5FPNA

Structure of heat shock-related 70kda protein 2 with small-molecule ligand 3,5-dimethyl-1h-pyrazole-4-carboxylic acid (at9084) in an alternate binding site.
Total Genus 119
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
119
sequence length
381
structure length
379
Chain Sequence
GPAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTIFDAKRLIGRKFEDATVQSDMKHWPFRVVSEGGKPKVQVEYKGETKTFFPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGGKVHSAVITVPAYFNDSQRQATKDAGTITGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKGCGEKNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVSHLAEEFKRKHKKDIGPNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGVDFYTSITRARFEELNADLFRGTLEPVEKALRDAKLDKGQIQEIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILIG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Signaling protein
molecule keywords HEAT SHOCK-RELATED 70 KDA PROTEIN 2
publication title Detection of Secondary Binding Sites in Proteins Using Fragment Screening.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 119
structure length 379
sequence length 381
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-12-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00012 HSP70 Hsp70 protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5fpnA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5fpnA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5fpnA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5fpnA04
4WQ5C 5AZIB 3SK3A 4H0VB 4BR2A 2IVOA 4BRLA 4XH5A 4BRMA 2YCHA 2P9SA 2AP1A 4PKHA 4BR5A 4BRQA 3BEXA 1NMDA 4XEIA 3CI5A 4Y0WA 3O1WA 1IJJA 1BOTO 5ELZA 2BUPA 5EXWA 4B9QA 3DXKB 4BQLA 4JHDB 4CBXA 3VEYA 2NZTA 4B1XB 1GLEG 2V52B 3J8AA 4WQ5A 1CZAN 1NWKA 2HF3A 2CH5A 3GE1A 2E2QA 2QWOA 4BQZA 5JMVA 2P9UA 3ULEB 5AQVA 1ATRA 5BREA 5AQXA 4H5RA 3VF6A 5I9EB 3CJ9A 3CJ1A 5BN9A 3R8EA 3VETA 5LJVA 4IJAA 4H5TA 2QM1A 3H1QA 3FGUA 4PL7A 4B1YB 1X3MA 1MA9B 4FOEA 3VEZA 1RDWX 3H3OB 3SLCA 4O8KA 4GY2B 2ZGYA 1NGDA 2FXUA 2GTDA 3FLCO 3LDPA 3MN5A 2P9LA 4LC9B 3ZX2A 2ITMA 1NGAA 1ZBSA 3LDNA 5FPNA 4CJ7A 2QWNA 4BRAA 1OKJA 2ZWHA 4FOIA 3FZMA 5ADXH 2H3GX 4CZHA 4FSVA 5AQNA 1GLJO 1SAZA 2W41A 1Z6RA 2P9LB 2HMPA 3UB5A 2QWLA 2HF4A 5AQLA 1YAGA 2A6AA 4A2BA 3GG4A 4FL9A 4CZKA 3H6EA 3ZEUB 2ASOA 4BRHA 3VF2A 4JD2A 2FSJA 4FWMA 3SJHA 3RSEB 5AFUA 3CIPA 3O08A 2BTFA 2E1YA 4FPAA 4WYBA 3WXIA 3FZKA 2V7YA 4H03B 3EO3A 1HUXA 1GLBG 4EIAA 3H45C 4EFHA 1JCEA 1SQKA 4M7XA 5JLFA 4CI6A 3QBXA 1ZXOA 5BRHA 3FFKB 4AM7A 3R9PA 4EHUA 2A3ZA 3H1VX 3A5MC 3U8XA 4J8FA 3D2EB 5KPRA 3ATVA 1X3NA 3UKUB 2J4RA 3ZETB 2E2OA 2YJFA 3D2FB 3QFPA 4MO4A 1NGEA 1S22A 3VGLA 3D7EO 1JCFA 4HWIA 2FSNA 4BG9A 1HKBA 4B1ZA 3IMXA 2QXLA 4DQ8A 5E26A 4BR7A 3W0LA 3WUHA 1Z05A 3SMPA 5AQYA 2Q97A 3I8BA 3HM8A 1EQYA 5F1XA 4H0PA 4K43A 3VEXA 3ZX3A 3FR0A 4RWTA 5LJWA 1HX1A 4JN4A 1YXQA 2E20A 2Q36A 2E2PA 3QDKA 2ASPA 2P9NA 5LY3A 1HKGA 4FWKA 5AFUH 1D4XA 3O4WA 2I7PA 3L4IA 2ZF5O 5KQ8A 4BRNA 2A42A 2DPNA 4CZMA 1T6CA 3IDHA 2QWQA 3MN7A 1GLFO 4MLHA 3ENOA 2QW9A 4AM6A 1XC3A 4I6MB 5AZJB 3KHYA 4ISFA 4H5NA 3JXUA 1GLCG 1RFQA 3A5NC 1T44A 1C0GA 4CBWA 3CJ7A 3B8AX 4ISEA 4WQ4A 2P9IA 3AAPA 2GWKA 4FPBA 1XQSC 5BN8A 3KVGA 1NGJA 4B1WB 3JS6A 3VEWA 3BUZB 2E88A 5EOYA 1QHAA 1U2VA 2OANA 4FWPA 5AQUA 2P9SB 3BF1A 2E2NA 3GOIA 4PL8A 3WXJA 3QFUA 4K25A 3IFRA 2IVPA 5F2RA 4BC2A 1QZ5A 2I7NA 2V51B 3AY9A 1J6ZA 1U2VB 3DAWA 1HKCA 1NGHA 3UKRA 3WQUA 3WXKA 2NRHA 2P9UB 3WEEA 1YVNA 1E4GT 1HLUA 4EAHD 4PKGA 1KAXA 2VYPA 3LDOA 4FO0A 4FWQA 3HZ6A 4A2AA 3H3NO 2UYTA 3MMVA 3VGKA 2YHWA 3C7NA 3VOVA 3EKUA 3U9DA 1BA0A 5BPLA 3WT0A 3VF4A 2Q0RA 3P4IA 3L6QA 5EX5A 4BC5A 4CZLA 1K8KA 2CGLA 3FZLA 1BU6O 3O8MA 3MN6A 1Q18A 3C0BA 3CETA 4CZGA 3FE1A 4QS7A 2VWBA 3C7NB 2GEMA 4BGBA 3QICA 1LOTB 1TYQA 1GLLO 1GLDG 2W40A 3CQYA 3EL2A 2AA4A 3R6MA 3HBTA 4FWSA 5AQIA 4CZIA 1K8KB 1HPMA 1JCGA 4MO5A 4EHTA 1IG8A 4BRIA 3QB0A 2GELA 3QMLA 2YHXA 4JD2B 4XH1A 4PKIA 4Z94A 5F0XA 4K42A 2FLOA 4GNIA 3VEVA 3ATUA 4BROA 3LM2A 4O5FA 1MDUB 4YDUA 2WUSA 2A41A 3EKSA 5JLHA 3CJCA 1NGFA 1BWFO 3VERA 3MN9A 1QQNA 2NLXA 3MCPA 3CJBA 4BRKA 5AR0A 1DEJA 4BG8A 1KAZA 4MLEA 3TPQA 2A5XA 4BR9A 1KXPA 2V7ZA 3IUCA 3LDQA 1V4SA 3LL3A 5KQDA 2ZGZA 3S41A 1BA1A 2P9PA 1C0FA 1SZ2A 4WQ4C 1YUWA 3H46O 2FF6A 4BRDA 1BUPA 3DXMA 3I33A 5AZIA 2QWMA 1QQMA 4FWNA 2E1ZA 3A0IX 5AQSA 5FPMA 1WOQA 4H5VA 1DGKN 5BRDA 1TUYA 2P9NB 3VGMA 5EY4A 1S3XA 1ATNA 5KPZA 2Q2RA 1P8ZA 4FWLA 3LM9A 4CD1A 4QS9A 1BG3A 3CERA 3DXKA 5BR9A 4JHDA 5FPDA 4RTFD 2CGKA 3WQTA 1ESVA 4H0YB 2Q31A 4NO7A 3KZBA 1Y64A 5AQZA 3AARA 1NBWA 4NB4A 3SMSA 3EZWA 3G25A 1G99A 2VCPA 3VPZA 4F9OA 1QQOA 3HTVA 3ULEA 5AQTA 4E1JA 5AQPA 2YHYA 4L3QA 5AQJA 4CZFA 2P9IB 1V4TA 2CH6A 2PAVA 4BVOA 3CQXA 2A40A 1NLVA 3BF3A 4BRCA 1KAYA 3HSCA 4BC3A 2IVNA 3FZFA 3O5BA 4DCHA 1R59O 2FF3B 4A62A 2GWJA 4CZEA 2Q0UA 5EVZA 4IXCA 4JAXA 2IIRA 4CBUA 4M63C 5AQRA 2E8AA 4A61A 3OHRA 3MDQA 3M3ZA 1NGBA 4K41A 3UKRB 4IJNA 5AQHA 3A5OC 4B1UB 4M7YA 3GL1A 3WEEB 2Q1NA 4RCHA 4DHYA 4FWOA 4DB3A 3F9MA 4KBOA 3WXLA 5AQFA 3O80A 5AQGA 3ZEUA 2HOEA 3ID8A 3TU5A 4H0XB 3U9ZA 1NGGA 3L0QA 3RSEA 2CGJA 4YDUC 3QBWA 4B1VA 2D0OA 5E84A 1H1VA 4H0TB 3DWLA 3ENHA 3GBTA 1BO5O 5FPEA 3EN9A 5BRFA 5JICA 4BR4A 4CD3A 1WUAA 3D2EA 4JNEA 3O1BA 3UKUA 3VENA 3FZHA 1TYQB 3ZETA 5AQKA 2KHOA 5AQOA 2EWSA 1ATSA 3MK6A 3D2FA 2P9KA 5TKYA 4BRPA 5B8HA 4BRFA 3A8YA 3CJAA 1T6DA 4XH4A 3HI0A 1HJOA 3W3DA 4H5WA 1MWMA 3VEOA 2YJEA 4BC4A 3CHWA 4QS8A 1XUPO 1RGIA 1X9JA 3BP8A 2F9TA 5BPMA 3A5LC 4H0OA 2QWRA 2P9KB 4CZJA 3DJCA 3M1FA 5AQWA 4BGAA 2D1KA 5AQQA 1E4FT 4C23A 5AQMA 3U4LA 5CE3A 2FSKA 1GLAG 3AAQA 1DKGD 4HTLA 4BR0A 2QWPA 2PBDA 1BDGA 1QZ6A 2D4WA 2GUPA 4BVPA 3GDQA 5KPTA 4IWVA 2YI1A 3UE5A 3LDLA 4IO8A 4BRGA 1ZC6A 4ISGA 1LCUA 4FWRA 3M6GA 2ASMA 4I6MA 5BPNA 2P9PB 1NGCA 1TUUA 5AZJA 3O6WA 2D0PA 1MWKA 4BREA 4IZ9A 1NGIA 3VESA 3ZX0A 5ADXA 1NM1A 2F9WA 1U6ZA 3DXMB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2GV9A 5AZIB 1Q8IA 1E3MA 4AHCA 4AHSA 4BR2A 4BRMA 1RNHA 2AP1A 2HBMA 1IJJA 3NF7A 2HHQA 2NY8X 4CBXA 2QEXN 4F2RA 2LR3A 1GLEG 1UA1A 3EE9A 4WQ5A 3R1XA 3K5NA 2IS3A 3O3GA 3NHGA 2HF3A 2F7TA 3GE1A 4YORA 2QWOA 4DQIA 1F21A 1I3AA 4FJIA 5BREA 4JLHA 1XNQK 1U45A 4W5QA 4PY5A 1VNBA 5HRSA 3R8EA 3VETA 1LV5A 3TTCA 1L3TA 1VQ7N 4B1YB 3AVLA 4FOEA 3H3OB 3CPWM 3ZYYX 1SKRA 1EETA 2FXUA 1C56A 2GTDA 2X6NA 1LWCA 3AA2A 4PWDA 3ZX2A 4FLXA 4F2SA 2ITMA 3QEIA 3TR8A 3SCXA 1ZBSA 3LDNA 1JLQA 2ZWHA 4FJMA 3HRGA 3G0ZA 3AVAA 3TSUA 4RW4A 4DFJA 2H3GX 1RDUA 1TK8A 5LL6Z 5AQNA 4BE1A 3MEGA 5IWAK 4CJRA 1SAZA 2GBZA 2W41A 4WE1A 3EYZA 3QI7A 1Z6RA 1XI1A 1BCGA 1G15A 3UB5A 3C6UA 4CF2A 4CZKA 3ZEUB 1EXQA 2IDOA 4FWMA 3HPGA 4GKJK 2OPPA 4YY3K 4L8RB 4CF8A 2V7YA 4H03B 5HRPA 1S9GA 3QEVA 1Q86O 3AO5A 3TAFA 1JCEA 1SQKA 4M7XA 4CI6A 4UADE 1ZXOA 3K2PA 3BDPA 4A5AA 3TWHA 3U8XA 4YHHK 3D2EB 2ITGA 3UKUB 2J4RA 1ZBLA 1RDAA 3HL8A 3QFPA 1HNVA 1CN2A 1S22A 3VGLA 1RBSA 4HWIA 1D8YA 3AVKA 4FK2A 2QXLA 1XWLA 3W0LA 3T1YK 2N2QA 3KLHA 1KRPA 1RILA 3SMPA 4DWIA 2PFUA 1VQNN 2RPIA 3P38A 3L2UA 4FJLA 3ZX3A 1N34K 2HBKA 3CFOA 1HX1A 2Q36A 4FW2A 3C65A 4JI4K 1VRUA 5J2NA 1S6QA 3NGIA 2R7YA 2E0HA 1HKGA 1SL0A 3RWUA 5AFUH 4B9UA 2NUBA 2ZF5O 1VNAA 4CZMA 2YIOA 3IDHA 4NYFA 3KC6A 1YJNN 3AO2A 3D45A 3ENOA 2QW9A 5EU7A 4AM6A 1XC3A 4I6MB 3OYAA 1C0GA 2LY6A 4CEBA 1WSEA 4RW6A 4AHUA 3HJFA 2P9IA 2GWKA 2G8HA 1XQSC 3QINA 3SZ2A 5BN8A 4DQRA 3KVGA 3ID6A 3JS6A 3WXMB 5J1EA 4BEBA 3CYGA 1U2VA 2OANA 4QOZB 4JK8A 3BF1A 3BZCA 3CC7N 4DQSA 3WXJA 3QFUA 4M3RA 1VQKN 3C94A 1TL3A 2QK9A 4JI1K 1B9DA 1NH5A 2KZZA 1QZ5A 3KP0A 2I7NA 3AY9A 1QHTA 4IG3A 2QA4N 1J6ZA 1U2VB 1FKOA 4DU3A 4OKJA 2W42A 2JLEA 1I94K 4DF4A 2NRHA 1SL2A 2PY5A 1HLUA 2HHUA 2VGNA 2VYPA 4FO0A 4JI3K 4NXMK 1FK9A 4A2AA 3E7UX 1SKWA 1NKEA 1QQCA 3VQ5A 5HLFA 3E66A 4FYDA 3VOVA 5BPLA 5C10A 3P31A 3PUFA 3WT0A 1RCHA 1BHLA 3KK3A 3TAMA 4CK1A 1K8KA 2RF2A 3D6RA 4GV3A 3TAGA 2QI2A 1GOAA 2YV0X 4NCGA 1KVBA 5GADP 4DSJA 4QS7A 3EZ5A 1XC9A 2O8FB 4CHYA 1FKPA 2XHBA 4BECA 1HJRA 1GOCA 1TYQA 2XO7A 1GLDG 2OPQA 2I61A 3EL2A 3SJJA 2G8KA 1K8KB 1OH8A 1C0MA 5D3GA 1JCGA 4MO5A 1IG8A 3QMLA 4XH1A 4PKIA 1VQ6N 2W6KA 3VEVA 2VQEK 4W5NA 4DFKA 3OBWA 4OVLA 2A41A 1C1CA 3TABA 1WAFA 5LMUK 4F3OA 1LQQA 3K5LA 4BE0A 5E41A 3CJCA 2G8UA 4E89A 4DTRA 4CEAA 3PX0A 2NLXA 2NRRA 3MCPA 1W2BM 4IFVA 2UUBK 3OTOK 5JENA 4OPAA 4BRKA 1HYSA 3T7ZA 2GX9A 2HNDA 4CF1A 4BG8A 2Y1IA 3O4QA 1Y97A 1VSDA 3LDQA 2B6AA 4JI7K 3V9ZA 4CK2A 3OYMA 1EWRA 4AH9A 4C8MA 3GKUA 4BRDA 1HNWK 4DS4A 1QQMA 2BE2A 2E1ZA 4Z4HA 3A0IX 2E3GA 1WOQA 3ZSYA 1NNEA 3SAHA 4FJHA 1T0ZA 4DSIA 2P9NB 5EY4A 1ATNA 4FM1A 3LPTA 4GMJB 4DR1K 4IO9L 3LPUA 3LM9A 4JKFA 3DXKA 5BR9A 4CESA 5FPDA 2ZQBA 3K0SA 4E19A 3C6AA 1C6VA 4RW8A 4DFMA 1KLNA 4H0YB 2Q31A 2OZMA 4CJTA 3EZWA 3QERA 3O3HA 4F9OA 4E1JA 3HTVA 3KD5E 3LP1A 4L3QA 4FK4A 5MLCQ 3VTIA 2ZM6K 1V4TA 2YNFA 1P0AA 2QTDA 4BVOA 3VQBA 4UAEF 1S9EA 4J2EA 2WONA 3BK3C 2KZMA 4UAFE 3TSQA 4BACA 4FW1A 4BRCA 1KAYA 4BC3A 4DF8A 2E5LK 1NG9A 1S1XA 4CHPA 2Q0UA 2F96A 5GINA 3LZIA 3CD6N 4M3YA 4M63C 2JWKA 3L2RA 3DLGA 5AQRA 3HOSA 3OHRA 4JKAA 4K41A 4CEZA 3PSIA 5AQHA 3E9LA 2LJMA 2HBJA 3PX6A 3GL1A 3WEEB 2Q1NA 4DHYA 4FWOA 3O9UA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2GV9 A;  5AZI B;  1Q8I A;  1E3M A;  4AHC A;  4AHS A;  4BR2 A;  4BRM A;  1RNH A;  2AP1 A;  2HBM A;  1IJJ A;  3NF7 A;  2HHQ A;  2NY8 X;  4CBX A;  2QEX N;  4F2R A;  2LR3 A;  1GLE G;  1UA1 A;  3EE9 A;  4WQ5 A;  3R1X A;  3K5N A;  2IS3 A;  3O3G A;  3NHG A;  2HF3 A;  2F7T A;  3GE1 A;  4YOR A;  2QWO A;  4DQI A;  1F21 A;  1I3A A;  4FJI A;  5BRE A;  4JLH A;  1XNQ K;  1U45 A;  4W5Q A;  4PY5 A;  1VNB A;  5HRS A;  3R8E A;  3VET A;  1LV5 A;  3TTC A;  1L3T A;  1VQ7 N;  4B1Y B;  3AVL A;  4FOE A;  3H3O B;  3CPW M;  3ZYY X;  1SKR A;  1EET A;  2FXU A;  1C56 A;  2GTD A;  2X6N A;  1LWC A;  3AA2 A;  4PWD A;  3ZX2 A;  4FLX A;  4F2S A;  2ITM A;  3QEI A;  3TR8 A;  3SCX A;  1ZBS A;  3LDN A;  1JLQ A;  2ZWH A;  4FJM A;  3HRG A;  3G0Z A;  3AVA A;  3TSU A;  4RW4 A;  4DFJ A;  2H3G X;  1RDU A;  1TK8 A;  5LL6 Z;  5AQN A;  4BE1 A;  3MEG A;  5IWA K;  4CJR A;  1SAZ A;  2GBZ A;  2W41 A;  4WE1 A;  3EYZ A;  3QI7 A;  1Z6R A;  1XI1 A;  1BCG A;  1G15 A;  3UB5 A;  3C6U A;  4CF2 A;  4CZK A;  3ZEU B;  1EXQ A;  2IDO A;  4FWM A;  3HPG A; 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