5FPNA

Structure of heat shock-related 70kda protein 2 with small-molecule ligand 3,5-dimethyl-1h-pyrazole-4-carboxylic acid (at9084) in an alternate binding site.
Total Genus 119
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
119
sequence length
381
structure length
379
Chain Sequence
GPAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTIFDAKRLIGRKFEDATVQSDMKHWPFRVVSEGGKPKVQVEYKGETKTFFPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGGKVHSAVITVPAYFNDSQRQATKDAGTITGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKGCGEKNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVSHLAEEFKRKHKKDIGPNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGVDFYTSITRARFEELNADLFRGTLEPVEKALRDAKLDKGQIQEIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILIG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Signaling protein
molecule keywords HEAT SHOCK-RELATED 70 KDA PROTEIN 2
publication title Detection of Secondary Binding Sites in Proteins Using Fragment Screening.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 119
structure length 379
sequence length 381
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-12-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00012 HSP70 Hsp70 protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5fpnA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5fpnA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5fpnA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5fpnA04
1XQSC 1K8KA 5JLHA 3O08A 5AZIA 3I33A 1NLVA 2ITMA 3ZX3A 2A42A 3LL3A 2P9NB 5AQNA 3VEVA 5AFUA 4K43A 1NGCA 1BWFO 2I7PA 3BEXA 2CGKA 4BR2A 3EKUA 4DHYA 2VYPA 5AQFA 2V7YA 2YHXA 4FWNA 4A2BA 3L6QA 3HBTA 4I6MB 2A3ZA 4B1ZA 3HI0A 2Q1NA 3VEXA 5AQZA 1MA9B 3A0IX 1S22A 4PL8A 3H6EA 4FO0A 3UKUA 1ESVA 1ZBSA 2F9WA 1NGBA 1K8KB 4H0TB 5AZIB 3VESA 4CI6A 4CZGA 2QWLA 4CZLA 5AQQA 2GEMA 5FPNA 2E2PA 3VGMA 3MN5A 3VOVA 3QBWA 4RTFD 1ZXOA 4RCHA 4FPAA 4CZIA 2YI1A 4CBUA 3CJ9A 3O8MA 3U9ZA 4BRIA 1Q18A 1HJOA 3EO3A 5AQRA 3SK3A 4CBWA 1U6ZA 3W0LA 1C0FA 2EWSA 4A62A 2QW9A 3C0BA 1GLCG 3HSCA 1T6DA 1OKJA 1X3NA 4IJNA 2YJFA 3AARA 3H3NO 1NGJA 3VEWA 3H45C 2ZWHA 1KAZA 3D2EA 4GNIA 3L4IA 2Q36A 2P9SA 3HM8A 3MN6A 4WQ4A 3A5OC 4ISEA 4JD2A 3O6WA 1JCGA 3VEZA 5BRDA 2FF3B 3O80A 1QQMA 5LJVA 3WXKA 3GDQA 1MWKA 2D0OA 4B1UB 4FWPA 2QM1A 3CJ7A 4NB4A 1QZ6A 2ASPA 2P9IA 5EXWA 3LDLA 4H0PA 2AA4A 3D2EB 4BRFA 4BR9A 1RDWX 1HPMA 2P9KA 2P9PA 1NGHA 3C7NB 3I8BA 2YCHA 2P9SB 4XH5A 4BRNA 2ZGZA 4H5RA 4IXCA 5AQHA 4BC3A 3F9MA 3BP8A 3UE5A 5AQKA 3FZKA 1T6CA 2I7NA 1MWMA 3SMSA 5F0XA 2H3GX 3FE1A 1C0GA 2V51B 4FWRA 3CQXA 4FWOA 2P9IB 1NWKA 2FLOA 1SZ2A 4IJAA 3O5BA 5LJWA 2V7ZA 2P9KB 2P9PB 3R6MA 2GWKA 4KBOA 1GLDG 4IWVA 3VERA 5AZJA 3VETA 3O1WA 1YVNA 3OHRA 4K25A 3S41A 5AQUA 3UB5A 3QBXA 4BC5A 4LC9B 1NGFA 3FR0A 1E4FT 1TUYA 2V52B 3VF2A 3MK6A 3O1BA 4FWLA 3LDOA 4M63C 1TYQA 1SQKA 4WQ4C 3M6GA 3TPQA 5EX5A 4RWTA 1ATRA 2W41A 5BRFA 2CGLA 1DEJA 3QDKA 4BREA 4QS9A 2HMPA 4O5FA 3LM2A 3CJAA 3A5LC 4FOIA 4BRKA 1JCEA 4H0YB 3U8XA 4H0OA 4O8KA 5AZJB 2Q2RA 5ADXH 2E1YA 3M3ZA 3FLCO 2F9TA 1BUPA 2WUSA 3FGUA 3U9DA 5BRHA 5KPRA 3IMXA 1GLFO 2KHOA 4HTLA 3KVGA 2D0PA 3L0QA 1S3XA 5ELZA 2FSKA 3ZX2A 5F2RA 3O4WA 3WQTA 4BRCA 1TYQB 2GUPA 1V4SA 1H1VA 1XUPO 4BQZA 2HOEA 2P9UB 2OANA 3WEEA 2E2NA 3UKRA 1U2VA 4BRLA 5JMVA 3QMLA 3P4IA 3ULEA 1HX1A 4EHTA 3D2FA 2D1KA 4IO8A 3FZFA 3CJ1A 1CZAN 4BR0A 4IZ9A 1NGGA 4PKIA 1LCUA 1QZ5A 3DAWA 4B9QA 2UYTA 3DJCA 1V4TA 5FPEA 5KQ8A 3ZEUA 1XC3A 2QWNA 2Q97A 3C7NA 3CI5A 3H1VX 3VGKA 3H1QA 2FSJA 5BPMA 3SJHA 1BU6O 5KQDA 4BC4A 4BRDA 4EHUA 1R59O 3WEEB 1QQOA 3UKRB 1U2VB 5BN8A 3MCPA 4DCHA 3TU5A 1BO5O 1ATNA 4FWMA 3ULEB 3H3OB 3D2FB 3W3DA 2P9LA 4WQ5A 2VCPA 1KAYA 1BDGA 2AP1A 3GE1A 4MLHA 4A61A 2YHYA 4NO7A 3VEYA 3SMPA 3CIPA 2BUPA 5FPMA 4FPBA 3ZEUB 5EVZA 5AFUH 4YDUC 2BTFA 1WOQA 4DB3A 2IVOA 1WUAA 2A5XA 2CH5A 4BGBA 1D4XA 4C23A 3LDQA 3MDQA 3ZX0A 3CETA 2YJEA 1BA0A 1E4GT 2PBDA 2P9LB 1IJJA 2NRHA 4BRGA 4FWKA 3J8AA 3QFPA 4BC2A 3VGLA 3H46O 3M1FA 3WQUA 1Y64A 3A5NC 4BR7A 5AQSA 2ZF5O 4MO4A 1SAZA 3DXMA 4F9OA 2QWPA 4CBXA 4E1JA 2E1ZA 2ZGYA 3SLCA 3MN7A 5AQYA 2GWJA 4BVPA 4L3QA 2QWOA 1Z6RA 2IVNA 3WUHA 3FZLA 4PKHA 3FFKB 4CZJA 3WT0A 1YUWA 4AM7A 3GBTA 3GG4A 1KAXA 4AM6A 3EZWA 4Y0WA 4QS8A 4BG9A 2PAVA 3WXJA 3D7EO 3ENHA 3VF4A 3HTVA 5AQLA 5BPLA 4FOEA 4H0XB 4DQ8A 2E8AA 4M7XA 3VF6A 3GOIA 3DWLA 3KZBA 4CZKA 3A5MC 2P9UA 5AR0A 1Z05A 3DXMB 4BGAA 4CZFA 3BUZB 2Q0UA 4H5VA 1X3MA 4WQ5C 5EY4A 3MMVA 3ATUA 5JLFA 4GY2B 4BRHA 2YHWA 2QXLA 3IUCA 5F1XA 4YDUA 2IVPA 3R9PA 3LM9A 3JS6A 4BRMA 2W40A 4XH4A 4EAHD 5AQJA 2FF6A 3BF1A 5B8HA 1G99A 2QWRA 4M7YA 1DGKN 5AQMA 4CZEA 4JHDA 5E26A 5AQIA 3RSEA 2FSNA 4BROA 1GLBG 2NLXA 1GLEG 1HUXA 1NM1A 2IIRA 4H5WA 3DXKA 1T44A 4BRQA 4B1VA 1JCFA 3VEOA 1GLLO 1IG8A 2ASOA 2HF3A 3ID8A 5EOYA 3FZMA 3CHWA 1RFQA 4XH1A 4K42A 4B1YB 4BRAA 3HZ6A 2FXUA 4H5NA 3FZHA 3LDNA 5LY3A 1YXQA 4FSVA 2D4WA 5AQOA 4H0VB 3ENOA 4ISFA 4ISGA 1ATSA 1BOTO 4WYBA 1HKGA 2GELA 2A6AA 5I9EB 3LDPA 5AQVA 5TKYA 3QICA 5BN9A 1GLJO 1BG3A 4JHDB 2Q31A 3RSEB 4BR4A 2J4RA 4CD1A 4PKGA 4JAXA 3QFUA 3DXKB 5AQXA 3ZETA 5KPZA 5AQPA 1KXPA 2A41A 3UKUB 2CGJA 4B1WB 2VWBA 1LOTB 5KPTA 1HLUA 4H03B 3R8EA 1NGDA 1YAGA 3AY9A 4H5TA 5ADXA 4JNEA 3CERA 3CJBA 4FWSA 4CJ7A 1BA1A 5FPDA 4CZMA 5CE3A 2E88A 3ATVA 3GL1A 5AQTA 4FL9A 1DKGD 4HWIA 4JN4A 4FWQA 2DPNA 1TUUA 4J8FA 1ZC6A 2NZTA 3EN9A 3A8YA 3ZETB 1HKBA 2CH6A 3WXIA 4BR5A 2A40A 4CZHA 2HF4A 2Q0RA 4CD3A 5BREA 2E2QA 4K41A 4MO5A 5AQWA 5JICA 4BG8A 5BR9A 2GTDA 5E84A 1GLAG 3EL2A 1RGIA 4QS7A 1QHAA 5AQGA 2E20A 3MN9A 3AAPA 2ASMA 4XEIA 2E2OA 3IDHA 4BRPA 4EFHA 4BQLA 1QQNA 3JXUA 3B8AX 4JD2B 4EIAA 1X9JA 2P9NA 3CQYA 3KHYA 4B1XB 3G25A 4A2AA 4BVOA 3CJCA 1NMDA 1P8ZA 3VPZA 1NGIA 1HKCA 4MLEA 1NGAA 1MDUB 3AAQA 1J6ZA 3WXLA 2QWMA 3IFRA 3VENA 3BF3A 1EQYA 1NBWA 3QB0A 5BPNA 3U4LA 4I6MA 1NGEA 4PL7A 3EKSA 2QWQA 4Z94A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2VQEK 4IOXA 2ITMA 3ZX3A 2F8SA 4FW1A 4FLYA 2LY5A 4AB0A 3HXMA 2P9NB 4RW7A 4DMNA 4CJRA 2NY8X 1SUQA 4BDYA 2D5RA 3BEXA 3KOWA 4KTWA 1KFSA 1SEGA 3WNFA 2PYJA 1NJXA 4FWNA 1SN1A 4JI4K 4B1ZA 3VEXA 3KD5E 2G8UA 1VK0A 4KO0A 3H6EA 1I2UA 1ESVA 2YNGA 4CIFA 3HK2A 1W0HA 1T1TA 3VESA 2QWLA 2X6NA 3LAKA 2E3FA 3AVBA 5FPNA 3VGMA 2Z1JA 2UUCK 4RTFD 4B3TK 4RCHA 1JKZA 1KV0A 1ZBIA 1DJTA 1JXEA 3EO3A 3VQ8A 3SAGA 4FJHA 1XHXA 4CEOA 1EP4A 4KI6A 4BE0A 2KZMA 1X3NA 4O55A 2WBNA 1NRAA 2PY5A 3B6OA 4O4GA 3BZKA 2ZWHA 2O8EB 2YIPA 4FJJA 4IEEA 2Q36A 3BZCA 4OPAA 3QNOA 3KK2A 3MN6A 1JLAA 4ISEA 1J53A 4E7LA 4DV1K 2DTUA 3C6HA 1I39A 3AA3A 3O6WA 3MEEA 3VEZA 3D0PA 2FF3B 3O80A 1RTJA 3RMCA 3ASMA 3WXKA 1VSJA 3GDQA 3CCLN 1W97L 4QOZB 1FJGK 5JENA 3TTFA 4OPJA 1VQNN 2D0OA 2YKMA 3LALA 1M90O 4NYFA 1NK4A 2YV0X 2LSNA 2RPIA 2ASPA 4Y1DA 3I8BA 3OJSA 1VSLA 4HCCA 4XH5A 3CM6A 2RKIA 1XI1A 4IXCA 4LH4A 3WNHA 3UE5A 4DSEA 4CJQA 5KRSA 4FYDA 5JVGL 4CW7B 3TAPA 1C1AA 3CCJN 4BWJA 1KLMA 4GVEA 1NJZA 1DTTA 3LPTA 1SZ2A 3O5BA 3T3FA 1YHQN 4FLVA 2GWKA 4KBOA 3VERA 4WE1A 3O1WA 4FZZA 3OHRA 4K25A 2BGGA 1S1VA 3CG7A 4LC9B 1NGFA 4WFNL 1SN4A 3VF2A 1JXBA 3VN5A 4YOVA 3LDOA 4Q5VA 3OS1A 1HMVA 5EX5A 3S3MA 1C1BA 2W41A 4DSJA 4LD0A 2CGLA 3TAQA 4JI2K 3ISNC 1QVGM 4BREA 3VQ9A 2G8FA 3HJFA 3O3GA 3CJAA 4H0YB 1VSIA 2KBJA 2F9TA 2WUSA 4YOUA 1J5EK 1RDBA 2ZJPL 3KVGA 2ITGA 1N5YA 2D0PA 1XNQK 1RDUA 1ZFUA 2K35A 4DU3A 1UAXA 3C95A 1H1VA 4K0KK 4M3YA 5JS1A 3G6EN 2QA4N 2N69A 4BRLA 1U2VA 3QMLA 1I2VA 3P4IA 5T7BA 3P83D 1P90A 4IO8A 3A2FA 3K59A 1L5UA 1QTMA 1Y97A 4IZ9A 1NGGA 3RVCA 4B9QA 4ZTJA 2E3GA 3NGZA 4CF0A 3OJUA 4JK9A 1S6QA 1RNHA 1XC3A 2QWNA 2JWLA 2Q97A 3H1QA 3KOZA 5KQDA 1N34K 4BECA 4BRDA 3J7YP 1R59O 3K5LA 3K5OA 3LWLA 1U2VB 2HVHA 1ATNA 1D5AA 4PHTX 2P9LA 3L56A 2VCPA 2O8CA 5FRNA 2D0BA 4DV7K 4M3TA 4A61A 1BI4A 2Y1JA 3N4PA 1BK8A 1TL1A 4C8NA 2W42A 1KSPA 3Q7BA 3J7ZO 3SMPA 3CIPA 2BUPA 5FPMA 4CJ3A 4CJ5A 3T1AA 1YIJN 3V9XA 3RWUA 3OYKA 4DV5K 1WUAA 4FJGA 2CH5A 1PE4A 1D4XA 3MDQA 3DRPA 3OYNA 3CETA 5HL7L 5C42A 1BA0A 1E4GT 1JLBA 2P9LB 1IJJA 1GOAA 2O8CB 4DSLA 4JI6K 1TL3A 3ZT3A 4J2BA 3VGLA 3H46O 1ASWA 1BI4B 3WQUA 3MEDA 3MAQA 3MEGA 4NLCA 2FBTA 2SN3A 2ETJA 3G71N 3THWB 4CIGA 3IS9A 4CBXA 3AVJA 4M41A 3ZSXA 4F3OA 3T7ZA 4OGCA 3P5JA 4M3RA 3FZLA 1RTIA 3WT0A 3V1QA 1YUWA 1HRHA 4YFUA 1RDCA 1YJNN 3RR8A 3EZWA 2E6LA 4QS8A 2PAVA 4BG9A 3QEXA 3TAMA 3D7EO 1SNBA 2FBVA 3M8PA 3DLRA 5AQLA 5C2DA 3GOIA 4GV3A 2KTQA 1T3VA 4FM2A 1WSJA 3L2RA 3SBGA 4BGAA 1B7DA 3BUZB 2Q0UA 4DTSA 1KLNA 1X3MA 3MMVA 3ATUA 1FK9A 4GY2B 1L3SA 3IUCA 4LSLA 3M8SA 2IVPA 3LM9A 5IWAK 4E89A 3JS6A 3QI7A 4BRMA 3OBYA 3SUNA 2WTUA 3PLAA 3OW2M 2QWRA 3VQCA 1PTXA 1RCHA 1S1UA 5AQMA 3E66A 4LSNA 4BWMA 4DR4K 2VG6A 3EY1A 4CERA 4BROA 5CHIA 1GLBG 1GLEG 2NLXA 4ICLA 4JKCA 4H5WA 3DXKA 3SV4A 3O9UA 4E19A 3U3GA 1RDDA 4BRQA 2XHBA 5EOYA 3FZMA 3AGRA 3KLHA 1NJYA 4DTUA 3EE8A 1RFQA 4K42A 3VQAA 4AEIA 4DFKA 4BRAA 2UUAK 1OVYA 4DV6K 3LDNA 4FJIA 1YXQA 2D4WA 1C56A 4CGGA 4H0VB 3ENOA 4ISGA 3CFOA 1NH5A 4CHNA 2RE2A 4WYBA 2GELA 4KHNA 4CJWA 5AQVA 4M3WA 5TKYA 4I9QA 4BR4A 1NKBA 4CD1A 4UY8O 2WFBA 4JAXA 4I9LA 1D8YA 4DFMA 3LWMA 3DXKB 5KPZA 1KXPA 3L2VA 2CGJA 3MECA 3L2UA 3CMAN 2VWBA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 2VQE K;  4IOX A;  2ITM A;  3ZX3 A;  2F8S A;  4FW1 A;  4FLY A;  2LY5 A;  4AB0 A;  3HXM A;  2P9N B;  4RW7 A;  4DMN A;  4CJR A;  2NY8 X;  1SUQ A;  4BDY A;  2D5R A;  3BEX A;  3KOW A;  4KTW A;  1KFS A;  1SEG A;  3WNF A;  2PYJ A;  1NJX A;  4FWN A;  1SN1 A;  4JI4 K;  4B1Z A;  3VEX A;  3KD5 E;  2G8U A;  1VK0 A;  4KO0 A;  3H6E A;  1I2U A;  1ESV A;  2YNG A;  4CIF A;  3HK2 A;  1W0H A;  1T1T A;  3VES A;  2QWL A;  2X6N A;  3LAK A;  2E3F A;  3AVB A;  5FPN A;  3VGM A;  2Z1J A;  2UUC K;  4RTF D;  4B3T K;  4RCH A;  1JKZ A;  1KV0 A;  1ZBI A;  1DJT A;  1JXE A;  3EO3 A;  3VQ8 A;  3SAG A;  4FJH A;  1XHX A;  4CEO A;  1EP4 A;  4KI6 A;  4BE0 A;  2KZM A;  1X3N A;  4O55 A;  2WBN A;  1NRA A;  2PY5 A;  3B6O A;  4O4G A;  3BZK A;  2ZWH A;  2O8E B;  2YIP A;  4FJJ A;  4IEE A;  2Q36 A;  3BZC A;  4OPA A;  3QNO A;  3KK2 A;  3MN6 A;  1JLA A;  4ISE A;  1J53 A;  4E7L A;  4DV1 K;  2DTU A;  3C6H A;  1I39 A;  3AA3 A;  3O6W A;  3MEE A;  3VEZ A;  3D0P A;  2FF3 B;  3O80 A;  1RTJ A;  3RMC A;  3ASM A;  3WXK A;  1VSJ A;  3GDQ A;  3CCL N; 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