5BPLA

Crystal structure of adp and pi bound human hsp70 nbd mutant r272k.
Total Genus 125
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
125
sequence length
380
structure length
380
Chain Sequence
KAAAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVALNPQNTVFDAKRLIGRKFGDPVVQSDMKHWPFQVINDGDKPKVQVSYKGETKAFYPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDRTGKGERNVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVNHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACERAKKTLSSSTQASLEIDSLFEGIDFYTSITRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDLVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILMG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Heat shock 70 kDa protein 1A
publication title Nucleotide binding to variants of the HSP70-NBD.
rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 125
structure length 380
sequence length 380
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-05-28
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5bplA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5bplA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5bplA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5bplA04
2V7ZA 4BGBA 4KBOA 1RGIA 3MN6A 3GL1A 4B1WB 3SK3A 1HKCA 3UKUB 4H0TB 5E26A 4CI6A 3ZETA 2GWJA 2CGJA 4CJ7A 2KHOA 5BRDA 5F1XA 1DGKN 4RCHA 3FLCO 4XEIA 3D2EB 5AQKA 1TUYA 1TUUA 4B1ZA 5F0XA 4BQLA 4CD3A 3HTVA 3JS6A 1QQOA 5LY3A 4K41A 1GLBG 3QFUA 3MN9A 5F2RA 3M1FA 2FF6A 5EOYA 1EQYA 3LM9A 4BRMA 4H0YB 4BC4A 4EAHD 2OANA 2IVOA 4MLEA 1NBWA 5BREA 1GLFO 2FSKA 4M7YA 1IG8A 3IFRA 3L6QA 3FZHA 3TU5A 4Z94A 4CD1A 5AQMA 1ZC6A 2FLOA 2J4RA 4WQ4A 5FPEA 3CQXA 1ESVA 3O8MA 3CJ1A 1V4SA 3D2FB 2V7YA 5AZIB 1GLCG 4CZFA 3CJ9A 3L0QA 3VETA 4BRFA 2QW9A 2Q97A 4CZLA 4FWQA 4I6MB 3VOVA 1MDUB 4CZMA 2NRHA 5ADXA 1ATRA 2NLXA 4FWRA 3C7NB 2P9UB 3EKSA 3P4IA 4YDUA 2IVNA 2BTFA 2QWNA 3ATUA 5AQNA 3R6MA 1ATNA 1BUPA 1YAGA 5JLHA 5AQYA 2QXLA 2QWRA 4WQ5C 2GWKA 2YJFA 3JXUA 1GLDG 2ASMA 4BRAA 3GBTA 2Q1NA 2GTDA 4IJAA 1S3XA 3LDNA 1LOTB 1K8KA 4BC5A 4FWLA 2H3GX 3VENA 4QS7A 1U6ZA 3FZLA 3H3OB 4DCHA 1HJOA 2QWMA 2D1KA 2BUPA 2V52B 3DXMA 3CIPA 4J8FA 2YJEA 3GOIA 4BC3A 4FWKA 3VPZA 3FR0A 4B1YB 1NGJA 1DKGD 3SLCA 3WXJA 4AM6A 1RFQA 3CHWA 1NLVA 2DPNA 3VGMA 3B8AX 3ULEA 4XH1A 4K43A 2HMPA 4WYBA 4PL7A 2Q0UA 4H0VB 1TYQB 3M3ZA 1T6CA 1V4TA 2E8AA 2Q36A 3W0LA 3GDQA 2A6AA 5EVZA 5FPMA 4IXCA 3O6WA 1NGHA 2AP1A 3RSEA 4E1JA 1NMDA 3EZWA 4GY2B 2PAVA 3O80A 2P9NB 3CJCA 3DXKB 3O4WA 3S41A 5ELZA 4CZEA 3HI0A 5BRHA 3LDLA 4JAXA 3UKRA 2FSJA 1YUWA 3VEWA 4A62A 1BA0A 4M63C 3LL3A 4O8KA 5AFUA 3WEEA 3VERA 1KXPA 4JD2B 1T6DA 1D4XA 1YXQA 2A5XA 1GLAG 4FO0A 2QWPA 2YI1A 2VYPA 3OHRA 2YHYA 5AQIA 1WUAA 2Q2RA 3MCPA 4JNEA 5AQJA 5BPMA 4H5NA 5AQHA 1U2VA 3O5BA 2P9SB 5BPLA 2HOEA 3DWLA 5BN8A 4HTLA 4DQ8A 2NZTA 4AM7A 3LDOA 2P9PB 3ENHA 4K25A 1P8ZA 2E2QA 4NO7A 2UYTA 3QBXA 4H0XB 4B9QA 4H5TA 3VGKA 3A5LC 5AQUA 3CJ7A 1HX1A 4RWTA 1MA9B 2YHWA 3ZX2A 3QFPA 2QWQA 2GELA 2CGKA 4BRQA 1BDGA 3C0BA 1E4FT 4RTFD 5AQOA 3VEVA 1NGEA 4WQ4C 4O5FA 3FFKB 1X3NA 4JN4A 4FPAA 5CE3A 5AZJB 2D0PA 3UKUA 4CZHA 3ZEUB 4FL9A 1IJJA 2I7NA 1BOTO 1NM1A 1X3MA 4BC2A 1NGGA 1K8KB 1CZAN 3KHYA 2CH5A 4CBUA 3I33A 3D2EA 4L3QA 3AY9A 5JICA 2QM1A 2E2PA 3H46O 2YHXA 2ZF5O 1NGIA 2A3ZA 1H1VA 2P9LA 4YDUC 2P9KB 2IIRA 3WQTA 1GLEG 1NGAA 1BG3A 3VEYA 1KAXA 1WOQA 5LJVA 5FPNA 3BUZB 1JCGA 4CZGA 2ASOA 4IO8A 5AQVA 2E88A 1Z05A 4BROA 5LJWA 3MMVA 1QQNA 4FWSA 3VESA 3KVGA 1MWMA 2A41A 3WXKA 1HPMA 1KAYA 1HKBA 3WT0A 5KQDA 4IJNA 4H0OA 4PKIA 4ISFA 4JHDB 4IWVA 3H1QA 3GG4A 1QQMA 1HUXA 3RSEB 3O08A 1YVNA 3QICA 3FE1A 3AAQA 1E4GT 3I8BA 3D2FA 3LDQA 1DEJA 2GUPA 3U9ZA 2F9TA 5AZIA 4BGAA 2W41A 5AQZA 4BRPA 3ZETB 3D7EO 1SZ2A 4FWNA 3WEEB 1J6ZA 2QWOA 2W40A 3ID8A 1SQKA 5AQPA 2E1YA 2CH6A 1MWKA 3VF2A 2E1ZA 4I6MA 5AQFA 5AQRA 2Q0RA 4NB4A 1KAZA 4MO5A 5FPDA 3BP8A 2VWBA 5AQXA 3C7NA 3ATVA 1X9JA 2P9UA 1U2VB 3DJCA 3AARA 4ISGA 4K42A 5AQSA 4BRCA 2ASPA 2ZGYA 3LDPA 5EXWA 3EL2A 5TKYA 2ZGZA 3WUHA 1XC3A 3VGLA 4EIAA 3CI5A 4CBXA 3SMSA 1G99A 4BG9A 4FPBA 1GLLO 3BEXA 4F9OA 1HLUA 4BR5A 4H5WA 3MDQA 3R9PA 2A40A 5AQWA 2P9IA 4HWIA 1LCUA 2E2OA 2FF3B 2IVPA 4FOIA 3EO3A 3MK6A 3IDHA 3TPQA 2VCPA 3HZ6A 3J8AA 3O1BA 3LM2A 4BR9A 4FSVA 1OKJA 5BN9A 3L4IA 1NWKA 2ITMA 1BWFO 3ZX0A 4FWMA 4DB3A 3KZBA 1Z6RA 1QZ6A 5B8HA 5AR0A 2YCHA 5KPZA 3HBTA 3H1VX 3AAPA 4Y0WA 3R8EA 4BR2A 4M7XA 4H5VA 4A61A 2D4WA 4PKHA 1XUPO 1ZBSA 5BPNA 4FOEA 5BRFA 2D0OA 3A0IX 3VF4A 1TYQA 2P9LB 4PKGA 3DAWA 4IZ9A 3H3NO 4BR7A 2V51B 2F9WA 5AFUH 3BF3A 2EWSA 3O1WA 3VF6A 3ZX3A 4BRKA 1QZ5A 4BRNA 5KPTA 1XQSC 4BRLA 4BRHA 3QDKA 3QMLA 2P9NA 3DXKA 1NGFA 3W3DA 4XH5A 3HSCA 3A5MC 2ZWHA 3FGUA 2QWLA 4H0PA 4ISEA 1C0GA 1JCEA 2E20A 1SAZA 4JD2A 1ATSA 3ENOA 1RDWX 4CZKA 4QS8A 4B1VA 4B1XB 4BG8A 1ZXOA 1HKGA 3A5NC 4BVOA 3DXMB 1Q18A 2Q31A 3WXLA 3M6GA 3EKUA 4EFHA 1BA1A 2P9SA 5BR9A 3F9MA 4EHUA 1BU6O 4FWPA 1BO5O 2P9PA 3ULEB 3SMPA 1Y64A 4A2BA 4BRIA 3U8XA 3BF1A 3FZMA 1C0FA 3IMXA 3UE5A 2HF3A 3HM8A 3FZFA 5EY4A 3A8YA 3CJAA 4MLHA 2WUSA 3CETA 4H03B 2CGLA 4WQ5A 3H6EA 4MO4A 4BVPA 4BQZA 3H45C 3VEXA 1GLJO 3QBWA 4LC9B 2PBDA 5KQ8A 1NGDA 1NGBA 3UKRB 4EHTA 5ADXH 4B1UB 5AQQA 5AZJA 4XH4A 1NGCA 2A42A 3ZEUA 4CZIA 4C23A 5I9EB 4BR0A 2P9IB 3IUCA 2HF4A 3A5OC 3WXIA 4QS9A 4BRGA 3G25A 2AA4A 2I7PA 3VEZA 3U4LA 4CZJA 3MN7A 5JMVA 4DHYA 3CJBA 4H5RA 2E2NA 3UB5A 3SJHA 5JLFA 5AQTA 2P9KA 4PL8A 1QHAA 1S22A 3VEOA 4CBWA 4BR4A 2FXUA 4FWOA 3EN9A 3MN5A 4GNIA 1T44A 5AQGA 3WQUA 3QB0A 5EX5A 2FSNA 3GE1A 5AQLA 1JCFA 5KPRA 3CERA 4BREA 2GEMA 4JHDA 3U9DA 3FZKA 5E84A 3CQYA 4A2AA 4BRDA 1R59O
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3AO1A 4BGBA 2E3GA 3L8BA 3UKUB 4CJUA 2LY6A 4MDAA 1NRBA 4CF2A 5E26A 1MR4A 2XY6A 1Y97A 4QCLA 1YVUA 2QXFA 3MWPA 4X66K 1KRPA 4XEIA 4RW6A 3CD6N 1LQQA 4DQIA 3KTQA 5F0XA 1HMVA 4BDYA 5SZTA 2FC0A 3MN9A 5EOYA 4O55A 4DFJA 1EQYA 2IGIA 5M1KA 4BC4A 1ZVGA 4EAHD 3TTFA 3CFPA 2OTJN 1VSKA 4ILGB 1IV0A 1K73O 3HK2A 1NBWA 1RTHA 2PYLA 1VQ6N 1TL3A 4FLZA 4AF1A 3HM9A 1IG8A 1ASWA 3L6QA 3QEXA 3FZHA 3AVJA 4M3TA 4LF4K 2HBJA 4DR1K 2FLOA 2J4RA 4GMJB 5FPEA 4CEZA 1BHLA 4OPHA 2QK9A 1I94K 1KFDA 3D2FB 3AVLA 1FK9A 1GLCG 3ALYA 1R0AA 4GW6A 2BE2A 2BGGA 3L0QA 4JS4A 4CK1A 2QW9A 1N6QA 2Q97A 1OH7A 1JZAA 2K35A 2KFNA 3NGZA 3HOTA 2HBKA 2NLXA 4YDUA 3C7NB 3P4IA 3OYGA 1TGOA 1CZ9A 3CPEA 1YT3A 3ATUA 2OZSA 3RWUA 3KC6A 1S6PA 4JI7K 4I9QA 5J2MA 3PLAA 3L2VA 1VSDA 1RT6A 2HHWA 4LH4A 1GLDG 2ASMA 4OKKA 1B7DA 3P31A 1BI4B 1HQEA 4DSEA 1S3XA 3LDNA 3VQEA 3EYZA 4B9NA 3IG1A 4DS5A 4L8RB 4FWLA 1LAVA 3FZLA 2LY5A 3E7UX 1HJOA 2QWMA 4KKOA 2BUPA 4AB0A 2F96A 1U48A 3DXMA 3CIPA 3HVTA 4J8FA 4BC3A 1RTDA 4GV3A 5I42A 3FR0A 4A57A 3VQ4A 3NVMA 4B1YB 3WXJA 4E7IA 1NE5A 3U3GA 4DTXA 3ULEA 4K43A 3KKRA 4YOXA 1C1CA 4WYBA 4N5SA 1VAZA 2QTDA 4DR7K 3GKUA 1TYQB 3NDKA 3NF9A 4FLUA 1SNBA 3W0LA 5FPMA 4FJ7A 3QNNA 1D8YA 4C8KA 2O8FB 4JEPA 4E1JA 1NMDA 2DFFA 3EZWA 1GOCA 1VQNN 2O8DA 2ZD1A 5BRHA 2ATBA 3UKRA 5M1FA 4F3OA 2N2QA 5TKWA 2KYQA 1KXPA 3BZCA 2GBZA 3SV4A 1C0UA 4JD2B 1D4XA 3SUNA 3LDSA 4FO0A 3UIQA 3MCAB 3OHRA 2G8UA 1SS6A 2Q2RA 4UAFE 4DR2K 4X62K 5AQJA 1Z25A 4H5NA 1BIUA 4CJSA 2HOEA 3DWLA 1HNXK 4AM7A 2YKNA 3OYNA 2P9PB 4KHNA 1BIZA 2I5JA 2YNIA 4H0XB 3K0SA 3VGKA 3A5LC 3SQ2A 1SL0A 1HX1A 3RVCA 4RWTA 1MA9B 2YHWA 3ZX2A 2GELA 3KK3A 1NMNA 2KBKA 1J54A 2CGKA 3ZCMA 2KZMA 4BRQA 1BDGA 1DTQA 5K14A 4IG3A 4O5BA 4RTFD 3E66A 3HPOA 4WQ4C 4FM2A 2G8KA 3JSMA 3TWHA 1LQHA 4FPAA 1XC9A 1XHXA 3ZEUB 4A59A 1BOTO 2DTUA 1X3MA 3TAGA 1L5UA 1K8KB 2YIOA 3KHYA 4CFDA 4H8KA 3AY9A 1B9DA 4FXDA 2E2PA 1RBVA 3H46O 2ZF5O 1C55A 2A3ZA 2YX6A 4CJTA 2NY9X 5GINA 2O8BA 4IDHA 3ZSOA 3WQTA 3K5NA 1QSLA 1TKTA 5GADP 3BUZB 2ASOA 2G8FA 4LH5A 5HRNA 4W5OA 5EU7A 3ASMA 2PFUA 4TSXA 2A41A 3WXKA 2OA8A 4FYDA 4CF1A 5M1OA 4CFCA 4IJNA 4H0OA 1U04A 4PKIA 4ISFA 1S1TA 3GG4A 3RSEB 4KTZA 1WSJA 3K9KA 1YVNA 1XI1A 4FVMA 5AZIA 4OPJA 3D7EO 4A5AA 2HVHA 1J9AA 2NRXA 3LAKA 3SNNA 1DT9A 4Q5VA 1TAUA 1GPSA 4DS4A 3DLRA 1NJYA 4KV8A 3BY5A 2Q0RA 1D9DA 1KAZA 5CZ2A 3JAMO 3J80O 3OYAA 5I3UA 3ATVA 4K42A 2P9UA 4IG0A 4ISGA 4AEIA 3K59A 1ILYA 1B92A 2ZGYA 1W0HA 3EL2A 5TKYA 2ZGZA 3TR8A 1SL2A 4CBXA 1HNVA 5CZ1A 2UUAK 3BEXA 3SQ1A 1SKWA 4H5WA 2HNDA 3R9PA 2A40A 5AQWA 2OYQA 3LALA 2FF3B 3EO3A 3BK3C 1WSGA 1WSEA 3E9PA 2VCPA 3SI6A 3L2RA 4FK2A 1JLCA 1NWKA 3CQ8A 4FWMA 2HHUA 1I2UA 4DQPA 1NJWA 5KPZA 1UAXA 3PIPL 1LQIA 1JKZA 3VQBA 5C0YA 4LD0A 4KHYA 3ITHA 2JDQD 4KHUA 5BPNA 4DR4K 4YOVA 1AHOA 2XY5A 1YJWN 4PKGA 4BR7A 4DQRA 1I39A 3OYFA 4Z4IA 5LMUK 5FRNA 1IKWA 5AFUH 3TTCA 5KTQA 1NK4A 2EWSA 3ZX3A 4BRKA 3D45A 5KRTA 1QZ5A 4BRNA 2MZ0A 4KHSA 1ICAA 1VSMA 3QDKA 2HSTA 3DXKA 3J7ZO 1T3VA 1WSIA 4B9VA 1A5VA 4DF4A 4WFBL 1C0GA 1JCEA 2E20A 4CW7B 3J7AP 1RDWX 1S5JA 1KVBA 4HHFA 4CERA 4DKWA 2LKBA 4B1XB 1ZXOA 1YITN 1HNZK 3A5NC 3SAHA 4XIUA 3DXMB 4DFPA 2Q31A 2LT8A 3AA5X 2UXCK 3EKUA 4EFHA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3AO1 A;  4BGB A;  2E3G A;  3L8B A;  3UKU B;  4CJU A;  2LY6 A;  4MDA A;  1NRB A;  4CF2 A;  5E26 A;  1MR4 A;  2XY6 A;  1Y97 A;  4QCL A;  1YVU A;  2QXF A;  3MWP A;  4X66 K;  1KRP A;  4XEI A;  4RW6 A;  3CD6 N;  1LQQ A;  4DQI A;  3KTQ A;  5F0X A;  1HMV A;  4BDY A;  5SZT A;  2FC0 A;  3MN9 A;  5EOY A;  4O55 A;  4DFJ A;  1EQY A;  2IGI A;  5M1K A;  4BC4 A;  1ZVG A;  4EAH D;  3TTF A;  3CFP A;  2OTJ N;  1VSK A;  4ILG B;  1IV0 A;  1K73 O;  3HK2 A;  1NBW A;  1RTH A;  2PYL A;  1VQ6 N;  1TL3 A;  4FLZ A;  4AF1 A;  3HM9 A;  1IG8 A;  1ASW A;  3L6Q A;  3QEX A;  3FZH A;  3AVJ A;  4M3T A;  4LF4 K;  2HBJ A;  4DR1 K;  2FLO A;  2J4R A;  4GMJ B;  5FPE A;  4CEZ A;  1BHL A;  4OPH A;  2QK9 A;  1I94 K;  1KFD A;  3D2F B;  3AVL A;  1FK9 A;  1GLC G;  3ALY A;  1R0A A;  4GW6 A;  2BE2 A;  2BGG A;  3L0Q A;  4JS4 A;  4CK1 A;  2QW9 A;  1N6Q A;  2Q97 A;  1OH7 A;  1JZA A;  2K35 A;  2KFN A;  3NGZ A;  3HOT A;  2HBK A;  2NLX A;  4YDU A;  3C7N B;  3P4I A;  3OYG A;  1TGO A;  1CZ9 A;  3CPE A;  1YT3 A;  3ATU A;  2OZS A;  3RWU A;  3KC6 A; 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