5EY4A

Crystal structure of human grp78 (70kda heat shock protein 5 / bip) atpase domain in complex with 2'-deoxy-atp
Total Genus 118
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
118
sequence length
382
structure length
378
Chain Sequence
DVGTVVGIDLGTTYSCVGVFKNGRVEIIANDQGNRITPSYVAFTPEGERLIGDAAKNQLTSNPENTVFDAKRLIGRTWNDPSVQQDIKFLPFKVVEKKTKPYIQVDITKTFAPEEISAMVLTKMKETAEAYLGKKVTHAVVTVPAYFNDAQRQATKDAGTIAGLNVMRIINEPTAAAIAYGLDKREGEKNILVFDLGGGTFDVSLLTIDNGVFEVVATNGDTHLGGEDFDQRVMEHFIKLYKKKTGKDVRKDNRAVQKLRREVEKAKRALSSQHQARIEIESFYEGEDFSETLTRAKFEELNMDLFRSTMKPVQKVLEDSDLKKSDIDEIVLVGGSTRIPKIQQLVKEFFNGKEPSRGINPDEAVAYGAAVQAGVLSG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Chaperone
molecule keywords 78 kDa glucose-regulated protein
publication title Probing the ATP Site of GRP78 with Nucleotide Triphosphate Analogs.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 118
structure length 378
sequence length 382
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.6.4.10: Non-chaperonin molecular chaperone ATPase.
pdb deposition date 2015-11-24
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5ey4A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5ey4A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5ey4A03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5ey4A04
2F9WA 4BQLA 4QS9A 4ISFA 1S22A 4BRKA 1DGKN 1KXPA 2P9SB 4RTFD 2GUPA 5E26A 1HKBA 1QZ6A 2HF3A 2YCHA 5AQWA 3HI0A 3CJ9A 2E2PA 4NB4A 4BRHA 1NBWA 4CBUA 2YHWA 4MO4A 1U2VA 3GBTA 4CBWA 1RGIA 4B1ZA 1GLFO 1HKCA 3ENHA 4IXCA 4B1WB 3J8AA 4HTLA 1R59O 3O1BA 3WQTA 1ZBSA 1BA0A 4QS8A 1YVNA 4H0TB 2P9NA 4FWSA 4L3QA 3WQUA 5LJVA 1T44A 3EKSA 3A5MC 5JICA 1X9JA 4A61A 4LC9B 3MK6A 1CZAN 1LOTB 3DXMB 2A42A 4IJAA 3I8BA 4K25A 1NGIA 4FSVA 4BC4A 3FZMA 3BF1A 1XC3A 1EQYA 2BTFA 4JD2A 4CJ7A 2A6AA 2F9TA 3ZX3A 4H5NA 3DAWA 4RCHA 1GLLO 1ATNA 2I7NA 3GE1A 2Q0UA 5AFUH 2OANA 3QFUA 3H46O 4BVPA 3VETA 3IMXA 2P9LA 1ZXOA 1K8KB 3D2EA 1X3MA 5AR0A 2FF3B 2VYPA 3LM9A 2QWPA 3QICA 5AQRA 3BEXA 3L6QA 1BA1A 4B1VA 5AQSA 2WUSA 2Q31A 3A0IX 2ASPA 3FFKB 2FF6A 2BUPA 4PL7A 2A41A 1GLAG 4O8KA 4CZEA 5JLFA 3ID8A 5EY4A 4CD1A 3IDHA 2PBDA 4K41A 3H1VX 2ASOA 2J4RA 3VOVA 3LDLA 4K43A 2QWLA 3QMLA 4BVOA 2CGLA 4IZ9A 3UE5A 1T6DA 5FPEA 1NGDA 5BREA 5ELZA 4JHDA 4BRFA 3MCPA 2IVNA 1S3XA 3EN9A 1Q18A 4PKGA 1X3NA 4KBOA 2Q36A 2E2OA 3LDNA 3DJCA 3H3OB 5CE3A 5AQKA 2DPNA 2V52B 4BG8A 3LDOA 3R6MA 4DB3A 5KPZA 4H5VA 3ZX0A 1JCGA 3L4IA 1BO5O 2CH6A 3C0BA 1DKGD 4AM6A 4CI6A 5EXWA 3CJ1A 5LY3A 3UB5A 3AY9A 4I6MB 2H3GX 3OHRA 4FPAA 3HM8A 2NRHA 3ATVA 3TU5A 4GNIA 3ZEUA 3QBXA 3WXJA 3U8XA 3F9MA 1Z05A 2PAVA 1TUUA 4BR9A 3HTVA 4BROA 3R8EA 4HWIA 2AA4A 5AZIB 4BRNA 2NZTA 1YAGA 4H0YB 4BGBA 4BR4A 3LM2A 4H5TA 1MWMA 3ZETB 5BR9A 2QW9A 2YJEA 3CJCA 3UKUB 4FPBA 3R9PA 3FE1A 1NGFA 1BOTO 2YHXA 5F2RA 3MN7A 1HPMA 3CI5A 3SK3A 3JXUA 2E1YA 2VCPA 1C0GA 1D4XA 1GLEG 3O8MA 2QWOA 4E1JA 5AQOA 1GLBG 4XH5A 2P9PA 4H5WA 3WXLA 3WEEA 2P9IB 2YHYA 3HSCA 3AARA 2NLXA 2FSKA 3QFPA 2QWRA 1Y64A 3VEYA 2GTDA 5KQDA 3VEOA 3RSEA 1TYQB 3A5LC 1RDWX 3FZLA 4B1UB 2QWNA 4H0OA 1OKJA 3SLCA 3AAQA 2UYTA 3VEZA 3CERA 3M3ZA 1BU6O 5AQIA 3A8YA 2IIRA 1KAYA 4I6MA 3FZHA 3DXKA 2P9KA 4BRLA 4DCHA 4BRIA 1NMDA 4WQ4C 2W41A 2D1KA 1WUAA 1NLVA 1NWKA 3CHWA 3UKRB 1LCUA 4WQ4A 2P9UB 1H1VA 1ZC6A 3IFRA 3GG4A 3VERA 3WXKA 3VF4A 2D4WA 2P9SA 1IG8A 1TUYA 1XQSC 1MA9B 4FWPA 3A5NC 3O08A 3D2FB 3CJ7A 3MN5A 5AZJB 5KQ8A 5KPRA 2V7ZA 2D0PA 3W3DA 3VF2A 3WXIA 3I33A 5F1XA 2IVOA 4CZMA 4CZIA 3H6EA 2A5XA 2E2QA 1HJOA 3DWLA 2HMPA 3CQXA 4PKHA 3GOIA 2HOEA 3EO3A 1BWFO 5AQXA 5KPTA 4BRPA 2ZF5O 3W0LA 5BPNA 5AFUA 3C7NB 1WOQA 3KVGA 1QQMA 3B8AX 1KAXA 1E4FT 3DXMA 3ULEB 1NGCA 1U6ZA 5BRFA 3GL1A 4MO5A 3VGKA 5AQNA 4M7YA 2Q2RA 3HBTA 4BC5A 4FWNA 4BQZA 3MMVA 1G99A 3UKRA 3CJBA 5BN8A 3O80A 4CZLA 5ADXH 2ZGZA 4FWLA 4EIAA 1QQOA 1Z6RA 2V51B 3QDKA 3GDQA 4BRGA 3EZWA 3LDPA 4BR2A 4CD3A 1DEJA 4BREA 1J6ZA 5EVZA 2FSNA 3CETA 1K8KA 1YXQA 1U2VB 3G25A 1MDUB 3VEWA 3EL2A 4EHUA 5F0XA 4H0VB 4IWVA 1V4SA 5JMVA 2GWJA 3FZKA 4FWKA 1QHAA 2W40A 4MLHA 4Z94A 1T6CA 3FGUA 3VEVA 2E2NA 4FWRA 2P9NB 2QXLA 4K42A 1NM1A 1HLUA 4BRQA 3P4IA 1RFQA 4JNEA 1SAZA 4H03B 4BR7A 1YUWA 5AQZA 3TPQA 4BR5A 3VGLA 3MDQA 2HF4A 5AQVA 3O4WA 4DQ8A 2CGJA 4MLEA 3BP8A 5AQTA 5FPDA 3O6WA 2ITMA 2GWKA 1QQNA 3O5BA 5FPNA 1SQKA 5AQPA 4IJNA 4FOEA 1GLJO 4JD2B 3WT0A 2FLOA 3ATUA 3H45C 4ISGA 3U9DA 5FPMA 1NGEA 4H0XB 3BUZB 5BPLA 1NGBA 1KAZA 4EFHA 2A40A 2P9LB 5EX5A 4RWTA 3D2EB 5AQJA 2E20A 2V7YA 2E1ZA 2YJFA 3MN9A 4A2AA 3ZX2A 4BRMA 2Q97A 4WYBA 4XEIA 4B1YB 1NGGA 4XH4A 4CBXA 4A62A 5AZIA 3SMSA 3LDQA 2CGKA 4WQ5C 3ZETA 5AQLA 4Y0WA 3UKUA 5AQQA 4EAHD 2Q1NA 1QZ5A 4IO8A 4BC3A 3ENOA 3M6GA 4JAXA 3CIPA 1IJJA 3FZFA 3FLCO 4WQ5A 1JCEA 4GY2B 4JHDB 2ASMA 3A5OC 4FWMA 4F9OA 2GELA 2P9IA 4YDUC 3O1WA 2Q0RA 3MN6A 3VGMA 4B9QA 3S41A 3VPZA 3KZBA 5E84A 1ESVA 4BGAA 1TYQA 2KHOA 3H3NO 1ATSA 4YDUA 4BG9A 4CZGA 2E88A 3JS6A 5LJWA 2ZGYA 5BRDA 1HUXA 1SZ2A 2QM1A 4EHTA 4A2BA 5AQHA 1JCFA 5TKYA 5AQYA 4FL9A 2AP1A 4CZJA 2EWSA 4BRAA 5AQUA 4QS7A 3M1FA 1HKGA 4BRDA 3VEXA 3QBWA 3ZEUB 2A3ZA 3D7EO 5BN9A 4FO0A 4NO7A 2GEMA 1P8ZA 4BR0A 5BPMA 2P9UA 3WUHA 3L0QA 4CZKA 3CJAA 4J8FA 1E4GT 1GLCG 5I9EB 3VENA 4B1XB 3FR0A 1GLDG 3U9ZA 3D2FA 4C23A 1BDGA 2E8AA 5AZJA 2FSJA 3LL3A 2QWQA 4H0PA 4DHYA 2CH5A 2P9PB 4O5FA 5EOYA 3WEEB 4AM7A 3CQYA 4BC2A 2YI1A 1MWKA 4CZFA 4PL8A 3RSEB 4JN4A 5ADXA 1NGAA 2IVPA 2I7PA 3U4LA 3VF6A 3SJHA 4CZHA 3SMPA 1NGJA 2FXUA 3AAPA 4FOIA 4BRCA 3HZ6A 5AQGA 5AQMA 3C7NA 1NGHA 4M7XA 1BG3A 5AQFA 2D0OA 1XUPO 1V4TA 2P9KB 3BF3A 3DXKB 3KHYA 3H1QA 4FWOA 4H5RA 4PKIA 1C0FA 5B8HA 4XH1A 3ULEA 1ATRA 3VESA 2QWMA 2VWBA 5JLHA 3EKUA 4ISEA 4M63C 1BUPA 2ZWHA 1HX1A 3QB0A 5BRHA 4FWQA 3IUCA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4JLHA 2PFUA 2KKZA 4QS9A 4FM0A 3BY5A 3BK3C 5E26A 2GUPA 2YHBA 2I5JA 4CJ3A 3ITHA 4UADE 1IBMK 1YF5L 2YCHA 4N41A 3KLFA 3HI0A 3CJ9A 2B68A 3M8PA 4BY9C 3O3HA 4O5BA 1ZVGA 2UUAK 1GPSA 3BGRA 4X64K 3AO1A 1BMRA 4B1ZA 2X78A 1CZ9A 3ENHA 2RKIA 1BQNA 3OYJA 4KB1A 4Z0UA 1ZBSA 4UQGA 3AA2A 3CW4A 1T7PA 3LWLA 1T44A 2HNZA 1Q8IA 3CCRN 4W5OA 4A61A 4LC9B 3MK6A 4JKGA 1CZAN 3V6DA 5J2MA 3M8QA 4I7FA 1EWQA 2KW4A 4DTXA 1K9MO 1BK8A 1HQUA 3L56A 5GAHP 1U49A 4DTNA 1LWFA 2F9TA 3M5RA 3O4NA 3ZX3A 3DAWA 1NMNA 1T7BA 4B08A 3C6UA 3GE1A 2Q0UA 4XIUA 5HRNA 3ENBA 3QI7A 3VETA 3O9QA 4C1NI 4CHYA 3L2WA 1MR4A 3ZSQA 2LT8A 1K8KB 1A5VA 5AR0A 3KKSA 2VYPA 2QWPA 3O3FA 3BEXA 1BA1A 2Q31A 3TAPA 3P83D 4PL7A 2KFZA 2A41A 4OO1J 5JLFA 3VQ9A 3S9HA 4WF9L 4E7JA 4AQYK 2LJMA 2J4RA 3VOVA 2IGIA 2VQFK 2NUBA 2QKKA 4BVOA 3SYZA 4CFAA 2CGLA 4N47A 3RVCA 3RMDA 4KHPK 5BREA 3B6PA 2BDPA 1XHXA 2IVNA 1A5XA 2IDOA 1NK9A 4LY7A 3DLHA 3LDNA 5AQKA 3CPWM 2V52B 1NK7A 3L4QA 3LDOA 2Z1GA 3R6MA 5KGXA 5KPZA 3NAEA 3K2PA 4DLGA 4DR2K 2CH6A 4W5RA 1DKGD 5EXWA 1CZBA 2HNYA 4DTRA 4K8XA 3ZSYA 4I6MB 3SQ4A 3TSQA 3C94A 3OHRA 3TU5A 4NXMK 1KRPA 4GNIA 3V1OA 1O1WA 4BR9A 3R1XA 4BRNA 4H0YB 4BGBA 4BR4A 1B3CA 5BR9A 3UKUB 4DR4K 1E3MA 1BOTO 4PY5A 1ASVA 3CI5A 3JXUA 2E1YA 3PSMA 4DR1K 3QERA 1GLEG 2QWOA 4E1JA 5AQOA 3T19A 4DMNA 3N4QA 1CXUA 2P9PA 4H5WA 4M3RA 5GADP 1RT1A 1W2BM 2YX6A 1NU0A 2Z1IA 2GTDA 1T7AA 5FROA 3TARA 3FZLA 3HVTA 4B1UB 2IAJA 3CCJN 1NJZA 1T7EA 1BU6O 3HPOA 4ICLA 4KB0A 3O9TA 5FLXO 1NH5A 3DLEA 2KBKA 4BRIA 1NMDA 4WQ4C 3D0PA 4LF4K 4CERA 1KV0A 3P5JA 4N56A 3NVKA 2F7TA 4IEEA 3PIPL 4JRPA 1LCUA 1LWEA 4WQ4A 3MX5A 2OZMA 3OYCA 1XMOK 4FJLA 3CCUN 4CJVA 1TI5A 3AA5X 2NY9X 2WTUA 1RBUA 3VF2A 4JS4A 3I33A 4B9VA 3VQ8A 2E2QA 4V19S 3CPEA 3GOIA 3HOSA 4DV6K 4CIEA 3TI0A 2YNGA 4X66K 1EP4A 4JI1K 2O8EA 4YNQA 2KBJA 2LY6A 2WFBA 1S6PA 3C7NB 3HRGA 2ZE2A 1RBTA 1Q9YA 4NCAA 3B8AX 3C6HA 1X1PA 4KHSA 3CG7A 3KLGA 2KLAA 2HBJA 3MAQA 4KV8A 3TR8A 3CCSN 1C1CA 4BC5A 3HBTA 2NRWA 2VG5A 4JK9A 4E7KA 3O80A 5KK4A 3QESA 5ADXH 4EIAA 2ITGA 1OVYA 1TAQA 1Z6RA 1FKOA 1UA0A 4BR2A 2E2FA 1HPZA 2XO7A 1DEJA 5HOOA 1O13A 3HO1A 3PLAA 4LH5A 3QEIA 3G25A 5K14A 1MDUB 3VEWA 4J2DA 1W9HA 4EHUA 1ZBFA 4FLUA 1I6FA 4H0VB 3OJSA 1V4SA 2KQ2A 4EZ9A 3L2UA 3ZT1A 2QXFA 3KP1A 3KK2A 1I3AA 3VEVA 4FWRA 4E7IA 4FJ5A 4K42A 4CCHA 2ASCA 1RFQA 4QCLA 4IOXA 1YUWA 1C56A 2VGMA 2W42A 4JKGB 4FM2A 1DQ7A 3O4WA 2HBMA 4M3UA 4BE1A 3MEDA 1RTJA 3O6WA 4OKKA 5D3GA 1VQ9N 2ZJQL 2A1SA 1JKZA 2ZJPL 4EP5A 4E0DA 1GLJO 4FLXA 3O9RA 5GAGP 2FLOA 4F4KA 5FPMA 3CC2N 5C2FA 1P90A 4JKDA 1NGBA 3NF7A 1VSFA 1ZYWA 4N5SA 3NGIA 4AHRA 2FBYA 2E20A 2V7YA 3MXMA 3MN9A 4BDPA 3SUNA 4CFCA 4RW6A 1JXBA 4UY8O 4AB0A 3MECA 2O8DA 1VHXA 3SMSA 3D6RA 3TSUA 2EX3A 3ZETA 5AQQA 1SS6A 1L3TA 2Q3SA 3DOLA 4RW4A 4B9NA 1FJGK 4YHHK 4GY2B 2ASMA 3V9ZA 1HYSA 1HNZK 1P00A 1WT7A 1RBRA 3WNGA 1BCMA 4YDUC 3A2FA 2HW3A 2Q0RA 4ILGB 5CYMA 1ZBUA 4RW7A 1D5AA 1N4NA 3OYHA 3ISNC 1ESVA 4BGAA 1TYQA 1VSJA 1ATSA 2NNWA 4YDUA 4BG9A 4CZGA 3ASMA 3JS6A 4DF4A 5BRDA 2QM1A 4AHVA 3PO4A 2YNIA 4CJUA 5AQYA 4FL9A 2AP1A 4KKOA 5HBMA 3SAHA 3M1FA 4DV1K 3NF6A 5BPMA 1TKTA 2P9UA 3KIOA 1HNWK 3CFOA 3O9UA 3C65A 2B5JA 3HL8A 1GLCG 5I9EB 1RDBA 3DLBA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 4JLH A;  2PFU A;  2KKZ A;  4QS9 A;  4FM0 A;  3BY5 A;  3BK3 C;  5E26 A;  2GUP A;  2YHB A;  2I5J A;  4CJ3 A;  3ITH A;  4UAD E;  1IBM K;  1YF5 L;  2YCH A;  4N41 A;  3KLF A;  3HI0 A;  3CJ9 A;  2B68 A;  3M8P A;  4BY9 C;  3O3H A;  4O5B A;  1ZVG A;  2UUA K;  1GPS A;  3BGR A;  4X64 K;  3AO1 A;  1BMR A;  4B1Z A;  2X78 A;  1CZ9 A;  3ENH A;  2RKI A;  1BQN A;  3OYJ A;  4KB1 A;  4Z0U A;  1ZBS A;  4UQG A;  3AA2 A;  3CW4 A;  1T7P A;  3LWL A;  1T44 A;  2HNZ A;  1Q8I A;  3CCR N;  4W5O A;  4A61 A;  4LC9 B;  3MK6 A;  4JKG A;  1CZA N;  3V6D A;  5J2M A;  3M8Q A;  4I7F A;  1EWQ A;  2KW4 A;  4DTX A;  1K9M O;  1BK8 A;  1HQU A;  3L56 A;  5GAH P;  1U49 A;  4DTN A;  1LWF A;  2F9T A;  3M5R A;  3O4N A;  3ZX3 A;  3DAW A;  1NMN A;  1T7B A;  4B08 A;  3C6U A;  3GE1 A;  2Q0U A;  4XIU A;  5HRN A;  3ENB A;  3QI7 A;  3VET A;  3O9Q A;  4C1N I;  4CHY A;  3L2W A;  1MR4 A;  3ZSQ A;  2LT8 A;  1K8K B;  1A5V A;  5AR0 A;  3KKS A;  2VYP A;  2QWP A;  3O3F A;  3BEX A;  1BA1 A;  2Q31 A;  3TAP A;  3P83 D;  4PL7 A;  2KFZ A;  2A41 A;  4OO1 J; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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