5F1XA

Crystal structure of human grp78 (70kda heat shock protein 5 / bip) atpase domain in complex with atp
Total Genus 117
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
117
sequence length
382
structure length
380
Chain Sequence
DVGTVVGIDLGTTYSCVGVFKNGRVEIIANDQGNRITPSYVAFTPEGERLIGDAAKNQSNPENTVFDAKRLIGRTWNDPSVQQDIKFLPFKVVEKKTKPYIQVDIGGGQTKTFAPEEISAMVLTKMKETAEAYLGKKVTHAVVTVPAYFNDAQRQATKDAGTIAGLNVMRIINEPTAAAIAYGLDKREGEKNILVFDLGGGTFDVSLLTIDNGVFEVVATNGDTHLGGEDFDQRVMEHFIKLYKKKTGKDVRKDNRAVQKLRREVEKAKRALSSQHQARIEIESFYEGEDFSETLTRAKFEELNMDLFRSTMKPVQKVLEDSDLKKSDIDEIVLVGGSTRIPKIQQLVKEFFNGKEPSRGINPDEAVAYGAAVQAGVLSG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Chaperone
molecule keywords 78 kDa glucose-regulated protein
publication title Probing the ATP Site of GRP78 with Nucleotide Triphosphate Analogs.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 117
structure length 380
sequence length 382
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.6.4.10: Non-chaperonin molecular chaperone ATPase.
pdb deposition date 2015-11-30
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5f1xA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5f1xA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5f1xA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5f1xA04
5FPEA 2P9NA 3VGMA 1D4XA 3M3ZA 2A5XA 4Y0WA 5JLFA 4BRMA 3BP8A 1JCGA 4BR2A 4BRHA 5AR0A 1QZ6A 4CD3A 4BC5A 3WXJA 1BUPA 2FSJA 1LCUA 1MWKA 4GY2B 2V52B 2P9LB 2Q31A 3FLCO 1S22A 4B1UB 5BPNA 5BRFA 2FLOA 3GDQA 4MO5A 4CBXA 5AZIB 1MA9B 2VCPA 3A5MC 1NM1A 4BRLA 1QQNA 2V7YA 3DWLA 4BC4A 2V7ZA 3LL3A 4CZEA 3VETA 4H5TA 1S3XA 2D1KA 4EFHA 1TUYA 2A3ZA 2YI1A 4FOEA 1WUAA 4RWTA 1YXQA 2ZWHA 3HI0A 3QBWA 5AQWA 1NGBA 2VWBA 3IDHA 1K8KB 2I7PA 1Z6RA 3TU5A 1GLLO 3LM2A 4BQZA 3WXKA 3VENA 2E2PA 4F9OA 1XC3A 4FPBA 5AQVA 4BRAA 4PKGA 4IWVA 5AQYA 4JAXA 4MLHA 5BRHA 2Q1NA 3LDQA 2QWNA 1NGHA 1RFQA 2P9LA 3CIPA 2FF3B 3D7EO 1RGIA 2OANA 2PBDA 3D2EB 3QBXA 4A61A 1MWMA 4FWKA 3MK6A 5AZIA 2YJFA 1YAGA 4BR4A 3AY9A 2P9KA 1BOTO 3MDQA 1HX1A 4JNEA 3SJHA 1E4FT 3LDLA 1QZ5A 4GNIA 3B8AX 4XH1A 1V4SA 1ATNA 1ZC6A 3LDPA 3QMLA 2E2OA 1XUPO 3KVGA 4PKHA 5LJWA 5KPTA 1QHAA 1OKJA 4BG8A 2CGKA 1GLAG 2D4WA 3GBTA 3VEYA 1IG8A 5JICA 3WEEA 5ADXA 1X9JA 5B8HA 3WXIA 2QWOA 1NLVA 2W40A 3FZLA 5AFUA 3D2FB 3IMXA 1ZBSA 3HBTA 2W41A 3WQTA 3CHWA 3WQUA 3BUZB 5AZJB 3ZETB 5EY4A 3FZHA 2E1YA 3ATVA 3ZEUB 2P9PA 4PL8A 2GELA 3FE1A 3QB0A 3DXMB 4CBWA 2KHOA 2QW9A 3VPZA 1T44A 4AM7A 4C23A 2CH5A 2WUSA 2I7NA 1C0GA 5CE3A 1NGGA 3DXKB 3WT0A 5BPLA 3LDOA 4CD1A 2E8AA 4BR5A 3QDKA 3VERA 3FGUA 4FWMA 4QS8A 4MLEA 5ADXH 4AM6A 1ATSA 2BUPA 4EHTA 2NZTA 1J6ZA 2A41A 5AQJA 2HMPA 5AFUH 4IXCA 4K42A 3SMPA 4DB3A 3VF4A 4BRIA 5AQRA 1X3NA 1QQOA 4WYBA 3EL2A 1T6CA 2NLXA 2IIRA 5AQGA 3ZX0A 3FFKB 4BR7A 3HTVA 4EIAA 1X3MA 3H1QA 2E2NA 4YDUA 4JHDB 4BRQA 3SLCA 2DPNA 4CI6A 4B1VA 4A62A 3U4LA 5FPNA 3F9MA 1E4GT 2QWQA 5AQZA 4WQ4A 3CQXA 2E2QA 1JCEA 4BRDA 1P8ZA 3OHRA 2P9IB 2P9UB 4LC9B 4FO0A 3UKUB 4BROA 3AARA 1BA1A 2A40A 3EZWA 3FR0A 4I6MA 1ATRA 4JD2B 4K43A 4CZGA 2IVNA 3H3OB 3ULEA 3SK3A 4FWPA 4A2AA 3H46O 1BA0A 3O4WA 3FZFA 2J4RA 2CGLA 1XQSC 5AQMA 1KXPA 2GWJA 4NO7A 5JLHA 3HSCA 1RDWX 4Z94A 1SZ2A 4CJ7A 3IUCA 3MN5A 4CZJA 3QFPA 4H0VB 3AAQA 2UYTA 4IJAA 3A5NC 3L0QA 4EHUA 4JN4A 4HTLA 3L6QA 1NGEA 2QM1A 3H6EA 3ENOA 3VEVA 4BRNA 2E1ZA 3VEOA 4FWQA 2ZF5O 1TUUA 3O08A 4CZFA 3P4IA 5AQKA 2E20A 4MO4A 3HM8A 4BG9A 5AQPA 2YHXA 4JD2A 2YCHA 3GOIA 3M1FA 1GLJO 3TPQA 5E26A 4QS9A 2QXLA 2ITMA 1K8KA 2A42A 5BREA 3ID8A 4FWRA 4H0TB 4XEIA 3BEXA 4M7XA 2F9TA 1C0FA 3MMVA 1LOTB 4EAHD 4J8FA 5KQ8A 1IJJA 1G99A 3SMSA 3ATUA 3O8MA 1SAZA 4BGAA 2V51B 5F0XA 5BPMA 3DJCA 2HF4A 3KHYA 5AQUA 3G25A 1H1VA 5AQNA 4IO8A 4BRCA 4BR0A 4H0PA 3GE1A 2IVOA 3D2EA 3R8EA 3LDNA 4BRKA 4H5VA 5E84A 2Q36A 3LM9A 1T6DA 5KPZA 3VEZA 3W0LA 3U9DA 4IJNA 3CJCA 4ISFA 2FF6A 2HOEA 4BQLA 5BR9A 2AA4A 3M6GA 2P9NB 5BN9A 5LY3A 5KPRA 1DEJA 1HKBA 1SQKA 2CH6A 4CBUA 4FWNA 3VEWA 3JS6A 3O6WA 4RCHA 3VGLA 1NGCA 5KQDA 5AQHA 1NGFA 2GUPA 5AQTA 1BDGA 1WOQA 5LJVA 3A5LC 1YVNA 4FSVA 3D2FA 2QWPA 1HKGA 3CJ9A 3UKRB 4FWLA 5AZJA 3ZETA 3S41A 2YHYA 3ZEUA 4BVOA 3C0BA 2QWLA 1Q18A 2ZGYA 4O5FA 4B1ZA 5AQQA 4KBOA 2Q2RA 3CERA 2FSNA 3DXMA 1BWFO 4BC3A 3MN9A 2PAVA 3WXLA 1GLCG 4RTFD 3DAWA 2ASPA 4B9QA 3DXKA 3FZKA 4B1YB 2YHWA 3CJ7A 1ZXOA 4PL7A 3MCPA 1KAXA 4H5NA 1ESVA 3VEXA 4IZ9A 4CZLA 1Y64A 5ELZA 3UB5A 4BRGA 3O1BA 5FPDA 1JCFA 3KZBA 3ZX2A 4CZHA 5AQXA 5AQSA 3VESA 3QFUA 4YDUC 4H5WA 4ISEA 3ZX3A 1HLUA 3UKRA 4CZKA 1MDUB 5TKYA 4O8KA 2CGJA 2P9KB 3O5BA 4WQ4C 1KAYA 4M7YA 3A0IX 3U8XA 3J8AA 3O1WA 1DGKN 1NGJA 1EQYA 3VGKA 2D0PA 3ENHA 4JHDA 5BRDA 2P9SB 3EN9A 4L3QA 1HUXA 2Q97A 1NBWA 1BU6O 3JXUA 4FPAA 3FZMA 3WEEB 2P9IA 2P9UA 4BR9A 5JMVA 4BREA 5AQLA 3UKUA 1GLDG 4H5RA 3I33A 2GEMA 1NMDA 1HKCA 2F9WA 4PKIA 3L4IA 3MN7A 1QQMA 2E88A 4A2BA 1BG3A 3CETA 5F1XA 1GLBG 4FL9A 3O80A 3QICA 3BF3A 3VF2A 1YUWA 2P9PB 3RSEB 2BTFA 3H1VX 5AQIA 3AAPA 3H3NO 2FSKA 2D0OA 4CZMA 4M63C 3CQYA 4CZIA 2IVPA 3R9PA 4B1XB 2YJEA 1NGAA 3A5OC 4K25A 3U9ZA 1HPMA 3UE5A 4K41A 1V4TA 3C7NB 2Q0UA 2P9SA 1BO5O 1KAZA 2QWMA 1TYQB 3EKSA 2EWSA 5I9EB 4B1WB 2AP1A 5EOYA 2HF3A 5BN8A 3VF6A 5F2RA 4WQ5A 4ISGA 3VOVA 1Z05A 2Q0RA 3HZ6A 4FWOA 3R6MA 4E1JA 1NWKA 1U2VB 1U6ZA 4DQ8A 4DHYA 3CJBA 2ZGZA 4FOIA 3W3DA 2GWKA 4DCHA 5AQFA 3I8BA 4H0XB 4BGBA 4XH5A 5EX5A 3RSEA 2ASOA 4BRFA 1NGIA 1GLFO 3EO3A 4H0OA 4FWSA 5EVZA 3EKUA 4HWIA 1NGDA 2ASMA 3H45C 1DKGD 1GLEG 4WQ5C 3CJAA 3MN6A 2A6AA 5FPMA 4XH4A 4BRPA 4BC2A 3CJ1A 2QWRA 1HJOA 4H03B 3C7NA 4I6MB 1TYQA 2VYPA 1R59O 4NB4A 4BVPA 3ULEB 1CZAN 2H3GX 5AQOA 3CI5A 2NRHA 4QS7A 5EXWA 3WUHA 4H0YB 2GTDA 3A8YA 1U2VA 3BF1A 3GG4A 3GL1A 2FXUA 3IFRA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4G1QA 2VGNA 4CJSA 1Q81O 4BRMA 3EY1A 1JCGA 1RTJA 3DLEA 4BR2A 4DS4A 4DR6K 2PYLA 3VQDA 1BUPA 3AV9A 3HT3A 4E1MA 1MWKA 2P9LB 1FKPA 4EP4A 3NHGA 4MO5A 2F4VK 4ELUA 2JWLA 4JI4K 4NLCA 4IFVA 1QQNA 4AHRA 4BC4A 2NRVA 2V7ZA 1D5AA 4JYAK 1WLJA 2GUIA 2O8CA 3VETA 4CQKA 3TSUA 4EFHA 2P5OA 3OTOK 1TUYA 4CJUA 3CFRA 2I5JA 4FK4A 2YI1A 5JS1A 3OYNA 1B9FA 4FYDA 1YXQA 4B8AB 1Q7YO 1XNQK 3OS2A 4DR3K 2WC9A 1Z6RA 1GLLO 4CFCA 2F8TA 3G0ZA 1NG9A 2E2PA 4JKGA 1TVRA 3MXIA 5AQVA 4JK9A 4AHUA 3M8QA 1TL3A 4JAXA 2FBYA 3LDQA 3K59A 4KH6A 4N41A 3RR7A 4M3ZA 2E3GA 1I2VA 4B3TK 2FF3B 4CHZA 2YHAA 1VK0A 4CK1A 2ZQBA 3LAKA 1YAGA 4LSNA 3H08A 3AY9A 3J80O 2P9KA 1C0UA 1VSKA 3V4IA 4XH1A 1V4SA 4CF1A 5GAEP 4RW8A 4YOUA 4DV2K 5LJWA 3DLBA 4FLYA 1NK6A 1EKEA 3GBTA 3MXJA 2X74A 4RW9A 1LAVA 5FLXO 1KVAA 2BE2A 5JICA 4DTMA 4H4OA 3PIPL 5ADXA 2W40A 2GV9A 3K58A 3SJJA 3SCXA 1C1AA 3WQTA 2BH1A 4O55A 3PSMA 3K0SA 5AZJB 3ZETB 1L5UA 3NF8A 5HP1A 4DTXA 4CGDA 4CGHA 3THWA 4BDZA 2QW9A 1JLQA 1FH3A 2HNZA 3CCLN 4C23A 2CH5A 4CEQA 5CE3A 3UIQA 2PFUA 3TTDA 2JLEA 1NGGA 4DQIA 3E9LA 3HPHA 4O0JA 4CJWA 2E8AA 2HHQA 1JZBA 4WFBL 4N76A 3FGUA 4C1NK 2KZZA 3C6HA 4FWMA 4OJRA 2HBJA 5I42A 4AM6A 4EHTA 1X9MA 3MEGA 1J6ZA 3SQ2A 5AQJA 5M1PA 3CC4N 1WMTA 3TAFA 1RILA 1JL2A 3CCVN 3V6DA 5AQRA 1QQOA 4HCCA 4ILGB 5AQGA 3ZSYA 2KYQA 5M1FA 1HJRA 4YORA 1KTQA 1X3MA 3CW4A 3D45A 3LAMA 2E2NA 4YDUA 3DYAA 1WAFA 4JK7A 4JHDB 3SLCA 4BRQA 2VG6A 4JKBA 3QI7A 4CJTA 2NY9X 3DRPA 3SI6A 4HUEA 4CHPA 4LC9B 2VG5A 4BROA 2E2FA 1DQ7A 1BRZA 3EZWA 3FR0A 4CZGA 2P51A 3H3OB 1VQ8N 4FZZA 4QCLA 1N34K 2NRTA 4FW1A 4AQYK 4JV5K 1EXQA 1T7PA 2NY8X 4OVLA 4BE7B 2HNDA 5CR4A 4NO7A 1ZVEA 5JLHA 3ID6A 4Z94A 4OGCA 3U3GA 3GKUA 1SZ2A 3IUCA 1P90A 3QFPA 4AHTA 2I61A 1S1WA 3L0QA 3K9JA 4EHUA 1HQEA 3L6QA 3TAEA 4HVJA 4DV5K 2EX3A 1REVA 4GW6A 1QVFM 4BRNA 2E1ZA 1RTDA 3VEOA 1TL1A 4FWQA 2KBKA 3O9RA 1XNRK 4OPJA 2E20A 4A59A 4BE2A 2BGGA 5AQPA 4JD2A 2YKNA 2E5LK 3CCEN 2YCHA 4BE0A 1JLFA 3QIOA 3SYZA 1ZYWA 1Q9YA 4WE1A 3TPQA 1TV6A 4DR1K 3V9UA 3OYHA 3ID8A 3CQ8A 4J8FA 5KQ8A 4NCBA 3ISNC 4ID1A 5JENA 3ATUA 3O8MA 4N5SA 1SAZA 4CK2A 2QXFA 4DTOA 3HVRA 5AQUA 1IO2A 1OZZA 1NU0A 4DSKA 3GE1A 2RHKA 1KLMA 3QNOA 2E4LA 2Q36A 2XO7A 4DTNA 3W0LA 1NJWA 1C0MA 1WB9A 3WNEA 3V9SA 4DSLA 4BQLA 1UOCA 2P9NB 4IEIA 4NLBA 5GIOA 1YJ9N 5BN9A 2A7TA 2CH6A 4CBUA 3HXMA 4FWNA 1UWBA 4QOZB 3OYFA 3TSQA 4A5BA 1TK8A 3JS6A 5KQDA 2LI7A 5AQTA 4B9SA 5LJVA 4MDBA 3A5LC 5C10A 2QWPA 3I0RA 4OPHA 2G8HA 3CJ9A 5GAHP 1J5OA 1VSLA 4DUYK 2JDQD 5AZJA 3ZETA 3S41A 2YHYA 2Z1GA 3C0BA 4N56A 4J2BA 4ID5A 3QEXA 2KKZA 3CYGA 3CERA 3KLHA 3VQPA 1BWFO 3MN9A 2PAVA 3HSTB 4FJLA 1GOCA 3P5JA 4Y1DA 3FZKA 3ASMA 2YILA 4LH5A 4FW2A 2GMOA 3MCPA 4N47A 1KAXA 1NK9A 3VEXA 3SZ2A 1TK5A 4IZ9A 4CZLA 2HHWA 1IKYA 4LFBK 4IOXA 4IBNA 4FJ9A 3AVJA 2NUBA 4OKKA 5HLFA 4FK0A 1PE4A 3AO3A 3ZSRA 4YDUC 3PO4A 5LMUK 2RE2A 3VQ8A 3PX6A 5TKYA 1DTTA 4AHVA 4M7YA 4FLTA 4CHYA 1DGKN 4KHNA 3CCJN 4MQ3A 1YIJN 3SF4D 4JHDA 2P9SB 3LDSA 4KI6A 1KFDA 4L3QA 1QE1A 5K14A 1NBWA 3BGRA 1GPSA 4FLXA 1RT3A 1AYJA 4Y1CA 4DV4K 3HO1A 3WEEB 1ZFUA 3L3VA 3DLRA 1QSLA 1T7AA 3ZLJA 1D9DA 5AQLA 1YJNN 2LJMA 3AO5A 1CHZA 2O8FB 2GEMA 3K2PA 4DU3A 2F9WA 3KLEA 4FLWA 4PKIA 3L4IA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4G1Q A;  2VGN A;  4CJS A;  1Q81 O;  4BRM A;  3EY1 A;  1JCG A;  1RTJ A;  3DLE A;  4BR2 A;  4DS4 A;  4DR6 K;  2PYL A;  3VQD A;  1BUP A;  3AV9 A;  3HT3 A;  4E1M A;  1MWK A;  2P9L B;  1FKP A;  4EP4 A;  3NHG A;  4MO5 A;  2F4V K;  4ELU A;  2JWL A;  4JI4 K;  4NLC A;  4IFV A;  1QQN A;  4AHR A;  4BC4 A;  2NRV A;  2V7Z A;  1D5A A;  4JYA K;  1WLJ A;  2GUI A;  2O8C A;  3VET A;  4CQK A;  3TSU A;  4EFH A;  2P5O A;  3OTO K;  1TUY A;  4CJU A;  3CFR A;  2I5J A;  4FK4 A;  2YI1 A;  5JS1 A;  3OYN A;  1B9F A;  4FYD A;  1YXQ A;  4B8A B;  1Q7Y O;  1XNQ K;  3OS2 A;  4DR3 K;  2WC9 A;  1Z6R A;  1GLL O;  4CFC A;  2F8T A;  3G0Z A;  1NG9 A;  2E2P A;  4JKG A;  1TVR A;  3MXI A;  5AQV A;  4JK9 A;  4AHU A;  3M8Q A;  1TL3 A;  4JAX A;  2FBY A;  3LDQ A;  3K59 A;  4KH6 A;  4N41 A;  3RR7 A;  4M3Z A;  2E3G A;  1I2V A;  4B3T K;  2FF3 B;  4CHZ A;  2YHA A;  1VK0 A;  4CK1 A;  2ZQB A;  3LAK A;  1YAG A;  4LSN A;  3H08 A;  3AY9 A;  3J80 O;  2P9K A;  1C0U A;  1VSK A;  3V4I A;  4XH1 A;  1V4S A;  4CF1 A;  5GAE P;  4RW8 A;  4YOU A;  4DV2 K; 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