5BPNA

Crystal structure of nucleotide-free human hsp70 nbd double mutant e268q+r272k.
Total Genus 119
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
119
sequence length
376
structure length
372
Chain Sequence
AIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVLNPQNTVFDAKRLIGRKFGDPVVQSDMKHWPFQVINDKPKVQVSYKGETKAFYPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDRTKGERNVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVNHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACQRAKKTLSSSTQASLEIDSLFEGIDFYTSITRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDLVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Heat shock 70 kDa protein 1A
publication title Nucleotide binding to variants of the HSP70-NBD.
rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 119
structure length 372
sequence length 376
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-05-28
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5bpnA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5bpnA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5bpnA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5bpnA04
2BUPA 3SLCA 3ATVA 1HKGA 2E2PA 4JHDB 3KVGA 5BPNA 2P9KA 5ELZA 2QW9A 5AQNA 1Q18A 5E84A 2YJEA 2CGLA 1QQOA 5AQQA 2E2OA 4XH4A 3VGMA 4BG9A 1NGEA 5AQPA 5AQYA 3FZFA 3CJAA 2QWLA 1CZAN 1P8ZA 4CZFA 5AZIB 4H5RA 1YVNA 4FWMA 1HLUA 3H3NO 1NWKA 2YHYA 3MN5A 5FPMA 2VCPA 3VERA 3AY9A 2ASPA 2V7YA 4PKGA 3UB5A 1BA0A 1HKCA 4H0OA 4IJNA 1X3MA 3LDOA 4BRAA 4I6MB 3VENA 3GBTA 3D2FA 1HUXA 3QDKA 1YAGA 2PBDA 1QQMA 4YDUC 3DJCA 3VEXA 4IJAA 3LM2A 5EX5A 3ZX3A 3L4IA 5BPLA 3LL3A 2Q0RA 4BC4A 1KAXA 3GDQA 3CQYA 2F9TA 3O4WA 3VF6A 4CZEA 2ZWHA 3UE5A 5AQIA 2QWMA 1X9JA 3CI5A 3R8EA 3VEZA 2YHXA 4PKHA 4XEIA 1EQYA 1WOQA 2FSJA 1J6ZA 1NLVA 3AAPA 2CH6A 3QB0A 3VGKA 1JCFA 2HOEA 3WXLA 4BVPA 3MCPA 2E20A 4WQ5C 3ZX0A 2Q97A 4BROA 3GL1A 1GLEG 4DHYA 4A2BA 3LDNA 3EKUA 4RTFD 1T44A 4CZKA 4CZMA 2Q36A 5BPMA 3W0LA 4FWKA 5AQLA 3EL2A 5EXWA 4AM6A 2Q2RA 4QS7A 1MDUB 1KXPA 2IVOA 4A2AA 4K41A 4B1XB 1BA1A 3A0IX 4BRMA 3HSCA 1GLFO 1JCGA 2AP1A 3UKUA 3H1QA 4DB3A 3QBXA 5F2RA 3ULEA 3DXKA 4BR4A 2ZGYA 2DPNA 3D2FB 4BQZA 3VF4A 3ENHA 1XUPO 5AZJA 5ADXA 3CJ9A 5ADXH 2BTFA 4WQ4C 3O08A 4MO4A 4PL8A 3IDHA 4EIAA 3BEXA 4BRNA 5LJVA 2F9WA 4BC5A 3IUCA 3QICA 1XC3A 1OKJA 4MO5A 2FLOA 5BRFA 5BN9A 3M6GA 1HX1A 3O1BA 4YDUA 3CJBA 4CD3A 2A3ZA 2NLXA 3MN9A 4L3QA 3ZEUA 4CZGA 4B1VA 1ZC6A 4A61A 4GNIA 2E2NA 1NGHA 3W3DA 5B8HA 4E1JA 4EHUA 2CH5A 5AR0A 2D0PA 2W40A 3CJ7A 4B1YB 4Y0WA 4FWRA 4PL7A 5AQRA 2NRHA 4BRKA 4CBUA 3SJHA 1IJJA 3P4IA 2VWBA 3AAQA 3HI0A 4WQ5A 2ITMA 4BR0A 2YJFA 4MLEA 4FWQA 4M63C 3WT0A 3O80A 3MDQA 3FE1A 3UKUB 5KPTA 4FWPA 5AQMA 3VEVA 3ULEB 4Z94A 3H1VX 2E8AA 3DXKB 2P9PA 4QS9A 3WXKA 4BR2A 4FO0A 1TUYA 3HZ6A 3VOVA 2FSNA 4FOIA 5AQXA 4ISFA 3RSEA 3U4LA 3EKSA 5BN8A 5AZJB 3IMXA 5AQKA 4WYBA 5JICA 4PKIA 3A5NC 3CETA 4M7YA 4BR7A 4CZLA 4B1UB 4DQ8A 4XH5A 4CBXA 5AQOA 4BR9A 2IVNA 5KPRA 3FLCO 5EY4A 3QFPA 3ZX2A 3CHWA 1ATNA 4WQ4A 3GOIA 4BREA 2CGKA 2P9UA 4K42A 2Q1NA 4HWIA 3MK6A 2E2QA 3WQUA 2P9SA 1Z05A 1NGCA 3I8BA 3ZEUB 3SK3A 3S41A 3D7EO 1YXQA 3HBTA 4FWNA 4H0TB 4BRDA 5LY3A 4M7XA 4H0XB 3A5MC 3QMLA 1C0FA 2ASOA 2E1ZA 5BRHA 3LM9A 1HPMA 2YHWA 1GLJO 3SMPA 3ID8A 4AM7A 3J8AA 1NMDA 3ZETA 4JAXA 3CQXA 4B1ZA 2A6AA 3IFRA 5FPEA 1H1VA 3QBWA 3EN9A 2NZTA 2P9PB 1BDGA 5JLFA 5BREA 2P9IA 2P9NA 4NO7A 4C23A 3U8XA 3RSEB 1TUUA 5AQFA 3WEEA 1DEJA 1BWFO 1V4SA 2QWOA 3JXUA 3EZWA 3D2EA 1NGIA 4CZIA 5BR9A 1NGDA 3EO3A 1NM1A 1BO5O 1LCUA 3H6EA 4BRPA 5CE3A 2ZF5O 2D0OA 4JN4A 1IG8A 1DGKN 1MWKA 1XQSC 2YCHA 3M1FA 3KZBA 1S22A 4H5WA 3TPQA 3BF3A 2FF3B 4FL9A 1R59O 3L0QA 1GLLO 2D1KA 3O8MA 4BGBA 2P9UB 4JNEA 2P9SB 3A5OC 3I33A 4BG8A 4BVOA 3L6QA 5AQUA 2A41A 3VETA 2H3GX 5AQJA 5I9EB 2P9LA 4CZJA 3GE1A 1NGJA 1ESVA 2GUPA 3VEWA 3QFUA 4H0VB 1U2VA 2QXLA 1ZXOA 1TYQA 2V52B 3A5LC 3VPZA 1RDWX 4KBOA 4BRQA 1NGGA 4CI6A 2GEMA 3SMSA 3WQTA 4IZ9A 3MN7A 3ZETB 1GLCG 4BQLA 2HF3A 2FXUA 1E4GT 1MWMA 5AQSA 1Z6RA 3CJ1A 3H3OB 4O5FA 4DCHA 4H0YB 2KHOA 3A8YA 1JCEA 4GY2B 2J4RA 3TU5A 4H5NA 2ASMA 2P9IB 2P9NB 4RCHA 2WUSA 3AARA 3R9PA 3WEEB 4FWSA 4BC3A 4FWOA 3H45C 3D2EB 5KQDA 5KQ8A 2QWQA 4K43A 4F9OA 1ATRA 3WXIA 3HTVA 3WUHA 1X3NA 1GLDG 3BF1A 1HKBA 2CGJA 4B9QA 3U9ZA 2E1YA 5KPZA 1ZBSA 5AQTA 4MLHA 4CD1A 3CIPA 1HJOA 4QS8A 1BG3A 1RGIA 4A62A 4IWVA 3UKRA 1ATSA 1K8KB 1SZ2A 2FF6A 1Y64A 2QWPA 1GLBG 3HM8A 4BRFA 4ISEA 1SAZA 5JLHA 3DAWA 2A42A 2I7PA 2W41A 2QWNA 3C7NA 3LDLA 3VEYA 2P9LB 5AFUA 5AQVA 3JS6A 5F1XA 5AFUH 4BRCA 2GELA 1GLAG 5LJWA 1U2VB 3O5BA 4JD2A 2V7ZA 1SQKA 1TYQB 3GG4A 4H03B 2HMPA 4EAHD 1LOTB 2HF4A 3FZMA 2QM1A 3M3ZA 4O8KA 3O6WA 1D4XA 2V51B 4H5VA 4IXCA 3C0BA 3DXMA 5BRDA 4RWTA 5AQGA 4BRHA 5AQWA 1NBWA 3OHRA 3BP8A 3DWLA 3WXJA 3CJCA 2IVPA 1QZ5A 1QZ6A 3FZHA 2P9KB 4EFHA 3O1WA 1E4FT 2AA4A 2ZGZA 4FPBA 4LC9B 4CJ7A 1U6ZA 3VESA 3VGLA 2QWRA 1RFQA 4JHDA 5FPNA 1NGBA 1BU6O 3R6MA 2Q0UA 5TKYA 3B8AX 3UKRB 4BC2A 4BGAA 2GWJA 1G99A 3VEOA 4XH1A 2FSKA 5E26A 2I7NA 2A5XA 3MMVA 3ATUA 5AZIA 1K8KA 3MN6A 3C7NB 2VYPA 4BRLA 2YI1A 1T6CA 1NGAA 1C0GA 3KHYA 5JMVA 2GWKA 4ISGA 4FWLA 5AQHA 3CERA 3FR0A 4H0PA 2IIRA 2D4WA 4BRIA 4CZHA 4IO8A 3F9MA 1T6DA 3BUZB 5F0XA 1KAYA 2E88A 1BUPA 5FPDA 4I6MA 4H5TA 4JD2B 3FZKA 4FSVA 1BOTO 4NB4A 4BRGA 1YUWA 2PAVA 1DKGD 2EWSA 4HTLA 4K25A 1NGFA 3U9DA 1KAZA 1QQNA 3LDQA 5AQZA 1MA9B 4CBWA 3FGUA 4FOEA 4B1WB 1WUAA 3FFKB 2GTDA 4BR5A 3VF2A 4J8FA 1V4TA 3DXMB 2Q31A 3ENOA 3FZLA 1S3XA 2A40A 2OANA 5EOYA 2UYTA 4FPAA 3H46O 3LDPA 3G25A 5EVZA 4EHTA 1QHAA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2BUPA 1BGXT 1BHLA 1HKGA 1NJYA 4W5RA 2E2PA 4JHDB 4JKCA 2VG6A 3EE8A 2CGLA 2E2OA 3I0SA 4FJHA 5AQYA 2IAJA 1L3VA 1CZAN 3NVMA 1I2VA 3OA9A 2VGMA 3G71N 2UXBK 1RCHA 4OPAA 3MN5A 1P0AA 1REVA 2DTUA 4CJ3A 1TKTA 1SUQA 3NGZA 2G8UA 3VMFB 1HKCA 4IJNA 4E1NA 4BRAA 4CJUA 4CEQA 3OY9A 3THWB 3D2FA 1L4VA 3QDKA 2PBDA 1QQMA 3RRGA 1T05A 2GBZA 3MX2A 3L4IA 3OYJA 4N76A 2XY5A 4BC4A 1SKRA 3M8QA 4BWJA 3LP3A 4PY5A 2ASCA 2YHXA 4PKHA 1Y97A 5GAGP 4KHQA 2CH6A 3U3YA 4ELTA 4BVPA 1JXBA 4M42A 3V1OA 4LY7A 2LJ7A 4IEEA 1GLEG 2W00A 4A2BA 3LDNA 5DMRA 4E7HA 4DFJA 1N4NA 3EZ5A 4CZKA 1AHOA 3QETA 1S9EA 4CZMA 5C10A 2WFBA 1MDUB 4AF1A 4WCEL 3VA0A 4AILC 2W6KA 3T19A 3JSMA 4FLVA 1AYJA 1VQ6N 2KPYA 4KYPA 4B9MA 2YEOA 1BI4B 3P31A 1JCGA 2AP1A 3DRRA 3AGKA 4R5PA 3MXJA 2WTUA 3OS1A 5D3GA 4H4MA 3NGYA 3DXKA 4JV5K 4XJXA 4CEZA 1NJXA 1WSFA 4YNQA 2MN5A 2DPNA 4J2DA 1JXEA 1FKOA 2YIPA 5AZJA 4DS4A 1X9MA 4E1MA 4JI8K 1K9MO 1YJWN 4JRQA 3NF9A 4CFAA 1JLGA 2C1GA 1FKPA 1KSPA 3I55N 3L2UA 2KFNA 2KZMA 3IUCA 1T0ZA 4Z0UA 4N5SA 2W42A 5BRFA 5BN9A 1D5AA 2P1JA 1OH6A 2NLXA 3CMAN 4FLYA 1D8YA 4CZGA 3CCRN 4B1VA 4CESA 4A61A 4RW8A 2E2NA 4EHUA 2W40A 3OVNA 3CJ7A 3ENBA 4FWRA 2NRHA 4BRKA 3L2RA 1N33K 1BL3A 3P4IA 1VQKN 1WSEA 3HI0A 3BZCA 4WFAL 4DR3K 3R1XA 1C6VA 1UA1A 1LQHA 4ILHA 1W9HA 3OBYA 5KRSA 3UKUB 4FWPA 2D56A 3ULEB 3H1VX 2E8AA 4Y1DA 3TAQA 1OVQA 1SKSA 1BCMA 2B4JA 4AH9A 1RDUA 4WYBA 4GKKK 4IOAL 4KKOA 4DFPA 4FLWA 4CF1A 2Z1JA 3O9UA 1NNEA 2LR3A 5EY4A 1UWBA 3QFPA 5C42A 3T1AA 1HYZA 1N34K 4FJ5A 3J80O 4CFBA 1NKBA 2HHTA 3GOIA 2CGKA 2P9UA 1JLQA 2HHIA 3MK6A 3I8BA 4X65K 3SYZA 2YKMA 3TSUA 4I9QA 4GV9A 3A5MC 4FM0A 4B9VA 3OYHA 2ASOA 3K57A 4YOUA 2YHWA 2E3GA 1GLJO 3QINA 4M3YA 1NMDA 3AVIA 1KQSM 3QERA 1C1BA 1U04A 2YNFA 3V81A 1H1VA 3QBWA 2ZE2A 2P9PB 2UU9K 4UADE 2K35A 1VQ8N 3C6UA 2VY6A 3KK1A 3RSEB 4LSNA 3WEEA 4CFCA 1VSJA 3N4PA 1DEJA 4IFEA 4G1QA 5AJ3K 3JXUA 2EX3A 1S1XA 3AVFA 4FYDA 1LCUA 1RNHA 5DM6L 4DSKA 4IG3A 2ZF5O 2D0OA 4KI4A 1MWKA 3F9KA 3M1FA 2GMOA 2FF3B 1HJRA 1GLLO 4CIEA 4CGIA 1MU2A 4BGBA 3CXCM 2HHHK 1IKYA 1N32K 2IOCA 3KLIA 3L3UA 5AQUA 3HJFA 3VETA 4M41A 4DR4K 4KPYA 4CZJA 4FZXC 1NGJA 4CEOA 3QFUA 1U2VA 2PFUA 2HBMA 2V52B 4E72A 4KBOA 1YI2N 2LKBA 4BRQA 4IZ9A 4CJFA 4PQUA 4DU1A 5M1OA 2IC3A 1VQMN 3CCSN 4M45A 4FLZA 3ZLJA 1T03A 3E7UX 1JCEA 3NDKA 2J4RA 3QNOA 4AHUA 3EE9A 2P9IB 2P9NB 2RN2A 1GOBA 3AARA 3OYMA 1NK0A 2ZD1A 3NH0A 2VWKA 3H45C 3D2EB 3E9OA 1ATRA 4YOWA 1X3NA 1HKBA 3U9ZA 2O8BA 3ZSZA 1FXXA 2IS3A 4BY9C 1ZBFA 4YOVA 3O9QA 4GV6A 2FBTA 3CYGA 2QWPA 1GLBG 3PLAA 1SAZA 5JLHA 4Z4GA 1QE1A 2YNGA 4LFCK 2I7PA 2W41A 3C7NA 2UUBK 3TTFA 2E0HA 2JGUA 2ZJPL 5AFUH 4CQKA 1JZAA 4KO0A 4DR7K 4CK2A 1SQKA 3P5JA 1ITGA 1TK5A 3GG4A 1VSEA 4H03B 4FJIA 4OPJA 2HMPA 4FJGA 2QM1A 5HRNA 3M3ZA 4O8KA 2V51B 4FLUA 4H5VA 4IXCA 1WB9A 3DXMA 3AO1A 4RWTA 1RT7A 4DSEA 3OBWA 2EHGA 1VSDA 3RVCA 1WSHA 3CFRA 4OJRA 1QZ5A 4C8NA 1QZ6A 4YOTA 3VQ8A 4KB1A 3S3OA 4EFHA 4JEPA 3O1WA 1E4FT 4FPBA 1U6ZA 2LSNA 2QWRA 4AAZA 3EY1A 2D0CA 2ZJQL 3VTHA 3ZT2A 1BK8A 4NLCA 3EYZA 5HLFA 1BISA 4DG1A 4RW6A 4BC2A 1G99A 2F8SA 2XY8A 1NMNA 1W0HA 4JKAA 4LF8K 4ID1A 4IOCL 4XIUA 4LFBK 1QVGM 2A5XA 4M3WA 3MMVA 3ATUA 3CCVN 2HBLA 2VYPA 1L3SA 4AB0A 1T7PA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2BUP A;  1BGX T;  1BHL A;  1HKG A;  1NJY A;  4W5R A;  2E2P A;  4JHD B;  4JKC A;  2VG6 A;  3EE8 A;  2CGL A;  2E2O A;  3I0S A;  4FJH A;  5AQY A;  2IAJ A;  1L3V A;  1CZA N;  3NVM A;  1I2V A;  3OA9 A;  2VGM A;  3G71 N;  2UXB K;  1RCH A;  4OPA A;  3MN5 A;  1P0A A;  1REV A;  2DTU A;  4CJ3 A;  1TKT A;  1SUQ A;  3NGZ A;  2G8U A;  3VMF B;  1HKC A;  4IJN A;  4E1N A;  4BRA A;  4CJU A;  4CEQ A;  3OY9 A;  3THW B;  3D2F A;  1L4V A;  3QDK A;  2PBD A;  1QQM A;  3RRG A;  1T05 A;  2GBZ A;  3MX2 A;  3L4I A;  3OYJ A;  4N76 A;  2XY5 A;  4BC4 A;  1SKR A;  3M8Q A;  4BWJ A;  3LP3 A;  4PY5 A;  2ASC A;  2YHX A;  4PKH A;  1Y97 A;  5GAG P;  4KHQ A;  2CH6 A;  3U3Y A;  4ELT A;  4BVP A;  1JXB A;  4M42 A;  3V1O A;  4LY7 A;  2LJ7 A;  4IEE A;  1GLE G;  2W00 A;  4A2B A;  3LDN A;  5DMR A;  4E7H A;  4DFJ A;  1N4N A;  3EZ5 A;  4CZK A;  1AHO A;  3QET A;  1S9E A;  4CZM A;  5C10 A;  2WFB A;  1MDU B;  4AF1 A;  4WCE L;  3VA0 A;  4AIL C;  2W6K A;  3T19 A;  3JSM A;  4FLV A;  1AYJ A;  1VQ6 N;  2KPY A;  4KYP A;  4B9M A;  2YEO A;  1BI4 B; 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