5FPDA

Structure of heat shock-related 70kda protein 2 with small-molecule ligand pyrazine-2-carboxamide (at513) in an alternate binding site.
Total Genus 119
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
119
sequence length
381
structure length
378
Chain Sequence
GPAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTIFDAKRLIGRKFEDATVQSDMKHWPFRVVSEGGKPKVQVEYKGETKTFFPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGGKVHSAVITVPAYFNDSQRQATKDAGTITGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKGGEKNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVSHLAEEFKRKHKKDIGPNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGVDFYTSITRARFEELNADLFRGTLEPVEKALRDAKLDKGQIQEIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILIG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Chaperone
molecule keywords HEAT SHOCK-RELATED 70KDA PROTEIN 2
publication title Detection of Secondary Binding Sites in Proteins Using Fragment Screening.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 119
structure length 378
sequence length 381
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-11-28
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5fpdA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5fpdA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5fpdA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5fpdA04
4BRQA 1GLLO 3DXMA 1DKGD 3H45C 3WQUA 1QZ6A 4O5FA 2Q0UA 3HTVA 2P9IB 1LCUA 5KPZA 3GOIA 3QICA 3VPZA 5AQNA 4BRLA 2Q36A 2YI1A 3GDQA 4A2BA 2GEMA 1K8KB 2A5XA 2D0OA 3AAQA 3FLCO 4XEIA 5BPNA 1ZXOA 3FZLA 2Q1NA 1XC3A 4HTLA 3HSCA 1GLDG 3WEEA 3ZEUB 3GG4A 3AY9A 4FO0A 3CI5A 4JNEA 2EWSA 4FSVA 3VGMA 3DXKA 1KAYA 5AQZA 2QWMA 2V7ZA 2I7PA 4K43A 4IJNA 5F0XA 4FPAA 4JD2A 2YJEA 4NB4A 3B8AX 3W0LA 3G25A 4EHTA 4PL7A 5AQUA 3QBWA 2ZGZA 1HJOA 3JS6A 4CI6A 4BC5A 2QWPA 1HKGA 4IWVA 2ZF5O 4H5RA 3UKRB 4YDUA 3KHYA 4B1YB 3QFPA 1YAGA 2E2PA 4BRNA 2HMPA 2PAVA 2I7NA 3U8XA 3M6GA 1HKCA 4ISFA 3VF2A 3QBXA 3O5BA 3J8AA 3H3NO 3AARA 5AZIA 2QWRA 4CZJA 3SMPA 3DXKB 5AZJA 3ENHA 4H0XB 3VF4A 5JMVA 4AM6A 4BQLA 3A8YA 5AQWA 3W3DA 4B1VA 3A5NC 1NBWA 2A3ZA 4JD2B 3BF1A 4BQZA 4L3QA 3VETA 3VEXA 4BC3A 2QXLA 4BRDA 2E1YA 3O8MA 4CZGA 3L6QA 2QM1A 3WXJA 1ATSA 4J8FA 4H5WA 1BO5O 2ASPA 2PBDA 3LL3A 1E4FT 1XQSC 3WXLA 3EL2A 4H0YB 4XH1A 1WUAA 2YHYA 3EN9A 1BDGA 2HF4A 3CQXA 3VEWA 5KQ8A 2HOEA 2J4RA 4EIAA 2P9LB 1E4GT 5ADXH 4CBWA 1C0GA 4I6MA 1EQYA 2CGJA 4DHYA 3M3ZA 3SLCA 1NGAA 3IUCA 3UE5A 4AM7A 5AZJB 5BRDA 1GLJO 2Q0RA 3P4IA 1ZBSA 1Z6RA 3O6WA 4FWMA 4BR9A 1KAXA 2E2OA 4GY2B 1JCGA 1IJJA 1YUWA 3H1QA 4FWOA 4H0TB 5B8HA 2A42A 1JCEA 3VESA 4H03B 4H5TA 4H0OA 4EHUA 2QW9A 3FGUA 4ISEA 4PKGA 5AQLA 2GWJA 4H5VA 3BEXA 3LDOA 1BA1A 2IIRA 4WQ5C 4BRFA 3ID8A 3LM9A 1T44A 1NLVA 4A61A 2FF6A 2V52B 1X3NA 4BC2A 1MWKA 4BR2A 5E84A 3GL1A 5AQQA 3C7NB 5AQIA 4FWPA 2E2QA 5KQDA 4JN4A 3WUHA 1NMDA 1LOTB 2BTFA 4BRKA 2V51B 3IFRA 1HUXA 3GBTA 3U9ZA 3VENA 1V4SA 4FOIA 3AAPA 4MLEA 4QS9A 2V7YA 1Y64A 2BUPA 4BRIA 4GNIA 3UKRA 4XH4A 4H5NA 3MK6A 2W40A 5BRHA 4BRMA 3OHRA 3UKUA 3EKSA 1ATRA 4E1JA 3WXIA 3VEOA 1NGEA 1XUPO 4FWQA 3A5LC 2OANA 5E26A 1QZ5A 3CETA 4B1XB 4EFHA 1SQKA 3IMXA 3O1WA 5AQMA 3VF6A 1GLAG 3EZWA 1RGIA 4MLHA 5BRFA 1NGDA 5LJWA 2ASOA 5AQYA 2Q31A 3ZETA 4BREA 5AQPA 2FSKA 3FZHA 1RDWX 2DPNA 4BR7A 1NGHA 1HPMA 2YJFA 3FZKA 3A5MC 4FWSA 3U9DA 5BREA 1SAZA 1NGFA 1G99A 4M63C 3QDKA 4Z94A 3CJCA 5LY3A 4CJ7A 2QWQA 4WQ4A 5AQGA 5F1XA 4B9QA 3UKUB 4CZLA 5EXWA 2P9LA 4BROA 1WOQA 5AQFA 5JLHA 5KPTA 4CZEA 1NM1A 3KVGA 4BRCA 3H3OB 3F9MA 3ZETB 5AFUA 1NWKA 4IZ9A 2E2NA 3HI0A 3MN6A 1BA0A 3C0BA 2W41A 1ESVA 1V4TA 1MWMA 3LDPA 1KXPA 1IG8A 4H0PA 4CBUA 3SK3A 4RCHA 1BUPA 3FFKB 3WT0A 3CQYA 3FE1A 2NZTA 2VYPA 3HM8A 2IVOA 3EO3A 1D4XA 4PKIA 3TU5A 3VGLA 3FZMA 1YXQA 2D4WA 2YCHA 1TYQA 3MN5A 1QQOA 5AQXA 2E1ZA 2F9WA 3C7NA 4BRGA 1HLUA 2NRHA 3RSEA 3JXUA 2E8AA 3O80A 3ENOA 5KPRA 3D2FA 5FPEA 4CBXA 5FPMA 5BR9A 4JAXA 1BOTO 4F9OA 3FR0A 2UYTA 3CJ7A 4MO5A 3LDNA 2ZGYA 3CIPA 4BRPA 5AQTA 5TKYA 1JCFA 2E88A 5BPMA 3R9PA 3EKUA 4QS8A 4DB3A 3CJAA 4CZIA 2FSNA 1ATNA 2YHWA 3DWLA 2QWLA 5BPLA 5FPDA 4K25A 1TYQB 2CH5A 1MDUB 3VGKA 1C0FA 3ULEA 2D1KA 4RWTA 4FWLA 1QQMA 4C23A 4FOEA 4DQ8A 2Q2RA 3H46O 3RSEB 3L4IA 2GUPA 4XH5A 4YDUC 5AQKA 4ISGA 3O1BA 3D2FB 1ZC6A 1QHAA 2IVPA 3WXKA 3ZX2A 3U4LA 2A40A 2GWKA 2FSJA 2GTDA 4CZMA 4O8KA 5AQHA 1U2VA 1S3XA 3QMLA 5AQVA 4BG8A 1TUUA 3ZX3A 5BN9A 3GE1A 4K41A 3R6MA 3DJCA 1NGIA 4IXCA 3VEVA 3M1FA 2F9TA 2VWBA 4BR0A 1NGJA 1KAZA 3CJ1A 3L0QA 4NO7A 3ULEB 4FWNA 4FWRA 4A2AA 1H1VA 4A62A 2QWOA 1BG3A 2FXUA 4BRHA 4BVOA 4BGBA 4BR4A 2FLOA 3FZFA 2A41A 3TPQA 4BRAA 2P9UB 1SZ2A 5JICA 3LDQA 5CE3A 1HX1A 1DGKN 4EAHD 4BC4A 2P9PA 1GLEG 1U2VB 4PKHA 4WYBA 1U6ZA 2P9SA 4WQ5A 1NGCA 3BF3A 3DXMB 3MMVA 4CD1A 2VCPA 3A0IX 1BWFO 1R59O 2ITMA 3BUZB 2AA4A 5F2RA 2CGLA 3D7EO 1TUYA 4MO4A 3SJHA 4JHDA 4CD3A 4H0VB 1T6DA 5ADXA 3H1VX 5FPNA 1QQNA 3CHWA 2P9KA 4FL9A 3S41A 2GELA 4B1UB 5JLFA 2WUSA 3HBTA 1MA9B 5EVZA 3VOVA 2Q97A 4IO8A 1X3MA 3LM2A 3WEEB 5AQOA 3ATVA 5LJVA 3ATUA 5EX5A 3D2EA 5AQSA 3A5OC 2P9PB 5AQJA 3MN7A 3I33A 4M7YA 3CERA 3O08A 3QFUA 4Y0WA 3WQTA 2P9SB 3KZBA 1S22A 2D0PA 2FF3B 3QB0A 4BG9A 3IDHA 2HF3A 4LC9B 4DCHA 2AP1A 5I9EB 2H3GX 3LDLA 4JHDB 1X9JA 2IVNA 2NLXA 3CJ9A 2P9NA 1NGBA 1BU6O 1NGGA 2P9KB 4BR5A 3MDQA 1DEJA 4B1WB 1P8ZA 3DAWA 4BGAA 3MCPA 2A6AA 5AQRA 1GLFO 1Z05A 3R8EA 2CH6A 3D2EB 5AZIB 5BN8A 3UB5A 4CZHA 3ZX0A 3VEYA 4CZKA 3VEZA 1Q18A 1GLCG 2E20A 2YHXA 2ZWHA 4M7XA 5AFUH 1OKJA 2P9IA 3O4WA 5EY4A 1YVNA 3VERA 3SMSA 4KBOA 3CJBA 3BP8A 4RTFD 4BVPA 4CZFA 2CGKA 1CZAN 3HZ6A 4IJAA 5EOYA 2P9NB 4FPBA 1K8KA 2ASMA 4B1ZA 1T6CA 3MN9A 4K42A 2KHOA 3H6EA 2QWNA 4FWKA 4WQ4C 2P9UA 4HWIA 5ELZA 1J6ZA 1GLBG 3ZEUA 3I8BA 4PL8A 5AR0A 1RFQA 4QS7A 1HKBA 4I6MB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2QKBA 1NG9A 2IC3A 1QZ6A 3L2QA 2Q0UA 2P9IB 1NK8A 1I2VA 1EO1A 1TGOA 3CCSN 5FLXO 5KPZA 3KK3A 4LSNA 1FJGK 4JKAA 4BRLA 2Q36A 2O8DA 1XI1A 2A5XA 3L2VA 1OMYA 4XEIA 3FZLA 1KFDA 4Z4HA 1GLDG 4XIUA 3S3MA 1K8AO 4E1NA 4FO0A 4A59A 1IG9A 2N2QA 4FSVA 1LWEA 3ZLJA 1TL3A 4X65K 3VQ7A 1SUQA 4FVMA 4JD2A 5C10A 2DY4A 3B8AX 1VHXA 4CEDA 4ZTJA 4EZ6A 2OPRA 1HNIA 3G25A 4G1QA 1NJZA 3VQPA 1NK0A 1L3VA 2YV0X 1VSIA 1K9MO 4OPAA 1HKGA 1RDBA 1BMRA 3JYTA 1VRUA 3KHYA 3QFPA 2I7NA 3EY1A 2HBJA 2YKMA 3J8AA 3H3NO 3AVMA 2JDQD 3LPUA 1QVFM 2B68A 2QWRA 3SMPA 1P90A 1CXUA 5LMNK 3E7UX 5JMVA 1UWBA 4BQLA 3A8YA 4IEIA 5AQWA 4O4GA 4B1VA 4BDZA 3NGIA 3KKSA 2HHQA 4L3QA 1G15A 3VEXA 4BRDA 2E1YA 4CGJA 2NY9X 4AHUA 3ISNC 3WXJA 4FZXC 2P5OA 1REVA 2ASPA 4CERA 3K57A 3LAKA 4DTNA 3LL3A 4W5OA 3E9OA 3O3FA 4H0YB 3PO4A 1J54A 3VEWA 1RDDA 4FW1A 2HOEA 4EIAA 3EYZA 1ASWA 5ADXH 4CBWA 1Q81O 3KLGA 5K14A 3SLCA 3OTOK 4DLGA 1WT7A 3UE5A 3NH0A 1A5XA 1ZBSA 4FWMA 3F5TA 4HE7A 1SL1A 2Z1JA 3H1QA 3QEWA 1JCEA 3VESA 3MXIA 1M90O 3LAMA 4H5TA 3TAEA 1YTUA 3ASMA 2QW9A 1YJNN 2FC0A 1P0AA 2P51A 3VQ4A 4H5VA 3BEXA 3LDOA 2YKNA 4CIEA 3ID8A 4B8CA 3NF7A 3KD5E 2YIOA 1BQMA 3AV9A 3EZ5A 2W6LA 3PIOL 4BY9C 1I3AA 4XJXA 3SCXA 1K6YA 3OS0A 2UU9K 5FRMA 3C7NB 5BR8K 2E2QA 1NMDA 3HVTA 3L8BA 4KHSA 3CPEA 4H4MA 2V51B 3GBTA 3VENA 3ZT0A 2O8EB 2O8FA 4FOIA 4MLEA 1W2BM 1FK9A 1Y64A 2V7YA 2BUPA 3K2PA 3UKRA 4CQKA 1U47A 5DM6L 4U7BA 2B3CA 4H5NA 3CCVN 3MK6A 2W40A 4DQRA 3AVCA 3VQAA 1SL0A 1ATRA 2ASCA 3VEOA 4FJMA 1NGEA 4OPJA 3A5LC 2G8WA 4EFHA 1DTTA 3ZT2A 3LP3A 4Y1DA 4CGFA 4C1NK 5LJWA 1NK9A 2JWLA 3NH1A 1T7PA 4JLHA 4BR7A 1HPMA 4L8RB 4N76A 1PTXA 2A1RA 1G99A 1VAZA 2AJQA 4Z94A 3TR8A 5DMRA 1DJTA 3B6PA 5AQFA 4PHTX 5JLHA 5KPTA 1ZU3A 5J2PA 4NCAA 4CECA 4CJ5A 4BRCA 4YORA 3H3OB 3JSMA 3R2VA 4WFAL 3THYB 3QO9A 3T1HK 2UUBK 1BA0A 5I42A 1V4TA 3SAGA 1MWMA 3M8RA 3LDPA 1KXPA 2YBRC 4WE1A 2R7YA 1C6VA 1XMQK 4DTMA 4RCHA 3L3UA 3WNFA 4FK0A 1HRHA 1S72N 4A5AA 1D5AA 3FE1A 4E89A 3V81A 3PV8A 2VYPA 3HM8A 3OS2A 4MQ3A 3O4NA 1TYQA 3N4PA 2F96A 1QQOA 5AQXA 4GKJK 2E1ZA 2NRHA 1Q82O 4E3SA 1BL3A 3C94A 1HMVA 3OYLA 3ITHA 5HRNA 2VWJA 3AA3A 4RW7A 1VQ7N 2FBTA 3NGZA 4JAXA 1BOTO 3FR0A 5C42A 2ZGYA 5HOOA 1JCFA 1GOBA 2XHBA 5BPMA 4N56A 2D0CA 4OJRA 4B3MK 3AO2A 3CCJN 2YHWA 1D9FA 5JENA 3DWLA 4K25A 2DFEA 1CN2A 2GUIA 3DLLL 3K59A 4KKOA 1QSYA 1YF5L 3AVIA 4RWTA 1ZYVA 3DOLA 4C23A 4FOEA 1GPTA 5M1NA 1VSEA 5AQKA 3MXJA 1RTJA 4IOCL 4NYNA 2G8FA 4C8LA 3AGKA 4JKHA 4DTUA 3T1YK 2UXBK 2FSJA 2GTDA 3THVA 3HT3A 3SUPA 1NK5A 4F2RA 4JK7A 5CR4A 1POIA 2HSTA 1YIJN 4FJ5A 1GOCA 3R6MA 1HQEA 4IXCA 2QTDA 1NU0A 1HNXK 4DTJA 3G71N 4JI1K 1DT9A 3NAEA 3CJ1A 2HBLA 1BISA 4NO7A 1ZUTA 3J7YP 2LR3A 3ULEB 1VSFA 2EX3A 3IG1A 2KTQA 5KGXA 4FWRA 3DRSA 1X1PA 4PA1A 1BG3A 3CCUN 2A41A 3TPQA 4UADE 1TVRA 5CZ1A 1FKPA 2JWKA 3LP1A 2QKKA 1HNWK 3HK2A 2G8KA 3NMUA 1RBSA 1PX9A 4WYBA 1U6ZA 4HCBA 2P1JA 4DV0K 1JLBA 3I55N 3AVBA 3A0IX 2ITMA 3NDKA 2AA4A 5F2RA 1NOZA 3D7EO 1C56A 3DRPA 1SS6A 1T6DA 3OYBA 2HW3A 1VSJA 1QQNA 2VQEK 4HHFA 1U4BA 1TK0A 3S41A 3MAQA 4YY3K 2O8DB 4B1UB 4CHZA 3AVNA 1XMOK 4NYFA 2YEOA 5EVZA 1UAXA 1VSLA 1X3MA 1WSEA 5AQOA 3ATVA 5LJVA 2KGQA 3ATUA 3D2EA 5EX5A 4JS5A 3A5OC 2P9PB 4LF8K 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2QKB A;  1NG9 A;  2IC3 A;  1QZ6 A;  3L2Q A;  2Q0U A;  2P9I B;  1NK8 A;  1I2V A;  1EO1 A;  1TGO A;  3CCS N;  5FLX O;  5KPZ A;  3KK3 A;  4LSN A;  1FJG K;  4JKA A;  4BRL A;  2Q36 A;  2O8D A;  1XI1 A;  2A5X A;  3L2V A;  1OMY A;  4XEI A;  3FZL A;  1KFD A;  4Z4H A;  1GLD G;  4XIU A;  3S3M A;  1K8A O;  4E1N A;  4FO0 A;  4A59 A;  1IG9 A;  2N2Q A;  4FSV A;  1LWE A;  3ZLJ A;  1TL3 A;  4X65 K;  3VQ7 A;  1SUQ A;  4FVM A;  4JD2 A;  5C10 A;  2DY4 A;  3B8A X;  1VHX A;  4CED A;  4ZTJ A;  4EZ6 A;  2OPR A;  1HNI A;  3G25 A;  4G1Q A;  1NJZ A;  3VQP A;  1NK0 A;  1L3V A;  2YV0 X;  1VSI A;  1K9M O;  4OPA A;  1HKG A;  1RDB A;  1BMR A;  3JYT A;  1VRU A;  3KHY A;  3QFP A;  2I7N A;  3EY1 A;  2HBJ A;  2YKM A;  3J8A A;  3H3N O;  3AVM A;  2JDQ D;  3LPU A;  1QVF M;  2B68 A;  2QWR A;  3SMP A;  1P90 A;  1CXU A;  5LMN K;  3E7U X;  5JMV A;  1UWB A;  4BQL A;  3A8Y A;  4IEI A;  5AQW A;  4O4G A;  4B1V A;  4BDZ A;  3NGI A;  3KKS A;  2HHQ A;  4L3Q A;  1G15 A;  3VEX A;  4BRD A;  2E1Y A;  4CGJ A;  2NY9 X;  4AHU A;  3ISN C;  3WXJ A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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