3D2EB

Crystal structure of a complex of sse1p and hsp70, selenomethionine-labeled crystals
Total Genus 109
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
109
sequence length
379
structure length
379
Chain Sequence
AAAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVALNPQNTVFDAKRLIGRKFGDPVVQSDMKHWPFQVINDGDKPKVQVSYKGETKAFYPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDRTGKGERNVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVNHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASLEIDSLFEGIDFYTSITRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDLVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILMG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural basis for the cooperation of Hsp70 and Hsp110 chaperones in protein folding.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Heat shock protein homolog SSE1
molecule tags Chaperone
source organism Saccharomyces cerevisiae
total genus 109
structure length 379
sequence length 379
chains with identical sequence D
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-05-08
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 3d2eB02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3d2eB01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3d2eB03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3d2eB04
4H5TA 3AY9A 3QFPA 4QS7A 1SZ2A 2FSJA 2FSNA 4FL9A 3VPZA 3QBXA 5EX5A 3DXKA 3P4IA 3H45C 2NZTA 4FOEA 3A5OC 1NGIA 4BRIA 3WXLA 3VENA 3CJ7A 3HSCA 3ZX2A 2V51B 3KHYA 4DB3A 3C7NA 3L0QA 3CJ9A 4FWQA 3QICA 3WEEA 4PKGA 3BF1A 5I9EB 3L6QA 3QFUA 4BR0A 1OKJA 4RCHA 1DKGD 4FPAA 4CZLA 3EO3A 3FZMA 3O08A 5BN8A 1QQMA 3AARA 1YXQA 1QZ6A 2IVNA 1GLFO 3CJCA 3D2FA 4FWMA 1NGCA 4CZFA 3QB0A 4MLHA 5BREA 4B1WB 1HJOA 2V7ZA 3GG4A 1Z6RA 4WQ5C 1GLDG 2IIRA 2Q2RA 2FXUA 4CZJA 4J8FA 5BN9A 4BRAA 3VERA 5AFUH 2E1ZA 1KAYA 1DGKN 1XUPO 5CE3A 4H0OA 3MK6A 2YJFA 3WEEB 4CBXA 1GLJO 3VGMA 2QWOA 3LDQA 1BWFO 2E2PA 2D1KA 5EXWA 3LL3A 3UKUA 3D2EB 4K43A 4CD1A 1BO5O 4IXCA 1SAZA 4BC5A 4PKIA 4XH5A 1KAZA 5AQZA 3CQYA 1NLVA 3FFKB 3CJAA 5AQNA 4BC4A 3U4LA 2QW9A 1NGGA 5KPTA 3FZFA 1BDGA 3F9MA 1D4XA 4BRGA 3G25A 1K8KA 2AA4A 4H5NA 3UE5A 1ATNA 1MWMA 4BQLA 4PKHA 5ADXA 3UKRA 1NWKA 1U6ZA 3WUHA 3LDOA 3CQXA 4Y0WA 3H46O 1Q18A 2P9NA 4BR7A 3M3ZA 3ZETA 3MDQA 5AQHA 2I7PA 4MO5A 3FR0A 5JMVA 1HKGA 3O8MA 3O6WA 3SMSA 4CBWA 1NGEA 5F1XA 4HTLA 3U9ZA 4CZMA 3BUZB 3VEVA 1GLAG 2GUPA 4GNIA 2W41A 4WQ5A 5BPNA 5AZIA 4CZGA 1K8KB 4FWNA 4CJ7A 3HBTA 3EL2A 5JICA 2FSKA 3M6GA 3ENHA 3UKRB 1C0FA 3VF2A 4BG8A 3IUCA 2I7NA 2P9NB 1YUWA 2Q0UA 1ZXOA 2E2NA 4IJAA 1DEJA 1J6ZA 1WUAA 3KZBA 4NO7A 1LCUA 1ATRA 3I33A 5AQRA 5BPLA 3ZX3A 4I6MA 3ZEUB 4BRCA 4BREA 3O80A 3EN9A 5E26A 5AQXA 4A2BA 2P9IB 4KBOA 5E84A 4PL8A 1BA0A 3HI0A 2YI1A 1HPMA 2E20A 3IDHA 2CH6A 2YJEA 2VWBA 4A61A 4NB4A 4BRNA 3SLCA 5ADXH 2YCHA 3VOVA 1HX1A 3FZHA 3CJBA 5EOYA 3ID8A 4FWLA 2Q1NA 4WQ4C 4CZIA 2ASMA 2Q0RA 4H03B 5BR9A 2OANA 3QBWA 3BEXA 3U8XA 2GWJA 5AQQA 3ZX0A 3S41A 4BR4A 4I6MB 4CZKA 3HZ6A 5AQJA 1JCEA 3O1WA 1MDUB 4BGBA 4XH1A 3A5MC 2W40A 2QWQA 1NGBA 5BRFA 2P9KA 1YAGA 2EWSA 3WT0A 4H0VB 4H5WA 3DXKB 3DXMA 3R9PA 4ISGA 1JCFA 3LM2A 4CZHA 3VEZA 5AZJA 2H3GX 2PBDA 3H3NO 4BRFA 1BU6O 3D7EO 4H0TB 1JCGA 1H1VA 1RDWX 4BR2A 3C7NB 2Q36A 4BRHA 4WYBA 4RTFD 1CZAN 3VEWA 5AQMA 2A41A 3CERA 3IMXA 1S22A 2P9KB 3O4WA 3QMLA 2YHXA 2QWRA 5F2RA 1HKBA 4B9QA 2CGKA 3D2FB 1XQSC 4FOIA 4BR9A 4Z94A 2QWMA 4H5RA 2VYPA 3DXMB 3KVGA 4BRKA 5AZJB 4A62A 5BPMA 2E2OA 2P9UA 4WQ4A 5AQTA 1IG8A 3FLCO 2Q97A 1TYQA 4EFHA 5F0XA 5BRHA 4BC2A 2F9WA 4JAXA 4EHTA 3ATVA 4H0PA 3VF6A 4DQ8A 3MN6A 4MLEA 3UKUB 4K25A 4EIAA 4F9OA 5JLHA 3FE1A 1ESVA 2CH5A 4CZEA 3ULEA 2KHOA 4B1VA 3U9DA 3A8YA 4FSVA 5FPMA 1HLUA 4M7YA 1BG3A 2DPNA 3EZWA 4EAHD 5ELZA 4AM7A 1E4GT 2QWLA 3OHRA 4FWKA 4B1YB 2UYTA 4B1ZA 3B8AX 1G99A 4AM6A 2ITMA 5KPRA 3SMPA 2P9UB 3HM8A 2GTDA 4ISFA 3J8AA 1TYQB 3CI5A 2IVPA 1BUPA 4DCHA 5AQKA 1NM1A 3R6MA 4O5FA 2J4RA 4M7XA 4BR5A 5KQ8A 3ULEB 2V7YA 3ZETB 2Q31A 2P9SA 2ASPA 3CJ1A 2ZGZA 4B1XB 5JLFA 4MO4A 1T6CA 2GELA 4JD2A 1QHAA 3BP8A 1S3XA 3GBTA 3H1QA 3R8EA 3VGKA 3MN7A 5AQSA 2HF4A 4E1JA 4BRMA 1HKCA 2E8AA 2QWPA 1R59O 3GDQA 1RGIA 3GE1A 5AZIB 3AAPA 4PL7A 5B8HA 1X3NA 3MMVA 5BRDA 4LC9B 3LDNA 3QDKA 2ZGYA 5AQYA 1ZC6A 1T44A 2E2QA 2NLXA 4K41A 3L4IA 3ATUA 3LDPA 2ZF5O 3A5LC 4C23A 2A6AA 3IFRA 1TUUA 2IVOA 4BRLA 3H1VX 3WXKA 2CGJA 5KQDA 5LJWA 4XH4A 2QXLA 3CHWA 1HUXA 4M63C 4XEIA 1NGFA 1NGJA 3RSEA 4CBUA 1C0GA 3TU5A 3O5BA 4BRQA 4FWOA 4JNEA 4BVPA 3HTVA 1NGHA 2A3ZA 1IJJA 4BRDA 2D0PA 1QQNA 1NBWA 2F9TA 4QS8A 4FO0A 4H0XB 2V52B 3DAWA 3UB5A 1KAXA 4BRPA 4BVOA 1V4SA 2BUPA 1QZ5A 4H5VA 4FWPA 4YDUC 1MWKA 1LOTB 4IWVA 4B1UB 4RWTA 5EVZA 5FPEA 1T6DA 3D2EA 5AQIA 1TUYA 3RSEB 1BA1A 1QQOA 1U2VA 5LY3A 1X9JA 3H6EA 1E4FT 3A0IX 5AQFA 1XC3A 3GL1A 1X3MA 1YVNA 3EKUA 4FWRA 1WOQA 2VCPA 1GLCG 2FF3B 3WXJA 3WQTA 1RFQA 3MN5A 3VGLA 2FF6A 3DWLA 3ENOA 5EY4A 3CETA 4JHDA 3TPQA 3SK3A 2E88A 1GLLO 4BG9A 2CGLA 2YHWA 4FWSA 1Y64A 3VETA 4JN4A 1U2VB 4O8KA 3EKSA 4H0YB 3LDLA 2PAVA 5AQPA 2GEMA 2QWNA 4A2AA 3JXUA 3MN9A 5LJVA 5AQOA 4CI6A 5AQVA 1SQKA 4DHYA 3W3DA 2HF3A 5AQGA 3AAQA 3DJCA 4CD3A 1BOTO 2P9PA 4IO8A 1ZBSA 3WXIA 1P8ZA 4QS9A 1NGAA 2HMPA 2YHYA 4K42A 5TKYA 3VESA 2AP1A 4JHDB 1GLBG 3MCPA 4BGAA 3WQUA 1Z05A 4L3QA 4YDUA 2FLOA 3CIPA 5AQWA 5AR0A 4IJNA 2QM1A 5AQUA 2P9LA 3FZLA 4IZ9A 3VEYA 4HWIA 1KXPA 2D4WA 2GWKA 4BC3A 3JS6A 2NRHA 3M1FA 3ZEUA 3LM9A 2A5XA 2ZWHA 1V4TA 2P9IA 1EQYA 5AQLA 2P9PB 3GOIA 3H3OB 2HOEA 3VEOA 4ISEA 2ASOA 3A5NC 3FZKA 4BQZA 4GY2B 2BTFA 4FPBA 3O1BA 2D0OA 1NMDA 3BF3A 3I8BA 5FPDA 2E1YA 3SJHA 1NGDA 2A40A 1GLEG 3VEXA 4EHUA 5FPNA 2A42A 3FGUA 5KPZA 3C0BA 5AFUA 3W0LA 4BROA 2P9LB 3VF4A 2P9SB 2WUSA 1ATSA 1MA9B 4JD2B
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3V9UA 4YOXA 2OA8A 1NKEA 5GIOA 3O9QA 4ELVA 3CM5A 3VPZA 2RPIA 2N66A 4MDBA 5EX5A 4JI1K 3P4IA 1EETA 3H45C 1NJXA 4PHTX 2YIOA 3QLHA 3OW2M 4O4GA 4C1NI 2G8FA 2WBNA 3CJ7A 2NRWA 3HSCA 3DM2A 4DV5K 3ZSXA 1NK9A 4DB3A 4J2AA 5CHIA 1U4BA 4DTSA 3PO5A 2B5JA 3NH2A 2HHTA 2G8HA 4KH6A 2IVNA 2OTLN 2ETJA 3D2FA 3QB0A 4MLHA 4B1WB 2XRIA 4CHOA 2P51A 3S5TA 3OYFA 1RBRA 4JKCA 2EX3A 4CZJA 3AA2A 1UA0A 4BRAA 3CD6N 4PY5A 1VQ5N 5CE3A 1W97L 2VWJA 4HHTA 4CBXA 2YJFA 1GLJO 3B6PA 1T7EA 1WT7A 1BWFO 4B3RK 3LL3A 4K43A 4IG0A 3OBYA 4CF9A 4DKWA 4QOZB 1T05A 3BGRA 1CXUA 4M3UA 4FJIA 3CC4N 3T7ZA 2HB5A 3K59A 1UAXA 4BC4A 3U4LA 5KPTA 4DSLA 1JLGA 3OYIA 1BDGA 3DRPA 1D4XA 3MXIA 3EE8A 1ASVA 4H5NA 1ATNA 5ADXA 4FJ9A 3WUHA 1U6ZA 1M90O 4KHNA 2B4JA 3E7UX 4Y0WA 3H46O 2GBZA 4Z4GA 2LN8A 1RTDA 3LP1A 3V4IA 5D3GA 2HHQA 1WAFA 3VQEA 1YJWN 3E9OA 4MO5A 3H08A 2KYQA 4IKFA 3L3VA 4CZMA 4HTLA 1R0AA 1ZYQA 1BI4B 1QE1A 1GLAG 2GUPA 5AZIA 1ZUTA 3R2VA 3DLGA 3HBTA 3V9ZA 4JI8K 1C55A 2FSKA 4F2SA 1UWBA 1D9DA 1XWLA 2I5JA 3CYMA 3HT3A 1YUWA 3SUNA 2Q0UA 4KO0A 2B6AA 1SS6A 5GAEP 3NE6A 1QVFM 1DEJA 5GAGP 1BCOA 4YOWA 3T3FA 4NO7A 4DFMA 3O4NA 1D8YA 1U49A 4JKBA 2O4GA 4NYNA 4I6MA 4BRCA 4W5NA 3EN9A 3ZT3A 1BHLA 4CJRA 4ID5A 2HHWA 3HI0A 4IFEA 1S1TA 3IDHA 1UA1A 4BRNA 4CF0A 4OPAA 1T1TA 3CJBA 4FZZA 3O9UA 2NRXA 4WQ4C 3HO1A 2PYJA 4YOVA 3QBWA 3BEXA 1NNEA 2DFFA 3U8XA 4BDZA 3S9HA 3CCMN 4IG3A 3S41A 1Y97A 4CZKA 4DSJA 3HZ6A 1NK6A 4XH1A 3IG1A 4RG8A 3K5LA 4CJFA 3MWTA 1HNZK 5BRFA 2P9KA 1VSHA 2MBKA 3D0PA 5A2QO 3SNNA 2X74A 4A57A 3BY5A 3R9PA 1SEGA 3LM2A 4N56A 2H3GX 2PBDA 2KBKA 4BRFA 3QESA 1KQSM 4CIEA 1RT6A 3SUPA 4R79A 4BRHA 1KVAA 5J1EA 3WNFA 5DM6L 3AGRA 1QVGM 2OPPA 1YJ9N 2VQEK 4FYDA 3CCRN 1S22A 4CHZA 3GKUA 2QWRA 4B9QA 4FJ8A 3D2FB 4FOIA 5C2DA 4A62A 1KTQA 3OYMA 4I7FA 5AQTA 4ZTJA 2E5LK 2FBVA 1OH8A 5MLCQ 4U67L 3NF7A 1CN2A 1HQUA 2KTQA 4F9OA 2ZJRL 3MN6A 4KAZA 3CPEA 1O13A 4CZEA 3ULEA 4B3TK 4CF1A 3QEWA 3THWA 3PX0A 1F21A 2QWLA 1DQ7A 3B8AX 1G99A 1A5WA 5KPRA 2VWKA 3SMPA 3SCXA 1QS4A 5LMUK 5J2PA 2ATQA 4ISFA 1TYQB 3K9KA 1BUPA 4AHUA 3SQ1A 4KYPA 1NM1A 1L5UA 2HBLA 2J4RA 2ATBA 1RCHA 1WNSA 3LDSA 2V7YA 2HHIA 2Q31A 2ASPA 4B1XB 4KHSA 4MO4A 1IKYA 2GELA 2W6LA 5LMNK 1ZVGA 3DOKA 3R8EA 2GMOA 2C1GA 3CCLN 3VGKA 1KRPA 1HKCA 2E6MA 1R59O 3GDQA 5AZIB 1VQPN 1S6QA 1XI1A 3AV9A 4DSFA 5B8HA 4BE0A 3L3UA 2A1RA 1LW2A 3DLKA 4FLTA 4Z4HA 3L4IA 2UXBK 1NPIA 3QNNA 1TL1A 2O8CA 4LH4A 4JYAK 4FLYA 4M42A 2IC3A 1BCGA 5T7BA 2XY8A 1GPTA 1BQMA 2CGJA 4H4MA 2QXLA 1QQCA 2F8SA 4YOUA 3CHWA 3TAGA 4O0JA 5SWMA 1HUXA 4M63C 1NGJA 1VSJA 4V1DC 4JNEA 4AHVA 4BVPA 2D0CA 2UUBK 4RW4A 4M3ZA 2A3ZA 3VTIA 4B9MA 5HL7L 1QQNA 3NVMA 2XY6A 1NBWA 4QS8A 5CR4A 3AO1A 1NJZA 2V52B 1TI5A 3MEGA 3R3LA 4CEZA 3KKRA 1V4SA 1CHZA 3LALA 3K57A 3THVA 1Q86O 5HRNA 1AHOA 2XO7A 1B92A 1LOTB 3E66A 1HYZA 1Q7YO 4MQ3A 3VQQA 4ILGB 3D2EA 3BDPA 3NGZA 1TUYA 2W6KA 3CG7A 3A0IX 3NF8A 5AQFA 2GX9A 3NGYA 1S72N 1C1BA 3GL1A 1TK0A 1X3MA 3EKUA 4FWRA 3UIQA 4A59A 5M1FA 4GKJK 2HHUA 3WXJA 1KFSA 2F96A 1RFQA 3MN5A 4LD0A 2IDOA 4CJ4A 4Z4CA 3VGLA 4DTNA 4Z4IA 4X66K 3CFOA 2YHWA 3VETA 1Y64A 1OH7A 4YOYA 4AHCA 4OX9K 4JN4A 1U2VB 3VA0A 4E7IA 1I39A 4F4KA 1RDDA 2PAVA 4CFBA 2QWNA 3SYZA 4OKKA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 3V9U A;  4YOX A;  2OA8 A;  1NKE A;  5GIO A;  3O9Q A;  4ELV A;  3CM5 A;  3VPZ A;  2RPI A;  2N66 A;  4MDB A;  5EX5 A;  4JI1 K;  3P4I A;  1EET A;  3H45 C;  1NJX A;  4PHT X;  2YIO A;  3QLH A;  3OW2 M;  4O4G A;  4C1N I;  2G8F A;  2WBN A;  3CJ7 A;  2NRW A;  3HSC A;  3DM2 A;  4DV5 K;  3ZSX A;  1NK9 A;  4DB3 A;  4J2A A;  5CHI A;  1U4B A;  4DTS A;  3PO5 A;  2B5J A;  3NH2 A;  2HHT A;  2G8H A;  4KH6 A;  2IVN A;  2OTL N;  2ETJ A;  3D2F A;  3QB0 A;  4MLH A;  4B1W B;  2XRI A;  4CHO A;  2P51 A;  3S5T A;  3OYF A;  1RBR A;  4JKC A;  2EX3 A;  4CZJ A;  3AA2 A;  1UA0 A;  4BRA A;  3CD6 N;  4PY5 A;  1VQ5 N;  5CE3 A;  1W97 L;  2VWJ A;  4HHT A;  4CBX A;  2YJF A;  1GLJ O;  3B6P A;  1T7E A;  1WT7 A;  1BWF O;  4B3R K;  3LL3 A;  4K43 A;  4IG0 A;  3OBY A;  4CF9 A;  4DKW A;  4QOZ B;  1T05 A;  3BGR A;  1CXU A;  4M3U A;  4FJI A;  3CC4 N;  3T7Z A;  2HB5 A;  3K59 A;  1UAX A;  4BC4 A;  3U4L A;  5KPT A;  4DSL A;  1JLG A;  3OYI A;  1BDG A;  3DRP A;  1D4X A;  3MXI A;  3EE8 A;  1ASV A;  4H5N A;  1ATN A;  5ADX A;  4FJ9 A;  3WUH A; 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