4IPA | Genus

Total Genus 127

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	127
sequence length	372
structure length	372
Chain Sequence	AISVDVLTKYKTAAQISEKVLAEVSKLCVPGAKIIDICEQGDKLMEEELSKVYRDKKTNKGFSHPTTVSPAAFITPYTPLRSDEKEAATEIQPGEPIKIQLGAQIDGYGTIVCDTIVAKNANDPDVIEGRQADLFLATYYANEVLLRLMVPPGLLATGTDEEKAKAAAVKPPSQAKISSLLEKVAKAYDCNIIESTTSWLFDKNEIEGKKKIILSPGENIKGEGVPEVGDVWGVEVGCSLGSGKVKQFEQRATLHRRTNNTYALKRPTSRKIYSEVQKKFGTFPFSLRQLEDERDAKSGVIECVRGGVFRQYEVTGDKDNAPVCRLLTTIAITKNGITRIGGPPAWDLSKFKTDKKIEDEEILKILEQPLSK

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Consistent mutational paths predict eukaryotic thermostability. pubmed doi rcsb
molecule tags	Hydrolase
source organism	Chaetomium thermophilum var. thermophilum dsm 1495
molecule keywords	Putative curved DNA-binding protein
total genus	127
structure length	372
sequence length	372
chains with identical sequence	B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date	2013-01-09

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00557	Peptidase_M24	Metallopeptidase family M24

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
1.10.10.10	Mainly Alpha	Orthogonal Bundle	Arc Repressor Mutant, subunit A	Winged helix-like DNA-binding domain superfamily/Winged helix DNA-binding domain	4ipaA02
3.90.230.10	Alpha Beta	Alpha-Beta Complex	Creatine Amidinohydrolase	Creatinase/methionine aminopeptidase superfamily	4ipaA01

1R5HA 1W7VA 4FX0A 4AWXB 2MLGA 1BJAA 1U3EM 2L02A 1LDJA 3TGNA 4ETSA 5FLXK 4S2TP 3L09A 4KMUX 3O2PE 5D5XB 1H9TA 1UB9A 2EFPA 1GVJA 1O7LA 3F3XA 3Q9VA 2RQPA 4G94A 3T8RA 2FA5A 1MDMB 3VEPA 3VB2A 3MZYA 2HEOA 4OIPF 3IC7A 3D27A 2AXLA 2IA0A 3V7RA 4FLJA 3R6SA 2A5YB 2VT3A 2A07F 3KE2A 2WC2A 1USTA 2RV8A 1QZYA 1QNTA 2KJBA 4KN4X 1ZRDA 2E1CA 3BDDA 5L3GA 4A6EA 2B3KA 4KNYA 4RZZA 4PGGA 1OR7A 2GXBA 3L00A 4BYYA 1W7PA 5HOOA 4FKCA 5E8GA 1HXDA 1SFXA 5FB2A 3E3VA 1J9IA 3IHUA 3J81Z 3D5LA 4I02A 2M87A 5ILUA 3VFZA 1ON1A 1BBYA 3RDIA 4EJVA 1YW7A 2BYVE 2HQRA 5F64A 1FBSA 5K5RA 3DFGA 4IKRA 4FLKA 4Z2YA 1R1VA 3ZMUA 1J2XA 1FZPB 2XGXA 1ONVA 1XD7A 4ASNA 4UXNA 4EM0B 5D6FA 4JBAA 3CUQB 1C21A 3U1DA 5H6RA 5CDVA 3WG9A 5HLHA 2V3ZA 1WSUA 2G7HA 4L0YB 2HR3A 2XAGA 1R1UA 4IJAA 2HZTA 4U1BA 5D4SA 3C3WA 2PG4A 2DO7A 2NAZA 4HF2A 1C24A 1FP1D 2E1NA 2GXGA 4WCGA 3WTVC 1FSEA 2XKOA 3MR1A 5CYVA 4ZZDA 2MATA 2FF4A 3MCZA 2CQKA 3ZMDA 3QP5A 4KT5C 4ZH4F 2DU9A 4A6WA 4N0BA 1LJ9A 1QZZA 4AVPA 4HDUA 3M8FA 4HOBA 3LA7A 1KA8A 1LB2A 1SMTA 1J59A 2FNPA 2XAJA 3QP6A 6PAXA 3CTAA 2HKOA 1H9GA 3PKCA 3JW4A 1U2WA 2MLKA 4EGYA 1S6LA 2FEZA 1KGSA 4ON0A 2EV6A 2V9VA 2OQRA 3J80K 3IU8A 2A6EF 3F22A 5D6EA 3CUQA 4KMFA 1EV7A 4U7DA 2HYFA 1FSHA 1ZRCA 1B59A 4LFUA 1TQPA 3NRVA 4IECA 3QOPA 3QPTA 4YIFA 5JVTA 3CO6C 4EM1A 2BWTA 2WWYA 2DI3A 3QU6A 1QBJA 2H94A 2MD5A 3I59B 4G7HF 1KQ0A 5BPDA 2XIGA 3FWEA 3MEXA 1A16A 3IRQA 4RGUA 1H0MA 3M8EA 5E8IA 1YG2A 4U71A 3HRMA 4YIIA 3HIFA 5HLGA 2DPDA 5HDKA 3WTUC 2GAUA 4GO1A 3K1NA 2MH9A 1DUXC 3C1DA 2JT1A 4O6JA 2F5DA 2RC4A 4DNCA 5LGNA 4CICA 5CVIA 4L18B 1FLIA 3SXYA 4KFCA 4O5VA 5D5UB 3LWFA 1K6OA 3K0LA 2PEXA 1LDKB 4KM3A 1LDDA 1YVMA 4HQMA 1XSXA 3KCCA 1MD0A 3EQLF 4KN7X 1D3YA 5E1ZB 1TQMA 1YW8A 2PMHA 5L3EA 4LG0B 3M1EA 1L3LA 3I59A 2EVMA 4U69A 5FCFA 4S05A 5K1YA 1CGPA 3DPTA 3AAFA 1KQ8A 1OKRA 5AIQA 5FD6A 3LA3A 2VBYA 2EV5A 4CYDA 3TO6A 5HVQC 3HRSA 1BI2A 4LJZF 3EDPA 4RB1A 3ML6A 5TRDA 2LKPA 2OBPA 4ENNA 1RUOA 3I58A 1ZG1A 2OD5A 4IRGA 1KP0A 4U0WA 2M1BA 5LBQA 2EA2A 2VC1A 4HX8A 3BY6A 2Q8KA 2FBKA 2KJCA 3G73A 4S04A 1HKSA 5F6FA 5D5WB 2QUFA 2NYXA 3BP8A 3IWFA 1A04A 2BWVA 2QVOA 3BIPA 5DV5A 3ABTA 1YYVA 4H0EA 2CGPA 3REOA 1G3YA 2V6CA 2W57A 4L5IA 3GX4X 3RVAA 4GCVA 4G6DA 4HDVA 4UV8A 1HBXG 1BI0A 3R61A 5CVRA 4LK0F 1K78B 1T39A 5FFXA 2J5OA 4RB2C 2CFXA 3SZTA 4P96A 1ZGJA 4CO8A 3HRTA 4LG0A 2YSRA 1EH6A 3FZVA 3LFKA 1C0WA 3R0AA 5F1RA 3H3ZA 3I54A 1FYLA 1DPUA 4I09A 5DUIA 2JSCA 3JSOA 2D1VA 2QENA 2GG8A 2DBBA 4RAZA 3LAJA 3MZHA 2BB7A 5KVRA 3DV8A 2TDXA 4MTEA 4ESFA 2VOPA 3SZPA 5CVJA 3KP6A 5CDEA 3IRRA 5K5OA 1IN7A 3WU1B 4YFNF 3U2RA 5DEQA 3RJPA 5CIKA 4HV6A 1HW1A 4OIOF 3LQQA 1O57A 1AWCA 4BNCA 4LLNA 2UXXA 3FMSA 2ZXJA 3GXOA 5A2QK 1MKMA 2XASA 3HHHA 3I64A 1XMKA 3CJNA 2Y75A 4EMSA 1R7JA 1OYIA 3HOTA 1E2XA 4ZWOA 1WRJA 3H92A 1PP8F 2V3YA 2V1XA 3RKWA 1K78A 4KYWA 3M9AA 4ZWPA 1MZBA 1XN7A 5E1XA 5D4RA 5DD8A 3WTWC 5IT9Z 2BWUA 2HTJA 3IU9A 3GF2A 2FMYA 3RIRA 4MTDA 3DPLC 3MATA 1O7FA 1F1ZA 3WTZA 3ULQB 5LRSA 1KU3A 2IW2A 3CDHA 4L9VA 1FWZA 3TKYA 1U5TC 2JPCA 1XGOA 2STTA 4HBLA 2C6YA 2OU2A 5JFRA 1P2FA 4MEXF 5JR3A 4BHPA 1VTNC 2PMUA 4HQEA 2VONA 1WL6A 2A6HF 3EYIA 5BPIA 1J5YA 5FLXZ 1ZN2A 1CF7B 3TDZC 5H6QA 4P9UA 2YX7A 2A68F 1BIBA 2YR2A 4M71A 3KP2A 2X0LA 3I4PA 1ZYRF 4I01A 4G6QA 4EJTA 4EQQA 1XGSA 5LRRA 5ICGA 3I71A 3PKEA 4QLCU 4S00A 1YJ3A 2ZSGA 2R7DA 1FP2A 2IRFG 2ZFWA 4MNUA 2NRAC 4MGRA 4G9YA 2UXNA 2P9AA 1W7PD 1FOKA 1UHMA 2P7CB 2Q93A 2HGCA 1QXYA 3FF5A 1SD4A 2GG5A 2RGVA 2GA1A 1KQ9A 5EEHA 4OINF 5HS7A 3M7GA 2GU4A 1JAWA 2NS0A 1KU9A 2NNNA 2BHCA 2GG3A 1YFHA 1DPRA 2PQ8A 3QAHA 3MX6A 2KRFA 4I0BA 1WBQA 2GG9A 3CTZA 1S8NA 3FXRA 4LB6B 5HDNA 3BOQA 2KIMA 3JTHA 3T5XA 1CF7A 1HKQA 1W4MA 2FXAA 1M35A 4A5NA 3F21A 5D8KB 5IT3A 1TLHB 2X4HA 3QPHA 4U6JA 3PKBA 4M74A 5LHHA 5ILSA 3PKDA 4CHUA 4IKTA 2RVCA 2Z9OA 2V1UA 3WU0A 1P4XA 5E5BA 1U8RA 4IDYA 3L24A 4AIKA 2YX4A 2XAQA 5ICEA 4ZYGA 4OIQF 4WXDA 2V79A 4GGGA 3E5UA 1ZLKA 3ZN0A 4OU0A 4MHGA 2H6CA 2W25A 4M6YA 3NEUA 2PBIA 3P7NA 3L7WA 4EVIA 2XV4S 5HDGA 4EM2A 3H3UA 3J7AO 3V8KA 4MATA 2PFBA 2L54A 1BC8C 2VE8A 2VN2A 1R23A 2CW0F 2GG0A 2BWXA 1IRFA 3HHGA 4MQVA 5J8CA 3LAPA 3TOBA 1W5TA 3GFIA 5HS9A 1IW7F 2O8XA 4U76A 3S2WA 4JQFA 5DYMA 5LGUA 3BJAA 2OA4A 3EETA 1SFEA 3VOEA 2EFOA 5K5QA 1QXZA 4BAYA 4M9ZA 4WX9A 3QRFF 2VE9A 3VODA 3EUHA 3R0JA 1Z1DA 3RKYA 1IN5A 1S7OA 1PDNC 1UCRA 5ILVA 1F9NA 4RGZ1 3KETA 2E7XA 2HQNA 1YIOA 1P4AA 3E5QA 2L01A 3I0TA 4YFXF 4Q5SF 1OYWA 1WLRA 1FX7A 4RGSA 2P6SA 4CXFA 4RGXA 2JTVA 3KFWX 3F6OA 3KZZA 3O6BB 3Q9SA 3BIQA 1BN5A 2LF7A 2M8EA 4XLPF 1WY2A 1XNZA 2DQLA 2ISYA 3BJOA 1JE8A 5ERIA 2DQRA 2F5FA 2HDCA 2IVMA 2A3SA 2D45A 1G4DA 5EEGA 3ZMZA 4NQWA 3DKWA 5FGMA 2BGCA 1YS7A 3GFMA 1B9NA 2HS5A 4JUQA 3IU7A 2LSOA 3K69A 1WI9A 2F5EA 2K4JA 2W84A 2XVCA 3SQNA 4FLLA 3DXJF 2KIFA 1O3RA 3ECOA 3HSRA 4BXUA 1Y0UA 3MWMA 4Q48A 3E6BA 1USSA 3TOAA 2NQ6A 1IN6A 4YG2F 4HX4A 4ZYHA 1YTYA 2GZWA 1WL9A 1Z9CA 4MEYF 4UVCA 1AOYA 2GGBA 4GXOA 3KEOA 3PQKA 1LNWA 3PFIA 4HXXA 3CB6A 2BV6A 4BHCA 1MGTA 3W6KB 2L3DA 1ZG5A 1I5ZA 4L9TA 2DT5A 1FYMA 2GU5A 1QQIA 3GYHX 4HA8A 4Z7MA 4U0YA 3OV8A 1U78A 1DP7P 2VBWA 2ZJ2A 4FX4A 1T6SA 1T2KA 4IRHA 1SD7A 2ADUA 1XMAA 4XSZF 3IKTA 3LA2A 2Q95A 3F8MA 2BBYA 4PCQA 5DDGA 3ZMTA 1S29A 3N4MA 4QR8A 4PZJA 2GU6A 2QBYB 4ZZLA 2IA2A 2G9WA 2Q94A 2P5LC 1WWXA 3FM3A 2A69F 3JAMK 4G7OF 3HUGA 4ESBA 4UVBA 4WXHA 3WTXC 1I27A 3T1BA 4U73A 3ISPA 1C27A 2QQAA 1TQIA 1G3WA 4OMYA 2ACJA 4WXCA 2MA3A 4EJOA 2EA4A 5HLIA 2IW5A 3K1MA 1QGPA 4RS8A 5CDLA 1XCVA 4A0ZA 2HWVA 1IUYA 5ICCA 3CUQC 2Y48A 3HYIA 2NNYA 5A2QZ 3GLXA 3HSEA 2XUBA 2Q0OA 4M6XA 3KP5A 1R1TA 3GUDA 5ED4A 4M72A 4HV5A 3MAJA 1QXWA 4M9XA 3K1PA 4Q4ZF 2DLLA 2JPBA 3ZMVA 2Q2EA 1JHFA 3QU3A 1ULYA 2BWWA 1P6RA 4UUVA 4KDPA 1DDNA 1K79A 2QBYA 3EYYA 5BOXA 4Y13A 1RZ4A 3ERED 2E7WA 5BS6A 3TB5A 3LQRA 1B9MA 3HRUA 1N51A 3GZ6A 2L4MA 4LLLA 2VBZA 2W85A 4WF2A 2FE3A 1J75A 1Z7UA 1XSDA 2BHDA 4S01A 1FNNA 1R22A 2HTSA 1GXQA 3R60A 3BPXA 3Q5FA 2P6TA 4TV7A 4U7BA 3WTSC 1FC3A 5LEKA 2VC0A 1R00A 2GG7A 5FD5A 2WV0A 4FT8A 5BQTA 2JRTA 4RZYA 4K2EA 2OAZA 2EJRA 4IU6A 1PV9A 3W6JB 2UZKA 2XKPA 3TO7A 4GYGA 3ELKA 4LLGF 4Y15A 4M73A 2GG2A 4EGEA 1O3SA 5CJ9A 2HYGD 1SFUA 1ZARA 1O3QA 5E18F 1YLFA 1JXSA 2DK8A 4XLNF 1XB4A 3KP4A 5D8LB 4B8XA 4UV9A 1RI7A 3RKXA 3NQOA 5FFZA 5DCMA 4WWCA 4PV4A 3CB5A 1XDUA 2FBHA 2UWMA 4U75A 2K4BA 4I7HA 2EFNA 2W24A 3FMQA 2JZYA 3RYRA 2YU3A 3KEQA 3P9IA 3FXQA 3V8JA 4L0ZB 4CGZA 4MQ9F 1HSTA 1ZG3A 2ESNA 2BN7A 4U6ZA 1IRGA 4G8XA 2H09A 4BH9A 2P5KA 3U9GA 4KIGA 4KIBA 4EV0A 1ZHFA 2M30A 2XAFA 2H6BA 3ZP5A 1IXSB 1JHHA 5JHUA 3B02A 2K7LA 1GXPA 1RNLA 2QLZA 2Y0MA 5IT9K 3IKVA 1P4WA 5CVVA 4IVNA 3F72A 1XGNA 3O3KA 2B3LA 5ICFA 4S2RP 1R5GA 2B0LA 3V4GA 3WODF 4FO7A 3IL2A 2DK5A 4HW0A 1B6AA 2P99A 2GA2A 2EVOA 3E5XA 1ZLJA 1C23A 3TAVA 5DUKA 2F2EA 4HLXA 4U0VA 2HFHA 1XDSA 3GWZA 2VODA 4HLYA 4ZWUA 4IF4A 1W2MA 4HAMA 2VOOA 1ODDA 2F5CA 1S3JA 2DFIA 2O03A 3HTSB 1I1SA 3I53A 4NB5A 1IXCA 4FLIA 2Z99A 3HTUA 1SMYF 3P9CA 3K9TA 1O0XA 2XAHA 2OKNA 3R4KA 2EFQA 1HKTA 1WQ2A 5JI6A 1V3FA 4XBFA 1RIOH 4O3MA 2P4WA 2GGCA 5D5VB 4A2UA 3BROA 3V7SA 2R7FA 3FX3A 1Z05A 1T98A 3LSTA 2M5WA 3P9KA 4JK1X 2FOKA 4LGWA 1PP7U 4AIHA 4R8HA 3IG4A 2FU4A 3F23A 1L0OC 4UHTA 2RKHA 2DPUA 4B28A 4IHTA 3KZYA 1T38A 4HF1A 2FSWA 1FBQA 1SD5A 1UFMA 3RTRA 3V7CA 4CZZA 1XCBA 2FNAA 4U70A 4L9NA 3MFKA 1RUNA 1CHMA 4A6VA 1G3SA 4LD5A 3FM5A 4F7ZA 1BIAA 2Z3YA 3BJ6A 5LHIA 1YQAA 1TW2A 4HX7A 4FUKA 5LLQA 1F4KA 3TDUC 1BI3A 2MH2A 4PNCA 2COMA 2Z33A 2LNBA 3I5UA 3E6DA 2BHBA 2PN6A 3J80Z 1REPC 1MDMA 4P5OA 1SD6A 1T0FA 1ZGAA 5LGTA 4M9SA 1P92A 2ZKZA 1KYZA 4IHSA 4XSXF 2MBFA 2VBXA 1U6GA 1Q1HA 3Q6DA 1FPQA 1KU2A 4A5MA 1TW3A 1O3TA 4ENMA 3J81K 2K02A 4OOIA 1LQ1A 4I2OA 2GZ5A 4IF7A 2K86A 1Z91A 2QQ9A 4KICA 2BWYA 3JTGA 4EJUA 4R1HA 3TO9A 3E6MA 2EK5A 1HW2A 5FCHA 1MJAA 5J8FA 3BWGA 4PDKA 2ZNYA 2CG4A 3FHZA 1XGMA 1TNTA 2V1DA 1MJBA 5L3FA 2STWA 2VT2A 3L9FA 2ZCWA 5L3BA 3PQJA 4RAYA 4GYIA 1KYWA 2QM3A 4U6EA 4RB0A 3WGIA 2ETHA 1I1GA 1XSVA 1OYYA 1LEBA 2EV0A 1F5TA 2QQBA 2FQ3A 4CDGA 1BM9A 3ZPLA 1BOAA 5CVUA 4FHTA 3WGGA 1R58A 4NHJA 4WK8F 2P7VB 2CSOA 4EJWA 1J7KA 1GHCA 3WE2A 2GTXA 2P98A 2G7UA 2DAOA 3T8TA 4UVAA 4XRFA 5CLSA 4I98B 2KIUA 3JSPA 4LB5A 3RPQA 2MC3A 4OOKA 5AIPA 3C18A 3KP7A 1X3UA 1Y1NA 2BE5F 3ZN1A 5J6XA 3S6BA 1U5TB 2ZMEB 2G6PA 3D0SA 1HSJA 1NHAA 3K2ZA 4ESJA 4P55A 3HOSA 3JAMZ 2O0YA 2CO5A 3GO5A 4HF0A 1BC7C 1ZH5A 3WTYC 3GVAA 2RN7A 3BPVA 1G6NA 1D8JA 1B1BA 3BZ6A 4EGZA 4U6WA 2HOEA 3ABUA 2DW4A 5E1WA 2L4AA 4FO8A 2OQGA 1C22A 2EVCA 2A61A 3L7GA 2HKXA 4N9HA 4ENKA 1I6XA 2XROA 4HZFA 2HOWA 1LEAA 2NQ7A 5KK1A 3SFZA 5HS8A 2AS5F 2QZ8A 5CE6A 4KA4A 3DQVC 3IWZA 1FYKA 4BHBA 2WTEA 3E97A 4QWQA 3ROUA 1WKMA 2M45A 3GW2A 3ECHA 4R79A 2IP2A 1YO5C 1MJ9A 1V4RA 3COAC 2XRNA 2LF8A 5FO5A 4AIJA 3HSFA 3T0YA 1WN1A 1MATA 1U5TA 2ZMEA 2OZUA 2BHAA 1FT9A 4ZYDA 4OMZA 4AD9A 2GIVA 3BITA 2H27A 1SAXA 1K7AA 3ZQ7A 1IF1A 2P8TA 4L9JA 2GQQA 1PUEE 2Q96A 1Z6TA 2DTRA 1IAWA 2EB7A 2Z5UA 1YW9A 4G7ZF 2Q92A 4IKSA 2IA1A 2EWNA 2ISZA 2YPRA 4KUMA 2ZNZA 4UNOA 2LDUA 3WTTC 1IN8A 1B4AA 2FBIA 4Y17A 4LMYA 3V8LA 3F8FA 3RI4A 4U88A 3E6CC 1STZA 4N9IA 3ZMSA 3L2CA 4BQAA 2ELHA 2PI0A 4ENJA 1EH8A 1KU7A 3DF8A 4IRIA 2V3XA 1D5VA 2IJLA 4YFKF 2PLYA 1HW5A 1OPCA 2O6GE 5DCMB 3KLNA 1YS6A 3C7JA 1R36A 4A0YA 1IXRC 3WGHA 4RB3C 4OIRF 1ON2A 3DEUA 5L3DA 4RGRA 2R3SA 3TQNA 3G3ZA 3CUOA 3GFLA 2CYYA 2B3HA 3CLOA 2D2WA 3N97A 2XHKA 2IT0A 1ZREA 4P9FA 2EFWA 3GEZA 5AONA 4A12A 4I0AA 2BH3A 1UHWA 1TNSA 4PGHA 5CNXA 1LVAA 3RYPA 3SHFA 3PKAA 3F6VA 2J5PA 2KKOA 4HYEA 4IKUA 4IPAA 3B73A 2OZ6A 1JGSA 3DP7A 3WE3A 3RORA 1HQCA 5LEJA 4DQ2A 4R60A 4LK1F 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chains in the Genus database with same CATH superfamily

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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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4IPAA

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structure length

Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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pfam database annotations