5BPMA

Crystal structure of unhydrolyzed atp bound human hsp70 nbd double mutant e268q+r272k.
Total Genus 125
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
125
sequence length
378
structure length
378
Chain Sequence
AAAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVALNPQNTVFDAKRLIGRKFGDPVVQSDMKHWPFQVINDGDKPKVQVSYKGETKAFYPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDRTGKGERNVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVNHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACQRAKKTLSSSTQASLEIDSLFEGIDFYTSITRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDLVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Nucleotide binding to variants of the HSP70-NBD.
rcsb
molecule tags Hydrolase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Heat shock 70 kDa protein 1A
total genus 125
structure length 378
sequence length 378
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-05-28
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5bpmA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5bpmA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5bpmA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5bpmA04
3QBWA 1X9JA 3WXJA 5AQSA 4BRHA 5JICA 4XEIA 1JCFA 3C7NB 5E84A 3R6MA 3VEVA 4BG8A 3F9MA 4BRNA 4BR2A 1NGIA 5JLHA 1K8KA 3CJAA 3UB5A 2P9PA 3DAWA 3BP8A 5TKYA 1Q18A 2CGLA 3VPZA 5FPMA 2HF3A 3R9PA 4I6MB 3HZ6A 3ENHA 2ZWHA 5AZJB 3H3OB 3JS6A 1NM1A 1G99A 3O1WA 1RDWX 2PBDA 3FZMA 5F1XA 3KHYA 4FSVA 3GOIA 2A6AA 3BF3A 3J8AA 4B1YB 5EX5A 5AZIA 4BR0A 1JCGA 1U6ZA 2J4RA 5I9EB 3MN6A 2KHOA 3A0IX 3IFRA 1ZXOA 3WEEB 4JAXA 4IZ9A 1BA0A 2IVOA 3D2FA 1SAZA 2E1ZA 3EO3A 1RGIA 2IIRA 4BR9A 1NGEA 3A5LC 1BWFO 2DPNA 3VETA 3ATVA 1GLCG 4ISFA 3O5BA 5AQWA 3O1BA 4WQ5A 1BOTO 3UKUB 1LOTB 1HKBA 4JHDA 4GNIA 2P9NA 2P9UB 5AR0A 1HKCA 4YDUA 3L4IA 2NZTA 3A5NC 3ULEB 1BA1A 4BC2A 2Q0RA 1GLEG 1EQYA 1S3XA 2A3ZA 3CI5A 4BVOA 2GWKA 3KZBA 3D2EA 1NGGA 4H0TB 3LM2A 4BQLA 3C7NA 3WXIA 1QZ5A 1D4XA 2EWSA 3MDQA 2FF6A 5BREA 1Z6RA 4KBOA 2VWBA 3MN5A 5BPLA 2CGJA 1IJJA 3CIPA 3SMPA 5BRFA 2ZGYA 3ZX0A 4BRFA 3VEXA 4EHTA 2ASMA 3FE1A 4FWSA 4FWMA 3VGMA 3WXLA 1ZBSA 4I6MA 1Y64A 4BRIA 3U8XA 2VCPA 4H03B 5KPTA 3HBTA 1NMDA 3SJHA 3FZFA 3CQYA 3TU5A 3VF2A 3FZKA 3ATUA 3U4LA 4CZJA 4WYBA 3GL1A 3DXKB 1ATSA 4FPAA 4BQZA 2A42A 4MO5A 3LDNA 4K25A 2YJEA 4WQ4C 3LDLA 1GLAG 5KQ8A 4CZGA 3QICA 4EAHD 3R8EA 3O6WA 4H5TA 4CD3A 3FFKB 2V7YA 2QWOA 1MDUB 3SLCA 3GDQA 2P9LB 2YHWA 1HJOA 1ZC6A 4H0XB 1BO5O 2FXUA 2Q97A 4FL9A 2UYTA 3O8MA 3CERA 4FPBA 5KQDA 1SQKA 1WUAA 4A2BA 3UKUA 1BG3A 2QWLA 4CZFA 1HUXA 2QW9A 3G25A 4H5VA 4BRGA 3ZX2A 4BRCA 1DKGD 1HPMA 4BREA 3ULEA 4JD2B 5F0XA 2V52B 2FLOA 4CZKA 2FSNA 2CGKA 2V51B 1T6CA 4ISEA 4FWPA 4BC4A 3QBXA 1RFQA 5BRDA 3HTVA 3H1QA 3VF6A 2HF4A 3B8AX 3RSEB 1BDGA 3H46O 1QQNA 3M3ZA 2QWRA 5BN9A 2E1YA 5AQIA 3VEYA 4PL8A 4BRMA 1GLLO 5CE3A 1T44A 4FWKA 4O5FA 1YVNA 3O80A 3VF4A 3ZEUB 2CH5A 4H5WA 1BUPA 2W41A 2H3GX 4FWRA 3QMLA 3H1VX 4BRQA 4B1WB 4FWQA 4J8FA 1TUUA 4BR7A 3LDOA 2D0PA 4BR5A 3EL2A 4XH4A 5AQXA 3EN9A 4DCHA 2HOEA 1J6ZA 5FPEA 1NBWA 2GEMA 3LL3A 1GLJO 3DXKA 4RCHA 3AY9A 1SZ2A 3GG4A 4FO0A 3VENA 2A40A 4XH1A 3CETA 2E2PA 4K42A 1KAYA 4GY2B 4IXCA 4CBWA 3CJCA 3MMVA 5AQNA 4Z94A 1YUWA 3L6QA 4EFHA 3DXMA 1XC3A 1NGAA 1WOQA 3WUHA 1NGDA 3ID8A 2P9LA 3HSCA 4L3QA 4PKGA 3QFPA 4QS9A 3M1FA 1X3NA 3BUZB 2ZGZA 3IDHA 1NGJA 4Y0WA 3A5MC 4BRDA 1U2VB 5EY4A 4A2AA 3O08A 1E4GT 2P9IB 2NLXA 1HX1A 2IVNA 5AQZA 3LM9A 3WQUA 4JD2A 3DWLA 4CZEA 4DB3A 1NGBA 5AFUH 3TPQA 4HTLA 3A5OC 5EVZA 5AZJA 2E2OA 3AAQA 4M7YA 3VGLA 4MLEA 1LCUA 1NGHA 2CH6A 1QZ6A 1GLFO 2PAVA 4NB4A 4RTFD 5AQLA 3RSEA 3M6GA 3ZETB 4BROA 5AQMA 2ASPA 1TYQB 5LJVA 4IWVA 4M7XA 3VESA 3EKUA 2E20A 1V4SA 2E2QA 4O8KA 2A5XA 5ADXH 2V7ZA 3ZEUA 5AQOA 3JXUA 1Z05A 3FLCO 5AQFA 5AFUA 5FPNA 2D4WA 3WEEA 2BTFA 3FGUA 3AAPA 2E8AA 3MN7A 2P9KB 3FZHA 2YI1A 2ASOA 1E4FT 3A8YA 2FSKA 4DQ8A 1S22A 3GBTA 4BC5A 4PKHA 4NO7A 3U9ZA 3CHWA 3QFUA 4FOEA 4BRPA 4H5NA 4B1ZA 1CZAN 4CD1A 2F9TA 3AARA 4A62A 4BRAA 4BC3A 5E26A 3CJ7A 2P9NB 3EZWA 5FPDA 4K43A 5ADXA 2P9UA 3KVGA 1MWMA 3IMXA 5LJWA 4M63C 4B9QA 5JLFA 5AQYA 1XQSC 2P9SB 3BF1A 3W0LA 5B8HA 3SK3A 5JMVA 4H0VB 3UE5A 2YHYA 3LDPA 1QQMA 4MLHA 1KXPA 1T6DA 4F9OA 4H0PA 3W3DA 4AM7A 2NRHA 3U9DA 4CZHA 5AQPA 4JN4A 1U2VA 4WQ5C 4QS7A 4CZMA 2E2NA 2GELA 2I7NA 3MK6A 4WQ4A 2QWQA 2P9IA 4IJNA 3CJBA 2YCHA 5BN8A 4YDUC 5AQHA 3UKRB 1OKJA 4H5RA 5AQRA 1ESVA 1H1VA 2HMPA 2Q36A 3MN9A 5BPMA 4JNEA 3VEOA 3IUCA 5BRHA 4CJ7A 3ZETA 1NWKA 3FR0A 4LC9B 5KPRA 2OANA 3CJ1A 4IJAA 1TYQA 3SMSA 3ENOA 4EIAA 1YXQA 4XH5A 4BVPA 2AA4A 2E88A 3P4IA 1GLDG 3H3NO 1ATNA 2QXLA 1QQOA 1TUYA 3QDKA 2W40A 2P9KA 4MO4A 3HI0A 2F9WA 1IG8A 4BRLA 5AQUA 4EHUA 2VYPA 4FWLA 3VEWA 2AP1A 5AQVA 2QM1A 4FWOA 3QB0A 4E1JA 5BPNA 3WQTA 1JCEA 4FWNA 4CBXA 3WT0A 2GTDA 1XUPO 2Q1NA 3ZX3A 4C23A 2WUSA 1K8KB 3FZLA 2P9PB 2QWPA 3CQXA 5AQKA 2GWJA 2Q2RA 4A61A 3WXKA 1C0FA 1HLUA 2FF3B 3S41A 1HKGA 1P8ZA 5BR9A 1NGFA 1R59O 3L0QA 4CZIA 2P9SA 3OHRA 1C0GA 5EXWA 2BUPA 4CZLA 3H45C 3VOVA 2D0OA 2QWMA 3C0BA 4PKIA 3HM8A 4BR4A 4FOIA 3H6EA 2ZF5O 1X3MA 3CJ9A 3GE1A 5AZIB 2FSJA 4DHYA 5KPZA 4CI6A 2Q31A 2I7PA 1NGCA 2IVPA 5F2RA 3LDQA 2YHXA 1V4TA 1NLVA 3UKRA 4PL7A 4BRKA 3O4WA 1QHAA 3MCPA 4H0OA 4AM6A 2GUPA 4ISGA 4K41A 4BGBA 4HWIA 3D2FB 4B1VA 5ELZA 1MA9B 3I33A 1DGKN 2Q0UA 1KAZA 4QS8A 3VEZA 4RWTA 4B1XB 3VERA 5AQTA 4IO8A 1ATRA 5AQGA 3BEXA 1DEJA 2ITMA 4CBUA 4BGAA 3VGKA 1BU6O 1GLBG 5AQJA 4JHDB 1YAGA 2A41A 5LY3A 1MWKA 3I8BA 4B1UB 3EKSA 3D7EO 4BG9A 1KAXA 3DXMB 2YJFA 2QWNA 2D1KA 4H0YB 5EOYA 3DJCA 3D2EB 5AQQA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1ZBLA 1X9JA 3WXJA 1NKBA 4XEIA 3C7NB 2F8SA 5E84A 3VQCA 4C8MA 1C0UA 1YF5L 3KOXA 4JLHA 2LI7A 3ASMA 1Q18A 4A5AA 4ILHA 3ULDA 3BDPA 1BQMA 3ZSYA 3AVIA 4RW8A 4CGJA 4CJVA 2O8DB 1NK9A 3H3OB 2WC9A 3SAGA 3FZMA 1IKWA 1ZU3A 1SNBA 3OS1A 2IGIA 2NRTA 3L2RA 1JZBA 3MEEA 5D3GA 3NAEA 3QINA 5AZIA 3HM9A 2J4RA 4CJRA 1T03A 4AHRA 4IFYA 1J5OA 3MN6A 2HHIA 2LN8A 2E6LA 1NE5A 2VQEK 5SZTA 4QCLA 1NOZA 1S5JA 2O8EB 3LAMA 4I9LA 3PX4A 3ZT1A 1VQ8N 1SAZA 1TKTA 1TI5A 2IIRA 4JS4A 4BR9A 1NGEA 5E41A 4FLTA 2O4GA 3ATVA 4DG1A 2W42A 5AQWA 3O1BA 2YIPA 1PTXA 3E01A 1I3AA 1VSHA 5HBMA 1ZVGA 4PA1A 3PSIA 3PY8A 1QVFM 1U45A 1FXXA 3ULEB 1BA1A 1JLAA 4B8CA 1S3XA 4F8RA 4GVEA 2HBKA 3C6UA 3L3VA 3F9KA 2YNIA 1HNXK 4BQLA 3C7NA 2RKIA 1L3UA 1QZ5A 4CJWA 1JL1A 2FF6A 2DFEA 3NF8A 4DSEA 3LANA 5BPLA 3CIPA 3K57A 3PX6A 4HUGA 2KQ2A 4WF9L 2BANA 4FWMA 3WXLA 1ZBSA 3L8BA 2VQFK 1Y64A 2G2KA 2YC1C 2O8DA 4Z4EA 2X6NA 2JDQD 5KPTA 1RT6A 2ATQA 3TU5A 3VF2A 3LWMA 3G10A 4G1QA 1XC9A 2E2FA 2UUCK 1N32K 3GL1A 1C6VA 4CHNA 4DR6K 5JVGL 3TAGA 1C56A 3LDNA 4WQ4C 2YJEA 1EP4A 3LDLA 5LMNK 5KQ8A 1J53A 3QICA 4HHTA 4CJKA 2O8EA 4H5TA 3HVTA 3KHWA 2QWOA 4EP4A 3CFPA 1MDUB 2GBZA 4N56A 3EEQA 1T7AA 1BO5O 2Q97A 4DWIA 3CERA 1ITGA 1QSSA 1SQKA 2QXFA 1UAXA 1VRTA 4M3XA 3KOYA 3K5LA 4KH5A 2GUIA 3CPEA 1DKGD 3K0SA 1HPMA 4FJHA 3ULEA 3SV3A 1OH6A 2QA4N 2FSNA 3SUPA 3LP0A 3SV4A 2YNFA 1RFQA 3F5TA 4LF5K 2I61A 3SNNA 4MFBA 3M5RA 2X6SA 4DS5A 3H46O 1YIJN 3THWB 4B9UA 4FJGA 1QQNA 1KSPA 2G8WA 2MBKA 3VEYA 4BRMA 4KHNA 4PL8A 1DTTA 1IH7A 1BGXT 1JLBA 3O80A 2IOCA 3ZEUB 3SBGA 4H5WA 1BUPA 4GV6A 2E4LA 4JRQA 4EZ6A 3JSMA 3CW4A 1TKZA 1TUUA 4M3ZA 3V9XA 4HCCA 5I42A 2RE2A 3EN9A 4E89A 1J6ZA 3VA0A 1LAWA 2GEMA 1GLJO 4BE0A 1S6QA 3RMAA 4RCHA 2KBHA 2PFUA 3AY9A 1SZ2A 3GG4A 4O8UA 2I5JA 4FO0A 1RTHA 2E3FA 3C6TA 2VWJA 3E1YA 3MMVA 5AQNA 2KBJA 1T7PA 1YUWA 4EFHA 4NXNK 5KGXA 3SJJA 2P5GA 3MX5A 3HSCA 4QS9A 3M1FA 3OTOK 4DV3K 3HVRA 1WB9A 2ZGZA 1NGJA 4Y0WA 4AB0A 1U2VB 4JRPA 5EY4A 4GV3A 1E4GT 4CFDA 2RF2A 4WFAL 2YEOA 1HX1A 3O9RA 2HB5A 2F4VK 4JI8K 2ZM6K 5EVZA 5AZJA 2E2OA 3AAQA 4KTWA 4DTMA 1JLEA 1QZ6A 1ZVEA 1C0TA 4NLBA 3SYZA 1KRPA 5AQLA 4GV9A 3T1AA 5KGWA 2HHWA 4ILJA 3THWA 4DUZK 4CF2A 2ASPA 2KYQA 3RR8A 4MDAA 1XMOK 3HL8A 4M7XA 1ZFUA 4W5NA 4U7BA 1CXQA 1RT5A 2E2QA 4O8KA 1BK8A 2A5XA 2V7ZA 3ZEUA 5AQOA 2KGQA 4DV1K 3FLCO 5AFUA 3HPHA 2ZE2A 3WEEA 2IS3A 2E8AA 3AAPA 2P1JA 4L8RB 2ASOA 2B5JA 1S1VA 1NJZA 3GBTA 1NU0A 3D6RA 4OPJA 3QFUA 4OKEA 4FJ8A 4JS5A 1NKCA 4IEEA 4J2AA 2F9TA 4BRAA 4LD0A 1Z26A 4YOTA 3M8RA 3VN5A 1RT7A 3WNEA 4K43A 1XWLA 1DTQA 2P9UA 3BK3C 2KPYA 5HOOA 1ZYVA 3D0PA 3HXMA 5AQYA 4OPKA 4DTPA 1VQON 2OZSA 2C1GA 1RDAA 4IBNA 4O55A 4DFPA 1N5YA 1KXPA 1T6DA 4F9OA 4H0PA 1WWNA 2E5LK 3U9DA 4CZHA 3OYHA 4JN4A 4DQIA 1U2VA 4QS7A 3IAYA 3CPWM 2GELA 1VSEA 3TR8A 3VMFB 3ZSRA 3WNFA 5AQRA 2C1IA 3KJVA 2Y1IA 4KI4A 3I8DA 1Q9YA 1L3SA 3IUCA 1EWRA 3TAMA 4CJ7A 4DMNA 5GAGP 3SF4D 1UA0A 4OJRA 1IBLK 2G8VA 3KKSA 1HMVA 3CMEN 1ILYA 4QOZB 4CJ3A 4LC9B 2UXBK 1BQNA 3CJ1A 3SAFA 4IJAA 3SMSA 1VSFA 3O3GA 3KD1E 1YXQA 2HHQA 5GADP 5FROA 1RDUA 3KLIA 1ATNA 5DMRA 1QQOA 1TUYA 1NH5A 2D56A 2EHGA 2W40A 3HSTB 3HI0A 4NCGA 3ZLJA 1NJWA 4H4MA 1HYSA 3K2PA 3HPOA 2D5RA 2A7TA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1ZBL A;  1X9J A;  3WXJ A;  1NKB A;  4XEI A;  3C7N B;  2F8S A;  5E84 A;  3VQC A;  4C8M A;  1C0U A;  1YF5 L;  3KOX A;  4JLH A;  2LI7 A;  3ASM A;  1Q18 A;  4A5A A;  4ILH A;  3ULD A;  3BDP A;  1BQM A;  3ZSY A;  3AVI A;  4RW8 A;  4CGJ A;  4CJV A;  2O8D B;  1NK9 A;  3H3O B;  2WC9 A;  3SAG A;  3FZM A;  1IKW A;  1ZU3 A;  1SNB A;  3OS1 A;  2IGI A;  2NRT A;  3L2R A;  1JZB A;  3MEE A;  5D3G A;  3NAE A;  3QIN A;  5AZI A;  3HM9 A;  2J4R A;  4CJR A;  1T03 A;  4AHR A;  4IFY A;  1J5O A;  3MN6 A;  2HHI A;  2LN8 A;  2E6L A;  1NE5 A;  2VQE K;  5SZT A;  4QCL A;  1NOZ A;  1S5J A;  2O8E B;  3LAM A;  4I9L A;  3PX4 A;  3ZT1 A;  1VQ8 N;  1SAZ A;  1TKT A;  1TI5 A;  2IIR A;  4JS4 A;  4BR9 A;  1NGE A;  5E41 A;  4FLT A;  2O4G A;  3ATV A;  4DG1 A;  2W42 A;  5AQW A;  3O1B A;  2YIP A;  1PTX A;  3E01 A;  1I3A A;  1VSH A;  5HBM A;  1ZVG A;  4PA1 A;  3PSI A;  3PY8 A;  1QVF M;  1U45 A;  1FXX A;  3ULE B;  1BA1 A;  1JLA A;  4B8C A;  1S3X A;  4F8R A;  4GVE A;  2HBK A;  3C6U A;  3L3V A;  3F9K A;  2YNI A;  1HNX K;  4BQL A;  3C7N A; 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