J4RA 4MLEA 3HSCA 5FPNA 3U9DA 4BR2A 3BUZB 4H03B 3KVGA 5AQWA 4BQLA 3FE1A 3UE5A 2QWRA 1NMDA 1TUYA 3VERA 3ATVA 1OKJA 1QZ5A 2VWBA 4BRPA 1RFQA 4XH1A 3I8BA 3A8YA 2E1ZA 5BRHA 1Q18A 2W40A 1MWMA 3ZX2A 3ULEA 1QQMA 4H0XB 3DJCA 3C7NA 1J6ZA 4CZIA 3DAWA 4CZJA 4PKGA 3ZETB 3FZLA 1MDUB 2E2QA 5EXWA 4WQ4C 4XEIA 4XH4A 1ESVA 2E8AA 1T6CA 4DQ8A 4PL8A 4PKIA 4MO5A 3R6MA 3BF1A 2AA4A 5AQKA 4IJNA 3O08A 4I6MB 2ZGYA 3M1FA 3IUCA 4BRNA 2I7NA 3P4IA 3O5BA 2QXLA 4BRKA 5AQSA 1ZC6A 2ASPA 3JXUA 2CGJA 2NRHA 1KAYA 4NO7A 3ZX0A 1WOQA 3EKUA 5AZJB 4FOIA 3VGLA 3BF3A 3D2EA 3CQXA 3BEXA 4O8KA 2Q31A 1QHAA 3LDPA 3VEYA 3ULEB 1DKGD 5AQVA 5F0XA 2V7ZA 1HKBA 2YHWA 4BROA 5BPMA 3C7NB 3FFKB 4JHDB 3CJ1A 5LJVA 3KHYA 4FWOA 4WYBA 2F9WA 3H3NO 3HM8A 2CGLA 3SMPA 3SMSA 3VGKA 3WXJA 4BREA 1X9JA 4CBXA 2ZF5O 3CJBA 4BRAA 2P9IB 5KQ8A 5LJWA 3LDOA 2YCHA 5AQTA 3D7EO 3O80A 3A5LC 1Z6RA 2ASMA 4PL7A 3AAPA 4FSVA 3IFRA 5JICA 1NGBA 4BC4A 2VCPA 3H46O 3LM2A 5EVZA 4BR7A 4M63C 4BRDA 1HPMA 3U9ZA 3SJHA 1XQSC 3QICA 4FWKA 4CBWA 1S3XA 1GLJO 1XUPO 4WQ5C 5BN8A 2A6AA 4K41A 3W3DA 3L6QA 5KPZA 1D4XA 1BO5O 4DB3A 2Q0RA 3D2EB 3A5MC 2CH5A 3HTVA 3MMVA 3FZKA 1LCUA 3L4IA 3CERA 1E4GT 4L3QA 4CD3A 1BOTO 2IVPA 1QZ6A 1Z05A 3MN5A 1JCFA 4BC3A 5BRFA 4H5WA 5KPTA 3A0IX 2CGKA 3ENOA 3B8AX 3D2FB 2YHYA 2GTDA 4ISFA 4BR4A 4FL9A 2Q2RA 2Q97A 3QDKA 2FSKA 5AFUA 5ADXH 2QW9A 1P8ZA 3CHWA 3O6WA 4FWMA 4BRCA 2UYTA 1DGKN 1U2VA 4AM6A 4I6MA 3TU5A 5AR0A 2V51B 2FSNA 1IG8A 1SQKA 5AQJA 3VEWA 1T6DA 2GUPA 2GEMA 1BDGA 2Q36A 4IJAA 3TPQA 5AZJA 2Q1NA 4BGBA 1MWKA 1U6ZA 2EWSA 2QWQA 4JNEA 3L0QA 2D4WA 2I7PA 3LL3A 5AQUA 5ADXA 3VEOA 1ZBSA 4JHDA 2W41A 2FSJA 1K8KA 4JAXA 1NGAA 4YDUC 4FWLA 2P9IA 2DPNA 4M7XA 3ZEUA 2D1KA 3R8EA 4CZHA 3LM9A 3U4LA 2ASOA 2IVOA 4FWSA 3VPZA 4BC5A 4CZFA 5AQGA 4H5TA 1KAZA 3W0LA 1U2VB 4IO8A 5TKYA 3QMLA 5E84A 4HWIA 3IMXA 4RTFD 3WXKA 1YAGA 2GWJA 4Y0WA 5BR9A 4WQ4A 1RDWX 1ATSA 4A2BA 3WT0A 5BRDA 1BU6O 3EN9A 3I33A 3GOIA 2FLOA 1V4SA 5EOYA 1KAXA 5AQXA 2HMPA 3MN7A 3VEXA 4QS9A 1C0GA 3OHRA 5I9EB 2YI1A 3CJCA 3VENA 1K8KB 1NM1A 4BR9A 1SZ2A 2QWOA 2P9KA 2V7YA 3ZEUB 4BVOA 1GLCG 1S22A 4EFHA 1BA0A 3RSEA 4EHUA 3D2FA 1HKCA 4ISGA 4A2AA 4CZLA 4JD2A 4IWVA 2YHXA 1KXPA 3EO3A 3EKSA 1NBWA 4H0TB 3MDQA 2FXUA 3GDQA 4CBUA 1QQOA 4B1XB 4B9QA 1YXQA 3EZWA 2HF3A 2GWKA 3A5NC 3AY9A 2NLXA 2IVNA 2PBDA 3VF6A 1NGEA 4CD1A 4BVPA 4XH5A 2AP1A 4LC9B 2A42A 5ELZA 2P9UA 1YUWA 5AQOA 5AZIA 2KHOA 2V52B 2OANA 2YJFA 3LDQA 2HOEA 3MK6A 3VF2A 3VESA 5E26A 4FWRA 1NWKA 4A62A 3CJ7A 5LY3A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3O1WA 4B08A 3VEZA 4OKEA 3C6AA 1T44A 3WQTA 5C42A 4A57A 4PKHA 1XRSB 4KTQA 4LY7A 1LWEA 3VQEA 3MN9A 2HHVA 4CF1A 4M7YA 5HRSA 4M3YA 1VNAA 5HBMA 5F1XA 4BRLA 4BQZA 3NF9A 1HNWK 4C8LA 2IC3A 3OS2A 4C1NK 4R79A 4X64K 1VQON 5J2NA 2P9UB 4I7FA 4EZ6A 4EIAA 3ENBA 3VTHA 4B1ZA 2W6LA 3GBTA 1DQ7A 4U7BA 4DV4K 3BZCA 2NRRA 1OMYA 5BPLA 1WNSA 1E4FT 2KLAA 2NRVA 3F9KA 1YVUA 5CHIA 3S3MA 2P9NA 3PV8A 3PX0A 4WCEL 4W5NA 2F96A 3GE1A 3CYMA 3C6TA 3J7AP 1JZAA 1CXQA 5AJ3K 3EE9A 4KBOA 4PY5A 4E7HA 1CZ9A 2GELA 2QWNA 3AAQA 3AGKA 3WEEA 3AVGA 4CIFA 3SBTA 3HK2A 3GG4A 1Q9XA 2R7YA 1G99A 1W0HA 4JI6K 4CZKA 3ASMA 4YDUA 1T7AA 1ATRA 4NB4A 2DFFA 4CQKA 2P9LA 4DR6K 4F3OA 5E41A 1TGOA 2UUBK 4KI4A 4JS5A 4FOEA 1SKWA 4QCLA 4CK2A 1KD1O 4JI1K 3V9SA 2XHBA 5BPNA 4HUGA 3PIPL 1QHTA 1LWFA 3PSMA 3CW4A 3D45A 4KRFA 2P9NB 4BRGA 4LF7K 3RRGA 1NE5A 4BR0A 3WNGA 1IH7A 4JYAK 1X3NA 3HT3A 4DR4K 3CI5A 1EWQA 5J2MA 3ZX3A 2LN8A 3HP9A 5AQHA 4CJSA 3LP2A 4R5PA 3ZLJA 3EYZA 3F2KA 1FK9A 3PX4A 4FK0A 1U45A 4O5FA 3OYDA 4C1NI 1RILA 3WEEB 1EQYA 1F21A 3DRRA 3QB0A 2BTFA 3QEWA 5HOOA 4XIUA 4KAZA 3O9UA 3WUHA 2JLEA 1VQ4N 4KO0A 3AO3A 4BACA 2G8HA 2JWLA 1ZBFA 1CZAN 3SNNA 3ZYYX 5KI6A 2P9LB 1NGCA 1ATNA 3WXMB 4OKJA 1REVA 3OJUA 4K0KK 5DMRA 1TV6A 3NH0A 3AO4A 2UXCK 3SAHA 2VQEK 4BRHA 4DV2K 2JWKA 3UKUA 4JI2K 1C0TA 1PE4A 4PA1A 1RGIA 1A5VA 5AFUH 3O9QA 1VQ7N 2LR3A 3M8RA 1V4TA 2A1SA 2QM1A 4OKKA 3CCLN 3CETA 3CJAA 4L8RB 2RPIA 5IWAK 3KLHA 2E88A 3FR0A 3SUOA 1NRAA 1L5UA 4H5NA 4H4MA 3CCUN 5JVHL 3CYGA 1KLMA 3AVLA 1GLDG 4CHYA 4HHFA 3HBTA 4DF8A 1RTIA 4IOXA 2OTJN 1OZZA 5AQFA 1K6YA 5C10A 4JKEA 1KV0A 1C0UA 3AO5A 1XWLA 4IKFA 3WXIA 1XI1A 3UKUB 3P83D 4NXMK 1QTMA 1JKHA 2VY6A 4FJ7A 1ZXOA 1ZBLA 3J80O 3MEEA 5BREA 1UWBA 3QBXA 3PX6A 1KQSM 4EAHD 2DY4A 1GLBG 3HSCA 1NNEA 5CZ2A 1Y97A 2NRXA 4BQLA 2QWRA 2GBZA 1NMDA 1TUYA 3VERA 1UA0A 1OKJA 3G4SN 4XH1A 3AA5X 1Q18A 4O4GA 4H0XB 2XY8A 3C7NA 5CY0A 3DYAA 3KOZA 4CZJA 3MX5A 3CCQN 2KBHA 1MDUB 4XEIA 1T6CA 4DQ8A 4MO5A 3BF1A 3OYHA 3QEPA 1VSHA 1LWCA 3QEVA 4IDKA 5EU7A 3B6OA 4IJNA 3O08A 1NJWA 1BCMA 2WONA 2NY9X 1HRHA 4BRKA 4B9NA 4A5BA 5AQSA 3JXUA 2YX6A 3ZX0A 4NO7A 4M3WA 1POIA 1WOQA 1S1UA 1D8YA 4FOIA 2NNWA 4JI5K 3KD5E 4DS5A 1YT3A 4Z4CA 1QHAA 3VQAA 4WFAL 2NRTA 1NJIO 3C7NB 4JHDB 1Q9YA 4FWOA 4WYBA 3SMPA 3HM8A 1SEGA 1J9AA 4CBXA 3HPHA 4DF4A 1SL0A 2HNDA 2P9IB 3RR7A 5LJWA 2P5GA 3MCAB 4M3TA 3O80A 2ASCA 4CVNE 2ASMA 4FSVA 2I5JA 3IS9A 3R1XA 2VCPA 4U67L 5EVZA 3PO4A 3KTQA 1IG9A 1HYSA 1C56A 4BRDA 3U9ZA 3LP0A 1XQSC 1XHZA 1S3XA 1GLJO 1XUPO 2KBJA 2G8UA 4K41A 1MU2A 3W3DA 4W5OA 3TTFA 1VSLA 4DB3A 2Q0RA 1BK8A 1Q82O 1MYNA 2CH5A 3MMVA 1C0MA 3VQ6A 3FZKA 4DV3K 4AHSA 3DLEA 1Q7YO 1E4GT 4B9MA 4YY3K 2KSKA 1ZVGA 1JCFA 1RT7A 1OH6A 4X62K 2GTDA 3OYMA 4FL9A 3C65A 4CIGA 4KYPA 2Q97A 3QDKA 3VA0A 1W97L 4J2AA 2QW9A 3R3LA 4N41A 3HRGA 4EP4A 1U48A 1U2VA 1N33K 3MEGA 3AVIA 2E4LA 5AR0A 3KIOA 1TL3A 2E2FA 1XNQK 1RTJA 1T3VA 3QLHA 1HNIA 2IGIA 1K8BA 5AZJA 2HNYA 3M8QA 1MWKA 3O3FA 3AVAA 3OTOK 3TAQA 1PX9A 4HVJA 4IG0A 5CYMA 1KRPA 1RBUA 5ADXA 3VEOA 1JXEA 2XY5A 3KJVA 1WAJA 4I9LA 3NMUA 2P51A 4JK8A 2N69A 3HJFA 3ZSRA 4DWIA 2YEOA 3S9HA 4M7XA 3F73A 2D1KA 3CM5A 3R8EA 4CZHA 3U4LA 4KTZA 1SKRA 2MN5A 4BWMA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3O1W A;  4B08 A;  3VEZ A;  4OKE A;  3C6A A;  1T44 A;  3WQT A;  5C42 A;  4A57 A;  4PKH A;  1XRS B;  4KTQ A;  4LY7 A;  1LWE A;  3VQE A;  3MN9 A;  2HHV A;  4CF1 A;  4M7Y A;  5HRS A;  4M3Y A;  1VNA A;  5HBM A;  5F1X A;  4BRL A;  4BQZ A;  3NF9 A;  1HNW K;  4C8L A;  2IC3 A;  3OS2 A;  4C1N K;  4R79 A;  4X64 K;  1VQO N;  5J2N A;  2P9U B;  4I7F A;  4EZ6 A;  4EIA A;  3ENB A;  3VTH A;  4B1Z A;  2W6L A;  3GBT A;  1DQ7 A;  4U7B A;  4DV4 K;  3BZC A;  2NRR A;  1OMY A;  5BPL A;  1WNS A;  1E4F T;  2KLA A;  2NRV A;  3F9K A;  1YVU A;  5CHI A;  3S3M A;  2P9N A;  3PV8 A;  3PX0 A;  4WCE L;  4W5N A;  2F96 A;  3GE1 A;  3CYM A;  3C6T A;  3J7A P;  1JZA A;  1CXQ A;  5AJ3 K;  3EE9 A;  4KBO A;  4PY5 A;  4E7H A;  1CZ9 A;  2GEL A;  2QWN A;  3AAQ A;  3AGK A;  3WEE A;  3AVG A;  4CIF A;  3SBT A;  3HK2 A;  3GG4 A;  1Q9X A;  2R7Y A;  1G99 A;  1W0H A;  4JI6 K;  4CZK A;  3ASM A;  4YDU A;  1T7A A;  1ATR A;  4NB4 A;  2DFF A;  4CQK A;  2P9L A;  4DR6 K;  4F3O A;  5E41 A;  1TGO A;  2UUB K;  4KI4 A;  4JS5 A;  4FOE A;  1SKW A;  4QCL A; 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