4IPA | Genus

Total Genus 127

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	127
sequence length	372
structure length	372
Chain Sequence	AISVDVLTKYKTAAQISEKVLAEVSKLCVPGAKIIDICEQGDKLMEEELSKVYRDKKTNKGFSHPTTVSPAAFITPYTPLRSDEKEAATEIQPGEPIKIQLGAQIDGYGTIVCDTIVAKNANDPDVIEGRQADLFLATYYANEVLLRLMVPPGLLATGTDEEKAKAAAVKPPSQAKISSLLEKVAKAYDCNIIESTTSWLFDKNEIEGKKKIILSPGENIKGEGVPEVGDVWGVEVGCSLGSGKVKQFEQRATLHRRTNNTYALKRPTSRKIYSEVQKKFGTFPFSLRQLEDERDAKSGVIECVRGGVFRQYEVTGDKDNAPVCRLLTTIAITKNGITRIGGPPAWDLSKFKTDKKIEDEEILKILEQPLSK

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Consistent mutational paths predict eukaryotic thermostability. pubmed doi rcsb
molecule keywords	Putative curved DNA-binding protein
molecule tags	Hydrolase
source organism	Chaetomium thermophilum var. thermophilum dsm 1495
total genus	127
structure length	372
sequence length	372
chains with identical sequence	B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date	2013-01-09

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00557	Peptidase_M24	Metallopeptidase family M24

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
1.10.10.10	Mainly Alpha	Orthogonal Bundle	Arc Repressor Mutant, subunit A	Winged helix-like DNA-binding domain superfamily/Winged helix DNA-binding domain	4ipaA02
3.90.230.10	Alpha Beta	Alpha-Beta Complex	Creatine Amidinohydrolase	Creatinase/methionine aminopeptidase superfamily	4ipaA01

2Z5UA 1YLFA 3L09A 4WK8F 3TOAA 3DPLC 5FFZA 5DUKA 5LHIA 4AIJA 4I7HA 4JQFA 4CO8A 3GVAA 5LEJA 3CLOA 1Z91A 5LGTA 2VXZA 4U76A 1QZYA 3ZN1A 2P5KA 4Z7MA 4JBAA 4ASNA 2KIFA 5CYVA 3IWZA 3K1MA 4L9TA 2A6HF 3F21A 1U8RA 2QM3A 1WWXA 4HQEA 3MATA 2P6TA 1ZN2A 3FZVA 1R00A 2PN6A 2FEZA 4JUQA 1R7JA 3TB5A 1XCVA 5K5QA 1ZG3A 5HLHA 3J81K 4WWCA 3ZMUA 2Y75A 1FY7A 1OKRA 3FM5A 5D4RA 2BEOA 1ZHFA 3P9KA 3FXQA 2R3SA 2Q95A 1ZAOA 4AVPA 1UHMA 2MLGA 1IN4A 4G6DA 3VOEA 2WWYA 1PP8F 2XAHA 4M9SA 1USSA 4YIFA 4P9UA 2LNBA 2H6CA 3HHHA 1MJAA 3G73A 1K7AA 2OQRA 2YU3A 4HYEA 2AXLA 3I0TA 4WXCA 4FX4A 3S6BA 2DFIA 1U2WA 4IECA 1TBXA 4G7HF 2ZCWA 3ECOA 1JE8A 5AIQA 5FFXA 4KMFA 1QBJA 1SD5A 3DXJF 2JTVA 1FOKA 4FLIA 2Y0MA 3KLNA 1QXYA 3M9AA 3Q9SA 3I59A 1WQ2A 4PV4A 2RKHA 3RIRA 3KP3A 3ZN0A 4XSZF 5E1ZB 2BWTA 4LFUA 2OAZA 5K1YA 1IRFA 4G7ZF 4S04A 2W85A 5LEKA 3WTTC 1MD0A 2A68F 2STWA 5FCHA 1BIAA 1Y0UA 2V79A 4BNCA 2DT5A 2OU2A 3J80Z 4ESJA 2K86A 1ZLKA 4UNOA 5E1WA 3K1NA 2VBYA 2K27A 1REPC 2HQRA 2ZMEA 4BH9A 3TO6A 2V1UA 3CO6C 3DKWA 4S2RP 3I58A 2BN7A 2HOEA 3JSPA 3B73A 1SD7A 1LJ9A 2V3YA 4UV8A 3ZMSA 3D27A 2IVMA 3LA2A 2STTA 5D5WB 4B8XA 2CG4A 2DK5A 4HZFA 3IKTA 3EETA 1EH6A 1TLHB 4ZWUA 2IPQX 1T2KA 3OV8A 2OA4A 1C21A 2H09A 3E6CC 4XBFA 4UUVA 4IHSA 4U0VA 3RPUA 2CWEA 4I02A 4NB5A 4R60A 2HR3A 3Q6DA 1SMYF 3BJ6A 2FBKA 2UXNA 4UV9A 4ZYDA 3QU6A 1G3TA 1YYVA 1E2XA 4ESFA 3ULQB 4M9XA 5L3GA 3F72A 3KLOA 2ZJ2A 3KCCA 3IG4A 1Z9CA 1B59A 4GXOA 1IN8A 1YO5C 1W5TA 4IF4A 3JTGA 1CF7A 4MATA 3MQ0A 4OMZA 3FXUA 3SFZA 3HUGA 1IN5A 2HYGD 3F8MA 1SFUA 3Q5FA 3G3ZA 1GVJA 1YIOA 1XSVA 4Q48A 2UZKA 3K2ZA 4LLLA 4ON0A 2GG5A 3T5XA 3PKEA 2W84A 3V8JA 1HKQA 3RKWA 4IRHA 4U6CA 4EQQA 3RYRA 3F8BA 5CJ9A 4CXFA 2DI3A 3WE2A 3BDDA 1LQ1A 1FP1D 4ZWOA 2PMHA 5L3EA 2CQKA 1MKMA 2FA5A 5LHGA 3IWFA 3K0LA 2PG4A 1FT9A 4KNYA 4S01A 2TDXA 4HDVA 4WF2A 1R5HA 1XNZA 5FLXZ 2EV0A 4L0ZB 5ERIA 1RUOA 3I54A 1TQPA 1QQIA 2QQAA 2G7HA 2XAJA 2GZWA 3JAMZ 1QXWA 4L9VA 4IKSA 1H9TA 3RJPA 1P4WA 1O3TA 3K9TA 3MCZA 2NQ6A 4GCVA 4OIQF 4EV0A 2P9AA 2YX4A 1TNTA 1R1VA 4I0BA 3EDPA 2EJRA 2GAUA 4EJUA 3M7GA 1FYKA 2LKPA 2ZNYA 2XUBA 3KEQA 3FMQA 3GF2A 4BXUA 1F9NA 2ZBKA 1O7FA 2EK5A 4U75A 2OD5A 2IA0A 2KRFA 1FNNA 1MDMA 3TAVA 2GG7A 1UB9A 2FF4A 5DCFA 1RUNA 5FCFA 4UVBA 3WTVC 1P4AA 1L0OC 1O3RA 4KIFA 4U6ZA 2KJCA 2ZSGA 1B9MA 5ICEA 1XGNA 4OIRF 1KU9A 1BI1A 4M9ZA 3ML6A 1FBQA 2J5OA 4KA4A 4MQ9F 2QYOA 5E8GA 2YPRA 3CO7C 1FX7A 2FU4A 1I1SA 4U69A 1ZARA 3RDIA 3NEUA 5E1XA 5IT9K 3WG9A 3RI4A 3RORA 2DK8A 4P9FA 1WBQA 2Z99A 2QWWA 1GXPA 3EYIA 2P98A 2AS5F 2JPCA 5K5RA 2E1CA 4N0BA 3HOTA 4OU0A 3GX4X 2WTEA 2LDUA 2GXGA 3HIFA 2PLYA 4FX0A 4IRIA 2MBFA 5LGNA 5A2QK 2BWWA 4KMUX 1MGTA 2D2WA 2W25A 5D5UB 4WCGA 4AD9A 4ZNGA 5TJJA 2GWRA 3E5XA 2VONA 4P55A 1QZZA 2DBBA 1XSDA 1OMIA 3MZYA 3ZMVA 3KP6A 3WGGA 2BWSA 1BIBA 3HRUA 3RPQA 2IA2A 4RS8A 4EVIA 4S2TP 2K02A 2DLLA 5D6EA 5DD8A 3AAFA 2IJLA 3LQRA 4WXHA 2VBWA 2MLKA 5F6FA 1S7OA 1P92A 3GFJA 4KN7X 4O3MA 1JXSA 2FBHA 2FOKA 3FXRA 5HDKA 3F8CA 5KVRA 2D45A 3I71A 1HW5A 2NRAC 4HXXA 3O3KA 1JAWA 1FPQA 4LLGF 2GU5A 4IVNA 5H6QA 4G94A 2Q0OA 3LA7A 3R61A 5CLSA 1S29A 1YW8A 4GYIA 1R36A 2FSWA 5DCMA 4G6QA 2G6PA 3GYHX 4MQVA 2B0LA 2MATA 4CHUA 2WC2A 5LGUA 3NRVA 4KFCA 3QP5A 4HOBA 1HKSA 4A5MA 4RB0A 1MATA 2GA1A 3IU8A 4U88A 4Y15A 2HDCA 1F4KA 3MWMA 1T39A 4ENJA 1DDNA 4IF7A 3WTYC 5JI6A 3PFIA 2ZXJA 3EUHA 2OQGA 2EFWA 3DEUA 4PDKA 3PKAA 2GTXA 3SZPA 1K78A 2HTJA 1P4XA 3I59B 3ECHA 4RB3C 2RDPA 3CUOA 1SD4A 2HWVA 3LFKA 4LK1F 1E17A 4EM1A 2XHKA 1JHFA 3GO5A 1XCBA 1KA8A 1KU3A 4A2UA 4KIGA 1XGOA 1R58A 3B02A 4S00A 4PNCA 4GYGA 5LRRA 2M87A 4M74A 2EV6A 2M30A 3EYYA 2IP2A 5KK1A 2A61A 2ZMEB 4FT8A 3WU1B 2QBYA 3RYPA 1O0XA 1TQIA 5CDVA 4UVAA 3WTUC 1G3SA 3KP5A 1BI0A 2P7VB 3TDZC 5DYMA 2B3LA 2HGCA 3JSOA 4MGRA 4YG2F 1BN5A 2XROA 4N9HA 1A04A 1CHMA 3I64A 2GQQA 1K79A 3IU9A 1DP7P 3BOQA 2G9WA 4B09A 1IZ1A 1C22A 2EFOA 3E6BA 1L3LA 1SMTA 1KQ8A 3E97A 3ELKA 2P5VA 2EFNA 2KIMA 2M8EA 3KE2A 3MR1A 1I6XA 1O3SA 3TKYA 2RC4A 5DV5A 1IRGA 3U2RA 3WU0A 3TDUC 5FD6A 2XASA 3FF5A 5CIKA 4A5NA 1XDUA 2JPBA 2PEXA 3E6DA 1BOAA 3BY6A 2BWXA 1D8KA 3T8RA 2MA3A 2Z3YA 1LDDA 3ZP5A 4MTDA 3W6KB 3DF8A 4TV7A 1ODDA 5F64A 1CF7B 5JR3A 5E18F 3BZ6A 4ZWPA 1YW9A 4KYWA 2ESNA 4B28A 1FSEA 3K69A 3BITA 1RIOH 1D3YA 2ZFWA 3T8TA 5D4SA 1SD6A 3N97A 1C0WA 4I09A 2CFXA 2H6BA 3BPVA 1LEBA 3MEXA 6PAXA 1OR7A 4LGWA 2E7XA 2FQ3A 2Q92A 3DP7A 2NS0A 3JAMK 2W57A 2V6CA 1BI2A 4ESBA 2M5WA 1ZH5A 1U6GA 1ZG1A 3CUQB 2CW0F 1U78A 2L02A 3HHGA 2HYFA 4EGZA 1S3JA 2ISZA 2X4HA 4UHTA 1LB2A 4KUMA 3HSRA 1J5YA 1KQ9A 2ELHA 3VODA 2F5CA 4Z2YA 1HQCA 1HW1A 2ETHA 4HAMA 3HRMA 5ILUA 5D6FA 1J7KA 4CICA 4OOKA 2MD5A 2VBZA 3DFGA 2EA2A 1W4MA 3SXYA 3F6VA 4R1HA 1WSUA 2UWMA 5LBQA 2IA1A 3JW4A 2FE3A 1OPCA 4RZYA 1UHWA 2BHAA 1FSHA 5CVJA 1TNSA 2Q2EA 1W7PA 2EB7A 3BP8A 4FUKA 2VODA 3HRSA 2YSRA 1FP2A 3KFWX 4RGSA 4CZZA 5J8FA 1PUEE 4H0EA 4MHGA 2DQRA 1G3WA 2ESHA 5LRSA 1T38A 3BROA 1WN1A 4G8XA 5ILVA 3GEZA 4A12A 1YS6A 2MH2A 2XRNA 2MH9A 3QOPA 3WTXC 1WLRA 4ZYEA 2GU4A 2BHDA 2GGBA 5L3FA 2EVOA 3TOBA 2XV4S 1J2XA 3C18A 2HKXA 3RTRA 2P8TA 1IAWA 4FO7A 1HKTA 4HQMA 3BJOA 2JRTA 5CDLA 4G7OF 2FBIA 2A3SA 2EVMA 1YTYA 2RGVA 3GWZA 2R7DA 2DPDA 3HTUA 2FNPA 4IKRA 4E70A 3FMRA 1F5TA 5ICCA 2P4WA 2EWNA 1VTNC 4FO8A 3BWGA 3KP7A 1QGPA 3GFMA 2VE9A 4G9YA 3E3VA 4ZYHA 1G3YA 4EJTA 2CSOA 2LF7A 2R7FA 2E7WA 2VT3A 2BBYA 1LNWA 3RVAA 1KU2A 4JK1X 4DNCA 4IJAA 3KETA 2MC3A 4OIOF 2PFBA 1V3FA 3V7SA 4OOIA 3HYIA 1TQMA 1LVAA 5BPDA 1EV7A 5DEQA 5AONA 3MFKA 2VT2A 5HDGA 3MZHA 4AIHA 1T6SA 3LAJA 4EGEA 4A6EA 5F1RA 4NHJA 2M45A 1IXRC 3L24A 3RKXA 4QR8A 3CB5A 2O61A 4FKCA 1ZREA 1YG2A 1N51A 4L5JA 4RB1A 2KIUA 3SZTA 2VN2A 4A0XA 2Q93A 3R60A 1I5ZA 2J5PA 3TQNA 1WL6A 4HV6A 4RB2C 3F22A 2CGPA 4HF0A 5D8LB 1Z6TA 5CVIA 1FLIA 5ILSA 2BWVA 3KEOA 1B1BA 2FXAA 5JFRA 1ZYRF 5DCMB 2XKPA 1HBXG 2GG0A 2NNNA 3F6OA 1IXCA 3I5UA 3IRRA 1T0FA 4I0AA 2IRFG 1IN6A 3C1DA 1U5TB 1EH7A 2V1DA 4LG0A 5TRDA 1W7VA 1Q1HA 4HLXA 3KP4A 3ZMDA 5FGMA 2RNJA 1X3UA 1TTYA 4ENNA 4U70A 3ABTA 3D5LA 3PKDA 2D1HA 4LK0F 2GGCA 4M73A 3FM3A 5LHHA 1K78B 1ULYA 4QWQA 2CO5A 5CDEA 3IKVA 3M8EA 1TW3A 4HV5A 4KN4X 2BYVE 2BE5F 3HSFA 4U6WA 3ZMZA 1YW7A 2VOOA 4A6VA 2ZNZA 2OZUA 3IC7A 2QQ9A 1J0RA 1B9NA 4EJOA 2A5YB 1WRJA 2UXXA 3M8FA 2RN7A 2EV5A 2OBPA 4FLKA 4A6WA 2F5FA 1Y1NA 3L9FA 2HZTA 4XLNF 5J6XA 5JVTA 5L3BA 4U7DA 3V7RA 4WXDA 4HBLA 4HX8A 2FMLA 1FYMA 4AWXB 1DPUA 3ZMTA 2GG8A 4KDPA 2QBYB 4L18B 5BOXA 4IHTA 3L2CA 1FWZA 2L3DA 3LWFA 1ONVA 2GZ5A 5HLIA 5DD4A 2ZKZA 1XGSA 3BJAA 1HSTA 2BV6A 2VBXA 4BHBA 2NNYA 5LLQA 1FC3A 1ZG5A 1Z05A 1DUXC 3LSTA 2HTSA 1MZBA 3V7CA 3PKCA 2GG3A 2GXBA 2B3KA 1FBUA 5HLGA 3DQVC 2IW5A 4YFNF 3BIQA 3MAJA 2JZYA 4OIPF 4YIIA 1HSJA 1ON2A 3FWEA 1XGMA 3J80K 1XMKA 4O5VA 2XAFA 1EH8A 3F8NA 1YVMA 4ZZLA 2A07F 5CVVA 2BGCA 1IXSB 4Q47A 3GZ5A 1D5VA 2GU6A 4PZJA 4L9NA 3LAPA 4KIBA 3V8LA 1FZPB 1SAXA 2KKOA 1GHCA 5HOOA 2PJPA 1J75A 1CGPA 2CYYA 3P9CA 3D0SA 4NQWA 1GXQA 3KP2A 4P5OA 2LF8A 1D8JA 2FMYA 3EQLF 5IT9Z 4XRFA 1HXDA 5K5OA 2HOWA 5D5VB 1V4RA 3WTSC 1J59A 1MJBA 1R1UA 5EEHA 2C6YA 1P6RA 3GXOA 1C23A 2QENA 4HLYA 2RQPA 4Q5SF 3CTZA 5A2QZ 3CDHA 4BYYA 4U1BA 4FHTA 4XSXF 4WX9A 4LJZF 2PMUA 5L3CA 2V9VA 1S7AA 1QNTA 3COAC 2DTRA 5BMZA 3S2WA 4RGUA 4M71A 4Q4ZF 3WGIA 4Y17A 4K2EA 3IHUA 4S05A 2O6GE 5EEGA 3JTHA 3HTSB 4EM0B 2NAZA 3P9IA 1ZGAA 4FLJA 4KICA 3GUDA 1H0MA 2L54A 2IT0A 5D8KB 2F5DA 2X0LA 4PGGA 4HX7A 4RAZA 2M1BA 1O57A 2DU9A 2EFQA 4IKTA 1STZA 4EMSA 4D0PA 1KQ0A 1W7PB 2ISYA 4YFKF 4U6JA 1DPRA 1WL9A 3ROUA 2P7CB 2QQBA 4RGXA 2BH3A 2V1XA 1W5SA 1U3EM 3R0JA 4ZYGA 4PGHA 4EM2A 4UVCA 1XB4A 2H27A 2HFHA 2DO7A 3V4GA 5D5XB 2K4JA 2O8XA 3WGHA 3J7AO 2Q8KA 5FLXK 4I01A 3MX6A 2XGXA 3FHZA 3L7WA 1HW2A 2FRHA 2E1NA 3LQQA 2A69F 4IKUA 2O3FA 2OZ6A 4HW0A 4L0YB 3FMSA 5E5BA 5BQTA 2ADUA 4M6XA 3U1DA 3GFIA 1F1ZA 3U9GA 2RVCA 3VB2A 3WTZA 4LMYA 2OKNA 3DV8A 4ETSA 1FYLA 1C24A 5BS6A 4EJWA 2VC1A 1BI3A 4M72A 5AIPA 2QVOA 3O2PE 1BM9A 1RZ4A 2EVCA 2XAGA 3I53A 4MEYF 1YQAA 3QPTA 2K7LA 1USTA 2BB7A 4A0ZA 1IN7A 2K4BA 5E20A 2BWUA 3KZYA 2DAOA 4IXAA 4L9JA 1KGSA 2PQ8A 2DPUA 5HVQC 3GW2A 4O6JA 2L4MA 4RAYA 4IPAA 2JT1A 4LB6B 1OYIA 1O7LA 1WY2A 2Z33A 1XMAA 5ED4A 2NQ7A 3WE3A 3J81Z 3QU3A 3KZZA 1H9GA 2V3XA 3TO7A 3QPHA 1KYWA 2EA4A 5CVRA 4HDUA 3R6SA 4XLPF 4LLNA 2XVCA 2L4AA 3F8FA 3H3ZA 3PQKA 3VFZA 1WI9A 5DUIA 3DPTA 3BPXA 3PQJA 1R1TA 4A6DA 5H6RA 3H3UA 4U71A 2Q94A 3REOA 2P5LC 1LDJA 1MDMB 2XKOA 1XDSA 3GLXA 2HEOA 1K6OA 5FB2A 3TO9A 1G4DA 1S8NA 1J9IA 1R5GA 5HS8A 1FBSA 1XSXA 2BHCA 4CDGA 4Y13A 1ON1A 4LB5A 4R8HA 4OINF 3IRQA 3I4PA 1IF1A 1BC7C 5CVUA 3VEPA 3M1EA 4QLCU 3QP6A 4DQ2A 2F2EA 1PDNC 1LEAA 3CUQC 3N4MA 1LDKB 2PBIA 4RZZA 4L5IA 2A6EF 1QXZA 1RI7A 5IT3A 4RGZ1 3TGNA 1KP0A 4LG0B 4R79A 1T98A 2HS5A 3CUQA 3C3WA 4BHPA 2BWYA 4YFXF 5HS7A 3K1PA 3IU7A 2EFPA 2Z9OA 1M35A 3ISPA 3GZ6A 1S6LA 3CTAA 5DDGA 1PP7U 2GG9A 1KU7A 2YX7A 3QRFF 2XAQA 2KJBA 1PV9A 4F7ZA 1BBYA 3T1BA 1B4AA 5ICFA 1B6AA 4MTEA 4HX4A 2VOPA 1C27A 1BJAA 5JHUA 4KM3A 2G7UA 3LA3A 1YFHA 2QLZA 3V8KA 4I2OA 1P2FA 2GU7A 4BAYA 3P7NA 1MJ9A 1UFMA 3E5UA 4HA8A 4IRGA 2HQNA 4U0YA 4HF2A 3O6BB 4GGGA 2VE8A 4EJVA 1WKMA 4ZH4F 4A0YA 3HOSA 4U6EA 2ACJA 5H20A 5FD5A 2GG2A 3GFLA 5HDNA 3SQNA 1O3QA 3ZPLA 1SFEA 3PKBA 1W2MA 2BHBA 1AOYA 4GO1A 2DQLA 5E17F 4P96A 2HKOA 3RKYA 1BC8C 1Z1DA 4BHCA 4M6YA 2NYXA 4IU6A 3HRTA 2PI0A 3F23A 5J8CA 2VC0A 4HF1A 1XD7A 2IW2A 1KYZA 3H92A 3C7JA 5ICGA 3WTWC 1IW7F 4FLLA 2ZO4A 2W24A 4ENMA 1OYWA 3HSEA 2O0YA 1Z6RA 1R23A 2LSOA 4MNUA 3ERED 4CYDA 2D1VA 1OYYA 1UCRA 4EGYA 2H94A 5CNXA 4IDYA 1SFXA 2P6SA 3OOPA 1ZRDA 4UXNA 3W6JB 2DW4A 1I1GA 5L3DA 1IUYA 4U73A 1NHAA 1ZGJA 5CE6A 2B3HA 1AWCA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily

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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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4IPAA

Total Genus

sequence length

structure length

Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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pfam database annotations