5F1XA

Crystal structure of human grp78 (70kda heat shock protein 5 / bip) atpase domain in complex with atp
Total Genus 117
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
117
sequence length
382
structure length
380
Chain Sequence
DVGTVVGIDLGTTYSCVGVFKNGRVEIIANDQGNRITPSYVAFTPEGERLIGDAAKNQSNPENTVFDAKRLIGRTWNDPSVQQDIKFLPFKVVEKKTKPYIQVDIGGGQTKTFAPEEISAMVLTKMKETAEAYLGKKVTHAVVTVPAYFNDAQRQATKDAGTIAGLNVMRIINEPTAAAIAYGLDKREGEKNILVFDLGGGTFDVSLLTIDNGVFEVVATNGDTHLGGEDFDQRVMEHFIKLYKKKTGKDVRKDNRAVQKLRREVEKAKRALSSQHQARIEIESFYEGEDFSETLTRAKFEELNMDLFRSTMKPVQKVLEDSDLKKSDIDEIVLVGGSTRIPKIQQLVKEFFNGKEPSRGINPDEAVAYGAAVQAGVLSG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Chaperone
molecule keywords 78 kDa glucose-regulated protein
publication title Probing the ATP Site of GRP78 with Nucleotide Triphosphate Analogs.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 117
structure length 380
sequence length 382
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.6.4.10: Non-chaperonin molecular chaperone ATPase.
pdb deposition date 2015-11-30
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5f1xA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5f1xA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5f1xA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5f1xA04
2A42A 5AQNA 1GLJO 4H5WA 3C0BA 3UKRA 1GLAG 3GDQA 2P9NB 3VGMA 5JMVA 4WQ5C 3DXMB 4BGBA 3ZX0A 1KXPA 5F0XA 3CJ1A 4CZGA 3AAPA 2QM1A 3A5MC 3M1FA 1V4TA 1NGFA 3JXUA 1QZ5A 3CQXA 2CGJA 5BRDA 2HF4A 1GLEG 5AQWA 2E2QA 3JS6A 1Y64A 5AQRA 4L3QA 3R8EA 3MN7A 3B8AX 4RTFD 3ATUA 2EWSA 3I8BA 4BR4A 4B1UB 3TU5A 1K8KB 5EX5A 4AM6A 5EY4A 3WXJA 3DJCA 2YJFA 3CJ9A 3WEEB 1G99A 1LCUA 4BR0A 1NGIA 1HLUA 4MLHA 3WT0A 3BF3A 3O8MA 5BPMA 1RGIA 3EN9A 4FSVA 3GOIA 2F9WA 1BO5O 5ELZA 1C0FA 4I6MA 5AQXA 2E2NA 2V51B 1MDUB 3HZ6A 3U9DA 3D2FA 2OANA 2W40A 3RSEA 4BRGA 3H45C 2FF3B 4BRLA 4PKIA 5JLHA 1S3XA 3QBXA 3KVGA 4AM7A 4YDUA 2P9PA 3FZMA 3UKRB 1V4SA 4BVOA 5EVZA 4H0YB 4JAXA 4H5RA 4GNIA 1X3MA 1ATSA 5ADXA 4QS8A 3VEWA 3LDOA 2IVNA 4MLEA 1T6DA 3CIPA 4FWNA 3BF1A 4CD1A 4K42A 1JCGA 1RDWX 2CH5A 4WYBA 3FE1A 5BREA 1TUYA 1U6ZA 2FXUA 3CETA 3VETA 4C23A 4M7XA 1BA0A 3BP8A 5AQOA 4BROA 4IO8A 3FR0A 3HI0A 2E1YA 5BRFA 4A61A 3SK3A 4H0VB 3LDLA 2FLOA 2IVOA 4BC2A 2P9UB 3MN9A 1GLDG 4ISEA 4PKHA 3AARA 5AQMA 4PKGA 3UKUA 3IUCA 2BTFA 3D2FB 3BEXA 4CI6A 3RSEB 2QWQA 2Q97A 2D0PA 2P9IA 1GLLO 5AQKA 1H1VA 3QFPA 4IXCA 1DGKN 2P9PB 3DAWA 3MCPA 3P4IA 4H0XB 4H0PA 2J4RA 4H5NA 1BA1A 5AQZA 4ISGA 3L0QA 1NWKA 4FOIA 5AQTA 3FZKA 3EKSA 1X9JA 3U4LA 2DPNA 4BRKA 1MWKA 5AQJA 3DXKB 2HMPA 2I7NA 4H0TB 3FGUA 4K41A 3KHYA 3A8YA 4FPBA 5BN8A 1NGDA 4BRQA 1WOQA 2ITMA 5F1XA 1GLCG 1YAGA 4FOEA 3VENA 1YVNA 3UB5A 5AR0A 2GWJA 4O5FA 4FWMA 4BR9A 2I7PA 4CJ7A 5LJWA 1TYQB 4H03B 1GLFO 3O1WA 3OHRA 4CBWA 3O4WA 2QWNA 1U2VA 3S41A 1NLVA 4H5VA 4K25A 4DCHA 2Q0UA 4RCHA 4PL8A 5BR9A 3MDQA 4Z94A 3C7NB 1Z6RA 2HF3A 1Z05A 3VGLA 4IZ9A 5E26A 4BRAA 2QW9A 1NGCA 1BWFO 2YJEA 1P8ZA 2E2OA 4BR2A 3M3ZA 3ATVA 1ZBSA 4Y0WA 2V7YA 4CZEA 1T6CA 5KQ8A 2D4WA 1XUPO 1DKGD 3LDPA 2CGLA 3FLCO 5KPZA 4XH1A 3ZETA 4E1JA 4DQ8A 3SMPA 4GY2B 2VCPA 4CZIA 4JHDB 3FZFA 4FPAA 5FPNA 3MN6A 4BRIA 1XC3A 5BRHA 5F2RA 2ZGZA 5AQGA 5JICA 3ULEA 4CZJA 4IJAA 3WUHA 4FWRA 3VF4A 2VWBA 4CZLA 5JLFA 2V52B 3QFUA 3HSCA 3CQYA 3EKUA 5AQSA 2YCHA 5ADXH 1IJJA 1U2VB 2Q0RA 2P9SA 2Q31A 2V7ZA 4WQ5A 3FFKB 3M6GA 1BU6O 3W0LA 2FSJA 4A62A 1BUPA 4FL9A 2E88A 3L6QA 2YHXA 1S22A 1E4GT 4FWOA 3A5LC 4CBUA 2E8AA 1SZ2A 2E20A 3DWLA 4NO7A 2GTDA 5FPMA 4CZHA 5AFUA 4BRNA 2AP1A 4QS9A 1BG3A 1NGAA 4CD3A 1EQYA 1ATNA 4FWQA 4H0OA 4BRHA 3H3NO 3TPQA 3WXIA 5LY3A 4I6MB 4KBOA 2QXLA 2Q1NA 4F9OA 1DEJA 3QDKA 3WQTA 4B1YB 2ASOA 3J8AA 3VPZA 4ISFA 4BC5A 1YUWA 2CH6A 4QS7A 1X3NA 3ULEB 1SAZA 3VESA 2KHOA 2VYPA 2ZF5O 1ATRA 3VEYA 5BPLA 2A3ZA 1NGEA 3QBWA 2D1KA 3DXMA 5AZJA 3CERA 2P9SB 4A2BA 3AY9A 3MK6A 2YI1A 2Q2RA 2UYTA 1QHAA 2ASPA 1BOTO 2QWPA 3WXKA 1QQOA 2CGKA 2F9TA 2FSKA 2GEMA 3WXLA 1ESVA 3O6WA 4BRFA 4A2AA 1TUUA 3W3DA 1HKGA 2P9KA 3QMLA 4B1WB 5EOYA 3ENOA 1K8KA 3D2EA 3U9ZA 3ZX2A 4EAHD 1MA9B 1YXQA 1LOTB 3A5OC 3CJBA 3IMXA 5FPDA 3WEEA 3CJCA 1HJOA 3ENHA 4CZKA 5KPTA 3HBTA 3O80A 4WQ4A 3IDHA 4B1ZA 3BUZB 4FWPA 3UKUB 4YDUC 3EO3A 5LJVA 4BGAA 1ZXOA 3G25A 3HTVA 3O08A 4XH5A 3EL2A 3VOVA 4CZFA 1HPMA 2P9IB 4JD2A 2D0OA 2YHWA 1KAYA 2NLXA 5EXWA 3CI5A 3A5NC 5AQPA 5AZJB 2PAVA 4HTLA 3VGKA 4NB4A 1HX1A 3GBTA 5E84A 3ZEUA 4BRPA 4JN4A 4FWLA 3AAQA 2FSNA 3WQUA 2A41A 3LM9A 4FO0A 4BVPA 4IJNA 2QWRA 5AQUA 1J6ZA 2Q36A 4PL7A 2QWOA 2P9KB 4EFHA 2YHYA 1RFQA 3R9PA 5TKYA 3VEVA 1NM1A 3GE1A 3R6MA 3D2EB 4XH4A 3H1VX 1JCFA 2FF6A 2HOEA 2BUPA 2QWMA 3HM8A 2ZWHA 2P9LA 2NZTA 3KZBA 2P9UA 2A6AA 2PBDA 2ZGYA 3QB0A 3VF2A 4JD2B 1D4XA 4B1XB 1GLBG 5KQDA 5AQVA 1IG8A 1NGJA 4DHYA 3VF6A 1NGBA 4B1VA 1OKJA 4O8KA 3SLCA 5BPNA 4MO4A 5AQQA 1ZC6A 1NBWA 4CBXA 3FZHA 3H3OB 3CJ7A 2GUPA 3ZEUB 2GWKA 4EHUA 4BQZA 3O5BA 1T44A 3LL3A 4XEIA 5AFUH 2W41A 1C0GA 4M63C 5KPRA 5AQYA 3CHWA 3DXKA 3IFRA 4CZMA 3D7EO 4H5TA 3ZETB 4EHTA 2QWLA 2E1ZA 4K43A 1QQNA 4BREA 3QICA 4BC4A 1E4FT 3FZLA 3LM2A 5AZIA 1QZ6A 2A5XA 5AQHA 4BC3A 4BG8A 1HKCA 4B9QA 1HKBA 4M7YA 3CJAA 5BN9A 3GG4A 1SQKA 4WQ4C 4EIAA 1HUXA 1TYQA 5FPEA 2P9LB 2P9NA 1QQMA 5AQIA 3H1QA 1WUAA 3VEXA 3VEOA 1Q18A 3ID8A 2AA4A 4FWSA 1KAZA 4RWTA 4BR5A 3EZWA 3O1BA 4BRCA 4J8FA 3SMSA 5AQFA 3SJHA 2H3GX 3C7NA 1CZAN 3U8XA 4FWKA 2IIRA 4HWIA 1MWMA 2WUSA 4IWVA 4BRDA 1KAXA 1R59O 4BQLA 2GELA 3MN5A 4JNEA 3VEZA 2NRHA 4LC9B 4DB3A 4BRMA 5I9EB 4BG9A 1JCEA 5CE3A 2ASMA 2IVPA 3UE5A 1NGGA 3MMVA 3VERA 5B8HA 4BR7A 3H46O 3L4IA 3A0IX 1BDGA 1NGHA 3LDQA 1XQSC 3GL1A 5AZIB 3I33A 3LDNA 3F9MA 2A40A 5AQLA 4JHDA 2E2PA 4MO5A 1NMDA 3ZX3A 3H6EA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1REVA 5IT9O 1LWCA 2O8EA 4LH4A 3VMFB 5JMVA 3OYNA 4IG0A 3AAPA 4IOXA 1DTTA 1VNBA 1JLGA 3AO2A 2XY8A 3EYZA 3CQXA 1B92A 4F2SA 5AQWA 4DLGA 1PE4A 4DR1K 5DMRA 3MN7A 3QI7A 2E6LA 3BZCA 3I8BA 3CCEN 1TV6A 4B1UB 4JK8A 4AM6A 4PHTX 1G99A 4CK1A 1NGIA 4HE7A 1DTQA 1RT2A 3MEDA 4MLHA 3IAYA 3BF3A 3ULDA 1P00A 4K8ZA 1IBKK 3MCAB 4M45A 1S5JA 2P51A 2UU9K 4QCLA 3D2FA 4DQRA 2OANA 3RSEA 4BRGA 5JLHA 1VRTA 1RBTA 3WNGA 4DLEA 1V4SA 5EVZA 2W6KA 2KPYA 1X3MA 4RW4A 5ADXA 4F2RA 3LDOA 3CIPA 4CD1A 4DG1A 4RW6A 1FJGK 4K42A 4OVLA 1VSKA 4FM0A 3QETA 2RHKA 3EE9A 5BREA 1HYZA 3OYJA 1TUYA 1U6ZA 3M5RA 4M7XA 2VG5A 1ZBUA 3CCRN 1Q82O 3SJJA 4BROA 4CJSA 4IO8A 2E1YA 1UGLA 1MR4A 2ZQBA 4FJIA 3SK3A 1TK8A 3E9LA 1Z26A 1L4VA 3ITHA 3AVJA 2IVOA 2JWLA 3OYBA 2HMIA 1RT1A 3T1HK 5A2QO 3CMAN 3LZIA 5HL7L 2HNYA 2F4VK 2BTFA 3TAMA 4CI6A 4DV5K 2G8HA 4BWMA 1WSFA 2QWQA 2X6NA 4GV9A 1ASUA 4I9LA 1H1VA 3MECA 3QFPA 4CFDA 4JKCA 2FC0A 2E4LA 4H0PA 3DLGA 1IBMK 4H5NA 4X64K 3K58A 4H8KA 2HW3A 4B3OA 5JS2A 2KBKA 2DPNA 4YOUA 4BRKA 3DXKB 5HOOA 2HMPA 1IKWA 2I7NA 1LAWA 5TKWA 3ZT2A 3KHYA 3AO4A 4CJEA 3SV3A 5BN8A 1LV5A 4BRQA 4B9TA 1WOQA 3Q7BA 3NHGA 5F1XA 1YAGA 2D0CA 1WSGA 3LAMA 3C6AA 4KAZA 2F96A 3SUNA 3F2KA 2KQ2A 4FK2A 2KBJA 3OHRA 4OKKA 4JYAK 1U2VA 3S5TA 3GKUA 2DFHA 1HNIA 4AHRA 5BR9A 4Z94A 2DTUA 3C7NB 4CCHA 1Z6RA 3E1YA 2ATQA 1ZU3A 4LD0A 2QW9A 3QERA 2E2OA 1U47A 2V7YA 4FYDA 1NU0A 4FZXC 5KQ8A 1DKGD 4DFJA 3FLCO 4XH1A 3LWMA 1Z25A 3ZETA 4DQ8A 3OYFA 3CM5A 2VCPA 3KTQA 3L4QA 1OVQA 4YFUA 3TSPA 3SPZA 4BE1A 2BANA 5JICA 2B6AA 3V4IA 4CFCA 1BQMA 4IJAA 4KO0A 3VF4A 3EKUA 4JI7K 3MXIA 2P9SA 1D9FA 4CJ4A 2ASCA 4CHZA 2WONA 4CF1A 3HVRA 3ZSVA 1WSHA 4X62K 2O8FB 1BU6O 3NF8A 3W0LA 1C0MA 2IOCA 1U04A 2FSJA 1JJ2M 4FL9A 3WNEA 1T7BA 4TSXA 1TGOA 4E7KA 5FDLA 3A5LC 4CBUA 1L3SA 2E20A 1ASVA 2VWKA 4Z4FA 4GV6A 1VQ4N 1X1PA 1B3CA 2VGMA 4RG8A 1S6PA 3THYB 2AP1A 4O55A 3PV8A 5HROA 3T19A 1TK5A 1IV0A 1I94K 4CD3A 1MU2A 4FWQA 4H0OA 3TAPA 3H3NO 3TPQA 3WXIA 5LY3A 2Q1NA 1DEJA 1TKZA 4C1NI 2D56A 2OCEA 4B1YB 2UXDK 4ISFA 3AO5A 3DLKA 2B4JA 1X3NA 2HHSA 1HYVA 1SAZA 3ZSOA 3OJUA 3S3MA 4JV5K 5KI6A 2VYPA 2ZF5O 3E7UX 1HNZK 1ATRA 3VEYA 4DV7K 4JI0K 1NKCA 4I9QA 1YJWN 3DXMA 1T7AA 4YOWA 4A2BA 2VQFK 1JXBA 3MK6A 2Z1JA 4F4KA 3KLEA 2GMOA 3LPUA 1QHAA 2ASPA 4IFEA 1XC9A 3V81A 1XMQK 4LFAK 2GEMA 3WXLA 1ZYQA 1ESVA 1NKBA 2P5GA 4BRFA 4A2AA 1TUUA 3W3DA 4JLHA 3QMLA 2Y1IA 3OYKA 3RMBA 3OYMA 2YNGA 4B1WB 4BDYA 4CEQA 3HL8A 3NMUA 4CGJA 5DM7L 3KOZA 2C1IA 2K35A 3PSMA 3D2EA 3ZX2A 3OYHA 2YKNA 3CM6A 3A5OC 3CJBA 3AGRA 1YHQN 1ZBIA 3ENHA 4CZKA 1C55A 4DTUA 3QLHA 4ICLA 3UKUB 4YDUC 2LN8A 1P90A 3HTVA 1HPMA 2P9IB 3MX5A 3PUFA 1TL1A 1AYJA 4JD2A 4ILJA 5CY4A 2NLXA 4M3WA 3CYGA 3SAFA 3K0SA 4ZTFA 3A5NC 1HQUA 2ETJA 4AILC 3ZT4A 1VSLA 4FJ7A 3NH1A 1VQLN 3VGKA 3GBTA 4JKGA 4IKFA 4JN4A 4NCGA 2HHTA 4JK7A 2P5OA 3DOLA 4IJNA 2QWRA 5AQUA 3CPEA 4LF8K 4I2PA 1TL3A 4NXNK 2YHYA 4J2EA 5TKYA 1R0AA 2KFNA 1KLNA 3GE1A 3ZLJA 1EETA 4KFBA 5JVGL 1HQEA 1JCFA 4FM1A 4C8MA 4JKEA 1EXQA 1N33K 1SUQA 3OY9A 2A6AA 2E0HA 2JDQD 4KHYA 2KBHA 1OMYA 2E3GA 1VSHA 3VF2A 1D4XA 2HHQA 5KQDA 4JKAA 4OKEA 4DHYA 1NGBA 1SV5A 4MO4A 4CJQA 5M1QA 1NJXA 1T03A 3ISNC 4OX9K 4DFMA 2GUPA 1OVYA 3ZEUB 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1REV A;  5IT9 O;  1LWC A;  2O8E A;  4LH4 A;  3VMF B;  5JMV A;  3OYN A;  4IG0 A;  3AAP A;  4IOX A;  1DTT A;  1VNB A;  1JLG A;  3AO2 A;  2XY8 A;  3EYZ A;  3CQX A;  1B92 A;  4F2S A;  5AQW A;  4DLG A;  1PE4 A;  4DR1 K;  5DMR A;  3MN7 A;  3QI7 A;  2E6L A;  3BZC A;  3I8B A;  3CCE N;  1TV6 A;  4B1U B;  4JK8 A;  4AM6 A;  4PHT X;  1G99 A;  4CK1 A;  1NGI A;  4HE7 A;  1DTQ A;  1RT2 A;  3MED A;  4MLH A;  3IAY A;  3BF3 A;  3ULD A;  1P00 A;  4K8Z A;  1IBK K;  3MCA B;  4M45 A;  1S5J A;  2P51 A;  2UU9 K;  4QCL A;  3D2F A;  4DQR A;  2OAN A;  3RSE A;  4BRG A;  5JLH A;  1VRT A;  1RBT A;  3WNG A;  4DLE A;  1V4S A;  5EVZ A;  2W6K A;  2KPY A;  1X3M A;  4RW4 A;  5ADX A;  4F2R A;  3LDO A;  3CIP A;  4CD1 A;  4DG1 A;  4RW6 A;  1FJG K;  4K42 A;  4OVL A;  1VSK A;  4FM0 A;  3QET A;  2RHK A;  3EE9 A;  5BRE A;  1HYZ A;  3OYJ A;  1TUY A;  1U6Z A;  3M5R A;  4M7X A;  2VG5 A;  1ZBU A;  3CCR N;  1Q82 O;  3SJJ A;  4BRO A;  4CJS A;  4IO8 A;  2E1Y A;  1UGL A;  1MR4 A;  2ZQB A;  4FJI A;  3SK3 A;  1TK8 A;  3E9L A;  1Z26 A;  1L4V A; 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