5BPNA

Crystal structure of nucleotide-free human hsp70 nbd double mutant e268q+r272k.
Total Genus 119
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
119
sequence length
376
structure length
372
Chain Sequence
AIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVLNPQNTVFDAKRLIGRKFGDPVVQSDMKHWPFQVINDKPKVQVSYKGETKAFYPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDRTKGERNVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVNHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACQRAKKTLSSSTQASLEIDSLFEGIDFYTSITRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDLVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Heat shock 70 kDa protein 1A
publication title Nucleotide binding to variants of the HSP70-NBD.
rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 119
structure length 372
sequence length 376
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-05-28
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5bpnA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5bpnA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5bpnA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5bpnA04
2V7ZA 3R6MA 2KHOA 4M63C 4H0XB 1NGAA 3L4IA 4BRHA 4FO0A 2FSJA 3ID8A 3WXLA 4BC2A 3WXKA 2GEMA 3D2EB 5BPNA 3AARA 4FPAA 1U6ZA 3H3NO 3FGUA 3L6QA 3AAPA 1QQMA 1P8ZA 4FWKA 2P9KA 4FWQA 3ZEUA 1NLVA 3VF6A 3WQTA 3UKRB 1ESVA 1BOTO 5AQJA 4CZMA 4M7XA 1S3XA 3CI5A 3H46O 3HM8A 1BA1A 1JCFA 3WT0A 3H6EA 1NBWA 5B8HA 5LY3A 2ASOA 1DEJA 1NWKA 2YHYA 3EL2A 1C0GA 4DB3A 4FWNA 4BRPA 2AA4A 2V7YA 5AQVA 4A62A 4H5VA 5AQGA 4WYBA 1ZC6A 3VENA 5EOYA 4KBOA 3MMVA 2VWBA 2P9IB 2P9SB 5FPEA 5AZIA 4I6MA 3CQXA 1T44A 3HTVA 3H1VX 4BRLA 3CJBA 2CGKA 4QS9A 3CETA 2Q31A 3O1WA 4CZLA 3A5MC 4JAXA 4DHYA 3FZFA 3TPQA 4IJAA 3UE5A 1ZXOA 4FWSA 3C0BA 3SJHA 2YHWA 1ZBSA 4BG8A 3C7NB 4FWPA 2IIRA 2W41A 5AQYA 4H0TB 4B1WB 1HKCA 1QZ6A 3QMLA 2ASPA 3LM2A 4Z94A 3ENHA 4WQ5A 3MCPA 4XEIA 1RGIA 1BU6O 4NB4A 1LCUA 2QWMA 3O4WA 1NMDA 3VGKA 1ATRA 1IG8A 3VF2A 1GLDG 2YJFA 2V51B 2NRHA 3VETA 3SMSA 4YDUC 3LM9A 3AAQA 3G25A 2QWPA 1GLEG 3RSEB 3FFKB 3VEWA 4BRIA 4HWIA 2ZGYA 3A5OC 3H1QA 5AQRA 1GLCG 1T6DA 5E26A 4BR7A 4H5TA 4HTLA 4C23A 4BC4A 1X3MA 5FPDA 2P9KB 1KAZA 3ZEUB 3U4LA 3H3OB 3A8YA 3O80A 4JHDA 4BR9A 1EQYA 1NGHA 4ISEA 4RCHA 4WQ5C 5F1XA 1GLAG 4CZHA 1BG3A 3WXJA 5AQPA 4FSVA 1TUUA 1GLFO 4F9OA 2UYTA 3CJ1A 4RTFD 1HX1A 3BF1A 3WQUA 1WOQA 3BF3A 4PKHA 4FWMA 4EIAA 1J6ZA 1NGJA 5I9EB 3VEZA 3RSEA 4XH4A 5AZJB 3ULEA 5AQHA 1X9JA 4H5RA 5AZIB 5KQDA 4I6MB 3S41A 3IMXA 3ATVA 2E2PA 4EHTA 3CJ7A 4GNIA 3R8EA 4H0YB 4ISFA 4M7YA 2E2OA 4MO5A 4BREA 5KPRA 3QFPA 2OANA 5JMVA 4BRQA 4MLHA 2D0PA 5BR9A 2E1YA 4BRGA 3VEYA 4FOEA 3A5LC 3F9MA 3UKUA 1BWFO 4CZIA 2Q0RA 1V4TA 1NM1A 4Y0WA 2I7NA 2P9LA 4ISGA 2CGJA 2E2NA 2CGLA 1Z05A 2AP1A 4QS7A 1RFQA 3GDQA 1GLJO 2YHXA 2FLOA 4RWTA 4BC5A 2I7PA 1NGGA 3M3ZA 3GG4A 5AZJA 4IZ9A 3VOVA 3KHYA 5AQXA 4CZKA 5KPTA 2A3ZA 2IVOA 3QB0A 4MO4A 3R9PA 1ATSA 3A0IX 1BO5O 3FE1A 3CJ9A 3SLCA 4A2BA 1QQOA 3QFUA 5BREA 3O8MA 3OHRA 4BQLA 4FOIA 5BN8A 5AFUH 3MN5A 1NGEA 3O1BA 3LL3A 1GLLO 4K41A 3HZ6A 1T6CA 3D7EO 4B1UB 2Q36A 4A61A 4BR4A 2CH6A 4J8FA 4CZJA 3WEEA 1DGKN 5F2RA 2E2QA 2A40A 4AM6A 2GUPA 2QWQA 3IDHA 2DPNA 2PAVA 5BRFA 5AQOA 4BR2A 3O5BA 1OKJA 4JHDB 1XQSC 1XUPO 4BRFA 1QZ5A 2GWKA 5F0XA 2BTFA 2E20A 4BR0A 5EXWA 2QXLA 2V52B 3VERA 1NGCA 5KPZA 3CJAA 3KZBA 1QQNA 2GTDA 3QBXA 5BRDA 3CQYA 3FZKA 3VEXA 1BDGA 1D4XA 1GLBG 5AFUA 2QW9A 3U8XA 3ULEB 2EWSA 2YI1A 1ATNA 3VESA 2IVPA 4A2AA 3VGMA 3HSCA 2D1KA 3BUZB 1HPMA 2BUPA 5AQZA 1KAXA 2HF3A 3UB5A 4DCHA 1NGBA 2P9NA 4H0PA 2QWRA 2IVNA 3L0QA 4QS8A 4BRMA 4IWVA 4WQ4A 4FWOA 3EKSA 4DQ8A 5BPMA 3FZHA 5AQTA 2A6AA 2A41A 3FR0A 3UKUB 4B1XB 1XC3A 3MK6A 4L3QA 4B9QA 1DKGD 2GWJA 2YCHA 2E88A 3HI0A 2E1ZA 1HKGA 3DXMB 3BEXA 3J8AA 4K42A 2P9LB 2QWOA 2PBDA 1RDWX 4BRNA 2ZWHA 4CJ7A 3FLCO 2P9PA 3QBWA 4BRDA 1R59O 1WUAA 4O8KA 4CBXA 5EX5A 4FWLA 1MDUB 1E4FT 3VPZA 4BRKA 1QHAA 3CHWA 1V4SA 4IXCA 3FZLA 1KXPA 5LJVA 3DXKB 2HF4A 4EHUA 4XH5A 3GBTA 2VYPA 1TYQA 5AR0A 1NGDA 5JLFA 2CH5A 2H3GX 2Q1NA 3MN9A 3VEOA 1HUXA 1U2VA 3B8AX 2Q2RA 1IJJA 3CIPA 2ZGZA 3O6WA 1SQKA 1BA0A 3VGLA 5JICA 4WQ4C 3WEEB 4B1ZA 2VCPA 3DXMA 3M6GA 5AQFA 4AM7A 4EAHD 2QWNA 5JLHA 4B1VA 3ZETA 4BG9A 4IJNA 4LC9B 2HMPA 2FSKA 4PL8A 2FF3B 2ZF5O 2WUSA 5BN9A 5CE3A 1X3NA 4BROA 4BRAA 2FF6A 2ITMA 5EY4A 4CI6A 5AQWA 3JXUA 3DAWA 4JD2A 3D2FA 3WUHA 3DXKA 5BRHA 4CBUA 1YUWA 3LDOA 2Q97A 2HOEA 4MLEA 3U9ZA 1K8KA 4BVOA 5ADXA 3M1FA 4O5FA 4CBWA 4CZEA 4JNEA 1G99A 3W0LA 1MWKA 1YXQA 1HJOA 3QICA 1S22A 3MN7A 3FZMA 3IFRA 5E84A 1Z6RA 4H0OA 3SMPA 4JN4A 2NZTA 3MN6A 1NGFA 4FL9A 4BGAA 3CERA 3LDNA 1HLUA 4YDUA 2P9NB 1C0FA 3D2EA 3WXIA 3LDQA 4PKIA 1Y64A 3GE1A 4GY2B 2A42A 4BGBA 4CD3A 3KVGA 4FWRA 4H03B 1SZ2A 3UKRA 2D4WA 2E8AA 2A5XA 3H45C 3ZX2A 1MWMA 1MA9B 4H0VB 1SAZA 3JS6A 1BUPA 3VF4A 1LOTB 1HKBA 5AQMA 4FPBA 3MDQA 1NGIA 4BR5A 4PL7A 4E1JA 3VEVA 2P9PB 5LJWA 4BVPA 5AQNA 5FPNA 1TUYA 3DJCA 4BC3A 3AY9A 2P9IA 2P9SA 4K43A 3GOIA 5AQIA 1TYQB 3EZWA 4BRCA 3I8BA 4CD1A 4IO8A 2P9UB 5AQUA 5EVZA 3TU5A 2ASMA 4CZFA 2F9WA 3O08A 1U2VB 3ZX0A 3EO3A 2Q0UA 5BPLA 2GELA 2J4RA 4CZGA 3U9DA 4EFHA 3I33A 3EN9A 4BQZA 3ATUA 2FSNA 5TKYA 4K25A 5KQ8A 4NO7A 3GL1A 3HBTA 2YJEA 3SK3A 3IUCA 3C7NA 3BP8A 1YAGA 5AQLA 3ZETB 3EKUA 4B1YB 4PKGA 1YVNA 4XH1A 2W40A 4H5WA 2QM1A 3A5NC 3W3DA 3ZX3A 2QWLA 3QDKA 4JD2B 5AQKA 3D2FB 1E4GT 5ELZA 3LDLA 3DWLA 5AQQA 1CZAN 1H1VA 1JCGA 2D0OA 1KAYA 3CJCA 3P4IA 3ENOA 4H5NA 5AQSA 1Q18A 1K8KB 5ADXH 2F9TA 2P9UA 5FPMA 3LDPA 2NLXA 2FXUA 1JCEA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3J80O 2D0AA 1K6YA 4FM1A 4F2SA 4H0XB 3L4IA 5CY0A 4BRHA 2O4IA 3OYDA 1SV5A 4Z4HA 1U6ZA 1ZVGA 4GKKK 1XHXA 4DR5K 4FWKA 2P9KA 4FWQA 1IKXA 3PIPL 1BMRA 4IOAL 3VQ7A 3CFRA 1VSEA 4RW8A 4J2EA 1YTUA 4HUEA 3CI5A 3HM8A 2Y1IA 5AJ3K 3ZSOA 5B8HA 1C6VA 2YHYA 4O44A 3D6RA 3I8DA 1P90A 3TTFA 4FZYA 4QCLA 4YY3K 5AQGA 4WYBA 3VENA 3ZT3A 2X74A 3OS2A 3DOLA 1SNBA 5KGWA 1WSGA 4KHQA 3HTVA 2BANA 1GPTA 1NKEA 3CJBA 2RKIA 1T1TA 2CGKA 3AO4A 4LY7A 3MECA 1F21A 3A5MC 1T7EA 4CZLA 4W5OA 4IJAA 2D5RA 2OZMA 1NH5A 3QEVA 4FWSA 3QETA 3C0BA 5EU7A 2YBRC 3C7NB 1ZVEA 3KK2A 3O4QA 4H0TB 4KH4A 2W00A 1J54A 3RMCA 1QZ6A 3RWUA 4DFMA 1S9GA 1L4VA 1JL2A 2WOMA 4XEIA 2WC9A 2IDOA 3ZT1A 3O4WA 1NK7A 1FH3A 3VGKA 2KZZA 3NF6A 2FBVA 1T05A 3E9LA 4JI3K 1N6QA 3THXB 3NCIA 3THYB 2V51B 5DM7L 2WTUA 1RNHA 3L8BA 4X62K 4LF4K 4CESA 3E9OA 3LM9A 1NJYA 1WSJA 4BRIA 3QIPA 4C8MA 3A5OC 3ALYA 3AO3A 4HHFA 1GLCG 3E7RL 2FBYA 5E26A 4CHQA 4HTLA 4CHZA 4BC4A 1IG9A 4FLXA 1B3CA 1FJGK 3O80A 3SF4D 4BR9A 1S1VA 4EZ6A 4DR3K 1HYZA 3TTCA 3KOYA 3OY9A 3WXJA 3T1YK 1SL2A 4RG8A 4F9OA 2UYTA 5JVGL 1S1XA 4PKHA 2VQEK 5C12A 3MX2A 4EZ9A 1N33K 1HNXK 5AQHA 1Y97A 2JLEA 3KP1A 4H5RA 5KQDA 4I6MB 4DSIA 1YVUA 1I3AA 4W5QA 2O8BA 3CJ7A 4GNIA 3NVKA 3CCSN 4ISFA 2E2OA 1S6QA 1GPSA 5KPRA 3QFPA 1DT9A 4BRQA 4YHHK 4JS4A 4FOEA 3MEEA 4CGIA 1XC9A 4CZIA 4O4GA 4KAZA 1CN2A 1NM1A 3T7ZA 2K35A 2P9LA 1ZYQA 2CGJA 2KFNA 1GOCA 4QS7A 1Z05A 2AP1A 4E0DA 1RFQA 3NH2A 3SUPA 4DTJA 3RR8A 3K5LA 1S1WA 4DV3K 4PY5A 3V9ZA 3VTHA 3O9SA 5AZJA 4CZKA 5AQXA 2A3ZA 4CJVA 4YOVA 2IVOA 2NRVA 4MO4A 4DV4K 1VHXA 3CQ8A 1T03A 1XRSB 4CEDA 3FE1A 1HMVA 3CJ9A 3M8RA 3TAPA 1WWNA 1ZBFA 3PUFA 5BREA 2B68A 4C8NA 5HRPA 3HPGA 2D0CA 1NOZA 4B08A 5BN8A 4IOXA 4CJ5A 3O1BA 3LL3A 1FW6A 1DQ7A 4B1UB 5J2NA 4JI0K 2CH6A 4CZJA 4KHYA 4DUYK 1DGKN 4OVLA 1MYNA 1KTQA 2I5JA 3AO5A 2QWQA 2DPNA 4KH5A 3ZT4A 5CY4A 4IFEA 3E66A 1OKJA 4JHDB 4NCGA 1XQSC 3NGZA 3HPOA 4DTMA 4DSLA 4FLZA 3MX5A 3V9WA 4FCYA 1IKVA 3MXIA 1TKTA 1BHLA 2E20A 2FBTA 3J7YP 3CYGA 3KZBA 3L4QA 4N76A 1D9FA 2X6SA 1ZBIA 1VQ7N 3O9RA 3FZKA 2O8CB 5D3GA 2P5GA 1BI4B 1GLBG 2QW9A 1JLFA 3CFOA 5AFUA 3ULEB 3PIOL 3LWMA 2EWSA 2KKZA 3VESA 4EP5A 3KKRA 2HHXA 1Z26A 3TANA 3VGMA 2OYQA 1JLCA 1HPMA 3HJFA 2NRXA 4OPKA 2NY8X 2IVNA 1EP4A 3LPUA 3L0QA 1TGOA 1BK8A 3OYFA 1IKWA 5AQTA 3P83D 3AVLA 3FR0A 1Q81O 5SWMA 1YT3A 3F73A 2XO7A 4CJUA 3SAGA 4CJKA 3HOTA 2E1ZA 2F4VK 2HBJA 4IG0A 1JJ2M 5KGXA 4CEEA 5MLCQ 4M3YA 1ASVA 4LF8K 1S72N 4KHUA 3VA3A 1NJZA 4FWLA 4IEEA 3FZLA 1HNVA 3DXKB 5M1QA 2HF4A 1JXEA 3GBTA 3V81A 1I2UA 4FJJA 2VYPA 4M3ZA 5FDLA 4DTSA 4UY8O 3S5TA 3AVMA 4B9VA 4DS4A 3U3YA 1L3UA 4LSLA 3MN9A 2QK9A 1U2VA 1SKSA 3CIPA 5HOOA 4UJ0A 3H08A 1BA0A 3VGLA 4WQ4C 3DLHA 3S9HA 2Z1IA 2M8BB 2LI7A 4AM7A 4CE9A 3NGIA 4IKFA 3J81O 5JLHA 1XNRK 3ZT2A 4FVMA 1TKZA 5CE3A 1XHZA 5I3UA 2RF2A 4CEQA 1TK5A 4CFAA 3JXUA 4HVJA 4RW4A 1KD1O 2KPYA 5BRHA 3MCAB 2HVHA 2XHBA 4FJKA 4CJEA 4FJGA 3OVNA 5ADXA 4O5FA 1G99A 4ILJA 1HJOA 3HXMA 5CYQA 3VQEA 2HNZA 3V4IA 3SMPA 3KC6A 2NZTA 4FJMA 1SEGA 1BCGA 4FL9A 4AAZA 1QE1A 4OO1J 3D2EA 4YNQA 4NCBA 3WXIA 3LDQA 4PKIA 1IBLK 3GE1A 1Q9YA 4V1DC 4CD3A 5DMRA 2W42A 2YHAA 3UKRA 2D4WA 4KHNA 3H45C 4H0VB 4KV8A 2GBZA 3THWA 3VQBA 2OPSA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3J80 O;  2D0A A;  1K6Y A;  4FM1 A;  4F2S A;  4H0X B;  3L4I A;  5CY0 A;  4BRH A;  2O4I A;  3OYD A;  1SV5 A;  4Z4H A;  1U6Z A;  1ZVG A;  4GKK K;  1XHX A;  4DR5 K;  4FWK A;  2P9K A;  4FWQ A;  1IKX A;  3PIP L;  1BMR A;  4IOA L;  3VQ7 A;  3CFR A;  1VSE A;  4RW8 A;  4J2E A;  1YTU A;  4HUE A;  3CI5 A;  3HM8 A;  2Y1I A;  5AJ3 K;  3ZSO A;  5B8H A;  1C6V A;  2YHY A;  4O44 A;  3D6R A;  3I8D A;  1P90 A;  3TTF A;  4FZY A;  4QCL A;  4YY3 K;  5AQG A;  4WYB A;  3VEN A;  3ZT3 A;  2X74 A;  3OS2 A;  3DOL A;  1SNB A;  5KGW A;  1WSG A;  4KHQ A;  3HTV A;  2BAN A;  1GPT A;  1NKE A;  3CJB A;  2RKI A;  1T1T A;  2CGK A;  3AO4 A;  4LY7 A;  3MEC A;  1F21 A;  3A5M C;  1T7E A;  4CZL A;  4W5O A;  4IJA A;  2D5R A;  2OZM A;  1NH5 A;  3QEV A;  4FWS A;  3QET A;  3C0B A;  5EU7 A;  2YBR C;  3C7N B;  1ZVE A;  3KK2 A;  3O4Q A;  4H0T B;  4KH4 A;  2W00 A;  1J54 A;  3RMC A;  1QZ6 A;  3RWU A;  4DFM A;  1S9G A;  1L4V A;  1JL2 A;  2WOM A;  4XEI A;  2WC9 A;  2IDO A;  3ZT1 A;  3O4W A;  1NK7 A;  1FH3 A;  3VGK A;  2KZZ A;  3NF6 A;  2FBV A; 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