5FPMA

Structure of heat shock-related 70kda protein 2 with small-molecule ligand 5-phenyl-1,3,4-oxadiazole-2-thiol (at809) in an alternate binding site.
Total Genus 121
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
121
sequence length
381
structure length
379
Chain Sequence
GPAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTIFDAKRLIGRKFEDATVQSDMKHWPFRVVSEGGKPKVQVEYKGETKTFFPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGGKVHSAVITVPAYFNDSQRQATKDAGTITGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKGGGEKNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVSHLAEEFKRKHKKDIGPNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGVDFYTSITRARFEELNADLFRGTLEPVEKALRDAKLDKGQIQEIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILIG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Chaperone
molecule keywords HEAT SHOCK-RELATED 70KDA PROTEIN 2
publication title Detection of Secondary Binding Sites in Proteins Using Fragment Screening.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 121
structure length 379
sequence length 381
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-12-02
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5fpmA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5fpmA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5fpmA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5fpmA04
4YDUA 4BRNA 1X3NA 2PBDA 2HF3A 3EZWA 4ISGA 3FZMA 2I7NA 5LJVA 4CJ7A 4BR7A 1QQNA 1DEJA 3WXIA 2YI1A 5KPTA 4B9QA 4A2BA 1NBWA 1RFQA 1Z05A 1GLAG 5EOYA 5AQUA 2FXUA 3HI0A 1BA1A 4BVPA 3I8BA 5AQKA 2Q31A 4JHDB 1T6CA 5TKYA 4H0VB 4BREA 3QB0A 2CGLA 2BUPA 2GUPA 1KAYA 2HMPA 4L3QA 3F9MA 3GBTA 3M3ZA 3UKUA 3EKUA 4WQ4A 2YJFA 1MWKA 1OKJA 3A5OC 3L4IA 3UE5A 2P9LB 4BG9A 3CHWA 4Z94A 4BR9A 1KAXA 4FWLA 4EAHD 1NGJA 4A2AA 2QWMA 5EX5A 1E4FT 4MO5A 2AA4A 5AQQA 2QWNA 3UKRA 2A40A 3MN7A 3WXLA 2F9TA 4CBWA 3AARA 1NM1A 5EXWA 1E4GT 1T44A 4CBXA 2DPNA 4C23A 4HWIA 2A3ZA 1KAZA 2UYTA 5KQ8A 2YJEA 5AQSA 5JLHA 4RTFD 2E2QA 4BGAA 4FOEA 4JD2A 1SZ2A 1XQSC 2FSJA 3MK6A 4BRHA 1YVNA 1HLUA 5AQWA 4FWKA 5FPDA 4WQ5A 3B8AX 3C0BA 2P9UA 2NLXA 1YUWA 5ELZA 1RDWX 3SK3A 5AQPA 3DWLA 1NGBA 2CGKA 2E1ZA 2FF3B 3ZX2A 1NGHA 4EHTA 4Y0WA 1NGIA 2QXLA 1ZBSA 4BRLA 4JNEA 1NGEA 2EWSA 5E84A 2V7ZA 5BPMA 1ZC6A 2QWQA 3O1BA 1YAGA 3VERA 1EQYA 4XH1A 3R9PA 2P9SA 2VCPA 2I7PA 1NLVA 4IJAA 2FLOA 5JMVA 3FLCO 2Q97A 1JCFA 4RWTA 3S41A 2A6AA 3BF3A 4BRMA 1HPMA 3ENHA 3WT0A 2CH5A 1GLJO 3U8XA 2CGJA 4BQZA 3P4IA 3TPQA 3CQYA 4KBOA 4XH4A 5AZJB 5FPNA 1HKBA 3JXUA 1U2VA 3BP8A 5BR9A 4FO0A 3C7NB 1C0FA 5BRHA 3VEZA 3HM8A 5AZIB 2E2PA 3DXMB 3KHYA 3SLCA 4BG8A 3AAPA 4CBUA 2ASPA 1R59O 4H0TB 3FR0A 3O1WA 3D2EB 5JICA 3SMSA 2Q2RA 3ZEUB 4K25A 4BC5A 3KVGA 4K42A 3A5LC 4WYBA 4FWRA 3QFPA 3MN5A 4BC4A 5FPEA 4IZ9A 3D2FB 3HTVA 4B1ZA 2QWOA 3GDQA 3DXKB 3O4WA 1JCEA 3CJ7A 5AQYA 2OANA 2D0PA 4B1XB 3AY9A 2AP1A 3QFUA 3LM2A 4M7YA 4H0XB 1WOQA 2P9NB 1T6DA 2A5XA 4CZFA 4FWNA 3O5BA 5BN9A 3QBXA 4EHUA 1QHAA 4F9OA 4H0YB 4IXCA 1Q18A 3LDLA 1X3MA 2PAVA 5BPLA 3FZFA 1NGFA 1Z6RA 4QS9A 5AQGA 5KPZA 2D0OA 1NGAA 3CIPA 3OHRA 4PKHA 4YDUC 4A62A 2P9IB 4CD1A 4FWMA 1MA9B 1MDUB 1GLCG 3WQUA 3VPZA 4O8KA 4AM7A 5E26A 2GWKA 4PKIA 3ATVA 3CQXA 1RGIA 3VGKA 4FOIA 3WEEB 2V51B 2IIRA 5BRDA 2YHXA 5KPRA 4PL7A 2KHOA 2E20A 5LJWA 4K41A 5AQVA 3GOIA 4FSVA 1G99A 2QWRA 1ZXOA 3SJHA 1LCUA 3A5NC 3VF4A 5F2RA 2CH6A 4BQLA 3W3DA 1BUPA 2P9LA 2A41A 3H1QA 2GTDA 4FPAA 3W0LA 5AQRA 4JD2B 3A5MC 3ULEB 3ENOA 4IO8A 3J8AA 4I6MB 3RSEB 2E2OA 4NO7A 5F1XA 3MN6A 4WQ4C 3O8MA 5AQMA 2Q0RA 3VGMA 3IUCA 1TUUA 4ISEA 3WQTA 5FPMA 3G25A 4BC2A 1S3XA 4BRAA 1D4XA 2VYPA 4BVOA 3FE1A 3VENA 2P9KB 1K8KB 4FWPA 4CZKA 2QWLA 1S22A 3QBWA 4B1YB 3U4LA 2ZGZA 3DJCA 4B1UB 3MCPA 2ITMA 2P9SB 4JN4A 3ZETB 4XEIA 1WUAA 2H3GX 1X9JA 3FZKA 3CJCA 3LDNA 3QDKA 3TU5A 1NWKA 4O5FA 1MWMA 3R6MA 3CJAA 4BR0A 3VOVA 4BRQA 4BR5A 1NGGA 4CZGA 3CERA 4H0OA 4FWSA 3GE1A 4B1VA 5AR0A 2GWJA 3GL1A 1ATRA 2P9PB 3HZ6A 1SAZA 2YHYA 3VF2A 3VEOA 1ATNA 4CZJA 5AQTA 1BU6O 5KQDA 4BR4A 2YCHA 2J4RA 1HX1A 2D1KA 5AQJA 4DHYA 1BA0A 1NMDA 4PKGA 2GEMA 3LDQA 4H5RA 1QZ6A 4BRKA 3U9ZA 5AQOA 3VESA 5AZJA 4ISFA 2Q0UA 1J6ZA 4FWQA 4QS8A 3C7NA 3O6WA 1NGDA 1KXPA 4BR2A 3LDPA 5AZIA 2QM1A 4M7XA 4PL8A 3DXMA 3VEWA 1TYQA 1BO5O 3VEYA 5JLFA 4NB4A 3D2EA 2HOEA 4BRDA 4BRGA 4LC9B 3ID8A 4H0PA 2V7YA 1BG3A 4CI6A 5BRFA 3U9DA 3VETA 5F0XA 4BRIA 2E88A 5AQNA 1NGCA 2IVPA 1JCGA 3D2FA 4FWOA 3CJBA 2ASMA 3DXKA 1YXQA 4B1WB 2VWBA 2NZTA 5EVZA 2ZF5O 3H46O 5AQIA 2P9NA 4K43A 5EY4A 3LL3A 3UKUB 1V4TA 5BREA 1GLEG 4JAXA 4CZHA 3VEVA 5ADXH 1V4SA 1LOTB 4JHDA 1GLFO 3M6GA 3HBTA 4XH5A 4MLHA 3UKRB 2P9IA 3A0IX 4H5WA 4DQ8A 1GLDG 3IDHA 1HJOA 4FL9A 2E8AA 3MMVA 2E2NA 1H1VA 5I9EB 4J8FA 3KZBA 3BF1A 2NRHA 3SMPA 3WEEA 1P8ZA 1XC3A 3MDQA 3EO3A 3LDOA 5BPNA 1BWFO 5LY3A 4CZIA 3H3NO 2E1YA 4M63C 4EFHA 2QW9A 1QQMA 3O80A 2ZWHA 2P9UB 3H6EA 3EN9A 2FSKA 3MN9A 3HSCA 4BRFA 1BDGA 4BROA 4DCHA 5AQFA 1IG8A 4CZEA 4DB3A 2W41A 3H3OB 2QWPA 4A61A 3ULEA 3UB5A 5AQXA 3WUHA 3RSEA 4I6MA 4BC3A 4QS7A 1HUXA 4EIAA 1GLLO 5AFUH 3VEXA 4GY2B 4HTLA 1HKGA 4IJNA 3L6QA 4H5TA 3ZX3A 4H5VA 3O08A 3A8YA 3I33A 2FF6A 4MLEA 5ADXA 3CJ9A 4WQ5C 3L0QA 1DKGD 2D4WA 3JS6A 3ATUA 3BEXA 2GELA 2YHWA 3CI5A 4MO4A 3EKSA 2P9KA 4RCHA 1K8KA 4AM6A 2ASOA 5BN8A 4IWVA 2IVOA 3QICA 5AQLA 3GG4A 2WUSA 1QZ5A 1U6ZA 2A42A 5B8HA 2W40A 1ESVA 2FSNA 3VGLA 2IVNA 5CE3A 3ZETA 3QMLA 5AQZA 1U2VB 4BGBA 3CETA 3D7EO 4BRCA 1ATSA 1GLBG 4E1JA 3WXJA 3FZLA 1CZAN 3LM9A 2BTFA 1IJJA 3H45C 1BOTO 4H03B 3AAQA 3H1VX 4CZLA 2HF4A 3IMXA 2ZGYA 4GNIA 3R8EA 3VF6A 1SQKA 5AQHA 4CZMA 3IFRA 3M1FA 3FZHA 3FGUA 2P9PA 3BUZB 3ZEUA 3ZX0A 1Y64A 1QQOA 3FFKB 1HKCA 1DGKN 4FPBA 2F9WA 4H5NA 5AFUA 3EL2A 1TUYA 3DAWA 1TYQB 3WXKA 1C0GA 2V52B 2Q36A 4CD3A 4BRPA 2Q1NA 3CJ1A 1XUPO
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4YDUA 4BRNA 4F8RA 2EHGA 5LJVA 4CJ7A 4CVNE 3S3MA 1ZBHA 4JYAK 5KI6A 4Q5VA 3NFAA 1N36K 2HHUA 1ZBIA 4DG1A 2W42A 3KTQA 2N66A 3ALYA 3E1YA 5BR8K 1VQ8N 4NYFA 3CFRA 3P31A 2YIPA 4CJVA 1NBWA 1RFQA 1Z05A 4J2EA 1KD1O 1GLAG 4E19A 4R5PA 2FXUA 4LFAK 1TAUA 4M45A 4DUYK 1NK0A 2O8EB 1XRSB 4IEEA 4JHDB 3V6DA 4DSEA 5TKYA 3P38A 2G8IA 5M1QA 4BEBA 3PLAA 4L3QA 1RTDA 3UKUA 5HBMA 1OKJA 3MWTA 4B8CA 3PX4A 4C8OA 5KGXA 4FWLA 1YTUA 3O4NA 3V1RA 2PYJA 2O8DB 3V9UA 1NGJA 4A2AA 1MYNA 4MO5A 2QWNA 2A40A 1QSLA 5GAHP 1KQSM 4CBWA 3AARA 3VQ7A 2PYLA 5HROA 4CJEA 2LN8A 4HWIA 1RBRA 3SPZA 3SUPA 2E6MA 3MXMA 2HHVA 2E2QA 5D3GA 4JD2A 4DQIA 1SZ2A 3PSFA 2ITGA 3ZT0A 4C1NI 3AVFA 5AQWA 3ULDA 1VRUA 3CC7N 3B8AX 1LW0A 2D0AA 4LSNA 1YUWA 1VQKN 2G8HA 1VQ5N 4NCAA 3AA3A 1NGBA 2XY7A 2Z1HA 4ILGB 2E3GA 2XO7A 3IAYA 3OYKA 3QEXA 2DFEA 1KFDA 2EWSA 2V7ZA 3THXA 1T3VA 3LAKA 1RBTA 4Z4FA 2KTQA 2P9SA 4KHYA 4CIEA 4DTMA 1K6YA 2FLOA 5JMVA 4CW7B 2LR3A 4DS5A 3RVCA 1C0TA 2A6AA 4YOXA 1CLQA 1NU0A 1OZZA 3CQYA 3TPQA 5AZJB 4M42A 3NMUA 1HKBA 2KGQA 5BR9A 3K9JA 1RT5A 1FH3A 3VEZA 4CJWA 3KHYA 2HBJA 1HNZK 3PO4A 1VQ9N 1A5VA 3EY1A 3OBWA 2F8TA 4JI6K 4F2SA 2UU9K 4K42A 4WYBA 3MN5A 2VWJA 5J2QA 3LWLA 3AO2A 4B1ZA 2QWOA 2VG5A 1ASWA 1JCEA 2OANA 4B1XB 3CPEA 3QFUA 4DFJA 3GKUA 1QQCA 1D5AA 1YTAA 4CJLA 3V1QA 4WFAL 4DV1K 4FWNA 4EHUA 3QBXA 3VN5A 4JKBA 4F9OA 5CHIA 4IXCA 2XY8A 1Q18A 3LDLA 2PAVA 4BWJA 4K0KK 4OPKA 3FZFA 1NGFA 3PX0A 4QS9A 3RMDA 3TSUA 3SQ2A 4FWMA 5J2MA 4Q0BA 1MA9B 1MDUB 1GLCG 1KV0A 4O8KA 3ZSRA 4AM7A 4E7KA 1JKHA 2YNFA 3WXMB 3OYDA 3EE9A 1RGIA 2O8EA 2V51B 3CC2N 2Y1IA 4Z0UA 2YHXA 5KPRA 1IH7A 1VNBA 2KHOA 2E20A 4JS4A 5LJWA 3LP3A 2QWRA 5HRSA 4IOXA 5HLFA 3VF4A 2CH6A 3MEGA 5T7BA 2YILA 3H1QA 4CJRA 2GTDA 4FPAA 1N6QA 5AQRA 3QLHA 3T7ZA 3A5MC 4IO8A 3J8AA 2RE2A 3R1XA 5F1XA 4YFUA 2LI7A 3CPWM 3OYFA 4CK3A 4CGDA 1CXUA 2WBNA 4JKAA 3C95A 4PWDA 1LWEA 4KH4A 5FPMA 4BRAA 5I3UA 2N69A 1D4XA 1FKPA 4JKDA 2NRZA 4AH9A 1RT4A 2NY8X 5C12A 4FWPA 4H8KA 3T1AA 3KLFA 5HRNA 3MXIA 4JS5A 3VA3A 1EETA 2ZGZA 1UGLA 4B1UB 2ITMA 4IDKA 2HHIA 3S5TA 3V4IA 4CJPA 1WUAA 2W6KA 4N41A 3T1YK 1I3AA 3FZKA 3CJCA 2I5JA 3QDKA 3NE6A 4A57A 3L2UA 4FVMA 4ID1A 4JRQA 1JL2A 4N47A 1ZFUA 3VTHA 4CZGA 2G8WA 4EZ6A 3I8DA 4QAGA 4FWSA 4UAFE 3GL1A 2KLAA 1JL1A 4N5SA 3KK1A 3VEOA 4RW4A 4OKJA 1HX1A 1HYVA 4DR5K 1Z26A 4DV5K 2GEMA 5AZJA 4CGIA 1BI4A 4FWQA 1S9EA 1NGDA 3NGYA 3L2WA 4MDAA 5JLFA 4CECA 1TK5A 4W5QA 1OH6A 5M1OA 2V7YA 3S3OA 3P83D 4M3RA 3QEPA 1C1CA 2OYQA 4FWOA 3M8SA 3AGKA 1KC8O 1J53A 4Y1DA 4CF1A 3LP1A 3CCEN 2O4IA 2NZTA 5EVZA 2ZF5O 4E0DA 3SBTA 5EY4A 1IBLK 3KOZA 4DTPA 3DLBA 1T7PA 1RDCA 4FK2A 1GOCA 3THYA 1GLEG 4JAXA 5ADXH 4QCLA 3NCIA 1K9MO 3M6GA 3O9UA 3HBTA 2Y1JA 4FLXA 2E2FA 1OVQA 3UKRB 3CCVN 4H5WA 4ID5A 4I2PA 4DQ8A 1L3UA 2YKNA 4GV3A 1LAWA 3MEEA 3ZSWA 3ID6A 4YOTA 1W9HA 3BF1A 4KV8A 3V81A 1P8ZA 3PX6A 2ATBA 1XC3A 3MDQA 3ZT4A 1ZVEA 1NKCA 1SKRA 1HJRA 4DFMA 1SKSA 5LY3A 4JKCA 3H3NO 2E1YA 3OW2M 4JV5K 4EFHA 3I56N 3ZT2A 2ZWHA 4FLWA 2LT8A 4CIFA 2C1GA 1S6PA 4J2BA 4BRFA 1D8YA 4BROA 1IG8A 1JXBA 4JI1K 2LY5A 1NK5A 4AHUA 3O4QA 3WUHA 2HNDA 1GLLO 2GUIA 3TARA 2JDQD 3TI0A 2QKBA 2R7YA 1W7AA 1HKGA 3NGZA 3L6QA 4H5TA 2WC9A 3O08A 2VQEK 3ZSXA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4YDU A;  4BRN A;  4F8R A;  2EHG A;  5LJV A;  4CJ7 A;  4CVN E;  3S3M A;  1ZBH A;  4JYA K;  5KI6 A;  4Q5V A;  3NFA A;  1N36 K;  2HHU A;  1ZBI A;  4DG1 A;  2W42 A;  3KTQ A;  2N66 A;  3ALY A;  3E1Y A;  5BR8 K;  1VQ8 N;  4NYF A;  3CFR A;  3P31 A;  2YIP A;  4CJV A;  1NBW A;  1RFQ A;  1Z05 A;  4J2E A;  1KD1 O;  1GLA G;  4E19 A;  4R5P A;  2FXU A;  4LFA K;  1TAU A;  4M45 A;  4DUY K;  1NK0 A;  2O8E B;  1XRS B;  4IEE A;  4JHD B;  3V6D A;  4DSE A;  5TKY A;  3P38 A;  2G8I A;  5M1Q A;  4BEB A;  3PLA A;  4L3Q A;  1RTD A;  3UKU A;  5HBM A;  1OKJ A;  3MWT A;  4B8C A;  3PX4 A;  4C8O A;  5KGX A;  4FWL A;  1YTU A;  3O4N A;  3V1R A;  2PYJ A;  2O8D B;  3V9U A;  1NGJ A;  4A2A A;  1MYN A;  4MO5 A;  2QWN A;  2A40 A;  1QSL A;  5GAH P;  1KQS M;  4CBW A;  3AAR A;  3VQ7 A;  2PYL A;  5HRO A;  4CJE A;  2LN8 A;  4HWI A;  1RBR A;  3SPZ A;  3SUP A;  2E6M A;  3MXM A;  2HHV A;  2E2Q A;  5D3G A;  4JD2 A;  4DQI A;  1SZ2 A;  3PSF A;  2ITG A;  3ZT0 A;  4C1N I;  3AVF A;  5AQW A;  3ULD A;  1VRU A;  3CC7 N;  3B8A X;  1LW0 A;  2D0A A; 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