5EXWA

Crystal structure of human grp78 (70kda heat shock protein 5 / bip) atpase domain in complex with 7-deaza-atp
Total Genus 118
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
118
sequence length
381
structure length
381
Chain Sequence
VGTVVGIDLGTTYSCVGVFKNGRVEIIANDQGNRITPSYVAFTPEGERLIGDAAKNQLTSNPENTVFDAKRLIGRTWNDPSVQQDIKFLPFKVVEKKTKPYIQVDIGGGQTKTFAPEEISAMVLTKMKETAEAYLGKKVTHAVVTVPAYFNDAQRQATKDAGTIAGLNVMRIINEPTAAAIAYGLDKREGEKNILVFDLGGGTFDVSLLTIDNGVFEVVATNGDTHLGGEDFDQRVMEHFIKLYKKKTGKDVRKDNRAVQKLRREVEKAKRALSSQHQARIEIESFYEGEDFSETLTRAKFEELNMDLFRSTMKPVQKVLEDSDLKKSDIDEIVLVGGSTRIPKIQQLVKEFFNGKEPSRGINPDEAVAYGAAVQAGVLSG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Chaperone
molecule keywords 78 kDa glucose-regulated protein
publication title Probing the ATP Site of GRP78 with Nucleotide Triphosphate Analogs.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 118
structure length 381
sequence length 381
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.6.4.10: Non-chaperonin molecular chaperone ATPase.
pdb deposition date 2015-11-24
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5exwA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5exwA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5exwA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5exwA04
1QQOA 4CBWA 4BROA 2E2PA 1HKCA 3H6EA 4FWNA 3QICA 3R9PA 1NWKA 3O8MA 1QHAA 3DJCA 5BREA 2OANA 4BRKA 4H5WA 5AQXA 4CZEA 1RDWX 3CHWA 4FWQA 4FWRA 2Q0RA 4BR7A 4BQZA 1ZXOA 3LM9A 3R6MA 1BA1A 4A62A 3CERA 3WEEB 3DXKA 3ENHA 1XC3A 2GUPA 1WOQA 3D2FB 2V7ZA 3SJHA 4CD1A 4IWVA 2IVNA 2E2QA 4BC3A 1R59O 4BR4A 3O1WA 1J6ZA 1BG3A 1JCGA 2Q97A 2E20A 3ATUA 4CBXA 5E84A 3D2EB 1BUPA 2AA4A 1MDUB 1HJOA 2A41A 4XH4A 3U4LA 3VPZA 4BREA 3VEVA 2CGLA 3JXUA 3I8BA 3L4IA 2YJFA 3KZBA 4BRGA 3VENA 3VEWA 4J8FA 4CZJA 3CJCA 4FWSA 4FPBA 4H0YB 4BVPA 5BN8A 3QFUA 3FZFA 4FWPA 4H0OA 3MCPA 4BR9A 1OKJA 4PKGA 1QZ5A 2P9NA 3U9DA 1LCUA 4BRDA 1Q18A 1SZ2A 5AQWA 5AQLA 1MWMA 1NGDA 3GL1A 1JCEA 3OHRA 2E2NA 3DXMB 3ID8A 1HKGA 3HBTA 3C7NA 2W40A 3F9MA 4K42A 5CE3A 3RSEA 4H5RA 5AZJB 1KXPA 2I7NA 2PBDA 2YI1A 4FWMA 2HF4A 1TUUA 4PL8A 3WXLA 3U9ZA 4BVOA 3IDHA 2FSKA 4B1ZA 3QBXA 2P9LA 4NO7A 2CH5A 3LDLA 3DWLA 3SMPA 1WUAA 4FWKA 4EAHD 2P9KB 3MN9A 5AZIA 3ZX0A 5AQFA 4MO4A 3IUCA 4CI6A 5FPEA 3FE1A 3ZX3A 2YHWA 5BRHA 1Z6RA 2AP1A 3EKSA 2FF6A 3M1FA 1GLEG 2QWPA 4XH5A 3L6QA 1XQSC 3DXKB 2CH6A 1GLBG 2V51B 2IVOA 3WXIA 4E1JA 3SMSA 5JMVA 2FXUA 4EIAA 3UKUA 4H5VA 4WQ5A 3WQTA 3LDPA 4H0TB 2D0OA 4BGAA 3L0QA 3VETA 4BR0A 1DKGD 3ZETA 2D4WA 4CD3A 3A0IX 3R8EA 3LDOA 4IJNA 3UB5A 3H3NO 2W41A 5F1XA 4FL9A 5FPMA 3AAPA 5ELZA 1YXQA 4CZGA 2E88A 3QFPA 3VGKA 4F9OA 3HM8A 2P9NB 3TPQA 2DPNA 4MO5A 3I33A 1T6DA 4IO8A 2V52B 3QBWA 4RTFD 4BG9A 1GLFO 5FPDA 3WUHA 3BEXA 1KAXA 1BOTO 2EWSA 4PKHA 2F9WA 3CJ9A 3HSCA 1T44A 3W0LA 2GTDA 3C7NB 3S41A 4A2AA 3O4WA 4WQ5C 3ZEUA 4HWIA 2GWKA 2J4RA 1S22A 3KHYA 4FWOA 2P9SA 1QZ6A 3GG4A 3ATVA 2ASPA 3BF3A 3WXKA 3GOIA 3VGLA 3HTVA 1S3XA 4DCHA 4CZLA 1GLLO 2NLXA 4BG8A 2YCHA 4IZ9A 2HF3A 4DQ8A 2A6AA 1XUPO 1NGFA 3FZHA 5FPNA 2GWJA 5BRFA 3WT0A 5AQNA 5AZIB 3ULEA 3HZ6A 1TUYA 4L3QA 4K25A 3CI5A 3H1QA 3O80A 3SLCA 3CJ7A 4BR5A 2PAVA 4WYBA 5AFUA 1BA0A 3D7EO 4JNEA 5JLHA 2P9PA 2ZGZA 1NMDA 4GNIA 2NZTA 3C0BA 2E8AA 2A5XA 4MLHA 4QS8A 3A8YA 1K8KA 2E2OA 2Q2RA 3MN7A 4FO0A 4ISEA 3VF2A 5BPNA 5KPRA 4B1YB 1SQKA 4H0VB 5AQHA 3ZETB 3MMVA 1NM1A 4QS9A 3P4IA 4I6MB 5AQRA 5KQDA 3LM2A 4B1XB 2QM1A 5AQGA 4M7YA 5JICA 1YUWA 3EKUA 3WXJA 1ZC6A 3VEOA 1BWFO 3DAWA 5ADXA 4FOEA 3EN9A 5AQVA 4H03B 1NGHA 3ZX2A 3JS6A 3IMXA 5LY3A 1U2VA 3H45C 3O08A 2H3GX 1NGJA 3QMLA 3HI0A 3BUZB 4HTLA 4YDUA 1X3MA 3ZEUB 3FZLA 4CZMA 3WEEA 1GLJO 4EHUA 2CGJA 4MLEA 2E1YA 4H0XB 4CZIA 1YAGA 1C0FA 3VOVA 1U6ZA 1V4TA 2GELA 4BRHA 5F2RA 4CZHA 2P9IA 4O8KA 1BO5O 5AQJA 5TKYA 4KBOA 2QXLA 4BQLA 4BRNA 2YHXA 1QQNA 1EQYA 3D2EA 2F9TA 4WQ4A 1HKBA 4H5NA 4FOIA 1NBWA 3ULEB 3W3DA 5BRDA 4PL7A 2ZGYA 4BRFA 4QS7A 3AAQA 4XH1A 1GLCG 4LC9B 2E1ZA 2Q1NA 2ZWHA 1HPMA 1ZBSA 1HX1A 5LJWA 2P9PB 3SK3A 4BR2A 2YJEA 2IVPA 5JLFA 5LJVA 4DHYA 4GY2B 1TYQA 3VERA 4Z94A 1K8KB 2A42A 1MA9B 3VF6A 3DXMA 4BC5A 1D4XA 4Y0WA 3GE1A 5AQTA 5EX5A 2FSJA 2ITMA 4CZFA 1DGKN 2Q31A 5AZJA 2HOEA 3O1BA 4RWTA 2BUPA 3VEYA 1ATSA 2YHYA 3RSEB 4FSVA 2BTFA 4WQ4C 3CJBA 5E26A 4A61A 3EO3A 3BF1A 3FGUA 3MN5A 3TU5A 1Z05A 1DEJA 1GLAG 2WUSA 3GDQA 5EOYA 1ATNA 3EZWA 4C23A 2QWMA 2P9LB 5AQUA 3ENOA 1U2VB 3GBTA 5BR9A 1ATRA 1GLDG 2QWRA 1BDGA 2P9KA 4JHDA 1IJJA 5KPZA 5F0XA 3A5MC 1JCFA 3G25A 1P8ZA 5AQSA 3H1VX 2VWBA 2GEMA 4H5TA 2D0PA 4B9QA 2D1KA 4O5FA 3LDNA 1KAZA 1E4FT 4BC2A 3VGMA 4BRPA 4BRAA 3FFKB 3FLCO 3VEXA 1IG8A 1Y64A 2P9IB 3M6GA 2Q36A 3UKUB 3CQXA 3A5LC 1NGGA 4H0PA 5I9EB 3UKRA 5EXWA 2FF3B 2P9UA 2CGKA 4FWLA 4JD2A 3MDQA 4BRIA 4BRLA 3CQYA 5AQMA 3U8XA 3QB0A 2UYTA 4K41A 3WQUA 1LOTB 1NGBA 1ESVA 1TYQB 5AFUH 5KQ8A 1RGIA 2VCPA 4AM7A 1SAZA 4PKIA 4CZKA 4B1WB 3H46O 3LL3A 5B8HA 2QWOA 4AM6A 1X3NA 2QWLA 1E4GT 4BGBA 3KVGA 5AQQA 4JAXA 1NGIA 4RCHA 4EFHA 4ISFA 1X9JA 4BRMA 2FSNA 1NGEA 2ASMA 2A40A 3CIPA 3EL2A 2ASOA 4NB4A 1YVNA 3LDQA 4XEIA 4DB3A 2P9SB 4EHTA 1KAYA 1BU6O 3IFRA 3QDKA 4FPAA 3D2FA 3FZMA 3J8AA 3MK6A 3B8AX 3H3OB 1MWKA 5KPTA 4B1VA 4CBUA 5AQPA 1NGCA 1V4SA 3O5BA 4BRCA 3CJ1A 4JHDB 5ADXH 3FR0A 2QWNA 1QQMA 1NGAA 3VESA 2IIRA 2ZF5O 5AQYA 1HLUA 4IJAA 4CJ7A 3A5NC 4ISGA 3M3ZA 3CJAA 4K43A 4BRQA 3VEZA 2I7PA 4BC4A 4M63C 3FZKA 4IXCA 4YDUC 5BPLA 3UE5A 2Q0UA 1RFQA 1C0GA 3MN6A 3VF4A 3AARA 3AY9A 5AQZA 3O6WA 1CZAN 1HUXA 4A2BA 3UKRB 2KHOA 1H1VA 2P9UB 2VYPA 3BP8A 4I6MA 5AQOA 1T6CA 5AR0A 4JD2B 5BPMA 5EY4A 4JN4A 3CETA 2FLOA 2V7YA 5AQKA 5EVZA 4M7XA 2QWQA 2QW9A 5AQIA 1NLVA 3A5OC 2HMPA 4B1UB 5BN9A 2A3ZA 1G99A 2NRHA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4FLZA 3VQQA 2X74A 3JYTA 1A5XA 1YIJN 3R9PA 4KH5A 2UXCK 2RKIA 4YOTA 4C8KA 1JLGA 3GKUA 3DJCA 1KRPA 1NJXA 3WNFA 3CCVN 3DRSA 5AQXA 3RMAA 1YHQN 1OH6A 1RDWX 3T3FA 1BA1A 1WMTA 3TANA 3DXKA 3ENHA 2HBKA 2E6MA 2E0HA 3DMJA 1RDAA 1S1VA 4FJLA 2E2QA 1R59O 3RVCA 1BG3A 4CBXA 1YVUA 3I0RA 2AA4A 3U4LA 4J2DA 1HJOA 2A41A 3VPZA 4LFAK 1T3VA 2CGLA 2QKBA 3KZBA 1RT7A 4E3SA 1KTQA 2KZZA 4CZJA 2FBVA 2YNHA 5HOOA 5CY0A 2E4LA 4FWSA 1XC9A 3HM9A 1VSMA 4H0YB 4OGEA 3C6TA 3QFUA 3FZFA 4M41A 4H0OA 5LMNK 1ASWA 1FXXA 3TSPA 1HNIA 4AQYK 4CJLA 4DQSA 5GIPA 3AA3A 1YT3A 4FJGA 5A2QO 1JXCA 1TAUA 1JCEA 3MXMA 4CF2A 1XI1A 1HKGA 3CFOA 3ZSOA 3F9MA 4K42A 3TARA 5CE3A 5GINA 3AVCA 4H5RA 3OYBA 1ZBHA 1KV0A 1EO1A 4PUOA 3D0PA 4MQ3A 4PL8A 1I39A 1ZYWA 3WXLA 3U9ZA 2YIPA 4GKJK 1NJWA 4YOUA 4U7BA 1NK7A 2E5LK 4LF7K 4DSEA 3OJSA 3QBXA 2WTUA 2CH5A 5CHIA 1T05A 3SMPA 3OA9A 1TV6A 4O55A 5AJ3K 1Q8IA 5FDLA 2ASCA 2P9KB 1O13A 3MN9A 1N5YA 4B3MK 1BK8A 4BDPA 3LWMA 5FPEA 3SF4D 4KHNA 2YHWA 5BRHA 3SAFA 1ILYA 4OX9K 4FLXA 4CHNA 3N4QA 3TABA 2V51B 2IVOA 3WXIA 4B3RK 4E1JA 3OS2A 4ILGB 4ICLA 2B6AA 3WQTA 3ZT2A 2W6LA 1T8EA 2D0OA 3TWHA 2UU9K 4KH4A 4UJ0A 3VETA 4R79A 1DKGD 3A0IX 4CJTA 1WBBA 1S5JA 3H3NO 4JK8A 4FL9A 4IEIA 2NY9X 1Q82O 4KAZA 3OS1A 1YXQA 4U67L 3QETA 4CECA 4O0IA 3O4QA 4CE9A 4CESA 1RDUA 2D5RA 2P9NB 4CF9A 2DPNA 3K58A 3I33A 3QBWA 3KP0A 1T1TA 1T6DA 2VG7A 3E66A 2N2QA 3TR8A 3BEXA 4JK7A 1C0UA 1EXQA 4PKHA 3CJ9A 2ZJQL 3HSCA 3C7NB 4M45A 3DOLA 4IKFA 1DLOA 2J4RA 2DTUA 2O8FB 2ASPA 3BF3A 3WXKA 4ZHRA 2VWJA 1S3XA 4CZLA 4MDAA 3SPYA 1YI2N 3LAKA 4DQ8A 4KHQA 2KYQA 1VQ8N 1CLQA 3IAYA 5AZIB 4CJQA 4WFNL 4L3QA 4DQRA 4KI6A 3H1QA 3O80A 4GW6A 1YJWN 4LY7A 4CGJA 4DTXA 1BHLA 4GKKK 3C6UA 5H1SQ 2PAVA 3KKRA 3IKMA 4WYBA 5AFUA 4KHUA 4JNEA 1CHZA 3TAQA 2ZGZA 2YNFA 1TL1A 3VQ9A 4GNIA 3QEIA 4AILC 5I42A 1ZBLA 2HVIA 3Q7BA 2ATQA 4QS8A 3A8YA 1K8KA 2E2OA 3DI6A 2KFZA 2Q2RA 3MN7A 4ISEA 4AHCA 1U49A 4AF1A 1JXEA 1S1UA 5J2NA 1SQKA 3MMVA 2QA4N 1NM1A 5AQRA 2KLAA 3CG7A 1KQSM 2QM1A 5AQGA 4M7YA 4YOYA 3WXJA 3DLRA 3QLHA 1ZBIA 1BWFO 1O1WA 2OZMA 2C1GA 4IDHA 3SUPA 4FOEA 3PO4A 1N33K 4H03B 3AO3A 2Z1HA 3R2VA 2IOCA 2RHKA 3V1RA 2UUBK 1NK8A 3NBPA 3NE6A 3M8RA 3OY9A 2HBJA 2YNGA 5JS2A 1DJTA 3QO9A 2PZSA 4HE7A 1Y97A 1X3MA 2F7TA 3CFRA 3KOXA 1C6VA 1GLJO 1IKYA 2CGJA 4CZIA 5KGXA 1C0FA 1CZBA 1S72N 1IBMK 1X9SA 3MX2A 5F2RA 4TSXA 3SBGA 4CJ3A 3HT3A 3RMDA 4ID1A 1HYZA 5DM7L 4LFBK 1ZYQA 4CJEA 1QQNA 2F9TA 3SPZA 4WQ4A 1LQIA 5KGWA 3O9TA 4B9NA 4JKCA 4FJ9A 3OYGA 3ULEB 5BRDA 1DTQA 4CF1A 4PL7A 3SJJA 2N2RA 3O9SA 5HRSA 4DQIA 1T7BA 4CGHA 1NU0A 2E1ZA 2ZWHA 4ZTJA 1RBUA 1ZBSA 1HX1A 3K5NA 4I2QA 3THXA 1EKEA 5LJWA 3QEVA 4FK0A 3BY5A 3P31A 1RTJA 1XMQK 1ZFUA 5JLFA 1LAVA 1K8AO 2YKNA 3RRHA 3PX6A 5HP1A 3KK7A 3N4PA 4DR5K 3KOWA 3KK2A 3SYZA 3DXMA 4BC5A 5GAEP 1OH7A 5C15A 4FJXA 5HBMA 4DLGA 3O3GA 2HOEA 3CC2N 2KBJA 1JZBA 4RWTA 2BUPA 3RSEB 4FSVA 3WXMB 4I2PA 1RTIA 5E26A 1KC8O 4A61A 4A57A 1Z05A 3ZSXA 2LSNA 2P9LB 4RW7A 4CJ5A 2P51A 1BDGA 1OVYA 1IJJA 3CYGA 3G71N 2WFBA 4HUFA 4E7KA 1Q86O 3BZKA 1NKBA 4H5TA 2OZSA 5IT9O 4B3OA 1OMYA 1N32K 1A5VA 2XRIA 4I9LA 2HMIA 2LJ7A 3FFKB 3FLCO 4DUYK 3VEXA 4DR3K 1Y64A 1VQON 2Q36A 1T03A 1J54A 2KQ2A 3DLEA 3HPHA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 5AQI A;  1NLV A;  3A5O C;  2HMP A;  4B1U B;  5BN9 A;  2A3Z A;  1G99 A;  2NRH A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 4FLZ A;  3VQQ A;  2X74 A;  3JYT A;  1A5X A;  1YIJ N;  3R9P A;  4KH5 A;  2UXC K;  2RKI A;  4YOT A;  4C8K A;  1JLG A;  3GKU A;  3DJC A;  1KRP A;  1NJX A;  3WNF A;  3CCV N;  3DRS A;  5AQX A;  3RMA A;  1YHQ N;  1OH6 A;  1RDW X;  3T3F A;  1BA1 A;  1WMT A;  3TAN A;  3DXK A;  3ENH A;  2HBK A;  2E6M A;  2E0H A;  3DMJ A;  1RDA A;  1S1V A;  4FJL A;  2E2Q A;  1R59 O;  3RVC A;  1BG3 A;  4CBX A;  1YVU A;  3I0R A;  2AA4 A;  3U4L A;  4J2D A;  1HJO A;  2A41 A;  3VPZ A;  4LFA K;  1T3V A;  2CGL A;  2QKB A;  3KZB A;  1RT7 A;  4E3S A;  1KTQ A;  2KZZ A;  4CZJ A;  2FBV A;  2YNH A;  5HOO A;  5CY0 A;  2E4L A;  4FWS A;  1XC9 A;  3HM9 A;  1VSM A;  4H0Y B;  4OGE A;  3C6T A;  3QFU A;  3FZF A;  4M41 A;  4H0O A;  5LMN K;  1ASW A;  1FXX A;  3TSP A;  1HNI A;  4AQY K;  4CJL A;  4DQS A;  5GIP A;  3AA3 A;  1YT3 A;  4FJG A;  5A2Q O;  1JXC A;  1TAU A;  1JCE A;  3MXM A;  4CF2 A;  1XI1 A;  1HKG A;  3CFO A;  3ZSO A;  3F9M A;  4K42 A;  3TAR A;  5CE3 A;  5GIN A;  3AVC A;  4H5R A;  3OYB A;  1ZBH A;  1KV0 A;  1EO1 A;  4PUO A;  3D0P A; 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