5BPNA

Crystal structure of nucleotide-free human hsp70 nbd double mutant e268q+r272k.
Total Genus 119
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
119
sequence length
376
structure length
372
Chain Sequence
AIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVLNPQNTVFDAKRLIGRKFGDPVVQSDMKHWPFQVINDKPKVQVSYKGETKAFYPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDRTKGERNVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVNHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACQRAKKTLSSSTQASLEIDSLFEGIDFYTSITRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDLVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Nucleotide binding to variants of the HSP70-NBD.
rcsb
molecule keywords Heat shock 70 kDa protein 1A
molecule tags Hydrolase
source organism Homo sapiens
total genus 119
structure length 372
sequence length 376
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-05-28
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5bpnA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5bpnA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5bpnA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5bpnA04
3ZX3A 1C0FA 3SMPA 1R59O 2ASMA 4MLEA 3GG4A 5JICA 3LDPA 2WUSA 4H0XB 2I7NA 3TPQA 3VEYA 3ULEA 2FLOA 4A61A 4B9QA 3VF6A 3VOVA 3C7NA 1BA1A 1GLLO 1OKJA 3ZETB 3L0QA 3RSEA 2J4RA 1HKGA 3A5LC 1KAYA 4B1ZA 3H1QA 3R8EA 3VESA 4BRQA 3GL1A 3VGLA 4CI6A 1QHAA 1ATNA 2F9TA 2VWBA 3LDLA 2IVOA 5BR9A 3DXMA 4BGBA 4JAXA 4C23A 3O4WA 1NGJA 2YHXA 3L6QA 4E1JA 2A5XA 3FE1A 2KHOA 3CHWA 2QWMA 4H0PA 3LM2A 5ELZA 1CZAN 3O08A 3FZKA 3TU5A 4BG8A 3D2FA 5BRDA 2HF4A 3FZFA 3U9DA 1HLUA 4MO4A 2HF3A 4BRLA 1TUYA 3M3ZA 4EHTA 3FFKB 2YJFA 3CJ7A 2V52B 1MWKA 4L3QA 4DCHA 2HOEA 4ISFA 2P9LA 4ISGA 1YUWA 2E1ZA 1YVNA 2F9WA 2P9KB 3WQTA 5JLHA 2ITMA 2QWLA 4CZHA 4H0VB 3QFPA 4RTFD 3FZMA 1G99A 1YAGA 4QS8A 1JCEA 3ENOA 2D1KA 2D4WA 1GLAG 1HJOA 5AQSA 3AY9A 3VERA 2QWPA 5AQGA 1U6ZA 3MK6A 3A8YA 4EFHA 3GOIA 4FSVA 4F9OA 2Q36A 2ASOA 4FPAA 4BGAA 5AZIB 3ZEUB 2P9PA 4WQ5C 3WUHA 3UKUA 1X3NA 3O5BA 5AQHA 2CGLA 3DJCA 2ZGYA 3VEWA 4CZFA 2V51B 4WQ5A 1NGBA 4FO0A 3SK3A 3DWLA 1NGFA 3VGMA 3BF3A 3W0LA 3D2EA 3AARA 4LC9B 1QQOA 3LDOA 2E2NA 3EZWA 2NRHA 4BR4A 3H3NO 3HBTA 3FR0A 3HI0A 4BR0A 4DHYA 3R6MA 3H3OB 1NGDA 2P9SA 3CIPA 4DQ8A 2D0PA 5EXWA 4Z94A 4PKHA 1QZ5A 1J6ZA 3SLCA 3VGKA 2P9UB 2YCHA 5KQ8A 4FWLA 1BDGA 4KBOA 1Q18A 4B1YB 5EVZA 3LDQA 1T6CA 3A0IX 4JHDB 1NGAA 4BRCA 2QWQA 3IFRA 5AQLA 3CJCA 1GLEG 5AQZA 5BRHA 1NMDA 3QDKA 2V7ZA 2CGJA 5AQYA 2V7YA 1KAXA 2ASPA 3BP8A 4XEIA 2A3ZA 1ZC6A 4BR7A 2QM1A 3H1VX 3VF2A 2GEMA 1NBWA 4RCHA 3UE5A 1NGEA 3G25A 1GLFO 2IVNA 3ATVA 4BC2A 4NO7A 3A5MC 3HM8A 3GDQA 4NB4A 3HZ6A 1NGGA 4H03B 3CJ9A 4CZLA 1IJJA 3A5NC 1NGIA 2H3GX 1DGKN 1D4XA 4CD1A 5F2RA 2IIRA 5EY4A 1BU6O 3JS6A 4EIAA 5E84A 3JXUA 3UB5A 3IMXA 5AQTA 5JMVA 2HMPA 4WYBA 3FLCO 3WXLA 3ATUA 1XQSC 4H0TB 1SAZA 3O80A 3VF4A 4B1UB 3EKUA 3QBXA 4CZGA 4H0YB 2VYPA 4A2BA 4FWOA 1MWMA 4BRFA 4IO8A 1Z6RA 3WT0A 3BF1A 4O5FA 3WEEB 3CERA 1HX1A 5KQDA 1BA0A 5AFUH 4I6MB 2P9IA 3U9ZA 1TYQA 4QS9A 3ZEUA 2Q1NA 4BVPA 3L4IA 3IDHA 5AQVA 1NM1A 4BR9A 4FWMA 4EHUA 3C7NB 4BG9A 2IVPA 1S3XA 3RSEB 4FWNA 3CJAA 1HPMA 4PL7A 3GE1A 1Y64A 4IXCA 5ADXH 4JNEA 1KAZA 3U4LA 5BPLA 5TKYA 5AQIA 4GY2B 3CJBA 3C0BA 5KPZA 3QMLA 3QICA 2GWJA 3H45C 4K43A 3DXMB 5CE3A 4FL9A 1NGHA 3O8MA 4BRMA 1XUPO 4BRAA 2E8AA 1BUPA 1DKGD 1GLJO 3H46O 3O1WA 2Q31A 3D2FB 4O8KA 3VETA 4XH1A 2W41A 4JD2A 4BRDA 3ID8A 2UYTA 5AQQA 4CD3A 2VCPA 3P4IA 5F1XA 1GLDG 2NZTA 3ENHA 3VEOA 5AQOA 4IWVA 4MO5A 5LY3A 5LJVA 5EX5A 2P9NA 3BUZB 4BRIA 4HWIA 4CZJA 1K8KA 3VEZA 5B8HA 2A6AA 2FF3B 1LCUA 2P9LB 2YI1A 2W40A 2NLXA 4BRPA 4FWQA 3QB0A 3F9MA 2Q0RA 1U2VA 3EL2A 5AQWA 3S41A 3DXKB 4FWKA 3WXKA 2E20A 3QBWA 5ADXA 2A42A 2E88A 4HTLA 4H5VA 5BPMA 3MN9A 5BRFA 3LM9A 1S22A 3MDQA 2GTDA 3ZETA 4J8FA 3WXIA 3R9PA 5AQFA 4IJAA 3I8BA 5AZJB 3HTVA 4CBUA 3OHRA 5I9EB 4BR5A 3UKUB 5FPNA 3AAPA 1RGIA 3FGUA 4FWRA 4CJ7A 1IG8A 4BRNA 5LJWA 1V4TA 3BEXA 3KZBA 2E2QA 2AA4A 1QQNA 3CI5A 1JCFA 1QQMA 3LDNA 3D2EB 2E2OA 2CH6A 2QXLA 4FWSA 4BC4A 2ZWHA 3QFUA 2GUPA 1E4GT 3WEEA 5AQMA 1XC3A 4WQ4C 1YXQA 2FSKA 4PKGA 2P9SB 1BO5O 4BRGA 5FPDA 4H5RA 4GNIA 3KVGA 4I6MA 4FOEA 5AQJA 3KHYA 1EQYA 2QW9A 4H0OA 4K42A 5BN9A 4M7XA 4WQ4A 1X9JA 2P9KA 5E26A 3VEXA 4M63C 4AM6A 4B1WB 4BREA 2PAVA 1SQKA 2Q97A 1DEJA 3VENA 4B1XB 1C0GA 4CBWA 3MN6A 3SMSA 1WUAA 4FPBA 3UKRB 2FSJA 3IUCA 1RFQA 4BRHA 5AQNA 4JN4A 2FSNA 1T6DA 3MN5A 2GELA 3J8AA 1WOQA 4FOIA 4PL8A 4XH4A 5AZIA 2QWOA 1JCGA 2QWNA 3FZLA 4QS7A 4DB3A 4BRKA 3LL3A 1BOTO 3ULEB 5BREA 4K25A 5FPMA 3MN7A 4BR2A 3D7EO 3MMVA 5AQKA 5AQUA 1MA9B 5BPNA 1Z05A 3EN9A 1P8ZA 2FXUA 1LOTB 1HUXA 4H5TA 2DPNA 4BQLA 1NWKA 2OANA 1HKBA 5AQRA 2FF6A 2ZF5O 1ATRA 3H6EA 4CZIA 3DXKA 3VPZA 1ATSA 3I33A 1H1VA 1NLVA 3WQUA 4MLHA 2BTFA 4PKIA 2AP1A 1X3MA 2CH5A 2P9UA 2ZGZA 4BQZA 1GLCG 5JLFA 4XH5A 3EO3A 3FZHA 1E4FT 3CQYA 4BROA 1TUUA 5FPEA 4IJNA 5EOYA 4CZEA 1T44A 3O1BA 2Q2RA 4JHDA 3SJHA 5AFUA 2P9IB 1HKCA 1TYQB 4ISEA 5AZJA 1BWFO 3CJ1A 2E1YA 3CQXA 4FWPA 1NGCA 2A41A 3U8XA 2YHYA 2E2PA 5AR0A 4A2AA 4Y0WA 2YJEA 4H5NA 4B1VA 2Q0UA 3HSCA 5KPTA 4A62A 3B8AX 1KXPA 4BVOA 1ZBSA 3W3DA 4EAHD 1MDUB 2BUPA 5F0XA 2D0OA 2QWRA 4AM7A 4YDUC 4CZKA 5BN8A 3A5OC 3DAWA 2YHWA 2PBDA 4IZ9A 4M7YA 2P9PB 3M1FA 4JD2B 2I7PA 3EKSA 4YDUA 4CBXA 1RDWX 1ESVA 3AAQA 4H5WA 1V4SA 3MCPA 4CZMA 3ZX2A 4BC5A 1SZ2A 3ZX0A 1ZXOA 2P9NB 3O6WA 3WXJA 3VEVA 1BG3A 4RWTA 5AQXA 1K8KB 5KPRA 3GBTA 2EWSA 3UKRA 1QZ6A 2GWKA 1GLBG 2A40A 3CETA 4BC3A 4K41A 5AQPA 2CGKA 3M6GA 1U2VB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1VAZA 3P39A 3V6DA 4DTRA 2G8UA 3LDPA 5J2PA 2I7NA 3TPQA 2DFHA 4CGFA 3MECA 1J53A 3S5TA 2JWLA 3QIPA 3ULEA 3VF6A 5KGWA 1BA1A 1OKJA 3LANA 3OYDA 3ULDA 1C1BA 2J4RA 1HKGA 3H1QA 3R8EA 3QEXA 3VTHA 1K8AO 3TSPA 3J7YP 3DLKA 1ATNA 1NNEA 2IVOA 4JAXA 3PUFA 2KZMA 3FE1A 5C2DA 1CZAN 3MCAB 2IDOA 1AYJA 4CEAA 3D2FA 4FJMA 3G71N 3VN5A 2I61A 2HF4A 3U9DA 2HF3A 1TUYA 3V9UA 3PO4A 3SCXA 4CJKA 1RTDA 4DFMA 2YJFA 4JKEA 4RW6A 1B9FA 1DJTA 1XMQK 5MLCQ 3T1AA 2P1JA 4ISFA 2HHVA 1ITGA 5CYMA 1XC9A 4CGJA 1YUWA 5JLHA 3U6FA 4FCYA 2VG6A 4CZHA 3QEVA 3TABA 2NRRA 3OBYA 4RTFD 3AA4A 4CGHA 4UAFE 1JCEA 2UXBK 4F2RA 4FXDA 2YNFA 5AQSA 3CFRA 3MK6A 3IG1A 5HBMA 4FSVA 4CF0A 5AZIB 2GL1A 3G10A 3TWHA 3VQDA 2YNIA 4G9ZA 1XI1A 3SUPA 4CJWA 2D56A 1X3NA 5J1EA 2CGLA 2YKNA 4LF4K 1R0AA 2O8BA 4K0KK 4WQ5A 3B6PA 3A2FA 2OPPA 3JSMA 3E1YA 2BE2A 3BZKA 3DWLA 3RMBA 3OA9A 4Z4FA 1RTHA 4LC9B 3HBTA 1PTXA 4CFCA 1SKWA 3H08A 3R6MA 3H3OB 2P9SA 3LPTA 3LWLA 2BH1A 4YOTA 4GV3A 4N76A 1UAXA 3F73A 1J6ZA 3P1GA 3M8PA 3TTCA 1FK9A 1WNSA 1ZBIA 3J80O 3AVCA 1JKHA 3TTFA 5EVZA 3K0SA 5GADP 3HVRA 4JHDB 4DR6K 1KLMA 3P31A 2VGMA 3IFRA 3OYFA 1S9EA 1GLEG 5AQZA 3QDKA 3GKUA 1LWFA 5LMNK 2V7ZA 2CGJA 1K73O 2V7YA 5SZTA 2ASPA 3V4IA 4DS4A 3CC7N 4DU3A 4DV3K 1ZC6A 4E7LA 4CECA 1IG9A 4MDAA 4OPAA 1NGEA 1IV0A 1KFSA 5KGXA 3DRPA 3M8QA 3GDQA 1RNHA 4CZLA 3PX0A 2H3GX 4M3UA 2B4JA 3AVBA 3JS6A 1BU6O 1XRSB 3DLGA 3OW2M 3RR7A 4CJSA 2B68A 4OKKA 1I2UA 1SKRA 1L3TA 1L3UA 1T7AA 1HYVA 4ILJA 4H0YB 3MEGA 3PIOL 4BRFA 3ITHA 4ELUA 3DM2A 1Q86O 4IO8A 1Z6RA 4O5FA 1NKEA 2HHTA 1U48A 3NGYA 2N2RA 1I6GA 1CLQA 2Q1NA 4I2PA 1NK8A 3IDHA 3JYTA 1NU0A 5AQVA 2YEOA 4BR9A 3NGZA 2HHIA 3V9ZA 4BG9A 4AQYK 5ADXH 3NAEA 3SAFA 5BPLA 4GY2B 2Z1GA 3PO5A 3DRRA 1CN2A 4BRAA 1IKYA 4DLGA 1X9MA 3KLFA 3S9HA 1L5UA 4DSFA 4UJ0A 4XH1A 2W41A 4JD2A 4NCGA 2OYQA 3R3LA 3ID8A 1WBBA 4DQRA 1GLDG 1MR4A 1LWCA 2NZTA 4KAZA 4B3OA 2EHGA 5EX5A 1K8BA 1ZUTA 2YILA 1VK0A 4DQPA 2KZZA 3QNOA 1VRTA 3VEZA 1VRUA 2P9LB 2YI1A 4A59A 1ZBHA 1CHZA 2NLXA 4BRPA 5KRSA 1HQUA 2NUBA 2W6KA 3O4NA 4FJHA 3RMDA 2Q0RA 3S41A 3K58A 3G0ZA 4FWKA 2YHAA 2UU9K 3WXKA 2E20A 3K5OA 3QBWA 4JI6K 2A42A 2E88A 1NJXA 2YIPA 3DLHA 1JLBA 4KTWA 4IBNA 1NPIA 2KBJA 1ZVGA 4FK4A 3ZETA 1BQNA 2E3GA 3ZSOA 4FLUA 1HQEA 3D6RA 1RDCA 4IJAA 3LWMA 3O3HA 4DV0K 3OYLA 5I9EB 4O55A 3I56N 5FPNA 5J2QA 4FWRA 3O9TA 2YHBA 3BGRA 2KFZA 3N4QA 3LDSA 4LF6K 1BQMA 3BEXA 3IS9A 3KZBA 4Y1CA 4DU1A 3AO5A 1T3VA 3L2QA 1QQMA 4U67L 1S72N 1Q82O 3LP1A 4K8ZA 1IKWA 2RF2A 3I0RA 4B9NA 1E4GT 1XC3A 1YJ9N 4PKGA 1QSSA 1WBDA 4CFAA 3PY8A 4BRGA 4JK9A 1B7DA 3KVGA 4WFBL 2F4VK 4IOCL 1EQYA 2QW9A 1TKZA 5BN9A 4M7XA 1WN7A 2P9KA 2O8DB 3SAHA 4I7FA 2Q97A 1NG9A 4O5BA 3E7UX 4NLCA 4RW8A 2G2KA 4FPBA 3UKRB 1VQ7N 4GKJK 2D5RA 3K59A 1RFQA 4CIEA 4QOZB 4JN4A 4DTNA 4FM2A 4C8NA 2VWKA 4FOIA 4PL8A 4M3ZA 5JENA 1C1AA 4JI8K 3E7RL 3KKSA 4DTSA 4QAGA 3FZLA 4Z0UA 1BOTO 4X65K 1U45A 3O9SA 4K25A 2EX3A 1I94K 1LW2A 4BR2A 1RBTA 4Z4GA 4IO9L 2LR3A 1C56A 2SN3A 4DTMA 1YHQN 1C6VA 1MYNA 4GVEA 1U04A 3M8RA 4Z4HA 3MXJA 1HUXA 4H5TA 3VTIA 2DPNA 4V1DC 1VSLA 1HKBA 5AQRA 3DRSA 2HBKA 3H6EA 4CZIA 1BISA 3VPZA 4F2SA 3EE9A 1ATSA 1ILYA 3I33A 1NLVA 1CXQA 3WQUA 5M1KA 2R7YA 3KWGA 2CH5A 2P9UA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1VAZ A;  3P39 A;  3V6D A;  4DTR A;  2G8U A;  3LDP A;  5J2P A;  2I7N A;  3TPQ A;  2DFH A;  4CGF A;  3MEC A;  1J53 A;  3S5T A;  2JWL A;  3QIP A;  3ULE A;  3VF6 A;  5KGW A;  1BA1 A;  1OKJ A;  3LAN A;  3OYD A;  3ULD A;  1C1B A;  2J4R A;  1HKG A;  3H1Q A;  3R8E A;  3QEX A;  3VTH A;  1K8A O;  3TSP A;  3J7Y P;  3DLK A;  1ATN A;  1NNE A;  2IVO A;  4JAX A;  3PUF A;  2KZM A;  3FE1 A;  5C2D A;  1CZA N;  3MCA B;  2IDO A;  1AYJ A;  4CEA A;  3D2F A;  4FJM A;  3G71 N;  3VN5 A;  2I61 A;  2HF4 A;  3U9D A;  2HF3 A;  1TUY A;  3V9U A;  3PO4 A;  3SCX A;  4CJK A;  1RTD A;  4DFM A;  2YJF A;  4JKE A;  4RW6 A;  1B9F A;  1DJT A;  1XMQ K;  5MLC Q;  3T1A A;  2P1J A;  4ISF A;  2HHV A;  1ITG A;  5CYM A;  1XC9 A;  4CGJ A;  1YUW A;  5JLH A;  3U6F A;  4FCY A;  2VG6 A;  4CZH A;  3QEV A;  3TAB A;  2NRR A;  3OBY A;  4RTF D;  3AA4 A;  4CGH A;  4UAF E;  1JCE A;  2UXB K;  4F2R A;  4FXD A;  2YNF A;  5AQS A;  3CFR A;  3MK6 A;  3IG1 A;  5HBM A;  4FSV A;  4CF0 A;  5AZI B;  2GL1 A;  3G10 A;  3TWH A;  3VQD A;  2YNI A;  4G9Z A;  1XI1 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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