5F2RA

Crystal structure of human grp78 (70kda heat shock protein 5 / bip) atpase domain in complex with amp-pcp
Total Genus 121
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
121
sequence length
381
structure length
381
Chain Sequence
VGTVVGIDLGTTYSCVGVFKNGRVEIIANDQGNRITPSYVAFTPEGERLIGDAAKNQLTSNPENTVFDAKRLIGRTWNDPSVQQDIKFLPFKVVEKKTKPYIQVDIGGGQTKTFAPEEISAMVLTKMKETAEAYLGKKVTHAVVTVPAYFNDAQRQATKDAGTIAGLNVMRIINEPTAAAIAYGLDKREGEKNILVFDLGGGTFDVSLLTIDNGVFEVVATNGDTHLGGEDFDQRVMEHFIKLYKKKTGKDVRKDNRAVQKLRREVEKAKRALSSQHQARIEIESFYEGEDFSETLTRAKFEELNMDLFRSTMKPVQKVLEDSDLKKSDIDEIVLVGGSTRIPKIQQLVKEFFNGKEPSRGINPDEAVAYGAAVQAGVLSG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Chaperone
molecule keywords 78 kDa glucose-regulated protein
publication title Probing the ATP Site of GRP78 with Nucleotide Triphosphate Analogs.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 121
structure length 381
sequence length 381
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.6.4.10: Non-chaperonin molecular chaperone ATPase.
pdb deposition date 2015-12-02
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5f2rA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5f2rA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5f2rA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5f2rA04
3VEXA 3KZBA 5AQGA 3VGLA 4BC3A 5AQTA 3SMPA 1DGKN 1GLCG 4GNIA 1U6ZA 1RFQA 2GELA 4CZIA 4H0VB 1ZC6A 3R9PA 2E88A 5AQFA 3F9MA 3AARA 4NO7A 4FWRA 3MK6A 2YJEA 5AQNA 1HX1A 1SAZA 2E2NA 2NRHA 3CETA 2F9TA 4FL9A 2I7NA 2QWQA 1NM1A 5AQRA 1BUPA 3WQUA 3QFPA 5BPMA 4H5VA 3D7EO 4JN4A 4EIAA 3VF2A 3WXLA 3FR0A 4FWNA 2YCHA 4DCHA 1ATSA 1Z05A 4CZHA 3VEVA 3DJCA 3RSEB 1YAGA 3JS6A 3CERA 2F9WA 3L0QA 5AR0A 1U2VA 4PKIA 3FZFA 3SMSA 4BRMA 4H0XB 4CZLA 4BRHA 4BQZA 4MO5A 5E26A 2CH5A 1K8KB 3LDOA 2KHOA 2ZF5O 2E2OA 3M3ZA 3ENOA 2EWSA 2HF3A 4BREA 1NGGA 3ZETB 5AQLA 1XUPO 3CJ1A 4JNEA 3LL3A 2V7ZA 4I6MB 1GLFO 3DAWA 3M1FA 4K43A 4DHYA 5FPEA 3IUCA 4BRFA 4BRKA 3BEXA 4H5NA 1KXPA 2YI1A 2YHXA 4JD2B 5AQIA 3ULEA 2E2QA 5AFUH 1TUYA 1KAXA 2P9SB 4XEIA 4FOIA 1NLVA 4CZGA 5F1XA 3LDNA 1JCGA 3VOVA 5JICA 1ZBSA 1QQNA 4FPBA 3QMLA 4BR9A 4H0YB 3A5OC 4K25A 2V51B 4BR7A 3MN7A 4DQ8A 3GG4A 2GTDA 5JLFA 4H5RA 5AZIA 1RGIA 2FLOA 2HF4A 4PKHA 4BR4A 4B1VA 4CZKA 1Z6RA 2P9KB 5EXWA 3ZX2A 4LC9B 5JLHA 2AA4A 2ZWHA 1T44A 1GLBG 1BA0A 5EVZA 5AQYA 5AQXA 5CE3A 1S3XA 1J6ZA 2P9LB 2P9UB 3EO3A 3UKRA 2VCPA 4MO4A 3EKSA 3H3NO 3H46O 4BVOA 3WXKA 5BPLA 4XH1A 1WUAA 2V52B 3FZMA 1JCEA 2H3GX 5ELZA 3D2FB 3WUHA 5AZJA 3C7NA 2CH6A 2P9PA 4WYBA 5ADXH 4QS9A 3O4WA 5EX5A 4JHDB 3WXIA 2PAVA 4BR5A 5KPZA 3ZEUA 1GLLO 2OANA 2A6AA 4H0PA 2D0OA 2A40A 1YVNA 3O8MA 4CD3A 2D4WA 3ID8A 2P9IA 3DXMA 5BRHA 4HWIA 2YHWA 4GY2B 4FWSA 2Q2RA 3MN9A 3KVGA 4IXCA 4FPAA 5AQOA 5EOYA 4CJ7A 1IG8A 2QWRA 3IMXA 1X9JA 1ZXOA 3A5NC 3WEEB 5FPDA 3LM2A 1DEJA 3D2EA 3LDPA 5BPNA 1MWKA 3C0BA 5KQ8A 1TYQB 1EQYA 2IIRA 5AQPA 5JMVA 3FGUA 2YJFA 2GEMA 1TUUA 3LDQA 1V4TA 4WQ5A 4ISFA 2P9NA 4H5TA 1NWKA 4BR0A 2E2PA 3VEOA 2A3ZA 4EFHA 3A5MC 2QXLA 1E4FT 3WXJA 4BRNA 4BRPA 1QZ5A 3CJ9A 3LM9A 1BG3A 1RDWX 2Q36A 1HKGA 2W41A 3DXKA 5KQDA 3U4LA 1V4SA 3IDHA 3P4IA 4A62A 1X3MA 4Z94A 1QQOA 2NZTA 4FWLA 3ATVA 3H3OB 4FWQA 3QBXA 4XH4A 3U9ZA 3H1QA 1GLJO 2A42A 3W0LA 2QWOA 1BDGA 1HKBA 1U2VB 1NMDA 5AQJA 4YDUC 2E20A 4MLEA 4FSVA 5BR9A 4L3QA 1NGFA 2BTFA 1YUWA 3ZX3A 3H45C 3FZLA 1X3NA 2GUPA 3EN9A 5BRDA 3VEZA 3L4IA 3HTVA 4BRCA 1SQKA 4B9QA 3OHRA 1BO5O 2FSJA 4B1YB 3VF6A 4PL7A 1K8KA 2QWLA 3A5LC 3GL1A 4ISEA 3CJAA 2FSNA 3I8BA 3GE1A 3AAQA 1HKCA 1ATNA 1NGBA 1C0FA 3U8XA 1NGIA 3HSCA 1JCFA 3WT0A 3MN5A 1GLEG 3IFRA 2DPNA 4C23A 3VGMA 1BWFO 3VGKA 5AQWA 2J4RA 1S22A 1H1VA 3CQXA 1T6CA 4BGAA 4B1UB 4BRGA 5AZIB 1LCUA 1ESVA 4FO0A 5ADXA 1MWMA 3QB0A 5FPMA 2HOEA 3FZKA 4IJNA 1HJOA 4CZJA 3G25A 2D1KA 3A8YA 5B8HA 3AY9A 3VEYA 4BRIA 2Q0UA 2ASMA 1BOTO 4F9OA 2A5XA 3A0IX 3UKRB 1QHAA 1NGHA 5BN9A 4EHUA 4M7XA 2E8AA 1D4XA 1GLAG 3WQTA 4A61A 4QS7A 1KAYA 3BUZB 4YDUA 3HZ6A 3O1WA 4J8FA 4BROA 4PL8A 5I9EB 4BC4A 4EHTA 3C7NB 1QZ6A 2FSKA 2P9PB 2Q97A 3CJCA 4NB4A 3ATUA 2D0PA 3VF4A 4BRAA 3GDQA 2CGLA 4AM7A 4E1JA 5AQQA 3ZEUB 5F2RA 4H0TB 3CJBA 3CJ7A 3UKUA 3KHYA 3HM8A 2P9IB 5AQZA 3S41A 4CBXA 1XQSC 2QWMA 3DXMB 3VEWA 4A2AA 5LJVA 4FWMA 1BA1A 4BQLA 4PKGA 3VESA 1HUXA 4K41A 3CIPA 3SLCA 5F0XA 1XC3A 2UYTA 2QWPA 3VETA 3EKUA 5AQKA 4BVPA 3I33A 5KPRA 2GWJA 2ITMA 3AAPA 3D2EB 4RTFD 3O80A 2VWBA 2E1YA 3MMVA 2E1ZA 3H1VX 1Y64A 3HI0A 3M6GA 3UB5A 4B1WB 5AQUA 4Y0WA 4AM6A 5AQVA 1E4GT 1QQMA 3GBTA 2IVPA 3U9DA 2P9NB 1SZ2A 1TYQA 2IVNA 3QDKA 2NLXA 3L6QA 4EAHD 4M7YA 1NBWA 3DWLA 2CGJA 3MDQA 4BR2A 3FFKB 3SK3A 2ASPA 2A41A 2Q0RA 4JAXA 3DXKB 2QWNA 4IJAA 2YHYA 4BG9A 5LY3A 2VYPA 5EY4A 1WOQA 4CD1A 5AFUA 1CZAN 3B8AX 5AQSA 1YXQA 3W3DA 3VENA 3MCPA 3RSEA 3QICA 5BREA 1NGEA 3O08A 1NGAA 3H6EA 1LOTB 2BUPA 3SJHA 4B1ZA 3QBWA 5FPNA 1GLDG 2I7PA 4MLHA 4BRQA 3O5BA 3LDLA 4QS8A 3JXUA 2Q1NA 5LJWA 4XH5A 1R59O 2ZGZA 4FWOA 1T6DA 3ULEB 3ZETA 4CBWA 3MN6A 4I6MA 3R6MA 2QM1A 4BRDA 4JD2A 3HBTA 3CHWA 1P8ZA 2P9SA 3ENHA 5AQMA 4H5WA 4WQ4C 1MDUB 3UE5A 1NGCA 4KBOA 3CI5A 3VERA 2QW9A 4IWVA 2ZGYA 3QFUA 3EL2A 4M63C 4RWTA 4IZ9A 4CZFA 4IO8A 2P9KA 3EZWA 1G99A 4H0OA 4A2BA 3O6WA 1IJJA 1Q18A 4CBUA 4BRLA 1NGJA 2V7YA 5TKYA 3R8EA 3GOIA 4WQ5C 3FE1A 2CGKA 2Q31A 2P9UA 2P9LA 2WUSA 5AZJB 1BU6O 3BF1A 4O8KA 4CZEA 2FF6A 2HMPA 2GWKA 4K42A 2IVOA 3D2FA 3J8AA 4FWPA 1DKGD 4DB3A 5E84A 5AQHA 3BP8A 2AP1A 3FLCO 2PBDA 4JHDA 4CI6A 1ATRA 2W40A 5KPTA 1KAZA 3UKUB 4O5FA 4CZMA 5BN8A 4FOEA 4H03B 3TPQA 4RCHA 4HTLA 5BRFA 4ISGA 2FXUA 1HLUA 1OKJA 3VPZA 4BG8A 4BC2A 2FF3B 1HPMA 3FZHA 1MA9B 3BF3A 4B1XB 4BGBA 3ZX0A 3O1BA 4BC5A 1C0GA 3CQYA 1NGDA 2ASOA 4WQ4A 3TU5A 4FWKA 3WEEA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2KLAA 3VEXA 4OPHA 5AQTA 1B92A 5BR8K 5JS1A 4M3TA 4CZIA 3OYFA 1ZC6A 4AILC 2QKBA 3L3VA 2E88A 3F2KA 4CFBA 3KLHA 2GL1A 3E9LA 4ICLA 2E2NA 2O4IA 4B9NA 2I7NA 2QWQA 4CJ3A 1IKWA 4QCLA 4CIFA 3OYDA 1IO2A 4E1NA 4WCEL 3D7EO 4JN4A 3HPGA 3DLGA 3WXLA 4A5BA 4FJ9A 1Z05A 3DLEA 2Z1HA 2KW4A 1AYJA 4CHPA 4CZHA 4DU1A 3VEVA 1D8YA 3QNNA 4KTZA 1QE1A 1YAGA 1N5YA 2X74A 3J81O 1MR4A 4BRHA 4E1MA 4J2BA 2CH5A 4CJ4A 1K8KB 3LDOA 5GINA 3CFPA 1DQ7A 2E2OA 2UXBK 3AVGA 3O9SA 5CY4A 2HF3A 2W6LA 3EE8A 4LD0A 5AQLA 4DFMA 3LL3A 2HHSA 4I6MB 3KK1A 4CJPA 4DHYA 3M1FA 3WNGA 3ZYYX 4BRKA 4UY8O 3BEXA 1C1BA 5M1FA 4TSXA 2A1RA 2HHWA 1KXPA 2YHXA 4IDKA 5AQIA 3ULEA 3TSUA 1TUYA 5C0YA 2P9SB 3JSMA 3MEDA 4FOIA 4QAGA 3HJFA 4CZGA 3MCAB 1UOCA 3IKMA 1ZBSA 5HLFA 1TKTA 2GV9A 1SL0A 4CW7B 2D0BA 1DTTA 1EO1A 1SNBA 1Q8IA 3IG1A 3DLKA 4KH5A 1RGIA 2FLOA 4JS4A 4BR4A 1Z6RA 3ZSOA 1TVRA 4OPJA 3ZX2A 5JLHA 1ICAA 2ZWHA 1CHZA 1QS4A 1N32K 5AQYA 5AQXA 4M3RA 3E1YA 3KOXA 1RBRA 1J5EK 1S3XA 1RBVA 1RBTA 3THYA 3KLFA 3LWMA 3M5RA 3TARA 4BVOA 2FBTA 1WUAA 2H3GX 3V81A 5ELZA 4J2DA 1EWQA 3OYHA 2IGIA 2CH6A 2P9PA 4WYBA 4DV3K 4JEPA 3IRXA 4AB0A 4FLTA 4JHDB 3TTDA 1VSLA 4CJSA 4BR5A 1BIUA 1GLLO 1NK7A 2A6AA 3G6EN 4CD3A 1WMTA 1LWFA 1TK0A 3SUOA 3DXMA 4FYDA 5BRHA 1NJYA 3C95A 3E7UX 1TL3A 2YHWA 3KIOA 3IAYA 2Q2RA 4IG3A 3KVGA 1S6QA 5AQOA 4DSEA 2NRXA 5J2NA 3IMXA 3MEGA 1X9JA 4DLEA 1X9WA 3AVAA 4NXNK 4DTNA 3LM2A 1DEJA 2YNHA 1MWKA 3NH0A 4FJNA 1EQYA 4KAZA 4HUEA 1VQPN 3KTQA 3FGUA 4FJ7A 5CY0A 4CFAA 3CD6N 3HPOA 4H4OA 2E2PA 4FJ5A 4ZTFA 2NRVA 3VEOA 1JJ2M 3A5MC 2QXLA 4KHUA 3WXJA 4BRPA 3L2QA 3DM2A 4JYAK 3KD5E 3AVJA 1C56A 2W41A 5KQDA 2NY8X 1XNRK 4A62A 4M3WA 2E4LA 4JS5A 1RBSA 1QQOA 2NZTA 1QVGM 2QKKA 3AGKA 3CM6A 4FZYA 3CF5L 2E6MA 1RTDA 1IG9A 2A42A 1NMDA 1U2VB 3S3OA 5AQJA 4YDUC 4FSVA 3VQAA 3S3MA 1NGFA 4M45A 4HCBA 1WAJA 4CESA 4CGGA 1YHQN 3HK2A 3ALYA 2Y1JA 2O8BA 3VEZA 3L4IA 4BRCA 1NE5A 1VQ5N 1BO5O 1YJNN 2HBMA 1UA1A 4NXMK 4FLVA 1NH5A 4DFJA 2QWLA 3RWUA 3HO1A 1W9HA 3CJAA 1VSKA 3L56A 1L3TA 3AAQA 1HKCA 1C0FA 3TTFA 1M90O 3IFRA 2DPNA 2AJQA 4B9VA 2VG5A 3DRPA 3CYGA 3VGKA 2QA4N 1H1VA 1T6CA 3VQQA 2NRTA 2VG6A 1QQCA 2HVHA 5FPMA 2HOEA 4CZJA 3G25A 2MZ0A 3A8YA 4GVMA 2KSKA 1SKRA 4CHZA 3BZKA 4IG0A 4F9OA 3A0IX 2F8SA 1Q9XA 2E8AA 4E89A 3KHWA 1EETA 3BUZB 2D0CA 4YDUA 3HZ6A 4BROA 4PL8A 5I9EB 4DV6K 4BC4A 2QEXN 2FBVA 1ASUA 4YOWA 1LW0A 1IBMK 4BRAA 3GDQA 1BIZA 2CGLA 3RMDA 5AQQA 3ZEUB 2UU9K 1UGLA 5F2RA 1NG9A 4K0KK 2ITGA 5JVHL 4FJXA 3UKUA 3KHYA 4PUOA 4JKFA 4CQKA 3L2RA 4F4KA 3VEWA 5LJVA 3D45A 4NLCA 1HR0K 1BA1A 3THXB 3OYMA 2HBKA 1JZBA 1I6GA 1C1CA 4FK0A 5C25A 3V9WA 3I33A 3LALA 2ITMA 3O80A 2VWBA 1KC8O 2E1YA 2P5OA 4DV1K 3I56N 4I9LA 1BL3A 4JI8K 2HHUA 5AQVA 1BQMA 4B08A 2LJMA 3GBTA 4FLXA 4ZTJA 1VAZA 3U9DA 4RW6A 4FJIA 1SZ2A 2P1JA 3KLIA 1KVCA 1RT2A 1HNWK 4EAHD 3C6HA 3TAPA 3DLBA 2C1GA 3LAKA 1OVYA 3LZIA 1LQIA 5M1NA 1OH6A 3OBWA 4FJHA 1S1XA 2B6AA 3ZT2A 3AV9A 2WFBA 2XY8A 2OA8A 3DXKB 1L5UA 5HL7L 3TR8A 2YHYA 2YV0X 1D9DA 1RT3A 3PIOL 2HHQA 1CZAN 3F9KA 1VQ7N 3T3FA 3RRGA 4CF9A 3QICA 3KD1E 4CFCA 2N2QA 4B1ZA 3QBWA 2UUBK 4BRQA 3SPZA 4A5AA 4ELTA 3DRSA 3CXCM 1XMQK 4DSKA 4CGHA 1C55A 1R59O 1XNQK 3ULEB 3L2UA 4I6MA 1PTXA 3QI7A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2KLA A;  3VEX A;  4OPH A;  5AQT A;  1B92 A;  5BR8 K;  5JS1 A;  4M3T A;  4CZI A;  3OYF A;  1ZC6 A;  4AIL C;  2QKB A;  3L3V A;  2E88 A;  3F2K A;  4CFB A;  3KLH A;  2GL1 A;  3E9L A;  4ICL A;  2E2N A;  2O4I A;  4B9N A;  2I7N A;  2QWQ A;  4CJ3 A;  1IKW A;  4QCL A;  4CIF A;  3OYD A;  1IO2 A;  4E1N A;  4WCE L;  3D7E O;  4JN4 A;  3HPG A;  3DLG A;  3WXL A;  4A5B A;  4FJ9 A;  1Z05 A;  3DLE A;  2Z1H A;  2KW4 A;  1AYJ A;  4CHP A;  4CZH A;  4DU1 A;  3VEV A;  1D8Y A;  3QNN A;  4KTZ A;  1QE1 A;  1YAG A;  1N5Y A;  2X74 A;  3J81 O;  1MR4 A;  4BRH A;  4E1M A;  4J2B A;  2CH5 A;  4CJ4 A;  1K8K B;  3LDO A;  5GIN A;  3CFP A;  1DQ7 A;  2E2O A;  2UXB K;  3AVG A;  3O9S A;  5CY4 A;  2HF3 A;  2W6L A;  3EE8 A;  4LD0 A;  5AQL A;  4DFM A;  3LL3 A;  2HHS A;  4I6M B;  3KK1 A;  4CJP A;  4DHY A;  3M1F A;  3WNG A;  3ZYY X;  4BRK A;  4UY8 O;  3BEX A;  1C1B A;  5M1F A;  4TSX A;  2A1R A;  2HHW A;  1KXP A;  2YHX A;  4IDK A;  5AQI A;  3ULE A;  3TSU A;  1TUY A;  5C0Y A;  2P9S B;  3JSM A;  3MED A;  4FOI A;  4QAG A;  3HJF A;  4CZG A; 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