5BPMA

Crystal structure of unhydrolyzed atp bound human hsp70 nbd double mutant e268q+r272k.
Total Genus 125
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
125
sequence length
378
structure length
378
Chain Sequence
AAAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVALNPQNTVFDAKRLIGRKFGDPVVQSDMKHWPFQVINDGDKPKVQVSYKGETKAFYPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDRTGKGERNVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVNHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACQRAKKTLSSSTQASLEIDSLFEGIDFYTSITRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDLVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Heat shock 70 kDa protein 1A
publication title Nucleotide binding to variants of the HSP70-NBD.
rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 125
structure length 378
sequence length 378
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-05-28
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5bpmA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5bpmA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5bpmA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5bpmA04
5F2RA 3MCPA 4JN4A 3TPQA 5AZIB 1X3NA 1S22A 4CZKA 3CJ7A 4BRDA 1NGGA 1V4TA 2A42A 5F1XA 4BR0A 1KAYA 4CBUA 1NGHA 2V52B 5B8HA 5LJWA 3VF2A 1HX1A 3WT0A 4DB3A 1XUPO 1DGKN 4FPAA 4Y0WA 4BVOA 3D2EA 4CD3A 5AQXA 2QWQA 1V4SA 4FWRA 4CJ7A 4BR2A 2NLXA 2P9LB 1NGFA 4M7XA 4PKHA 2HF4A 4CBWA 4H0OA 1C0FA 1YXQA 2P9PA 1C0GA 3C0BA 1NMDA 5BRFA 2QWRA 4BGBA 3VEYA 4JHDA 4K43A 2IIRA 3C7NB 1GLAG 4WYBA 2PAVA 5AZJB 3RSEA 4BRNA 3BEXA 3BUZB 4B1XB 3OHRA 2QWLA 5AQQA 2P9SB 3ULEA 3U8XA 3ZEUB 1IJJA 4A61A 5KPTA 3JXUA 5AQFA 1ZBSA 3WXKA 1HJOA 4JD2A 3R8EA 3UKUA 3ZX2A 5JICA 3DXKA 2VCPA 2ZWHA 1OKJA 4EFHA 1MDUB 2YHXA 5AQIA 2ASMA 2CH6A 2P9IB 3IUCA 3FZMA 2YI1A 3ZX3A 3CQYA 3A5OC 3CJ9A 5JLHA 3QDKA 1P8ZA 1KAZA 4HTLA 1E4GT 2Q1NA 4IJAA 4FOEA 4M7YA 4CZLA 4B1WB 2YHYA 5E26A 2IVOA 3VEWA 1ESVA 2A41A 2D0PA 2E1YA 2OANA 4M63C 2E2QA 3UKRA 2UYTA 3SMPA 1NGEA 5BN9A 3WXIA 4DQ8A 4BC4A 3P4IA 5EVZA 3ZETA 3ID8A 4K42A 1JCEA 3WEEA 5BPNA 3ATUA 5AQVA 1LOTB 1E4FT 5AQTA 1XC3A 4QS8A 2YHWA 1U6ZA 4BRIA 1BU6O 4XEIA 3GG4A 4FOIA 2NRHA 4F9OA 5AQWA 1KAXA 5LY3A 4BRPA 1GLCG 4AM6A 2BTFA 4CZJA 3HZ6A 4CD1A 3U9ZA 5FPMA 3VETA 3H45C 5BRDA 4H0XB 5EXWA 2GTDA 1SZ2A 1YVNA 2J4RA 3JS6A 4PKGA 2A5XA 1H1VA 5E84A 1YAGA 3AAPA 2AA4A 1HKBA 5I9EB 4DCHA 3HI0A 3TU5A 4BREA 3GL1A 3B8AX 4B9QA 5ELZA 4XH4A 2ZGZA 4BR9A 5AFUH 3VF4A 4ISGA 3SK3A 3CHWA 1HUXA 2D0OA 4BC5A 2P9UA 1NGCA 4FWSA 1KXPA 1R59O 1TUYA 4A2BA 5F0XA 3M3ZA 3MN5A 1ZXOA 3WQTA 4B1YB 5BPMA 3FFKB 4IWVA 3F9MA 1U2VA 1SAZA 4BR5A 4B1VA 1HKCA 3UB5A 2QM1A 4BRCA 3AY9A 1GLEG 4IJNA 4H5WA 2FLOA 2V7YA 3L4IA 3I8BA 2H3GX 4BVPA 3WQUA 4CZMA 5KPZA 1QZ5A 3H1VX 3HM8A 5EOYA 4H0TB 3GDQA 3EKUA 4FWPA 2CGKA 2A6AA 1MWMA 3QMLA 3H6EA 2ZGYA 3O8MA 4MLEA 4L3QA 3FZFA 1GLDG 1BG3A 4FWQA 3D2FA 3ZX0A 3FGUA 4DHYA 4PL7A 2A3ZA 1NGBA 1ATNA 4PL8A 3ZEUA 4CZEA 2HF3A 2CGJA 3D2EB 2QWMA 3UE5A 5LJVA 2F9WA 3FLCO 1JCGA 1D4XA 3MN6A 5BRHA 3R6MA 3O4WA 4FWKA 4B1UB 4BRMA 4EHTA 1Z6RA 4BRFA 3O6WA 4CZHA 3G25A 1BOTO 4XH5A 2P9PB 4QS7A 4BRKA 1XQSC 3VERA 4JHDB 1WOQA 4H5NA 1IG8A 5AQYA 2GELA 4JAXA 3RSEB 3MK6A 3J8AA 2I7PA 3FR0A 4H0PA 2QWPA 2CH5A 5FPDA 3ULEB 4BG8A 2ASPA 3LM2A 3L0QA 3D7EO 4FWMA 1NM1A 3WUHA 3VEXA 2E2PA 4JD2B 4WQ4C 4FWNA 2HMPA 3A5LC 4ISEA 3UKUB 3DXMA 1NGDA 3DXKB 4BRHA 3VGKA 5AQOA 4BRAA 1EQYA 2QW9A 4BQZA 4Z94A 3LDNA 1LCUA 2YCHA 4B1ZA 2P9NA 4NO7A 4BC3A 2PBDA 3O1WA 3FZHA 2Q31A 3A5MC 4J8FA 4PKIA 3VOVA 2E8AA 2D1KA 3U9DA 2P9KA 3H3NO 3CJBA 3CERA 4BC2A 3WXLA 3VEOA 3HBTA 2GWKA 3QBXA 1BWFO 5EY4A 3GOIA 1HKGA 1T44A 4RWTA 5BN8A 2VWBA 1TYQA 2GEMA 1BUPA 4BR7A 3CIPA 3M1FA 4FPBA 3UKRB 3VPZA 4BR4A 4I6MA 3A5NC 4CZGA 3A8YA 3ZETB 3WEEB 4HWIA 3BP8A 1RFQA 5AQMA 4CZIA 4H5RA 1J6ZA 4YDUC 2WUSA 1DKGD 3O1BA 1SQKA 3SMSA 4GNIA 5AR0A 5AZIA 2EWSA 3KHYA 2VYPA 1QQNA 3BF1A 3ATVA 2FF3B 4BRQA 3SJHA 1MWKA 3HSCA 3R9PA 1NBWA 5TKYA 5AQUA 1K8KB 3MMVA 3EL2A 1BDGA 3CJ1A 3FZKA 2YJEA 3H46O 3WXJA 5AQZA 3S41A 3CI5A 4MO5A 4WQ5C 2E88A 1WUAA 1NGJA 5ADXH 2P9LA 4IXCA 5AQHA 2Q0RA 3KZBA 3U4LA 3I33A 3LDPA 3EZWA 4K41A 4KBOA 2ZF5O 2DPNA 3EN9A 2FSJA 3LM9A 1NWKA 2F9TA 3IDHA 2HOEA 5AQJA 2GUPA 4FL9A 1CZAN 3SLCA 4K25A 1T6DA 5AQKA 2AP1A 3C7NA 4H0YB 5AZJA 2P9UB 1GLBG 1QQOA 3LL3A 2V51B 3VENA 5JMVA 1HPMA 2P9SA 1BO5O 1GLLO 3W3DA 2FSKA 2Q2RA 3FZLA 5KQ8A 2BUPA 4BRGA 1U2VB 2CGLA 3AARA 5KPRA 3MN7A 1MA9B 2E1ZA 2W40A 2I7NA 4CI6A 4FO0A 4EAHD 3O08A 2QXLA 2V7ZA 2IVNA 2E20A 2GWJA 4RCHA 4O5FA 3LDOA 4FWOA 2P9IA 4WQ4A 2YJFA 3D2FB 3QICA 2QWNA 1DEJA 4RTFD 4EIAA 4H0VB 3LDQA 1QQMA 2E2OA 2W41A 1Y64A 4ISFA 3LDLA 3DJCA 4XH1A 3H3OB 2Q36A 1ATRA 3MN9A 3VGLA 3VGMA 3VEVA 4BQLA 5BREA 4MLHA 3HTVA 3QFPA 5AQNA 4BG9A 2A40A 4H03B 2ASOA 5AFUA 3O80A 3W0LA 4H5TA 5FPEA 3O5BA 3H1QA 5BR9A 4O8KA 5CE3A 1JCFA 3ENOA 3IMXA 1X9JA 1HLUA 3CJAA 4EHUA 3IFRA 2FXUA 1Q18A 2Q97A 3L6QA 1G99A 4A62A 5AQGA 5AQRA 5EX5A 1TUUA 1BA1A 1YUWA 5ADXA 4YDUA 5AQPA 3ENHA 3VF6A 3EO3A 2QWOA 3GBTA 4E1JA 5FPNA 1RDWX 4IZ9A 3GE1A 5BPLA 3DWLA 1Z05A 3VEZA 3MDQA 3DXMB 4IO8A 4BROA 3QFUA 4FWLA 5KQDA 3CETA 4BGAA 4NB4A 2P9NB 1GLJO 1BA0A 2ITMA 3CQXA 2IVPA 3VESA 2FF6A 4CBXA 3M6GA 4WQ5A 4GY2B 3A0IX 2P9KB 4JNEA 4AM7A 1T6CA 1NGIA 2Q0UA 2KHOA 4H5VA 1X3MA 5AQLA 1K8KA 1QHAA 2D4WA 1QZ6A 3QBWA 5JLFA 4LC9B 3AAQA 1TYQB 3EKSA 5AQSA 3FE1A 2NZTA 4I6MB 1GLFO 2FSNA 4A2AA 4BRLA 1NLVA 3QB0A 3BF3A 1ZC6A 3CJCA 4CZFA 4C23A 2E2NA 3DAWA 4FSVA 1S3XA 1ATSA 1NGAA 4MO4A 1RGIA 4QS9A 3KVGA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1KLMA 3AO5A 1GOCA 1X3NA 4CZKA 3CJ7A 4BRDA 4AHSA 3CCJN 3SQ1A 2IOCA 3HPOA 1Q86O 3HOTA 5F1XA 5CZ2A 4AHTA 4LF9K 1UGLA 4OX9K 4DFJA 1P00A 2AJQA 3WT0A 4BVOA 4DR5K 2QWQA 2E6LA 4KREA 4KKOA 3L8BA 4GMJB 4MDBA 4CJ7A 3IG1A 4FJIA 4AHRA 1ZYVA 4PKHA 4E0DA 1T7EA 1Q9XA 1ZBHA 2I5JA 4HHFA 4FJMA 1C0FA 1QQCA 2P9PA 1C0GA 3C0BA 4IOXA 3OYBA 1ZBFA 2QWRA 4BGBA 4CJFA 2YHAA 4K43A 1WN7A 2IIRA 3RSEA 4BRNA 1WT7A 3AGRA 5J2QA 3BEXA 2M8BB 3KJVA 5AQQA 4MQ3A 3U8XA 4DS4A 3AVBA 3CCUN 4DR2K 1XNRK 5KPTA 4YOTA 3WXKA 4ID5A 4HCBA 1L3SA 2WC9A 5GADP 1TKZA 3E7RL 3ZX2A 3OYMA 5JICA 1NKEA 3TSQA 3SUPA 4B9VA 1IV0A 2D56A 1SL2A 5LMNK 3O3FA 1W97L 1HNVA 4Z0UA 3FZMA 4CJLA 4M3ZA 2G8WA 3KP0A 1IH7A 1E4GT 4CZLA 4GVEA 5M1PA 5M1KA 1N5YA 4RG8A 4G1QA 4KFBA 1BCGA 2D0PA 2E1YA 2OANA 1KV0A 2E2QA 4E72A 3WNFA 1NGEA 5BN9A 3WXIA 2O8BA 2KBJA 4LD0A 2B68A 4E1MA 1S6PA 3WEEA 1SL0A 1HNXK 5C0YA 5AQVA 1LOTB 3HVTA 1U49A 4B3RK 4CJSA 5SWMA 4DFPA 1NK0A 4JKGB 4QAGA 3CD6N 4BRIA 1BU6O 1JKZA 4B3OA 2NRHA 2F8TA 4F9OA 1KAXA 3BDPA 5GAHP 4WF9L 4CFCA 4JRPA 2BTFA 4E3SA 2MZ0A 3MEEA 1XNQK 4CEQA 4W5NA 3M8QA 5BRDA 2HNYA 3CM6A 1L3UA 4KHQA 5EXWA 4DTSA 2GTDA 3PIPL 3ASMA 3SPZA 3OYJA 2HNZA 4JK9A 2G8UA 2YKNA 5I3UA 5I9EB 2QEXN 4BWMA 3VQBA 5CYQA 4FM0A 3GL1A 2KKZA 5ELZA 5GINA 4GW6A 2UUBK 4JI3K 2ZGZA 4BR9A 3NF7A 3VF4A 4ISGA 1IKWA 2D0OA 4HCCA 1JZBA 1NGCA 4FWSA 1KRPA 5CZ1A 4NCBA 4M3RA 1TUYA 1FXXA 4A2BA 3PLAA 3MN5A 1ZXOA 1RNHA 4DV2K 3N4QA 3KD5E 3QEIA 2GX9A 4IWVA 1DTQA 1T03A 4IFEA 4BR5A 2F7TA 1RTHA 4LH4A 3ZSWA 3L4IA 4DU1A 4CK2A 2E3GA 4BE2A 2BDPA 1A5XA 3E9OA 3K5MA 3GDQA 4FWPA 5C15A 2GBZA 1S6QA 3FZFA 2HNDA 1RDAA 4FWQA 5C24A 3D2FA 1Y97A 4KHYA 3FGUA 4PL7A 2A3ZA 2RF2A 4GV3A 1JXCA 4OKJA 4PL8A 4KHPK 1KSPA 3EYZA 2UXDK 1BIUA 3V9WA 2QWMA 3UE5A 5LJVA 3QIPA 4ELUA 1K8BA 2NY9X 2YEOA 3SAGA 3HM9A 4AB0A 4HUFA 4AEIA 4IKFA 1TAQA 2XY5A 2X78A 4CHOA 3AO2A 4KI6A 1LQQA 3OVNA 4QS7A 5HOOA 4KB1A 4Z4IA 2E4LA 1YJWN 3KKRA 3VERA 1POIA 4H5NA 2GELA 4AHCA 4RW6A 4JI1K 1C6VA 3OYGA 3V4IA 3LM2A 2XY7A 2JWKA 3CCVN 4CJUA 3QERA 1JXEA 1XHXA 3LAKA 4FWNA 2HMPA 4ISEA 3AVGA 4DV7K 4G9ZA 3DXKB 4W5OA 5JENA 2N2RA 1S1TA 3THYB 2QW9A 3T7ZA 4Z94A 4YFUA 1LCUA 4DV6K 1XRSB 1KQSM 2P9NA 3RMAA 3AVNA 1K8AO 3LPTA 3A5MC 4PKIA 4CIGA 1GPTA 2HSTA 4KH6A 2E8AA 3MXJA 4DQSA 3D0PA 2P9KA 2O8EB 3CERA 2HW3A 3PY8A 2OTLN 1U04A 3THWB 3LDSA 3KLGA 3GOIA 4FK2A 4DR3K 2YIOA 5JVHL 4F2SA 4RW4A 4FLVA 1HPZA 3CIPA 4FPBA 2Q3SA 3UKRB 3VPZA 4DR6K 3CCRN 4HUEA 1NRAA 1LWCA 1ZYQA 4J2DA 3T1AA 4CZIA 3RTVA 4H5RA 1J6ZA 2PY5A 2WUSA 3ZSOA 2O4IA 5AR0A 3PUFA 4C8LA 4DTRA 4GV6A 4FM2A 4BRQA 1N34K 1NK4A 3R9PA 2UU9K 2NRTA 4DV5K 3O4QA 4CJKA 2OTJN 3EL2A 1YI2N 1RTIA 3AO4A 1FKOA 1T1TA 3FZKA 2YJEA 3WNGA 4FJNA 5AQZA 2QKKA 1EWQA 3TANA 2QXFA 2E88A 4V1DC 1WUAA 3KLEA 5ADXH 5AQHA 1SEGA 3I33A 3LDPA 3EZWA 3V1QA 3CF5L 3CM5A 4KBOA 4OLAA 1CN2A 2FSJA 1WSFA 4FLYA 2PFUA 2A1RA 3RRHA 4X66K 4FL9A 3SLCA 4K25A 2P51A 5AQKA 1YT3A 1VQ7N 1M1KO 1C0MA 2C1GA 1HPMA 2QI2A 3RMCA 1CHZA 1GLLO 4J2AA 2YC1C 2Q2RA 3SPYA 3FZLA 3LWMA 1HYZA 4CECA 2I61A 1U2VB 2CGLA 2ZJQL 4CI6A 3KOZA 4DSFA 3KOXA 3O08A 1RT3A 2N2QA 1NU0A 2NRXA 3P39A 2GWJA 1D8YA 1EO1A 1BQNA 2ETJA 4Z4GA 2P9IA 1VQ6N 4WFBL 4KI4A 1RT5A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1KLM A;  3AO5 A;  1GOC A;  1X3N A;  4CZK A;  3CJ7 A;  4BRD A;  4AHS A;  3CCJ N;  3SQ1 A;  2IOC A;  3HPO A;  1Q86 O;  3HOT A;  5F1X A;  5CZ2 A;  4AHT A;  4LF9 K;  1UGL A;  4OX9 K;  4DFJ A;  1P00 A;  2AJQ A;  3WT0 A;  4BVO A;  4DR5 K;  2QWQ A;  2E6L A;  4KRE A;  4KKO A;  3L8B A;  4GMJ B;  4MDB A;  4CJ7 A;  3IG1 A;  4FJI A;  4AHR A;  1ZYV A;  4PKH A;  4E0D A;  1T7E A;  1Q9X A;  1ZBH A;  2I5J A;  4HHF A;  4FJM A;  1C0F A;  1QQC A;  2P9P A;  1C0G A;  3C0B A;  4IOX A;  3OYB A;  1ZBF A;  2QWR A;  4BGB A;  4CJF A;  2YHA A;  4K43 A;  1WN7 A;  2IIR A;  3RSE A;  4BRN A;  1WT7 A;  3AGR A;  5J2Q A;  3BEX A;  2M8B B;  3KJV A;  5AQQ A;  4MQ3 A;  3U8X A;  4DS4 A;  3AVB A;  3CCU N;  4DR2 K;  1XNR K;  5KPT A;  4YOT A;  3WXK A;  4ID5 A;  4HCB A;  1L3S A;  2WC9 A;  5GAD P;  1TKZ A;  3E7R L;  3ZX2 A;  3OYM A;  5JIC A;  1NKE A;  3TSQ A;  3SUP A;  4B9V A;  1IV0 A;  2D56 A;  1SL2 A;  5LMN K;  3O3F A;  1W97 L;  1HNV A;  4Z0U A;  3FZM A;  4CJL A;  4M3Z A;  2G8W A;  3KP0 A;  1IH7 A;  1E4G T;  4CZL A;  4GVE A;  5M1P A; 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