5FPDA

Structure of heat shock-related 70kda protein 2 with small-molecule ligand pyrazine-2-carboxamide (at513) in an alternate binding site.
Total Genus 119
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
119
sequence length
381
structure length
378
Chain Sequence
GPAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTIFDAKRLIGRKFEDATVQSDMKHWPFRVVSEGGKPKVQVEYKGETKTFFPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGGKVHSAVITVPAYFNDSQRQATKDAGTITGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKGGEKNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVSHLAEEFKRKHKKDIGPNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGVDFYTSITRARFEELNADLFRGTLEPVEKALRDAKLDKGQIQEIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILIG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Chaperone
molecule keywords HEAT SHOCK-RELATED 70KDA PROTEIN 2
publication title Detection of Secondary Binding Sites in Proteins Using Fragment Screening.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 119
structure length 378
sequence length 381
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-11-28
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5fpdA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5fpdA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5fpdA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5fpdA04
3A5LC 4PL7A 1NGGA 4IXCA 4FWKA 1YAGA 4F9OA 1U2VA 4RCHA 1S3XA 3C7NA 4BRHA 3I8BA 4EIAA 3L4IA 1BA1A 2BUPA 3DAWA 3KHYA 3ZEUA 5E26A 1ATSA 4K42A 4CD3A 3CIPA 1E4FT 2E1ZA 3HBTA 4QS8A 3ZX3A 1S22A 1U6ZA 4O8KA 5ADXH 1R59O 3H3NO 2E1YA 4BRGA 2QXLA 2QWOA 4BR4A 3VESA 2P9UA 1DEJA 5EVZA 4B1VA 3O08A 2QWNA 3CJ9A 5AQOA 1RFQA 2A6AA 1NGAA 1Z6RA 4NO7A 3VEOA 1RDWX 3WXKA 2FXUA 2FSJA 2VYPA 4CJ7A 1GLFO 1BG3A 4A62A 2IIRA 3FFKB 4FOEA 3WEEA 4FWMA 3CHWA 2ITMA 2PAVA 4DCHA 3C0BA 3EKUA 3UKRB 2EWSA 1GLBG 4IJAA 1GLEG 3GOIA 3B8AX 5AQQA 4JD2B 3QBXA 4HWIA 4CZKA 1NGBA 3D2EA 4BGBA 3M3ZA 5CE3A 4EAHD 5BN9A 1P8ZA 4EHUA 3VF2A 1NGEA 2HF3A 3FZHA 4H03B 4RTFD 3FZLA 2UYTA 2HF4A 5FPMA 3DXMB 3M6GA 4HTLA 4QS7A 1GLJO 4EHTA 4B1WB 2HOEA 2GUPA 4FWSA 2A42A 1Q18A 3WT0A 5AQFA 4I6MB 5AQNA 2GWJA 3BEXA 3HM8A 1KAXA 3H6EA 3VGLA 3ZX2A 3DWLA 5AQIA 3AARA 4CZEA 3C7NB 2VWBA 4BRIA 4BRKA 3ZEUB 4BRMA 1OKJA 5AFUA 1NLVA 4CZFA 5AQMA 3FLCO 3O80A 3O6WA 2V51B 3IMXA 4CZMA 1BWFO 2WUSA 1NGFA 3I33A 4H5TA 4IO8A 3W3DA 1JCEA 4DB3A 2YHWA 4YDUA 4KBOA 2VCPA 1ATNA 1X3MA 4H0YB 3LM2A 2YHXA 3MDQA 3BF1A 3R6MA 3TU5A 2P9UB 4Z94A 1GLAG 3VEZA 5AQLA 2E2QA 1NGIA 4MLEA 2IVNA 4WQ4A 4FWQA 4BRDA 5JLFA 4WQ5A 4CZGA 5BR9A 1HUXA 3MCPA 1YVNA 3H45C 2W40A 1NBWA 3JXUA 2D1KA 3ENHA 1D4XA 3GL1A 2V7ZA 4CZJA 1T6DA 5FPEA 5BPLA 3HI0A 1DGKN 1TUUA 3U9DA 3WEEB 2DPNA 4M63C 1K8KA 5F1XA 3HSCA 4ISEA 1C0FA 2NZTA 3A0IX 3SLCA 4CBUA 1JCFA 2E2PA 3GE1A 3D2EB 2I7NA 2E2NA 3BUZB 4IWVA 2GELA 1YXQA 2ASMA 4FOIA 3SMSA 4WYBA 4B1XB 1G99A 4K43A 2NRHA 2ZGYA 3LDOA 4DQ8A 3VF6A 3L0QA 3CJCA 4H0PA 3A8YA 2P9KA 3UB5A 2A40A 4BRCA 1GLLO 3CJBA 4H0OA 4CBWA 2FF6A 3MMVA 3KVGA 3VENA 3VETA 3R9PA 4GNIA 3ID8A 4H5WA 5AQWA 1HKBA 2V52B 4JN4A 4BRAA 5FPNA 2CGJA 4E1JA 1ZXOA 2YJFA 4H0XB 3GBTA 4CBXA 3KZBA 1X3NA 2ZGZA 3VEXA 4MO4A 4BGAA 4FWLA 4BROA 1BUPA 1ATRA 1V4SA 5AZJA 4DHYA 1HKCA 4XH1A 3ULEA 3WUHA 5FPDA 4B9QA 4JHDA 3D2FA 4FWPA 4AM6A 1J6ZA 4Y0WA 4BR2A 4C23A 1H1VA 4WQ5C 1NGJA 5AQKA 1MWMA 3DXKA 4BVPA 5ADXA 4J8FA 2P9PA 1HKGA 4BRFA 4CZHA 3HZ6A 1QQNA 5AZIA 1QQMA 4A61A 3CJAA 3ZETA 3VOVA 2I7PA 4JAXA 1T44A 1WUAA 4BC4A 5BRFA 3O5BA 5KPZA 2ZF5O 3VERA 3EO3A 1HX1A 4FPAA 3S41A 3FGUA 3AAPA 1DKGD 3FZFA 4LC9B 1U2VB 3LM9A 5AQSA 3O1WA 4BVOA 3QICA 4BRQA 1NMDA 5ELZA 4M7YA 3VEVA 5AQRA 1K8KB 3LDLA 1KAZA 4IZ9A 5TKYA 3QFUA 5F0XA 1TUYA 2Q97A 1BOTO 1IG8A 3P4IA 3ATUA 3R8EA 2FF3B 1GLCG 3J8AA 5LJVA 2CH6A 1MA9B 5KPTA 3O1BA 2CGLA 3MN6A 1RGIA 4BC2A 2E20A 3VGKA 3UKUA 4QS9A 3VPZA 3WQTA 1BU6O 3LL3A 2A41A 2P9KB 2CGKA 1MWKA 2Q2RA 4O5FA 4BG9A 3VF4A 1E4GT 3SMPA 2P9IA 2F9TA 1BA0A 3LDNA 3D7EO 3L6QA 2V7YA 5KPRA 4RWTA 1XUPO 4H5NA 5AQGA 1ESVA 1NWKA 4IJNA 3EL2A 4FWRA 4XH4A 1LCUA 3IUCA 2D0OA 2AP1A 3LDPA 2E2OA 4NB4A 4BC3A 4GY2B 2ASOA 3H46O 2A5XA 3WXJA 1JCGA 4A2BA 1QZ6A 3WXIA 4CI6A 4XEIA 5BN8A 3ATVA 1GLDG 1XC3A 3H1VX 3U8XA 3M1FA 5AZJB 3EN9A 1QHAA 4B1YB 3EZWA 3ULEB 4EFHA 5EY4A 3A5NC 4JHDB 5F2RA 3W0LA 3D2FB 3JS6A 3VEWA 4BG8A 2D0PA 1XQSC 2W41A 3DXKB 1HJOA 5E84A 3QB0A 4MO5A 3FZMA 2FSKA 2P9SA 5AZIB 2QWRA 1T6CA 3AY9A 4L3QA 4BR9A 5BPNA 2Q36A 1NGDA 2CH5A 3ZETB 2QWQA 5AQXA 3RSEA 2YI1A 3A5MC 3WQUA 4A2AA 2P9LA 2YJEA 1HPMA 1NGCA 2ASPA 3CETA 5AQZA 1TYQA 1WOQA 4BR7A 3CERA 2QWLA 4BQZA 5EXWA 3EKSA 4CD1A 3HTVA 2P9NA 1MDUB 3VEYA 3CQYA 2QWMA 4YDUC 3UE5A 2FSNA 2GEMA 2E88A 3ENOA 5EX5A 4CZIA 2YHYA 3MN9A 1ZC6A 2AA4A 4H0VB 1KXPA 2HMPA 4JNEA 3O8MA 3VGMA 4FWNA 4BQLA 4FWOA 1KAYA 4FL9A 4WQ4C 1QQOA 5AQHA 2OANA 5AR0A 5KQ8A 3QMLA 4H0TB 1Y64A 2QM1A 4FPBA 4K25A 2IVPA 4PL8A 1CZAN 3H1QA 5AQYA 5BREA 3UKUB 5EOYA 5B8HA 5BRHA 1QZ5A 3FZKA 3AAQA 1BDGA 3GDQA 3CQXA 3GG4A 4K41A 1LOTB 2P9IB 5AFUH 5AQUA 3U9ZA 2QWPA 1C0GA 3O4WA 3MK6A 5LY3A 3IFRA 3IDHA 3A5OC 1V4TA 2H3GX 4PKHA 2FLOA 3QDKA 4H5VA 4BR5A 2GWKA 3BF3A 2ZWHA 3SK3A 3QBWA 3H3OB 4ISFA 4M7XA 4BRPA 3MN7A 4FO0A 2NLXA 5KQDA 1ZBSA 3ZX0A 3U4LA 5AQTA 1NM1A 5AQVA 1NGHA 1EQYA 1BO5O 3CJ7A 2Q0RA 1SZ2A 4MLHA 3QFPA 4FSVA 4B1ZA 2BTFA 4XH5A 5LJWA 2P9SB 5AQJA 3FR0A 1SAZA 4PKGA 3LDQA 4BC5A 2F9WA 3FE1A 3RSEB 5I9EB 3MN5A 2Q0UA 2GTDA 2P9LB 3SJHA 3UKRA 2PBDA 3CJ1A 1Z05A 3DJCA 3WXLA 1TYQB 1X9JA 1SQKA 5AQPA 2A3ZA 4JD2A 5JLHA 5JICA 2E8AA 2P9NB 1HLUA 2YCHA 2Q1NA 4PKIA 3TPQA 3G25A 5BPMA 4BREA 4BR0A 1IJJA 4H5RA 2IVOA 2KHOA 3DXMA 2QW9A 3F9MA 4ISGA 2D4WA 2Q31A 3OHRA 4BRLA 5BRDA 2J4RA 4B1UB 4BRNA 3CI5A 5JMVA 1YUWA 4AM7A 3BP8A 4I6MA 4CZLA 2P9PB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1RCHA 1K73O 3N4PA 1NGGA 3HRGA 4FWKA 1YAGA 1JLGA 4FLWA 4FLZA 2QXFA 4RCHA 3NH0A 1S3XA 3K5MA 1B3CA 1BA1A 2M8BB 4E1NA 4DV4K 3MX5A 4KHYA 1E4FT 1Q82O 2LR3A 3ZX3A 2JGUA 5GAGP 1S22A 3CM6A 1R59O 1B9FA 3F9KA 1K8BA 3ITHA 2QWOA 4NCGA 1NK9A 3QEVA 1DEJA 1K6YA 4O8UA 4OKJA 1NOYA 4B1VA 3O08A 2PZSA 2QWNA 1Z26A 4ILGB 3CJ9A 5DM7L 5AQOA 2KQ2A 1WN7A 4DU1A 2B68A 4CF1A 1B92A 1NPIA 4RG8A 3WXKA 4DV0K 1IKYA 2FXUA 3QETA 3DOKA 1EX4A 4JK9A 1QHTA 2JWLA 3FFKB 2B5JA 5CY0A 1DJTA 2D56A 2ITMA 5JVHL 3CC4N 3C0BA 3EKUA 1W2BM 4PA1A 4RW4A 1GLEG 4DQQA 1T05A 1I2UA 5AQQA 4JD2B 4BE2A 3QBXA 2ZJRL 4CVNE 1KCFA 2IC3A 2X74A 2OA8A 3TAGA 4EHUA 3EE9A 4CGDA 1VQMN 1JLQA 2GBZA 3NF6A 3JSMA 2YBRC 4FW1A 2UYTA 3NF8A 3WXMB 5FPMA 4CJ5A 4CW7B 1OZZA 4HTLA 4DLGA 4UY8O 3NBPA 4E7JA 1ZVEA 1GLJO 1QSYA 4LH4A 2OTJN 3ZSRA 1WSHA 2A42A 4IOXA 2PFUA 1DLOA 2SN3A 1KVAA 3SUQA 3OYMA 3DLEA 2HHXA 2GWJA 4LD0A 4JI6K 3HM8A 3H6EA 4IDKA 3KK2A 3MCAB 1FKOA 3QEIA 3DRSA 2DFFA 3AVNA 4ID1A 4XJXA 4CK2A 2HHIA 3D45A 2RPIA 4AHRA 4CZMA 1EKEA 4O0IA 3ULDA 2YHWA 4R5PA 1X3MA 4FJLA 3OA9A 4E72A 2BH1A 3MDQA 3R6MA 1BCMA 3TU5A 2OPRA 5JS2A 3VEZA 1HNZK 4BWJA 3ZSVA 1TV6A 3C6UA 1NGIA 4FJHA 4M3WA 3E66A 3P5JA 4MLEA 4DTJA 2I5JA 2IVNA 4WQ4A 3RMCA 4QOZB 2N2RA 4WQ5A 5BR9A 3VMFB 4JI8K 4Z4EA 3OBYA 1A5WA 2O8BB 1NK0A 1U47A 4DSFA 1N32K 1NBWA 3JXUA 2D1KA 2XY6A 1UA1A 2V7ZA 4CZJA 2B6AA 3OW2M 2UXCK 3CQ8A 1TUUA 1Q9XA 3CG7A 3V1QA 3NF9A 2KJAA 3CC2N 4GVMA 3CD6N 4CEAA 2Z1JA 3RMBA 4ISEA 4OPJA 4FJJA 5CZ2A 4KHNA 4CHYA 4O4GA 3NVKA 1JCFA 2NNWA 2E2PA 4DSIA 5DK5A 3D2EB 3C6TA 4DFMA 4LFAK 4E7IA 4CHOA 1L5UA 4W5NA 1YXQA 2B3CA 1G99A 4KHWA 4K43A 4H0OA 3I0RA 3VETA 3O9QA 3R9PA 4M3RA 1YTAA 1C56A 4OGEA 1C1CA 3BZKA 4CERA 4BRAA 4JYAK 5C42A 3MXIA 3GBTA 4MQ3A 4CBXA 3KZBA 3E7UX 1MR4A 2X78A 4JK8A 2KZMA 4DU4A 1BI4A 4XIUA 3JYTA 1SL1A 4NXNK 3D2FA 4BR2A 1J6ZA 4Y0WA 1IBMK 4EZ9A 1UWBA 1MWMA 5ADXA 1NG9A 3CW4A 2P9PA 4BRFA 4CEOA 2PY5A 1KVBA 2YC1C 1LQHA 4C8OA 5HL7L 3NDKA 1EETA 3F2KA 2LJ7A 4B9VA 1WUAA 1KV0A 5KPZA 4FZXC 1S1VA 2HNDA 3FGUA 1JKZA 4KHSA 4KO0A 1UA0A 3FZFA 4W5QA 1PE4A 4BVOA 1Q81O 3NH2A 5ELZA 3TAMA 5JS1A 3KK7A 3VEVA 5AQRA 3M5RA 3QFUA 4ILJA 1ICAA 2XO7A 1TUYA 3P4IA 2UXDK 3ATUA 1Z25A 5LJVA 3S3OA 1SNBA 2LN8A 1RGIA 4BC2A 1M1KO 1IV0A 3VGKA 3MAQA 1T7BA 3WQTA 3Q7CA 2P9KB 4JI3K 1MWKA 2Q2RA 4BG9A 4AAZA 4FJGA 5FDLA 2OPQA 4HUGA 3SMPA 1LWCA 1VSKA 2BRZA 3V81A 3LDNA 2OYQA 5M1NA 2XRIA 4RWTA 1XUPO 4H5NA 4DV6K 2G8IA 4JKCA 4XH4A 3IUCA 1T3VA 4CFBA 1TAUA 4CF9A 3ZSOA 1NK6A 4HHTA 4GY2B 3H46O 2KYQA 1QZ6A 3WXIA 4CI6A 4DSEA 4GV6A 4E89A 3S9HA 3ATVA 1GLDG 3H1VX 2NRVA 3U8XA 3M1FA 3EN9A 1A5VA 2E6MA 1VQNN 3WNGA 5HP1A 3W0LA 3QNOA 1SV5A 3JS6A 3PSFA 3VEWA 1N34K 3DXKB 1HJOA 4ICLA 5CR4A 3KKSA 3FZMA 1IO2A 3U6FA 4DU3A 3U3YA 3L2VA 2QWRA 1T6CA 4L3QA 4DTUA 2Q36A 1NGDA 3DLKA 4FJMA 3CCJN 3A5MC 4IG0A 1NGCA 4LF9K 3CPEA 4LSLA 1ZFUA 1TYQA 1WOQA 4BR7A 2R7YA 3G71N 4KYPA 5HBMA 4DTSA 2P9NA 4YDUC 1HQEA 2GV9A 3NFAA 4M45A 4B9TA 2G8KA 4H0VB 1KXPA 3KLHA 4JNEA 3O8MA 4Y1CA 4CJPA 4DV7K 2DFEA 1C1AA 3V6DA 1VQPN 4DV3K 1LW0A 3QIPA 2NRRA 3NGZA 2JWKA 4OGCA 3QMLA 3CCEN 4BDZA 2QM1A 4FPBA 1N8RO 3T69A 1ZBHA 1IBKK 2N2QA 2PYLA 5AQYA 5EOYA 4B9NA 3E01A 3NF7A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 1RCH A;  1K73 O;  3N4P A;  1NGG A;  3HRG A;  4FWK A;  1YAG A;  1JLG A;  4FLW A;  4FLZ A;  2QXF A;  4RCH A;  3NH0 A;  1S3X A;  3K5M A;  1B3C A;  1BA1 A;  2M8B B;  4E1N A;  4DV4 K;  3MX5 A;  4KHY A;  1E4F T;  1Q82 O;  2LR3 A;  3ZX3 A;  2JGU A;  5GAG P;  1S22 A;  3CM6 A;  1R59 O;  1B9F A;  3F9K A;  1K8B A;  3ITH A;  2QWO A;  4NCG A;  1NK9 A;  3QEV A;  1DEJ A;  1K6Y A;  4O8U A;  4OKJ A;  1NOY A;  4B1V A;  3O08 A;  2PZS A;  2QWN A;  1Z26 A;  4ILG B;  3CJ9 A;  5DM7 L;  5AQO A;  2KQ2 A;  1WN7 A;  4DU1 A;  2B68 A;  4CF1 A;  1B92 A;  1NPI A;  4RG8 A;  3WXK A;  4DV0 K;  1IKY A;  2FXU A;  3QET A;  3DOK A;  1EX4 A;  4JK9 A;  1QHT A;  2JWL A;  3FFK B;  2B5J A;  5CY0 A;  1DJT A;  2D56 A;  2ITM A;  5JVH L;  3CC4 N;  3C0B A;  3EKU A;  1W2B M;  4PA1 A;  4RW4 A;  1GLE G;  4DQQ A;  1T05 A;  1I2U A;  5AQQ A;  4JD2 B;  4BE2 A;  3QBX A;  2ZJR L;  4CVN E;  1KCF A;  2IC3 A;  2X74 A;  2OA8 A;  3TAG A;  4EHU A;  3EE9 A;  4CGD A;  1VQM N;  1JLQ A;  2GBZ A;  3NF6 A;  3JSM A;  2YBR C;  4FW1 A;  2UYT A;  3NF8 A;  3WXM B; 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