5BPMA

Crystal structure of unhydrolyzed atp bound human hsp70 nbd double mutant e268q+r272k.
Total Genus 125
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
125
sequence length
378
structure length
378
Chain Sequence
AAAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVALNPQNTVFDAKRLIGRKFGDPVVQSDMKHWPFQVINDGDKPKVQVSYKGETKAFYPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDRTGKGERNVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVNHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACQRAKKTLSSSTQASLEIDSLFEGIDFYTSITRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDLVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Heat shock 70 kDa protein 1A
publication title Nucleotide binding to variants of the HSP70-NBD.
rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 125
structure length 378
sequence length 378
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-05-28
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5bpmA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5bpmA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5bpmA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5bpmA04
2QWNA 1QZ5A 4I6MB 4BGAA 2D0PA 3DWLA 2YJFA 1XQSC 3ZEUB 2EWSA 1V4SA 2QW9A 4K42A 1ATNA 2P9SA 3BP8A 3UKUB 1YVNA 3UKUA 1SQKA 3VEXA 3ZX3A 2FSKA 2FF3B 4DHYA 2QM1A 3FZMA 4H0YB 2OANA 1HKGA 3M1FA 3GG4A 3HTVA 4H5TA 3U4LA 3A0IX 2YHXA 5FPNA 2P9KB 1IJJA 3VEYA 2P9KA 3VGKA 2P9UA 3WQUA 3VGLA 1NGEA 5F2RA 2NLXA 3A5LC 3ENOA 4BROA 2QWLA 4BRNA 3D2FB 4F9OA 4CZGA 4XH5A 5F0XA 1K8KA 1V4TA 2F9TA 2NRHA 5CE3A 3C7NA 4DB3A 1TYQB 5AQHA 1H1VA 1TYQA 3R6MA 5AZJA 1GLJO 1IG8A 4GNIA 4IJNA 1R59O 1SZ2A 1U6ZA 4BGBA 2HF4A 4CZIA 3C0BA 4B1XB 2E1YA 2GUPA 3D2EB 3A8YA 2V52B 3D2EA 2E1ZA 3CJ9A 4ISFA 1NGHA 4FWSA 3FZFA 1KAZA 3O8MA 1MWMA 2BTFA 3UKRA 1NGGA 4MO5A 5BRDA 2P9LB 3LL3A 4FOEA 5AQFA 4JNEA 5AQTA 4IJAA 1U2VA 4NB4A 3FLCO 2GTDA 1MDUB 1BA1A 3WT0A 2IVOA 4BR0A 4HTLA 4FSVA 4FWMA 3LDNA 3WXIA 3WUHA 3TPQA 1HX1A 4B1VA 5BN9A 2GWKA 4H0PA 4H5RA 3J8AA 3MN9A 3DAWA 4PKHA 5TKYA 1XC3A 4EHTA 4MO4A 3OHRA 2QWPA 1ESVA 3HZ6A 3CJ7A 2VCPA 5BRHA 1QQMA 3ATVA 5EVZA 1WOQA 2A6AA 3HSCA 2HF3A 3CQYA 5KPTA 5AQJA 1ATSA 1HUXA 1MA9B 1WUAA 1JCGA 4A2BA 3CETA 3LM9A 1BOTO 2NZTA 2E2PA 1T6DA 2ZGYA 2BUPA 3WXKA 1BU6O 1P8ZA 3CJAA 1D4XA 1ZC6A 3H1QA 2ZWHA 1ZXOA 4BG8A 3AAPA 4IWVA 4FL9A 3CI5A 3GBTA 1Y64A 2F9WA 1GLDG 1Q18A 2D0OA 1NBWA 3WQTA 3EO3A 3TU5A 1X3MA 1YUWA 1BDGA 3EKUA 4BC2A 2I7PA 4WYBA 1E4FT 3GL1A 3HI0A 1GLFO 1KAYA 2IVNA 3ID8A 2FSNA 2GEMA 3IUCA 4BRQA 5AQIA 1TUUA 1TUYA 5ELZA 2YCHA 4I6MA 3O1BA 1DGKN 3ATUA 3WEEB 3VOVA 3WEEA 5AQWA 5EX5A 2E20A 1NWKA 3ZEUA 2QXLA 4CD3A 4M63C 5AQUA 3WXJA 4BRCA 1NLVA 3QDKA 2Q97A 3P4IA 4CBXA 1NGBA 4CZJA 4CD1A 4BRPA 2PBDA 3VEZA 1S3XA 2P9NB 4PL8A 4FOIA 2CH5A 5AQXA 3VEWA 3VETA 3U9ZA 4GY2B 4JAXA 4Y0WA 4EFHA 4BRIA 2W41A 3DJCA 2DPNA 2V51B 3MCPA 1KAXA 1X3NA 4BRFA 2QWOA 3D2FA 5AQLA 1GLCG 4CZLA 4FPAA 4BRMA 3LDPA 5ADXH 3IMXA 5KQDA 4M7XA 3CERA 3A5MC 3GOIA 2J4RA 3DXKB 1HLUA 3GE1A 3QB0A 1NMDA 5KQ8A 3M3ZA 1NGIA 2FXUA 4H0TB 5JLHA 2CGKA 3H3NO 3CJBA 3FFKB 3SLCA 2Q0UA 4K25A 1QQNA 2P9PB 2P9PA 2P9LA 4XH4A 1S22A 5I9EB 5AQSA 1QQOA 1SAZA 3VEOA 5BPNA 1DEJA 4MLHA 1NGAA 2YJEA 3EL2A 3L0QA 3BF1A 3VEVA 3AARA 1BWFO 2V7YA 4KBOA 3ULEB 3VESA 4C23A 5JLFA 1QZ6A 4L3QA 1C0FA 4RWTA 3VERA 2E2OA 2VWBA 3I33A 3L6QA 2CH6A 4BRAA 3W0LA 5AQQA 2H3GX 2HMPA 3L4IA 3HM8A 4M7YA 5AQPA 4B1ZA 5EXWA 3BF3A 4E1JA 3CJCA 1HKBA 3QBXA 3FE1A 2YI1A 2ITMA 1OKJA 5BRFA 3KZBA 4H0OA 5FPMA 5E26A 1BA0A 5BPLA 5LY3A 3QFUA 1NM1A 4FWRA 4IXCA 3KHYA 3WXLA 4BC4A 4BR9A 2AP1A 3CIPA 4BRHA 1NGFA 3UB5A 4XEIA 2Q1NA 3O6WA 5BPMA 3AY9A 4CZFA 2P9IB 3HBTA 5LJWA 1LCUA 3D7EO 3ZETB 3IDHA 4CZKA 5AFUH 4CI6A 1GLBG 3H3OB 4WQ4C 4JN4A 4CZEA 4BR5A 4EAHD 4BC3A 3JXUA 1BO5O 4WQ4A 3U9DA 3VENA 3M6GA 5BREA 4QS8A 3LDOA 2YHWA 4MLEA 3ZX0A 1YXQA 3A5NC 4ISGA 4RTFD 1JCFA 5AZIB 4J8FA 4B1UB 5AQZA 3A5OC 3CHWA 4BVPA 3W3DA 1T44A 4FWPA 3MK6A 4FWQA 2HOEA 1LOTB 1MWKA 4A62A 3ENHA 2FLOA 5FPEA 5AFUA 4EIAA 4H03B 2Q0RA 2P9NA 3O1WA 5AR0A 3QICA 5BN8A 3QMLA 3H6EA 1EQYA 3SMSA 3MN7A 2E8AA 4A61A 4JD2B 3EZWA 4BRDA 4WQ5C 1DKGD 4K43A 4BC5A 3H1VX 3GDQA 1BUPA 4IO8A 2D4WA 4CZHA 3FGUA 4WQ5A 4AM6A 2P9SB 4BRLA 3O5BA 2IIRA 4FWNA 1GLLO 4FWLA 4H0VB 3O08A 3R9PA 4FPBA 5E84A 3IFRA 4ISEA 3CQXA 3O4WA 2A40A 2QWQA 1NGJA 2P9UB 2ZGZA 3MN5A 5F1XA 1HKCA 3BUZB 1YAGA 3DXKA 3I8BA 4FO0A 2UYTA 4H0XB 4IZ9A 4PKIA 2QWRA 1Z6RA 5EOYA 3R8EA 4HWIA 1RFQA 1GLEG 3LM2A 4BQLA 1K8KB 2A5XA 2GELA 1QHAA 2FSJA 5EY4A 3H46O 3S41A 4CBUA 3LDLA 3FR0A 4BQZA 3C7NB 5ADXA 1GLAG 4H5VA 1HJOA 4QS9A 1KXPA 5AZJB 4AM7A 4PKGA 2FF6A 3FZKA 2A42A 3VPZA 5AQOA 2CGJA 5KPZA 4PL7A 1X9JA 3F9MA 4XH1A 1ZBSA 4BRKA 2ASPA 3O80A 4K41A 3ULEA 4EHUA 2Q36A 3VGMA 3CJ1A 3UKRB 3VF6A 5B8HA 2E2QA 5AQNA 3FZHA 4O5FA 5FPDA 2V7ZA 4H5WA 1U2VB 3VF4A 4DQ8A 4A2AA 4CBWA 2D1KA 2YHYA 2ASMA 4BG9A 1RDWX 4YDUC 4B1WB 1CZAN 1NGCA 1T6CA 4RCHA 4B9QA 4NO7A 1E4GT 2IVPA 4YDUA 4BR4A 4BVOA 5AQKA 3KVGA 3DXMB 4FWOA 2QWMA 3DXMA 3AAQA 2GWJA 3G25A 4LC9B 3MDQA 3VF2A 3FZLA 4FWKA 4B1YB 3SK3A 1J6ZA 2WUSA 2I7NA 5JICA 4DCHA 1G99A 4JHDB 4JHDA 4BREA 2P9IA 5KPRA 3UE5A 3QBWA 3RSEB 2CGLA 3ZETA 3RSEA 3SMPA 3U8XA 3JS6A 5AQMA 5AQRA 4QS7A 2KHOA 1BG3A 1JCEA 4O8KA 4CJ7A 4Z94A 4BRGA 1XUPO 5JMVA 1Z05A 2E2NA 2W40A 5AQVA 2A3ZA 4H5NA 5AZIA 2Q2RA 5BR9A 3EKSA 5AQYA 3B8AX 2E88A 2PAVA 2AA4A 5LJVA 3H45C 3LDQA 2A41A 1ATRA 3MMVA 3EN9A 3SJHA 4BR2A 3MN6A 3QFPA 1HPMA 3BEXA 3ZX2A 4CZMA 2VYPA 5AQGA 2ZF5O 2Q31A 4BR7A 2ASOA 1RGIA 1C0GA 1NGDA 4JD2A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4BGAA 1YIJN 4IG0A 1FW6A 3SAFA 1V4SA 2OPRA 4K42A 1ATNA 4M3UA 3TARA 4ELVA 3UKUA 1SQKA 2OPQA 1ZU3A 2FF3B 5GADP 4BY9C 3SQ1A 2QM1A 4NCAA 5KRSA 1LQHA 3DRRA 3GG4A 1HYSA 2O8BA 3A0IX 4B9UA 2YHXA 5FPNA 3VEYA 1ASUA 4Z4CA 1NE5A 3VN5A 5F2RA 1CN2A 1VHXA 3ENOA 3CM5A 3OJUA 3CCEN 4BRNA 3L4QA 4ICLA 2UU9K 5JVHL 4FK4A 2F9TA 2NRHA 1BHLA 3CYMA 4KTQA 1JXEA 5CE3A 5HROA 1TYQB 5AQHA 3D45A 1IG8A 4BWJA 2BANA 4IJNA 1R59O 1U6ZA 3VQ7A 4BGBA 1LAVA 3C0BA 5KRTA 1CXQA 2GUPA 3A8YA 1T1TA 2V52B 2E1ZA 2ASCA 1KFSA 1WN7A 2KJAA 3V9ZA 5K14A 2VG7A 2KSKA 1MWMA 3UKRA 3NVKA 2LI7A 3TI0A 3PSMA 4FOEA 1LW0A 5CY4A 4DSKA 1MDUB 1BA1A 4BR0A 3OYAA 1N34K 4FSVA 3OYMA 1SS6A 4B1VA 5BN9A 2GWKA 4CF0A 3TANA 3J8AA 3DAWA 1XWLA 3DRPA 4LFCK 2XY5A 1XC3A 3C6HA 5DM7L 4AHUA 1ESVA 4B9NA 3CJ7A 4JRPA 1BMRA 1WMTA 3ATVA 5EVZA 1JLBA 5BRHA 4W5TA 1EP4A 3CQYA 1Y97A 1NK7A 1ATSA 1MA9B 1WUAA 3ALYA 1Z26A 2W6LA 3AO4A 3E66A 3CETA 5A2QO 2NZTA 3OS1A 4E7LA 4KHNA 1T6DA 2BUPA 1GOCA 2PYJA 1BU6O 4JKBA 4DUZK 4KI4A 4FVUA 2HBLA 4LSLA 3CJAA 1RCHA 3T7ZA 3CI5A 1QHTA 1HR0K 4DKWA 4CJRA 1NOZA 3AVMA 5HP1A 3THYB 4CJSA 4OPHA 3TTCA 1PX9A 3WQTA 1U47A 2NRWA 1WAFA 1NOYA 3HI0A 1Q9YA 1ZUTA 1C55A 1XNQK 2FSNA 2GEMA 3PO4A 4A5BA 3S3OA 1J53A 4CERA 1VQON 5ELZA 1TUYA 1C6VA 4I6MA 3O1BA 1DGKN 4Q5VA 4DFJA 3VMFB 3VOVA 2E20A 1RDAA 1LWEA 4OGCA 2QXLA 1XHZA 4B3OA 4ID5A 2NUBA 5AQUA 3OW2M 4KRFA 3QDKA 3QEVA 2HB5A 1NGBA 4ID1A 1VQNN 3PSIA 4CF2A 4CD1A 3DMJA 4BRPA 2O8FA 4DV6K 3V9UA 2CH5A 3RRHA 2HVHA 4JAXA 2QTDA 4EFHA 4KH5A 4N56A 1WSHA 4JI1K 3WXMB 3MCPA 1VRTA 4DV0K 4CF8A 5LMUK 3IRXA 2QWOA 3AA3A 3KK1A 3V6DA 1B9DA 1MU2A 3AVFA 3AO1A 5C10A 4B3MK 4CZLA 4I2PA 2UUBK 3P39A 4GW6A 1VNBA 4NYNA 3KTQA 4LSNA 3DXKB 1HLUA 4EP5A 4NXNK 1NMDA 3MXIA 2YNGA 1HNXK 1I94K 1N33K 4C1NK 3H3NO 3SLCA 2Y1JA 1TL3A 1VQMN 1KLNA 5EU7A 4DFMA 2KZMA 2P9PA 1BIZA 1BRZA 2E6LA 5I9EB 4DLGA 1SN1A 5BPNA 2PYLA 2YJEA 1LW2A 4JKEA 4KBOA 1JL1A 2YC1C 4JEPA 3O9RA 4JKGB 1C0FA 4OKKA 4RWTA 2ZJRL 3VERA 3SBTA 3NF9A 3VQ4A 1R0AA 2VWBA 2CH6A 4BRAA 4GVEA 3PY8A 3AGKA 2A7TA 1VSFA 3TTFA 3NH0A 2HMPA 2VWKA 4KHYA 1JZBA 4E1JA 4CFAA 1IKVA 4FM2A 3P31A 1KFDA 3DLLL 3LP3A 1BI4B 4R5PA 3OYFA 3G4SN 4Z4IA 5E26A 1BA0A 5TKWA 5BPLA 1K8AO 4FWRA 1XNRK 4IFEA 3WXLA 2F96A 4CFBA 4FJ7A 3KP1A 3THXA 3QI7A 1DTQA 2OTJN 3K9KA 2Q1NA 5BPMA 4CZFA 3RWUA 1OH8A 4KFBA 2G8VA 1TVRA 3AVGA 3HBTA 2YBRC 1LCUA 2B5JA 4KHUA 4LH5A 3IDHA 3MX2A 2GMOA 1RDBA 1GLBG 3PO5A 3KK3A 3NAEA 1OMYA 3JXUA 5KI6A 1NU0A 3SV3A 1L3VA 4WFNL 2YHWA 1YXQA 2OCEA 3A5NC 3OVNA 1JCFA 2RE2A 4RTFD 3NH1A 3CC4N 2HHQA 2W42A 2OZSA 5AQZA 1YVUA 3VQBA 3W3DA 1HNZK 2OA8A 3T69A 4FWPA 4FWQA 1EKEA 3OYHA 3VA3A 4IEIA 4EIAA 1B7DA 1IBKK 3O1WA 5AR0A 2NY8X 1S1VA 5BN8A 3SMSA 1RTHA 1NRAA 4LF9K 1KVCA 2E8AA 4A61A 4MDBA 4BRDA 4EP4A 2D4WA 3HJFA 4CZHA 3ENBA 1C56A 4BRLA 1KD1O 1U4BA 1T7AA 2E0HA 3TAMA 5CHIA 3K59A 4OVLA 4H0VB 2P5GA 4KB1A 3IKMA 4IOXA 2O8BB 3TWHA 1B3CA 1ICAA 2QWQA 3RRGA 3PX6A 4DTUA 4YOWA 1FH3A 3I55N 3EYZA 1HQUA 4DR3K 3J7YP 2QWRA 4CGHA 1C1CA 4HE7A 3L2QA 3LM2A 4B08A 4ELTA 1RT1A 2KZZA 2GELA 4V19S 4K0KK 3LDLA 1AYJA 3OYKA 1HJOA 2PZSA 1KXPA 2QA4N 4AM7A 4CGJA 2A42A 4DR5K 5LL6Z 2YKMA 3CCJN 1Q81O 4XH1A 3I8DA 3C94A 4DV7K 3KWIA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 4BGA A;  1YIJ N;  4IG0 A;  1FW6 A;  3SAF A;  1V4S A;  2OPR A;  4K42 A;  1ATN A;  4M3U A;  3TAR A;  4ELV A;  3UKU A;  1SQK A;  2OPQ A;  1ZU3 A;  2FF3 B;  5GAD P;  4BY9 C;  3SQ1 A;  2QM1 A;  4NCA A;  5KRS A;  1LQH A;  3DRR A;  3GG4 A;  1HYS A;  2O8B A;  3A0I X;  4B9U A;  2YHX A;  5FPN A;  3VEY A;  1ASU A;  4Z4C A;  1NE5 A;  3VN5 A;  5F2R A;  1CN2 A;  1VHX A;  3ENO A;  3CM5 A;  3OJU A;  3CCE N;  4BRN A;  3L4Q A;  4ICL A;  2UU9 K;  5JVH L;  4FK4 A;  2F9T A;  2NRH A;  1BHL A;  3CYM A;  4KTQ A;  1JXE A;  5CE3 A;  5HRO A;  1TYQ B;  5AQH A;  3D45 A;  1IG8 A;  4BWJ A;  2BAN A;  4IJN A;  1R59 O;  1U6Z A;  3VQ7 A;  4BGB A;  1LAV A;  3C0B A;  5KRT A;  1CXQ A;  2GUP A;  3A8Y A;  1T1T A;  2V52 B;  2E1Z A;  2ASC A;  1KFS A;  1WN7 A;  2KJA A;  3V9Z A;  5K14 A;  2VG7 A;  2KSK A;  1MWM A;  3UKR A;  3NVK A;  2LI7 A;  3TI0 A;  3PSM A;  4FOE A;  1LW0 A;  5CY4 A;  4DSK A;  1MDU B;  1BA1 A;  4BR0 A;  3OYA A;  1N34 K;  4FSV A;  3OYM A;  1SS6 A;  4B1V A;  5BN9 A;  2GWK A;  4CF0 A;  3TAN A;  3J8A A;  3DAW A;  1XWL A; 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